CC BY
72
ВЕСТНИК ПЕРМСКОГО УНИВЕРСИТЕТА
2020 БИОЛОГИЯ Вып. 4
УДК 579:873:579.222.2
DOI: 10.17072/1994-9952-2020-4-321-333.
О. В. Ястребоваa, Е. Г. Плотниковаa,b
a «Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН, Пермь, Россия b Пермский государственный национальный исследовательский университет, Пермь, Россия
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ БАКТЕРИЙ СЕМЕЙСТВА MICROCOCCACEAE, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ БИОТОПОВ С РАЗЛИЧНЫМ АНТРОПОГЕННЫМ ВОЗДЕЙСТВИЕМ
Проанализированы данные по систематической принадлежности и распространению бактерий сем. Micrococcaceae, выделенных из экосистем с различной степенью антропогенной нагрузки (г. Пермь, Березники, Соликамск, Оса; Пермский край). Показано филогенетическое разнообразие и широкое распространение представителей семейства Micrococcaceae в различных биотопах района разработок Верхнекамского месторождения солей. Разнообразие видов бактерий семейства Micrococcaceae выявлено в почве и ризосфере растений, произрастающих вблизи солеотвалов. На основании анализа гена 16S рРНК исследуемые штаммы семейства Micrococcaceae были отнесены к семи родам: Arthrobacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Micrococcus, Kocuria, Nesterenkonia, Rothia. Исследуемые культивируемые бактерии семейства Micrococcaceae, выделенные из экотопов с экстремальными условиями среды, являются перспективными для дальнейшего их использования в биотехнологических целях.
Ключевые слова:Micrococcaceae; идентификация; ген 16S рРНК; засоление; загрязненные экотопы.
O. V. Yastrebovaa, E. G. Plotnikovaa b
a Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms of the Ural Branch RAS, Perm, Russian Federation b Perm State University, Perm, Russian Federation
PHILOGENETIC DIVERSITY OF BACTERIA OF THE FAMILY MICROCOCCACEAE ISOLATED FROM BIOTOPES WITH DIFFERENT ANTHROPOGENIC IMPACT
The data on the taxonomy and distribution of bacteria of the family Micrococcaceae isolated from ecosystems with different degrees of anthropogenic impact (Perm Territory: Perm, Berezniki, Solikamsk, Osa) are analyzed. The phylogenetic diversity and wide distribution of the family Micrococcaceae representatives in various biotopes of the Verkhnekamskoe salt deposit mining area are shown. A variety of species of the Micrococcaceae family bacteria was revealed in the soil and rhizosphere of plants growing near salt dumps. Based on the analysis of the 16S rRNA gene, the studied strains of the family Micrococcaceae were assigned to seven genera: Arthrobacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Micrococcus, Kocuria, Nesterenkonia, Rothia. The studied cultivated bacteria of the family Micrococcaceae, isolated from ecotopes with extreme environmental conditions, are promising for their further use for biotechno-logical purposes.
Key words:Micrococcaceae; identification; 16S rRNA gene; salinization; polluted ecotopes.
Введение
Micrococcaceae - семейство порядка Actinomycetales, включающее роды грамположи-тельных, облигатно и факультативно аэробных бактерий, имеющих широкое распространение в почвенных и водных экосистемах. Типовым для семейства является род Micrococcus, впервые описанный Cohn F. в 1872 г. Семейство Micrococcaceae, предложенное E. Pribram [1929], было в дальнейшем изменено E. Stackebrandt с коллегами
[1997] на основе последовательностей гена 16S рРНК. Помимо типового рода Micrococcus, в семейство были включены роды Arthrobacter [Conn, Dimmick, 1947], Kocuria [Koch, Schumann, Stackebrandt, 1995], Nesterenkonia [Stackebrandt et al., 1995], Renibacterium [Sanders, Fryer, 1980], Rothia [Georg, Brown, 1967], Stomatococcus [Bergan, Kocur, 1982], Citricoccus [Altenburger et al., 2002], Acaricomes [Pukall et al., 2006], Zhihen-gliuella [Zhang et al., 2007], Yaniella [Li, Zhi, Euzeby, 2008], Sinomonas [Zhou et al., 2009], Auri-
© Ястребова О. В., Плотникова Е. Г., 2020
tidibacter [Yassin et al., 2011] и Enteractinococcus [Cao et al., 2012]. В 2016 г. виды рода Arthrobacter были реклассифицированы в отдельные 5 родов семейства: Paenarthrobacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Paeniglutamicibacter, Pseudoglu-tamicibacter [Busse, 2016].
Представители семейства Micrococcaceae встречаются в морских экосистемах, в тканях растений, на поверхности кожи млекопитающих, а также являются типичными обитателями почвенных экосистем. Бактерии данного семейства присутствуют как в загрязненных, так и в неподверженных антропогенному воздействию почвах, где представляют значимую часть культивируемых микроорганизмов. Среди представителей семейства Micrococcaceae описаны деструкторы устойчивых, токсичных органических соединений, в том числе полициклических ароматических углеводородов и фталатов [Hu, Yang, Wang, 2015; Vandera et al., 2015]. В семействе Micrococcaceae обнаружены галофильные виды, принадлежащие к родам Nesterenkonia и Kocuria, имеющие оптимум роста в средах с повышенным содержанием соли, а также галотолерантные бактерии рода Arthrobacter [Kushner, 1978; Hamedi, Mohammadipanah, Vento-
sa, 2013].
Цель работы - филогенетическая характеристика бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из разных экотопов Пермского края.
Материалы и методы исследования
Из рабочей коллекции микроорганизмов Лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии Института экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН отобран 41 штамм бактерий, идентифицированных ранее как представители семейства Micrococcaceae. Исследуемые штаммы были выделены из различающихся по физико-химическим условиям среды экотопов: образцов калийных солей (каменная соль, карналлит) из Верхнекамского месторождения калийно-магние-вых солей (ВКМС); техногенно-минеральных образований (ТМО); почв, грунтов и донных отложений, загрязненных отходами химических и соледобывающих производств (г. Березники, Соликамск, Пермский край), из почвы сельскохозяйственного использования (г. Оса, Пермский край), активного ила очистных сооружений г. Перми (табл. 1).
Таблица 1
Штаммы и источники выделения бактерий сем. Micrococcaceae
Источник выделения
Штамм
Калийные соли (ВКМС)
Каменная соль (глубина 239.7-239.8 м) 38-1
Карналлит (глубина 254.2-254.4 м) 43-1
Каменная соль (глубина 372.2-372.4 м) 69-6
Каменная соль (глубина 411.5-411.6 м) 72-1
72-2
72-4
Глина (мергель, глубина 326.9-327.0 м) YKS63
Соледобывающие предприятия (г. Березники)
ТМО, шламохранилище (глубина 0.5 м) BO19
ТМО, шламохранилища (глубина 0.2 м) ВО37
ТМО2, шламохранилище (глубина 0.2 м) BO25
ТМО2, шламохранилище (глубина 0.4 м) BO34-1
ТМО2, шламохранилище (глубина 0.3 м) BO21
Почва на расстоянии 500 м от солеотвала B1
Почва на расстоянии 5 м от солеотвала SN17 (ВКМ Ас-2065)
Почва на расстоянии 500 м от солеотвала SMB11 (ВКМ Ас-2552)
SMB145 (ВКМ Ас-2551)
SF27 (ВКМ Ас-2063)
Донные отложения р. Зырянка, вблизи солеотвала DF14 (ВКМ Ас-2064)
Почва/грунт на расстоянии 3-10 м от солеотвала B901 ВКМ Ac-2548
B904 (ВКМ Ac-2549)
B905 (ВКМ Ac-2550)
Донные отложения промышленных стоков, «Промканал» PD13
Ризосферная почва бескильницы расставленной (Puccinellia distans), около солеотвала PB8-1
Окончание табл. 1
Источник выделения
Штамм
Соледобывающие предприятия (г. Соликамск)
Ризосферная почва бескильницы расставленной (Puccinellia distans), 4 м от рассолосборника, около солеотвала BR3-22(1)
BR3-22(2)
BR4-2
Ризосферная почва ежи сборной (Dactylis glomerata), около солеотвала (загрязнение дизельным топливом) NDT16
NDT18
EDT13
Ризосферная почва мятлика лугового (Poa pratensis), 5-10 м от со-леотвала M56-102
104
ML 17
М87-1
М46-10
M45-1N
Ризосферная почва мятлика лугового (Poa pratensis), 20 м от солеот-вала 72
M55-2N
M55-5N
ООПТ «Осинская лесная дача» (г. Оса)
Почва WD25
Биологические очистные сооружения (г. Пермь)
Активный ил SA7
SA14
Для уточнения таксономического положения отобранных штаммов были проведены амплификация, секвенирование и филогенетический анализ гена 16S рРНК. Чистые культуры бактерий выращивали на агаризованной богатой среде Раймонда [Raymond, 1961] с добавлением 5 г/л триптона и 2.5 г/л дрожжевого экстракта в качестве ростовых субстратов.
Выделение ДНК из биомассы колоний, выросших на агаризованной среде, осуществляли методом щелочного лизиса. Единичная колония культуры помещалась в пробирку «эппендорф», содержащую 100 мкл 0.05N NaOH. Смесь инкубировали при температуре 95оС 15 мин., затем охлаждали в течение 15 мин. при температуре 20°С и центрифугировали при 12 000 об/мин 2 мин. Для проведения амплификации генов 16S рРНК отбирали 1 мкл супернатанта лизата.
Амплификацию гена 16S рРНК проводили с использованием бактериальных праймеров 27F ^-AGAGTTTGATCCA/QTGGCTCAG^) и 1492R (5* -ACGG(C/T)TACCTTGTTACGACTT-3') на приборе My Cycler "Bio-Rad Laboratories" (США) согласно описанию [Weisburg et al., 1991]. Определение нуклеотидных последовательностей проводили с применением набора реактивов Big Dye Terminator Cycle Sequencing Kit v. 3.1 на автоматическом секвенаторе Genetic Analyser 3500XL "Applied Biosystems" (США) согласно рекомендациям производителя.
Филогенетический анализ полученных нуклео-тидных последовательностей 16S рДНК осуществляли с использованием программ CLUSTAL W (http://www.ebi.ac.uk/clustalw), Sequence Scanner v
2.0. Поиск гомологичных последовательностей осуществляли при использовании баз данных GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) и EzTaxon (http://www.eztaxon.org). Филогенетическое дерево строили с помощью программы MEGA7 c использованием метода «neighbor joining» [Kumar, 2016].
Результаты и их обсуждение
Штаммы бактерий, изолированные из различных экотопов Пермского края (табл. 1), были идентифицированы на основании анализа гена 16 S рРНК, как представители класса Actinobacteria, порядка Micrococcales, семейства Micrococcaceae. Исследуемые штаммы были отнесены к родам: Ar-throbacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Micrococcus, Kocuria, Nesterenkonia, Rothia.
Бактерии рода Arthrobacter
Девять штаммов бактерий рода Arthrobacter были изолированы из образцов почвы и донных отложений водоемов, отобранных в районе разработок ВКМС (табл. 1, 2). Восемь штаммов были близкородственны виду А. crystallopoietes (сходство с типовым штаммом вида по генам 16S рРНК составляло 99.7-99.89%) (табл. 2).
Штамм M56-102 наиболее близок виду A. echini (сходство по генам 16S рРНК - 98.05%) (табл. 2).
На дендрограмме, показывающей филогенетические отношения исследуемых бактерий родов Arthro-bacter, Glutamicibacter и Pseudoarthrobacter, показано, что данные штаммы разделяются на четыре кластера, имеющих отдельные ветви. Восемь штаммов
рода Arthrobacter группируются с типовым штаммом вым штаммом вида A. echini, (рис. 1). вида A. crystallopoietes, а штамм M56-102 - с типо-
Таблица 2
Результаты филогенетического анализа штаммов рода Arthrobacter
Штамм Типовой штамм ближайшего родственного вида, номер в базе данных GenBank Количество сравниваемых нуклеотидов Сходство генов 16S рРНК, %
B1 Arthrobacter crystallopoietes DSM 20117T (Х80738) 512 99.61
SMB11 B901 B904 B905 SMB145 Arthrobacter crystallopoietes DSM 20117T (Х80738) 1400 99.70
SF27 Arthrobacter crystallopoietes DSM 20117T (Х80738) 1400 99.85
DF14 Arthrobacter crystallopoietes DSM 20117T (Х80738) 940 99.89
M56-102 Arthrobacter echini AM23T (NR 148833) 871 99.00
Ранее было установлено, что выделенные штаммы Arthrobacter spp. обладают широкой субстратной специфичностью и способны к росту на моно- и полиароматических углеводородах, а также фталатах при культивировании в присутствии 3%-ного №0. Все штаммы использовали орто-фталат (орто-ФК) и ди-бутилфталат (ДБФ), протокатеховую кислоту, а также нафталин в качестве единственного источника углерода и энергии; два штамма ^27 и DF14) растут также на фенантрене [Плотникова и др., 2011; Татарских, Корсакова, 2014].
Бактерии рода Pseudoarthrobacter
Четыре штамма, изолированных из шламохра-нилища соледобывающего предприятия (штаммы BO21, BO19, BO34-1) и из донных отложений промышленных стоков г. Березники (штамм PD13), ранее были идентифицированы как представители рода Arthrobacter, однако согласно новой классификации, основанной на данных хемо-таксономических характеристик и филогенетическом анализе [Busse, 2016], были отнесены к новому роду Pseudoarthrobacter (табл. 3).
Таблица 3
Результаты филогенетического анализа штаммов рода Pseudoarthrobacter
Штамм Типовой штамм ближайшего родственного вида и номер в базе данных GenBank Количество сравниваемых нуклеотидов Сходство генов 16S рРНК, %
PD13 Pseudoarthrobacter siccitolerans 4J27 (NR108849) 850 99,03
BO21 Pseudoarthrobacter oxydans DSM 20119T 1388 99,20
BO19 Pseudoarthrobacter oxydans DSM 20119T (Х83408) 1233 100
BO34-1 Pseudoarthrobacter oxydans DSM 20119T (Х83408) 1401 100
Штаммы BO21, BO19 BO34-1 были близкородственны штамму P. oxydans DSM 20119T (сходство по гену 16S рРНК 99,20-100%), штамм PD13 показал сходство на уровне 99,03% с типовым штаммом вида P. siccitolerans. Филогенетический анализ, основанный на сравнении нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК, показал, что исследуемые бактерии рода Pseudoarthrobacter находятся в одном кластере со штаммами видов P. oxydans, P. phe-nantrenivorans и P. siccitolerans (рис. 1).
Как было показано ранее, выделенные штаммы рода Pseudoarthrobacter способны к утилизации ароматических субстратов, в частности орто-ФК, ДБФ, нафталина, салицилата, бензоата [Корсакова, Пьянкова, Плотникова, 2013; Гагарских, Корсакова, 2014; Гагарских, Ястребова, 2017].
Бактерии рода Glutamicibacter
Девять штаммов, выделенных из образцов почв района солеразработок: почвы вблизи солеотвала
(штаммы SN17, PB8-1, NDT16, NDT18, EDT13), шламохранилища (штамм BO25), рассолосборника (штаммы BR3-22(1), BR3-22(2), BR4-2), были ранее отнесены к роду Arthrobacter [Плотникова и др. 2011; Гагарских, Корсакова 2014]. Однако на основании новой классификации, предложенной Busse [Busse, 2016], штаммы были реклассифици-рованы как представители рода Glutamicibacter.
Штаммы SN17 и PB8-1 показали наибольшее сходство с типовым штаммом вида G. arilaitensis (100%-ное сходство по гену 16S рРНК), штаммы BO25, BR4-2, NDT16, NDT18 и EDT13 близкородственны G. nicotianae DSM 20123T (сходство -98,85-99,25%), штаммы BR3-22(1) и BR3-22(1) наиболее близки G. halophytocola KLBMPT (сходство 99,00 -99,41%) (табл. 4). В то же время, на дендрограмме (рис. 1), показывающей филогенетические отношения исследуемых бактерий (ген 16S рРНК), видно, что штаммы BR3-22(1), BR3-22(2), EDT13, NDT16, NDT18, BR4-2, BO25 рас-
полагаются на одной ветви (составляют один кластер) со штаммом вида О. 1ш1ор1Шосо1а. Штаммы
64
PB8-1, SN17 хорошо кластеризуются с типовым
штаммом вида G. arilaitensis (рис. 1).
ВR3-22Cl J, BR3-22P)
ffli/tomiriictrteriiotofiivtiro'DKLBfïlP EUSD' (JX333762) ЕОТ13 NBT16 BR4-2 NDT18 BCGE
Gtutamiciboc1Ernit:otiDnaeDSN\20l23l (NF; D2G19D) PB8-1 ■-5N17
GlutDmicitKxmrDrtiDilEnxs Fié 117 (NF; 074608) GltttamicibactErbergej-ei CalLlh1 (NR 025612) ~Gtvtaf7?icibactE{- protaphoimioe DSM 201 68' (NR 026135)
¿rtbrabacter ginsengisati DCi'yl (KF212463) ¿rthrobacter gtobiformis 13321 (NR 112192) ixudortbrobactETSulfiimva-ans&LV (NR 0 2 5 084) Ж-tbrobacteroryiaeKV-651' (NR 041545) ¿rthroboctETpascens DSM 20545' (NR 026131) ВМЭ BGG1 ВОЗИ РШЗ
(NR 074770)
°5ecjtionrthrcboctercxydon5riSN\2011%1 (NR 026236) ^seudoorthroboctersicciiDteronsmT1 (NR 108S43)
64r-M 36-102
'-Arthrabocter echini AM2 3' (N R 1488 33 )
I-A-tfcroiiDrtH-Dä^i DSM 20550' (NR 0 2 61 38)
'—А-Лгабогсн-ргггоизтраеТрг1 (NR 133363) -А-Лгайоян-гажю CMS30' (NR 028925) -A-rtTroÎjDftertofEenssCAlS-S1 (NR 025665)
SF27 □Fl 4
SMB11, 01 ВЭ05, ВЭ01, ВЭШ SMB145
A-tkroboctercrystatlopoietes DSM20117 (NR 026183)
Рис. 1 . Дендрограмма, отображающая филогенетическое положение штаммов родов Arthrobacter,
Pseudoarthrobacter и Glutamicibacter
Таблица 4
Результаты филогенетического анализа штаммов рода Glutamicibacter
Штамм Типовой штамм ближайшего родственного вида и номер в базе данных вепБапк Количество сравниваемых нуклеотидов Сходство генов 16S рРНК, %
SN17 Glutamicibacter arilaitensis Яе117 т (ЫЯ. 074608) 823 100
PB8-1 856
NDT16 Glutamicibacter nicotianae Б8М 20123т (ЫЯ. 026190) 873 98.85
NDT18 916
BR4-2 Glutamicibacter nicotianae Б8М 20123т (ЫЯ 026190) 847 99.00
BO25 Glutamicibacter nicotianae Б8М20123т (ЫЯ 026190) 823 99.10
EDT13 Glutamicibacter nicotianae Б8М 20123т (ЫЯ 026190) 1340 99.25
BR3-22(1) Glutamicibacter halophytocola КЬБМРт (1X993762) 850 99.00
BR3-22(2) Glutamicibacter halophytocola КЬБМРт (1X993762) 848 99.41
Исследуемые штаммы Glutamicibacter Брр., как было установлено ранее, способны к деструкции фта-латов (орто-ФК, ДБФ), бензоата, а штаммы БШ7,
BO25 - к разложению нафталина и салицилата [Плотникова и др., 2011; Корсакова, Пьянкова, Плотникова, 2013; Гагарских, Корсакова, 2014].
Бактерии рода Micrococcus
BO37 - из образца ТМО шламохранилища, а штамм 104 - из ризосферной почвы мятлика лугового (табл. 1). Все штаммы, согласно анализу генов 16 S рРНК, близкородственны Micrococcus lu-teus ATCC 4698T на уровне 99.13-100% (табл. 5, рис. 2).
Таблица 5
Результаты филогенетического анализа штаммов рода Micrococcus
Восемь штаммов бактерий рода Micrococcus выделены из разных биотопов района солеразработок: шесть штаммов - из образцов калийных солей, отобранных с глубины 254.2-411.6 м; штамм
Штамм Типовой штамм ближайшего родственного вида и номер в базе данных GenBank Количество сравниваемых нуклеотидов Сходство генов 16S рРНК, %
69-6 Micrococcus luteus NCTC 2665T (CP001628) 814 99.13
38-1 Micrococcus luteus NCTC 2665T (CP001628) 1383 99.57
43-1 Micrococcus luteus NCTC 2665T (CP001628) 1237 99.59
YKS63 Micrococcus luteus NCTC 2665T (CP001628) 752 99.73
72-1 739
72-4 Micrococcus luteus NCTC 2665T (CP001628) 784 100
ВО37 500
104 886
ЗА
BO37
YKS63 38-1 43-1 69-6 72-1, 72-4 104
Micrococcus luteus ATCC 4698T (CP 035298) Micrococcus aloeverae AE-6T (NR 134088) Micrococcus yunnanensis YIM 65004T (NR 116578)
-Micrococcus lylae DSM 20315T (NR 026200)
-Micrococcus endophyticus YIM 56238T (NR 044365)
-Citricoccus nitrophenolicus PNP1T (NR 117546)
-Micrococcus terreus V3M1T (NR 116649)
5Э
-Micrococcus cohnii WS4601T (NR 117194)
-Micrococcus antarcticus T2T (NR 025285.1)
-Micrococcus flavus LW4T (NR 043881)
0.005
Рис. 2. Дендрограмма, отображающая филогенетическое положение штаммов рода Micrococcus
Установлено, что все исследуемые штаммы рода Micrococcus способны к утилизации бензоата, а штаммы YKS63, 43-1 и 72-1 растут также на ор-то-ФК, но не способны к деструкции полиароматических углеводородов [неопубликованные данные].
Бактерии рода Kocuria
Штаммы рода Kocuria были выделены из ризосферы мятлика лугового, произрастающего на за-
соленной почве (5 штаммов), один штамм - из глубинной породы каменной соли и один штамм -из почвы агроэкосистемы (табл. 1). Выделенные штаммы близкородственны (по гену 16 S рРНК) c типовыми штаммами трех видов рода Kocuria: K. arsenatis, K. rosea, K. polaris (табл. 6, рис. 3).
Филогенетический анализ, основанный на сравнении нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК, показал, что исследуемые бактерии рода Kocuria разделяются на 3 кластера: штамм ML 17 находится в одном кластере с видами K. ar-
senatis и K. rhizophila, штамм M45-1N - на одной ветви со штаммом K. polaris, а штаммы М46-10, 72 и 72-2 - в кластере с видом K. rosea (рис. 3). Штамм M87-1 представлен на отдельной ветви,
имеет небольшой процент сходства (98.94%) с типовым штаммом вида Kocuria arsenatis, в дальнейшем может представлять интерес для описания нового таксона (вида) рода Kocuria.
Таблица 6
Результаты филогенетического анализа штаммов рода Kocuria
Штамм Типовой штамм ближайшего родственного вида и номер в базе данных GenBank Количество сравниваемых нуклеотидов Сходство генов 16S рРНК, %
WD25 Kocuria arsenatis CM1E1T (KM874399) 918 99,78
М87-1 Kocuria arsenatis CM1E1T (KM874399) 941 98,94
ML17 Kocuria arsenatis CM1E1T (KM874399) 895 100
M45-1N Kocuria polaris CMS 76orT (AJ278868) 743 99,70
М46-10 Kocuria rosea DSM 20447T (X87756) 892 99,66
72-2 Kocuria rosea DSM 20447T (X87756) 721 99,77
72 Kocuria rosea DSM 20447T (X87756) 860 100
Как показано ранее, штаммы Kocuria sp. WD25 и ML17 обладают широкой субстратной специфичностью и способны к деструкции ряда моно- и полиароматических углеводородов: фенантрена, нафталина, бензоата, а также орто-ФК и ДБФ [Юдин, Ястребова, Плотникова, 2019].
Бактерии рода Nesterenkonia
Два штамма M55-5N и M55-2N рода Nesteren-konia были выделены из ризосферы мятлика лугового, произрастающего на засоленной почве (табл. 1). На основании анализа гена ^ рРНК штаммы отнесены к виду N. halotolerans со сходством 100% с типовым штаммом вида. На дендро-грамме данные штаммы находятся в одном кластере с типовым штаммом вида N. halotolerans (рис. 4).
Показано, что исследуемые штаммы рода Nesterenkonia не обладают деградативной активностью в отношении моно- и полиароматических углеводородов и фталатов [неопубликованные данные].
Бактерии рода Rothia
Два штамма рода Rothia были выделены из образца активного ила биологических очистных сооружений предприятия ОАО «Сибур-Химпром» (г. Пермь).
Как показал филогенетический анализ, исследуемые штаммы SA7 и SA14 находятся в одном кластере с типовым штаммом вида R. amarae (рис. 5). Сходство по генам 16S рРНК составляет 99.88% (штамм SA7) и 100% (штамм SA14).
Установлено, что выделенные штаммы Rothia sp. SA7 и SA14 растут на бензоате и орто-ФК, но не способны к росту на сложных эфирах
фталевой кислоты [Ястребова, Юдин, Плотникова, 2019].
Заключение
В результате проведенной работы были исследованы бактерии семейства Micrococcaceae (порядок Actinomycetales), выделенные из различных биотопов Пермского края. Показано филогенетическое разнообразие и широкое распространение представителей семейства Micrococcaceae: штаммы были выделены из образцов почв и ризосферы растений, образцов шламов, активного ила очистных сооружений, а также соленосной толщи Верхнекамского месторождения (породы карналлита и каменной соли). Наибольшее разнообразие видов бактерий семейства Micrococcaceae было выявлено в почве и ризосфере растений, произрастающих вблизи солеотвалов. На основании анализа гена 16S рРНК исследуемые штаммы семейства Micrococcaceae были отнесены к семи родам: Arthrobacter (9 штаммов), Pseudoarthrobacter (4 штамма), Glutamicibacter (9 штаммов), Micrococcus (8 штаммов), Kocuria (7 штаммов), Nesterenkonia (2 штамма), Rothia (2 штамма). Среди исследованных бактерий сем. Micrococcaceae наибольшей субстратной специфичностью по отношению к моно- и полиароматическим углеводородам и фталатам обладали штаммы родов Arthro-bacter и Glutamicibacter.
Полученные данные расширяют наши представления о бактериях семейства Micrococcaceae -представителях микрофлоры экосистем с повышенным засолением среды и высокой промышленной нагрузкой. Штаммы бактерий данного семейства являются перспективными для разработки на их основе биотехнологий очистки загрязненных почв и промышленных стоков.
62
72
Коемпа тзва ББМ 20447т (МЫ840035)
М46-10
72-2
-Коемпа ж1та Иу14Ът (Ж 159199)
М45-Ш
ео КоемпароЬпз СМБ 76отт (КХ959605) Коемпа Ытаека1впз1з 1СМ 13326т (ЬС113906)
-РавпаНкгоЬаМвг nitгogмajaеoliемs О2-1т (МК424299)
57
—Коемпа ав^рйа УГМ 70003т (Ж 043511)
-Коемпа dвеhangвnsis ЖЛи-8т5-33т (Ж 137239)
-Коемпа оеват ЕХ18.095т (Ж 156033)
-Коемпа/1ауа Н0-9041т (СР013254)
-Коемпа зваШтз ЕСБ-11т (Ж 118222)
-Коемпа tмrfanвnsis Н0-9042т (МЫ826469)
Г
: I—I
78 Коемпа tмrfanвnsis Н0-9042т (СР014480) -Коемпа змЬДауа УГМ 13062т (Ж 144586)
100 \Kocuria аяяатетгя 89-65т (КТ989850) Коемпа раШпз тЛОЛ27т (Ж 026451)
—Коемпа halotolвrans УГМ 90716т (Ж 044025) -Коемпа korввnsis Р31т (Ж 116745)
92
100 IКосипа uropygioeca 257т (N5. 157676) Ъ^Коемпа мropygialis 36т (Ж 157675) -Коемпа тапша КММ 3905т (Ж 025723) -Коемпа Меа ЫГ0-1021т (Ж 133767)
-КоемпарвЬрЫЬ ЯБ-2-3т (Ж 151938)
7Б
89 \Kocuria сатгрЫЬ ССМ 132т (Ж 027193) Тоемпа аМщав Р30т (КГ989856)
-Коемпа gwangalliвnsis Б12т (ЫЪ 116266)
70 |-М87-1
Г
Коемпа tytoniеola 489т (МО 547560)
79
-Коемпа заЫ^а 104т (Ж 117299) -Коемпа уапат ЛтСС 15306т (Ж 114674)
95 59
МЬ17
Косипа агзепаий СМ1Е1Т (Ж 148610) Коемпа ^орЫЬ ББМ 11926т (Ю476722)
0.002
Рис. 3. Дендрограмма, отображающая филогенетическое положение штаммов рода Коемпа
8Б
7Б
ЭЭ
52
78
M55-5N
Nesterenkonia halotolerans YIM70084T (NR 029073) M55-2N
Nesterenkonia sandarakina YIM 70009T (NR 029119)
78 1-Nesterenkonia jeotgali JG-241T (NR 043279)
_I Nesterenkonia lutea YIM 70081T (NR 029120)
Nesterenkonia luteus YIM 70081T (AY588278) - Nesterenkonia aurantiaca CK5T (NR 148812)
-Citricoccus lacusdiani JXJ CY211 (KT318581)
£
Nesterenkonia halobia DSM 20541Т (NR 026197) 100 I— Nesterenkonia halophile YIM 70179Т (NR 043205)
- Nesterenkonia xinjiangensis УЖ70097Т (NR 029075)
- Nesterenkonia suensis Sua-BAC020'r (NR 116866)
55
- Nesterenkonia aethiopica DSM 17733Т (NR 042989)
-Nesterenkonia lacusekhoensis EL-301 (NR 028928)
-Nesterenkonia cremea 10СТ (NR 156955)
-Nesterenkonia flava CAAS 251T (NR 044353)
-Nesterenkonia alba CAAS 252Т (NR 044527)
Nesterenkonia massiliensis NP11 (NR 144709)
I Nes
100 I-
Nesterenkonia rhizosphaerae EGI 80099Т (NR 134096)
h
0.005
4
Рис. 4. Дендрограмма, отображающая филогенетическое положение штаммов рода Nesterenkonia
SA7
100
91
65
91
SA14
Rothia amarae J18T (NR 029045) ^ Rothia aerolata CCM 8669т (MT760050) — Rothia kristinae DSM 20032Т (NR 026199) Kocuria subflava YIM 13062Т (NR 144586) Г Rothia terrae L-143T (NR 043968) Rothia nasimurium CCUG 35957Т (NR 025310) Rothia marina JSM 078151Т (FJ425908) Rothia endophytica YIM 67072Т (NR 109752) Rothia mucilaginosa DSM 20746Т (NR 044873) Rothia dentocariosa ATCC 17931Т (NR 074568) -Rothia aeria A1-17B1 (AP017895)
h
0.1
4
Рис. 5. Дендрограмма, отображающая филогенетическое положение штаммов рода Rothia
Работа выполнена в рамках государственного задания, номер госрегистрации темы: АААА-А19-119112290008-4, и при финансовой поддержке РФФИ и Министерства образования и науки Пермского края в рамках научного проекта19-44-590011 р_а.
Библиографический список
Гагарских О.Н., Корсакова Е.С. Галотолерантные бактерии рода Arthrobacter, выделенные из загрязненных почв и отходов соледобывающих предприятий Пермского края // Симбиоз -Россия 2014: материалы VII Всероссийского Конгресса молодых биологов. Екатеринбург, 2014. С. 105-107. Гагарских О.Н., Ястребова О.В. Характеристика галотолерантого штамма-деструктора фталатов Arthrobacter sp. PD13-12 // Симбиоз - 2017: X Всерос. конгресс молодых ученых-биологов: сб. тез. Казань, 2017. C. 75-76. Корсакова Е.С., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы стойких органических загрязнителей - эфиров фталевой кислоты, как основа для создания новых экобиотехнологий // Известия Самарского научного центра РАН. 2013. Т. 15, № 3 (5). С. 1633-1636. Плотникова Е.Г. и др. Галотолерантные бактерии рода Arthrobacter - деструкторы полициклических ароматических углеводородов // Экология. 2011. № 6. С. 459-466. Юдин Д.С., Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Характеристика бактерий рода Ko^ria - активных деструкторов фталатов // VI Международная конференция молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов: сб. тез. Новосибирск, 2019. С. 236-239.
Ястребова О.В., Юдин Д.С., Плотникова Е.Г. Выделение и характеристика смешанных культур и бактерий-деструкторов фталатов // Утилизация и рециклинг отходов производства и потребления: инновационные подходы и технологии: I Всерос. науч.-практ. конф. Киров, 2019. С. 160-162. Altenburger P. et al. Citricoccus muralis gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated from a medieval wall painting // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2002. Vol. 52. P. 2095-2100. Bergan T., Kocur M. Stomatococcus mucilagi-nosus gen. nov., sp. nov., ep. rev., a member of the family Micrococcaceae // International journal of systematic bacteriology. 1982. Vol. 32. P. 374-377.
Busse H.J. Review of the taxonomy of the genus Arthrobacter, emendation of the genus Arthrobacter sensu-lato, proposal to reclassify selected species of the genus Arthrobacter in the novel genera Glutamicibac-ter gen. nov., Paeniglutamicibacter gen. nov., Pseudoglutamicibacter gen. nov., Paenarthrobacter gen. nov. and Pseudarthrobacter gen. nov., and emended description of Arthrobacter roseus // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2016. Vol. 66. P. 9-37.
Cao Y.R. et al. Enteractinococcus coprophilus gen. nov., sp. nov., of the family Micrococcaceae, isolated from Panthera tigris amoyensis faeces, and transfer of aniella fodinae Dhanjal et al. 2011 to the genus Enteractinococcus as Enteractinococ-cus fodinae comb. nov. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2012. Vol. 62. P. 2710-2716.
Cohn F. Untersuchungen über Bakterien // Beiträge zur Biologie der Pflanzen.1872. Vol. 1 (Heft II). P. 127-224.
Conn H.J., Dimmick I. Soil bacteria similar in morphology to Mycobacterium and Corynebacterium // Journal of Bacteriology. 1947. Vol. 54. P. 291-303.
Hamedi J., Mohammadipanah F., Ventosa A. Systematic and biotechnological aspects of halophilic and halotolerant actinomycetes // Extremophiles. 2013. Vol. 17. P. 1-13.
Hu J., Yang Q., Wang J.L. Biodegradation of di-n-butyl phthalate in sequencing batch reactor bio-augmented with Micrococcus sp. and the bacterial community analysis // International Journal of Environmental Science and Technology. 2015. Vol. 12. P. 2819-2828.
Georg L.K., Brown J.M. Rothia, gen. nov. an anaerobic genus of the family Actinomycetaceae // International journal of systematic bacteriology. 1967. Vol. 17. P. 79-88.
Koch C., Schumann P., Stackebrandt E. Reclassification of Micrococcus agilis (Ali-Cohen 1889) to the genus Arthrobacter as Arthrobacter agilis comb. nov., and emendation of the genus Arthro-bacter // International journal of systematic bacteriology. 1995. Vol. 45. P. 837-839.
Kumar S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Molecular Biology and Evolution. 2016. Vol. 33. P. 1870-1874.
Kushner D. Life in high salt and solute concentrations // Microbial life in extreme environments. 1978. P. 317-368.
Li W.J., ZhiX.Y., Euzeby J.P. Proposal of Yaniellace-ae fam. nov., Yaniella gen. nov. and Sinobaca gen. nov. as replacements for the illegitimate pro-karyotic names Yaniaceae //. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology.
2008. Vol. 58. P. 525-527.
Pribram E. A contribution to the classification of microorganisms // Journal of Bacteriology. 1929. Vol. 18. P. 361-394.
Pukall R. et al. Acaricomes phytoseiuli gen. nov., sp. nov., isolated from the predatory mite Phytosei-ulus persimilis // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2006. Vol. 56. P. 465-469.
Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons // Developments in Industrial Microbiology. 1961. Vol. 2, № 1. P. 23-32.
Sanders J.E., Fryer J.L. Renibacterium salmoninar-um gen. nov., sp. nov., the causative agent of bacterial kidney disease in salmonid fishes // International journal of systematic bacteriology. 1980. Vol. 30. P. 496-502.
Stackebrandt E. et al. Taxonomic dissection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesteren-konia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Derma-coccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. // International journal of systematic bacteriology. 1995. Vol. 45. P. 682-692.
Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Ac-tinobacteria classis nov. // International journal of systematic bacteriology. 1997. Vol. 47. P. 479-491.
Vandera E. et al. Comparative proteomic analysis of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 on phe-nanthrene, phthalate and glucose // Journal of Proteomics. 2015. Vol. 113. P. 73-89.
Weisburg W.G. et al. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study // Journal of Bacteriology. 1991. Vol. 173. P. 697-703.
Yassin A.F. et al. Auritidibacter ignavus gen. nov., sp. nov., a novel bacterium of the family Micro-coccaceae isolated from ear swab of a man with otitis externa, transfer of the family Yaniellaceae Li et al. 2008 to the family Micrococcaceae and emended description of the suborder Micrococ-cineae // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2011. Vol. 61. P. 223-230.
Zhang Y.Q. et al. Zhihengliuella halotolerans gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Mi-crococcaceae // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2007. Vol. 57. P. 1018-1023.
Zhou Y. et al. Proposal of Sinomonas flava gen. nov., sp. nov., and description of Sinomonas atrocyanea comb. nov. to accommodate Arthrobacter atrocy-aneus // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2009. Vol. 59. P. 259-263.
References
Altenburger P., Kämpfer P., Schumann P., Steiner R.,
Lubitz W., Busse H.-J. Citricoccus muralis gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated from a medieval wall painting. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 52 (2002): pp. 2095-2100.
Bergan T., Kocur M. Stomatococcus mucilagi-nosus gen. nov., sp. nov., ep. rev., a member of the family Micrococcaceae International journal of systematic bacteriology. V. 32 (1982): pp. 374377.
Busse H.J. Review of the taxonomy of the genus Ar-throbacter, emendation of the genus Arthrobacter sensulato, proposal to reclassify selected species of the genus Arthrobacter in the novel genera Glu-tamicibacter gen. nov., Paeniglutamicibacter gen. nov., Pseudoglutamicibacter gen. nov., Paenar-throbacter gen. nov. and Pseudarthrobacter gen. nov., and emended description of Arthrobacter roseus. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 66 (2016): pp. 937.
Gagarskikh O.N., Korsakova Ye.S. [Halotolerant bacteria of the genus Arthrobacter, isolated from contaminated soils and wastes of salt mining enterprises of the Perm Region]. Simbioz-Rossija 2014. Materialy VII Vserossijskogo Kongressa molodych biologov [Symbiosis-Russia 2014. Materials of the VII All-Russian Congress of Young Biologists]. Ekaterinburg. 2014, pp. 105-107. (In Russ.).
Gagarskikh O.N., Yastrebova O.V. [Characteristics of the halotolerant phthalate destructor strain Arthrobacter sp. PD13-12]. Simbioz - 2017. X Vse-rossijskiy kongress molodych ucenych-biologov [Symbiosis - 2017. X All-Russian Congress of Young Biological Scientists]. Kazan, 2017, pp. 75-76. (In Russ.).
Cao Y.R., Jiang Y., Jin R.X., Han L., He W.X., Li Y.L., Huang X.S., Xue Q.H. Enteractinococcus coprophilus gen. nov., sp. nov., of the family Mi-crococcaceae, isolated from Panthera tigris am-oyensis faeces, and transfer of aniella fodinae Dhanjal et al. 2011 to the genus Enteractinococcus as Enteractinococcus fodinae comb. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 62 (2012): pp. 2710-2716.
Cohn F. Untersuchungen über Bakterien Bertr. Biol. Pflanz. V. 1 (Heft II) (1872): pp. 127-224.
Conn H.J., Dimmick I. Soil bacteria similar in morphology to Mycobacterium and Corynebacterium. Journal of Bacteriology. V. 54 (1947): pp. 291303.
Hamedi J., Mohammadipanah F., Ventosa A. Systematic and biotechnological aspects of halophilic and halotolerant actinomycetes. Extremophiles. Vol. 17 (2013): pp 1-13.
Hu J., Yang Q., Wang J.L. Biodegradation of di-n-butyl phthalate in sequencing batch reactor bio-
augmented with Micrococcus sp. and the bacterial community analysis. International Journal of Environmental Science and Technology. V. 12 (2015): pp. 2819-2828.
Georg L.K., Brown J.M. Rothia, gen. nov. an anaerobic genus of the family Actinomycetaceae. International journal of systematic bacteriology. V. 17 (1967): pp. 79-88.
Koch C., Schumann P., Stackebrandt E. Reclassification of Micrococcus agilis (Ali-Cohen 1889) to the genus Arthrobacter as Arthrobacter agilis comb. nov. and emendation of the genus Arthro-bacter. International journal of systematic bacteriology. V. 45 (1995): pp. 837-839.
Korsakova E.S., Pyankova A.A., Plotnikova E.G. [Bacteria-destructors of persistent organic pollutants - phthalic acid esters, as a basis for the creation of new ecobiotechnologies]. Izvestija Samarskogo naucnogo centra RAN. V. 15, N 3(5) (2013): pp. 1633-1636. (In Russ.).
Kumar S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution V. 33 (2016): pp. 18701874.
Kushner D. Life in high salt and solute concentrations In: Microbial life in extreme environments. 1978, pp. 317-368.
Li W.J., Zhi X.Y., Euzéby J.P. Proposal of Yan-iellaceae fam. nov., Yaniella gen. nov. and Sino-baca gen. nov. as replacements for the illegitimate prokaryotic names Yaniaceae. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 58 (2008): pp. 525-527.
Plotnikova E.G., Yastrebova O.V., Anan'ina L.N., Dorofeeva L.V., Lysanskaya V.Ya., Demakov V.A. [Halotolerant Bacteria of the Genus Arthrobacter Degrading Polycyclic Aromatic Hydrocarbons]. Russian Journal of Ecology. V. 42, N 6 (2011): pp. 502-509. (In Russ.).
Pribram E A contribution to the classification of microorganisms. Journal of Bacteriology. V. 18 (1929): pp. 361-394.
Pukall R., Schumann P., Schutte C., Gols R., Dicke M. Acaricomes phytoseiuli gen. nov., sp. nov., isolated from the predatory mite Phytoseiulus per-similis. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 56 (2006): pp. 465-469.
Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinichydrocarbons. Developments in Industrial Microbiology. V. 2, N 1 (1961): pp. 23-32.
Sanders J.E., Fryer J.L. Renibacterium salmoninarum gen. nov., sp. nov., the causative agent of bacterial kidney disease in salmonid fishes. International Journal of systematic bacteriology. V. 30 (1980): pp. 496-502.
Stackebrandt E., Koch C., Gvozdiak O., Schumann P.
Taxonomic d
issection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesterenkonia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Dermacoccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. International Journal of systematic bacteriology. V. 45 (1995): pp. 682692.
Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. International Journal of systematic bacteriology. V. 47 (1997): pp. 479-491.
Vandera E., Samiotaki M., Parapouli M., Panayotou G., Koukkou A.I. Comparative proteomic analysis of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 on phenanthrene, phthalate and glucose. Journal of Proteomics. V. 113 (2015): pp. 73-89.
Weisburg W.G., Barns S.M., Pelletier D.A., Lane D.J. 16S ribosomal DNA amplification for phylo-genetic study. Journal of Bacteriology. V. 173, N 2 (1991): pp. 697-703.
Yassin A.F., Hupfer H., Siering C., Klenk H.P., Schumann P. Auritidibacter ignavus gen. nov., sp. nov., a novel bacterium of the family Micrococca-ceae, isolated from ear swab of a man with otitis externa, transfer of the family Yaniellaceae Li et al. 2008 to the family Micrococcaceae and emended description of the suborder Micrococ-cineae. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 61 (2011): pp. 223-230.
Yastrebova O.V., Yudin D.S., Plotnikova E.G. [Isolation and characterization of mixed cultures and phthalate-destroying bacteria]. Utilizacija I reci-kling otchodov proizvodstva I potreblenija [Utilization and recycling of production and consumption waste: innovative approaches and technologies: I all-Russian scientific and practical conference]. Kirov, 2019, pp. 378-385 (In Russ.).
Yudin D.S., Yastrebova O.V., Plotnikova E.G. [Characteristics of bacteria of the genus Kosuria -active destructors of phthalates]. VI Mezdunarod-naja konferencija molodych ucenych: biofizikov, biotechnologov, molekuljarnych biologov i vi-rusologov [VI International conference of young scientists: biophysicists, biotechnologists, molecular biologists and virologists]. Novosibirsk, 2019, pp. 236-239. (In Russ.).
Zhang Y.Q., Schumann P., Yu L.Y., Liu H.Y., Zhang Y.Q., Xu L.H., Stackebrandt E., Jiang C.L., Li W.J. Zhihengliuella halotolerans gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Micrococca-ceae. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 57 (2007): pp. 1018-1023.
Zhou Y, Wei W, Wang X, Lai R. Proposal of Sino-monas flava gen. nov., sp. nov., and description of Sinomonas atrocyanea comb. nov. to accommo-
date Arthrobacter atrocyaneus. International
Journal of Systematic and Evolutionary Microbi- Посгупила в редакцию 15 10 2020
ology. V. 59 (2009): pp. 259-263. ' '
Об авторах
Ястребова Ольга Викторовна, кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии
«Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской академии наук» - филиал ПФИЦ УрО РАН ORCID: 0000-0003-4997-6525 614081, Пермь, ул. Голева, 13; [email protected]; (342)2808431
Плотникова Елена Генриховна, доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии
«Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН
профессор кафедры ботаники и генетики растений
ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» ORCID: 0000-0002-0107-0719 614081, Пермь, ул. Голева, 13; [email protected]; (342)2808431
About the authors
Yastrebova Olga Victorovna, candidate of biology, researcher of laboratory of molecular microbiology and biotechnology
Institute of Ecology and Genetics of Microorganism UB RAS.
ORCID: 0000-0003-4997-6525 13, Golev str., Perm, Russia, 614081; [email protected]; (342)2808431
Plotnikova Elena Genrikhovna, doctor of biology, leading researcher of laboratory of molecular microbiology and biotechnology Institute of Ecology and Genetics of Microorganism UB RAS.
professor of the Department of botany and plant genetics
Perm State University. ORCID: 0000-0002-0107-0719 13, Golev str., Perm, Russia, 614081; [email protected]; (342)2808431
Информация для цитирования:
Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Филогенетическое разнообразие бактерий семейства Micrococca-ceae, выделенных из биотопов с различным антропогенным воздействием // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2020. Вып. 4. С. 321-333. DOI: 10.17072/1994-9952-2020-4-321-333.
Yastrebova O.V., Plotnikova E.G. [Philogenetic diversity of bacteria of the family Micrococcaceae isolated from biotopes with different anthropogenic impact]. Vestnik Permskogo universiteta. Biologija. Iss. 4 (2020): pp. 321-333. (In Russ.). DOI: 10.17072/1994-9952-2020-4-321-333.
