CC BY-ND
13
30
ЗНиСО август №8 (317)
© Голицына Л.Н., Зверев В.В., Селиванова С.Г., Пономарева Н.В., Кашников А.Ю., Созонов Д.В., Сашина Т.А., Епифанова Н.В., Евплова И.А., Резайкин А.В., Сапега Е.Ю., Новикова Н.А., Ефимов Е.И., 2019
УДК 557.083.2 578.522 578.53 578.7 578.835
ЭТИОЛОГИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ЭНТЕРОВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2017-2018 ГГ.
Л.Н. Голицына1, В.В. Зверев1, С.Г. Селиванова1, Н.В. Пономарева1, А.Ю. Кашников1, Д.В. Созонов1, Т.А.Сашина1, Н.В. Епифанова1, И.А. Евплова1, А.В. Резайкин2, Е.Ю. Сапега3, Н.А. Новикова1, Е.И. Ефимов1
:ФБУН «Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной» Роспотребнадзора, ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950, Россия 2ФБУН «Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций» Роспотребнадзора, ул. Летняя, д. 23, г. Екатеринбург, 620030, Россия 3ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора, ул. Шевченко, д. 2, г. Хабаровск, 680610, Россия
При обследовании 4 122 пациентов с различными клиническими формами энтеровирусной инфекции (ЭВИ) в период 2017-2018 гг. тип энтеровирУса был установлен в 2 753 случаях. Идентифицированы вирусы 42 типов, относящиеся к видам Enterovirus A-В-С. Соотношение видов ЭВ-А:ЭВ-В:ЭВ-С составило 51,29:47,06:1,65 %. В образцах из 413 ООС идентифицированы неполиомиелитные энтеровирусы 29 типов, три из которых -СА14, ЭВА76 и ЕСНО25 не были обнаружены в данный период у больных с ЭВИ. Доминирующим агентом в этиологической структуре ЭВИ в 2017 г. на большинстве территорий был вирус Коксаки А6, обусловивший резкий подъем заболеваемости экзантемными формами; ведущими этиологическими агентами энтеровирус-ного менингита (ЭВМ) являлись вирусы ЕСНО30, ЕСНО9, ЕСНО18. В 2018 г. в целом по России наблюдалось снижение заболеваемости как всеми формами ЭВИ, так и ЭВМ вследствие снижения активности циркуляции эпидемических вариантов вирусов Коксаки А6 и ЕСН030. Эпидемический процесс ЭВМ в 2018 г. поддерживался активизировавшимися или сохранившими активность вирусами ЕСНО6, Коксаки В5, ЕСНО9, ЕСНО18 и другими вирусами вида Энтеровирус В. Сохраняющийся относительно высокий уровень заболеваемости экзан-темными формами ЭВИ помимо вируса Коксаки А6 поддерживался активизировавшимися вирусами Коксаки А16, Коксаки А5 и другими вирусами вида Энтеровирус А. Результаты филогенетического анализа последовательностей генома доминировавших этиологических агентов ЭВИ указывают, что в 2018 г. состоялся множественный занос эпидемических вариантов энтеровирусов на территорию РФ, поддержавший эпидпроцесс ЭВИ/ЭВМ в целом по РФ и вызвавший осложнение эпидситуации в ряде субъектов. Не исключено, что этим событиям способствовал приезд большого числа болельщиков на Чемпионат мира по футболу 2018 и безвизовый въезд на территорию РФ для этой категории туристов до конца года. Ключевые слова: энтеровирусная инфекция, менингит, экзантема, энтеровирусы.
Для цитирования: Голицына Л.Н., Зверев В.В., Селиванова С.Г., Пономарева Н.В., Кашников А.Ю., Созонов Д.В., Сашина Т.А., Епифанова Н.В., Евплова И.А., Резайкин А.В., Сапега Е.Ю., Новикова Н.А., Ефимов Е.И. Этиологическая структура энтеровирусных инфекций в Российской Федерации в 2017-2018 гг. // Здоровье населения и среда обитания. 2019. № 8 (317). С. 30-38. DOI: http://doi.org/10.35627/2219-5238/2019-317-8-30-38 L.N. Golitsyna, V.V. Zverev, S.G. Selivanova, N.V. Ponomareva, A.Yu. Kashnikov, D.V. Sozonov, T.A. Sashina, N.V. Epifanova, I.A. Evplova, A.V. Rezaykin, E.Yu. Sapega, N.A. Novikova, E.I. Efimov □ ETIOLOGICAL STRUCTURE OF ENTEROVIRUS INFECTIONS IN THE RUSSIAN FEDERATION IN 2017-2018 □ Academician I.N. Blokhina Nizhny Novgorod Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology, 71 Malaya Yamskaya Str., Nizhny Novgorod, 603950, Russia; Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, 23 Letnaya Str., Ekaterinburg, 620030, Russia; Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology, 2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610, Russia.
Type of enterovirus was detected in 2753 cases when examining 4122 patients with various clinical forms of enterovirus infection (EVI) during the 2017-2018 period. We identified viruses of 42 types belonging to Enterovirus A-B-С species. The ratio of EV-A: EV-B: EV-C species was 51.29 percent: 47.06 percent: 1.65 percent. In 413 environment samples 29 non-polio enteroviruses were identified, three of which, CA14, EVA76 and ECHO25, were not detected in the period in patients with EVI. The Coxsackie A6 virus, which caused a drastic increase in the morbidity of exanthema forms was the dominant agent in the etiological structure of EVI in 2017 in most areas; the leading etiological agents of enteroviral meningitis (ECM) were the ECH030, ECHO9, ECHO18 viruses. There was a decrease in the morbidity of both all forms of EVI and computers due to a decrease in the activity of the circulation of epidemic variants of the Coxsackie A6 and ECH030 viruses as a whole in Russia in 2018. The computer epidemic process in 2018 was supported by the become active or remained active viruses of ECHO6, Coxsacke B5, ECHO9, ECHO18 and other viruses of the Enterovirus B species. The remaining relatively high morbidity of exanthema forms of EVI in addition to the Koksaki A6 virus was supported by the activated viruses Koksaki A16, Koksaki A5 and other viruses of the Enterovirus A species. The results of phylogenetic analysis of genome sequences that dominated etiological agents of EVI indicate that in 2018 there was a multiple importation of enterovirus epidemic variants into the territory of the Russian Federation, which supported the EVI/ computer epidemiological process in the Russian Federation as a whole and caused a complication of the epidemiological situation in a number of subjects. It is possible that these events contributed to the arrival of a large number of fans at the 2018 FIFA World Cup and visa-free entry into the territory of the Russian Federation for this category of tourists until the end of the year.
Keywords: enterovirus infection, meningitis, exanthema, enteroviruses.
For citation: Golitsyna L.N., Zverev V.V., Selivanova S.G., Ponomareva N.V., Kashnikov A.Yu., Sozonov D.V., Sashina T.A., Epifanova N.V., Evplova I.A., Rezaykin A.V, Sapega E.Yu., Novikova N.A., Efimov E.I. Etiologicheskaya struktura enterovirusnykh infektsii v Rossiiskoi Federatsii v 2017-2018 gg. [Etiological structure of enterovirus infections in the Russian Federation in 2017-2018]. Zdorov'e naseleniya i sreda obitaniya, 2019, no. 8 (317), pp. 30-38. (In Russ.) DOI: http://doi.org/10.35627/2219-5238/2019-317-8-30-38
АВГУСТ №8 (317)
31
Энтеровирусные инфекции человека — это группа инфекционных заболеваний, вызываемых вирусами видов Enterovirus A-D (EV-A-D, более ста представителей) рода Enterovirus семейства Picornaviridae [20].
Энтеровирусные инфекции (ЭВИ) могут различаться по клиническим проявлениям и тяжести течения: от бессимптомной инфекции или легких лихорадочных состояний до серьезных мультисистемных заболеваний, сопровождающихся поражением сердечно-сосудистой и центральной нервной системы. Благодаря особенностям молекулярной организации энтеровирусов в процессе их эволюции могут формироваться штаммы с повышенной нейровирулентностью или нетипичной па-тогенностью, обладающие при этом эпидемическим потенциалом. В последние годы в Европейских странах, в том числе и в России, регулярно происходят вспышки асептического менингита, чаще всего вызываемого вирусом ЕСНОЗО [4, 6, 9, 10]. Начиная с 2008 г. в мире распространяются атипичные формы инфекции, обусловленные вирусом Коксаки А6 (CV-A6), протекающие с необычными кожными проявлениями [18]. В недавнем прошлом по всему миру регистрировались вспышки, связанные с энтеровирусами EV-A71, EV-D68 и др. Эти вспышки привлекли внимание специалистов в связи с повышенной частотой неврологических проявлений, значительной долей тяжелых случаев и летальных исходов [15, 16]. В связи с вышесказанным систематическое глобальное наблюдение за циркуляцией энтеровирусов, анализ спектра и установление особенностей смены типов и генотипов возбудителей энтеровирусных инфекций имеет значение для слежения за формированием и распространением эпидемических вариантов энтеровирусов, что, в свою очередь, важно для разработки качественных критериев прогнозирования роста заболеваемости энтеровирусной инфекцией.
В многолетней динамике заболеваемость энтеровирусной инфекцией в России характеризуется общей тенденцией к росту. Так, самый высокий подъем за период 2006—2016 гг. наблюдался в 2013 г. [6, 7]. В 2017 г. была зафиксирована заболеваемость всеми формами ЭВИ, превысившая уровень 2013 г., в ряде субъектов были отмечены рекордные показатели заболеваемости ЭВМ. В 2018 г. заболеваемость
ЭВИ снизилась по сравнению с 2017 г. в 1,7 раза (ЭВМ — в 1,6 раза); особенностью сезона этого года стала повышенная миграционная активность населения, связанная с безвизовым въездом в РФ и перемещением внутри страны болельщиков Чемпионата мира по футболу.
Цель исследования — установить этиологическую структуру различных клинических форм энтеровирусной инфекции, дать молекулярно-генетическую характеристику эпидемических вариантов неполиомиелитных энтеровирусов, выявленных в 2017—2018 гг.
Материалы и методы. В работе были исследованы 4 122 образца биоматериала от пациентов с различными клиническими формами ЭВИ, поступившего из ФБУЗ Центров гигиены и эпидемиологии в 83 субъектах Российской Федерации и 413 проб ООС.
Определение типа энтеровирусов проводили методом частичного секвенирования области VP1 генома [17].
Выравнивание нуклеотидных последовательностей, построение дендрограмм и анализ филогенетических взаимоотношений осуществляли с использованием программного обеспечения MEGA 5.0 [19] и пакета программ Beast v1.8.1 [12]. Группы последовательностей с бутстреп-поддержкой менее 70 или апостериорной вероятностью узла менее 0,95 при анализе не учитывались.
Результаты исследования. Тип энтеровируса был установлен в 2 753 случаях ЭВИ (таблица).
В 2017 г. у пациентов было идентифицировано 35 типов неполиомиелитных энтеровирусов. Соотношение видов ЭВА:ЭВВ:ЭВС составило 57,03:42,13:0,8 %. В образцах из ООС идентифицированы неполиомиелитные энтеровирусы 17 типов, один из которых — ЭВА76 — не был обнаружен у больных с ЭВИ. В целом в 2017 г. на территории Российской Федерации (РФ) установлена циркуляция неполиомиелитных энтеровирусов 36 типов [2].
В 2018 г. идентифицировано 37 типов неполиомиелитных энтеровирусов. Соотношение вирусов видов ЭВА:ЭВВ:ЭВС составило 45,61:53,06:1,25 %. В образцах из ООС идентифицированы неполиомиелитные энтеровирусы 25 типов, 5 из которых - СА14, ЭВА76, Е3, Е12, Е24 — не были обнаружены у больных с ЭВИ. Суммарно в 2018 г. на территории России была установлена циркуляция непо-лиомиелитных энтеровирусов 42 типов [5].
Таблица. Исследование клинических материалов, поступивших в Центры в 2017-2018 гг. Table. Study of clinical materials received at the Centers in 2017-2018
Федеральный округ 2017 2018 Итого
Обследовано Тип определен Обследовано Тип определен Обследовано Тип определен
ЦФО 262 183 154 108 416 291
СЗФО 157 127 160 138 317 265
ПФО 455 279 417 282 872 561
ЮФО 80 51 94 68 174 119
СКФО 36 34 18 14 54 48
УФО 464 273 317 263 781 536
СФО 399 247 321 213 720 460
ДФО 466 239 322 234 788 473
Всего 2319 1433 1803 1320 4122 2753
32
ЗНиСО август №8 (317)
У пациентов с экзантемными формами ЭВИ выявлялись преимущественно вирусы вида ЭВА: Коксаки А2-8, А10, А16, ЭВА71. Наибольшее распространение в 2017—2018 гг. получил вирус Коксаки А6. В 2017 г. этот вирус был выявлен у больных с экзантемными формами ЭВИ на территории 64 субъектов всех федеральных округов РФ, в том числе в 42 очагах групповой заболеваемости экзантемой, герпангиной, ОРВИ. Этот вирус был в числе ведущих агентов в этиологической структуре ЭВИ на всех территориях с самой высокой заболеваемостью. Доля вируса Коксаки А6 среди всех типированных энтеровирусов, составила 35,5 %. В 2018 г. число случаев, связанных с вирусом Коксаки А6, сократилось. Тем не менее он остался самым многочисленным и распространенным среди идентифицированных энтеровирусов и был выявлен на территории 35 субъектов всех федеральных округов РФ, но преимущественно на территории Урала, Сибири и Дальнего Востока. Доля этого вируса составила 13,8 %.
В 2018 г. вирус Коксаки А6 получил наибольшее распространение в Уральском, Сибирском и Дальневосточном округах; на территории Европейской части России среди возбудителей экзантемных форм ЭВИ доминирующее положение занял вирус Коксаки А16, значительно выросла активность вируса Коксаки А5.
В 2017 г. проводилось исследование материала от заболевших ЭВИ после посещения зарубежных стран: 34 — из Турции, 5 — из Вьетнама, 3 — из Туниса. Тип энтеровируса был установлен в 35 случаях. Наибольшую долю идентифицированных штаммов составил вирус Коксаки А6 (27 штаммов), который завозился из всех трех стран. Помимо вируса Коксаки А6 из Турции был прослежен завоз вирусов Коксаки А2 (1 случай), Коксаки А4 (1 случай), Коксаки А10 (2 случая); из Вьетнама — Энтеровируса С104; из Туниса — вируса ЕСНО11 и Энтеровируса А71 генотипа С1.
В результате филогенетического анализа установлено, что все случаи Коксаки А6-инфекции в России, начиная с 2014 г., были связаны с вирусом недавно сформировавшегося генотипа, который в настоящее время имеет пандемическое распространение, а в РФ активно проявляется при вспышечной и спорадической заболеваемости энтеровирусной экзантемой, герпангиной и малыми формами ЭВИ, начиная с 2012 г. [2-5].
В 2018 г. отмечен рост активности циркуляции и распространение вируса Коксаки А16, который занял второе место среди возбудителей ЭВИ. Его доля составила 12,11 %; вирус был идентифицирован на территории 33 субъектов всех ФО. Наибольшее эпиднеблаго-получие по ЭВИ, связанное с этим вирусом, наблюдалось в Сахалинской области, где была зафиксирована самая высокая в 2018 г. заболеваемость ЭВИ в России. Ранее повышенная активность циркуляции вируса Коксаки А16, сопровождавшаяся формированием очагов групповой заболеваемости на ряде территорий, наблюдалась в 2011 г. [1]. Согласно
классификации C. Hassel с соавторами [12], в России за период наблюдений была отмечена циркуляция вируса Коксаки А16 генотипов В1 и D (рис. 1). Внутри обозначенных генотипов российские штаммы, выделенные в 2017—2018 гг., вместе с различными современными зарубежными изолятами сформировали несколько монофилетических кластеров. Это иллюстрирует генетическую неоднородность российской популяции вируса Коксаки А16 и свидетельствует о множественных заносах этого вируса на территорию страны из разных географических зон.
У больных ЭВМ в 2017 г. были выявлены энтеровирусы 17 типов, в 2018 г. — 24 типов, преимущественно вида ЭВВ (рис. 2).
В 2017 г. ведущими этиологическими ЭВМ являлись вирусы ЕСН030, ЕСНО9, ЕСНО18. В 2018 г. среди возбудителей ЭВМ на территории Европейской части России сохранилась активность циркуляции вируса ЕСН030, на территории Урала, Сибири и Дальнего востока этот вирус выявлялся значительно реже, чем в 2017 г. В целом по России выросла активность циркуляции вирусов ЕСНОб, Коксаки В4 и В5, сохранили активность вирусы ЕСН09 и ЕСН018. Именно с вирусом ЕСНОб связан многократный рост заболеваемости ЭВИ и ЭВМ в Калининградской области, в Хабаровском крае, где в 2018 г. также был зафиксирован значительный рост числа случаев ЭВИ/ЭВМ, этот вирус составил наибольшую долю среди этиологических агентов.
Вирус ЕСН030 по итогам молекуляр-но-генетических исследований, проведенных в 2017 г., был выявлен у больных серозным менингитом и ЭВИ в 21,62 % случаев на территории 29 субъектов РФ, в том числе в 24 очагах групповой заболеваемости.
В результате филогенетического анализа было установлено, что большинство штаммов вируса ЕСН030, идентифицированных в 2017 г. на территориях ХМАО-Югры и Тюменской области, а также некоторые штаммы из Ростовской, Омской и Саратовской областей, Красноярского края и Республики Коми относятся к генотипу h, имеют 99,4—100 % гомологии нуклеотидных последовательностей и формируют на филогенетическом дереве мо-нофилетическую группу отдельно от штаммов вируса ЕСНО30 генотипа h, идентифицированных в России в 2012—2016 гг. Штаммы вируса ЕСНО30 генотипа h, который в настоящее время имеет пандемическое распространение, относятся к новому для России геноварианту вируса ЕСНО30-^Ь (условно Е30^2017-Яи4). По всей вероятности, этот вариант вируса сформировался в результате отдельного заноса на территорию РФ, ориентировочно в конце 2016 — начале 2017 г. Именно этот геновариант вируса ЕСНО30 обусловил эпидемический подъем заболеваемости ЭВМ в ХМАО-Югре и Тюменской области.
Российские штаммы вируса ЕСНО30 генотипа Е30^2017-Яи4 имели наибольшую гомологию нуклеотидных последовательностей со штаммами ЕСНО30, выделенными
АВГУСТ №8 (317)
33
KP751584 JN11-017/NJ/CHN 2011 AB771956 1215-Yamagata JPN 2011 " "1-13 Kursk 2013 JQ315114 Yuyao/c477China 2010
LC038035 20124019-Sapporo 2012 LC012442 114-A22-YN-CHN 2012 502 EVI Amursk 2013 1686 HMAO 2016 223-15 Omsk 2014
-# 2549 Penza 2017
k 1627 Smolensk 2018 KF193621 SD09-05 CHN 2009 1435 Vladimir 2015
_1891 Murmansk 2018
70, 1343 Omsk 2015
1164 Kazan 2016 KM235952 EV371/GD/CHN 2014 KP751613 LH11-052/NJ/CHN 2011 1536 Izhevsk 2016 - 1681 HMAO 2016 ~~ KX871387 SHCA2015-041 CHN 2015 ' 1211 Turkey/Ivanovo 2018 KP751514 PK13-005/NJ/CHN 2013 JX068833 BJ08/07 CHN2008 1094 Elista 2016 KC879501 29072 CVA16 RUS 2007 AY821798 BJ03-ZDP CHN 2003 - HM776235 JB140600050 CHN 2006
- KM235854 EV736/GD/CHN 2011 2382 out Ivanovo 2014 2897F Kurgan 2014
2684R ASM Saratov 2014 1038 Taganrog 2013 4617 Karelia 2013
• AM292476 SB16087/SAR Malay 2005
76 _ Spb4447/11 324-13 Kovdor 2011 —J KC879548 41555 CVA16 KAZ 2011
I-2867 Penza 2014
KC879517 34950 CVA16 RUS 2009
-HQ122413 1448 Murmansk 2010
- 1389-12 HFWD Orenburg 2012 1612 HFWD V.Novgorod 2010 JN203543 N-450B AFP India 2008
1987 out HFWD Leningr Reg 2012 2359 Rostov/Egorlik 2013 out Len Reg 2014
rfE1
73
AB771998 1976-Yamagata JPN 2011 - LT577765 CF198037 FRA 2012
90 ■— MH111068 C105/CHW/AUS 2016 I KM235916 EV1506/GD/CHN 2013 96 i A 2053 Udmurtia 2018
-\- A 2945 SPb 2018
I-▲ 1900 PP LO 2018
MF094720 NIV1211473/Ahmedabad/IND 2012 KY796210 NIV1324321/Pune/IND 2013 Э3075 Moscow 2017 2114 Orenburg 2017 3246 Murmansk 2017 A 1703 N.Novgorod 2018
Í2250 Uljanovsk 2017 1432 Komi 2018
81
- AB465389 260/Toyama JPN 2002
. 93, KC879516 34351 CVA16 RUS 2009
I-KC879529 39156 CVA16 RUS 2010
- JX139790 1426 AGE N.Nov 2008
88
— AM492504 FR-10-2005-164 FRA 2005
-GU142868 143.2668 Austral 2000
-AM292462 S110251/SAR Malay 2003
HQ283631 TW-3570-01 TWN 2001
— AY208087W42-44/01 FRA 2001
-AY956576Germany/757 2003
JX139787 14175 ivN.Novgorod 2006
>— JX139789 14433 iv N.Nov 2007 - AB634324 808-Yamagata 1998
-AB634300 Y95-2200 J PN1995
JN248410 PM-14194- 97 MAL 1997
-HE572993 CF160074 FRA 2010
JX139791 1715 iv N.Nov 2010
100 г
HQ897684 CSF-09-3358 UK 2009 AM292445 CNS32874/SAR Malay 2003 AM292434 0001 Australia 1999
-2722-13 232 plox.Kursk 2013
97 p- GQ184140Siriraj07 THA 2005 JX139788 14323 iv N.Nov 2006 AM292440 577T/VNM 2005
i MH644626 22/SZLG CHN 2017
__P-A 1699 Karelia 2018
qq ._\ '-LMC18/001 VNM 2018
-\ I LC038065 20144178-Sapporo 2014
'-1315 Voronezh 2015
AB465401 355/Toyama Japan 2005
9^-2333 ASM Stavropol 2012
"I-KC879522 37323 CVA16 UKR 2010
KM235843 EV391/GD/CHN 2011 KC866846 JB143090024 CHN 2009
I-KF913229 2724/Kursk/Russia 2013
-1153 Feodosia Krim 2018
' 1187 Smolensk 2017
2068 Gatchina LO 2018 ' 2397 Orenburg 2018
* 2633 ASM Riazan 2018
_ 3230 Kursk 2017 -1039 Rostov na Donu 2015
LT577809 PMB171042 FRA 2014
-MG993100 16192-24513-1494 LTU 2016
-MH084318 Env- 15-022-A16a UK 2015
-J^A 1689 Orel 2018 iqlA 2567 Kursk 2018
IA 2839 Penza 2018 MH361019 SCO SWG UK 2015
2071 Gatchina LO 2018
2509 Kaliningrad 2017
■ HQ283792 TW-17' —I i-AY8950S
4 I-K
I-\- HM776
98 I— AB634:
• A 1521 Yaroslavl 2018 ■-A 2842 HealthyCh MO 2018
MH111070 C123/CHW/AUS 2016 I MH010203 Shenzhen169/CHN 2017
I HQ283792 TW-1761-98 TWN 1998
- AY895097 shzh01-77 CHN 2001
• KC879536 40188 CVA16 RUS 2004 - HM776226 JB140500084 CHN 2005 98 I— AB634394 2222-Yamagata 2005
■ AB46536624/Toyama JPN 1981
B1
GU142869 132.2264 Austral 1999
KF956720 FLA6916 PERU 2009
_ 1458 N.Nov. 2017 1745 AEVI Voskresensk 2011 2459 disbios Nov 2011
878 AGE N.Nov 2012 T577749 CF221066 FRA 2011 KX187410 123.11 GRE 2011 LT617115 CVA16 C PAR190033 FRA 2014 2021 f ASM Vologda 2011
MF159875 LA-20006 USA 2014 MH084319 Env- 15-022-A16b UK 2015 __9^A 1160 SW Saky Krim 2018
'A 1158 ASM Evpatoria Krim 2018 LT577790 PMB112174 FRA 2014
MG957117 SH-HP-16-51 CHN 2016
JQ315094 CA16v-2010221 CHN 2010
Рис. 1. Филогенетические взаимоотношения штаммов вируса Коксаки А16, идентифицированного в Российской Федерации в 2017—2018 гг. Жирным шрифтом отмечены штаммы, идентифицированные в России: • — в 2017 г., ▲ — в 2018 г. Fig. 1. Phylogenetic interactions of Coxsackie A16 viruses strains indentified in the Russian Federation in 2017—2018. In bold are strains indentified in Russia: • — 2017, ▲ — 2018.
1.00
D
A
100
98
34
ЗНиСО август №8 (317)
в США в 2017 г. и в Китае в 2015-2016 гг. При выезде специалистов Центров в Тюменскую область в августе 2017 г. были установлены факты проживания на данных территориях большого числа мигрантов из Средней Азии (в т. ч. из граничащих с Китаем Казахстана и Таджикистана) и подтопления весной 2017 г. ряда территорий, пограничных с Казахстаном. Полученные результаты филогенетического анализа в совокупности с фактами эпидемиологического расследования определяют высокую вероятность заноса нового геноварианта вируса ЕСН030 эпидемического генотипа Ъ на территорию Тюменской области и ХМА0-Югры из стран Средней Азии.
Вирус ЕСН030 субгенотипа Е30Ъ/2013-ЯШ, с которым был связан эпидемический подъем заболеваемости ЭВМ во многих субъектах РФ в 2013-2016 гг. и циркуляция которого фиксируется на территории России, начиная с 2012 г. ежегодно, в 2017 г. продолжал циркулировать преимущественно на территории Европейской части РФ. С вирусом этого геноварианта было связано эпиднеблагополучие по ЭВМ в Самарской области.
Вирус ЕСН030, по итогам молекуляр-но-генетических исследований, проведенных в 2018 г., был выявлен у больных серозным менингитом и ЭВИ в 11,26 % (в 2017 г. 21,6 %) случаев на территории 23 субъектов РФ.
В 2018 г. на территории России было зафиксировано возобновление циркуляции эпидемического варианта вируса ЕСН030 — ЕСН030 генотипа е (рис. 3). Это вариант вируса ЕСН030 был выявлен при спорадической и групповой заболеваемости ЭВИ/ЭВМ
на территории 15 субъектов РФ: в Республике Карелия, Пермском крае, Владимирской, Калининградской, Курганской, Московской, Нижегородской, Новгородской, Новосибирской, Саратовской, Свердловской, Тюменской областях, ХМА0-Югре, Санкт-Петербурге. Филогенетический анализ штаммов вируса ЕСН030 показал, что штаммы ЕСН030 генотипа е, выявленные в 2018 г. в трех субъектах европейской части РФ, в 2016 г.
— в Краснодарском крае, в 2013—2014 гг. — в некоторых странах Европы и в 2016 г. в США, образуют монофилетический кластер, отдельно от штаммов ЕСН030 генотипа е, вызвавших подъем заболеваемости ЭВМ в ряде субъектов РФ в 2007—2009 гг. и продолжавших циркулировать до 2011 г. Это свидетельствует в пользу того, что возобновление циркуляции вируса ЕСН030 генотипа е в России является следствием нового заноса этого эпидемического варианта вируса ЕСН030 на территорию страны.
Вирус ЕСН030 генотипа Ъ в 2018 г. продолжил циркуляцию, его штаммы были идентифицированы при спорадической заболеваемости и в очагах ЭВИ/ЭВМ на территории 13 субъектов РФ: Алтайского, Краснодарского и Пермского краев, Белгородской, Кемеровской, Курганской, Новосибирской, Свердловской, Тульской и Тюменской областях, ХМА0-Югре, Ямало-Ненецком А0, г. Севастополь.
Следует отметить, что в 2018 г. на территории РФ впервые зафиксирована циркуляция редкого, «старого» генотипа вируса ЕСН030
— ЕСН030 генотипа Ь. Циркуляция этого вируса в мире наблюдалась лишь трижды:
2017
2018
СА19 СА1 Е31 El 5 СА5 Е7 СВ2 Е5 СА1Б Е4 СА2 El 6 Е25 El 4 СВЗ СБ4 СА10 CAS CB5 E6 Ell E13 CA9 ÎBA71 El S E9 E30
CA19 CA1 E31 El 5 CA5 E7 CB2 E5 CA16 E4 CA2 El 6 E25 El 4 CB3 CB4 CA10 CA& CB5 ES Ell E13 CA9 ЭВА71 El В E9 E30
0 50 100 150 200 250 и ьи 1ш 1ьи
Рис. 2. Типы энтеровирусов, обнаруженные у больных энтеровирусным менингитом Fig. 2. Types of enteroviruses detected in patients with enterovirus meningitis
АВГУСТ №8 (317)
35
1397_Sokol/N. Nov._2018 1393_Sokol/N. Nov._2018 1391_Sokol/N. Nov._2018
2100 Tiumen 2018
2102 Kurgan 2018 1535_EVI/N. Nov_2018 1529_ASM/N. Nov_2018 1459_198/N. Nov_2018
2101 Kurgan 2018 2112 Kurgan 2018 1700 Karelia 2018
2103 Ekaterinburg 2018
2104 Ekaterinburg 2018 2523 Krasnodar 2016
KT809224_eC2_7586/PL22_P0L_2014 - KT809217_eC2_6959/P0L_2014
- MF346639 B001/USA 2016
- FJ868308_06.081.3581_A US_2006 -MF678335 NSW-V46 AUS 2008
L MF678337 NSW-V47B AUS 2005 -KP090710 eC2 29306 RUS 2007
- KT809183_eC2_195/P L14_P0L_2006
|-KP090722 eC2 31542 RU ROS 2008
-f |-KP090734 eC2 33688 RU OMS 2008
-KP090742 eC2 34170 RU MOW 2009
^-KP090752 eC2 35108 RU MOW 2010
- AM946153 eC2 707 Bahrein 1999
- AJ276815 eC2 97CF1619 FRA 1997
- AM236602 CF2191-01 France 2001
-EU280301 eC1 20885 Moldova 2003
-EU280310 20798 Russia Siber 2003
"EE
Рис. 3. Филогенетические взаимоотношения штаммов вируса ЕСН030 генотипа е,
идентифицированного в Российской Федерации в 2018 г. Fig. 3. Phylogenetic interactions of strains of the virus ЕСН030 genotype e indentified
in the Russian Federation in 2018
в 1995 г. на Филиппинах, в 2003-2004 гг. в Южной Корее, в 2009-2010 г. в Японии. В 2018 г. вирус ЕСН030 генотипа Ь был идентифицирован у одного больного ЭВМ в Краснодарском крае, нескольких больных менингитом из Карелии и в очаге ЭВИ/ЭВМ в Тамбовской области [5].
В 2017 г. при исследовании материалов от спорадических больных серозным менингитом и из очагов ЭВИ/ЭВМ в Саратовской области был выявлен вирус ЕСНО18. Энтеровирус этого типа последние годы относительно редко обнаруживался в России у больных ЭВИ, исключительно при спорадической заболеваемости. За последнее десятилетие это первое в РФ обострение эпидситуации, сопровождавшееся формированием множественных очагов групповой заболеваемости ЭВМ, связанное с вирусом ЕСНО18. Кроме Саратовской области вирус ЕСНО18 был идентифицирован при изучении двух групповых заболеваний ЭВИ (СМ и ОКИ) в Красноярском крае.
В 2017-2018 гг. продолжилась циркуляция вируса ЕСНО9, который был одной из ведущих причин подъема заболеваемости ЭВМ в РФ в 2016 г. В сезон 2017 г. вирус ЕСНО9 был идентифицирован у больных серозным менингитом на территории девяти субъектов РФ (преимущественно в тех, где наблюдался рост или сохранился высокий уровень заболеваемости ЭВМ) и в двух очагах групповой заболеваемости серозным менингитом в Ленинградской области и Удмуртской Республике.
С вирусом ЕСНО6 был связан значительный рост заболеваемости ЭВМ в Сахалинской
и Калининградской областях в 2018 г. По итогам года, этот вирус выявлялся в очагах ЭВМ и спорадической заболеваемости ЭВИ/ЭВМ в 32 субъектах РФ, из них 21 - в Европейской части России.
В результате филогенетического анализа установлено, что идентифицированные в 2018 г. штаммы вируса ЕСНО6 принадлежат двум генотипам - С1 и С7 [5]. Большинство российских штаммов генотипа ЕСНО6-С7 имели близкое родство и образовали монофи-летический кластер с вирусом, выделенным в Великобритании из сточной воды в 2017 г. Ранее в РФ вирус ЕСНО6, относящийся к этому генотипу, не выявлялся.
Штаммы вируса ЕСНО6 генотипа С1 2018 г. сформировали отдельную геногруппу в монофилетическом кластере вместе с вирусами, идентифицированными в РФ ранее, в 2016 и 2017 гг., и с вирусами, циркулировавшими в разных европейских странах в 2011-2016 гг. Следует отметить, что циркуляция вируса ЕСНО6 генотипа С1 наблюдалась в России в 2006-2010 гг., но эти вирусы были генетически далеки от современных штаммов. В прежние годы в РФ была отмечена циркуляция вируса ЕСНО6 генотипов С9Ь, С9с, С9ё, С9е, С9Г, с9е, С9И.
Энтеровирус А71 в 2018 г. был обнаружен в 16 субъектах РФ у больных разными формами ЭВИ, в т. ч. в двух очагах групповой заболеваемости везикулярным стоматитом в Ханты-Мансийском АО. Все штаммы ЭВА71, идентифицированные на Европейской части России, относились к генотипу С1 и проявили генетическое родство со штаммами ЭВА71 генотипа С1, большинство которых
3С
ЗНиСО август №8 (317)
было выявлено в 2015-2017 гг. в Европе, единичные находки были в 2016 г. в США, в 2017 г. - в Японии [14]. Циркуляция ЭВ71 генотипа С1 на территории РФ возобновилась в 2016 г. после 9-летнего перерыва. Следует отметить, что современные российские изо-ляты ЭВА71-С1 значительно отличались от штаммов 2007 г. (рис. 4), были генетически неоднородны и представляли несколько ге-новариантов, родственных различным зару-
бежным изолятам, что указывает на то, что за последние 3 года произошло несколько заносов ЭВА71 на территорию РФ.
В 2017 г. в субъектах Дальневосточного федерального округа наибольшую долю в структуре типированных ЭВ составил вирус Коксаки А10 (33,0 %) [8]. В 2017 г. в целом по России циркуляция этого вируса зафиксирована в 27 субъектах. Коксаки А10-инфекция наиболее часто проявляется в виде экзантемы,
J-MH484071 7F SPA 2016 J— LC321990 C1 31170101JPN 2017 F-MH472EE0C1 48423 GER2016 I— MH472E88C1 46169 GER 2016 J-MH472687 C1 37107 GER 2016 4-MG367596 CI DK16-02 DEN 2016 г МН472673 C1 47503 GER2016 jL MH4726B9C1 48515 GER2016 IT—MH472670 CI 991215 GER2016 LKX1394E2 C1 Jena 15-984 GER2015 МН47271Б CI 36301 GER2016 MH472725 C1 47848 GER2016
-МН7182Б9 СО-2302Б USA201S
KUE41501 C1 37507/TH/DE GER 2015 MH472726C1 37381 GER2016 LR027527 01|TOU148153 FRA 201Б r-MH4727lS"C1 47305 GER~2016 ^ЫН472719 CI 991514 GER2016 -LR027539 26|PMB501259|FRA 2017
— MH472727C1 991359 GER2016
— KY888026 C1 19522 USA2016 j— 175-19 0msk2013
176-19 Omsk2013 -181-19 HMAO 2MB
re
-LT719067 LIT-CIP-041 CAM 2008 JQ973699 RUS 2007
KF906434 C1 V11-913 IND 2011 KJB45796 C1 42404 AZE2011
4
FNE492E4 STU546711 GER2008
KU E414 8 7 15 3 3 9/B W/D E_G ER_2011
-KUE41489 22784/BB/DE GER 2013
■HG934216 C1 LY026277 FRA 200E ■FN598744 LY005158 FRA2005 AB524188 2727 NET 2004 HG934182 CI CF097017 FRA 2003
HG934181 C1 VIE94AUT2001
HG934180 C1 NAN387 FRA. 2006
HG934229 GRE29 FRA. 2007 EU414331 C1 SWI200S HG934210 CI POI777 FRA2005
Kb
i-HG h
I-Fl I
tE
HG934183 C1 CAE571 FRA2003
_l-HG934220 C1 ANG100 FRA200E
1-AM939587 C1 EP/8300 GER 2004 AB52419E CI 1ШЗЖТ2ЖГ — H Q E 7E2 0 G_J P2 7/S d/WJ РЫ_2 003 HG934162C1 STU11E GER2003 HG93418E CI STY21 AUT2003 — HG93419E C1 CAE201 FRA2004 KJ4072E9 FLU4059 PERU 200E
AB524181 21E NET 2002 — HG934175 CI CAE1053 FRA2000
-HG934187 C1 GRE454 FRA2003
HG934178 CI ULM705 GER 2000 HG934177 CI EER409 GER 2000
АМ49015Ё C1 730/VNM 2005
x— HG934171 C1 CF1744~FRS. 2000 ~*HG9341E9 CI LY028978 FRA. 1999 гHG934163 CI NAN10838 FRA 1994 1FN598720 C1 FRA. 1994
—AF135952 CI USA 1987 -AY722887 C1 AUS 198E
Рис. 4. Филогенетические взаимоотношения штаммов ЭВА71 генотипа С1, идентифицированных
в Российской Федерации в 2007 и 2018 гг. Fig. 4. Phylogenetic interactions of strains of the virus ЕУА71 genotype С1 indentified in the Russian
Federation in 2007 and 2018
август №8 (317)
ЗНСО
37
герпангины, 0РЗ, однако в 2017 г. в структуре клинических форм Коксаки А10-инфекции наблюдалось увеличение доли ЭВМ. Важно отметить, что увеличение частоты тяжелых форм (неврологические проявления и летальные случаи) наблюдаются у одного из геновариантов вируса Коксаки А10 [11]. В европейской части России и Сибири циркуляция вируса Коксаки А10 этого геноварианта прослеживается ежегодно, начиная с 2015 и до конца 2017 г.
Заключение. В 2017 г. в России наблюдался рост заболеваемости ЭВИ. По всей вероятности, резкий подъем заболеваемости ЭВИ при меньшем росте заболеваемости ЭВМ, с одной стороны, был связан с дальнейшим распространением и увеличением интенсивности циркуляции эпидемических вариантов энтеровирусов вида ЭВА, что помимо повышения спорадической заболеваемости сопровождалось формированием множественных очагов энтеровирусной экзантемы, определивших вспышечную заболеваемость, уровень которой прогнозировать достаточно сложно. С другой стороны, не исключено, что увеличилась настороженность в отношении экзантемных и малых форм ЭВИ и что привело к улучшению диагностики и регистрации этих заболеваний. Наибольшее обострение эпидситуации по ЭВИ и ЭВМ складывалось на территориях, где активизировалась или продолжилась циркуляция эпидемических вариантов вирусов ЕСН030, Коксаки А6, ЕСН09. С активностью вируса ЕСН030 была связана заболеваемость энтеровирусным менингитом, с вирусом Коксаки А6 и другими ЭВА — экзантемными формами ЭВИ. Именно этими энтеровирусами был обусловлен эпидемический подъем заболеваемости в наиболее неблагополучных по ЭВИ регионах. В отличие от предыдущих сезонов, в 2017 г. на территории ряда регионов, преимущественно Сибири, распространился новый для России геновариант вируса ЕСН030 эпидемического генотипа Ъ — Е30Ъ/2017-Яи4. 0собенностью сезона 2017 г. стала также активизация циркуляции вируса Коксаки А10, которая наиболее интенсивно проявилась в субъектах Дальневосточного федерального округа.
В 2018 г. в целом по России наблюдалось снижение заболеваемости всеми формами ЭВИ, в том числе энтеровирусным менингитом, вследствие снижения активности циркуляции эпидемических вариантов вирусов Коксаки А6 и ЕСН030. Эпидпроцесс ЭВМ поддерживался активизировавшимися или сохранившими активность вирусами ЕСН06, Коксаки В5, ЕСН09, ЕСН018 и др. вирусами вида Энтеровирус В. Сохраняющийся относительно высокий уровень заболеваемости экзантемными формами ЭВИ помимо вируса Коксаки А6 поддерживается активизировавшимися вирусами Коксаки А16, Коксаки А5 и др. вирусами вида Энтеровирус А. Результаты филогенетического анализа последовательностей генома двух доминировавших в 2018 г. этиологических агентов ЭВМ (вирусов ЕСН030 и ЕСН06) указывают, что в 2018 г. состо-
ялся множественный занос эпидемических вариантов энтеровирусов на территорию РФ, поддержавший эпидпроцесс ЭВИ/ЭВМ в целом по РФ и вызвавший осложнение эпидситуации в ряде субъектов. Не исключено, что этим событиям способствовал приезд большого числа болельщиков на Чемпионат мира по футболу 2018 г. и безвизовый въезд на территорию России для этой категории туристов до конца года.
ЛИТЕРАТУРА (пп. 10-20 см. References)
1. Бичурина М.А., Романенкова Н.И., Новикова Н.А., Голицына Л.Н., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Ермакова М.В., Камынина Л.С., Михайлова Е.А., Валдай-цева Н.В., Леонова Н.П., Иванова Т.Г. Групповые заболевания энтеровирусной инфекцией, обусловленные вирусами Коксаки А16, на Северо-западе России // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2014. № 2. С. 51—59.
2. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Епифанова Н.В., Сашина Т.А., Кашников А.Ю., Созонов Д.В., Резайкин А.В., Сапега Е.Ю., НовиковамН.А. Неполиомиелитные энтеровирусы в Российской Федерации в 2017 году // Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции [Электронный ресурс]. 2018. № 5. С. 5—12. Режим доступа: https://nniiem.ru/development/informanalit/ evi.html (дата обращения: 24.06.2019)
3. Голицына Л.Н. Зверев В.В., Парфенова О.В., Епифанова Н.В., Сашина Т.А., Кашников А.Ю., Григорьева Г.И., Новикова Н.А. Вирус Коксаки А6 в Российской Федерации в 2014 году // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015. № 28. С. 12—20.
4. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Сашина Т.А., Епифанова Н.В., Новикова Н.А. Эпидемические варианты неполиомиелитных энтеровирусов в Российской Федерации // Сборник трудов IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика-2017», 18—20 апреля 2017 г. М., 2017. Т. 2. С. 351-352.
5. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Селиванова С.Г., Пономарева Н.В., Кашников А.Ю., Созонов Д.В., Сашина Т.А., Епифанова Н.В., Новикова Н.А., Ефимов Е.И. Эпидемиологическая ситуация по энтеровирусной инфекции в РФ в 2018 году: заболеваемость, результаты лабораторной диагностики, прогноз на 2019 год // Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции. 2019. № 6. С. 5-12. [Электронный ресурс]. Режим доступа: https://nniiem.ru/development/
informanalit/evi.html (дата обращения: 24.06.2019)
6. Морозова Н.С., Чернявская О.П., Михайлова Ю.М., Новикова Н.А., Голицына Л.Н., Зверев В.В., Фомина С.Г. Энтеровирусная (неполио) инфекция в Российской Федерации в сезон 2013 года // Здоровье населения и среда обитания. 2014. № 10. С. 34-37.
7. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2018 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2019. 254 с.
8. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Горяев Д.В., Дмитриева Г.М., Детковская Т.Н., Жданова Н.И., Зайцева Т.А., Игнатьева М.Е., Курганова О.П., Копылов П.В., Лапа С.Э., Пережогин А.Н., Рубцова А.А., Фунтусова О.А., Ханхареев С.С., Щучинов Л.В. Моле-кулярно-эпидемиологический анализ энтеровирусов, циркулирующих на территории Дальневосточного и Сибирского федеральных округов Российской Федерации, в том числе участвующих в возникновении очагов групповой заболеваемости // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2018. № 35 (35). С. 5-14.
9. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Гарбуз Ю.А., Балахонов С.В., Каравян-ская Т.Н., Носков А.К., Лебедева Л.А., Резник В.И., Севостьянова А.В. Роль молекулярно-генетических методов исследования в выявлении потенциальных рисков завоза энтеровирусной инфекции на терри-
38
ЗНиСО август №8 (317)
торию Хабаровского края // Здоровье населения и среда обитания. 2018. № 2 (299). С. 44-51.
REFERENCES
1. Bichurina M.A., Romanenkova N.I., Novikova N.A., Golitsyna L.N., Rozaeva N.R., Kanaeva O.I., Ermako-va M.V., Kamynina L.S., Mikhailova E.A., Valdaitseva N.V., Leonova N.P., Ivanova T.G. Gruppovye zabolevaniya enterovirusnoi infektsiei, obuslovlennye virusami Koksaki A16, na Severo-zapade Rossii [Group diseases of enterovirus infection due to Coxsackie A16 viruses in the Northwest of Russia]. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii,
2014, no. 2, pp. 51-59. (In Russ.)
2. Golitsyna L.N., Zverev V.V., Epifanova N.V., Sashina T.A., Kashnikov A.Yu., Sozonov D.V., Rezaikin A.V., Sapega E. Yu., Novikova N.A. Nepoliomielitnye enterovirusy v Rossiiskoi Federatsii v 2017 godu [Non-polio enteroviruses in the Russian Federation in 2017]. Zabolevayemost', etiologicheskaya struktura i voprosy profilaktiki ente-rovirusnoy (nepolio) infektsii]. Zabolevaemost', etiologicheskaya struktura i voprosy profilaktiki enterovirusnoi (nepolio) infektsii, 2018, no. 5, pp. 5-12. Available at: https://nniiem.ru/development/informanalit/evi.html (accessed: 24.06.2019) (In Russ.)
3. Golitsyna L.N. Zverev V.V., Parfenova O.V., Epifanova N.V., Sashina T.A., Kashnikov A.Yu., Grigor'eva G.I., Novikova N.A. Virus Koksaki A6 v Rossiiskoi Federatsii v 2014 godu [Coxsackie A6 virus in the Russian Federation in 2014]. Dal'nevostochnyi zhurnal infektsionnoi patologii,
2015, no. 28, pp. 12-20. (In Russ.)
4. Golitsyna L.N., Zverev V.V., Sashina T.A., Epifanova N.V., Novikova N.A. Epidemicheskie varianty nepoliomielitnykh enterovirusov v Rossiiskoi Federatsii [Epidemic variants of non-polio enteroviruses in the Russian Federation]. Sbornik trudov IX Vserossiiskoi nauchno-prakticheskoi konferentsii s mezhdunarodnym uchastiem «Molekulyarnaya diagnostika-2017», 18-20 aprelya 2017 g. Moscow, 2017, vol. 2, pp. 351-352. (In Russ.)
5. Golitsyna L.N., Zverev V.V., Selivanova S.G., Pono-mareva N.V., Kashnikov A.Yu., Sozonov D.V., Sashina T.A., Epifanova N.V., Novikova N.A., Efimov E.I. Epidemiologicheskaya situatsiya po enterovirusnoi infektsii v RF v 2018 godu: zabolevaemost', rezul'taty laboratornoi diagnostiki, prognoz na 2019 god [Epidemiological situation on enterovirus infection in the Russian Federation in 2018: morbidity, results of laboratory diagnostics, prognosis for 2019]. Zabolevaemost', etiologicheskaya struktura i voprosy profilaktiki enterovirusnoi (nepolio) infektsii, 2019, no. 6, pp. 5-12. Available : https://nniiem.ru/development/ informanalit/evi.html (accessed: 24.06.2019) (In Russ.)
6. Morozova N.S., Chernyavskaya O.P., Mikhailova Yu.M., Novikova N.A., Golitsyna L.N., Zverev V.V., Fomina S.G. Enterovirusnaya (nepolio) infektsiya v Rossiiskoi Federatsii v sezon 2013 goda [Enterovirus (nepolio) infection in the Russian Federation during the 2013 season]. Zdorov'e naseleniya i sreda obitaniya, 2014, no. 10 (259), pp. 34-37. (In Russ.)
7. O sostoyanii sanitarno-epidemiologicheskogo blagopo-luchiya naseleniya v Rossiiskoi Federatsii v 2018 godu: Gosudarstvennyi doklad [On the state of sanitary and epidemiological wellbeing of the population in the Russian Federation in 2018: State report]. Moscow: Federal'naya sluzhba po nadzoru v sfere zashchity prav potrebitelei i blagopoluchiya cheloveka Publ., 2019, 254 p. (In Russ.)
8. Sapega E.Yu., Butakova L.V., Trotsenko O.E., Goryaev D.V., Dmitrieva G.M., Detkovskaya T.N., Zhdanova N.I., Zaitseva T.A., Ignat'eva M.E., Kurganova O.P., Kopy-lov P.V., Lapa S.E., Perezhogin A.N., Rubtsova A.A., Funtusova O.A., Khankhareev S.S., Shchuchinov L.V. Molekulyarno-epidemiologicheskii analiz enterovirusov, tsirkuliruyushchikh na territorii Dal'nevostochnogo i Sibirskogo federal'nykh okrugov Rossiiskoi Federatsii, v tom chisle uchastvuyushchikh v vozniknovenii ochagov gruppovoi zabolevaemosti [Molecular-epidemiological analysis of enteroviruses circulating in the Far Eastern and Siberian Federal Districts of the Russian Federation
including those ones involved in the occurrence of foci of morbidity group]. Dal'nevostochnyi zhurnal infektsionnoi patologii, 2018, no. 35 (35), pp. 5-14. (In Russ.)
9. Sapega E.Yu., Butakova L.V., Trotsenko O.E., Zaitseva T.A., Garbuz Yu.A., Balakhonov S.V., Karavyan-skaya T.N., Noskov A.K., Lebedeva L.A., Reznik V.I., Sevost'yanova A.V. Rol' molekulyarno-geneticheskikh metodov issledovaniya v vyyavlenii potentsial'nykh riskov zavoza enterovirusnoi infektsii na territoriyu Khabarovskogo kraya [The role of molecular genetic analysis in detection of potential importation of enterovirus infection in the Khabarovsk region]. Zdorov'e naseleniya i sreda obitaniya, 2018, no. 2 (299), pp. 44-51. (In Russ.)
10. Broberg E.K., Simone B., Jansa J., The EU/EEA Member State Contributors. Upsurge in echovirus 30 detections in five EU/EEA countries, April to September, 2018. Euro Surveill, 2018, vol. 23 (44), pp. 1-12. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2018.23.44.1800537
11. Chen M., He S., Yan Q., et al. Severe hand, foot and mouth disease associated with Coxsackievirus A10 infections in Xiamen, China in 2015. J. Clin. Virol., 2017, vol. 93, pp. 20-24. DOI: 10.1016/j.jcv.2017.05.011
12. Drummond A.J., Suchard M.A., Xie D., Rambaut A. Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol. Biol. Evol., 2012, vol. 29 (8), pp. 1969-73.
13. Hassel C., Mirand A., Farkas A. et al. Phylogeography of coxsackievirus A16 reveals global transmission pathways and recent emergence and spread of a recombinant genogroup. J. Virol, 2017, vol. 91, pp. e00630-17. D0I:10.1128/JVI.00630-17
14. Karrasch M., Fischer E., Scholten M. et al. A severe pediatric infection with a novel enterovirus A71 strain, Thuringia, Germany. J. Clin. Virol., 2016, vol. 84, pp. 90-95.
15. Lugo D., Krogstad P. Enteroviruses in the early 21st century: new manifestations and challenges. Curr. Opin. Pediatr., 2016, vol. 28 (1), pp. 107-113. DOI: 10.1097/ MOP.0000000000000303
16. Messacar K., Schreiner T.L., Maloney J.A., et al. A cluster of acute flaccid paralysis and cranial nerve dysfunction temporally associated with an outbreak of enterovirus D68 in children in Colorado, USA. The temporal association of enterovirus D68 with acute flaccid paralysis is detailed in this article, expanding the ongoing debate regarding the neurotropism of this virus. The Lancet, 2015, vol. 385, pp. 1662-1671. DOI: 10.1016/S0140-6736(14)62457-0
17. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, pp. 2698-2704.
18. Puenpa J., Vongpunsawad S., Osterback R., et al. Molecular epidemiology and the evolution of human coxsackievirus A6. J. Gen.. Virol, 2016, vol. 97 (12), pp. 3225-3231. DOI: 10.1099/jgv.0.000619
19. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. and Evol., 2011, vol. 28. pp. 273-2739.
20. Zell R., Delwart E., Gorbalenya A.E. et al. ICTV Virus Taxonomy Profile: Picornaviridae. J. Gen. Virol., 2017, vol. 98 (10), pp. 2421-2422. DOI: 10.1099/jgv.0.000911
Контактная информация:
Голицына Людмила Николаевна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспо-требнадзора
e-mail: lyudmila_galitzina@mail.ru Contact information:
Golitsyna Lyudmila, Candidate of Biological Science, Leading Researcher of Academician I.N. Blokhina Nizhny Novgorod Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology e-mail: lyudmila_galitzina@mail.ru
öö ö
