Научная статья на тему 'Внутрипородный полиморфизм генов рецепторов эстрогена (ESR) и меланокортина-4 (МС4R) украинской мясной породы свиней'

Внутрипородный полиморфизм генов рецепторов эстрогена (ESR) и меланокортина-4 (МС4R) украинской мясной породы свиней Текст научной статьи по специальности «Животноводство и молочное дело»

CC BY
129
32
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
молекулярно-генетический полиморфизм / ПЦР–ПДРФ / гены коли-чественных признаков / генотипы / ESR / МС4R / воспроизводительные и откормочные качества / украинская мясная порода свиней. / molecular-genetic polymorphism / PCR-RFLP / quantitative trait genes / geno-types / ESR / MС4R / reproductive and feeding qualities / the Ukrainian meat pig breed.

Аннотация научной статьи по животноводству и молочному делу, автор научной работы — Е.В. Сидоренко, С.А. Костенко

Установлен полиморфизм и проанализирована генетическая структура свиней укра-инской мясной породы по генам ESR и МС4R. Обнаружено, что частота генотипа ВВ гена ESR в породе составляет 0,05, гетерозигот (АВ) – 0,67, аллеля В – 0,38. Частота гетерозиготного генотипа (МР) гена МС4R породе составляла 0,42, а частота гомозигот-ных генотипов ММ и РР – 0,27 и 0,31 соответственно, аллеля Р – 0,52.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по животноводству и молочному делу , автор научной работы — Е.В. Сидоренко, С.А. Костенко

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Intrabreeding gene polymorphism of estrogen receptors (ESR) and melanocortine-4 (МС4R) in the Ukrainian meat breed.

Polymorphism of the Ukrainian meat breed has been established and the genetic structure of the breed has been analyzed on grounds of ESR and MS4R genes. It has been revealed that the BB genotype frequency of the ESR gene in the breed is 0.05, frequency of heterozygotes (AB) is 0.67, and that of B-allele – 0.38. The frequency of heterozygous genotype (MP) of MC4R gene in the breed was 0.42, and frequency of MM and PP homozygous genotypes– 0.27 and 0.31 respectively, and that of P-allele – 0.52.

Текст научной работы на тему «Внутрипородный полиморфизм генов рецепторов эстрогена (ESR) и меланокортина-4 (МС4R) украинской мясной породы свиней»

6. Deeming, D.C. Ostrich. Biology, breeding end diseases / D.C. Deeming. - United Kingdom: Manchester University, 1999. - 342 p.

7. Deeming, D.C. Ostrich eggs - an incubation challenge / D.C. Deeming // World Poultry. - 1996. - V 12 (11). - P. 49-53.

8. Deeming, D.C. Ratite egg incubation, a practical guide / D.C. Deeming // Ratite Conference, High Wycombe, UK. - 1997. - 171 p.

9. Drawer, K. The ostrich as farm animal / K. Drawer // Veterinary medical review. -1994. - V 1/76. - P. 105-109.

10. Horbanczuk, J.O. Doskonalenie technologii sztucznych legow strusia afrykanskiego z uwzqlednieniem aspektow biologicznych / J.O. Horbanczuk // Prace i materially Zootechniczne. - 2000. - V. 10. - P. 112-117.

11. Satteneni, G. Factors affecting hatchability of ostrich eggs / G. Satteneni, D.G. Satterlee // Poultry Science. - 1994. - Vol. 9. - P. 113.

12. Stewart, J.S. Ratite incubation / J. S. Stewart // Proceedings of the Association of Avian Veterinarians. - New Orleans, 1992. - P. 336-339.

13. Wilson, H.R. Storage time and ostrich egg hatchability / H.R. Wilson, A.R. Eldred, C.J. Wilcox // Applied Poultry Science. - 1997. - V. 6. - P. 216-220.

УДК 575:636.4.082.4

ВНУТРИПОРОДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ

РЕЦЕПТОРОВ ЭСТРОГЕНА (ESR) И МЕЛАНОКОРТИНА-4 (MC4R) УКРАИНСКОЙ МЯСНОЙ ПОРОДЫ СВИНЕЙ

Е.В. СИДОРЕНКО Институт разведения и генетики животных НААН Украины с. Чубинское, Бориспольский р-н, Киевская обл., Украина, 08321 С.А. КОСТЕНКО

Национальный университет биоресурсов и природопользования Украины г. Киев, Украина, 03041

(Поступила в редакцию 26.01.2012)

Введение. Интенсивное развитие животноводства невозможно без использования достижений генетики и селекции. Первое десятилетие нынешнего столетия называют золотым временем для развития гено-мики [1]. Современная селекция имеет возможность базироваться на использовании методов оценки потенциально ценных в племенном отношении животных на уровне их генотипов с использованием моле-кулярно-генетических маркеров [2-4]. Они дают возможность не только проводить исследования генетической структуры пород, оценивать микроэволюционные процессы в популяциях под действием искусственного отбора, но и прогнозировать их продуктивные качества. Идентификация и контроль генетической изменчивости - обязательное условие сохранения и удачного использования существующих пород животных [4].

На сегодняшний день накоплен опыт в выявлении полиморфизма племенных животных по генам, связанным с хозяйственно полезными признаками. Для свиноводства актуальными являются репродуктивные [5] и откормочные [6] качества животных.

Среди генов, полиморфизм которых ассоциирован с показателями воспроизводительных функций свиней, наиболее изученным является

15

ген рецептора эстрогена (ЕБЯ), локализованный на хромосоме 1 (р. 2.5 -р. 2.4) [7]. Влияние этого гена на воспроизводительные качества обусловлено его однонуклеотидным полиморфизмом (аллели А и В).

Ген рецептора меланокортина-4 (МС4Я) считают потенциальным маркером откормочных и мясных качеств, который также локализован на хромосоме 1 №2 - q27) [13]. Полиморфизм этого гена обусловлен наличием двух аллелей Ми Р и способствует лучшему потреблению корма (примерно на 10 %), более высоким приростам живой массы (68 %) и массы животных на откорме (6-10 %) [5].

Цель работы - исследовать полиморфизм и анализ генетической структуры свиней украинской мясной породы по генам Е8Я и МС4Я.

Материал и методика исследований. Отбор генетического материала (волосяных фолликул) осуществляли в ведущих хозяйствах, занимающихся разведением свиней украинской мясной породы: ГП ОХ «Элита» Киевской обл. (Центральный тип (ЦТ), п = 21), ГП ОХ «Гон-таровка» Харьковской обл. (Харьковский тип (ХТ), п = 49) и ООО «Лу-говское» Днепропетровской обл. (селекции Днепропетровского сельскохозяйственного государственного университета (ДСХУ), п = 34).

Генетический анализ проводили в лаборатории генетики Института разведения и генетики животных НААН Украины. Геномную ДНК свиней выделяли с помощью комплекта реактивов «ДНК-сорб В» (АмплиСенс, Россия) в соответствии с рекомендациями производителя. Начальный этап лизиса проводили в течение двух часов при температуре 65 оС. Полиморфизм исследованных генов анализировали методом ПЦР-ПДРФ (полимеразная цепная реакция, полиморфизм длин рестрикционных фрагментов) по методикам, представленным в источниках [8-10].

Рестрикцию продуктов ПЦР проводили с помощью эндонуклеаз Руи II (для гена ЕБЯ) и Тад1 (для гена МС4Я) согласно рекомендациям производителя («Сибензим», Россия). Рестрикционные фрагменты разделяли в 4%-ном агарозном геле (Хеликон, Россия). Электрофоре-граммы визуализировали на трансилюминаторе в УФ свете. Статистическую обработку результатов осуществляли путем анализа распределения частот аллелей и генотипов, отклонения от состояния равновесия согласно закону Харди-Вайнберга [11].

Результаты исследований и их обсуждение. Украинская мясная порода свиней является одной из самых многочисленных среди пород мясного направления продуктивности, разводимых в Украине [8]. Эта порода создавалась в 1981-1993 гг. под методическим руководством ученых Полтавского Института свиноводства УААН во главе с доктором сельскохозяйственных наук Б.В. Баньковским путем сложного воспроизводительного скрещивания крупной белой, миргородской, ландрас, уэльс, пьетрен, уэссекс-сеудлбекской и украинской степной белой пород. В табл. 1 и 2 представлены частоты аллелей и генотипов по генам ЕБЯ и МС4Я у свиней украинской мясной породы.

У свиней ХТ и селекции ДСХУ частота генотипа ВВ была в пределах от 0,03 до 0,08. У представителей ЦТ этот генотип нами не обнаружен.

Таблица 1. Частоты генотипов и аллелей гена ЕЖ у свиней украинской мясной породы

Тип п Генотип (р ± Sв) Аллель ^ ± $0) X2

АА АВ ВВ А В

ЦТ 21 Ф 0,19±0,086 0,81±0,086 - 0,60±0,034 0,40±0,041 9,73**

О 0,36±0,104 0,48±0,109 0,16±0,081

ХТ 49 Ф 0,31±0,066 0,61±0,070 0,08 ± 0,039 0,61±0,022 0,39±0,027 4,08*

О 0,38±0,069 0,48±0,071 0,14 ± 0,051

ДСХУ 34 Ф 0,29±0,078 0,68±0,080 0,03±0,029 0,63±0,025 0,37±0,033 7,04**

О 0,40±0,084 0,47±0,086 0,13±0,059

Всего 104 Ф 0,28±0,044 0,67±0,046 0,05±0,021 0,62±0,015 0,38±0,019 18,09***

О 0,38±0,048 0,47±0,049 0,14±0,034

*Р<0,05; **Р<0,01; ***Р<0,001 (различия между фактическим (Ф) и ожидаемым (О) распределением гетерозигот согласно закону Харди - Вайнберга).

Наименьшая частота генотипа АА наблюдалась в популяции свиней ЦТ, у свиней ХТ и селекции ДСХУ частота этого генотипа была почти на одном уровне. Частота гетерозиготного генотипа АВ находилась в пределах от 0,61 до 0,81. Частота аллеля В была в пределах от 0,37 (селекции ДСХУ) до 0,40 (ЦТ). Всего по породе частота генотипа ВВ составляет 0,05, гетерозигот (АВ) - 0,67, аллеля В - 0,38. Анализ соответствия полученных частот генотипов гена EВR всех исследованных популяций свиней с распределением согласно закону Харди - Вайнберга свидетельствует о достоверно высоком (Р<0,01) смещении генетического равновесия в пользу гетерозигот. Таким образом, наблюдается статистически достоверное увеличение частот гетерозигот в исследованных популяциях. Это может свидетельствовать о наличии отбора в пользу гетерозигот, поскольку, по нашим данным, гетерозиготы АВ гена ESR имеют преимущества как по воспроизводительным, так и по откормочным качествам. Хряки - носители генотипов ВВ и АВ пород крупная белая и ландрас лучше аналогов генотипа АА по объему эякулята, концентрации и количеству сперматозоидов в эякуляте. Свиноматки крупной белой породы генотипа АВ по толщине шпика лучше носителей генотипа ВВ на 4,04 мм (р <0,01) [12].

При анализе опоросов свиноматок крупной белой породы и белорусской мясной Н.В. Журина (2006) установила, что общее количество поросят при рождении у животных с генотипом ВВ достоверно (Р<0,05) превосходило аналогов с генотипом АА на 0,7 гол. Данная закономерность сохранялась и по числу живорожденных поросят, предпочтение в пользу носителей генотипа ВВ составило 0,9 гол. [13].

Сравнение полученных нами результатов по частоте генотипа ВВ (0-0,13) с породами ландрас (0-0,04), дюрок (0-0,12), пьетрен (0-0,18), крупная мясная (0,02) [12-16] показывает, что исследованные нами популяции украинской мясной породы соответствуют показателям мясных пород. При исследовании белорусской мясной породы, генофонд которой использовали при создании украинской мясной породы,

17

И.П. Шейко и коллеги (2005) не выявили носителей генотипа ВВ [15]. В дальнейших исследованиях этой породы Н.В. Журина (2006) [13] и О.А. Епишко и др. (2008) [14] частота генотипа ВВ не превышала 0,073. Таким образом, по сравнению с белорусской мясной породой некоторые популяции украинской мясной породы характеризуются более высокой частотой генотипа ВВ гена ESR. Это может быть обусловлено как направлением отбора на многоплодие, так и эффектом основателя благодаря использованию крупной белой породы в качестве материнской, которая характеризуется высокими частотами алле-ля В по сравнению с мясными породами [12].

Частоты генотипов и аллелей гена MC4R у свиней украинской мясной породы представлены в табл. 2.

Таблица 2. Частоты генотипов и аллелей гена МС4R у свиней украинской мясной породы

Тип n Генотип (p ± Sp) Алель (q ± Sq) х2

ММ МР РР М Р

ЦТ 21 Ф 0,14±0,076 0,62±0,106 0,24±0,093 0,45±0,040 0,55±0,037 1,31

О 0,20±0,088 0,50±0,109 0,30±0,100

ХТ 49 Ф 0,41±0,064 0,39±0,070 0,20±0,058 0,60±0,022 0,40±0,027 1,77

О 0,36±0,069 0,48±0,071 0,16±0,052

ДСХУ 34 Ф 0,15± 0,061 0,35±0,082 0,50±0,086 0,32±0,033 0,68±0,023 1,27

О 0,10±0,053 0,44±0,085 0,46±0,085

Всего 104 Ф 0,27±0,044 0,42±0,048 0,31±0,045 0,48±0,018 0,52±0,017 2,43

О 0,23±0,041 0,50±0,049 0,27±0,044

Среди исследованных нами популяций высокая частота генотипа РР гена МС4R была характерна для свиней селекции ДСХУ и составила 0,50, а генотипа ММ у свиней ХТ - 0,41. Частота гетерозиготного генотипа МР находилась в пределах от 0,39 (ХТ) до 0,62 (ЦТ). Частота аллеля Р находилась в пределах от 0,40 (ХТ) до 0,68 (селекции ДСХУ). В целом по породе частота гетерозиготного генотипа (МР) составила 0,42, а гомозиготных генотипов ММ и РР - 0,27 и 0,31 соответственно, аллеля Р - 0,52. Распределение частот генотипов гена МС4R отвечало ожидаемому согласно закону Харди - Вайнберга. Это может свидетельствовать об отсутствии отбора по откормочным качествам в исследованных популяциях.

Сравнение полученных нами данных с результатами исследований пород свиней мясного направления продуктивности, которых использовали при создании украинской мясной породы, свидетельствует, что частота гомозиготного генотипа РР находилась в пределах от 0,040 (пьетрен) [9] до 0,300 (дюрок) [17]. У свиней породы ландрас частота этого генотипа составила 0,200 [13]. Таким образом, исследованные нами популяции животных характеризуются более широким размахом полиморфизма частот генотипов гена МС4R, чем другие мясные породы, которые принимали участие в создании исследованной украинской мясной породы. Это можно объяснить как разными направлениями

18

отбора при создании, так и случайными причинами (эффект основателя).

Заключение. Установлен полиморфизм и проанализирована генетическая структура украинской мясной породы свиней по генам ESR и MC4R. Выявлено, что частота генотипа ВВ гена ESR в породе составляет 0,05, гетерозигот (АВ) - 0,67, аллеля В - 0,38. Частота гетерозиготного генотипа (МР) по гену MC4R в породе составляла 0,42, а частота гомозиготных генотипов ММ и РР - 0,27 и 0,31 соответственно, аллеля Р - 0,52. Полученные нами данные свидетельствуют о необходимости дальнейшей работы по анализу генетической структуры других популяций свиней, обнаружении полиморфизма исследованных генов, а также установлении его воздействия на продуктивные признаки животных.

ЛИТЕРАТУРА

1. Development and Application of High-density SNP Arrays in Genomic Studies of Domestic Animals / Bin Fan, Zhi-Qiang Du, Danielle M. Gorbach, Max F. Rothschild // Asian-Aust. J. Anim. Sci. - Vol. 23. - No. 7. - P. 833-847.

2. Копилов, К.В. ДНК^агностика у селекцшно-племшнш робот! / К.В. Ко-пилов / Методологгя наукових дослщжень з питань селекци, генетики та бютехнологл у твариннищта: матер. наук.-теорет. конф., присвячено! пам'ят академжа УААН Вале-рiя Петровича Бурката. - Ки!в: Аграрна наука, 2010. - С. 68-69.

3. Метлицька, О.1. Методичш i прикладш особливост використання ISSR-PCR марюрування внутршньо- та ¡шжпородно! мшливосп свиней / О.1. Метлицька // Розведення i генетика тварин: ¡шжвщомчий тематичний науков. зб. - Ки!в, 2008. -Вип. 42. - С. 187-197.

4. Метлицька, О.1. Генетико-селекцшш аспекти прогнозування племшно! цшно-ст кнурiв / О.1. Метлицька, В.М. Гиря // В1СНИК Полтавсько! державно! аграрно! ака-демii. - 2011. - № 2. - C. 87-91.

5. Rothschild, M.F. Advances in pig molecular genetics, gene mapping and genomics / M.F. Rothschild // http: www.pdffinder.com.

6. Гетманцева, Л.В. Генетические детерменирование толщины шпика свиней товарных гибридов / Л.В. Гетманцева // Научный журнал КубГАУ. - 2011. - N° 69 (05).

7. A physically anchored linkage map of pig chromosome 1 uncovers sex-and position-specific recombination rates / H. Ellegren, B.Chowdhary, M. Fredholm [et al.] // Genomics. -1994. - Vol. 24. - Р. 342-350.

8. 1дентифжащя алельних варiантiв гешв ESR та MC4R, яю впливають на господар-сько-корисш ознаки свиш свшсько! Sus scrota, L. / О.М. Коновал, С.О. Костенко, В.Г. Спиридонов, С.Д. Мельничук. - Ки!в: Видавничий центр НУБiП Укра!ни, 2008. - 24 с.

9. Different allele frequencies of MC4R gene variants in Chinese pig Breeds / M. Chen, A. Wang, J. Fu and N. Li // Arch. Tierz., Dummerstorf. - 2004. - Vol. 47. - № 5. - P. 463-468.

10. Effect of the estrogen receptor locus on reproduction and production traits in four commercial рig lines / Т. H. Short, M. F. Rothschild, О. I. Southwood [et al.] // Anim. Sci. -1997. - Vol. 75. - P. 3138-3142.

11. Животовский, Л.А. Популяционная биометрия / Л.А. Животовский. - М.: Наука, 1991. - 271 с.

12. Сидоренко, О.В. Полiморфiзм гешв рецептс^в естрогену (ESR) i меланокор-тину-4 (MC4R) у свиней: автореф. дис. на здобуття наук. ступеня канд. с.-г. наук: спец. 03.00.15 «Генетика» / О. В. Сидоренко. - Чубинське, 2011. - 20 с.

13. Журина, Н.В. Влияние гена эстрогенового рецептора на репродуктивные признаки свиноматок крупной белой и белорусской мясной пород / Н. В. Журина // Весщ нацыянальнай акадэмп навук Беларуси - 2006. - № 4. - С. 71-74.

14. Е п и ш к о , О . А. Полигенный характер детерминации репродуктивных признаков свиноматок и воспроизводительных хряков-производителей белорусской мясной

породы / О.А. Епишко, Т.И. Епишко, Д.Е. Мостовой // Генетика и биотехнология XXI века. Фундаментальные и прикладные аспекты : материалы междунар. науч. конф., 3 - 6 дек. 2008 г. - Минск: Изд. центр БГУ, 2008. - С. 181-183.

15. Шейко, И.П. Разработка методов молекулярной генной диагностики и их использование в свиноводстве Беларуси / И.П. Шейко, Н.А. Лобан, О.Я. Василюк // Весщ нацыянальнай акадэми навук Беларуси - 2005. - № 1. - С. 62-66.

16. Effect of the estrogen receptor locus on reproduction and production traits in four commercial рig lines / Т. H. Short, M. F. Rothschild, О.1. Southwood [et al.] II Anim. Sci. -1997. - Vol. 75. - P. 3138-3142.

17. Kim, K.S. Rapid communication: linkage and physical mapping of the porcine melanocortin-4 receptor (MC4R) gene I K.S. Kim, N.J. Larsen, M.F. Rothschild II Journal of animal science. - 2000. - № 78. - P. 791-792.

УДК 636.22/28.082

ВЛИЯНИЕ СТЕПЕНЕЙ ИНБРИДИНГА НА МОЛОЧНУЮ ПРОДУКТИВНОСТЬ ЧЕРНО-ПЕСТРЫХ КОРОВ

А.И. ШЕНДАКОВ, С.П. КЛИМОВА, Т.А. ШЕНДАКОВА ФГБОУ ВПО «Орловский государственный аграрный университет» г. Орел, Россия, 302019

(Поступила в редакцию. 27.01.2012)

Введение. Молочное скотоводство занимает важное место в агропромышленном комплексе Орловской области. Уровень его развития влияет на продовольственную безопасность региона. За последние два десятилетия в области, традиционно занимающейся молочным животноводством, численность коров в хозяйствах всех категорий уменьшилась в четыре раза, а производство молока - в три раза. Для решения данных проблем Правительство области предприняло ряд мер по развитию молочного скотоводства. Была принята отраслевая целевая Концепция «Развитие молочного скотоводства и увеличение производства молока в Орловской области на 2009-2012 годы» [4].

В сложившейся ситуации сохранение биологического разнообразия и уникальных генетических свойств адаптированного поголовья крупного рогатого скота - одна из приоритетных задач селекции. Это необходимо, в частности, для того, чтобы улучшать экономически важные признаки, эффективно реагировать на меняющиеся запросы потребителей и противостоять изменениям в среде производства. В программах по сохранению генофонда сельскохозяйственных животных, разрабатываемых в разных странах, одно из центральных мест отводится инбридингу [1, 2, 8]. При этом во многих странах с развитым скотоводством происходит снижение генетической изменчивости основных селекционных признаков. В условиях интенсификации отрасли возрастает инбредная депрессия, что сопровождается повышением частоты рождения телят с генетическими аномалиями и снижением молочной продуктивности [3, 7].

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.