CC BY
42
238
Вопросы онкогематологии
Ж. К. Буркитбаев*, С. Д. Раисов*, А. А. Турганбекова*,
И. Р. Рамильева*, Д. У. Якияева*, Д. К. Баймукашева*, Е. Б. Жибурт**
Сравнение Н1_А-аллелей в Республике Казахстан и в мировом генофонде
* Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения Министрества здравоохранения и социального развития Республики Казахстан «Научно-производственный центр трансфузиологии»,
г. Астана, Казахстан
** Национальный медико-хирургический центр имени Н. И. Пирогова"
Минздрава России, г. Москва
Введение
Исследование гистосовместимости по HLA-антигенам (HLA-т ипирование) на сегодняшний день не утратило своей значимости при трансплантации органов и тканей, поскольку успешность трансплантации коррелирует с числом совпадений HLA-антигенов у донора и реципиента.
HLA-система - самая полиморфная в геноме человека, по состоянию на октябрь 2014 г. известно о 9232 аллелях HLA класса I и 3010 HLA аллелях класса II [http://hla.alleles.org/ nomenclature/stats.html].
Число выявляемых специфичностей, и особенно аллелей, продолжает расти. Все это необозримое число аллелей присутствует у народонаселения Земли в разных вариантах и сочетаниях. Вместе с тем, у конкретного индивида может быть два аллеля каждого из HLA-локусов или один в случае гомозиготности (по одному на каждый из парных хромосом), т.е. набор из 8-12 (чаще 8-10) HLA-аллелей (в зависимости от числа выявляемых или рассматриваемых локусов) [Зарецкая Ю.М. и соавт., 2008; Sveigaard A., et al., 1974].
Цель работы - сравнить HLA-аллели генофонда Казахстана и мирового генофонда.
Сравнение HLA-аллелей в Республике Казахстан и в мировом генофонде 239
Материалы и методы
Мы изучили данные о 756 потенциальных донорах гемопоэтических стволовых клеток (ГСК) Казахстана, 1512 антигенов по пяти локусам A, B, C, DR, DQ, типирование проводили молекулярно-генетическим методом Sequence Based Typing на высоком уровне разрешения.
Для сравнения с HLA-аллелями в мировом генофонде воспользовались базой данных интернет-ресурса Allele frequencies in Worldwide populations.
Данный сайт разработан Royal Liverpool University Hospital и предназначен для изучения HLA-локусов научным сообществом разных стран. В базе данных содержится информация о 8 HLA-локусах (A, B, C, DRB1, DPA1, DPB1, DQA1, DQB1), собранных в различных программах по изучению HLA-генофонда (антропологические исследования, донорство крови и костного мозга, заболевания, ассоциированные с HLA и т.д.).
В качестве методов статистической обработки для определения «идентичности» встречаемости аллелей всех пяти локусов в Казахстане и в базе данных использованы х2, а также корреляционный анализ.
Результаты и обсуждение
Локус А. Наиболее встречаемыми аллельными вариантами в Казахстане являются А*02:01 (22,09%), 24:02 (14,74%), 01:01 (11,44%), 03:01 (9,79%), 11:01 (6,68%). В мире данные аллели также одни из самых часто встречаемых (х2 = 294,4; p > 0,001).
Локус В - самое большое разнообразие аллелей (77), наиболее встречаемые в Республике Казахстан - HLA^*13:02 (7,94%), 51:01 (7,94%), 07:02 (6,61%), 08:01 (4,96%), 15:01 (4,23%). В мире наиболее распространенными аллелями локуса В являются иные аллели (х2 = 636,22; p > 0,001).
Локус С представлен 34 аллелями, наиболее встречаемые в Республике Казахстан - С*06:02 (15,61%), 07:02 (9,99%), 04:01 (9,06%). В мире наиболее распостраненными аллелями Локуса С послужили иные вариации (х2 = 396,39; p > 0,001).
В локусе DRB1 51 аллель, наиболее встречаемыми в республике Казахстан -- DRB1*07:01 (14,09%), 03:01 (9,85%), 15:01 (8,6%). В мире наиболее распостраненными аллелями локуса DRB1 являются 07:01 (7,31%), 11:01 (7,3%), 15:01 (6,67%) (х2 = 551,09; p > 0,001).
Локус DQB1 один из самых малочисленных по числу аллелей. Из его 27 аллелей наиболее встречаемыми в республике Казахстан являются DQB1*03:01 (23,41%), 02:01 (12,9%), 05:01 (9,52%). В мире наиболее распостраненными аллелями локуса
240
Вопросы онкогематологии
DQB1 являются 03:01 (22,56%), 02:01 (11,43%), 03:02 (11,14%) (Х2 = 1380,91; p > 0,001).
Выводы
Для успешного нахождения совместимых доноров ГСК для пациентов с часто встречающими генами в нашей республике необходимо дальше развивать деятельность регистра доноров ГСК и увеличивать количество потенциальных доноров ГСК.
Для подбора совместимых доноров для пациентов с редкими HLA-генами необходимо сотрудничать с зарубежными регистрами, у которых частота встречаемости данных редких генов выше, чем в нашей стране.
Результаты HLA-исследования играют важную роль в популяционной генетике, позволяют установить ареалы распространения различных HLA-антигенов среди казахской популяции и способствуют развитию трансплантации ГСК в нашей стране.
