CC BY
66
ВЕСТНИК ПЕРМСКОГО УНИВЕРСИТЕТА
2011
БИОЛОГИЯ
Вып. 1
УДК 579.24+579.222.4
ЗАВИСИМОСТЬ КАРБОКСИЛЭСТЕРАЗНОЙ АКТИВНОСТИ ПОЧВЕННЫХ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ ОТ СТАДИИ РОСТА И СОСТАВА СРЕДЫ
Н. Б. Ремезовскаяа, А. Ю. Максимовa,b, В. А. Демаковa,b
a Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН, 614081, Пермь, ул. Голева, 13; [email protected] b Пермский государственный университет, 614990, Пермь, ул. Букирева, 15; [email protected]; (342)2807442
Изучена зависимость роста и карбоксилэстеразной активности почвенных грамотрицательных бактерий рода Pseudomonas от концентрации источника углерода, азота и фосфора. Установлено, что карбоксилэстеразная активность исследуемых культур имеет высокий уровень конститутивного выражения. При высоких концентрациях глюкозы (более 1%) наблюдается угнетение роста и понижение эстеразной активности. Карбоксилэстеразная активность культур P. flu-orescens в оптимальных условиях достигала 10 мкмоль/мг/мин.
Ключевые слова: биотрансформация; карбоксилэстераза; сложные эфиры; Pseudomonas.
В настоящее время бактериальные эстеразы эффективно применяют в органическом синтезе оптически чистых компонентов. Кроме того, они активно используются в качестве биодеструкторов при деградации органических соединений в загрязненных природных объектах. Интерес к данной группе ферментов связан еще и с тем, что эстеразы не являются зависимыми от кофакторов, а также обычно стабильны и даже активны в органических растворах (Bomscheuer, 2002). Несмотря на значительные успехи в области селекции микроорганизмов - продуцентов ферментов, потребность промышленности в новых штаммах непрерывно возрастает (Коновалов, 2002; Мубараков, 2002). В связи с этим поиск новых эффективных микроорганизмов, содержащих высокоактивные карбоксилэстеразы с целью создания на их основе биокатализаторов, является актуальной задачей (Доронина и др., 2006). Основным источником для скрининга и селекции высокоактивных штаммов для биотрансформации и биодеградации органических соединений являются почвы естественной среды и техногенно-измененные грунты (Звягинцев, 1987; Bornscheuer, 2002, Демаков и др., 2007).
Ранее нами были селекционированы и идентифицированы культуры грамотрицательных почвенных микроорганизмов, аэробных протеобакте-рий, относящиеся главным образом к роду Pseudomonas, обладающие высокой карбоксилэ-стеразной активностью, определены минимальные ингибирующие концентрации эфиров спиртов в диапазоне С1-С10 и исследована эстеразная активность штаммов в отношении ряда ацетатных эфиров (Старкова, Ремезовская, 2007).
В данной работе исследуются зависимость роста и карбоксилэстеразной активности почвенных грамотрицательных бактерий рода Pseudomonas от соотношения концентраций источника углерода, азота и фосфора.
Объекты и методы исследования
Объектами исследования являются штаммы почвенных псевдомонад, выделенные из образцов подзолистой луговой и аллювиальной болотной почв, не несущих значительной антропогенной нагрузки, собранных в Нытвенском районе Пермского края с глубины 5 и 20 см от поверхности.
Для выращивания штаммов микроорганизмов, утилизирующих эфиры карбоновых кислот, была использована синтетическая среда N, имеющая следующий состав (г/л): KH2PO4 - 1.0; K2HPO4 х 3H2O - 1.6; NaCl - 0.5; MgSO4 x 7H2O - 0.5; CaCl2 - 0.005; CoCl2 x 6H2O - 0.01; FeSO4 x 7H2O -0.005; pH 7.2 + 0.2. (Максимов и др., 2003). В качестве источника азота использовали NH4Cl в концентрации 10 mM, источника углеводов - глюкозу в концентрации 0.1% или бутилацетат в концентрации 2-10 мМ. Ростовые субстраты асептически добавляли до конечной концентрации в автокла-вированную и охлажденную до 25°С среду в соответствии с условиями эксперимента.
Количественное определение эстеразной активности по высвобождению р-нитрофенола из соответствующих его эфиров осуществляли с помощью фотоэлектроколориметра КФК-3 в кюветах с длиной оптического пути 0.5 см при Х=410 нм. В качестве субстрата использовали р-нитрофенил (№)-ацетат.
© Ремезовская Н. Б., Максимов А. Ю., Демаков В.А., 2011
60
25 мкл 10 мМ субстрата вносили в 2 мл среды, содержащей тестерную клеточную культуру. Реакцию проводили при температуре 22°С или 30°С (согласно условиям эксперимента) в течение 30 мин. Единица эстеразной активности (1ЕД) соответствует 1 мкмоль р-нитрофенола /мин /мг сухого веса клеток.
Результаты исследований
Зависимость роста и эстеразной активности
бактерий от состава ростовой среды
Исследовали влияние сочетаний различных концентраций фосфатов и глюкозы на рост штаммов. Обнаружили, что для всех штаммов восьмикратное от 6.25 до 50 мМ изменение концентрации фосфатов (при стандартной концентрации в среде N - 25 мМ) приводит к незначительным изменениям в эффективности утилизации глюкозы в диапазоне от 0.05 до 0.5% (рис. 1). Во всех случаях плотность культуры увеличивалась пропорционально концентрации глюкозы (до 0.25%). При дальнейшем увеличении её содержания в среде накопление биомассы снижалось в разной степени в зависимости от индивидуальных биохимических характеристик изучаемых изолятов.
концентрация фосфатов
Рис. 1. Зависимость роста штамма Р. fluorescem
ОН 5 от различных концентраций глюкозы и фосфатов
При изучении влияния различных сочетаний глюкозы и фосфатов в ростовой среде на эстераз-ную активность исследуемых культур обнаружили, что для большей их части зависимость активности от концентрации фосфатов детектируется только на низких концентрациях глюкозы (рис. 2).
Установлено, что в отличие от большинства штаммов специфическая активность штамма Р. fluorescem ЛН 4 не зависит от изменения содержания глюкозы и фосфатов в широком диапазоне концентраций.
Определяли зависимость роста и активности выделенных штаммов от сочетания различных концентраций глюкозы и аммония в ростовой среде. Обнаружено, что количество вносимого источника азота незначительно оказывает влияние на плотность культуры при содержании глюкозы в среде 0.1%, притом утилизация псевдомонадами больших количеств глюкозы прямо зависела от
увеличения концентрации аммония (рис. 3). При дальнейшем повышении концентрации изучаемых ростовых агентов наблюдалось снижение плотности культуры, в первую очередь, при повышении содержания глюкозы. Совместное внесение до высоких концентраций глюкозы и аммония приводило к ингибированию роста всех культур.
И 0,05% □ 0,10% а 0,25% ■ 0,50%
6,25 тМ 12,5 тМ 25 тМ 50 тМ
концентрация фосфатов
Рис. 2. Карбоксилэстеразная активность штамма P. fluorescens ОН5 при различных концентрациях глюкозы и фосфатов
0,25 -0,2 -§ 0,15-
I/)
О 0,1 -0,05 -0 1
1 тМ 10 тМ 50 тМ 100 тМ концентрация аммония
Рис. 3. Зависимость роста штамма Pseudomonas sp.OH 1 от различных концентраций глюкозы и аммония
Показано, что эстеразная активность изучаемых штаммов не имеет линейной зависимости от концентрации источника азота в ростовой среде в широком диапазоне концентраций (рис. 4).
50 45 х 40
1 35 1 30 1 25 1 20
£ 15 S ю
5 0
1 тМ 10 тМ 50 тМ 100 тМ концентрация аммония
Рис. 4. Зависимость активности штамма Pseudomonas sp. ОН 1 от различных концентраций глюкозы и аммония
Обнаружено также, что высокий уровень карбоксилэстеразной активности (более 4 мкмоль/мг/ мин), близкий к наблюдаемому на минеральной
б2
Н. Б. Ремезовская, А. Ю. Максимов, В. А. Демаков
среде с глюкозой, достигается на полноценных питательных средах, таких как среда Luria-Bertani.
Полученные результаты изучения влияния источников азота, углеводов и энергии на рост и кар-боксилэстеразную активность бактерий свидетельствуют о том, что синтез эстераз изучаемыми культурами имеет в большей степени конститутивный характер и не требует специфической индукции.
Зависимость роста и активности штаммов
от фазы роста культуры
Для определения зависимости эстеразной активности культуры от фазы роста клетки исследуемых штаммов выращивали в течение 7 сут. на среде N разного состава (рис. 5). Измерения плотности и активности производились каждые 12 ч. Перед опытом штаммы длительно пассировали на жидкой среде LB.
часы
Рис. 5. Рост штамма Ps. fluorescens ОН 6 на средах:
1 - 0.1% глюкоза; 2 - 0.1% глюкоза + 2мМ бутилацетат; 3 - 0.1% глюкоза + 10 мМ бутилацетат;
4 - бутилацетат 2 мМ; 5 - бутилацетат 10 мМ
Обнаружено, что при росте изолятов, выделенных из аллювиальной почвы, на средах, содержащих глюкозу в качестве единственного источника углерода или в сочетании с бутилацетатом, период адаптации составляет 6 ч., стадия логарифмического роста имеет протяженность не более 24 ч., и далее культура переходит в стационарную фазу. Показано, что в варианте с 10 мМ бутилацетатом лаг-фаза затягивается до 48 ч. Очевидно, что это связано с длительностью.
Как видно из представленного графика, период активного роста в варианте с 10 мМ бутилацетатом совпадает со второй зоной логарифмического роста в варианте с глюкозой и 10 мМ бутилацетатом, что свидетельствует о переключении ферментных систем с утилизации глюкозы на утилизацию бутил-ацетата. Бутилацетат как единственный источник углеводов не является оптимальным ростовым агентом, плотность культуры на среде с его концентрацией 2 мМ не превышает 15%, а при концентрации 10 мМ - 55-60% максимальной, детектируемой в варианте с двумя источниками углерода.
Среди штаммов, выделенных из луговой почвы, только ЛН 4 рос на средах, содержащих глюкозу. Как видно из представленных данных (рис.
6), сочетание глюкозы и бутилацетата в разных концентрациях оказывает стимулирующее влияние на ростовые процессы описываемого штамма, в то время как на средах с единственным ростовым источником наблюдается задержка стадии адаптации до 48 ч. К концу периода измерения максимальная плотность была зафиксирована в варианте с 10 мМ бутил ацетатом.
часы
Рис. 6. Рост штамма Pseudomonas sp. ЛН 4 на средах различного состава:
1 - 0.1% глюкоза; 2 - 0.1% глюкоза + 2мМ бутилацетат; 3 - 0.1% глюкоза + 10 мМ бутилацетат;
4 - бутилацетат 2 мМ; 5 - бутилацетат 10 мМ
При изучении зависимости эстеразной активности штаммов от фазы роста культуры обнаружили, что в первые часы после переноса клеток с полной среды на минимальную наблюдается незначительное повышение активности фермента, связанное с адаптацией к новым ростовым условиям, после чего на всех штаммах во всех вариантах детектируется значительное снижение активности эстеразы.
Анализ динамики изменения ферментной активности штамма ОН 6 свидетельствует о том, что повышение активности на 48-м часу роста культуры связано, вероятно, с переходом от утилизации глюкозы к бутилацетату и экспрессией соответствующих генов. В конце периода измерения на стационарной стадии роста на всех вариантах наблюдалось повышение эстеразной активности культур, в ряде вариантов до 150% от исходного уровня, что может быть вызвано истощением ростовых агентов и активацией ферментных систем клетки в стрессовых условиях.
Сходная динамика изменения эстеразной активности наблюдается и при росте штамма ЛН 4, однако в этом случае повышение скорости конверсии маркерного субстрата детектируется только в варианте с 10 мМ бутилацетатом.
Заключение
Исходя из полученных данных о влиянии источников азота, фосфора, углеводов и энергии на рост и специфическую активность штаммов можно сделать вывод, что синтез эстераз изучаемыми культурами имеет в большей степени конститутивный характер и не требует специфической индукции. При этом увеличение концентрации глюкозы
до 1%, фосфата в интервале 6.25-25 мМ и аммония в интервале 1-50 мМ стимулировало рост культуры, но приводило к лишь небольшому повышению уровня эстеразной активности. Этим изучаемые культуры отличаются от ранее исследованных продуцентов нитрилгидратаз, уровень активности которых был чувствителен к концентрации источников основных элементов (Максимов и др., 2003). Карбоксилэстеразная активность культур P. fluorescens в оптимальных условиях достигала 10 мкмоль/мг/мин, что выше, чем у ранее описанных аналогов (Доронина и др., 2006).
Показано, что при высоких концентрациях глюкозы (5%) наблюдается угнетение роста бактерий и, у некоторых культур, понижение эстеразной активности. Таким образом, для получения высокого выхода активной биомассы могут быть использованы следующие концентрации источников углерода, азота и фосфора: глюкоза - 1%, аммоний - 50 мМ, фосфат - 25 мМ.
Работа поддержана ФЦП «Научные и научнопедагогические кадры инновационной России на 2009-2013 годы» (ГК№ 02.740.11.0078) и АВЦП «Развитие научного потенциала высшей школы (2009-2010 годы)», проект № 2.1.1.6252.
Библиографический список
Демаков В.А. и др. Биологическое разнообразие нит-рилметаболизирующих бактерий антропогенно-измененных почв Пермского края // Экология. 2007. № 3. С. 1-6.
Доронина Н.В. и др. Биодеградация метилацетата и этилацетата иммобилизованными клетками Pseudomonas esteropholus // Прикл. биохим. и микро-биол. 2006. Т. 42, № 1. С. 52-54.
Звягинцев Д.Г. Почва и микроорганизмы. М.: Изд-во МГУ, 1987. 256 с.
Коновалов А.А. Разработка методов разделения рацемических эфиров с помощью гидролаз микроорганизмов: автореф. дис. ... канд. биол. наук. Уфа, 2002. 16 с.
Максимов А.Ю и др. Влияние нитрилов и амидов на рост и нитрилгидратазную активность штамма Rhodococcus sp. gt1 // Прикл. биохим. и микро-биол. 2003. Т. 39, № 1. С. 63-68.
Мубараков А.И. Разработка энантиоселективных биокатализаторов парциального ацилирования спиртов: автореф. дис. ... канд. биол. наук. Уфа, 2002. 18 с.
Старкова М.К., Ремезовская Н.Б. Селекция грамот-рицательных микроорганизмов, обладающих эс-теразной активностью // Современные проблемы экологии, микробиологии и иммунологии. Екате-ринбург-Пермь, 2007. С. 107-109.
Bornscheuer U.T. Microbial carboxyl esterases: classification, properties and application in biocatalysis // FEMS Microbiology reviews. 2002. Vol. 26. P. 7381.
Поступила в редакцию 16.12.2010
Dependence of carboxyl esterase activity in soil gram-negative microorganisms on growth phase and medium composition N. B. Remezovskaya, engineer
Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences. 13, Golev str., Perm, Russia, 614081; [email protected]; (342)2446712 A. Yu. Maksimov, candidate of biology, senior scientist, associate professor; [email protected] V. A. Demakov, doctor of medicine, professor, correspondent member of RAS; [email protected]
Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences. 13, Golev str., Perm, Russia, 614081; (342)2446712 Perm State University. 15, Bukirev str., Perm, Russia,614990
Dependence of growth and carboxyl esterase activity in soil Gram-negative bacteria of genus Pseudomonas on concentration of carbon, nitrogen, and phosphorus sources was analyzed. It was determined that carboxyl esterase activity in cultures under study possessed high level of constitutive expression. Under high glucose concentrations (over 1%) growth suppression and lowering of the esterase activity was observed. It was found that carboxyl esterase activity in P. fluorescens cultures approached 10 mmol/mg/min under the optimal conditions.
Key words: biotransformation; carboxyl esterase; esters; Pseudomonas.
Ремезовская Наталья Борисовна, инженер ГУ РАН «Институт экологии и генетики УрО РАН»
Mаксимов Александр Юрьевич, кандидат биологических наук, доцент
Демаков Виталий Алексеевич, доктор медицинских наук, профессор, чл.-корр. РАН, зав. лабораторией ГУ РАН «Институт экологии и генетики УрО РАН»
ГОУВПО «Пермский государственный университет»
