Научная статья на тему 'Ассоциации вариабельных сайтов rs5743551 гена TLR1 и rs4986790 TLR4 со степенью поражения коронарного русла, оцененной по шкале syntax score, у больных с ишемической болезнью сердца'

Ассоциации вариабельных сайтов rs5743551 гена TLR1 и rs4986790 TLR4 со степенью поражения коронарного русла, оцененной по шкале syntax score, у больных с ишемической болезнью сердца Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
96
15
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Жидкова И. И., Понасенко А. В., Хуторная М. В., Кутихин А. Г., Барбараш О. Л.

Цель исследования. Выявить ассоциации аллельнитета [TLRs (Toll-like receptors)] со степенью пораженых вариантов генов рецепторов врожденного иммуния коронарного русла у пациентов с ишемической болезнью сердца (ИБС). Материалы и методы исследования. В исследо­вание включены 292 пациента, подвергшиеся аортокоронарному шунтированию на базе НИИ КПССЗ, г. Кеме­рово в 2011-2012 гг. В зависимости от показателей по шкале SYNTAX SCORE пациенты были разделены на две группы: в первую группу включены 180 (61,64%) паци­ентов, тяжесть поражения коронарного русла у кото­рых не превышала 22 балла по шкале SYNTAX SCORE, а во вторую 112 (36,38%) человек, имеющие выражен­ный стеноз коронарных артерий (от 23 баллов и выше шкале SYNTAX SCORE). Материалом служили образцы геномной ДНК. Исследовали 8 аллельных вариантов 4 генов системы TLRs: TLR1 (rs5743551 и rs5743611), TLR2 (rs3804099 и rs5743708), TLR4 (rs4986790 и rs4986791), TLR6 (rs3775073 и rs5743810). Выделение производи­лось методом фенол-хлороформной экстракции из цельной венозной крови. Генотипирование проводили по технологии TaqMan в формате RT-PCR, по протоколу производителя. Математическая обработка проводи­лась при помощи программы SNPStats. Для оценки ри­ска, обусловленного наличием определенных аллелей или генотипов, высчитывали отношения шансов (ОШ) с 95% доверительными интервалами (95%ДИ). Различия считали статистически значимыми при p<0,05. Мате­матические модели расчета рисков рассчитывались посредством бинарной логистической регрессии с по­шаговым включением и исключением предикторов. Результаты исследования: Первая модель осно­вывалась на математическом расчете величины риска каждого из возможных предикторов, при включении и исключении 16 клинических факторов риска (инфаркт миокарда, дислипидемия, нарушения углеводного обмена, индекс массы тела > 25 кг/м2, III-IV функцио­нальный класс стенокардии и хронической сердечной недостаточности, дебют ИБС в возрасте 55 лет и моло­же, пол, артериальная гипертензия, курение, фракция выброса левого желудочка (ФВ ЛЖ) <55%, двухсосуди­стое и более поражение коронарных артерий (КА), сте­ноз артерий нижних конечностей и брахиоцефальных артерий от 50% и более, мультифокальный атероскле­роз, ишемический инсульт). Значимыми предикторами оказались такие клинические показатели, как ФВ ЛЖ <55% и однососудистое поражение КА. На модели про­демонстрировано, что в случае определения у пациен­та однососудистого поражения КА его риски развития тяжелого стеноза коронарных артерий снижаются в 6,25 раза. В противоположность, уменьшение ФВ ЛЖ <55% увеличивает индивидуальные риски тяжелого поражения КА в 1,92 раза. Площадь под ROC-кривой составила 0,677 (0,620-0,730). Вторая модель с вве­дением в анализ генетических предикторов (TLRs) к 15 клиническим предикторам демонстрирует, что в дополнение к рискам, сопровождающим снижение у пациента ФВ ЛЖ <55%, в случае носительства геноти­па C/T сайта rs5743551 TLR1 риск тяжелого поражения КА увеличивается в 1,83 раза. В то же время риск тя­желого поражения КА меньше в три раза у носителей генотипа A/G сайта rs4986790 TLR4, что, в совокупности с однососудистым поражением КА, является благопри­ятным фактором течения заболевания. Площадь под ROC-кривой составила 0,677 (0,620-0,730). Заключение. При определении генотипа C/T вари­абельного сайта rs5743551 TLR1 и ФВ менее 55% мож­но прогнозировать выявление тяжелых форм коро­нарного атеросклероза (показатель по шкале SYNTAX SCORE > 23 баллов). Носительство генотипа A/G сайта rs4986790 TLR4 в совокупности с однососудистым по­ражением КА является благоприятным фактором тече­ния ИБС.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Жидкова И. И., Понасенко А. В., Хуторная М. В., Кутихин А. Г., Барбараш О. Л.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Ассоциации вариабельных сайтов rs5743551 гена TLR1 и rs4986790 TLR4 со степенью поражения коронарного русла, оцененной по шкале syntax score, у больных с ишемической болезнью сердца»

что только у 6 из 24 исследованных случаев ткани аорты больных фракции ТДСЬЫ (гладкомышечного трансгели-на) практически не детектировались. В области липофи-брозных бляшек в интиме количество изоформ ТДСЬЫ увеличивалось еще больше, и только в 5 случаях они практически не детектировалось. Во всех случаях количество ТДСЬЫ в интиме было меньше, чем в параллельных образцах медиального слоя. Более того, в тех случаях, где в интиме наблюдалось накопление гладкомышечных клеток (6 из 18), в трети случаев выраженно менялось и соотношение количества разных вариантов трансгелина. Кроме этого, в интиме больных было также выявлено в 11 из 24 случаев увеличение количества трех фракций в зоне липофиброзных бляшек, идентифицированных

как Ы-концевые фрагменты трансгелина. В медиальном слое такие фрагменты если и обнаруживались, то только в следовом количестве. Более того, данные фракции фрагментов ТДСЬЫ оказались и частично окисленными, что характерно для многих белков при атерогенезе, но впервые выявлено для трансгелина.

Выводы. Полученные результаты протеомного исследования в целом показали, что гладкомышечный трансгелин является активным компонентом механизма патогенеза атеросклероза не менее чем у трети больных. У части пациентов выявлено наличие аутоантител к глад-комышечному трансгелину. Показано участие гладкомышечного трансгелина в прогрессировании атеросклероза как его этапа, или одной из форм течения заболевания.

АССОЦИАЦИИ ВАРИАБЕЛЬНЫХ САЙТОВ (^4986790 и ^4986791) ГЕНА ^4 С АТЕРОСКЛЕРОТИЧЕСКИМ ПОРАЖЕНИЕМ БРАХИОЦЕФАЛЬНЫХ АРТЕРИЙ У БОЛЬНЫХ СО СТАБИЛЬНОЙ ФОРМОЙ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА

И.И. ЖИДКОВА, А.В. ПОНАСЕНКО, М.В. ХУТОРНАЯ, А.Г. КУТИХИН, О.Л. БАРБАРАШ Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний», Кемерово, Россия

Цель исследования. Выявить ассоциации аллельных вариантов генов рецепторов врожденного иммунитета [TLRs (Toll-like receptors)] с риском развития атеросклеро-тического поражения брахиоцефальных артерий (БЦА) у пациентов с ишемической болезнью сердца (ИБС).

Материалы и методы исследования. В исследование включены 292 пациента, подвергшиеся аортокоро-нарному шунтированию на базе НИИ КПССЗ, г. Кемерово в 2011-2012 гг. В первую группу пациентов без стенозов и стенозами БЦА < 30% по данным ультразвукового исследования вошли 188 (64,38 %) человек, во вторую группу пациентов со стенозами БЦА более 30% вошли 104 (35,62%) пациента. Материалом служили образцы геномной ДНК. Исследовали 8 аллельных вариантов 4 генов системы TLRs: TLR1 (rs5743551 и rs5743611), TLR2 (rs3804099 и rs5743708), TLR4 (rs4986790 и rs4986791), TLR6 (rs3775073 и rs5743810). Выделение производилось методом фенол-хлороформной экстракции из цельной венозной крови. Генотипиро-вание проводили по технологии TaqMan в формате RT-PCR, по протоколу производителя. Математическая обработка проводилась при помощи программы SNPStats. Для оценки риска, обусловленного наличием определенных алле-

лей или генотипов, высчитывали отношения шансов (ОШ) с 95% доверительными интервалами (95%ДИ). Различия считали статистически значимыми при p<0,05.

Результаты исследования. Распределение частот генотипов во всех группах соответствовало равновесию Харди-Вайнберга (Hardy-Weinberg equilibrium, HWE). Аллель G вариабельного сайта rs4986790 и аллель T вариабельного сайта rs4986791 гена TLR4 ассоциированы с повышением в 2 раза риска развития стенозов БЦА более 30 % у пациентов с ИБС (ОШ = 2,41, 95% ДИ = 1,30-4,44, p = 0,0046 и ОШ = 2,15, 95% ДИ = 1,20-4,00, p = 0,01, соответственно), независимо от пола и возраста пациентов. Кроме того, гетерозиготный А/G генотип вариабельного сайта rs4986790 гена TLR4 ассоциирован с увеличением в 2 раза риска развития стенозов БЦА более 30% у мужчин с ИБС (ОШ = 2,23, 95% ДИ = 1,09-4,56, p = 0,037).

Заключение. Результаты настоящего исследования продемонстрировали участие генов рецепторов врожденного иммунитета (TLRs): вариабельных сайтов (rs4986790 и rs4986791) гена TLR4 в увеличении риска развития атеросклероза БЦА (наличия стенозов более 30%) у пациентов со стабильной формой ИБС.

АССОЦИАЦИИ ВАРИАБЕЛЬНЫХ САЙТОВ rs5743551 ГЕНА TLR1 И rs4986790 TLR4 СО СТЕПЕНЬЮ ПОРАЖЕНИЯ КОРОНАРНОГО РУСЛА, ОЦЕНЕННОЙ ПО ШКАЛЕ SYNTAX SCORE, У БОЛЬНЫХ С ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНЬЮ СЕРДЦА

И.И. ЖИДКОВА, А.В. ПОНАСЕНКО, М.В. ХУТОРНАЯ, А.Г. КУТИХИН, О.Л. БАРБАРАШ Федеральное государственое бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний», Кемерово, Россия

Цель исследования. Выявить ассоциации аллель- нитета [TLRs (Toll-like receptors)] со степенью пораже-ных вариантов генов рецепторов врожденного имму- ния коронарного русла у пациентов с ишемической

болезнью сердца (ИБС).

Материалы и методы исследования. В исследование включены 292 пациента, подвергшиеся аортоко-ронарному шунтированию на базе НИИ КПССЗ, г. Кемерово в 2011-2012 гг. В зависимости от показателей по шкале SYNTAX SCORE пациенты были разделены на две группы: в первую группу включены 180 (61,64%) пациентов, тяжесть поражения коронарного русла у которых не превышала 22 балла по шкале SYNTAX SCORE, а во вторую - 112 (36,38%) человек, имеющие выраженный стеноз коронарных артерий (от 23 баллов и выше шкале SYNTAX SCORE). Материалом служили образцы геномной ДНК. Исследовали 8 аллельных вариантов 4 генов системы TLRs: TLR1 (rs5743551 и rs5743611), TLR2 (rs3804099 и rs5743708), TLR4 (rs4986790 и rs4986791), TLR6 (rs3775073 и rs5743810). Выделение производилось методом фенол-хлороформной экстракции из цельной венозной крови. Генотипирование проводили по технологии TaqMan в формате RT-PCR, по протоколу производителя. Математическая обработка проводилась при помощи программы SNPStats. Для оценки риска, обусловленного наличием определенных аллелей или генотипов, высчитывали отношения шансов (ОШ) с 95% доверительными интервалами (95%ДИ). Различия считали статистически значимыми при p<0,05. Математические модели расчета рисков рассчитывались посредством бинарной логистической регрессии с пошаговым включением и исключением предикторов.

Результаты исследования: Первая модель основывалась на математическом расчете величины риска каждого из возможных предикторов, при включении и исключении 16 клинических факторов риска (инфаркт миокарда, дислипидемия, нарушения углеводного обмена, индекс массы тела > 25 кг/м2, III-IV функциональный класс стенокардии и хронической сердечной

недостаточности, дебют ИБС в возрасте 55 лет и моложе, пол, артериальная гипертензия, курение, фракция выброса левого желудочка (ФВ ЛЖ) <55%, двухсосуди-стое и более поражение коронарных артерий (КА), стеноз артерий нижних конечностей и брахиоцефальных артерий от 50% и более, мультифокальный атеросклероз, ишемический инсульт). Значимыми предикторами оказались такие клинические показатели, как ФВ ЛЖ <55% и однососудистое поражение КА. На модели продемонстрировано, что в случае определения у пациента однососудистого поражения КА его риски развития тяжелого стеноза коронарных артерий снижаются в 6,25 раза. В противоположность, уменьшение ФВ ЛЖ <55% увеличивает индивидуальные риски тяжелого поражения КА в 1,92 раза. Площадь под ROC-кривой составила 0,677 (0,620-0,730). Вторая модель с введением в анализ генетических предикторов (TLRs) к 16 клиническим предикторам демонстрирует, что в дополнение к рискам, сопровождающим снижение у пациента ФВ ЛЖ <55%, в случае носительства генотипа C/T сайта rs5743551 TLR1 риск тяжелого поражения КА увеличивается в 1,83 раза. В то же время риск тяжелого поражения КА меньше в три раза у носителей генотипа A/G сайта rs4986790 TLR4, что, в совокупности с однососудистым поражением КА, является благоприятным фактором течения заболевания. Площадь под ROC-кривой составила 0,677 (0,620-0,730).

Заключение. При определении генотипа C/T вариабельного сайта rs5743551 TLR1 и ФВ менее 55% можно прогнозировать выявление тяжелых форм коронарного атеросклероза (показатель по шкале SYNTAX SCORE > 23 баллов). Носительство генотипа A/G сайта rs4986790 TLR4 в совокупности с однососудистым поражением КА является благоприятным фактором течения ИБС.

АССОЦИАЦИЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ НАРУШЕНИЙ ЛИПИДНОГО ОБМЕНА С ВНЕЗАПНОЙ СЕРДЕЧНОЙ СМЕРТЬЮ: ИССЛЕДОВАНИЕ СЛУЧАЙ-КОНТРОЛЬ

А. А. ИВАНОВА

«Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины» - филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия

Введение. Внезапная сердечная смерть (ВСС) продолжает оставаться одной из нерешенных проблем современного здравоохранения. ВСС составляет около 50% в структуре сердечно-сосудистой смертности. Одним из факторов риска ВСС являются нарушения липидного обмена.

Цель исследования. Поиск и изучение ассоциации молекулярно-генетических маркеров нарушений липидного обмена (гб1 800588 гена ИРС, Е2/Е3/Е4 гена АРОЕ, ^2516839 гена ОБП, ^2228314 гена SREBF2) с ВСС.

Материал и методы. Группа ВСС (п=391, средний возраст 52,9±9,2 лет, мужчины - 77,2%, женщины -22,8%) сформирована с использованием критериев ВСС ВОЗ и Европейского общества кардиологов, группа контроля (п=387, средний возраст 52,4 ± 8,8 лет,

мужчины - 62,3%, женщины - 37,7%) сформирована из банка ДНК международных исследований HAPIEE и MONICA. ДНК выделена методом фенолхлоро-формной экстракции. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующим анализом полиморфизма длин рестрик-ционных фрагментов и методом ПЦР в режиме реального времени (TaqMan зонды, Applied Biosystems, USA). Полученные результаты обработаны с помощью программы SPSS 16.0 с использованием хи-квадрата по Пирсону, точного двустороннего критерия Фишера с поправкой Йетса на непрерывность, тестов Колмогорова-Смирнова, ANOVA, Крускалла-Уоллиса и Манна-Уитни.

Результаты. По частотам генотипов полиморфиз-

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.