CC BY
1
Кардиоваскулярная терапия и профилактика.2023;22(11):3805.
doi:10.15829/1728-8800-2023-3805
ISSN 1728-8800 (Print)
ISSN 2619-0125 (Online)
№
23b. M
SfcivP
< нминr
РОПНИЗ
РОССИЙСКОЕ
КАРДИОЛОГИЧЕСКОЕ
ОБЩЕСТВО
Создание в Ханты-Мансийском автономном округе — Югре коллекции биологических образцов пациентов, перенесших инфаркт миокарда
Морозкина А. В.1, Воробьев А. С. и, Донников М. Ю.1, Коваленко Л. В.1, Сафронова М. Л.1, Гапурова А. Х.1, Николаев К. Ю.1'3
:БУ ВО ХМАО-Югры "Сургутский государственный университет". Сургут; 2БУ ХМАО-Югры "Окружной кардиологический диспансер "Центр диагностики и сердечно-сосудистой хирургии". Сургут; 3НИИ терапии и профилактической медицины — филиал ФГБНУ ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН. Новосибирск, Россия
Цель. Создание коллекции образцов цельной крови, лейкоцитарной взвеси, геномной дезоксирибонуклеиновой кислоты у пациентов с инфарктом миокарда для фундаментальных и прикладных исследований в области медицины.
Материалы и методы. Сбор, транспортировка и обработка образцов биоматериала в биобанке медицинского института Сургутского государственного университета проведены по стандартным методикам с использованием рекомендаций, стандартных операционных процедур и национального руководства по биобанкированию. Результаты. По состоянию на 1 сентября 2023г в коллекции собрано 744 аликвоты цельной крови и лейкоцитарной взвеси и выделено 108 образцов геномной дезоксирибонуклеиновой кислоты от 108 доноров, перенесших инфаркт миокарда. Аликвоты образцов из коллекции биобанка активно используются для ряда молекулярно-генетических исследований (генотипирование, массовое параллельное секвенирование).
Заключение. Собранная коллекция биологических образцов пациентов в биобанке на базе Сургутского государственного университета обеспечивает текущие и будущие научно-исследовательские проекты в кардиологии качественным биоматериалом. Ключевые слова: биобанк, биологические образцы, инфаркт миокарда.
Отношения и деятельность. Исследование выполнено при финансовой поддержке Фонда научно-технологического развития Югры в рамках научного проекта № 2022-05-04.
Поступила 23/10-2023 Рецензия получена 27/10-2023 Принята к публикации 31/10-2023
Для цитирования: Морозкина А. В., Воробьев А. С., Донников М. Ю., Коваленко Л. В., Сафронова М. Л., Гапурова А. Х., Николаев К. Ю. Создание в Ханты-Мансийском автономном округе — Югре коллекции биологических образцов пациентов, перенесших инфаркт миокарда. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2023;22(11):3805. doi:10.15829/1728-8800-2023-3805. EDN OVZEOG
Creation of a biosample collection from patients after myocardial infarction in the Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra
Morozkina A. V.1, Vorobyov A. S.1,2, Donnikov M. Yu.1, Kovalenko L.V.1, Safronova M. L1, Gapurova A. Kh.1, Nikolaev K. Yu.1,3
1Surgut State University. Surgut; 2District Cardiac Dispensary "Center for Diagnostic and Cardiovascular Surgery". Surgut; 3Research Institute
of Internal and Preventive Medicine — branch of the Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics. Novosibirsk, Russia
Aim. Creation of a sample collection of whole blood, leukocyte suspension, genomic deoxyribonucleic acid from patients with myocardial infarction for fundamental and applied research in medicine. Materials and methods. The collection, transportation and processing of biomaterial samples in the biobank of the Medical Institute of Surgut State University were carried out according to standard methods
using recommendations, standard operating procedures and national guidelines for biobanking.
Results. As of September 1, 2023, the collection has collected 744 aliquots of whole blood and leukocyte suspension and isolated 108 samples of genomic deoxyribonucleic acid from 108 donors after myocardial infarction. Aliquots of samples from the biobank
*Автор, ответственный за переписку (Corresponding author): e-mail: morozkina_av@surgu.ru
[Морозкина А. В.* — к.б.н., в.н.с. научно-образовательного центра медицинского института, ORCID: 0009-0000-0547-4959, Воробьев А. С. — к.м.н., в.н.с. научно-образовательного центра, доцент кафедры кардиологии медицинского института, врач-кардиолог отдела госпитализации с телемедицинским центром, зам. зав. кафедрой кардиологии, OCRID: 0000-0001-7014-2096, Донников М. Ю. — к.м.н., врач-лабораторный генетик, в.н.с. научно-образовательного центра медицинского института, ORCID: 0000-0003-0120-4163, Коваленко Л. В. — д.м.н., директор медицинского института, зав. кафедрой патофизиологии и общей патологии, ORCID: 0000-0002-0918-7129, Сафронова М. Л. — магистрант института естественных и технических наук, эксперт центра коллективного пользования, ORCID: 0009-0006-0020-8620, Гапурова А. Х. — магистрант института естественных и технических наук, лаборант центра коллективного пользования, ORCID: 0009-0008-9123-4000, Николаев К. Ю. — д.м.н., профессор кафедры кардиологии, зав. лабораторией неотложной терапии, ORCID: 0000-0003-4601-6203].
collection are actively used for a number of molecular genetic studies (genotyping, massively parallel sequencing).
Conclusion. This biosample collection on the basis of Surgut State University provides current and future research projects in cardiology with high-quality biomaterial.
Keywords: biobank, biological samples, myocardial infarction.
Relationships and Activities. The study was financially supported by the Ugra Scientific and Technological Development Foundation within the research project № 2022-05-04.
Morozkina A. V.* ORCID: 0009-0000-0547-4959, Vorobyov A. S. OCRID: 0000-0001-7014-2096, Donnikov M.Yu. ORCID: 0000-0003-01204163, Kovalenko L.V. ORCID: 0000-0002-0918-7129, Safronova M. L.
ORCID: 0009-0006-0020-8620, Gapurova A. Kh. ORCID: 0009-00089123-4000, Nikolaev K.Yu. ORCID: 0000-0003-4601-6203.
'Corresponding author: morozkina_av@surgu.ru
Received: 23/10-2023 Revision Received: 27/10-2023 Accepted: 31/10-2023
For citation: Morozkina A. V., Vorobyov A. S., Donnikov M.Yu., Kovalenko L.V., Safronova M. L., Gapurova A. Kh., Nikolaev K.Yu. Creation of a biosample collection from patients after myocardial infarction in the Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2023;22(11):3805. doi:10.15829/1728-8800-2023-3805. EDN OVZEOG
БУ ХМАО-Югры "ЦД и ССХ" — Бюджетное учреждение Ханты-Мансийский автономного округа — Югры Окружной кардиологический диспансер "Центр диагностики и сердечно-сосудистой хирургии", гДНК — геномная дезоксирибонуклеиновая кислота, ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота, ИМ — инфаркт миокарда, МИ — медицинский институт, п.о. — пар оснований, ССЗ — сердечно-сосудистые заболевания, СурГУ — Сургутский государственный университет, ХМАО-Югра — Ханты-Мансийский автономный округ — Югра.
Ключевые моменты Что известно о предмете исследования?
Благодаря стандартизации работы, биобанки обеспечивают высокое качество сохраняемых образцов биоматериала для разнообразных видов биомедицинских исследований. Коллекция образцов биоматериала пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями с подробной сопровождающей информацией позволяет выполнять как ретроспективный анализ, так и прогнозирование исходов социально-значимых заболеваний.
Что добавляют результаты исследования? Собрана и описана уникальная для региона ХМАО-Югра коллекция образцов биологического материала пациентов, перенесших инфаркт миокарда.
Качество образцов и сопроводительной информации позволяют эффективно использовать биоматериал в молекулярно-генетических исследованиях, в т.ч в формате сотрудничества между разными научными коллективами.
Key messages What is already known about the subject?
Thanks to the standardization of work, biobanks provide high quality preserved samples of biomaterial for a variety of types of biomedical research.
A collection of biomaterial samples from cardiovascular patients with detailed information allows for both retrospective analysis and prediction of the outcomes of socially significant diseases.
What might this study add? A unique collection of biological samples from patients after myocardial infarction, unique for the Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra, was collected and described.
The quality of samples and accompanying information allows the effective use of biomaterial in molecular genetic research, including in cooperation between different research teams.
Введение
Реализация важной задачи ранней диагностики сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ) невозможна без развития института биобанкирования. Современные клинические исследования обеспечивают поток клинических, инструментальных и лабораторных данных, которые хранятся в особых регистрах, специализированных для исследуемой патологии. По мере развития и внедрения персонализированной медицины представляется актуальным ведение регистров пациентов одновременно с накоплением образцов крови и ее компонентов в биобанках для изучения новых биохимических и генетических маркеров ССЗ [1, 2]. С одной
стороны, для надлежащей лабораторной практики необходимым условием является не только достаточное количество биообразцов, сбор которых может занять длительное время, но и высокое качество содержащихся в образцах нуклеиновых кислот и ряда других биохимических молекул, которые являются перспективными для исследований [3, 4]. С другой стороны, относительная дороговизна экспресс-диагностики "у койки пациента" (point-of-care) обусловливает необходимость фармакоге-нетического тестирования в асинхронном режиме, а бурное развитие новых тест-систем позволяет изучать новые молекулы по мере их извлечения из хранимого биоматериала при возникающей по-
Таблица 1
Клинико-анамнестическая характеристика пациентов с ИМ (n=108)
Характеристики Количество больных n %
Пол:
— мужской (57,2±4,6 лет) 86 79,6
— женский (61,7±5,9 лет) 22 20,4
Тип ИМ:
— с подъемом сегмента ST 67 62,0
— без подъема сегмента ST 41 38,0
Локализация ИМ:
— передняя 63 58,3
— задняя 45 41,7
ИМ, развившийся:
— впервые 92 85,2
— повторно 16 14,8
Классы КШр:
— I 56 51,9
— II 38 35,2
— III 9 8,3
— IV 5 4,6
Артериальная гипертензия 91 8 3
Сахарный диабет 2 типа 20 18,5
Примечание: п — количество пациентов, ST — отрезок кривой электрокардиограммы, ИМ — инфаркт миокарда.
требности, что особенно актуально для пациентов с инфарктом миокарда (ИМ) [5].
Материал и методы
Диагностика ИМ основывалась на стандартных критериях (жалобы, биомаркеры, характерные изменения на электрокардиограмме), в соответствии с отечественными и международными клиническими рекомендациями [6, 7].
Образцы биоматериала были последовательно собраны на этапе стационарного лечения в Бюджетном учреждении Ханты-Мансийский автономного округа — Югры Окружном кардиологическом диспансере "Центр диагностики и сердечно-сосудистой хирургии" (БУ ХМАО-Югры "ЦД и ССХ") в г. Сургуте у пациентов с ИМ. Сбор венозной крови проводили натощак в утренние часы в пробирки с этилендиаминтетрауксусной кислотой и транспортировали в течение 2 ч в термоконтейнере с хладоэлементами (+4о С) в биобанк Медицинского института (МИ) Сургутского государственного университета (СурГУ) с использованием стандартных операционных процедур, разработанных в генетической лаборатории МИ СурГУ и валидированных на основе рекомендаций Национального руководства по биобанкированию [5]. Период сбора образцов занял 6 мес.
При включении в исследуемую группу всеми пациентами было подписано информированное добровольное согласие на сбор и хранение образцов крови и ее компонентов в биобанке, одобренное локальным этическим комитетом СурГ У. Пациентам проведено полное разъяснение использования образцов биоматериала исключительно в научных целях. В исследование не включали пациентов, не подписавших информированное добровольное согласие, имеющих тяжелую сопутствующую
соматическую патологию (терминальная хроническая болезнь почек, онкологическое заболевание с метастазиро-ванием, вирус иммунодефицита человека), ограничивающую вероятность выживания пациента по поводу ИМ.
В день доставки образцов в биобанк осуществлялось аликвотирование цельной крови с этилендиаминтетрауксусной кислотой в криопробирки объемом 1 мл в штативе на 96 лунок (LVL Technologies GmbH, Германия) и размещение на длительное хранение в морозильной камере (Haier DW-86L48) с постоянной температурой -80о С. Выделение геномной дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) (гДНК) осуществляли с помощью набора Blood DNA Mini Kit (Foregene, КНР). Микроаликвоту выделенного образца гДНК использовали для оценки качества и подготовки библиотек для проведения таргетного секве-нирования; оставшийся объем размещали на длительное хранение при низкой температуре (см. выше). Измерение концентрации образцов проводили с использованием набора реагентов Qubit dsDNA HS Assay Kit и Lumiprobe QuDye dsDNA HS Assay Kit на флуориметре Qubit 3.0 (Thermo Fisher Scientific, США). Оценка качества гДНК и библиотек ДНК проведена согласно стандартным методам [5]. Оценка целостности и размеров образцов гДНК и библиотек ДНК проведена путем капиллярного гель-электрофореза на анализаторе Qsep100 (BiOptic, Тайвань). Чистота ДНК оценивалась по соотношению A260/A280 и A260/A230 на спектрофотометре BioMate160 (Thermo Fisher Scientific, США). Соотношение A260/A280 >1,8 и соотношение A260/A230 >2,0 соответствовало образцу гДНК высокого качества. Значение <1,8 могло указывать на загрязнение образца полипептидами, >2 — на возможную деградацию и наличие свободных нуклеотидов. Сравнение концентраций выполнили с применением одно факторного дисперсионного анализа (F).
Результаты
По состоянию на сентябрь 2023г общая емкость коллекции составляет 842 аликвоты, из них 744 — цельной крови, 108 — гДНК, полученных от 108 уникальных доноров, перенесших ИМ. Налажен стабильный поток образцов от клинической базы СурГУ БУ ХМАО-Югры "ЦД и ССХ". Сбор биоматериала продолжается, но уже сейчас очевидно, что коллекция является уникальной для ХМАО-Югры. Собранные образцы и ассоциированные с ними данные позволили начать проведение ряда прикладных научных проектов. Например, с использованием собранных образцов реализовано фармакогене-тическое исследование по определению генотипов CYP2C19 и VEGFR методом полимеразной цепной реакции в реальном времени, а также таргетное сек-венирование с кастомизированной таргетной панелью для поиска генетических маркеров сердечнососудистой патологии (Roche, США) [8].
Клинико-анамнестическая характеристика пациентов с ИМ, образцы которых были использованы для создания настоящей коллекции, представлена в таблице 1.
Преимущественное большинство в сформированной когорте составили пациенты мужского по-
Оценка качества гДНК Таблица 2
Срок хранения, мес. n Концентрация ДНК, нг/мкл Соотношение А260/А280 Соотношение А260/А230 Индекс качества ДНК (DQN)
M±m M+m M+m M+m
<1 50 45,14+1,01 1,86+0,01 1,81+0,01 9,5+0,5
1-2 50 44,60+1,36 1,85+0,02 1,83+0,02 9,4+0,5
2-6 50 43,20+1,44 1,87+0,04 1,80+0,06 9,3+0,6
>6 20 43,08+1,48 1,88+0,03 1,81+0,09 9,2+0,7
Примечание: п — количество исследуемых образцов, М — среднее значение, т — стандартная ошибка; А 260/280 — отношение поглощения на длинах волн 260 и 280 нм, А260/А230 — отношение поглощения на длинах волн 260 и 230 нм, гДНК — геномная ДНК.
ла (79,6%), ИМ с подъемом сегмента был диагностирован у 62% лиц, ИМ передней локализации был установлен в 58,3% случаев; ИМ перенесли впервые 85,2% больных. Низкие классы ЮШр (1-11) острой сердечной недостаточности имели место у наибольшего количества пациентов (87,1%). Среди сопутствующих заболеваний артериальная ги-пертензия имела место у 84,3% пациентов; сахарный диабет 2 типа установлен в 18,5% случаев (таблица 1). Данная выборка из 108 лиц с ИМ является репрезентативным фрагментом общей когорты, состоящей из 742 пациентов с ИМ, у которых были собраны образцы крови на протяжении 11 лет (2012-2023гг) для оценки сывороточных уровней ряда информативных кардиальных биохимических маркеров и фармакогенетического тестирования. Полученные биомолекулярные данные наряду с клиническими характеристиками и показателями визуализации миокарда активно используются для построения предиктивных моделей оценки отдаленных исходов ИМ [9, 10].
Сбор образцов был начат в январе 2023г, и по состоянию на 1 сентября 2023г коллекция включала 744 аликвоты цельной крови, лейкоцитарной взвеси и 108 образцов гДНК от 108 доноров. Среднее количество аликвот на один уникальный образец составило 6-8 пробирок (объемом 1 мл). Поступление образцов биоматериала доноров с патологией сердечно-сосудистой системы в биобанк в 2023г было равномерным, среднемесячный показатель составил 14 образцов (рисунок 1).
В биобанке МИ СурГУ собирается коллекция образцов гДНК, выделенная из аликвот цельной крови, хранящихся при -80о С не >2 мес. Контроль качества образцов гДНК показал, что исследуемые образцы имеют высокую чистоту по соотношению А260/А280 и удовлетворительную по соотношению А260/А230, которая не снижается за период хранения (таблица 2). Диапазон 1,7<А260/А230<2,0 считается пригодным для использования биообразца в молекулярно-генетических исследованиях [5].
Анализ концентрации гДНК в образцах, выделенных из аликвот цельной крови в первые дни и недели после поступления в биобанк, показал,
120 100 80 60 40 20 0
к
S s
S s
о &
е
Рис. 1 Динамика прироста количества образцов в коллекции биобанка СурГУ в 2023г.
что хранение гДНК при -80о С в течение 6 мес. практически не влияет на концентрацию (F=1,25; р=0,291) (таблица 2). При количественной оценке целостности индекс качества (DNA Quality Number, DQN) был >7, что также свидетельствует о хорошем качестве образцов ДНК (таблица 2) [5. С. 223].
Оценка целостности библиотек ДНК на системе капиллярного электрофореза Qsep100 показала отсутствие чрезмерно коротких и сверхдлинных фрагментов (характерный паттерн приведен на рисунке 2). Качество библиотек через 6 мес. хранения соответствует рекомендованному производителем (Roche) медианному значению в 350-400 пар оснований (п.о.). В дальнейшем планируется проведение регулярной оценки качества образцов с более длительным сроком хранения (>6 мес.) при -80о С.
Очевидно, что стандартизация процедур сбора образцов биоматериала, их обработки, выделения гДНК на всех этапах создания коллекции обеспечивает высокую воспроизводимость получаемых результатов исследований.
Обсуждение
Успешное развитие разветвленной системы биобанков на Западе и в России подтверждает необходимость создания региональных "малых" (базовых) институтских биобанков, которые дают
Рис. 2 Результаты капиллярного электрофореза для библиотеки ДНК (образец №60К23Щ).
Примечание: изображение получено на приборе Qsep100™ (BiOptic, Тайвань) с помощью программного обеспечения Q-Analyzer™. RFU — относительные единицы флуоресценции (relative fluorescence units), Length (bp) — длина фрагментов (п.о.), п.о. — пар оснований. Цветное изображение доступно в электронной версии журнала.
любому научно-образовательному учреждению возможность развернуть активную исследовательскую деятельность нового порядка и стать непосредственным участником развития методов трансляционной и персонализированной медицины — в частности, обеспечивая возможность поиска перспективных биомаркеров и ранней диагностики ССЗ [11-14]. Ввиду географических особенностей ХМАО-Югры и удаленности многих населенных пунктов, а также высокого риска смерти после перенесенного ИМ, своевременный сбор биологических образцов в период нахождения пациентов в стационаре очень важен. Однако длительное хранение крови и ее компонентов в стандартных лабораторных условиях невозможно из-за отсутствия низкотемпературных морозильников, системы бесперебойного электроснабжения и т.д., что в дальнейшем может сказаться на результатах исследований или привести к потере образцов.
Впервые в ХМАО-Югре был реализован проект создания региональной коллекции образцов био-
материала, полученных от пациентов с сердечнососудистой патологией. Размещение образцов биоматериала в биобанке МИ СурГУ позволило собрать и разместить на долговременное хранение репрезентативную выборку образцов. Для успешного проведения таргетного секвенирования к образцам ДНК предъявляются высокие требования: суммарная концентрация 100-150 нг в образце и достаточная степень очистки. В литературе накоплено достаточное количество информации о результатах долгосрочного хранения образцов цельной крови и гДНК, однако данные противоречивы. Большинство авторов указывают, что при длительном хранении цельной крови наблюдается снижение концентрации выделенной ДНК, но без изменения профиля метилирования и качества ДНК [15, 16]; однако есть публикации, в которых не выявлена связь между временем хранения цельной крови и концентрацией выделенной ДНК [17]. Считается, что концентрация гДНК в элюатах с буферными растворами незначительно снижается в процессе хранения, в отличие от
хранения замороженных образцов цельной крови. Оценка качества образцов, собранных в биобанке, подтверждает пригодность их использования для молекулярно-генетических исследований, включая секвенирование нового поколения. Аналогичный подход с использованием коллекции образцов, собранных в популяционном биобанке, применен для фармакогенетического тестирования пациентов с ССЗ в Восточной Европе, на Северном Кавказе, в Приуралье и Русской равнине [13].
Не менее важен централизованный электронный учет потока биообразцов и сопроводительной информации, обеспечивающие поддержание актуальной базы данных, интегрирующей все ключевые параметры коллекции и быстрый доступ к любому элементу коллекции для исследователей. Кроме того, в современных условиях становится актуальным создание дата-центра при биобанке, где будут храниться большие объемы биомедицинских данных (клинические, биомаркеры, генетика) о каждом пациенте, которые будут накапливаться по мере оценки новых молекул в его образцах и анализироваться с использованием методов биоинформатики и биостатистики, математической биологии, которые также постоянно совершенствуются и требуют надежного хранения анализируемой информации.
Проведенное исследование было ограничено сбором образцов биоматериала на одной клинической базе (БУ ХМАО-Югры "ЦД и ССХ", г. Сургут). Это было обосновано тем, что данная медицинская организация является региональным центром координации оказания медицинской помощи пациентам с болезнями системы кровообращения в ХМАО-Югре, в т.ч. обеспечивающим диагностику и лечение пациентов с ИМ в округе: по данным 2022г, в центре было пролечено 1077 (54%) больных ИМ от общего количества (1999) данной категории пациентов в округе. Еще одним ограничением на-
Литература/References
1. Gnennaya NV, Timofeeva SV, Sitkovskaya AO, et al. Creation of a collection of blood samples of patients with multiple myeloma. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2021;20(8):3043. (In Russ.) Гненная Н. В., Тимофеева С. В., Ситковская А. О. и др. Создание коллекции образцов компонентов крови больных множественной миеломой. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2021;20(8):3043. doi:10.15829/1728-8800-2021-3043.
2. Illarionov RA, Kosyakova OV, Vashukova ES, et al. Collection of samples from women at different stages of pregnancy to search for early biomarkers of preterm birth. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2020;19(6):2708. (In Russ.) Илларионов Р. А., Косякова О. В., Вашукова Е. С. и др. Особенности создания коллекции образцов беременных женщин на разных сроках гестации для поиска ранних биомаркеров преждевременных родов. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2020;19(6):2708. doi:1015829/1728-8800-2020-2708.
3. Doludin YuV, Limonova AS, Kozlova VA, et al. Collection and storage of DNA-containing biomaterial and isolated DNA. Cardio-
стоящего исследования явился отбор в исследуемую когорту пациентов только с ИМ (без включения больных хронической ишемической болезнью сердца), что было определено необходимостью последующего таргетного секвенирования коллекции образцов биоматериала для поиска лиц с генетически обусловленным высоким риском повторных сердечно-сосудистых катастроф и формирования из них фокусной группы интенсивного наблюдения с применением телемедицинских технологий.
Заключение
Актуальность сбора образцов биоматериала у пациентов с перенесенным ИМ подтверждается наличием негативного прогноза в контексте высокого риска смерти и низкой мобильности из-за постинфарктной сердечной недостаточности. В ХМАО-Югре в силу суровых климатических условий и низкой плотности населения, проживающего на обширной территории, создание регионального биобанка путем объединения организационных усилий как клинического учреждения, так и высшего учебного заведения, позволяет проводить изучение новых биомаркеров и разрабатывать современные методы терапии и профилактики ССЗ. Таким образом, коллекция образцов биоматериала, созданная на базе биобанка МИ СурГУ, призвана обеспечить текущие и будущие научно-исследовательские проекты качественным биоматериалом, в т.ч. за счет пробоподготовки и долговременного хранения образцов высокого качества в соответствии с разработанными стандартными операционными процедурами.
Отношения и деятельность. Исследование выполнено при финансовой поддержке Фонда научно-технологического развития Югры в рамках научного проекта № 2022-05-04.
vascular Therapy and Prevention. 2020;19(6):2730. (In Russ.) Долудин Ю. В., Лимонова А. С., Козлова В. А. и др. Сбор и хранение ДНК-содержащего биоматериала и выделенной ДНК. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2020; 19(6): 2730. doi:10.15829/1728-8800-2020-2730.
4. Kalinin RS, Goleva OV, Illarionov RA, et al. Development of a biobank in the structure of scientific and diagnostic and treatment institutions and prospects for interregional integration. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2022;21(11):3401. (In Russ.) Калинин Р. С., Голева О. В., Илларионов Р. А. и др. Формирование биобанка в структуре научных и лечебно-диагностических учреждений и перспективы межрегиональной интеграции Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11): 3401. doi:1015829/1728-8800-2022-3401.
5. Anisimov SV, Akhmerov TM, Balanovsky OP, et al. Biobanking. National guideline. M: Triumph Publishing House, 2022. p. 308. (In Russ.) Анисимов С. В., Ахмеров Т. М., Балановский О. П. и др. Биобанкирование. Национальное руководство. М: ООО
"Издательство Триумф", 2022. 308 с. ISBN: 978-5-93673322-2.
6. Thygesen K, Alpert J, Jaffe A, et al. Fourth Universal Definition of Myocardial Infarction (2018). Circulation. 2018;138(20):e618-51. doi:10.1161/CIR.0000000000000617.
7. Averkov OV, Duplyakov DV, Gilyarov MYu, et al. 2020 Clinical practice guidelines for Acute ST-segment elevation myocardial infarction. Russian Journal of Cardiology. 2020;25(11):4103. (In Russ.) Аверков О. В., Дупляков Д. В., Гиляров М. Ю. и др. Острый инфаркт миокарда с подъемом сегмента ST электрокардиограммы. Клинические рекомендации 2020. Российский кардиологический журнал. 2020;25(11):4103. doi: 10.15829/ 1560-4071-2020-4103.
8. Vorobev AS, Lifshits GI, Zelenskaya EM, et al. Results of a study of clinically significant CYP2C19 genotypes in patients with myocardial infarction in the northern region of Russia. Russian Journal of Cardiology. 2023;28(10):5533. (In Russ.) Воробьев А. С., Лифшиц Г. И., Зеленская Е. М. и др. Результаты исследования клинически значимых генотипов CYP2C19 у больных инфарктом миокарда в условиях северного региона России. Российский кардиологический журнал. 2023; 28(10):5533. doi:10.15829/1560-4071-2023-5533.
9. Vorobev AS, Kashtalap VV, Urvantseva IA, et al. Association of cardiovascular biomarkers with myocardial and coronary imaging characteristics in patients having acute myocardial infarction and type 2 diabetes mellitus. Complex Issues of Cardiovascular Diseases. 2021; 10(2S): 104-6. doi: 10.17802/2306-1278-2021-10-2S-104-106.
10. Vorobev AS, Kovalenko LV, Nikolaev KYu, et al. Clinical predictive value of tissue inhibitor of metalloproteinase-1 and myocardial remodeling development in patients having Q-wave myocardial infarction. Ateroscleroz. 2019;15(2):17-23. (In Russ.) Воробьев А. С., Коваленко Л. В., Николаев К. Ю. и др. Клинико-прогностическое значение тканевого ингибитора металлопро-теиназы-1 в развитии ремоделирования миокарда у пациентов, перенесших инфаркт миокарда с зубцом Q. Атеросклероз. 2019;15(2):17-23. doi:10.15372/ATER20190203.
11. Borisova AL, Pokrovskaya MS, Meshkov AN, et al. ISO 20387 biobanking standard. Analysis of requirements and experience of implementation. Russian Clinical Laboratory Diagnostics. 2020;65(9):587-92. (In Russ.) Борисова А.Л., Покровская М. С., Мешков А. Н. и др. Стандарт по биобанкированию ISO 20387. Анализ требований и опыт внедрения. Клиническая лабораторная диагностика. 2020;65(9):587-92. doi: 10.18821/08692084-2020-65-9-587-592.
12. Pokrovskaya MS, Borisova AL, Metelskaya VA, et al. Role of biobanking in managing large-scale epidemiological studies. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2021;20(5):2958. (In Russ.) Покровская М. С., Борисова А. Л., Метельская В. А. и др. Роль биобанкирования в организации крупномасштабных эпидемиологических исследований. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2021;20(5):2958. doi:1015829/1728-8800- 2021-2958.
13. Pylev VYu, Agdzhoyan AT, Gorin IO, et al. Population biobank as a basis for determining spatial variation of clinically relevant pharmacogenetic biomarkers of cardiovascular diseases. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2022;21(11):3430. (In Russ.) Пылев В. Ю., Агджоян А. Т., Горин И. О. и др. Популяционный биобанк как основа для выявления пространственной изменчивости клинически значимых фармакогенетических биомаркеров сердечно-сосудистых заболеваний. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11):3430. doi:1015829/1728-8800-2022-3430.
14. Kit OI, Timofeeva SV, Sitkovskaya AO, et al. The biobank of the National Medical Research Centre for Oncology as a resource for research in the field of personalized medicine: A review. Journal of Modern Oncology. 2022;24(1):6-11. (In Russ.) Кит О. И., Тимофеева С. В., Ситковская А. О. и др. Биобанк ФГБУ "НМИЦ онкологии" Минздрава России как ресурс для проведения исследований в области персонифицированной медицины. Современная онкология. 2022;24(1):6-11. doi:10.26442/18151 434.20221.201384.
15. Bulla A, Witt B, Ammerlaan W, et al. Blood DNA Yield but Not Integrity or Methylation Is Impacted After Long-Term Storage. Biopreserv Biobank. 2016;14(1):29-38. doi:10.1089/ bio.2015.0045.
16. Skirko OP, Meshkov AN, Efimova IA, et al. Shelf life of whole blood samples in a biobank and the yield of deoxyribonucleic acid during genetic testing. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2020;19(6):2726. (In Russ.) Скирко О. П., Мешков А. Н., Ефимова И. А. и др. Срок хранения образцов цельной крови в биобанке и выход выделенной из нее дезоксири-бонуклеиновой кислоты при проведении генетических исследований. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2020;19(6):2726. doi:10.15829/1728-8800-2020-2726.
17. Chen WC, Kerr R, May A, et al. The Integrity and Yield of Genomic DNA Isolated from Whole Blood Following Long-Term Storage at -30°C. Biopreserv Biobank. 2018;16(2):106-13. doi:10.1089/ bio.2017.0050.
