CC BY
41
УДК 575.167
ВСТРЕЧАЕМОСТЬ ПОЛИМОРФИЗМА LEU33PRO ГЕНА ITGB3 В ВЫБОРКАХ ИЗ ПОПУЛЯЦИЙ АЛЖИРА, СИРИИ И ЦЕНТРАЛЬНОЙ РОССИИ
© 2016 А. Аит Аисса1, М. М. Азова2, О. О. Гигани3, О. Б. Гигани4, М. Л. Благонравов5
1 аспирант кафедры биологии и общей генетики медицинского института
e-mail: аИ mira9()a,hotmail. fr 2докт. биол. наук, доцент, заведующая кафедрой биологии и общей генетики медицинского института e-mail: azova mm@pfur.ru
3 канд. биол. наук, доцент кафедры биологии и общей генетики медицинского института
e-mail: gigani oo@pfur.ru
4 канд. биол. наук, доцент кафедры биологии и общей генетики медицинского института
e-mail: gigani ob@pfur.ru, 5 докт. мед. наук, профессор кафедры общей патологии и патологической физиологии медицинского института e-mail: blagonravov_ml@pfur.ru
Российский университет дружбы народов (РУДН)
Изучена частота полиморфного маркера сердечно-сосудистых заболеваний Leu33Pro гена ITGB3 среди арабов из Алжира и Сирии, алжирских берберов и русских из Центральной России. Генотипирование осуществлялось методом аллель-специфичной ПЦР. Между изучаемыми выборками выявлены достоверные различия в распределении генотипов по данному полиморфизму.
Ключевые слова: генный полиморфизм, Leu33Pro, популяция, сердечнососудистые заболевания
Тромбоцитарный рецептор фибриногена представляет собой мембранный белковый комплекс, участвующий в агрегации тромбоцитов и формировании тромба. Он относится к семейству интегринов и состоит из двух гликопротеиновых субъединиц - GPIIb и GPIIIa. К настоящему времени в гене ITGB3, кодирующем субъединицу GPIIIa, было выявлено около тысячи однонуклеотидных полиморфных вариантов, многие из которых ассоциированы с различной патологией. Активно проводятся исследования, направленные на изучение полиморфизма Leu33Pro, при котором замена тимина на цитозин приводит к замене лейцина на пролин в 33 положении, так как обнаружена ассоциация мутантного аллеля с развитием артериальной гипертензии, ишемического инсульта, инфаркта миокарда, и установлено влияние данного полиморфизма на эффективность некоторых антиагрегантов [Зотова и соавт. 2013; Мяндина и соавт. 2014; Floyd et al. 2015; Floyd et al. 2014; Goodman et al. 2008; Naran et al. 2008]. Известно, что распределение генотипов Leu33Pro географически и этнически варьируется [Naran et al. 2008; Salem et al. 2014]. В связи с широкой распространенностью сердечно-сосудистых заболеваний, занимающих лидирующие места среди причин смертности [ВОЗ 2014], и тем фактом, что до настоящего времени данный полиморфный маркер не был исследован среди сирийского населения, а также практически отсутствуют сведения о его распространенности среди алжирцев,
представляется крайне актуальным изучение встречаемости полиморфизма Leu33Pro гена ITGB3 среди населения Сирии и Алжира в сравнении с русскими из Центральной России.
Работа проводилась на кафедре биологии и общей генетики медицинского института и ЦКП (НОЦ) Российского университета дружбы народов. В исследуемую группу вошли 56 здоровых алжирцев (33,4 ±11,6 лет), среди которых 33 араба (31,8±11 лет) и 23 бербера (35,8±1.4 лет), 50 здоровых сирийцев арабского происхождения (26,0±8 лет) и 59 русских из Центральной России (20,5±6,8 лет). ДНК выделяли из венозной крови с помощью реагента «ДНК-экспресс-кровь» (НПФ «Литех», Москва). Полиморфизм Leu33Pro гена ITGB3 определяли с помощью аллель-специфичной ПИР (комплект реагентов «SNP-экспресс» производства НПФ «Литех», Москва) с последующей детекцией продуктов амплификации в 3% агарозном геле.
Статистическую обработку данных проводили с использованием программы «R language» [R Core Team 2015], для сравнения частот генотипов и аллелей применяли критерий Хи-квадрат и точный тест Фишера. Результаты считали статистически значимыми при значениях P<0,05.
Результаты исследования встречаемости аллелей гена ITGB3 представлены в таблицах 1 и 2. Наблюдаемое распределение частот аллелей и генотипов во всех выборках соответствует теоретически ожидаемому (Р>0.05).
Сравнение частот аллелей показало отсутствие достоверных отличий как между алжирцами, сирийцами и русскими (Р=0.532), так и между алжирскими этническими группами (Р=0.43). Таким образом, среди населения Алжира, Сирии и Центральной России частота аллеля Т превышает встречаемость мутантного аллеля С, что соответствует результатам исследований, проведенных в других популяциях, согласно которым встречаемость аллеля С среди белых европейцев колеблется в диапазоне 0.14— 0.19, среди арабов - 0.165-0.252 [Naran et al. 2008; Salem et al. 2014].
Таблица 1
Частоты аллелей по полиморфизму ЬеиЭЭРго гена 1ТОБ3 среди алжирцев, сирийцев и русских
Аллель Алжирцы (N=56) Сирийцы (N=50) Русские (N=59)
Т 0.77 0.78 0.83
С 0.23 0.22 0.17
Таблица 2
Частоты аллелей по полиморфизму ЬеиЭЭРго гена 1ТОБ3 среди алжирских берберов и арабов
Аллель Алжирские берберы (N=23) Алжирские арабы (N=33)
Т 0.83 0.73
С 0.17 0.27
При сравнении встречаемости генотипов Т/Т, Т/С и С/С в трех популяциях (табл. 3) выявлено, что частота гомозигот ТТ превышает частоту гетерозигот, причем это более выражено у русских. Для сирийцев характерна наиболее высокая встречаемость гетерозигот, в то время как в данной выборке гомозиготы по мутантному аллелю С обнаружены не были. Установлено, что сирийцы и русские достоверно отличаются по частотам изучаемых генотипов (Р=0.006), однако отличие по соответствующим показателям между русскими и алжирцами, несмотря на
Аит Аисса А., Азова М. М., Гигани О. О., Гигани О. Б., Благонравов М. Л.
Встречаемость полиморфизма ЬеиЗЗРго гена 1ТОБЗ в выборках из популяций Алжира, Сирии и Центральной России
выраженную тенденцию, не оказалось статистически значимым (Р=0.206), что можно объяснить неоднородностью алжирской популяции, состоящей из арабов и берберов. В этой связи для дальнейшего исследования группа алжирцев была разделена на арабов и берберов (табл. 4). Последующий анализ выявил достоверные отличия по встречаемости генотипов между алжирскими арабами и русскими (Р=0.034), а также между алжирскими арабами и берберами (Р=0.012).
Таблица 3
Частоты генотипов по полиморфизму ЬеиЗЗРго гена ITGB3 среди алжирцев, сирийцев и русских
Генотип Алжирцы (N=56) Сирийцы (N=50) Русские (N=59)
ТТ 57.14% 56% 69.49%
ТС 39.29% 44% 27.12%
СС 3.57% 0 3.39%
Таблица 4
Частоты генотипов по полиморфизму ЬеиЗЗРго гена ITGB3 среди алжирских берберов и арабов
Генотип Алжирские берберы (N=23) Алжирские арабы (N=33)
ТТ 65.22% 51.52%
ТС 34.78% 42.42%
СС 0 6.06%
В результате проведенного исследования обнаружено, что частоты генотипов по полиморфизму Leu33Pro гена ITGB3 достоверно различаются у алжирцев, сирийцев и этнических русских. Частота мутантного аллеля С повышена среди арабов по сравнению с русскими и берберами, и, возможно, в более крупных выборках отличие достигнет статистически значимого порога. Таким образом, необходимо учитывать этнические особенности арабов и алжирского населения при исследовании патогенеза сердечно-сосудистых заболеваний в странах Африки и Ближнего Востока и изучении влияния указанного полиморфизма на деятельность сердечно-сосудистой системы.
Библиографический список
ВОЗ, 2014. World Health Organization - Noncommunicable Diseases (NCD) Country Profiles, 2014. URL: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs317/ru/ (дата обращения: 12.04.2016).
Зотова Т.Ю., Мяндина Г.И., Фролов В.А., Комарова А.Г., Зотов А.К. Влияние полиморфизма гена ITGB3 на частоту развития артериальной гипертензии у больных с острым коронарным синдромом // Клиническая медицина. 2013. № 8. Т. 91.С. 22-24.
Мяндина Г.И., Зотова Т.Ю., Вареха Л.А., Касапова Е.Н. Полиморфизмы генов ITGB3 и протромбина среди пациентов с дислипидемиями, страдающих гипертонической болезнью и ишемической болезнью сердца // The journal of scientific articles "Health & education millennium". 2014. Vol. 16. N 4. P. 56-59.
Floyd C.N., Ferro A., Warner TD. Expression of the PlA2 allele of glycoprotein Ilia and its impact on platelet function // JRSM Cardiovasc Dis. 2015.Vol. 4. P. 1-4.
Floyd CN, Ellis BH, Ferro A. The PlA1/A2 polymorphism of glycoprotein Ilia as a risk factor for stroke: a systematic review and meta-analysis // PLoS ONE 9.2014. Vol. 9. N 7. P. 1-8.
Goodman T., Ferro A., Sharma P. Pharmacogenetics of aspirin resistance: a comprehensive systematic review // Br J Clin Pharmacol. 2008. N 66. P. 222-232.
Naran N.H.,Chetty N., Crowther NJ. The prevalence of the platelet glycoprotein Ilia Pl(A1/A2) polymorphism in three South African ethnic groups and its effect on platelet function // Thromb Res. 2008.Vol. 123. N 2. P. 316-323.
Core Team. 2015. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL http://www.R-project.org/.
Salem AH, Abdel Hamed A.E., Abdalla EM., Almawi W. Gene frequencies of human platelet alloantigens 1-5 in two Arab populations // Blood Transfus. 2014. N 12. Suppl 1. P. 281-285
