CC BY
9Проблемы медицинской микологии. 2020, Т.22. №3
на модели формалинизированных эритроцитов. Определяли средний показатель адгезии и коэффициент адгезии. Для изучения микробного антагонизма использовали метод агаровых слоев. Видовой состав лактобацилл выявляли посредством мультиплексной ПЦР с использованием видоспецифических праймеров к областям 16S rRNA и 23S rRNA с электрофоретической детекцией. Антагонистическую активность по отношению к патогенным и условно- патогенным штаммам изучали с использованием тест-культур штаммов Escherichia coii, Kiebsieiia pneumoniae, Proteus mirabilis, Streptococcus pyogenes и Staphylococcus aureus.
Результаты. Уровень содержания лактобацилл в составе просветной микро-биоты для крыс колебался в наших опытах от 106 до109, для кроликов - от iG7 доЮ9, а для хомячков - от iG5 до iG11 КОЕ/г. Лактобациллы представлены видами L. casei, L. deibrueckii, L. piantarum, L. reuteri и L. rhamnosus. При анализе биологических свойств изолированных штаммов лактобацилл выявили их высокую адге-зивность по отношению к формалинизированным эритроцитам. У крыс, кроликов и хомячков адгезивные штаммы составляли 48, 39 и 62% от общего количества изученных культур соответственно. Способностью подавлять рост хотя бы одной из тест-культур обладали 3,7% штаммов изолированных у крыс, i i ,5% - у кроликов и 8,4% - у хомячков.
Заключение. Проведено сравнительное изучение видового состава, а также адгезивных и антогонистических свойств лактобактерий ЖКТ 3-х видов модельных животных - удобных кандидатов для доклинических испытаний.
ЭНТЕРОКОККИ АНТАРКТИКИ: ВИДОВОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ПАТОГЕННЫЙ ПОТЕНЦИАЛ
Колоджиева В.В. 12 , Гончаров Н.Е.3, Ткачев П.В.2 , Гончаров А.Е. 2,1
Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова; 2Институт экспериментальной медицины; Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург, Россия
ENTEROCOCCI OF POLAR HABITATS: SPECIES DIVERSITY AND PATHOGENIC POTENTIAL
Kolodzhieva V.V12, Goncharov N.E. 3, Tkachev P.V.2 , Goncharov A.E.21
1 North-Western State Medical University named after I.I. Mechnikov; 2Institute of Experimental Medicine; 3Pasteur Research Institute of Epidemiology and Microbiology, St. Petersburg, Russia
В настоящее время представления об экологии бактерий рода Enterococcus, включающего условно-патогенных возбудителей нозокомиальных инфекций, существенно изменялись, в частности, появляются доказательства того, что энтерококки способны длительно персистировать в природных экосистемах (Weigand M.R., 2014). В то же время вопрос о потенциальной патогенности природных штаммов энтерококков практически не изучен.
Цель исследования - получение предварительной характеристики биоразнообразия штаммов Enterococcus spp., выделенных из орнитогенных местообитаний Антарктиды.
Материалы и методы. Проанализировано i85 образцов биологического материала (погадки, фекалии, вода пресноводных озер), ассоциированного с мигрирующими птицами Антарктики (Pagodroma nivea, Catharacta maccormicki, Pygosceiis adeiiae). Видовую идентификацию микроорганизмов проводили методом MALDI-TOF. Полногеномное секвенирование штамма 85-4d выполняли с помощью технологии Illumina MiSeq. Алгоритм BLAST использован для сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей.
Результаты. Энтерококки обнаружены в 39 из i85 исследуемых образцов (2i,G8%). В видовом составе выделенных изолятов преобладал Enterococcus faecaiis (94,8%), энтерококки других видов (E. hermammiensis, E. faecium, E. devriesei) были представлены единичными находками. В ходе исследования был секвенирован и аннотирован геном штамма Enterococcus faecaiis 85-4d, выделенный из гуано на острове Кинг-Джордж. (GenBank Acc.№ SAXBGGGGGGGG.i). К особенностям данного генома относятся наличие ряда генов вирулентности (желати-назы, фибронектин/фибриноген связывающего белка, гемолизинов, коллагеназы), геномного острова размером 6,8 kb, содержащего гены цитолизина и коллаген-связывющего белка, аналогичного острову патогенности LIPI-i патогенных листе-рий и наличие гена белка холодового шока, филогенетически близкого соответствующему гену психротрофной бактерии Crassaminiceiia sp. SY095 (GenBank Acc.№ CPG42243.i).
Заключение. Возможность формирования в орнитогенных местообитаниях Антарктики необычных вирулентных генотипов условно-патогенных бактерий, таких как энтерококки, позволяет поставить вопрос о необходимости систематического микробиологического мониторинга в полярных регионах в локализациях, посещаемых перелетными птицами.
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ ШТАММОВ ESCHERICHIA COLI СЕРОГРУППЫ О25 К БАКТЕРИОФАГАМ
Колупаева Л.В.12, Слукин П.В.1, Фурсова Н.К.1
'Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск; 2Пущинский государственный естественно-научный институт, Пущино, Россия
ESCHERICHIA COLISEROGROUP О25 STRAINS SUSCEPTIBILITY TO BACTERI-OPHAGES
Kolupaeva L.V.1,2, Slukin P.V.1, Fursova N.K.1
1State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk; 2Pushchino State Institute of Natural Science, Pushchino, Russia
Цель исследования - определение чувствительности антибиотикорези-стентных уропатогенных штаммов Escherichia coli серогруппы О25 к литическим бактериофагам.
Материалы и методы. Штаммы E. coli (n=102) выделены из мочи пациентов, имевших урологические заболевания и находившихся на лечении в медицинских учреждениях г. Москвы в 2016-2019 гг. Принадлежность к серогруппе определяли методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) со специфичными праймерами (Li D. et al., 2010). Устойчивость к 7 антибактериальным препаратам (АБП) - ампициллину (АМП), амоксиклаву (АМК), цефтазидиму (ЦЕФ), ципрофлоксацину (ЦИП), гентамицину (ГЕН), фосфомицину (ФОС) и нитрофурантоину (НИТ) выявляли методом серийных разведений в бульоне, в соответствии с рекомендациями EUCAST 10.0. Бактериофаги (БФ) N1, N5, N6, N13, N35 и N44 выделены из сточных вод г. Серпухова и г. Троицка Московской области в 2016-2018 гг. Чувствительность бактерий к бактериофагам устанавливали спот-методом, степень лизиса культуры оценивали по четырёхкрестной системе (Асланов, 2015).
Результаты. Все исследуемые уропатогенные штаммы E. coli (УПЭК) отнесены к О25 серогруппе. Показано, что эти штаммы устойчивы хотя бы к одному из использованных АБП. К АМП были устойчивы 97%, к АМК - 90%, к ЦЕФ - 93%, к ЦИП - 96%, к ГЕН - 44%, к ФОС - 9%, к НИТ - 14% штаммов. При этом множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) обладали 55 штаммов. Установлено, что 1% был не чувствителен ни к одному БФ; чувствительны: 7% - к 1 БФ, 10% - к 2 БФ, 32% - к 3 БФ, 20% - к 4 БФ, 20% - к 5 БФ, 11% - к 6 БФ. Среди штаммов с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) большинство (n=54) были чувствительны к 1-6 БФ, а один МЛУ штамм не был чувствителен ни к одному из использованных БФ.
Выводы. Охарактеризованные штаммы УПЭК клинически значимой серо-группы О25 обладают высоким уровнем устойчивости к антибактериальным препаратам. Большинство этих штаммов чувствительны к литическому действию бактериофагов, которые могут быть использованы для разработки новых терапевтических препаратов против уропатогенов.
Работа выполнена в рамках НИР 049 Роспотребнадзора.
ХАРАКТЕРИСТИКА СИКВЕНС-ТИПОВ СРЕДИ УРОШТАММОВ ENTEROCOCCUS FAECALIS, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ЮГЕ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА
Коменкова Т.С., Зайцева Е.А.
Тихоокеанский государственный медицинский университет, Владивосток, Россия
SEQUENCE-TYPES CHARACTERISTIC OF UROPATHOGENIC ENTEROCOCCUS FAECALIS ISOLATED IN THE SOUTH OF THE FAR EAST
Komenkova T.S., Zaitseva E.A.
Pacific State Medical University, Vladivostok, Russia
Цель - характеристика сиквенс-типов (ST) у клинически значимых уропатогенных Enterococcus faecaiis, выделенных в Приморском крае.
Материалы и методы. Исследовано 42 штамма E. faecaiis, изолированных в 2013-2017 гг. из мочи детей в возрасте от 3 дней до 16 лет с инфекциями мочевы-водящих путей (ИМП). Чувствительность энтерококков к антимикробным препаратам (АМП) определяли диско-диффузионным методом. Детекцию генов патогенности (aggA-esp-cylA-efaA-eep-gelE) проводили с помощью полимеразной цепной реакции. Генотипирование осуществляли методом мультилокусного сиквенс типирования.
Результаты. Среди уропатогенных E. faecaiis выявлено четырнадцать (ST6, ST16, ST21, ST25, ST40, ST41, ST64, ST116, ST133, ST151, ST179, ST774, ST480, ST537) сиквенс-типов, наиболее распространенными из которых были ST179 (n=13), ST774 (n=6), ST6 (n=5). Сиквенс-тип ST179 характеризовался наличием максимального числа исследуемых генов патогенности (aggA-esp-cyiA-efaA-eep-gelE). Среди штаммов данного ST обнаружено три фенотипа резистентности: 1) устойчивые к гентамицину и триметоприму сульфаметоксазолу (ТС) (n=2); 2) устойчивые только к гентамицину (n=7); 3) устойчивые только к ТС (n=1). Наиболее резистентными оказались E. faecaiis ST6 и ST774. Все штаммы ST6 имели одинаковый профиль генов патогенности (aggA-efaA-eep-geiE) и один фенотип резистентности (устойчивость к фторхинолонам, аминогликозидам и ТС). E. faecaiis ST774 несли aggA-efaA-eep гены и имели три фенотипа устойчивости к АМП: 1) резистентность к фторхинолонам, аминогликозидам и ТС (n=4); 2) резистентность к фторхинолонам и аминогликозидам (n=1); 3) резистентность к фторхино-
