Научная статья на тему 'Вариации числа копий последовательности ДНК (CNV) в генах, вовлеченных в геномную сеть цикла деления клетки: значение для соматического мозаициз-ма'

Вариации числа копий последовательности ДНК (CNV) в генах, вовлеченных в геномную сеть цикла деления клетки: значение для соматического мозаициз-ма Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
239
37
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Зеленова М.А., Юров И.Ю., Ворсанова С.Г., Коростелев С.А., Юров Ю.Б.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Вариации числа копий последовательности ДНК (CNV) в генах, вовлеченных в геномную сеть цикла деления клетки: значение для соматического мозаициз-ма»

ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ПЕДИАТРИИ И ДЕТСКОЙ ХИРУРГИИ

и «низкопроцентной» анеуплоидией по хромосоме Y. Кариотип ребенка: 45,X,?del(2)(q37.3->qter),9qh+[2]/ 46,XY,?del(2)(q37.3->qter),9qh+[18].

У мальчика наблюдались следующие клинические проявления: задержка интеллектуального развития, долихоцефалическая форма черепа, удлиненное лицо, широкая переносица, полные губы, утолщение кожи вокруг суставов пальцев кистей, снижение болевой чувствительности. Следует отметить, что такие клинические признаки не являются характерными как для субтеломерных делеций хромосомы 2 (2q37), так и для отсутствия хромосомы Y при мужском фенотипе. Для выяснения наличия субтеломерной микроделеции на хромосоме 2, а также для уточнения точек разрыва было рекомендовано проведение молекулярно-цитогенетического исследования с использованием молекулярно-цитогенетических технологий, а именно, серийной сравнительной геномной гибридизации (array CGH), так называемого молекулярного кариотипирования. Этот метод позволяет сканировать весь геном с разрешением от 3 000 000 до 50 000 и менее пар нуклеотидов, в зависимости от применяемых микрочипов. Кроме того, для уточнения доли аномального клона без хромосомы Y, ребенку было рекомендовано исследование с помощью FISH (флюоресцентной гибридизации in situ) с двумя хромосомоспецифичными ДНК зондами на хромосомы Х и Y при повторном культивировании лимфоцитов периферической крови. Следует отметить, что при «низкопроцентном» мозаицизме по анеуплоидии гоносом (10% клеток и менее) возникают особые сложности при культивировании, когда может наблюдаться селективный отбор клеток с хромосомными аномалиями или без них. Отсутствие аномального клона 45, Х при повторном исследовании с помощью FISH, не может служить основанием для полного исключения у мальчика анеуплои-дии по этому клону. Такое явление известно в науке под названием «исчезающий мозаицизм». Оно впервые было описано в 1967 году (La Marche et al., 1967), поэтому в будущем данному ребенку необходимо провести поиск «скрытого» хромосомного мозаициз-ма с помощью FISH на некультивированных клетках различных тканей, в которых процентное соотношение нормальных и аномальных клонов клеток может быть более корректным. Поиск микроаномалий хромосом и уточнение точек разрыва на них, а также выявление «низкопроцентного» мозаицизма позволяет проводить более корректную корреляцию генотип-фенотип, и тем самым способствует выделению новых хромосомных синдромов. Данный случай демонстрирует необходимость применения нескольких современных методов молекулярно-цитогенетиче-ской диагностики в практике клинической генетики, а именно FISH и array CGH. Исследование осуществлено при финансовой поддержке Российского научного фонда (грант № 14-15-00411).

ВАРИАЦИИ ЧИСЛА КОПИЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК (CNV) В ГЕНАХ, ВОВЛЕЧЕННЫХ В ГЕНОМНУЮ СЕТЬ ЦИКЛА ДЕЛЕНИЯ КЛЕТКИ: ЗНАЧЕНИЕ ДЛЯ СОМАТИЧЕСКОГО МОЗАИЦИЗ-МА

Зеленова М.А.1-2-3, Юров И.ЮР-4, Ворсанова С.Г.1-2-3, Коростелев С.А.5, Юров Ю.Б.1,2,3 'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва

Обособленное структурное подразделение «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии им. академика Ю.Е. Вельтищева» ГБОУ ВПО РНИМУ им.Н.И. Пирогова Минздрава России, г. Москва

3ГБОУ ВПО «Московский государственный психолого-педагогический университет», г. Москва 4ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва

5Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России г. Москва

Соматический мозаицизм (или соматические вариации генома) в течение уже продолжительного времени рассматривается как один из факторов разнообразия генома человека, так и в качестве геномной патологии. Несмотря на это, причины и следствия постзиготических вариаций генома остаются преимущественно неизвестными, следствием чего, вероятно, является отсутствие должного внимания к феномену мозаицизма. В настоящее время соматические вариации генома обнаруживаются практически во всех тканях у здоровых индивидуумов и чаще всего проявляются в виде анеуплоидии. Кроме того, было показано, что соматическая анеуплоидия, вероятно, является патогенетическим механизмом при различных заболеваниях у детей. Вероятно, что зиготические геномные вариации скорее всего предрасполагают к ненаследуемым генетическим изменениям (анеуплоидии), приобретенным в течение жизни посредством воздействия различных факторов на регуляцию клеточного цикла, поддержание стабильности генома и связанных с ними геномных сетей. В настоящей работе нами были исследованы CNV (вариации числа копий последовательности ДНК) в генах, вовлеченных в геномную сеть клеточного цикла (cell cycle pathway, согласно Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes/KEGG), в когорте из 225 пациентов с микроаномалиями/пороками развития, умственной отсталостью, аутизмом и/или эпилепсией. Фенотипические особенности пациентов не были ассоциированы с геномными перестройками, затрагивающими исследуемую геномную сеть, однако соответствовали обнаруженным при молекулярном кариотипировании геномным аномалиям. Возраст детей варьировал от одного месяца до 18 лет. Непатогенные вариации генома, за-

РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИК ПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 4, 2016 ROSSIYSKIY VESTNIK PERINATOLOGY IPEDIATRII, 4, 2016

Раздел 6. Наследственные заболевания и врожденные пороки развития

трагивающие 20 генов, вовлеченных в геномную сеть клеточного цикла, были обнаружены у 161 из 225 пациентов (71,6%), у 62 из которых отмечалось более двух С№У, затрагивающих вышеупомянутую геномную сеть. Полученные нами результаты подтверждают гипотезу, о зиготических вариациях генома, предрасполагающих к постзиготическим изменениям (анеуплоидии) путем вовлечения генов, участвующих в геномных сетях цикла деления клетки. Работа поддержана грантом Российского научного фонда (проект №14-15-00411).

МОЛЕКУЛЯРНОЕ КАРИОТИПИРОВАНИЕ

В ГРУППЕ ДЕТЕЙ С МАКРОЦЕФАЛИЕЙ, УМСТВЕННОЙ ОТСТАЛОСТЬЮ И/ИЛИ АУТИЗМОМ И ВРОЖДЕННЫМИ ПОРОКАМИ РАЗВИТИЯ

Зеленова М.А.1-2-3, Юров Ю.Б.123, Васин К.С.123, Куринная О.С.1-2-3, Ворсанова С.Г.1-2-3, Юров И.Ю.124 'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва

2Обособленное структурное подразделение «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии им. академика Ю.Е. Вельтищева» ГБОУ ВПО РНИМУ им.Н.И. Пирогова Минздрава России, г. Москва

3ГБОУ ВПО «Московский государственный психолого-педагогический университет», г. Москва 4ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва

Макроцефалия, или увеличение головного мозга без водянки, как правило, сопровождается нарушением психического развития. Помимо умственной отсталости, хорошо описана связь между макроцефалией и аутизмом. Случаи тяжелой макроцефалии (>3 SD) ассоциированы с мутациями в гене PTEN, однако генетические причины остальных случаев остаются в большей степени неизученными. Целью настоящего исследования являлось выявление геномных вариантов и перестроек у детей с макроцефалией, умственной отсталостью и/или аутизмом и врожденными пороками развития. В группе из 333 детей макроцефалия наблюдалась у семнадцати пациентов (5,1%). Данная когорта была исследована с применением методов стандартного цитогенетического анализа, молекулярного кариотипирования (АГутеШх Су^сап HD) и оригинального биоинформатическо-го анализа. У всех 17 пациентов отмечалась умственная отсталость, у 8 детей было выявлено расстройство аутистического спектра. Среди клинических характеристик также у 6 пациентов отмечалось высокое физическое развитие, у 9 — аномалии ушной раковины, у 4 — гепатомегалия. В результате исследования у 6 детей были обнаружены крупные (>500 тыс.пн) геномные перестройки, среди которых: Yq11.223q11.23, 5q14.3q21.1, 5q35.1q35.3, 5q35.2q35.3, 11p11.2p11.12,

12p13.31p13.1, 12q24.33, 22q13.31q13.33. Пациенты с крупными геномными перестройками были исключены из дальнейшего исследования. Последующий биоинформатический анализ выявил, что у четырех из одиннадцати детей гены, обнаруженные в перестроенных участках, были вовлечены в метаболические геномные сети [KEGG ID: hsa01100 (metabolic pathways)]. Таким образом, в группе детей с макроцефалией, умственной отсталостью и/или аутизмом и врожденными пороками развития крупные хромосомные аномалии обнаруживаются в 35,3% (6 из 17), и у 23,5% (4 из 17) детей обнаруживаются гены, вовлеченные в метаболические геномные сети (проценты взяты условно). Можно сделать вывод о том, что генетическая диагностика методом молекулярного кариотипирования при макроцефалии является оправданной. Исследование выполнено при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект №14-35-00060).

КЛИНИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ АУТОСОМНО-РЕЦЕССИВНОГО МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ЗАБОЛЕВАНИЯ, ОБУСЛОВЛЕННОГО МУТАЦИЯМИ В ГЕНЕ DNA2

Какаулина В.С.1, Печатникова Н.Л.1, Полякова Н.А.1, Крылова Т.Д.2, Иткис Ю.С.2 ТБУЗ «Морозовская ДГКБ ДЗМ», г. Москва 2ФГБНУ «Медико-генетический научный центр» ФАНО, г. Москва

Введение: DNA2 — ген, кодирующий фермент хеликазу, участвующий в процессах репликации и репарации мтДНК. Для некоторых митохондри-альных болезней, связанных с нарушениями межгеномного взаимодействия, описаны клинические варианты, обусловленные мутациями в одном гене, но с разными типами наследования. К настоящему времени в литературе описаны случаи заболевания с мутациями в гене DNA2, клинически проявляющиеся в виде прогрессирующего миопатического синдрома, наружного офтальмопареза с дебютом на 3—4 десятке жизни с аутосомно-доминантным типом наследования. Приводим описание семейного случая, при котором предполагается новый вариант мито-хондриального заболевания, обусловленный компаунд-гетерозиготными мутациями в гене DNA2.

Клинический случай: сибсы — мальчик 13 лет и девочка 7 лет, рожденные от здоровых молодых родителей. Течение беременности и родов — без осложнений. Оба ребенка с рождения наблюдались с грубой задержкой психомоторного развития. В возрасте 1 года обоим был установлен диагноз детского церебрального паралича, атонически — астатическая форма. После 2 лет у детей появились эпилептические приступы, гиперкинезы. У мальчика в 12 лет появилась двусторонняя катаракта. В настоящее время (возраст 13 и 7 лет) у обоих детей наблюдается тя-

РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИК ПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 4, 2016 ROSSIYSKIY VESTNIK PERINATOLOGY IPEDIATRII, 4, 2016

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.