Научная статья на тему 'Термодинамика взаимодействия и структура комплексов молекулы ДНК с производными изохинолина, содержащими индольный заместитель'

Термодинамика взаимодействия и структура комплексов молекулы ДНК с производными изохинолина, содержащими индольный заместитель Текст научной статьи по специальности «Химические науки»

CC BY
277
33
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ / INTERACTION / ДНК / DNA / ПРОИЗВОДНЫЕ ИЗОХИНОЛИНА / ISOQUINOLINE DERIVATIVES / КАЛОРИМЕТРИЯ / CALORIMETRY / СПЕКТРОФОТОМЕТРИЯ / SPECTROPHOTOMETRY / ИНТЕРКАЛЯЦИЯ / INTERCALATION

Аннотация научной статьи по химическим наукам, автор научной работы — Морошкина Евгения Борисовна, Осинникова Дарья Николаевна, Травкина Вероника Игоревна

Изучалось взаимодействие молекулы ДНК с новыми синтетическими аналогами изохинолинового алкалоида папаверина, содержащими в первом положении изохинолинового хромофора индольный заместитель. Исследованные соединения различались положением метильной группы. Показано, что изученные соединения взаимодействуют с молекулой ДНК, образуя обратимые равновесные комплексы. Методами спектрофотометрического и калориметрического титрования получены термодинамические характеристики взаимодействия. Способ связывания соединений с ДНК определялся с помощью методов вискозиметрии и динамического двойного лучепреломления. Показано, что наличие метильной группы значительно уменьшает сродство соединения к ДНК, а её положение влияет на способ связывания соединения с ДНК. Метильная группа на индольном кольце препятствует интеркаляционному связыванию соединения с ДНК. В то же время соединение с метильной группой на изохинолиновом хромофоре является интеркалятором. Можно сделать вывод, что у этого ряда производных изохинолина интеркалирующим элементом является индольный заместитель. Библиогр. 17 назв. Ил. 6. Табл. 2.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по химическим наукам , автор научной работы — Морошкина Евгения Борисовна, Осинникова Дарья Николаевна, Травкина Вероника Игоревна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

THERMODYNAMICS OF INTERACTION AND THE STRUCTURE OF THE DNA MOLECULE COMPLEXES WITH ISOQUINOLINE DERIVATIVES CONTAINING INDOLE SUBSTITUTE

In this work the interaction of the DNA molecule with new synthetic analogs of the isoquinoline alkaloid papaverine, containing in the first position of the isoquinoline chromophore the indole substitute, was studied. The studied compounds differ in the position of the methyl group. It was shown that these compounds interact with the DNA molecule by means of forming reversible equilibrium complexes. Thermodynamic characteristics of the interaction were obtained by the methods of spectrophotometric and calorimetric titration. The way of binding was determined by viscometry and dynamic birefringence. It is shown that the presence of the methyl group significantly reduces the affinity of compound to DNA, and its position affects the binding of compound with DNA. The methyl group on the indole ring prevents intercalation binding of compound with DNA. At the same time, the compound with a methyl group on the isoquinoline chromophore is intercalator. It can be concluded that the indole substitute is the intercalating element in this series of isoquinoline derivatives. Refs 17. Figs 6. Tables 2.

Текст научной работы на тему «Термодинамика взаимодействия и структура комплексов молекулы ДНК с производными изохинолина, содержащими индольный заместитель»

УДК 537.323.2

Вестник СПбГУ. Сер. 4. Т. 2 (60). 2015. Вып. 4

Е. Б. Морошкина, Д. Н. Осинникова, В. И. Травкина

ТЕРМОДИНАМИКА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ И СТРУКТУРА КОМПЛЕКСОВ МОЛЕКУЛЫ ДНК С ПРОИЗВОДНЫМИ ИЗОХИНОЛИНА, СОДЕРЖАЩИМИ ИНДОЛЬНЫЙ ЗАМЕСТИТЕЛЬ

Санкт-Петербургский государственный университет, Российская Федерация, 199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7—9

Изучалось взаимодействие молекулы ДНК с новыми синтетическими аналогами изохи-нолинового алкалоида папаверина, содержащими в первом положении изохинолинового хромофора индольный заместитель. Исследованные соединения различались положением ме-тильной группы. Показано, что изученные соединения взаимодействуют с молекулой ДНК, образуя обратимые равновесные комплексы. Методами спектрофотометрического и калориметрического титрования получены термодинамические характеристики взаимодействия. Способ связывания соединений с ДНК определялся с помощью методов вискозиметрии и динамического двойного лучепреломления. Показано, что наличие метильной группы значительно уменьшает сродство соединения к ДНК, а её положение влияет на способ связывания соединения с ДНК. Метильная группа на индольном кольце препятствует интеркаляцион-ному связыванию соединения с ДНК. В то же время соединение с метильной группой на изохинолиновом хромофоре является интеркалятором. Можно сделать вывод, что у этого ряда производных изохинолина интеркалирующим элементом является индольный заместитель. Библиогр. 17 назв. Ил. 6. Табл. 2.

Ключевые слова: взаимодействие, ДНК, производные изохинолина, калориметрия, спек-трофотометрия, интеркаляция.

E. B. Moroshkina, D. N. Osinnikova, V. I. Travkina

THERMODYNAMICS OF INTERACTION AND THE STRUCTURE OF THE DNA MOLECULE COMPLEXES WITH ISOQUINOLINE DERIVATIVES CONTAINING INDOLE SUBSTITUTE

St. Petersburg State University, 7—9, Universitetskaya nab., St. Petersburg, 199034, Russian Federation

In this work the interaction of the DNA molecule with new synthetic analogs of the isoquinoline alkaloid papaverine, containing in the first position of the isoquinoline chromophore the indole substitute, was studied. The studied compounds differ in the position of the methyl group. It was shown that these compounds interact with the DNA molecule by means of forming reversible equilibrium complexes. Thermodynamic characteristics of the interaction were obtained by the methods of spectrophotometric and calorimetric titration. The way of binding was determined by viscometry and dynamic birefringence. It is shown that the presence of the methyl group significantly reduces the affinity of compound to DNA, and its position affects the binding of compound with DNA. The methyl group on the indole ring prevents intercalation binding of compound with DNA. At the same time, the compound with a methyl group on the isoquinoline chromophore is intercalator. It can be concluded that the indole substitute is the intercalating element in this series of isoquinoline derivatives. Refs 17. Figs 6. Tables 2.

Keywords: interaction, DNA, isoquinoline derivatives, calorimetry, spectrophotometry, intercalation.

Введение. При создании новых лекарственных препаратов основой часто служат известные природные биологически активные соединения: антибиотики, алкалоиды. Большую группу последних составляют изохинолиновые алкалоиды, среди них имеются известные соединения, которые являются аналогами широко используемых препа-

ратов с различной биологической активностью: папаверин, берберин [1, 2]. Индольная группа также входит в состав многих природных биологических соединений ^-триптофан, серотонин) и лекарственных препаратов, созданных на их основе. Таким препаратом является, в частности, обладающий противовирусным и иммуномоделирующим действием арбидол [3].

В состав всех этих соединений входит плоский гетероциклический хромофор. Наличие такого хромофора создает возможность интеркаляционного взаимодействия с молекулой ДНК, при котором плоский хромофор встраивается в двойную спираль ДНК, вызывая её локальные нарушения [4]. Образование интеркаляционного комплекса является составной частью молекулярного механизма биологического действия различных противоопухолевых агентов [5]. Однако наличие плоского гетероциклического хромофора не является достаточным условием для интеркаляционного взаимодействия ли-ганда с ДНК. Как было показано ранее, интеркаляции могут препятствовать громоздкие заместители [6], наличие дополнительных центров связывания [7], а также особенности электронной структуры хромофора [8]. Поэтому для определения способа связывания с ДНК каждого конкретного соединения необходимо проводить исследования структуры комплексов и изменений макромолекулярных параметров ДНК в составе комплекса.

В представляемой работе спектральным, калориметрическим и гидродинамическим методами исследовано взаимодействие молекулы ДНК с новыми синтетическими аналогами изохинолинового алкалоида папаверина, содержащими в 1-м положении ин-дольный заместитель.

Структура образующихся равновесных комплексов определялась с помощью методов вискозиметрии и динамического двойного лучепреломления (ДЛП).

Экспериментальная часть. Использовали ДНК из тимуса телёнка фирмы "Sigma" (США). Молекулярная масса M = 107 Да. Концентрацию ДНК в растворе определяли спектрофотометрически. Коэффициент экстинкции ДНК £259 = 6400 + + 6700 М-1-см-1. Исследуемые соединения были синтезированы как производные папаверина в НИИ гигиены, профпатологии и экологии человека [9] и любезно предоставлены Д. В. Криворотовым. В качестве растворителя использовали водный раствор NaCl с ионной силой ц = 0,001, рН = 6,0 + 6,5. Комплексы готовили прямым смешением растворов ДНК и соединений соответствующих концентраций.

Стехиометрию комплексов, определяемую как количество связанного лиганда, приходящегося на пару азотистых оснований ДНК (г), получали из данных спектрофото-метрического титрования (СФТ). В процессе титрования концентрация лиганда (Слиг.) сохранялась постоянной и составляла 10-5М. Концентрация ДНК в растворе (СДнк) изменялась в диапазоне 0-10-4М (пар нуклеотидов). Константы связывания (K) и количество мест связывания на пару оснований (n) соединения I рассчитывали, используя

I: Ri — H, R2 — CH3; II: Ri — CH3, R2 — H; III: Ri — H, R2 — H

различные модели связывания [10, 11]. Спектры поглощения растворов регистрировали на спектрофотометрах "Specord UV-Vis" и "Shimadzu UV-1800".

Энтальпию взаимодействия и термодинамические параметры связывания определяли также методом изотермического калориметрического титрования (ИКТ) на микрокалориметре TA Instruments Nano ITC 2G ресурсного центра СПбГУ «Термогравиметрические и калориметрические методы исследования». В кювету прибора, содержащую раствор ДНК объёмом 1,4 мл, добавляли раствор лиганда порциями объёмом 6,9 мкл через интервалы 500 с. Максимальный объём инъектанта в растворе ДНК—лиганд достигал 0,25 мл. Термодинамические параметры связывания соединения I с ДНК определяли с использованием модели с идентичными местами связывания [11]. Энтальпия взаимодействия соединений II и III с ДНК определялась безмодельным методом.

Структуру комплекса и способа связывания соединений с ДНК определяли с помощью методов вискозиметрии и ДЛП на основании анализа изменений [п] и оптической анизотропии макромолекулы (ai — a2) при образовании комплекса по методу, описанному ранее [12, 13]. Для расчёта [п] проводили измерение зависимости относительной вязкости растворов, пг, от СДнк в растворе с помощью магнитного ротационного вискозиметра [14]: [п] = lim(nr — 1)/СДНК при g ^ 0 и СДНК ^ 0, где g — градиент скорости.

Для определения изменения величины (ai — a2) при образовании комплекса использовали соотношение Петерлина [15], пропорциональное оптической анизотропии статистического сегмента макромолекулы:

где Дп — величина двойного лучепреломления; по — вязкость растворителя. Дп измеряли в титановом динамооптиметре с помощью экспериментальной оптической установки со слюдяным полутеневым компенсатором [16].

Результаты и их обсуждение.

Термодинамика взаимодействия с молекулой ДНК. Соединение I. В присутствии ДНК в растворе наблюдаются характерные изменения интенсивности и положения максимума длинноволновой полосы поглощения соединения, свидетельствующие об образовании комплекса ДНК—лиганд (рис. 1). Все спектры имеют общую изобестическую точку, что позволяет сделать вывод об одном типе связывания этого соединения с ДНК в условиях эксперимента.

An

-- ~ ai — 0(2,

0,30-, D

0,250,20 J I

0,15 -

0,10-

0,05

Рис. 1. Спектры поглощения соединения I в присутствии возрастающей концентрации ДНК:

0,00

340 360 380 400 420 440 460 480

Я, нм

CI = 4,8• 10~БМ, СДНК = 0^6,0• 10~4М

Результаты ИКТ раствора ДНК растворами соединения I представлены на рис. 2 в виде зависимости удельной теплоты комплексообразования от соотношения концентраций ДНК—лиганд. Монотонное уменьшение выделенной удельной теплоты с ростом соотношения С\/Сднк также свидетельствует об одном типе связывания соединения I с ДНК.

Рис. 2. Калориметрическая изотерма связывания соединения I с ДНК — зависимость удельной теплоты (Дф), выделившейся при каждой инъекции соединения I, от отношения С\/Сднк :

сплошная линия соответствует модели идентичных независимых мест связывания с параметрами АН = —3 ± ±1 ккал/моль, К = (1,0±0,5)-10б М"1, п = 0,14 ±0,05

0,5 0,0 -0,5 1,0 1,5 -2,0

-2,5

0,0

0,2

0,4 С С

0,6

0,8

1,0

Результаты расчёта термодинамических параметров взаимодействия соединения I с молекулой ДНК при использовании модели с идентичными невзаимодействующими местами связывания [11] приведены в табл. 1. Константа связывания и количество мест связывания по данным СФТ заметно превышают соответствующие параметры, вычисленные по данным ИКТ. Можно предположить, что различия в значениях параметров, определённых с помощью СФТ и ИКТ, обусловлены различием в используемых концентрациях взаимодействующих компонентов и в процедуре титрования.

Таблица 1

Термодинамические параметры взаимодействия соединения I с ДНК

Метод АН, ккал/моль К ■ 10~ь, м~х п

СФТ - 3,7 ± 0,3 0,38 ± 0,04

ИКТ — 3 ± 1 1,0 ± 0,5 0,14 ± 0,05

Соединение II. В случае соединения II наблюдается точка пересечения кривых титрования при Сц/Сднк < 0,4, а общая точка пересечения со спектром свободного лиганда отсутствует (рис. 3). Можно предположить, что в данной области соотношения

Рис. 3. Спектры поглощения соединения II в присутствии возрастающей концентрации ДНК:

Оц = 4,3-10"бМ, СДНК = 0^5,4х х 10"4М

340 360 380

400 420 Я, нм

440 460 480

концентраций практически нет свободного лиганда и Сц/Сднк = г- При этом связанный лиганд находится в двух спектрально различимых формах. При Сц/Сднк > 0,4 увеличение содержания лиганда в комплексе сопровождается появлением свободного лиганда в растворе. В этом случае термодинамические параметры связывания не могут быть определены методом СФТ.

Результаты ИКТ соединения II представлены на рис. 4. В отличие от соединения I изменение удельной теплоты при увеличении соотношения Сц/Сднк носит немонотонный характер, свидетельствуя о двух процессах, вызывающих изменение тепловых эффектов.

Слиг./СДНК

Рис. 4. Калориметрическая изотерма связывания соединения II с ДНК:

зависимость удельной теплоты (Дф), выделившейся при каждой инъекции соединения II, от отношения Сц/Сднк

На начальных этапах титрования тепловые эффекты близки к нулю. Максимальное выделение тепла наблюдается при соотношении концентраций реагентов, Сц/Сднк = = 0,4. Уменьшение тепловых эффектов при Сц/Сднк > 0,4 согласуется с данными СФТ о появлении в этих условиях свободного лиганда в системе. Отсутствие свободного лиганда при Сц/Сднк < 0,4 позволяет использовать для интерпретации этого участка термограммы безмодельный подход. Можно предположить, что связывание лиганда происходит двумя способами: первичным, более энергетически сильным, с энтальпией связывания, близкой к нулю, и вторичным, энтальпию которого можно оценить по максимальной величине удельной теплоты, достигаемой в этом интервале соотношения концентраций, ДН2 = —5,6 ± 0,2 ккал/моль. Возрастание энтальпии при увеличении количества связанного лиганда может быть вызвано также появлением взаимодействия между молекулами лиганда, располагающимися на соседних местах связывания.

Соединение III. Кривые СФТ соединения III распадаются на две группы спектров, каждая из которых имеет свою точку пересечения (рис. 5). Как и в случае соединения II, наличие общей точки пересечения у спектров, в число которых не входит спектр свободного лиганда, свидетельствует о том, что в этой области Сщ/Сднк свободный лиганд практически отсутствует, а связанный находится в одной из двух спектрально различимых форм. Спектры этой группы соответствуют условию Сщ/Сднк < < 2. Следовательно, в этом диапазоне концентраций можно считать Сщ/Сднк = r. В отличие от соединения II в области избытка лиганда в системе (Сш/Сднк > 2) существует общая точка пересечения кривых титрования со спектром поглощения свободного лиганда. Это указывает на то, что появление свободного лиганда в системе возникает только при полном насыщении макромолекулы лигандом. При r < 0,1 (кривая 2) спектр поглощения лиганда остаётся постоянным (предельный спектр), харак-

0,40-1 D

Рис. 5. Спектры поглощения соединения III в присутствии возрастающей концентрации ДНК:

Ciii = 4,2 • 10-БМ; Сднк = (0 -- 6,0) • 10~4М; 1 — СДНК = 0; 2 — СДНК = (4,2 - 6,0) • 10-4М

0

340 360 380 400 420 440 460 480

Я, нм

теризуя наиболее сильно связанную форму лиганда. Описанное выше спектральное поведение соединения III при взаимодействии с ДНК свидетельствует о его высоком сродстве к ДНК в данных условиях (K > 107 M-1).

При взаимодействии ДНК с соединением III наблюдаются наибольшие тепловые эффекты. Как и в случае соединения II, вид термограммы, полученной в широкой области изменения соотношения концентраций ДНК—лиганд (рис. 6), свидетельствует

0 двух способах связывания лиганда.

Отсутствие свободного лиганда по данным СФТ позволяет использовать безмодельный подход для расчёта энтальпии взаимодействия обоих типов связывания. Для более точного определения энтальпии первичного связывания соединения III с ДНК было проведено ИКТ в условиях большого избытка концентрации ДНК (Сш/Сднк < 0,1). Исходная СДнк = 2 • 10~4М. Величина теплоты ДQ, выделяющейся при каждой инъекции лиганда, в этих условиях была постоянной, свидетельствуя об одном способе связывания, энтальпия которого ДН = —4,4 ± 0,2 ккал/моль. Тогда, согласно рисунку, энтальпия вторичного связывания ДН2 = —9,6 ± 0,2 ккал/моль.

Первичное связывание c ДНК соединений II и III, как и связывание соединения

1 с ДНК, обладает значительно более низкой энтальпией, чем вторичное связывание соединений II и III. Свободная энергия взаимодействия с ДНК соединения I (ДС), по данным ИКТ, составляет —6,7 ккал/моль. Следовательно, энтропийный вклад в образование комплекса ДНК—I TДБ = +3,7 ккал/моль. Величина энтальпии первичного

0

Рис. 6. Калориметрическая изотерма связывания соединения III с ДНК:

зависимость удельной теплоты (AQ), выделившейся при каждой инъекции соединения III, от отношения Сщ/Сднк

10

0,0 0,5 1,0 1,5 2,0

взаимодействия соединения III близка к значению энтальпии взаимодействия соединения I. В случае соединения II первичное связывание с ДНК носит исключительно энтропийный характер. Можно предположить, что первичное связывание этих соединений с ДНК является мономерным. В случае соединения II и особенно соединения III увеличение содержания лиганда в комплексе приводит к взаимодействию связанных молекул лиганда между собой, кроме того, в случае соединения III и к образованию связанных димеров, вызывая значительное повышение энтальпии вторичного связывания.

Вискозиметрия и динамическое двойное лучепреломление. Для определения способа связывания лиганда с ДНК в области первичного связывания (r < 0,2) использовали методы вискозиметрии и ДЛП. Согласно данным СФТ и ИКТ, в этих условиях практически весь лиганд находится в связанном состоянии. Используемая методика позволяет обнаружить увеличение контурной длины (L) высокомолекулярной ДНК при образовании комплекса, имеющее место при интеркаляционном связывании лиганда [4]. Результаты измерения характеристической вязкости и отношения Петер-лина представлены в табл. 2.

Таблица 2

Гидродинамические параметры ДНК и её комплексов с производными изохинолина

Комплекс г [т)], м3/кг Дп/(<7(т1-Ло))-107, м-с2/кг Ьг/Ьдак

ДНК 0 15 ± 1 26 ± 1 -

ДНК—I 0,1 18 ± 1 25 ± 1 1,13 ±0,02

ДНК-II 0,2 15,0 ± 1,5 25 ± 1 1,00 ±0,05

днк-ш 0,2 21,0 ± 1,5 27 ±1 1,25 ± 0,05

Здесь и далее индекс r обозначает принадлежность характеристики комплексу, стехиометрия которого равна r.

Увеличение характеристической вязкости наблюдается при образовании комплекса ДНК с соединениями I и III. В случае высокомолекулярной ДНК подобные изменения могут быть вызваны как увеличением контурной длины, так и увеличением термодинамической жёсткости макромолекулы, определяемой по длине статистического сегмента

(A) [17].

Величина соотношения Петерлина, пропорциональная термодинамической жёсткости макромолекулы, остаётся в пределах погрешности постоянной. Следовательно, увеличение характеристической вязкости ДНК при комплексообразовании с соединениями I и III происходит в результате изменения её контурной длины. При интеркаляционном связывании контурная длина молекулы ДНК (L) возрастает пропорционально количеству связанного лиганда:

Lr = Ьднк(1 + r). Используя формулу Флори для клубкообразных макромолекул [17]

r 1 (LA)3/2 з

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

где М — молекулярная масса; Ф — коэффициент Флори; у — коэффициент линейного набухания при неизменной термодинамической жёсткости получаем

Расчёт показывает, что это изменение соответствует интеркаляции молекул связанного лиганда в двойную спираль ДНК. Соединение II связывается снаружи двойной спирали ДНК, не изменяя её макромолекулярные параметры.

Зависимость способа связывания соединений от их структуры. Так как все

соединения в условиях эксперимента имеют положительный заряд на изохинолиновом хромофоре, большую роль в их взаимодействии с ДНК играют электростатические взаимодействия. Структуры всех трёх исследованных соединений различаются только положением метильной группы. В случае соединения I она располагается на изохино-линовом кольце молекулы. В случае соединения II эта группа находится на индольной части молекулы. Соединение III метильной группы не имеет. Можно предположить, что именно положение этой группы оказывает значительное влияние на спектральные, гидродинамические и термодинамические свойства комплексов индольных производных изохинолина с ДНК, а соответственно и на способ их связывания с макромолекулой.

Наибольшее сродство к ДНК имеет производное без метильной группы (соединение III). В области 0,2 < r < 2 это соединение связывается с ДНК двумя способами. При r < 0,2 имеет место интеркаляционное связывание. При увеличении содержания лиганда в комплексе возникает вторичное связывание с образованием димеров на поверхности двойной спирали.

Наличие метильной группы на индольном кольце (соединение II) заметно уменьшает сродство лиганда к ДНК и препятствует его интеркаляции в двойную спираль ДНК. Взаимодействие этого соединения с ДНК носит коооперативный характер. К сожалению, проведённые исследования не позволяют установить точную локализацию связанного лиганда на поверхности двойной спирали ДНК.

Наибольшее влияние на сродство индольного производного изохинолина к ДНК оказывает метильная группа при её расположении на изохинолиновом хромофоре. В этом случае заметно уменьшается способность соединения образовывать димеры на поверхности ДНК. В то же время при большом избытке мест связывания это соединение взаимодействует с ДНК интеркаляционным способом. Сопоставляя полученные результаты для всех исследованных соединений, можно сделать вывод, что интеркаляция индоль-ных производных изохинолина осуществляется в основном за счёт индольного кольца. В то же время образование димеров и даже агрегатов на поверхности ДНК со значительным увеличением сродства к макромолекуле происходит за счёт изохинолинового хромофора. Можно предположить также, что положение метильной группы влияет на конформацию молекулы лиганда.

Литература

1. Schmeller T., Latz-Bruning B., WinkM. Biochemical activities of berberine, palmatine and sanguinar-ine mediating chemical defence against microorganisms and herbovires // Phytochemistry. 1997. Vol. 44. P. 257-266.

2. GrycovaL., Dostal J., MarekR. Quaternary protoberberine alkaloids // Phytochemistry. 2007. Vol. 68. P. 150-175.

3. BlaisingJ., PolyakS. J., PecheurE.-I. Arbidol as a broad-spectrum antiviral: An update // Antivir. Res. 2014. Vol. 107. P. 84-94.

4. LermanL.S. Structural considerations in interaction of DNA and acridines //J. Mol. Biol. 1961. Vol. 3. P. 18-30.

5. Ferguson L. R., Denny W. A. Genotoxicity of non-covalent interactions: DNA intercalators // Mutation Res. 2007. Vol. 623. P. 14-23.

6. Морошкина Е. Б., Кривцова М. А., Глибин Е. Н. Влияние природы заместителей амидов актино-цина на способ их связывания с ДНК // Биофизика. 2002. Т. 47. С. 444-448.

7. Кривцова М. А., Морошкина Е. Б., Глибин Е. Н., ФрисманЭ. В. Взаимодействие ДНК с низкомолекулярными лигандами различной структуры. III. Комплексы ДНК с дистакцинами // Мол. биология. 1984. Т. 18, вып. 4. С. 950-956.

8. МорошкинаЕ. Б., Кривцова М. А. Структура комплексов ДНК с соединениями фенотиазонового ряда // Мол. биология. 1991. Т. 25, вып. 5. С. 1285-1292.

9. Криворотов Д. В., Морошкина Е. Б., Леонтьева Т. В. Папаверин в синтезе новых лигандов ДНК // Материалы VI Московского международного конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития». М.: ЗАО «Экспо-биохим-технологии», РХТУ им. Менделеева, 2011. Ч. 1. С. 70-71.

10. Mc Ghee J. D., von Hippel P. N. Theoretical aspects of DNA-protein interactions: Co-operative and non-co-operative binding of large ligands to a one-dimensional homogeneous lattice // J. Mol. Biol. 1974. Vol. 86. P. 469-489.

11. Breslauer K. J., FreireE., Straume M. Calorimetry: a tool for DNA and ligand-DNA studies // Methods Enzymol. 1992. Vol. 211. P. 533-567.

12. Морошкина Е. Б., Шишов А. К., Кривцова М. А. и др. Исследование влияния акридиновых красителей на молекулярную структуру ДНК // Мол. биология. 1975. Т. 9, вып. 6. С. 836-844.

13. Веселков А. Н., Морошкина Е. Б., Соболева О. И., ФрисманЭ. В. Сравнительное исследование взаимодействия ДНК с дауномицином и профлавином в растворе // Мол. биология. 1984. Т. 18, вып. 2. С. 481-487.

14. Frisman E. V., Schagina L. V., Vorobiev V. I. A glass rotation viscometer // Biorheology. 1965. Vol. 2. P. 189-194.

15. Peterlin A. Viscosity and streaming birefringence in nonlinear concentration range of macromolecular solutions // J. Polym. Sci. 1954. Vol. 12. P. 45-51.

16. ФрисманЭ. В., ЦветковВ. Н. Динамическое двойное лучепреломление и геометрические размеры макромолекул в растворе // Журн. эксп. теор. физики. 1952. Т. 23. С. 690-702.

17. FloryP. Principles of the polymer chemistry. N.-Y.: Cornell Univ. Press, 1953.

References

1. Schmeller T., Latz-Bruning B., Wink M. Biochemical activities of berberine, palmatine and san-guinarine mediating chemical defence against microorganisms and herbovires. Phytochemistry, 1997, vol. 44, pp. 257-266.

2. Grycova L., Dostal J., Marek R. Quaternary protoberberine alkaloids. Phytochemistry, 2007, vol. 68, pp. 150-175.

3. Blaising J., Polyak S. J., Pecheur E.-I. Arbidol as a broad-spectrum antiviral: An update. Antivir. Res., 2014, vol. 107, pp. 84-94.

4. Lerman L. S. Structural considerations in interaction of DNA and acridines. J. Mol. Biol., 1961, vol. 3, pp. 18-30.

5. Ferguson L. R., Denny W. A. Genotoxicity of non-covalent interactions: DNA intercalators. Mutation Res, 2007, vol. 623, pp. 14-23.

6. Moroshkina E. B., Krivtsova M.A., Glibin E.N. Vliianie prirody zamestitelei amidov aktinotsina na sposob ikh sviazyvaniia s DNK [Influence of the nature of deputies of amides of an aktinotsin on a way of their linkng with DNA]. Biofiziha [Biophysics], 2002, vol. 47, pp. 444-448. (In Russian)

7. Krivtsova M. A., Moroshkina E. B., Glibin E. N., Frisman E. V. Vzaimodeistvie DNK s nizkomoleku-liarnymi ligandami razlichnoi struktury. III. Kompleksy DNK s distaktsinami [Interaction of DNA with low-molecular ligands of various structure. III. The DNA complexes with distaktsina]. Mol. biologiia [Molecular biology], 1984, vol. 18, iss. 4, pp. 950-956. (In Russian)

8. Moroshkina E. B., Krivtsova M. A. Struktura kompleksov DNK s soedineniiami fenotiazonovogo riada [Structure of the DNA complexes with connections of a fenotiazonovy row]. Mol. biologiia [Molecular biology], 1991, vol. 25, iss. 5, pp. 1285-1292. (In Russian)

9. Krivorotov D.V., Moroshkina E. B., Leont'eva T.V. Papaverine in synthesis of new DNA ligands. Proc. of the VI Moscow International Congress "Biotechnology: State of the Art and Prospect of Develop-

ment". Moscow, JSC "Expo-biochem-technologies", D.I. Mendeleev University of Chemistry and Technology of Russia, 2011, Part 1, pp. 70-71.

10. Mc Ghee J. D., von Hippel P. N. Theoretical aspects of DNA-protein interactions: Co-operative and non-co-operative binding of large ligands to a one-dimensional homogeneous lattice. J. Mol. Biol., 1974, vol. 86, pp. 469-489.

11. Breslauer K. J., Freire E., Straume M. Calorimetry: a tool for DNA and ligand-DNA studies. Methods Enzymol. 1992, vol. 211, pp. 533-567.

12. Moroshkina E. B., Shishov A. K., Krivtsova M. A. et al. Issledovanie vliianiia akridinovykh krasitelei na molekuliarnuiu strukturu DNK [Influence research the akridinovykh of dyes on molecular structure of DNA]. Mol. biologiia [Molecular biology], 1975, vol. 9, iss. 6, pp. 836-844. (In Russian)

13. Veselkov A. N., Moroshkina E. B., Soboleva O. I., Frisman E. V. Sravnitel'noe issledovanie vzaimod-eistviia DNK s daunomitsinom i proflavinom v rastvore [Comparative research of interaction of DNA with daunomitsiny and proflaviny in solution]. Mol. biologiia [Molecular biology], 1984, vol. 18, iss. 2, pp. 481-487. (In Russian)

14. Frisman E. V., Schagina L. V., Vorobiev V.I. A glass rotation viscometer. Biorheology, 1965, vol. 2, pp. 189-194.

15. Peterlin A. Viscosity and streaming birefringence in nonlinear concentration range of macromolecular solutions. J. Polym. Sci., 1954, vol. 12, pp. 45-51.

16. Frisman E. V., Tsvetkov V. N. Dinamicheskoe dvoinoe lucheprelomlenie I geometricheskie rasmeri makromolecul v rastvore [Streaming birefringence and geometrical dimensions of macromolecule in solution]. Zhurn. eksp. teor. fiziki. [Journal of Experimental and Theoretical Physics], 1952, vol. 23, pp. 690-702. (In Russian)

17. Flory P. Principles of the polymer chemistry. N.-Y., Cornell Univ. Press, 1953.

Статья поступила в редакцию 26 сентября 2015 г.

Контактная информация

Морошкина Евгения Борисовна — кандидат физико-математических наук, доцент; e-mail: [email protected]

Осинникова Дарья Николаевна — аспирантка; e-mail: [email protected]

Травкина Вероника Игоревна — студентка; e-mail: [email protected]

Moroshkina Evgenia — Ph.D., Associate Professor; e-mail: [email protected]

Osinnikova Daria — post-graduate student; e-mail: [email protected]

Travkina Veronika — student; e-mail: [email protected]

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.