CC BY
20
Научные результаты биомедицинских исследований. 2020. Т. 6, № 1. С. 63-77 Research Results in Biomedicine. 2020. Vol. 6, № 1. Р. 63-77
[M
УДК616.346.2-002
DOI: 10.18413/2658-6533-2020-6-1-0-6
Д.И. Свинарева
Вклад ген-генных взаимодействий полиморфных локусов матриксных металлопротеиназ в подверженность к первичной открытоугольной глаукоме у мужчин_
Некоммерческое партнерство «Офтальмологический Центр «Поколение», мкр. Буденного, д. 16, г. Старый Оскол, 309502, Российская Федерация Автор для переписки: Д.И. Свинарева ([email protected])
Аннотация
Актуальность: Первичная открытоугольная глаукома (ПОУГ) относится к одной из самых распространенных и тяжелых форм заболеваний глаз, приводящих к слепоте и инвалидности. Глаукома у мужчин встречается в более чем половине случаев (65%). Цель исследования: Изучить вклад ген-генных взаимодействий полиморфных локусов матриксных металлопротеиназ в подверженность к первичной открытоугольной глаукоме у мужчин. Материалы и методы: Выборка для исследования включала 236 мужчин с ПОУГ (диагноз был подтвержден клиническими, инструментальными и лабораторными методами обследования) и 176 мужчин контрольной группы, не имеющих данного заболевания. Проведено молекулярно-генетическое исследование 8 полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ (MMP). Изучение взаимодействий, ассоциированных с развитием ПОУГ, проводилось с использованием программы АРSampler. Результаты: Установлено 16 моделей взаимодействий генов MMP (4 двухлокусных, 7 трехлокусных и 5 четырехлокусных) определяющих подверженность к развитию ПОУГ у мужчин (pperm<0,05), среди которых 6 моделей являются протективными и 10 моделей - факторы риска развития ПОУГ (OR=1,80-9,26). В состав моделей входят все 8 изучаемых нами полиморфных локусов MMP: ге3918249, ге3787268, ^2250889, ге17577, ге17576, ^3918242 гена ММР-9, ^1799750 гена ММР-1, ге679620 гена ММР-3. При этом два полиморфизма (ге1799750 ММР-1 и ге2250889 ММР-9) включены в наибольшее количество моделей (10 и 8 моделей соответственно). Полиморфные локусы ге1799750 и ге2250889 имеют важное функциональное значение в организме - проявляют эпигенетические эффекты, ассоциированы с уровнем экспрессии (cis-eQTL) генов MMP1, MMP10, WTAPP1, PLTP, PCIF1, NEURL2 и уровнем альтернативного сплайсинга транскрипта гена SLC12A5, определяют несинонимическую замену в гене MMP-9 (p.Arg574Pro). Заключение: Межгенные взаимодействия полиморфных локусов ММР ассоциированы с формированием ПОУГ у мужчин. Ключевые слова: матриксные металлопротеиназы; взаимодействия;
ПОУГ; полиморфизм; мужчины
Благодарности: Работа выполнена при финансовой поддержке гранта Президента Российской Федерации для ведущих научных школ Российской Федерации (проект НШ-2609.2020.7).
Для цитирования: Свинарева ДИ. Вклад ген-генных взаимодействий полиморфных локусов матриксных металлопротеиназ в подверженность к первич-
Научные результаты биомедицинских исследований. 2020. Т. 6, № 1. С. 63-77 Research Results in Biomedicine. 2020. Vol. 6, № 1. Р. 63-77
ной открытоугольной глаукоме у мужчин. Научные результаты биомедицинских исследований. 2020;6(1):63-77. DOI: 10.18413/2658-6533-2020-6-1-0-6
Dina I. Svinareva
The contribution of gene-gene interactions of polymorphic loci of matrix metalloproteinases to susceptibility to primary open-angle glaucoma in men_
Ophthalmological Center «Generation», 16 Budyonny Micr., Stary Oskol, 309502, Russia Corresponding author: Dina I. Svinareva ([email protected])
Abstract
Background: Primary open-angle glaucoma (POAG) is a serious form of eye diseases leading to blindness and disability. Glaucoma in men occurs in more than half of cases (65%). The aim of the study: To study the contribution of gene-gene interactions of polymorphic loci of matrix metalloproteinases to susceptibility to primary open-angle glaucoma in men. Materials and methods: The study included 236 men with POAG (the diagnosis was confirmed by clinical, instrumental and laboratory examination methods) and 176 men of the control group without this disease. A molecular genetic study of 8 polymorphic loci of matrix metalloproteinase (MMP) genes was performed. The study of SNP^SNP interactions associated with the POAG development was conducted using the Arsampler program. Results: 16 models of SNP x SNP interactions of MMP genes (4 two-locus, 7 three-locus and 5 four-locus) that determine susceptibility to the development of POAG in men (pperm <0.05) were identified, among which 6 models are protective and 10 models are risk factors for the development of POAG (OR = 1.80-9.26). The models include all 8 MMP polymorphic loci studied: rs3918249, rs3787268, rs2250889, rs17577, rs17576, rs3918242 of the MMR-9 gene, rs1799750 of the MMP-1 gene, and rs679620 of the MMP-3 gene. Two polymorphisms (rs1799750 MMP-1 and rs2250889 MMP-9) are included in the largest number of models (10 and 8 models, respectively). The polymorphic rs1799750 and rs2250889 loci are of great functional importance in the body - they exhibit epigenetic effects associated with the expression level (cis-eQTL) of the MMP1, MMP10, WTAPP1, PLTP, PCIF1, NEURL2 genes and the level of alternative splicing of the SLC12A gene transcript, they determine the non-sync5 gene MMP-9 (p.Arg574Pro). Conclusion: Intergenic interactions of polymorphic MMP loci are associated with the POAG formation in men. Keywords: matrix metalloproteinases; SNPxSNP interactions; POAG; polymorphism; men
Acknowledgements: This work was financially supported by a grant from the President of the Russian Federation for leading scientific schools of the Russian Federation (project NSh-2609.2020.7).
For citation: Svinareva DI. The contribution of gene-gene interactions of polymorphic loci of matrix metalloproteinases to susceptibility to primary open-angle glaucoma in men. Research Results in Biomedicine. 2020;6(1):63-77. (In Russian) DOI: 10.18413/2658-6533-2020-6-1 -0-6
Введение. Первичная открытоуголь- заболеваний глаз, приводящих к слепоте и
ная глаукома (ПОУГ) относится к одной из инвалидности. [1]. Среди всех видов глау-
самых распространенных и тяжелых форм ком на долю ПОУГ приходиться от 72,3 до
96,1% [2]. ПОУГ - хроническое заболевание, характеризующееся прогрессирующей и необратимой дегенерацией клеток ганглиозного слоя, входящего в состав зрительного нерва и слоя нервных волокон сетчатой оболочки [3]. Следует отметить, что мужской пол является фактором риска развития глаукомы - данное заболевание встречается у мужчин в 65% [4]. Особенностью ПОУГ является бессимптомное течение и довольно сложная и трудоемкая диагностика на начальных стадиях, поэтому выявление данного заболевания в большинстве случаев происходит на стадиях, сопровождающихся уже необратимыми изменениями зрительного нерва [5]. ПОУГ - одна из главных причин слабовидения и слепоты среди лиц трудоспособного возраста в развитых странах [6].
Установлено, что в формировании ПОУГ важное значение имеют матриксные металлопротеиназы (далее ММР). ММР вовлечены в патогенез различных типов глаукомы [7-10], их содержание существенно выше в глаукоматозных глазах [11]. Матриксные металлопротеиназы участвуют в регуляции оттока внутриглазной жидкости [12]. По сравнению со здоровыми глазами, содержание ММР-2 и -9 существенно выше в глаукоматозных глазах. Эти изменения были обнаружены в водянистой влаге, радужно-роговичный углу и теноновой капсуле у пациентов с первичной открытоугольной глаукомой, первичной закрытоугольной глаукомой и эксфолиативной глаукоме [13, 14]. Повышение содержания металлопротеиназы-9 как в системном кровотоке, так и местно также может свидетельствовать о нарушении процессов клеточного ремоделирова-ния в структурах глаза, что способствует формированию аутоиммунного воспаления с деструкцией тканей [15]. Наибольшее значение в формировании ПОУГ имеют ММР-1 и ММР -9 [16, 17].
Генетические исследования ПОУГ активно проводятся как зарубежными научными коллективами, так и российскими учеными [18-21]. Исследуется вовле-
ченность генов матриксных металлопротеиназ в формирование глаукомы. Так, в проведенном Golubnitschaja O. et. al. исследовании установлено, что экспрессия генов тканевого ингибитора матриксных металлопротеиназ ММР-9 и ММР-14 была повышена у пациентов с нормотензивной глаукомой по сравнению с контрольной группой [22]. Aung T et. al. изучали полиморфизм rs2664538 гена ММР- 9 у 217 пациентов с ПЗУГ и 83 индивидуумов контрольной группы в Китае [23]. Markiewicz L. et. al. провели анализ ассоциаций полиморфных локусов -1607 1G / 2G ММР-1, -1562 C / T ММР-9, -82 A / G ММР-12, C / T IL-1ß -511 и 372 T / C TIMP1 с возникновением ПОУГ и исследовали их влияние на основные клинические признаки глаукомы [24]. В результате исследования, проведенного Micheal S. et. al. обнаружено, что у мужчин фактором риска ПЗУГ является полиморфизм rs17576 (c.836A> G) гена ММР-9, который у женщин не играл существенной роли [25]. Следует отметить, что в Российской Федерации изучение роли полиморфизма генов MMP в развитии ПОУГ до последнего времени не проводилось.
Цель исследования. Изучить вклад ген-генных взаимодействий полиморфных локусов матриксных металлопротеиназ в подверженность к первичной открыто-угольной глаукомы у мужчин.
Материалы и методы исследования. Выборка для исследования включала 236 мужчин с ПОУГ (диагноз был подтвержден клиническими, инструментальными и лабораторными методами обследования) и 176 мужчин контрольной группы, не имеющих данного заболевания. Все мужчины, включенные в данное исследование, являлись уроженцами Центрального Черноземья Российской Федерации (Курская, Белгородская, Воронежская, Липецкая области), имели русскую национальность и не находились в родстве друг с другом [18, 19]. Диагноз глаукома был поставлен согласно следующих диагностических критериев: повышение ВГД, вид глаукоматозной экскавации ДЗН при оф-
тальмоскопии, изменения периферического поля зрения, специфичные для глаукомы. Обследование обеих групп было проведено в офтальмологическом отделении ОГБУЗ Белгородской областной клинической больницы им. Святителя Иоасафа (Белгород) и офтальмологическом центре «Поколение» (Старый Оскол).
Группа контроля была сформирована из индивидуумов мужского пола, не имеющих острых и хронических заболеваний глаз, у которых отсутствовали какие-либо признаки глаукомы - ВГД было ниже 21 при пневматической тонометрии, отсутствовала глаукоматозная экскавация диска зрительного нерва и периферическое поле зрения было в пределах нормы. Также они не имели тяжелых соматических патологий, в том числе приводящих к поражениям глаз.
Все исследования пациентам проводились только после их информированного согласия на использование персональных и лечебно- диагностических данных для научно-исследовательских целей, полученных в ходе госпитализации.
Средний возраст пациентов с ПОУГ составил 70,5± 4,8 лет, контрольной группы - 69,7 ± 5,2 лет ф>0,05). Более половины больных ПОУГ (52,6%) имели сопутствующие заболевания других органов и систем, в группе контроля - 48,1%. При оценке индекса массы тела больные ПО-УГ не отличались от группы контроля: у больных ПОУГ - 27,99±4,82, варьировал от 16,4 до 47,3, у пациентов из контрольной группы - 28,21±5,70, варьировал от 17,93 до 51,4 (р=0,59).
Для молекулярно-генетического исследования были отобраны 8 полиморфных локусов генов матриксных металло-протеиназ ге3918249, ге3787268, ^2250889, ге17577, ге17576, ^3918242 гена ММР-9, ^1799750 гена ММР-1, ге679620 гена ММР-3 с учетом их значимого влияния на экспрессию и регуляторный потенциал генов [26].
Анализ полиморфных маркеров осуществлялся методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) синтеза ДНК на амплифи-
каторе CFX96. Генотипирование проводилось в режиме реального времени методом TaqMan зондов. Использовались наборы реагентов для генотипирования полиморфных локусов rs3918249, rs3787268, rs2250889, rs17577, rs17576, rs3918242 гена ММР-9, rs1799750 гена ММР-1, rs679620 гена ММР-3 с соответствующими олиго-нуклеотидными праймерами и зондами, синтезированными ООО «ТестГен» (Ульяновск).
Анализ SNPXSNP взаимодействий, определяющих подверженность к развитию ПОУГ у мужчин, проводился методом Монте-Карло марковских цепей и байесовской непараметрической статистики с использованием программного обеспечения APSampler (http:
//sources.redhat.com/cygwin). Для коррекции на множественные сравнения использовался пермутационный тест. Характер ассоциации, выявленных межгенных взаимодействий, оценивался с помощью показателя отношения шансов (OR) и его 95% доверительного интервала (95%CI) [27].
Функциональное значение исследуемых полиморфных локусов генов ММР изучалось с помощью программ HaploReg (v4.1)
(http ://archive.broadinstitute.org/mammals/ha ploreg/haploreg.php) (оценивались эпигенетические эффекты полиморфных локусов), GTExportal (http://www.gtexportal.org/) (изучалась связь полиморфизма генов с экспрессией генов (cis-eQTL)), PolyPhen-2 (http ://genetics.bwh.harvard .edu/pph2/index.s html) (выявлялась связь с аминокислотными заменами в кодируемом полипептиде и оценивался их предикторный потенциал).
Результаты и их обсуждение. Результаты популяционно-генетического анализа полученного нами распределения генотипов MMP в исследуемых выборках мужчин, больных ПОУГ и контрольной группы, представлены в таблице 1. Следует отметить, что по всем рассмотренным локусам генов MMP наблюдаемая гетеро-зиготность (Ho) соответствует теоретически ожидаемой гетерозиготности (He) (наблюдаемое распределение генотипов
достоверно не отличается от ожидаемого распределения согласно равновесия Хар-ди-Вайнберга) (>0,05).
С использованием биоинформатиче-ского подхода (программа АРSampler) определены комбинации генетических вариантов полиморфных локусов генов ММР, вовлеченных в формирование ПОУГ у мужчин (табл. 2). Полученные нами данные свидетельствуют о статистических
значимых ассоциациях 16 моделей ЗКР^КР взаимодействий генов MMP разного уровня (4 двухлокусных, 7 трехло-кусных и 5 четырехлокусных моделей) c развитием ПОУГ у мужчин (pperm<0,05). При этом, среди 16 статистически значимых моделей, связанных с формированием ПОУГ у мужчин, 6 моделей являются про-тективными и 10 моделей - факторы риска развития ПОУГ ^=1,80-9,26).
Таблица 1
Анализ распределения полиморфных маркеров генов MMP среди мужчин, больных ПОУГ и в контрольной группе
Table 1
Analysis of the distribution of polymorphic markers of MMP genes in men with POAG
Полиморфный локус Показатели Больные ПОУГ (n=236) Группа контроля (n=176)
rs3918249 ММР-9 Генотипы* 98/110/32 65/78/33
Ho/He (Phwe) 0,46/0,46 (>0,05) 0,44/0,48 (>0,05)
rs3787268 ММР-9 Генотипы* 163/72/9 110/55/9
Ho/He (Phwe) 0,30/0,30 (>0,05) 0,32/0,33 (>0,05)
rs2250889 ММР-9 Генотипы* 189/48/6 147/24/3
Ho/He (Phwe) 0,20/0,22 (>0,05) 0,14/0,16 (>0,05)
rs17577 ММР-9 Генотипы* 163/76/6 114/52/4
Ho/He (Phwe) 0,31/0,29 (>0,05) 0,31/0,29 (>0,05)
rs17576 ММР-9 Генотипы* 100/107/31 59/88/26
Ho/He (Phwe) 0,44/0,45 (>0,05) 0,50/0,48 (>0,05)
rs3918242 ММР-9 Генотипы* 167/65/6 126/42/6
Ho/He (Phwe) 0,27/0,27 (>0,05) 0,24/0,26 (>0,05)
rs1799750 ММР-1 Генотипы* 42/123/73 45/81/48
Ho/He (Phwe) 0,51/0,49 (>0,05) 0,46/0,49 (>0,05)
rs679620 ММР-3 Генотипы* 71/116/55 49/80/46
Ho/He (Phwe) 0,47/0,49 (>0,05) 0,45/0,49 (>0,05)
Примечание: *- указано количество гомозигот по частому аллелю/гетерозигот/ гомозигот по редкому аллелю; Но - наблюдаемая гетерозиготность; He - ожидаемая гетерозиготность. Note: * - the number of homozygotes for the frequent allele / heterozygotes / homozygotes for the rare allele is indicated; Ho - observed heterozygosity; He - the expected heterozygosity.
Обращает на себя внимание факт того, что в состав моделей межгенных взаимодействий, определяющих подверженность к ПОУГ у мужчин, входят все 8 изучаемых нами полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ: rs3918249, rs3787268, rs2250889, rs17577, rs17576, rs3918242 гена ММР-9, rs1799750 гена
ММР-1, ге679620 гена ММР-3. Так же следует отметить, что в состав наибольшего количества моделей ген-генных взаимодействий, ассоциированных с формированием ПОУГ, входят полиморфные локусы ге1799750 ММР-1 (10 моделей) и ^2250889 ММР-9 (8 моделей).
Установлено, что SNPXSNP взаимодействие rs2250889 ММР-9 х rs17576 ММР-9 является основой 6 моделей, а rs3918249 ММР-9 х rs1799750 ММР-1 входит в состав 5 «значимых» моделей, связанных с формированием ПОУГ у мужчин.
На следующем этапе нашей работы были изучены эпигенетические эффекты наиболее ПОУГ-значимых полиморфных локусов генов матриксных металлопроте-иназ (rs1799750 ММР-1 и rs2250889 ММР-9). С использованием программы HaploReg (v4.1) установлено, что rs 1799750, расположенный в интроне гена ММР-1, имеет выраженный регуляторный потенциал: он находится в области регуля-торных мотивов ДНК, взаимодействующих с регуляторными белками CFOS и GATA2, регионе гиперчувствительности к ДНКазе-1 в пяти клеточных культурах и тканях (в том числе в H1 Derived Mesenchymal Stem Cells, Fibroblast Primary Cells и др.), регионе модифицированных гистонов (H3K4me1, H3K9ac), маркирующих энхансеры в шести различных культурах клеток, тканях и органах, находится в области сайтов связывания с 21 транскрипционным фактором (AP-1_disc8, CHX10, DMRT2, Dbx1, En-1_3, Ets_disc1, Evi-1_4, GATA_known1, HMG-IY_1, Hlx1, Hoxb4, Msx-1_2, Ncx_2, Nkx6-1_2, PLZF, Pax-4_2, Pax-6_3, Pou2f2_known4, Pou3f2_4, Pou3f4, Pou6f1_2). Наряду с этим, согласно данным, представленным в онлайн базе GTExportal, полиморфизм rs 1799750 ассоциирован с уровнем экспрессии трех генов (MMP1, MMP10, WTAPP1) в различных органах и тканях (pfdr<0,05) (табл. 3).
Согласно нашим данным регулятор-ные эффекты полиморфного локуса rs2250889 гена ММР-9 также значимы: в соответствии с базой данных HaploReg (v4.1) он находится в эволюционно консервативном регионе ДНК, локализован
в регионе модифицированных гистонов маркирующих промоторы (H3K4me3, H3K27ac) и энхансеры (H3K4me1, H3K9ac) в множестве различных культур клеток, тканях и органах (H1, H9 Derived Neuronal Progenitor Cultured Cells, H9 Derived Neuron Cultured Cells, hESC Derived CD56+ Ectoderm Cultured Cells, hESC Derived CD 184+ Endoderm Cultured Cells, hESC Derived CD56+ Mesoderm Cultured Cells, H1 Derived Mesenchymal Stem Cells и др.), находится в области регуляторного мотива ДНК, взаимодействующего с регу-ляторным белком CTCF и расположен в регионе сайтов связывания с 2 транскрипционными факторами (NRSF_disc3 и NRSF_known2). Материалы, представленные в онлайн базе данных GTExportal, свидетельствуют о важном eQTL и sQTL значении полиморфизма rs2250889. Данный полиморфный локус ассоциирован с уровнем транскрипции гена PLTP в слизистой оболочке пищевода (ß=0,49, р=7,5е-13, pfdr<0,05), коже (ß=0,42-0,45, р=6,2е-11 - 6,8e-10, pfdr<0,05), гена PCIF1 в крови (ß=-0,12, р=0,000065, pfdr<0,05), гена NEURL2 в большеберцовом нерве (ß=0,35, р=0,00012, pfdr<0,05), а также с связан с уровнем альтернативного сплайсинга транскрипта гена SLC12A5 в гипофизе (ин-трон ID:46021886:46023369:clu_29529, ß=1,10, p=4,7e-9, pfdr<0,05). Наряду с этим полиморфизм rs2250889, расположенный в 10 экзоне гена MMP-9, определяет несинонимическую замену нуклеотида G на C в 1721 положении (c.1721G>C), что приводит к замене аминокислоты аргинин на аминокислоту пролин в 574 положении полипептида MMP-9 (p.Arg574Pro) (http://www.ensembl.org/). Эта миссенс мутация, согласно базы данных PolyPhen-2, имеет предикторный класс «BENIGN» (score=0, чувствительность 1,00, специфичность - 0,00).
Частота комбинаций генетических вариантов MMP у мужчин больных ПОУГ и в контрольной группе Frequency of combinations of ^ genetic variants of MMP in men with POAG and in the control group
Таблица 2 (начало) Beginning of Table 2
Полиморфизмы Комбинации (генетические варианты) Больные ПОУГ Контрольная группа Р (Pperm) OR (95% CI)
n/N % n/N %
Двухлокусные модели
rs 679620 ММР-3x rs 1799750 ММР-1 C rs 679620 x D rs 1799750 144/236 61,01 79/173 45,66 0,001 (0,007) 1,86 (1,25-2,77)
rs 2250889 ММР-9 x rs 17576 ММР-9 CC rs 2250889 x G rs 17576 108/235 45,96 103/171 60,23 0,003 (0,012) 0,56 (0,38-0,84)
rs 2250889 ММР-9 x rs 17576 ММР-9 GC rs 2250889 x G rs 17576 28/235 11,97 7/171 4,09 0,004 (0,015) 3,17 (1,35-7,43)
rs 3918249 ММР-9 x rs 1799750 ММР-1 A rs 3918249 x D rs 1799750 172/233 73,82 106/174 60,92 0,004 (0,042) 1,80 (1,19-2,76)
Трехлокусные модели
rs 3787268 ММР-9 x rs 3918249 ММР-9 x rs 1799750 ММР-1 G rs 3787268 x A rs 3918249 x D rs 1799750 171/233 73,39 102/172 59,30 0,018 (0,025) 0,34 (0,13-0,88)
rs 3787268 ММР-9 x rs 679620 ММР-3 x rs 1799750 ММР-1 A rs 3787268 x T rs 679620 x W rs 1799750 30/235 12,76 41/171 23,98 0,021 (0,029) 0,35 (0,13-0,91)
rs 3918249 ММР-9 x rs 1799750 ММР-1 x rs 17576 ММР-9 A rs 3918249 x D rs 1799750 x A rs 17576 164/229 71,61 99/171 57,89 0,032 (0,034) 0,46 (0,21-0,99)
rs 17577 ММР-9 x rs 2250889 ММР-9 x rs 1799750 ММР-1 A rs 17577 x G rs 2250889 x D rs 1799750 16/235 6,81 2/167 1,20 0,005 (0,034) 6,02 (1,37-26,58)
rs 17577 ММР-9 x rs 2250889 ММР-9 x rs 679620 ММР-3 A rs 17577 x G rs 2250889 x T rs 679620 16/238 6,72 2/167 1,20 0,005 (0,034) 5,95 (1.35-26.22)
Таблица 2 (окончание)
Частота комбинаций генетических вариантов MMP у мужчин больных ПОУГ и в контрольной группе
End of Table 2
Frequency of combinations of genetic variants of MMP in men with POAG and in the control group
Полиморфизмы Комбинации (генетические варианты) Больные ПОУГ Контрольная группа Р (Pperm) OR (95% CI)
n/N % n/N %
rs 3918249 ММР-9 x rs 2250889 ММР-9 x rs 17576 ММР-9 Ars 3918249 x G rs 2250889 x G rs 17576 24/230 10,43 6/171 3,51 0,006 (0,037) 3,20 (1,27-8,02)
rs 2250889 ММР-9 x rs 3918242 ММР-9 x rs 17576 ММР-9 G rs 2250889 x A rs 3918242 x G rs 17576 12/231 5,19 1/170 0,59 0,007 (0,050) 9,26 (1,19-71,92)
Четы рехлокусные модели
rs 3787268 ММР-9 x rs 3918249 ММР-9 x rs 679620 ММР-3 x rs 1799750 ММР-1 A rs 3787268 x Grs 3918249 x T rs 679620 x W rs 1799750 27/231 11,68 40/171 23,39 0,001 (0,007) 0,43 (0,25-0,74)
rs 3787268 ММР-9 x rs 679620 ММР-3 x rs 1799750 ММР-1 x rs 3918242 ММР-9 A rs 3787268 x T rs 679620 x W rs 1799750 x G rs 3918242 28/232 12,06 40/169 23,66 0,001 (0,007) 0,44 (0,26-0,75)
rs 17577 ММР-9 x rs 3787268 ММР-9 x rs 2250889 ММР-9 x rs 1799750 ММР-1 A rs 17577 x G rs 3787268 x G rs 2250889 x DW rs 1799750 11/234 4,70 0/165 0 0,003 (0,012) 5,73 (1,70-19,33)
rs 2250889 ММР-9 x rs 679620 ММР-3 x rs 3918242 ММР-9 x rs 17576 ММР-9 G rs 2250889 x G rs 679620 x A rs 3918242 x G rs 17576 10/231 4,33 0/169 0 0,004 (0,016) 5,88 (1,65-20,92)
rs 2250889 ММР-9 x rs 1799750 ММР-1 x rs 3918242 ММР-9 x rs 17576 ММР-9 G rs 2250889 x W rs 1799750 x A rs 3918242 x G rs 17576 9/230 3,91 0/230 0 0,008 (0,045) 5,85 (1,54-22,25)
Полиморфизм rs1799750 и уровень экспрессии генов (cis-eQTL) в различных органах и тканях Rs1799750 polymorphism and gene expression level (cis-eQTL) in various organs and tissues
Таблица 3 Table 3
Экспрессируемый ген Аллель (ref) Алелль (alt) ß Р Орган/ткань
MMP1 ТС Т -0,66 9,6e-84 Cells - Cultured fibroblasts
MMP1 ТС Т -0,52 1,3e-25 Thyroid
MMP1 ТС Т -0,42 1,9e-25 Lung
MMP1 ТС Т -0,58 5,8e-23 Heart - Atrial Appendage
MMP1 ТС Т -0,45 1,7e-18 Adipose - Visceral (Omentum)
MMP1 ТС Т -0,46 6,6e-15 Heart - Left Ventricle
MMP1 ТС Т -0,36 2,2e-11 Nerve - Tibial
MMP1 ТС Т -0,32 1,3e-8 Esophagus - Muscularis
MMP1 ТС Т -0,35 1,5e-8 Artery - Aorta
MMP1 ТС Т -0,28 2,4e-8 Adipose - Subcutaneous
MMP1 ТС Т -0,22 3,8e-7 Artery - Tibial
MMP10 ТС Т -0,19 0,0000025 Lung
MMP1 ТС Т -0,3 0,0000028 Esophagus - Gastroesophageal Junction
MMP1 ТС Т -0,28 0,0000075 Breast - Mammary Tissue
WTAPP1 ТС Т -0,15 0,00004 Testis
Примечание: использованы Note: data from the Genotype
данные проекта Genotype-Tissue Expression (GTEx) (http://www.gtexportal.org/) -Tissue Expression (Gtx) project was used (http://www.gtexportal.org/)
Таким образом, полиморфные локу-сы ^1799750 ММР-1 и ^2250889 ММР-9, играющие наиболее существенную роль в формировании подверженности к ПОУГ у мужчин (входят в состав наибольшего количества моделей взаимодействий, ассоциированных с развитием заболевания), имеют важное функциональное значение в организме (эпигенетические эффекты, eQTL, sQTL, несинонимическая замена). Полиморфизм ге1799750 ММР-1 находится в области регуляторных мотивов ДНК, взаимодействующих с регуля-торными белками CFOS и GATA2, регионе гиперчувствительности к ДНКазе-1 в пяти клеточных культурах и тканях, регионе модифицированных гистонов, маркирующих энхансеры в шести различных культурах клеток, тканях и органах, находится в области сайтов связывания с 21 транскрипционным фактором, ассоциирован с уровнем экспрессии трех генов (MMP1, MMP10, WTAPP1). Полиморфный локус ге2250889 определяет несинонимическую замену в гене MMP-9 (р.А^574Рго), локализован в эволюционно консервативном регионе ДНК, расположен в регионе модифицированных гистонов маркирующих промоторы и энхансеры в множестве различных культур клеток, тканях и органах, находится в области регуляторного мотива ДНК, взаимодействующего с регу-ляторным белком CTCF, расположен в регионе сайтов связывания с 2 транскрипционными факторами (NRSF_disc3 и NRSF_known2), ассоциирован с уровнем транскрипции 3 генов (PLTP, PCIF1, NEURL2) и уровнем альтернативного сплайсинга транскрипта гена SLC12A5.
Согласно литературным данным, матриксные металлопротеиназы представляют собой обширное семейство внеклеточных, цинк-содержащих протеиназ, отвечающих за рзрушение компонентов внеклеточного вещества как при физиологических, а также при патологических состояниях [28, 29, 30]. регулируемые на разных уровнях, включая транскрипцию, активацию белка и взаимодействие с эндогенными ингибиторами. MMP имеют
большое значение в обмене белков соединительной ткани, в процессах развития межклеточного вещества в норме, а также при онкогенном перерождении клеток, ре-моделировании внеклеточного матрикса в процессе развития и роста различных тканей, включая ткани глаз [31]. Матриксная металлопротеиназы-1 (MMP-1), также известная как интестинальная коллагеназа и коллагеназа I, синтезируется фибробла-стами, хондроцитами, макрофагами, кера-тиноцитами, эндотелиальными клетками и остеобластами [32].
Матриксная металлопротеиназа-9 (MMP-9 или желатиназа B) играет важную роль в процессах воспаления, ремоделиро-вания ткани, репарации, регуляции связанных факторов роста и обмена цитокинов. Активность MMP-9 регулируется TIMP-3 и различными цитокинами и факторами роста, включая интерлейкины, интерферо-ны, эпидермальный фактор роста (EGF), фактор роста нервов (NGF), основной фактор роста фибробластов (FGFb), фактор роста сосудистого эндотелия (VEGF), тромбоцитарный фактор роста (PDGF), фактор некроза опухоли а (TNF-а), трансформирующий фактор роста в (TGF-в) и остеопонтин [18, 19]. MMP-9 отвечает за лизис белков внеклеточного межуточного вещества, а также активация различных факторов роста, таких как pro-TGF-в и pro-TNF-a [30].
В ряде ранее проведенных исследований установлено, что ММР-1 и MMP-9 были вовлечены в снижении устойчивости к оттоку внутриглазной жидкости глаза, особенно содержание ММР-9 было связано с процессом глаукомы. По сравнению со здоровыми глазами в глаукоматозных глазах концентрация ММР- 9 была достоверно выше. Эти изменения были обнаружены в водянистой влаге, радужно-роговичный углу и теноновой капсуле у пациентов с различными видами глауком, в том числе, ПОУГ [13]. Роль матриксных металлопротеиназ в регуляции оттока ВГЖ исследовалась Ronkko S.et al. (2007). Была изучена экспрессия ММР и тканевых ингибиторов (MMP-1, -2, -3, -9,
TIMP-1, -2, -3) у больных ПОУГ и эксфо-лиативной глаукомой (ЭГ). Концентрация ММР-1 в образцах с ПОУГ значительно превышало этот показатель при эксфолиа-тивной глаукоме [33].
Авторы Manabe S et я1. (2005) сообщают о том, что аномальная активация ММБ-9 при помощи оксида азота NO вызывает внеклеточный сигнальный каскад, ведущий к апоптозу. У мышей с удаленным геном ММР-9, в той же степени, как и у животных, у которых ММР-9 фармакологически был ингибирован, ретинальные клетки не погибают от апоптоза [34].
При изучении ассоциации полиморфизмов ММР-9 с глаукомой в популяции Южного Китая установлено, что полиморфизм ге2250889 является фактором риска для развития первичной закрытоугольной глаукомы (ПЗУГ) ДО = 1,76, р = 0,004)
[35], что полностью согласуется с полученными нами результатами о значимой роли данного полиморфизма в формировании ПОУГ у мужского населения России. В результате исследования, проведенного Micheal S. et al у 112 пациентов с ПОУГ, 82 пациентов с ПЗУГ и 118 здоровых людей в популяции Пакистана, выявлено, что фактором риска развития ПОУГ у женщин является полиморфизм ММР-1 ге1799750 (1607 Ш / 2G) (р<0,001), в то время как этот полиморфизм у лиц мужского пола не ассоциирован с ПОУГ (р> 0,47) [25]. Mossb6ck G et я1. исследовали полиморфизм ММР-1-1 ге1799750 у пациентов с ПОУГ. В исследование были включены 322 пациента с ПОУГ, 202 пациентов с эксфолиативной глаукомой и 248 здоровых индивидуумов. Никаких существенных различий в распределении данного полиморфизма не было установлено между пациентами с ПОУГ и контрольной группой
[36]. Следует отметить, что в нашем исследовании, показана значимая роль полиморфизма ге1799750 ММР-1 в формировании ПОУГ у мужчин.
Заключение. Межгенные взаимодействия полиморфных локусов генов ММР ассоциированы с формированием первичной открытоугольной глаукомы у
мужчин. 16 моделей SNPXSNP взаимодействий генов MMP (4 двухлокусных, 7 трехлокусных и 5 четырехлокусных) определяют подверженность к развитию заболевания, из которых 10 моделей, ассоциированы с повышенным риском, а 6 моделей имеют протективную направленность. В состав наибольшего количества моделей ген-генных взаимодействий, связанных с развитием ПОУГ, входят полиморфные локусы rs1799750 ММР-1 (10 моделей) и rs2250889 ММР-9 (8 моделей). Данные полиморфные локусы (rs1799750 и rs2250889) имеют важное функциональное значение в организме (эпигенетические эффекты, eQTL, sQTL, несинонимическая замена).
В отношении данной статьи не было зарегистрировано конфликта интересов.
Список литературы
1. A multiethnic genome-wide association study of primary open-angle glaucoma identifies novel risk loci / H. Choquet [et al.] // Nat Commun. 2018. Vol. 11, N 9. P. 2278. DOI: 10.1038/s41467-018-04555-4
2. Тикунова Е.В., Чурносов М.И. Генетические исследования при первичной откры-тоугольной глаукоме // Вестник офтальмологии. 2014. Т. 130, N 5. С. 96-99.
3. Metabolomics Profiling of Glaucoma Points to Mitochondrial Dysfunction, Senescence, and Polyamines Deficiency / S. Leruez [et al.] // Invest Ophthalmol Vis Sci. 2018. Vol. 59, N 11. P. 4355-4361. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.18-24938
4. Нероева В.В. Офтальмология: клинические рекомендации [Электронный ресурс] / под ред. В. В. Нероева. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2018. 496 c. URL: https://www.rosmedlib.ru/book/ISBN9785970448 113.html (дата обращения: 12.12.2019).
5. Relationship between the rate of change in lamina cribrosa depth and the rate of retinal nerve fiber layer thinning following glaucoma surgery / P. Krzyzanowska-Berkowska [et al.] // PLoS One. 2018. Vol. 13(11). Article ID e0206040. DOI: https://doi.org/10.1371/journal. pone.0206040
6. Поиск новых маркеров в ранней диагностике первичной открытоугольной глаукомы / Н.И. Курышева [и др.] // Российский офтальмологический журнал. 2015. N 3. С. 23-29.
7. Altered Expression Levels of MMP1, MMP9, MMP12, TIMP1, and IL-1p as a Risk Factor for the Elevated IOP and Optic Nerve Head Damage in the Primary Open-Angle Glaucoma Patients / L. Markiewicz [et al.] // Biomed Res Int. 2015.P.812503. Article ID 812503. DOI: http://dx.doi.org/10.1155/2015/812503
8. Gene polymorphisms of the MMP1, MMP9, MMP12, IL-1P and TIMP1 and the risk of primary open-angle glaucoma / L. Markiewicz [et al.] // Acta Ophthalmol. 2013. Vol. 91(7). P. 516523. DOI: https://doi.org/10.1111/aos.12149
9. Старикова Д.И., Чурносов М.И. Генетические исследования при первичной откры-тоугольной глаукоме // РМЖ. Клиническая офтальмология. 2017. Т. 17, N 1. С. 49-52.
10. Старикова Д.И., Чурносов М.И. Современные представления о молекулярных основах этиопатогенеза первичной открыто-угольной глаукомы // Офтальмохирургия.
2017, N 3. С. 80-83.
11. Analysis combining correlated glaucoma traits identifies five new risk loci for open-angle glaucoma / P. Gharahkhani [et al.] // Sci Rep.
2018. Vol. 8, N 1. P. 3124. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-018-20435-9
12. Kim E.M., Hwang O. Role of matrix metalloproteinase-3 in neurodegeneration // J Neurochem. 2011. Vol. 116, N 1. P. 22-32. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1471-4159.2010.07082.x
13. Genome-wide association study identifies seven novel susceptibility loci for primary open-angle glaucoma / Y. Shiga [et al.] // Hum Mol Genet. 2018. Vol. 27, N 8. P. 1486-1496. DOI: https://doi.org/10.1093/hmg/ddy053
14. Ronkko S. Matrix metalloproteinases and their inhibitors in the chamber angle of normal eyes and patients with primary open-angle glaucoma and exfoliation glaucoma / S. Ronkko [et al.] // Arch Clin Exp Ophthalmol. 2007. Vol. 245, N 5. P. 697-704. DOI: https://doi.org/10.1007/s00417-006-0440-1
15. Исследование факторов регуляции экстраклеточного матрикса и биомеханических свойств корнеосклеральной оболочки при физиологическом старении и первичной от-крытоугольной глаукоме / М.У. Арапиев [и др.] // Национальный журнал Глаукома. 2015. Т. 14, N 4. C. 13-20.
16. MTHFR gene C677T and A1298C polymorphisms and homocysteine levels in primary open angle and primary closed angle glaucoma / S. Micheal [et al.] // Mol Vis. 2009. Vol. 15. P. 2268-2278.
17.Levels and activation of matrix metalloproteinases in aqueous humor are elevated in uveitis-related secondary glaucoma / M. Määttä [et al.] // Glaucoma. 2006. Vol. 15(3). P. 229-237. DOI: 10.1097/01.ijg.0000212229.57922.72
18.Изучение ассоциаций генетических полиморфизмов факторов роста с развитием первичной открытоугольной глаукомы / М.Ю. Кириленко [и др.] // Вестник офтальмологии. 2017. Т. 133, N 3. С. 9-15.
19.Genes of tumor necrosis factors and their receptors and the primary open angle glaucoma in the population of central Russia / E. Tikunova [et al.] // International Journal of Ophthalmology. 2017. Vol. 10(10). P. 1490-1494. DOI: 10.18240/ijo.2017.10.02
20.Тикунова Е.В., Чурносов М.И. Генетические исследования при первичной откры-тоугольной глаукоме // Вестник офтальмологии. 2014. N 5. С. 96-99.
21. Старикова Д.И., Чурносов М.И. Особенности течения и клинических проявлений первичной открытоугольной глаукомы у населения центрального региона Российской Федерации // Современные технологии в офтальмологии. 2018. N 4. С.221-223.
22.Increased expression of matrix metalloproteinases in mononuclear blood cells of normaltension glaucoma patients / O. Golubnitschaja [et al.] // J Glaucoma. 2004. Vol. 13(1). P. 66-72. DOI: http://dx.doi.org/10.1097/00061198-
200402000-00013
23.Lack of association between the rs2664538 polymorphism in the MMP-9 gene and primary angle closure glaucoma in Singaporean subjects / T. Aung [et al.] // J Glaucoma. 2008. N 4. P. 257-258. DOI: http://dx.doi.org/10.1097/IJG.0b013e31815c3aa5
24.Gene polymorphisms of the MMP1, MMP9, MMP12, IL-1ß and TIMP1 and the risk of primary open-angleglaucoma / L. Markiewicz [et al.] // Acta Ophthalmol. 2013. Vol. 91(7). P. 516523. DOI: https://doi.org/10.1111/aos.12149
25.Polymorphisms in matrix metalloproteinases MMP1 and MMP9 are associated with primary open-angle and angle closure glaucoma in a Pakistani population / S. Micheal [et al.] // Mol Vis. 2013. N 19. P.441-447.
26.Association of genetic polymorphisms with age at menarche in Russian women / I. Ponomarenko [et al.] // GENE. 2019. Vol. 686. P. 228-236. DOI: https://doi.org/ 10.1016/j.gene.2018.11.042
27.Пономаренко И.В. Использование метода Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) и его модификаций для анализа ген-генных и генно-средовых взаимодействий при генетико-эпидемиологических исследованиях (обзор) // Научные результаты биомедицинских исследований. 2019. Т. 5, N 1. С. 4-21. DOI: 10.18413/2313-8955-2019-5-1-0-1
28.Wang X., Khalil R.A. Chapter Eight -Matrix Metalloproteinases, Vascular Remodeling, and Vascular Disease // Advances in Pharmacology. 2018. Vol. 81. P. 241-330. DOI: https://doi.org/10.1016/bs.apha.2017.08.002
29. Next generation matrix metalloprotein-ase inhibitors - Novel strategies bring new prospects / M. Levin [et al.] // Biochimica et Bio-physica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 2017. Vol. 1864, N 11(A). P. 1927-39. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2017.06.009
30.Zhao F., Fan Z., Huang X. Role of matrix metalloproteinase-9 gene polymorphisms in glaucoma: A hospital-based study in Chinese patients // J Clin Lab Anal. 2019. Vol. 00. P. e23105. DOI: https://doi.org/10.1002/jcla.23105
31. ExtracellularMMP-9-Based Assessment of Ocular Surface Inflammation in Patients with PrimaryOpen-Angle Glaucoma / A. Zaleska-Zmijewska [et al.] // J Ophthalmol. 2019. Vol. 3. P. 1240537. DOI: 10.1155/2019/1240537
32.Novel STAT binding elements mediate IL-6 regulation of MMP-1 and MMP-3 / S.J. Cutler [et al.] // Sci Rep. 2017. Vol. 7. P. 1-12. DOI: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-08581-y
33. Matrix metalloproteinases and their inhibitors in the chamber angle of normal eyes and patients with primary open-angle glaucoma and exfoliation glaucoma / S. Ronkko [et al.] // Grae-fes Arch Clin Exp Ophthalmol. 2007. Vol. 245(5). P. 697-704. DOI: https://doi.org/10.1007/s00417-006-0440-1
34. Manabe S., Gu Z., Lipton S.A. Activation of matrix metalloproteinase-9 via neuronal nitric oxide synthase contributes to NMDA-induced retinal ganglion cell death // Invest. Ophthalmol. Vis Sci. 2005. Vol. 46(12). P. 4747-4753. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.05-0128
35. Association of the single nucleotide polymorphisms in the extracellular matrix metallo-protease-9 gene with PACG in southern China / Y. Cong [et al] // Mol. Vis. 2009. Vol. 15. P. 1412-1417.
36. Role of functional single nucleotide polymorphisms of MMP1, MMP2, and MMP9 in
open angle glaucomas / G. Mossböck [et al] // Mol Vis. 2010. Vol. 16. P. 1764-70.
References
1. Choquet H, Paylakhi S, Kneeland SC, et al. A multiethnic genome-wide association study of primary open-angle glaucoma identifies novel risk loci. Nat Commun. 2018 Jun 11;9(1):2278. DOI: 10.1038/s41467-018-04555
2. Tikunova EV, Churnosov MI. [Genetic studies in primary open-angle glaucoma]. Bulletin of Ophthalmology. 2014;130(5):96-99. Russian.
3. Leruez S, Marill A, Bresson T, et al. A Metabolomics Profiling of Glaucoma Points to Mitochondrial Dysfunction, Senescence, and Pol-yamines Deficiency / Invest Ophthalmol Vis Sci. 2018 Sep 4;59(11):4355-4361. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.18-24938
4. Neroeva VV. [Ophthalmology: Clinical Recommendations] [Internet]. M.: ^OTAP-Megna; 2018 [cited 2019 Dec 12]. Available from:
https://www.rosmedlib.ru/book/ISBN9785970448 113.html. Russian.
5. Krzyzanowska-Berkowska P, Czajor K, Helemejko I, et al. Relationship between the rate of change in lamina cribrosa depth and the rate of retinal nerve fiber layer thinning following glaucoma surgery. PLoS One. 2018 Nov 6;13(11):e0206040. 2018. DOI: https://doi.org/10.1371/journal. pone.0206040
6. Kurysheva NI, Parshunina OA, Ar-jevnishvili TD, et al. [Search for new markers in the early diagnosis of primary open-angle glaucoma]. Rossiyskiy oftal'mologicheskiy zhurnal. 2015;3:23-29. Russian.
7. Markiewicz L, Pytel D, Mucha B, et al. Altered Expression Levels of MMP1, MMP9, MMP12, TIMP1, and IL-1ß as a Risk Factor for the Elevated IOP and Optic Nerve Head Damage in the Primary Open-Angle Glaucoma Patients Biomed Res Int. 2015;2015:812503. DOI: http://dx.doi.org/10.1155/2015/812503
8. Markiewicz L, Majsterek I, Przybylow-ska K, et al. Gene polymorphisms of the MMP1, MMP9, MMP12, IL-1ß and TIMP1 and the risk of primary open-angleglaucoma. Acta Ophthalmol. 2013 Nov;91(7):516-23. DOI: https://doi.org/10.1111/aos.12149
9. Starikova DI, Churnosov MI. [Genetic studies in primary open-angle glaucoma]. Rossiyskiy meditsinskiy zhurnal. Klinicheskaya of-tal'mologiya. 2017;17(1):49-52. Russian.
10. Starikova DI, Churnosov MI. [Modern views on the molecular basis of etiopathogenesis of primary open-angle glaucoma]. Oftal'mokhi-rurgiya. 2017;3:80-83. Russian.
11. Gharahkhani P, Burdon KP, Cooke Bailey JN, et al. Analysis combining correlated glaucoma traits identifies five new risk loci for open-angle glaucoma. Sci Rep. 2018 Feb 15;8(1):3124. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-018-20435-9.
12. Kim EM, Hwang O. Role of matrix met-alloproteinase-3 in neurodegeneration. J Neuro-chem. 2011;116(1):22-32. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1471-4159.2010.07082.x
13. Shiga Y, Akiyama M, Nishiguchi KM, et al. Genome-wide association study identifies seven novel susceptibility loci for primary open-angle glaucoma. Hum Mol Genet. 2018 Apr 15;27(8):1486-1496. DOI: https://doi.org/10.1093/hmg/ddy053
14. Rönkkö S, Rekonen P, Kaarniranta K, et al. Matrix metalloproteinases and their inhibitors in the chamber angle of normal eyes and patients with primary open-angle glaucoma and exfoliation glaucoma. Graefes Arch Clin Exp Ophthalmol. 2007;245(5):697-704. DOI: https://doi.org/10.1007/s00417-006-0440-1
15.Arapiev MU, Lovpache DN, Slepova OS, et al. [Study of regulating factors of the extracellular matrix and biomechanical properties of corneascleral membranes at physiological aging and primary open-angle glaucoma]. Nacional'nyj zhurnal Glaukoma. 2015;14(4):13-20. Russian.
16. Micheal S, Qamar R, Akhtar F, et al. MTHFR gene C677T and A1298C polymorphisms and homocysteine levels in primary open angle and primary closed angle glaucoma. Mol Vis. 2009;15:2268-2278.
17. Määttä M, Tervahartiala T, Vesti E, et al. Levels and activation of matrix metalloproteinases in aqueous humor are elevated in uveitis-related secondary glaucoma. Glaucoma. 2006;15(3):229-237. DOI: 10.1097/01.ijg.0000212229.57922.72
18. Kirilenko MYu, Tikunova EV, Sirotina SS, et al. [The study of the associations of genetic polymorphisms of growth factors with the development of primary open-angle glaucoma]. Vestnik oftal'mologii. 2017;133(3):9-15. Russian.
19. Tikunova E, Ovtcharova V, Reshetnikov E, et al. Genes of tumor necrosis factors and their receptors and the primary open angle glaucoma in the population of central Russia. International
Journal of Ophthalmology. 2017;10(10):1490-1494. DOI: 10.18240/ijo.2017.10.02
20.Tikunova EV, Churnosov MI. [Genetic studies in primary open-angle glaucoma]. Vestnik oftal'mologii. 2014;130(5):96-99. Russian.
21.Starikova DI, Churnosov MI. [Features of the course and clinical manifestations of primary open-angle glaucoma in the population of the central region of the Russian Federation]. Sov-remennyye tekhnologii v oftal'mologii. 2018;(4):221-223. Russian.
22.Golubnitschaja O, Yeghiazaryan K, Liu R, et al. Increased expression of matrix metallo-proteinases in mononuclear blood cells of normaltension glaucoma patientsJGlaucoma. 2004;13(1):66-72. DOI: http://dx.doi.org/10.1097/00061198-200402000-00013
23.Aung T, Yong VH, Lim MC, et al. Lack of association between the rs2664538 polymorphism in the MMP-9 gene and primary angle closure glaucoma in Singaporean subjects. J. Glaucoma. 2008;4:257-258. DOI: http://dx.doi.org/10.1097/IJG.0b013e31815c3aa5
24.Markiewicz L, Majsterek I, Przybylow-ska K, et al. Gene polymorphisms of the MMP1, MMP9, MMP12, IL-1ß and TIMP1 and the risk of primary open-angleglaucoma. Acta Ophthalmol. 2013 Nov;91(7):516-23. DOI: https://doi.org/10.1111/aos.12149
25.Micheal S, Yousaf S, Khan MI, et al. Polymorphisms in matrix metalloproteinases MMP1 and MMP9 are associated with primary open-angle and angle closure glaucoma in a Pakistani population. Mol Vis. 2013;19:441-7.
26.Ponomarenko I, Reshetnikov E, Altu-chova O, et al. Association of genetic polymorphisms with age at menarche in Russian women. GENE. 2019 Feb 20;686:228-236. DOI: https://doi.org/ 10.1016/j.gene.2018.11.042
27.Ponomarenko IV. [Using the method of Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) and its modifications for analysis of gene-gene and gene-environment interactions in genetic-epidemiological studies (review)]. Research Results in Biomedicine. 2019;5(1):4-21. Russian. DOI: 10.18413/2313-8955-2019-5-1-0-1
28.Wang X, Khalil RA. Chapter Eight -Matrix Metalloproteinases, Vascular Remodeling, and Vascular Disease. Advances in Pharmacology. 2018;81:241-330. DOI: https://doi.org/10.1016/bs.apha.2017.08.002
29.Levin M, Udi Y, Solomonov ISI, et al. Next generation matrix metalloproteinase inhibi-
tors - Novel strategies bring new prospects. Bio-chimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 2017;1864(11(A)):1927-39. DOI: https://doi.org/ 10.1016/j.bbamcr.2017.06.009
30.Zhao F, Fan Z, Huang X. Role of matrix metalloproteinase-9 gene polymorphisms in glaucoma: A hospital-based study in Chinese patients. J Clin Lab Anal. 2019 Nov 12;00:e23105. DOI: https://doi.org/10.1002/jcla.23105
31.Zaleska-Zmijewska A, Strzemecka E, Wawrzyniak ZM, et al. ExtracellularMMP-9-Based Assessment of Ocular Surface Inflammation in Patients with PrimaryOpen-Angle Glaucoma. J Ophthalmol. 2019 Apr 3;2019:1240537. DOI: 10.1155/2019/1240537
32. Cutler SJ, Doecke JD, Ghazawi I, et al. Novel STAT binding elements mediate IL-6 regulation of MMP-1 and MMP-3. Sci Rep. 2017; 7:1-12. DOI: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-08581-y
33. Rönkkö S, Rekonen P, Kaarniranta K, et al. Matrix metalloproteinases and their inhibitors in the chamber angle of normal eyes and patients with primary open-angle glaucoma and exfoliation glaucoma. Graefes Arch Clin Exp Ophthalmol. 2007;245(5):697-704. DOI: https://doi.org/10.1007/s00417-006-0440-1
34. Manabe S, Gu Z, Lipton SA. Activation of matrix metalloproteinase-9 via neuronal nitric oxide synthase contributes to NMDA-induced retinal ganglion cell death. Invest. Ophthalmol.
Vis Sci. 2005;46(12):4747-53. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.05-0128
35.Cong Y, Guo X, Liu X, et al. Association of the single nucleotide polymorphisms in the extracellular matrix metalloprotease-9 gene with PACG in southern China. Mol. Vis. 2009;15:1412-1417.
36.Mossböck G, Weger M, Faschinger C, et al. Role of functional single nucleotide polymorphisms of MMP1, MMP2, and MMP9 in open angle glaucomas. Mol Vis. 2010 Aug 28;16:1764-70.
Информация об авторе
Дина Ильсуровна Свинарева, врач-офтальмолог, НП «Офтальмологический Центр «Поколение», E-mail: [email protected], ORCID: 0000-0001-7866-3494.
Information about the author Dina I. Svinareva, Ophthalmologist, Ophthalmo-logical Center «Generation», E-mail: [email protected], ORCID: 0000-0001-78663494.
Статья поступила в редакцию 13 октября 2019 г. Receipt date 2019 October 13.
Статья принята к публикации 12 января 2020 г. Accepted for publication 2020 January 12.
