Научная статья на тему 'АНАЛИЗ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ РЕЦЕПТОРОВ СЕРОТОНИНА И ГАММА-АМИНОМАСЛЯНОЙ КИСЛОТЫ У БОЛЬНЫХ САХАРНЫМ ДИАБЕТОМ 2 ТИПА'

АНАЛИЗ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ РЕЦЕПТОРОВ СЕРОТОНИНА И ГАММА-АМИНОМАСЛЯНОЙ КИСЛОТЫ У БОЛЬНЫХ САХАРНЫМ ДИАБЕТОМ 2 ТИПА Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
52
9
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
САХАРНЫЙ ДИАБЕТ 2 ТИПА / НЕЙРОТРАСМИТТЕРНАЯ СИСТЕМА / РЕЦЕПТОРЫ СЕРОТОНИНА / РЕЦЕПТОР ГАММА-АМИНОМАСЛЯНОЙ КИСЛОТЫ

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Кочетова О.В., Авзалетдинова Д.Ш., Корытина Г.Ф., Викторова Т.В.

Актуальность: СД2 одно из наиболее распространенных заболеваний 21 века. СД2 имеет многофакторную природу, в его этиологии ведущую роль играют такие факторы, как возраст и ожирение, а также генетическая предрасположенность, обусловленная полиморфизмом ряда генов. Цель исследования: Анализ полиморфных вариантов генов рецепторов серотонина HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR2A rs6313, HTR3A rs1062613, HTR2C rs6318, гена рецептора гамма-аминомасляной кислоты GABRA2 rs279845, среди больных СД2, проживающих в РБ. Материалы и методы: Образцы ДНК включали группу больных СД2 691 человек и контроль 1096 человек. Исследование полиморфных маркеров проводили с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) TaqMan. Результаты: В результате изучения 6 полиморфных локусов генов нейротрансмиттерной системы были выявлены протективные маркеры, включающие генотипы CT и СС полиморфного локуса rs1062613 гена HTR3A (OR=0,73, Pcor_FDR=0,0007) и генотипы риска GC и CC полиморфного локуса rs6318 гена HTR2C (OR=2,21, Pcor_FDR=0,0045) среди женщин, генотип СС является рисковым и среди мужчин (OR=4,05, Pcor_FDR=0,0045). Мультилокусный анализ комбинаций генотипов и аллелей выявил пять сочетаний повышенного и пониженного риска развития СД2. Наиболее значимая ассоциация была выявлена для комбинации HTR3A rs1062613 аллель C+HTR2A rs6313 аллель A+HTRD rs674386 аллель А+HTR1F rs55639841 генотип СС (OR=1,74, Pcor_FDR=0,0004). Проведенный анализ ROC кривых показал, что исследуемые локусы HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR3A rs1062613, GABRA2 rs279845 и такие переменные как пол, возраст обследуемых и уровень ИМТ, включенные в построение модели расчета риска, могут предсказывать развитие СД2 с чувствительностью 79,0% и специфичностью 75,0%, площадь под кривой AUC составила 83,40% (95% CI 83,50-87,40). Заключение: Полученные результаты могут свидетельствует о высоком уровне прогностической значимости полиморфных вариантов генов нейротрасмиттерной системы в оценке предрасположенности к риску СД2.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Кочетова О.В., Авзалетдинова Д.Ш., Корытина Г.Ф., Викторова Т.В.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

ANALYSIS OF POLYMORPHIC VARIANTS OF SEROTONIN AND GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR GENES IN PATIENTS WITH TYPE 2 DIABETES MELLITUS

Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is an expanding global health problem of the 21st century. There has been a global increase in the number of patients with T2DM. It has established a strong association of obesity and age with T2DM. The aim of the study: To analyze polymorphic variants of the serotonin receptor genes HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR2A rs6313, HTR3A rs1062613, HTR2C rs6318, the gamma-aminobutyric acid receptor gene GABRA2 rs279845, in patients with type 2 diabetes living in the Republic of Bashkortostan. Materials and methods: DNA samples included a group of patients with T2DM - 691 individuals and control - 1096 individuals. The study of polymorphic markers was carried out using the polymerase chain reaction (PCR) TaqMan. Results: As a result of the study of 6 polymorphic loci of the genes of the neurotransmitter system, protective markers were identified, including the CT and CC genotypes of the rs1062613 polymorphic locus of the HTR3A gene (OR=0.73, Pcor_FDR=0.0007) and the GC and CC risk genotypes of the rs6318 polymorphic locus of the HTR2C gene (OR=2.21, Pcor_FDR =0.0045) among women, the CC genotype is also at risk among men (R=4.05, Pcor_FDR=0.0045). Multilocus analysis of combinations of genotypes and alleles revealed five combinations of increased and decreased risk of developing T2DM. The most significant association was found for the combination of HTR3A rs1062613 allele C + HTR2A rs6313 allele A + HTRD rs674386 allele A + HTR1F rs55639841 CC genotype (OR=1.74, Pcor_FDR=0.0004). The analysis of ROC curves showed that the studied loci HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR3A rs1062613, GABRA2 rs279845 and variables such as gender, age of the subjects and the level of BMI included in the construction of the risk calculation model can predict the development of T2DM with a sensitivity of 79.0% and a specificity of 75.0%, the area under the AUC curve was 83.40% (95% CI 83.50-87.40). Conclusion: The results obtained may indicate a high level of prognostic significance of polymorphic variants of the genes of the neurotransmitter system in the formation of predisposition to T2DM.

Текст научной работы на тему «АНАЛИЗ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ РЕЦЕПТОРОВ СЕРОТОНИНА И ГАММА-АМИНОМАСЛЯНОЙ КИСЛОТЫ У БОЛЬНЫХ САХАРНЫМ ДИАБЕТОМ 2 ТИПА»

DOI: 10.18413/2658-6533-2023-9-3-0-3 УДК 575.113.2

Анализ полиморфных вариантов

генов рецепторов серотонина и гамма-аминомасляной кислоты у больных сахарным диабетом 2 типа

О.В. Кочетова1'2 , Д.Ш. Авзалетдинова2 , Г.Ф. Корытина1'2 ,

Т.В. Викторова2

1 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук,

пр-т. Октября, д. 71, г. Уфа, 450054, Российская Федерация 2 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Башкирский государственный медицинский университет», ул. Ленина, д.3, г. Уфа, 450008, г. Уфа, Российская Федерация Автор для переписки: О.В. Кочетова (Olga_mk78@mail.ru)

Резюме

Актуальность: СД2 одно из наиболее распространенных заболеваний 21 века. СД2 имеет многофакторную природу, в его этиологии ведущую роль играют такие факторы, как возраст и ожирение, а также генетическая предрасположенность, обусловленная полиморфизмом ряда генов. Цель исследования: Анализ полиморфных вариантов генов рецепторов серотонина HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR2A rs6313, HTR3A rs1062613, HTR2C rs6318, гена рецептора гамма-аминомасляной кислоты GABRA2 rs279845, среди больных СД2, проживающих в РБ. Материалы и методы: Образцы ДНК включали группу больных СД2 691 человек и контроль 1096 человек. Исследование полиморфных маркеров проводили с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) TaqMan. Результаты: В результате изучения 6 полиморфных локусов генов нейротрансмиттерной системы были выявлены протективные маркеры, включающие генотипы CT и СС полиморфного локуса rs1062613 гена HTR3A (OR=0,73, Pcor_FDR=0,0007) и генотипы риска GC и CC полиморфного локуса rs6318 гена HTR2C (OR=2,21, Pcor_FDR=0,0045) среди женщин, генотип СС является рисковым и среди мужчин (OR=4,05, Pcor_FDR=0,0045). Мультилокусный анализ комбинаций генотипов и аллелей выявил пять сочетаний повышенного и пониженного риска развития СД2. Наиболее значимая ассоциация была выявлена для комбинации HTR3A rs1062613 аллель C+HTR2A rs6313 аллель A+HTRD rs674386 аллель А+HTR1F rs55639841 генотип СС (OR=1,74, Pcor_FDR=0,0004). Проведенный анализ ROC кривых показал, что исследуемые локусы HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR3A rs1062613, GABRA2 rs279845 и такие переменные как пол, возраст обследуемых и уровень ИМТ, включенные в построение модели расчета риска, могут предсказывать развитие СД2 с чувствительностью 79,0% и специфичностью 75,0%, площадь под кривой AUC составила 83,40% (95% CI 83,50-87,40). Заключение: Полученные результаты могут свидетельствует о высоком уровне прогностической значимости полиморфных вариантов генов нейротрасмиттерной системы в оценке предрасположенности к риску СД2.

Ключевые слова: сахарный диабет 2 типа; нейротрасмиттерная система; рецепторы серото-нина; рецептор гамма-аминомасляной кислоты

Для цитирования: Кочетова ОВ, Авзалетдинова ДШ, Корытина ГФ, и др. Анализ полиморфных вариантов генов рецепторов серотонина и гамма-аминомасляной кислоты у больных сахарным диабетом 2 типа. Научные результаты биомедицинских исследований. 2023;9(3): 322-332. DOI: 10.18413/2658-6533-2023-9-3-0-3

Analysis of polymorphic variants of serotonin and gamma-aminobutyric acid receptor genes in patients with type 2 diabetes mellitus

Olga V. Kochetova1'2 , Diana Sh. Avzaletdinova2 , Gulnaz F. Korytina1'2 ,

Tatiana V. Viktorova2

1 Ufa Scientific Center, RAS, 71 Oktyabrya Ave., Ufa, 450054, Russia 2 Bashkir State Medical University, 3 Lenin St., Ufa, 450008, Russia Corresponding author: Olga V. Kochetova (Olga mk78@mail.ru)

Abstract

Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is an expanding global health problem of the 21st century. There has been a global increase in the number of patients with T2DM. It has established a strong association of obesity and age with T2DM. The aim of the study: To analyze polymorphic variants of the serotonin receptor genes HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR2A rs6313, HTR3A rs1062613, HTR2C rs6318, the gamma-aminobutyric acid receptor gene GABRA2 rs279845, in patients with type 2 diabetes living in the Republic of Bashkortostan. Materials and methods: DNA samples included a group of patients with T2DM - 691 individuals and control - 1096 individuals. The study of polymorphic markers was carried out using the polymerase chain reaction (PCR) TaqMan. Results: As a result of the study of 6 polymorphic loci of the genes of the neurotransmitter system, protective markers were identified, including the CT and CC genotypes of the rs1062613 polymorphic locus of the HTR3A gene (OR=0.73, Pcor_FDR=0.0007) and the GC and CC risk genotypes of the rs6318 polymorphic locus of the HTR2C gene (OR=2.21, Pcor_FDR =0.0045) among women, the CC genotype is also at risk among men (R=4.05, Pcor_FDR=0.0045). Multilocus analysis of combinations of genotypes and alleles revealed five combinations of increased and decreased risk of developing T2DM. The most significant association was found for the combination of HTR3A rs1062613 allele C + HTR2A rs6313 allele A + HTRD rs674386 allele A + HTR1F rs55639841 CC genotype (OR=1.74, Pcor_FDR=0.0004). The analysis of ROC curves showed that the studied loci HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR3A rs1062613, GABRA2 rs279845 and variables such as gender, age of the subjects and the level of BMI included in the construction of the risk calculation model can predict the development of T2DM with a sensitivity of 79.0% and a specificity of 75.0%, the area under the AUC curve was 83.40% (95% CI 83.50-87.40). Conclusion: The results obtained may indicate a high level of prognostic significance of polymorphic variants of the genes of the neu-rotransmitter system in the formation of predisposition to T2DM.

Keywords: type 2 diabetes mellitus; neurotransmitter system; serotonin receptors; gamma-aminobu-tyric acid receptor

For citation: Kochetova OV, Avzaletdinova DSh, Korytina GF, et al. Analysis of polymorphic variants of serotonin and gamma-aminobutyric acid receptor genes in patients with type 2 diabetes mellitus. Research Results in Biomedicine. 2023;9(3):322-332. Russian. DOI: 10.18413/2658-6533-20239-3-0-3

Введение. Сахарный диабет 2 типа (СД2) является метаболическим заболеванием, характеризующимся повышенным содержанием глюкозы в крови, его развитие обусловлено формированием резистентности инсулину [1]. Распространенность СД2 увеличивается во всем мире, приводя к снижению качества жизни и преждевременной смерти [1]. Основываясь на концепции психобиосоциальной модели патогенеза СД2 и рассматривая образ жизни в качестве триггерного фактора формирования СД2, актуальным и целесообразным представляется изучение нейро-траснмиттеров при развитии СД2. Одним из нейромедиаторов центральной нервной системы является серотонин (5-НТ), который принимает участие в регуляции сложного поведения, например, такого как агрессия и контроль аппетита [2]. Серото-нин встречается в организме в двух разных пулах, один в центральной нервной системе и другой в периферических тканях. Примерно 90% всего 5-НТ, присутствующего в организме, вырабатывается клетками желудочно-кишечного тракта, выделяемый нейромедиатор принимает участие в контроле секреции инсулина [3]. Установлено, что измененные функции серотонина обуславливает дисфункцию ß-клеток поджелудочной железы и в конечном итоге приводят к развитию СД2 [4]. Bennet H., 2015 установили, что повышенная экспрессия генов HTR1D и HTR2A в ткани ß-клеток поджелудочной железы среди больных СД2 по сравнению со здоровым контролем [5]. Исследования связи СД2 и серото-нинергической системы выявили ассоциацию полиморфных вариантов генов рецепторов серотонина HTR2A, HTR2C с риском развития СД2 типа у европеоидов [6, 7], полиморфные варианты гена HTR3B ассоциированы с СД2 типа у корейцев [8], полиморфизм гена HTR2C связан с СД2 у иранцев [9]. Полиморфные варианты гена GABRA2, кодирующий а2 субъединицу рецептора гамма-аминомасляной кислоты (ГАМК-а),

были связаны с риском зависимости от алкоголя [10]. Также эти рецепторы, играют важную роль в регуляции секреции инсулина и высвобождения глюкагона в остров-ковых клетках поджелудочной железы как у здоровых, так и у пациентов СД2 [11]. По результатам GWAS исследований среди жителей Арабских Эмиратов для генов ГАМК- а были определены маркеры риска развития СД2 [12]. Однако роль нейротрасмиттеров в патогенезе СД2 остается мало изученной. В этой связи анализ полиморфных вариантов генов нейротрасмиттерной системы представляет актуальную проблему.

Цель исследования. Анализ полиморфных вариантов генов рецепторов серо-тонина HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR2A rs6313, HTR3A rs1062613, HTR2C rs6318, гена рецептора гамма-аминомасляной кислоты GABRA2 rs279845, среди больных СД2, проживающих в Республике Башкортостан (РБ).

Материалs и методы исследования. В работе были использованы образцы ДНК неродственных индивидов, татар по этнической принадлежности, проживающих на территории Республики Башкортостан. Группа больных СД2 включала 691 человек. Клинический диагноз СД2 определялся согласно диагностическим критериям Всемирной организации здравоохранения (1999-2013 гг.) и Алгоритмам специализированной медицинской помощи больным сахарным диабетом от 2021 г.: концентрация глюкозы в плазме венозной крови натощак более или равно 7,0 ммоль/л, либо концентрация глюкозы в плазме венозной крови через 2 часа после проведения ПГТТ более или равно 11,1 ммоль/л [1]. Группа пациентов была сформирована с учетом клинико-инструментального исследования на базе многопрофильного стационара Городская клиническая больница №21 г. Уфа. Контрольная группа включала 1096 практически здоровых индивидов. Характеристика групп пациентов и контроля представлена в таблице 1.

Таблица 1

Характеристика выборок, включенных в исследование

Table 1

Characteristics of the samples included in the study

Параметры Контроль n = 1096 СД2 n = 691 P value

Возраст, лет, среднее ± Std,Dv 51,82 ±9,70 58,08 ±12,28 0,050

Мужчины, п (%) 263 (23,90) 158 (22,20) 0,483

Женщины, п (%) 833 (76,01) 555 (77,80)

Индекс массы тела (ИМТ) (кг/м2), среднее ± SD 26,72 ±2,78 31,12 ± 5,82 <0,0001

Ожирение, п (%) - 612 (85,80) -

Длительность СД2, медиана — 7,23 [2; 15] —

Артериальная гипертензия, п (%) - 602 (84,50) -

Сердечно сосудистые заболевания, п (%) — 256 (36,00) —

(%), медиана Г01;031 4,90 [3,8; 5,90] 9,20 [7,10; 14,00] <0,0001

Глюкоза натощак (ммоль/л), медиана 4,80 [3,20; 5,90] 8,36 [8,31; 15,00] <0,0001

Общий холестерин (ммоль/л), медиана 4,50 [3,30; 6,12] 5,30 [3,20; 10,30] 0,0008

ЛПНП (ммоль/л), медиана 2,70 [0,79; 3,99] 3,20 [1,60; 7,09] <0,005

ЛПВП (ммоль/л), медиана 1,10 [0,87; 1,40] 1,10 [0,85; 1,30] 0,080

Триглицериды (ммоль/л), медиана 1,32 [1,10; 2,07] 1,67 [1,15; 2,17] 0,029

Примечание: ЛПНП - липопротеины низкой плотности, ЛПВП - липопротеины высокой плотности, Std. dv. -стандартное отклонение

Note: ЛПНП - low density lipoproteins, ЛПВП - high density lipoproteins, Std. dv. - standard deviation

Исследование одобрено комитетом по этике ИБГ УФИЦ РАН. От всех участников исследования получали информированное добровольное согласие на использование биологического материала в планируемых исследованиях.

ДНК выделяли из венозной крови методом фенольно-хлороформной экстракции. Исследование полиморфных маркеров проводили с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) TaqMan (https://oligos.ru, ООО «ДНК-синтез», Россия) на приборе CFX Bio-Rad Laboratories Inc., USA. Флуоресценцию «по конечной точке» и дискриминацию генотипов определяли по протоколу BioRad CFX96TM, используя программу CFX Manager TM Software.

Статистическая обработка. Оценку соответствия частота генотипов и аллелей равновесию Харди-Вайнберга проводили с помощью критерия х2 (Р х-в). Анализ ассоциаций с развитием СД2 проводили с использованием программы PLINK v.1.9 [13]. Поправку на множественность сравнения

Pcor_FDR оценивали с помощью он-лайн калькулятора

https://www.sdmproject.com/utilities/?show= FDR. Ассоциация считалась значимой при уровне Pcor_FDR менее 0.05, а 95% доверительный интервал не пересекал единицу. Анализ ассоциаций рассчитанной для основной группы представлен в моделях: ко-доминатной и аддитивной, а также в виде аллельного теста. Множественной логистический регрессионный анализ и ROQ-ана-лиз проводился с использованием SPSS v.22. Анализ ген-генных ассоциаций с СД2 между аллелем и или/генотипом был рассчитан с помощью программы APSampler 3.6.0 (http://apsampler.sourceforge.net).

Результаты и обсуждения. Для проведения анализа ассоциаций первоначально был произведен расчет на соответствие распределения частот генотипов исследованных полиморфных локусов равновесию Харди-Вайнберга, с учетом частоты редкого аллеля (MAF) среди больных и здоровых испытуемых (Табл. 2).

Таблица 2

Описание исследуемых генов и равновесие Харди-Вайнберга

Table 2

Description of the studied genes and the Hardy-Weinberg equilibrium

Полиморфизм Ген Локализация Р х-в контроль Р х-в пациенты MAF (European) MAF

rs279845 GABRA2 chr 4:463277G6 0,10 0,05 44,8 44,G

rs1G62613 HTR3A chr11:113975284 0,06 0,42 22,6 25,G

rs6318 HTR2C chrX:114731326 0,52 0,26 16,2 8,G

rs6313 HTR2A chr 13:468958G5 0,11 0,39 42,G 48,G

rs674386 HTRD chr1:23192984 0,28 0,79 22,1 27,G

rs56398417 HTR1F chr3:87975836 0,42 0,01 28,8 17,G

Примечание: Х-В уровень значимости при определении равновесия Харди-Вайнберга, MAF (European) частота минорного аллеля в популяция европеоидов (проект 1000 геномов), MAF - частота минорного аллеля в контрольной группе.

Note: X-B significance level in determining the Hardy-Weinberg equilibrium, MAF (European) minor allele frequency in the Caucasian population (1000 genomes project), MAF - minor allele frequency in the control group.

Локус гена HTR2C расположенного в Х-хромосоме анализировали отдельно у женщин и мужчин. Анализ проводился в кодоминатной и аддитивной моделях, а также оценивался аллельный тест, данные представлены в таблице 3. Статистически значимые различия были получены для локуса ге1062613 гена HTR3A в кодоминант-ной модели для генотипов СТ и СС (ОЯ=0,71 и ОЯ=0,59, Роог_рэк=0,004). В аддитивной модели показатель ОЯ составил 0,73, Роог_рэк=0,0007. Для полиморфного локуса ге6318 гена HTR2C получены статистически значимые различия в группе женщин. В кодоминантной модели ассоциация с риском развития СД2 определена для генотипов ОС и СС (ОЯ=2,37 (95% С1 1,743,24), Роог_рэк=0,0045, ОЯ=2,77 (95% С1 0,93-8,25), Рсог_рэк=0,0045). Учитывая, что доверительный интервал во-втором случае пересек 1, наиболее статистически значимой моделью является аддитивная ОЯ=2,21 (95% С1 1,66-2,94), Роог_рэк=0,0045). Среди мужчин генотип СС также ассоциировал с риском развития СД2 (ОЯ=4,05, Роог_рэк=0,0045). Анализ локуса ^279845 гена GABRA2 выявил тенденцию к увеличению частоты генотипа ТТ среди пациентов до 37,2% по сравнению с 31,0% в контроле (ОЯ=0,75 и ОЯ=0,79, Роог_рэк=0,046), соответственно для проективных генотипов СТ и СС.

В результате проведения мультило-кусного анализа ассоциаций определено

пять сочетаний генотипов и аллелей, показавших статистическую значимость с СД2. Аллель C локуса rs1062613 гена HTR3A входил в состав двух моделей повышенного риска СД2 и аллель Т входит в состав трех моделей пониженного риска. В трех моделях встречался локус rs674386 гена HTRD, в этом случае аллель А представлена в модели повышенного риска заболевания, аллель G определялся в составе моделей пониженного риска (Pcor_FDR=0,007 и (Pcor_FDR=0,001). При индивидуальном анализе ассоциация аллель G также чаще встречался среди здоровых. наиболее значимая ассоциация была выявлена для сочетания HTR3A rs1062613 аллель C +HTR2A rs6313 аллель A+HTRD rs674386 аллель A+HTR1F rs55639841 генотип СС (OR=1,74, Pcor_FDR=0,0004).

При анализе ROC кривых для оценки прогностической значимости выявленных рисковых значений в развитии СД2 были построены две модели, для первой модели были учтены только полиморфные локусы: HTRD rs674386, HTR1F rs56398417, HTR3A rs1062613, GABRA2 rs279845, во вторую модель были включены эти же локусы, а также такие переменные как пол, возраст обследуемых и ИМТ. Эффективность прогноза измеряли с использованием площади под кривой (AUC). ROC-анализ показал AUC равную 56.70% (95% CI 53,90-59,40) для модели, включающей только исследуемые полиморфные варианты.

Таблица 3 (начало)

Ассоциация исследованных полиморфных локусов генов рецепторов серотонина и GABBRA2

Beginning of Table 3

Association of studied polymorphic loci of serotonin receptor genes and GABBRA2

Ген, ОНП Модель Аллель, генотип СД2 п/ (%) Контроль п/(%) OR (95 CI) P P fdr

HTR1D rs674386 Кодоминантная GG/AG/AA 330 (47,80)/ 296 (42,90)/ 63 (9,10) 591 (53,90)/ 418 (38,10)/ 87 (7,90) 1,00/ 1,27 (1,04-1,56)/ 1,30 (0,91-1,84) 0,045 0,062

HTR1D rs674386 Аллельный тест G/A 957 (69,00)/ 423 (31,00) 1600 (73,00)/ 592 (27,00) 1,19 (1,02-1,39) 0,019 0,046

HTR1D rs674386 Аддитивная — — 1,19 (1,03-1,38) 0,021 0,046

HTR1F rs56398417 Кодоминантная CC/CT/TT 499 (72,30)/ 165 (23,90)/ 26 (3,80) 780 (71,20)/ 294 (26,80)/ 22 (2,00) 1,00/ 0,88 (0,70-1,09)/ 1,85 (1,04-3,30) 0,041 0,062

HTR1F rs56398417 Аллельный тест C/T 1163 (84,00)/ 217 (16,00) 1854 (85,00)/ 338 (17,00) 1,02 (0,85-1,23) 0,843 0,932

HTR1F rs56398417 Аддитивная — — 1,02 (0,85-1,23) 0,812 0,932

GABRA2 rs279845 Кодоминантная TT/AT/AA 257 (37,20)/ 307 (44,40)/ 127 (18,40) 340 (31,00)/ 542 (49,50)/ 214 (19,50) 1,00/ 0,75 (0,60-0,93) / 0,79 (0,60-1,03) 0,023 0,046

GABRA2 rs279845 Аллельный тест T/A 821 (59,00)/ 561 (41,00) 1222 (56,00)/ 970 (44,00) 0,86 (0,75-0,98) 0,034 0,055

GABRA2 rs279845 Аддитивная — — 0,86 (0,76-0,99) 0,034 0,055

HTR3A rs1062613 Кодоминантная CC/CT/TT 440 (63,70)/ 227 (32,90)/ 24 (3,50) 604 (55,10)/ 435 (39,70)/ 57 (5,20) 1,00/ 0,71 (0,58-0,87)/ 0,59 (0,36-0,96) 0,0012 0,004

HTR3A rs1062613 Аллельный тест C/T 1107 (80,00)/ 275 (20,00) 1643 (74,90)/ 549 (25,00) 0,74 (0,63-0,88) 0,0001 0,00045

HTR3A rs1062613 Аддитивная — — 0,73 (0,64-0,88) 0,0002 0,0007

HTR2A rs6313 Кодоминантная CC/CA/AA 177 (25,60)/ 356 (51,60)/ 157 (22,80) 290 (26,50)/ 559 (51,00)/ 247 (22,50) 1,00 / 1,04 (0,83-1,31)/ 1,04 (0,79-1,37) 0,931 0,931

HTR2A rs6313 Аллельный тест C/A 710 (51,00)/ 670 (49,00) 1139 (52,00)/ 1053 (48,00) 1,02 (0,89-1,17) 0,931 0,931

HTR2A rs6313 Аддитивная — — 1,02 (0,89-1,17) 0,761 0,931

Таблица 3 (окончание)

Ассоциация исследованных полиморфных локусов генов рецепторов серотонина и GABBRA2

End of Table 3

Ген, ОНП Модель Аллель, генотип СД2 п/ (%) Контроль п/(%) OR (95 CI) P P fdr

HTR2C rs6318 Кодоминантная женщины GG/GC/CC 554 (68,70)/ 235 (29,10)/ 18 (2,20) 341 (84,00)/ 61 (15,00)/ 4 (1,00) 1,00 2,37 (1,74-3,24)/ 2,77 (0,93-8,25) 0,0001 0,00045

HTR2C rs6318 Аллельный тест женщины G/C 1343 (83,00)/ 271 (17,00) 743 (92,00)/ 69 (8,00) 2,17 (1,64-2,87) 0,0001 0,00045

HTR2C rs6318 Аддитивная женщины — — 2,21 (1,66-2,94) 0,0001 0,00045

HTR2C rs6318 Мужчины гемизиготы G/C 114 (75,50)/ 37 (24,50) 237 (92,60)/ 19 (7,40) 1,00/ 4,05 (2,23-7,35) 0,0001 0,00045

Примечание: жирным шрифтом выделены статистически значимые различия, ОНП - однонуклеотидный полиморфизм. Note: Statistically significant differences are in bold, SNPs are single nucleotide polymorphisms.

Для второй модели AUC составила 83,40% (95% CI 83,50-87,40) с чувствительностью 79,0% и специфичностью 75,0%, что указывает на высокую способность показателей включенных в анализ правильно классифицировать индивидов с СД2 и здоровых.

Наибольшее количество ассоциаций продемонстрировал полиморфный вариант rs1062613 гена HTR3A. Данный полиморфизм расположен в 5'UTR области гена, установлено, что аллель С данного полиморфного локуса влияет на аффинность связывания фактора транскрипции CTCF с промоторной областью гена HTR3A [14]. По данным ряда авторов аллель С ассоциирован с низкой экспрессией гена HTR3A

[15] и высоким уровень метилирования

[16]. Низкая экспрессия, в свою очередь, обуславливает снижение уровня серото-нина в центральной нервной системе, приводит к изменению пищевого поведения и развитию гиперфагии, а впоследствии и ожирения, провоцирующего развитие СД2

[17]. Ассоциация с развитием СД2 была показана для локуса rs6318 гена HTR2C. Данный полиморфизм обусловлен заменой аминокислоты Cys на Ser в 23 положении. Показано, что белок, кодируемый аллелем Ser23 или С имеет пониженную аффинность к серотонину [18]. Рядом авторов установлена ассоциация данного локуса с риском развития депрессии [18], а также ожирения и СД2, что подтверждает наши данные [19-21]. Локус rs279845 гена GABRA2 ассоциирован с алкоголизмом, носители аллеля Т в меньшей степени страдают алкоголизмом [22, 23].

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Заключение. В данном исследовании мы провели оценку влияния полиморфных вариантов генов нейротрансмиттерной системы на риск развития СД2 с помощью анализа комбинаций генотипов и аллелей, а также анализа ROC кривых. Показано, что набор генетических вариантов (HTRD rs674386, HTRIF rs56398417, HTR3A rs1062613, GABRA2 rs279845) и таких показателей как пол, возраст и значение ИМТ,

достоверно улучшает прогнозирование развития СД2 среди жителей РБ. Анализ комбинаций генотипов и аллелей выявил пять сочетаний повышенного и пониженного риска развития СД2. Тем не менее, необходимы дальнейшие масштабные исследования нейротрансмиттерной системы для подтверждения значимости генов рецепторов серотонина в развитии СД2.

Информация о финансировании

Исследование поддержано Российским научным фондом (№22-25-00010). Financial support

The study was supported by the Russian Science Foundation (No22-25-00010).

Конфликт интересов

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. Conflict of interests

The authors have no conflict of interest to declare.

Список литературы

1. Дедов ИИ, Шестакова МВ, Майоров АЮ, редакторы. Алгоритмы специализированной медицинской помощи больным сахарным диабетом. 10-й выпуск. М.; 2021. DOI: https://doi.org/10.14341/DM12802

2. Cataldo Bascunan LR, Lyons C, Bennet H, et al. Serotonergic regulation of insulin secretion. Acta Physiologica. 2019;225(1):e13101. DOI: https://doi.org/10.1111/apha.13101

3. Choi WG, Choi W, Oh TJ, et al. Inhibiting serotonin signaling through HTR2B in visceral adipose tissue improves obesity-related insulin resistance. Journal of Clinical Investigation. 2021;131(23):e145331. DOI: https://doi.org/10.1172/JCI145331

4. Georgescu T, Lyons D, Heisler LK. Role of serotonin in body weight, insulin secretion and glycaemic control. Journal of Neuroendocrinology. 2021;33(4):e12960. DOI: https://doi.org/10.1111/jne.12960

5. Bennet H, Balhuizen A, Medina A, et al. Altered serotonin (5-HT) 1D and 2A receptor expression may contribute to defective insulin and glucagon secretion in human type 2 diabetes. Pep-tides. 2015;71:113-120. DOI: https://doi.org/10.1016/j.peptides.2015.07.008

6. Kring SI, Werge T, Holst C, et al. Polymorphisms of serotonin receptor 2A and 2C genes and COMT in relation to obesity and type 2 diabetes. PLoS ONE. 2009;4(8):e6696. DOI: https://doi.org/10.1371/joumal.pone.0006696

7. Iordanidou M, Tavridou A, Vasiliadis MV, et al. The-759C/T polymorphism of the 5-HT2C receptor is associated with type 2 diabetes in male and female Caucasians. Pharmacogenetics and Genomics. 2008;18(2):153-159. DOI: https://doi.org/10.1097/FPC.0b013e3282f4ae93

8. Kwon YJ, Hong KW, Park BJ, et al. Serotonin receptor 3B polymorphisms are associated with type 2 diabetes: The Korean Genome and Epidemiology Study. Diabetes Research and Clinical Practice. 2019;153:76-85. DOI: https://doi.org/10.1016Zj.diabres.2019.05.032

9. Asadzadeh A, Seyedhosseini GH, Shole-hvar F, et al. Investigation of the Association between 5-Hydroxytryptamine Transporter Gene-Linked Polymorphic Region with Type 2 Diabetes Mellitus, Obesity and Biochemical Profiles of Serum in Iranian Population. Avicenna Journal of Medical Biotechnology. 2019;11(3):239-244.

10.Gajos JM, Russell MA, Cleveland HH, et al. Romantic Partner Alcohol Misuse Interacts with GABRA2 Genotype to Predict Frequency of Drunkenness in Young Adulthood. Journal of Contemporary Criminal Justice. 2019;35(1):7-20. DOI: https://doi.org/10.1177/1043986218810578

11. Al-Kuraishy HM, Hussian NR, Al-Naimi MS, et al. The Potential Role of Pancreatic y-Aminobutyric Acid (GABA) in Diabetes Mellitus: A Critical Reappraisal. International Journal of Preventive Medicine. 2021;12:19. DOI: https://doi.org/10.4103/ijpvm.IJPVM_278_19

12. Al Safar HS, Cordell HJ, Jafer O, et al. A genome-wide search for type 2 diabetes susceptibility genes in an extended Arab family. Annals of Human Genetics. 2013;77(6):488-503. DOI: https://doi.org/10.1111/ahg.12036

13.Purcell S, Neale B, Todd-Brown K, et al. PLINK: a tool set for whole-genome association and population-based linkage analyses. American Journal of Human Genetics. 2007;81(3):559-75. DOI: https://doi.org/10.1086/519795

14. Jahn K, Kurz B, Sinke C, et al. Serotonin system-associated genetic and epigenetic changes in pedophilia and child sexual offending. Journal of Psychiatric Research. 2021;145:60-69. DOI: https: //doi .org/10.1016/j .jpsychires.2021.11.042

15. Suchanecka A, Chmielowiec J, Chmie-lowiec K, et al. Serotonin Receptor HTR3A Gene

Polymorphisms rs1985242 and rs1062613, E-Cig-arette Use and Personality. International Journal of Environmental Research and Public Health. 2022;19(8):4746. DOI:

https://doi.org/10.3390/ijerph19084746

16. Ledermann K, Hasler G, Jenewein J, et al. 5'UTR polymorphism in the serotonergic receptor HTR3A gene is differently associated with stri-atal Dopamine D2/D3 receptor availability in the right putamen in Fibromyalgia patients and healthy controls-Preliminary evidence. Synapse. 2020;74(5):e22147. DOI: https://doi.org/10.1002/syn.22147

17.Manfredi L, Accoto A, Couyoumdjian A, et al. A Systematic Review of Genetic Polymorphisms Associated with Binge Eating Disorder. Nutrients. 2021;13(3):848. DOI: https://doi.org/10.3390/nu13030848

18.Levchenko A, Vyalova NM, Nurgaliev T, et al. NRG1, PIP4K2A, and HTR2C as Potential Candidate Biomarker Genes for Several Clinical Subphenotypes of Depression and Bipolar Disorder. Frontiers in Genetics. 2020;11:936. DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00936

19.Drago A, Serretti A. Focus on HTR2C: A possible suggestion for genetic studies of complex disorders. American Journal of Medical Genetics, Part B: Neuropsychiatric Genetics. 2009;150(5):601-637. DOI: https://doi.org/10.1002/ajmg.b.30864

20.Bah J, Westberg L, Baghaei F, et al. Further exploration of the possible influence of polymorphisms in HTR2C and 5HTT on body weight. Metabolism. 2010;59(8):1156-1163. DOI: https://doi.org/10.1016/j.metabol.2009.11.007

21. Santos-Júnior AD, Henriques TB, de Mello MP, et al. Pharmacogenetics of Risperidone and Cardiovascular Risk in Children and Adolescents. International Journal of Endocrinology. 2016;2016:5872423. DOI: https://doi.org/10.1155/2016/5872423

22. Schlomer GL, Cleveland HH, Deutsch AR, et al. Developmental Change in Adolescent Delinquency: Modeling Time-Varying Effects of a Preventative Intervention and GABRA2 Halpotype Linked to Alcohol Use. Journal of Youth and Adolescence. 2019;48(1):71-85. DOI: https://doi.org/10.1007/s10964-018-0929-z

23. Kim J, Park A. A systematic review: Candidate gene and environment interaction on alcohol use and misuse among adolescents and young adults. American Journal on Addictions. 2018;10:10.1111/ajad.12755. DOI: https://doi.org/10.1111/ajad.12755

References

1. Dedov II, Shestakova MV, Mayorov AYu., editors. Standards of specialized diabetes care. 10th edition. Moscow; 2021. Russian. DOI: https://doi.org/10.14341/DM12802

2. Cataldo Bascunan LR, Lyons C, Bennet H, et al. Serotonergic regulation of insulin secretion. Acta Physiologica. 2019;225(1):e13101. DOI: https://doi.org/10.1111/apha.13101

3. Choi WG, Choi W, Oh TJ, et al. Inhibiting serotonin signaling through HTR2B in visceral adipose tissue improves obesity-related insulin resistance. Journal of Clinical Investigation. 2021;131(23):e145331. DOI: https://doi.org/ 10.1172/JCI 145331

4. Georgescu T, Lyons D, Heisler LK. Role of serotonin in body weight, insulin secretion and glycaemic control. Journal ofNeuroendocrinology. 2021;33(4):e12960. DOI: https://doi.org/10.1111/jne.12960

5. Bennet H, Balhuizen A, Medina A, et al. Altered serotonin (5-HT) 1D and 2A receptor expression may contribute to defective insulin and glucagon secretion in human type 2 diabetes. Pep-tides. 2015;71:113-120. DOI: https://doi.org/10.1016/j.peptides.2015.07.008

6. Kring SI, Werge T, Holst C, et al. Polymorphisms of serotonin receptor 2A and 2C genes and COMT in relation to obesity and type 2 diabetes. PLoS ONE. 2009;4(8):e6696. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0006696

7. Iordanidou M, Tavridou A, Vasiliadis MV, et al. The-759C/T polymorphism of the 5-HT2C receptor is associated with type 2 diabetes in male and female Caucasians. Pharmacogenetics and Genomics. 2008;18(2):153-159. DOI: https://doi.org/10.1097/FPC.0b013e3282f4ae93

8. Kwon YJ, Hong KW, Park BJ, et al. Serotonin receptor 3B polymorphisms are associated with type 2 diabetes: The Korean Genome and Epidemiology Study. Diabetes Research and Clinical Practice. 2019;153:76-85. DOI: https://doi.org/10.1016Zj.diabres2019.05.032

9. Asadzadeh A, Seyedhosseini GH, Shole-hvar F, et al. Investigation of the Association between 5-Hydroxytryptamine Transporter Gene-Linked Polymorphic Region with Type 2 Diabetes Mellitus, Obesity and Biochemical Profiles of Serum in Iranian Population. Avicenna Journal of Medical Biotechnology. 2019;11(3):239-244.

10.Gajos JM, Russell MA, Cleveland HH, et al. Romantic Partner Alcohol Misuse Interacts with GABRA2 Genotype to Predict Frequency of

Drunkenness in Young Adulthood. Journal of Contemporary Criminal Justice. 2019;35(1):7-20. DOI: https://doi.org/10.1177/1043986218810578

11. Al-Kuraishy HM, Hussian NR, Al-Naimi MS, et al. The Potential Role of Pancreatic y-Aminobutyric Acid (GABA) in Diabetes Mellitus: A Critical Reappraisal. International Journal of Preventive Medicine. 2021;12:19. DOI: https://doi.org/10.4103/ijpvm.IJPVM_278_19

12. Al Safar HS, Cordell HJ, Jafer O, et al. A genome-wide search for type 2 diabetes susceptibility genes in an extended Arab family. Annals of Human Genetics. 2013;77(6):488-503. DOI: https://doi.org/10.1111/ahg.12036

13.Purcell S, Neale B, Todd-Brown K, et al. PLINK: a tool set for whole-genome association and population-based linkage analyses. American Journal of Human Genetics. 2007;81(3):559-75. DOI: https://doi.org/10.1086/519795

14. Jahn K, Kurz B, Sinke C, et al. Serotonin system-associated genetic and epigenetic changes in pedophilia and child sexual offending. Journal of Psychiatric Research. 2021;145:60-69. DOI: https://doi.org/ 10.1016/j .jpsychires.2021.11.042

15. Suchanecka A, Chmielowiec J, Chmie-lowiec K, et al. Serotonin Receptor HTR3A Gene Polymorphisms rs1985242 and rs1062613, E-Cig-arette Use and Personality. International Journal of Environmental Research and Public Health. 2022;19(8):4746. DOI: https://doi.org/10.3390/ijerph19084746

16. Ledermann K, Hasler G, Jenewein J, et al. 5'UTR polymorphism in the serotonergic receptor HTR3A gene is differently associated with stri-atal Dopamine D2/D3 receptor availability in the right putamen in Fibromyalgia patients and healthy controls-Preliminary evidence. Synapse. 2020;74(5):e22147. DOI: https://doi.org/10.1002/syn.22147

17.Manfredi L, Accoto A, Couyoumdjian A, et al. A Systematic Review of Genetic Polymorphisms Associated with Binge Eating Disorder. Nutrients. 2021;13(3):848. DOI: https://doi.org/10.3390/nu13030848

18. Levchenko A, Vyalova NM, Nurgaliev T, et al. NRG1, PIP4K2A, and HTR2C as Potential Candidate Biomarker Genes for Several Clinical Subphenotypes of Depression and Bipolar Disorder. Frontiers in Genetics. 2020;11:936. DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00936

19.Drago A, Serretti A. Focus on HTR2C: A possible suggestion for genetic studies of complex disorders. American Journal of Medical Genetics, Part B: Neuropsychiatric Genetics.

2009;150(5):601-637. DOI:

https://doi.org/10.1002/ajmg.b.30864

20.Bah J, Westberg L, Baghaei F, et al. Further exploration of the possible influence of polymorphisms in HTR2C and 5HTT on body weight. Metabolism. 2010;59(8):1156-1163. DOI: https://doi.org/10.1016/j.metabol.2009.11.007

21.Santos-Jrnior AD, Henriques TB, de Mello MP, et al. Pharmacogenetics of Risperidone and Cardiovascular Risk in Children and Adolescents. International Journal of Endocrinology. 2016;2016:5872423. DOI:

https://doi.org/10.1155/2016/5872423

22.Schlomer GL, Cleveland HH, Deutsch AR et al. Developmental Change in Adolescent Delinquency: Modeling Time-Varying Effects of a Preventative Intervention and GABRA2 Halpotype Linked to Alcohol Use. Journal of Youth and Adolescence. 2019;48(1):71-85. DOI: https://doi.org/10.1007/s10964-018-0929-z

23.Kim J, Park A. A systematic review: Candidate gene and environment interaction on alcohol use and misuse among adolescents and young adults. American Journal on Addictions. 2018;10:10.1111/ajad.12755. DOI:

https://doi.org/10.1111/ajad.12755

Статья поступила в редакцию 1 сентября 2022 г. Поступила после доработки 28 октября 2022 г. Принята к печати 24 декабря 2022 г.

Received 1 September 2022 Revised 28 October 2022 Accepted 24 December 2022

Информация об авторах

Ольга Владимировна Кочетова, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории физиологической генетики Института биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук; доцент кафедры биологии ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет», г. Уфа, Российская Федерация, E-mail: 01ga_mk78@mail.ru, ORCID: https://orcid.org/0000-0003-2071-0969. Диана Шамилевна Авзалетдинова, кандидат медицинских наук, доцент кафедры эндокринологии ФГБОУ ВО «Башкирский государственный

медицинский университет», г. Уфа, Российская Федерация, E-mail: ecolab_203@mail.ru, ORCID: https://orcid.org/0000-0002-1590-6433. Гульназ Фаритовна Корытина, доктор биологических наук, доцент, главный научный сотрудник лаборатории физиологической генетики Института биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук; профессор кафедры биологии ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет», г. Уфа, Российская Федерация, E-mail: guly_kory@mail.ru, ORCID:

https://orcid.org/0000-0002-1695-5173. Татьяна Викторовна Викторова, доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой биологии ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет», г. Уфа, Российская Федерация, E-mail: t_vict@mail.ru, ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8900-2480.

Information about the authors Olga V. Kochetova, Cand. Sci. (Biology), Senior Researcher at the Laboratory of Physiological Genetics, Institute of Biochemistry and Genetics, Ufa Scientific Center of RAS; Associate Professor at the Department of Biology, Bashkir State Medical University, Ufa, Russia, E-mail: Olga_mk78@mail.ru, ORCID: https://or-cid.org/0000-0003-2071-0969. Diana Sh. Avsaleydiniva, Cand. Sci. (Medicine), Associate Professor at the Department of Endocrinology, Bashkir State Medical University, Ufa, Russia, E-mail: ecolab_203@mail.ru, ORCID: https://orcid.org/0000-0002-1590-6433. Gulnas F. Korytina, Doct. Sci. (Biology), Associate Professor, Chief Researcher at the Laboratory of Physiological Genetics, Institute of Biochemistry and Genetics, Ufa Scientific Center of RAS; Professor at the Department of Biology, Bashkir State Medical University, Ufa, Russia, E-mail: guly_kory@mail.ru, ORCID: https://or-cid.org/0000-0002-1695-5173.

Tatiana V. Viktorova, Doct. Sci. (Medicine), Professor, Head of the Department of Biology, Bashkir State Medical University, Ufa, Russia, E-mail: t_vict@mail.ru, ORCID: https://orcid.org/ 0000-0001-8900-2480.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.