Научная статья на тему 'Возможность выявления штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза при сочетании методов иммуноблоттинга и амплификации ДНК'

Возможность выявления штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза при сочетании методов иммуноблоттинга и амплификации ДНК Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
79
12
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
Ключевые слова
САП / МЕЛИОИДОЗ / МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА / ПЦР-РВ / ДОТ-БЛОТ / GLANDERS / MELIOIDOSIS / MONOCLONAL ANTIBODY / RT-PCR / DOT-BLOT

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Ветчинин С.С., Щит И.Ю., Шевяков А.Г., Бикетов С.Ф.

В системах классификации опасных бактериальных патогенов возбудители мелиоидоза и сапа входят в число наиболее опасных для человека. Кроме того, Burkholderia pseudomallei и Burkholderia mallei являются потенциальными агентами биотерроризма. В связи с этим своевременная диагностика этих микроорганизмов является актуальной. В настоящей работе предпринята попытка разработать способ выявления патогенных буркхольдерий, основанный на сочетании видоспецифичной амплификации ДНК и штаммоспецифичного дот-блот анализа на основе моноклональных антител (МКАт). В работе использовали следующие штаммы патогенных буркхольдерий: B. mallei (C-4, C-5, t-12, B-120, P-1, Мuksuwar-11, Z-12, Zagreb, Ivanovich, 5534), B. pseudomallei (100, 102, 115, 116, 132, 135, 301, 51274, 60913, 61503). Детекцию патогенов проводили методами ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) и дот-блота на основе моноклональных антител к поверхностным структурам буркхольдерий. Для ПЦР-РВ были сконструированы оригинальные праймеры к фрагменту ДНК IS407A-fliP B. mallei и к гену Orf12 B. pseudomallei. Для реакции ПЦР-РВ ДНК выделяли из суспензии бактериальных клеток в концентрации 1 × 104 микробных клеток/мл. Накопление конечного продукта реакции регистрировали с использованием красителя SYBR Green I. Для определения специфичности реакции амплификации регистрировали температуры плавления (Tm) полученных продуктов и проводили их электрофоретический анализ. Показано, что при использовании праймеров к фрагменту ДНК IS407A-fliP выявляются все 10 исследованных штаммов B. mallei, а праймеров к гену Orf12 все 10 штаммов B. pseudomallei. Сигналов с ДНК гетерологичных микроорганизмов (выделенной из бактериальных суспензий с концентрацией 1 ×107 м.к./мл), в ПЦР-РВ получено не было. Таким образом, ПЦР-РВ дает возможность проводить межвидовую дифференциацию патогенных буркхольдерий. В дот-блот анализе МКАт 3D3 связываются с клетками штаммов обоих возбудителей, то есть демонстрируют родоспецифичность. Моноклональные антитела 2D11, в отличии от МКАт 3D3, избирательно не связываются с клетками штаммов Р1 B. mallei и 100 B. pseudomallei, то есть обладают штаммоспецифическим профилем взаимодействия. Сделан вывод о том, что сочетание видоспецифичной амплификации ДНК (ПЦР-РВ) и иммунного анализа (дот-блот), с использованием набора моноклональных антител различного профиля взаимодействия со штаммами, перспективно для внутривидовой дифференциации патогенных буркхольдерий.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Ветчинин С.С., Щит И.Ю., Шевяков А.Г., Бикетов С.Ф.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The possibility of identifying individual strains of glanders and melioidosis pathogens with a combination of immunoblotting and DNA amplification methods

Causative agents of melioidosis and glanders are among the most dangerous bacterial pathogens for human. Moreover, Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei are considered to be potential bioterrorism agents. In connection with this, timely diagnostics of such bacteria is of high importance. In our study, we made an attempt to develop an approach for detecting pathogenic Burkholderia spp. by combining species-specific amplification and strain-specific dot blotting assay with monoclonal antibodies. The following pathogenic Burkholderia strains were used in experiments: B. mallei (C-4, C-5, t-12, B-120, P-1, Мuksuwar-11, Z-12,Zagreb, Ivanovich, 5534), and B. pseudomallei (100, 102, 115, 116, 132, 135, 301, 51274, 60913, 61503). Real-Time PCR (RT-PCR) and dot blotting with monoclonal antibodies against surface Burkholderia epitopes were used to detect such pathogens. RT-PCR was carried out by using primers designed to recognize DNA fragments in B. mallei IS407A-fliP and the gene Orf12 from B. pseudomallei. For this, DNA was isolated from bacterial cells suspended at 1 × 104 microbial cells/ml. accumulation of the end reaction products was visualized by staining with dye SYBR Green I. Specificity of amplification reaction was determined by measuring melting temperature (Tm) for end products followed by running gel electrophoresis. It was demonstrated that all ten strains of either B. mallei or B. pseudomallei examined in the study were detected by using primers against IS407A-fliP DNA fragment and the gene Orf12, respectively. It was demonstrated that all ten strains of either B. mallei or B. pseudomallei examined in the study were detected by using primers against IS407A-fliP DNA fragment and the gene Orf12, respectively. Importantly, no signals specific to heterologous microbial DNA (isolated from bacterial cell suspension at concentration of 1 × 107 microbial cells/ml) were detected by using RT-PCR. Thus, RT-PCR provides an opportunity for assessing an inter-species diversity among pathogenic Burkholderia species. A genus-specificity was observed by using monoclonal antibodies 3D3 which bind to both Burkholderia strains, whereas antibodies 2D11 exhibited no selective binding to strain Р1 B. mallei and strain 100 B. pseudomallei, thereby displaying a strain-specific interaction. Thus, it allowed to conclude that combining a species-specific DNA amplification particularly RT-PCR together with immune-based assay such as dot blotting by using a panel of monoclonal antibodies seems to be a promising approach for assessing intra-species diversity among pathogenic Burkholderia.

Текст научной работы на тему «Возможность выявления штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза при сочетании методов иммуноблоттинга и амплификации ДНК»

Методы

Methods

Инфекция и иммунитет Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet

2019, Т. 9, № 2, с. 404-408 2019, vol. 9, no. 2, pp. 404-408

ВОЗМОЖНОСТЬ ВЫЯВЛЕНИЯ ШТАММОВ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САПА И МЕЛИОИДОЗА ПРИ СОЧЕТАНИИ МЕТОДОВ ИММУНОБЛОТТИНГА И АМПЛИФИКАЦИИ ДНК

С.С. Ветчинин, И.Ю. Щит, А.Г. Шевяков, С.Ф. Бикетов

ФБУНГосударственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, п. Оболенск, Московская область, Россия

Резюме. В системах классификации опасных бактериальных патогенов возбудители мелиоидоза и сапа входят в число наиболее опасных для человека. Кроме того, Burkholderia pseudomallei и Burkholderia mallei являются потенциальными агентами биотерроризма. В связи с этим своевременная диагностика этих микроорганизмов является актуальной. В настоящей работе предпринята попытка разработать способ выявления патогенных буркхольдерий, основанный на сочетании видоспецифичной амплификации ДНК и штаммоспецифичного дот-блот анализа на основе моноклональных антител (МКАт). В работе использовали следующие штаммы патогенных буркхольдерий: B. mallei (C-4, C-5, t-12, B-120, P-1, Мuksuwar-11, Z-12, Zagreb, Ivanovich, 5534), B. pseudomallei (100, 102, 115, 116, 132, 135, 301, 51274, 60913, 61503). Детекцию патогенов проводили методами ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) и дот-блота на основе моноклональных антител к поверхностным структурам буркхольдерий. Для ПЦР-РВ были сконструированы оригинальные праймеры к фрагменту ДНК IS407A-fliP B. mallei и к гену Orf12 B. pseudomallei. Для реакции ПЦР-РВ ДНК выделяли из суспензии бактериальных клеток в концентрации 1 х 104 микробных клеток/мл. Накопление конечного продукта реакции регистрировали с использованием красителя SYBR Green I. Для определения специфичности реакции амплификации регистрировали температуры плавления (Tm) полученных продуктов и проводили их электрофоре-тический анализ. Показано, что при использовании праймеров к фрагменту ДНК IS407A-fliP выявляются все 10 исследованных штаммов B. mallei, а праймеров к гену Orf12 — все 10 штаммов B. pseudomallei. Сигналов с ДНК гетерологичных микроорганизмов (выделенной из бактериальных суспензий с концентрацией 1 х 107 м.к./мл), в ПЦР-РВ получено не было. Таким образом, ПЦР-РВ дает возможность проводить межвидовую дифференциацию патогенных буркхольдерий. В дот-блот анализе МКАт 3D3 связываются с клетками штаммов обоих возбудителей, то есть демонстрируют родоспецифичность. Моноклональные антитела 2D11, в отличии от МКАт 3D3, избирательно не связываются с клетками штаммов Р1 B. mallei и 100 B. pseudomallei, то есть обладают штаммоспецифическим профилем взаимодействия. Сделан вывод о том, что сочетание ви-доспецифичной амплификации ДНК (ПЦР-РВ) и иммунного анализа (дот-блот), с использованием набора моноклональных антител различного профиля взаимодействия со штаммами, перспективно для внутривидовой дифференциации патогенных буркхольдерий.

Ключевые слова: сап, мелиоидоз, моноклональные антитела, ПЦР-РВ, дот-блот.

Адрес для переписки:

Шевяков Антон Георгиевич

142279, Россия, Московская область, Серпуховский р-н, п. Оболенск, ФБУН ГНЦ прикладной микробиологии. Тел.: 8 (4967) 36-07-73 (служебн.). E-mail: shevyakov@obolensk.org

Библиографическое описание:

Ветчинин С.С., Щит И.Ю., Шевяков А.Г., Бикетов С.Ф. Возможность выявления штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза при сочетании методов иммуноблоттинга и амплификации ДНК // Инфекция и иммунитет. 2019. Т. 9, № 2. С. 404-408. doi: 10.15789/2220-7619-20192-404-408

© Ветчинин С.С. и соавт., 2019

Contacts:

Anton G. Shevyakov

142279, Russian Federation, Moscow Region, Serpukhov District, Obolensk, State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology.

Phone: +7 (4967) 36-07-73 (office). E-mail: shevyakov@obolensk.org

Citation:

Vetchinin S.S., Shchit I.Yu., Shevyakov A.G., Biketov S.F. The possibility of identifying individual strains of glanders and melioidosis pathogens with a combination of immunoblotting and DNA amplification methods // Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2019, vol. 9, no. 2, pp. 404-408. doi: 10.15789/2220-7619-2019-2-404-408

DOI: http://dx.doi.org/10.15789/2220-7619-2019-2-404-408

THE POSSIBILITY OF IDENTIFYING INDIVIDUAL STRAINS OF GLANDERS AND MELIOIDOSIS PATHOGENS WITH A COMBINATION OF IMMUNOBLOTTING AND DNA AMPLIFICATION METHODS

Vetchinin S.S., Shchit I.Yu., Shevyakov A.G., Biketov S.F.

State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow Region, Russian Federation

Abstract. Causative agents of melioidosis and glanders are among the most dangerous bacterial pathogens for human. Moreover, Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei are considered to be potential bioterrorism agents. In connection with this, timely diagnostics of such bacteria is of high importance. In our study, we made an attempt to develop an approach for detecting pathogenic Burkholderia spp. by combining species-specific amplification and strain-specific dot blotting assay with monoclonal antibodies. The following pathogenic Burkholderia strains were used in experiments: B. mallei (C-4, C-5, t-12, B-120, P-1, Muksuwar-11, Z-12, Zagreb, Ivanovich, 5534), and B.pseudomallei (100, 102, 115, 116, 132, 135, 301, 51274, 60913, 61503). Real-Time PCR (RT-PCR) and dot blotting with monoclonal antibodies against surface Burkholderia epitopes were used to detect such pathogens. RT-PCR was carried out by using primers designed to recognize DNA fragments in B. mallei IS407A-fliP and the gene Orf12 from B. pseudomallei. For this, DNA was isolated from bacterial cells suspended at 1 x 104 microbial cells/ml. accumulation of the end reaction products was visualized by staining with dye SYBR Green I. Specificity of amplification reaction was determined by measuring melting temperature (Tm) for end products followed by running gel electrophoresis. It was demonstrated that all ten strains of either B. mallei or B. pseudomallei examined in the study were detected by using primers against IS407A-fliP DNA fragment and the gene Orf12, respectively. It was demonstrated that all ten strains of either B. mallei or B. pseudomallei examined in the study were detected by using primers against IS407A-fliP DNA fragment and the gene Orf12, respectively. Importantly, no signals specific to heterologous microbial DNA (isolated from bacterial cell suspension at concentration of 1 x 107 microbial cells/ml) were detected by using RT-PCR. Thus, RT-PCR provides an opportunity for assessing an inter-species diversity among pathogenic Burkholderia species. A genus-specificity was observed by using monoclonal antibodies 3D3 which bind to both Burkholderia strains, whereas antibodies 2D11 exhibited no selective binding to strain P1 B. mallei and strain 100 B. pseudomallei, thereby displaying a strain-specific interaction. Thus, it allowed to conclude that combining a species-specific DNA amplification particularly RT-PCR together with immune-based assay such as dot blotting by using a panel of monoclonal antibodies seems to be a promising approach for assessing intra-species diversity among pathogenic Burkholderia.

Key words: glanders, melioidosis, monoclonal antibody, RT-PCR, dot-blot.

Введение

Сап и мелиоидоз относятся к особо опасным заболеваниям, вызываемым патогенными бурк-хольдериями Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei. Основными источниками заражения являются больные животные, контами-нированные пищевые продукты, почва и вода. Невозможность вакцинопрофилактики, высокие контагиозность и смертность (при отсутствии лечения) позволяют отнести возбудителей сапа и мелиоидоза к потенциальным агентам биотерроризма [7, 9, 13].

Для выявления и идентификации возбудителей применяют классические бактериологические и биохимические методы, а также современные иммунохимические тесты, использующие моноклональные антитела (МКАт) и молекулярную диагностику на основе анализа специфических нуклеотидных последовательностей ДНК [1, 8, 12]. Опубликованы результаты применения амплификации ДНК для детекции и дифференциации B. mallei и B. pseudomallei посредством ПЦР, включая мультиплексный вариант [3, 11] и ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) [14, 15]. На основе высокопроизводительного секвенирования активно разрабатываются подходы для внутривидовой дифференциации патогенных буркхольдерий.

Цель данной работы — установление возможности выявления и внутривидовой дифферен-

циации штаммов патогенных буркхолдерий при совместном использовании ПЦР-РВ и дот-блот анализа на основе (МКАт).

Материалы и методы

В работе использованы по 10 штаммов B. mallei (C-4, C-5, t-12, B-120, P-1, Muksuwar-11, Z-12, Zagreb, Ivanovich, 5534) и B. pseudomallei (100, 102, 115, 116, 132, 135 , 301, 51274, 60913 , 61503) из коллекции ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Рос-потребнадзора. В качестве контрольных гетеро-логичных микроорганизмов использовали следующие штаммы: F. tularensis 15/10, B. abortus 19, Y. pestis И-3449, Y. pseudotuberculosis C79, Y. entero-colitica C-126, B. anthracis СТИ-1, V. cholerae Eltor M878, E. coli JM83, L. pneumophila 33152, P. aeruginosa АТСС ВАА-427 (все из Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск»).

Все работы c микроорганизмами I—II групп и ДНК микроорганизмов I—IV групп выполняли в соответствии с соответствующими нормативными документами [2, 4].

Для ПЦР ДНК выделяли из бактериальных суспензий B. mallei и B. pseudomallei с концентрацией 1 х 104 м.к./мл микроорганизмов с помощью коммерческого набора «ДНК-сорб-В» (ОАО «ИнтерЛабСервис», Россия) в соответствии с инструкцией производителя.

Таблица. Праймеры для детекции B. pseudomallei и B. mallei с помощью ПЦР в реальном времени

Table. Real-time PCR primers for detection of B. pseudomallei and B. mallei

Праймер Primers Последовательность праймера Primer sequence Мишень Target

F3-Bma54 5'-gcttccttcagaaacccgat-3' IS407A-fliP B. mallei

B3-Bma54 5'-ggcacgacctattcgttgag-3'

F3-Bp27 5'-attcaggttgatgctggagg-3' Orf12 области кластера генов TTS1 B. pseudomallei Orf12 regions in gene Cluster TTS1

B3-Bp27 5'-cgataatgctctgccgcc-3'

Нуклеотидные последовательности праймеров рассчитывали с помощью программы «Primer Explorer 3» (www.primerexplorer.jp/elamp3.0.0/ index.html) и проверяли на специфичность с использованием программы «BLAST» (www.blast. ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi). Праймеры синтезированы и очищены компанией «Синтол», Москва. Последовательности праймеров представлены в таблице.

Полимеразную цепную реакцию в реальном времени проводили на приборе «7500 RealTime PCR Systems» (Applied Biosystems, США) в следующем режиме: первичная денатурация (95°C - 10 мин), 40 циклов: 95°C - 15 с, 60°C -1 мин. Считывание флуоресценции. Построение кривой плавления интервале от 60 до 95°C. Реакционная смесь объемом 25 мкл содержала 1х буфер Б с красителем SYBR Green I, 1,25 ед. Taq-полимеразы, 2,5 мМ MgCl2, 0,25 мМ каждого дНТФ, праймеры 0,4 мкМ каждого, 5 мкл матрицы (0,1 мкг ДНК). Накопление специфического продукта амплификации - фрагмента ДНК B. mallei или B. pseudomallei — детектировалось по каналу FAM/SYBR Green dye. Анализ данных осуществляли с помощью программного обеспечения Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR Systems. Накопление продукта регистрировали по изменению флуоресценции интеркалирую-щего красителя SYBR Green I, для определения специфичности реакции проводили анализ кривой плавления и вычисление температуры плавления (Tm) полученных продуктов [6].

Моноклональные антитела 2D11 (гибридо-ма получена после иммунизации мышей ЛПС из штамма С-5 B. mallei) [5], нарабатывали в ас-цитной жидкости и очищали методом аффинной хроматографии на белок А-сефарозе.

Для дот-блот анализа на полоски из нитроцел-люлозной бумаги наносили по 2 мкл суспензии бактериальных клеток с концентрацией 109 мк/ мл. Полоски подсушивали, инкубировали при покачивании в 5% растворе альбумина, последовательно промывали в 0,1 М фосфатного буферного раствора рН 7,4 (ФБР) и ФБР с 10 мМ твин 20 (ФБРТ) инкубировали с МКАт в концентрации 1 мкг/мл или (в отрицательном контроле) с нормальной мышиной сывороткой в разведении 1:1000, а затем с пероксидазным конъюгатом кроличьих антител к IgG мыши в рабочем разведении. После промывки ФБРТ и деионизован-ной водой, полоски инкубировали с субстратом (0,2 мг/мл диаминобензидина) до появления видимых пятен.

Результаты и обсуждение

В результате амплификации в ПЦР-РВ фрагментов генов-мишеней IS407A-fliP B. mallei и Orfl2 B. pseudomallei были получены специфические продукты. Как видно из рисунка 1, на кривых плавления находятся единичные пики, соответствующие ожидаемым размерам продуктов амплификации.

Кроме того, при анализе продуктов ПЦР-РВ с помощью гель-электрофореза в геле были детектированы единичные полосы с ожидаемыми размерами: 202 п.н. в случае праймеров Bma54, 194 п.н. в случае праймеров Bp27. Таким образом Bma54 выявлял штаммы B. mallei, а Bp27 — B. pseudomallei. Аналитическая чувствительность ПЦР-РВ с указанными праймерами была определена в отдельных экспериментах и составила 1 х 102 м.к./мл. В реакции по определению специфичности брали ДНК выделенную из бактериальных суспензий штаммов B. mallei и B. pseudomallei с концентрацией 1 х 104 м.к./мл.

Сигналов с ДНК гетерологичных микроорганизмов (выделенной из бактериальных суспензий с концентрацией 1 х 107 м.к./мл), в ПЦР-РВ получено не было.

Таким образом, рассчитанные нами прайме-ры в реакции ПЦР-РВ обеспечивали видоспе-цифическую детекцию всех использованных штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза в концентрациях от 1 х 102 м.к./мл.

Результаты проверки взаимодействия МКАт 2D11 и МКАт 3D3 с бактериальными клетками тех же штаммов B. mallei и B. pseudomallei в дот- блот анализе показали следующее. Моноклональные антитела 3D3 связываются с клетками штаммов обоих возбудителей, то есть демонстрируют родо-специфичность. Моноклональные антитела 2D11, в отличии от МКАт 3D3, не связываются с клетками штаммов Р1 B. mallei и 100 B. pseudomallei, то есть обладают штаммоспецифическим профилем взаимодействия (рис. 2).

В литературе имеются похожие сведения об избирательном взаимодействии МКАт (к кап-сулярному полисахариду возбудителя мелио-идоза) со штаммами B. pseudomallei и B. mallei [10].

Мы предполагаем, что подобные антитела со штаммоспецифическим профилем при расширении их спектра и совместном использовании с видоспецифической ПЦР-РВ, могут дать дополнительные возможности для внутривидовой дифференциации штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза.

Рисунок 1. Анализ температуры плавления продуктов амплификации после проведения ПЦР в реальном времени с использованием SYBR Green I и праймеров Bma54 (А) и Bp27 (Б)

Figure 1. Analysis of the melting temperature of amplification products after real time-PCR using SYBR Green I and primers Bma54 (A) and Bp27 (B)

A. При определении специфичности праймеров Bma54 к мишени IS407A-fliP использовали следующие штаммы:

B. pseudomallei 100, F. tularensis 15/10, B. abortus 19, Y. pestis И-3449, Y. pseudotuberculosis C79, Y. enterocolitica C-126, B. anthracis СТИ-1, V. cholerae Eltor M878, E. coli JM83, L. pneumophila 33152, P. aeruginosa АТСС ВАА-427.

Б. При определении специфичности праймеров Bp27 на ген Orf12 области кластера генов TTS1 B. pseudomallei использовали следующие штаммы: B. malleiC-5, F. tularensis 15/10, B. abortus 19, Y. pestis И-3449, Y. pseudotuberculosis C79, Y. enterocolitica C-126, B. anthracis СТИ-1, V. cholerae Eltor M878, E. coli JM83, L. pneumophila 33152, P. aeruginosa АТСС ВАА-427.

A. The following strains were used to determine the specificity of the Bma54 primers for the IS407A-fliP target:

B. pseudomallei 100, F. tularensis 15/10, B. abortus 19, Y. pestis I-3449, Y. pseudotuberculosis C79, Y. enterocolitica C-126, B. anthracis STI-1, V. cholerae Eltor M878, E. coli JM83, L. pneumophila 33152, P. aeruginosa АТСС ВАА-427. B. The following strains were used to determine the specificity of Bp27 primers for the Orf12 gene of the region TTS1 B. pseudomallei gene cluster: B. mallei C-5, F. tularensis 15/10, B. abortus 19, Y. pestis I-3449, Y. pseudotuberculosis C79, Y. enterocolitica C-126, B. anthracis STI-1, V. cholerae Eltor M878, E. coli JM83, L. pneumophila 33152, P. aeruginosa АТСС ВАА-427.

Рисунок 2. Дот-блот МКАт 2D11 и 3D3 с клетками B. mallei and B. pseudomallei

Figure 2. Dot-blot of Mabs 2D11 and 3D3 with cells of B. mallei and B. pseudomallei

Примечание. С — штаммы B. mallei: 1 — C-4; 2 — C-5;

3 — t-12; 4 — B-120; 5 — P-1; 6 — IVIuksuwar-11; 7 — Z-12;

8 — Zagreb; 9 — Ivanovich; 10 — 5534. М — штаммы B. pseudomallei: 1 — 100; 2 — 102; 3 — 115; 4 — 116;

5 — 132; 6 — 135; 7 — 301; 8 — 51274; 9 — 60913; 10 — 61503. НМС — сыворотка интактной мыши в разведении 1:1000, МКАт с концентрацией 1 мг/мл в разведении 1:1000. Note. С — B. mallei strains: 1 — C-4; 2 — C-5; 3 — t-12;

4 — B-120; 5 — P-1; 6 — Muksuwar-11; 7 — Z-12; 8 — Zagreb;

9 — Ivanovich; 10 — 5534. M — B. pseudomallei strains: 1 — 100; 2 — 102; 3 — 115; 4 — 116; 5 — 132; 6 — 135;

7 — 301; 8 — 51274; 9 — 60913; 10 — 61503. НМС — naive mouse serum diluted to 1:1000, concentration of Mab 1 mg/ml diluted to 1:1000.

Список литературы/References

1. Антонов В.А., Илюхин В.И., Храпова Н.П., Прохватилова Е.В., Викторов Д.В., Сенина Т.В., Будченко А.А., Ткаченко Г.А., Алексеева В.В., Захарова И.Б., Савченко С.С., Зинченко О.В., Сорокина Ю.И., Алексеев В.В. Современные подходы к диагностике сапа и мелиоидоза. Идентификация и типирование B. mallei и B. pseudomallei // Проблемы особо опасных инфекций. 2012. № 2 (112). С. 46-50. [Antonov V.A., Ilyukhin V.I., Khrapova N.P., Prokhvatilova E.V., Viktorov D.V., Senina T.V., Budchenko A.A., Tkachenko G.A., Alekseeva V.V., Zakharova I.B., Savchenko S.S., Zinchenko O.V., Sorokina Yu.I., Alekseev VV. Modern approaches for detection of glanders and melioidosis. Identification and typing of Burkholderia mallei and Burkholderia pseudomallei. Problemy osobo opasnykh infektsiy = Problems of Particularly Dangerous Infections, 2012, no. 2 (112), pp. 46—50. (In Russ.)]

2. Безопасность работы с микроорганизмами I—II групп патогенности (опасности): санитарные правила СП 1.3.1285-03. [Safety of work with microorganisms of the I—II pathogenicity (hazard) groups: sanitary rules SP 1.3.1285-03]

3. Лемасова Л.В., Ткаченко Г.А., Савченко С.С., Бондарева О.С., Антонов В.А. Разработка мультиплексной тест-системы для обнаружения дифференциации Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei методом ПЦР в режиме реального времени // Проблемы особо опасных инфекций. 2016. Вып. 4. С. 56—59. [Lemasova L.V., Tkachenko G.A., Savchenko S.S., Bondareva O.S., Antonov V.A. Development of real-time multiplex PCR assay for the detection and differentiation of Burkholderia mallei and Burkholderia pseudomallei. Problemy osobo opasnykh infektsiy = Problems of Particularly Dangerous Infections, 2016, no. 4, pp. 56—59. (In Russ.)]

4. Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I—IV групп патогенности: методические указания МУ 1.3.2569-09. [Organization of work of laboratories using nucleic acid amplification methods when working with a material containing microorganisms of the I—IV pathogenicity groups: guidelines MU 1.3.2569-09.]

5. Федюкина Г.Н., Ветчинин С.С., Баранова Е.В., Рудницкий С.Ю., Соловьев П.В., Колосова Н.В., Бикетов С.Ф. Получение компонентов иммунохроматографического теста для выявления возбудителей сапа и мелиоидоза // Биотехнология. 2015. № 1. С. 85—93. [Fediukina G.N., Vetchinin S.S., Baranova E.V., Rudnitskii S.Yu., Soloviov P.V., Kolosova N.V., Biketov S.F. Obtaining of components of immunochromatography test for glanders and melioidosis causes detection. Biotekhnologiya = Biotechnology, 2015, no. 1, pp. 85-93. (In Russ)].

6. Andersen K., Dargis R., Kemp M., Christensen J.J. Detection of Burkholderia pseudomallei by SYBR green real time PCR. Open Pathol. J., 2009, vol. 3, pp. 30-32.

7. Esters D.M., Dow S.W., Schweizer H.P., Torres A.G. Present and future strategies for melioidosis and glanders. Expert Rev. Anti Infect. Ther, 2010, vol. 8, no. 3. pp. 325-338.

8. Foong Y.C., Tan M.R., Bradbury R.S. Melioidosis: a review. Rural Remote Health., 2014, vol. 14, p. 2763.

9. Gregory B.C., Waag D.M. Glanders. In: Medical aspects ofbiological warfare. Ed. Dembek Z.F. Washington, DC: Borden Institute Walter Reed Army Medical Center, 2007, pp. 121-146.

10. Houghton R.L., Reed D.E., Hubbard M.A., Dillon M.J., Chen H., Currie B.J., Mayo M., Sarovich D.S., Theobald V., Limma-thurotsakul D., Wongsuvan G., Chantratita N., Peacock S.J., Hoffmaster A.R., Duval B., Brett P.J., Burtnick M.N., Aucoin D.P. Development of a prototype lateral flow immunoassay (LFI) for the rapid diagnosis of melioidosis. PLOSNeglected Tropical Dis., 2014. vol. 8, no. 3, pp. 1-10.

11. Lee M.A., Wang D., Yap E.H. Detection and differentiation of Burkholderia pseudomallei, Burkholderia mallei and Burkholderia thailandensis by multiplex PCR. FEMS Immunol. Med. Microbiol., 2005, vol. 43, pp. 413-417.

12. Lowe W., March J.K., Bannell A.J., O'Noill R.L., Robinson R.A. PCR-based methodologies used to detect and differentiate the Burkholderia pseudomallei complex: B. mallei and B. pseudomallei and B. thailandensis. Curr. Issues Mol. Biol, 2013, vol. 22, no. 16 (2), pp. 23-54.

13. Sanford J.P. Pseudomonas species (including melioidosis and glanders). In: Principles and practice of infectious diseases. Eds. Mandell G.L., Bennett J.E., Dolin R. 8th ed. New York, N.Y.: Churchill Livingstone, 1995, pp. 2003-2009.

14. Tomaso H., Scholz H.C., Al Dahouk S., Eickhoff M., Treu T.M., Wernery R., Wernery U., Neubauer H. Development of a 5'-nuc-lease real-time PCR assay targeting fliP for the rapid identification of Burkholderia mallei in clinical samples. Clin. Chem., 2006, vol. 52, no. 2, pp. 307-310.

15. Tomaso H., Scholz H.C., Al Dahouk S., Pitt T.L., Treu T.M., Neubauer H. Development of 5' nuclease real-time PCR assays for the rapid identification of the Burkholderia mallei/Burkholderia pseudomallei complex. Diagn. Mol. Pathol., 2004, vol. 13, pp. 247-253.

Авторы:

Ветчинин С.С., к.б.н., старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник сектора Лайм-боррелиоза отдела иммунобиохимии патогенных микроорганизмов ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии (ГНЦ ПМБ) Роспотребнадзора, п. Оболенск, Московская область, Россия;

Щит И.Ю., к.б.н., старший научный сотрудник сектора Лайм-боррелиоза отдела иммунобиохимии патогенных микроорганизмов ФБУН ГНЦ ПМБ Роспотребнадзора, п. Оболенск, Московская область, Россия; Шевяков А.Г., младший научный сотрудник сектора Лайм-боррелиоза отдела иммунобиохимии патогенных микроорганизмов ФБУН ГНЦ ПМБ Роспотребнадзора, п. Оболенск, Московская область, Россия; Бикетов С.Ф., к.б.н., зав. отделом иммунобиохимии патогенных микроорганизмов ФБУН ГНЦ ПМБ Роспотребнадзора, п. Оболенск, Московская область, Россия.

Поступила в редакцию 28.05.2018 Отправлена на доработку 11.03.2019 Принята к печати 09.04.2019

Authors:

Vetchinin S.S., PhD (Biology), Senior Researcher, Leading Researcher, Lime-Borreliosis Sector, Department for Immunobiochemistry of Pathogenic Microorganisms, State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow Region, Russian Federation; Shchit I.Yu., PhD (Biology), Senior Researcher, Lime-Borreliosis Sector, Department for Immunobiochemistry of Pathogenic Microorganisms, State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow Region, Russian Federation; Shevyakov A.G., Junior Researcher, Lime-Borreliosis Sector, Department for Immunobiochemistry of Pathogenic Microorganisms, State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow Region, Russian Federation; Biketov S.F., PhD (Biology), Head of the Department for Immunobiochemistry of Pathogenic Microorganisms, State Research Center for Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow Region, Russian Federation.

Received 28.05.2018 Revision received 11.03.2019 Accepted 09.04.2019

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.