Научная статья на тему 'Случай персистенции у новорожденного двух различных штаммов Mycobacterium tuberculosis'

Случай персистенции у новорожденного двух различных штаммов Mycobacterium tuberculosis Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
62
25
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ТУБЕРКУЛЕЗ НОВОРОЖДЕННОГО / СЛУЧАЙ ДВУХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РАЗЛИЧНЫХ ШТАММОВ M.TUBERCUIOSIS

Аннотация научной статьи по биотехнологиям в медицине, автор научной работы — Медведева Т. В., Огарков О. Б., Ушаков Игорь Васильевич, Козьякова Е. С., Некипелов О. М.

В сообщении описывается случай обнаружения у новорожденного двух различных штаммов М. tuberculosis. С помощью ПЦР было проведено MIRU типирование по 12 полиморфным локусам генома возбудителя туберкулеза. ПЦР паттерны из клинического образца (биоптат лимфоузла) и ДНК штамма выделеного из этого же лимфоузла были достоверно различны. Приводятся доказательства действительного существования двух различных штаммов у одного новорожденного.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Медведева Т. В., Огарков О. Б., Ушаков Игорь Васильевич, Козьякова Е. С., Некипелов О. М.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The case of persistence of two different stra1s in a newborn Mycobacterium tuberculosis

The report presents the case of indication of two different strains of M. tuberculosis in a newborn. MIRU testing was fulfilled by PCR for 12 polymorphous loci at genome of M. tubeculosis. PCR patterns of clinical samples and DNA from lymphatic nodule were significantly different. It was shown the evidence of existence of two various strains in one patient.

Текст научной работы на тему «Случай персистенции у новорожденного двух различных штаммов Mycobacterium tuberculosis»

исследование в обычных пробирках, а с января 2003 г. материал принимали только в пробирках с вакуумной системой. Это привело к снижению числа повторных анализов, связанных с гемолизом или наличием микросгустков в привезенной крови. Следует отметить, что при использовании вакуумных систем забора крови со специфическими стабилизаторами, существует даже возможность выполнения качественных анализов на такие быстро разлагающиеся а налиты, как лактат и глюкоза, при поступлении их из отдаленных регионов области (в пределах 24 часовой доставки). Все остальные причины невыполнения исследований при обращении в ОЛД устраняются с трудом, так как они зависят от степени понимания

врачами правил работы с ИОДЦ и изменчивости потока больных на те или иные анализы.

Таким образом, присутствие на территории области централизованной базы с прецизионным лабораторным оборудованием (ОЛД ИОДЦ) и отлаженной системой контроля качества исследований на всех этапах проведения анализов весьма эффективно себя зарекомендовало. Очевидно, что такая централизация, не только снижает затраты на приобретение дорогостоящего оборудования в целом по области, повышает качество исследований, снижает их себестоимость, но и служит хорошим стимулом для КДЛ в освоении новых технологий проведения лабораторного анализа на всех этапах от забора биологического материала до выдачи результатов.

CENTRALIZATION OF LABORATORY SERVICE IN IRKUTSK CITY R.G. Skvortsova, V.V. Kuzmenko, I.V. Ushakov (Irkutsk State Diagnostic Center)

Centralization of clinical laboratory investigations is a way to increase effectiveness and quality of investigations, reduce their cost and execution time. Irkutsk diagnostic center is a basis with precise laboratory equipment, well projected and thoroughly tested quality control system of laboratory investigations on the all stages of analysis process. The IDC experience showed that such centralization significantly reduces expenses on the expensive medical equipment in hospitals. Moreover, centralization also serves as a good incentive for learning new technologies of laboratory analysis conducting in clinical laboratories.

Литература

1. Долгов В.В., Мошкин A.B., Малахов B.H. и др. Обеспечение качества в лабораторной медицине // Учебное пособие. - М.: изд. РМАПО, 1997. - 92 с.

Случаи из практики

© МЕДВЕДЕВА Т.В., ОГАРКОВ О Б.. УШАКОВ ИВ., КОЗЬЯКОВА Е С., НЕКИПЕЛОВ О.М., СКВОРЦОВА Р.Г., БЕЛИКОВ С,И. -

СЛУЧАЙ ПЕРСИСТЕНЦИИ У НОВОРОЖДЕННОГО ДВУХ РАЗЛИЧНЫХ ШТАММОВ Mycobacterium tuberculosis

Т.В. Медведева, О.Б. Огарков, И.В. Ушаков, Е.С. Козьякова, ОМ. Некипелов,

Р.Г. Скворцова, С.И. Беликов.

(ГУЗ Иркутский областной диагностический центр (ИОДЦ), гл. врач - к.м.н. И.В. Ушаков; Иркутский областной противотуберкулезный диспансер (ОПТД), гл. врач - Е.С. Козьякова; Лимнологический институт СО РАН, директор - акад. РАН М.А. Грачев)

Резюме. В сообщении описывается случай обнаружения у новорожденного двух различных штаммов М. tuberculosis. С помощью ПЦР было проведено MIRU типирование по 12 полиморфным локусам генома возбудителя туберкулеза. ПЦР паттерны из клинического образца (биоптат лимфоузла) и ДНК штамма выделеного из этого же лимфоузла были достоверно различны. Приводятся доказательства действительного существования двух различных штаммов у одного новорожденного.

Ключевые слова: туберкулез новорожденного, случай двух генетических различных штаммов M.tubercuiosis.

Таблица 1.

Различия между M1RUгенотипами штамма и биоптата от больного К.

Порядковый номер №MIRU локуса 2 4 10 16 20 23 24 26 27 31 39 40

Количество тандемных повторов в локусе

Штамм от больного К. 2 2 3 1 2 5 1 4 3 2 2 4

Биоиат от больного К. 2 2 3 3 2 5 1 5 3 4 3 3

В феврале 2001 в лабораторию молекулярной биологии ИОДЦ из ОПТД поступил биоитат лимфоузла от новорожденного К. с подозрением на врожденный туберкулез. Из поступившего клинического материала была выделена ДНК и проведено ПЦР исследование на присутствие нуклеотидных последовательностей IS6110 u mtp40. В обоих случаях был получен положительный результат, что доказывало на наличие в лимфоузле именно М. tuberculosis, поскольку только этот вид микобактерий имеет участок ДНК именуемый mtp40. Через два месяца ОПТД был завершен бактериологический анализ, подтвердивший наличие М. tuberculosis в биоитате. Из изолята от этого же больного была выделена ДНК. Однако, сравнение генотипов ДНК иунктата и ДНК штамма показало значительные различия при проведении тиииро-вания но 12 полиморфным локусам, называемых (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units MIRU) [1,2]. Для проверки данного результата был проведен широкий скрининг штаммов выделяемых от больных в 2000-2001 годах но вышеуказанным профилям (в настоящем исследовании не представлено) и анализ полученных результатов но базе данных MIRU паттернов [3]. Обнаружено достоверное отличие двух полученных электрофоретических профилей как от известных в мире генотипов [2,3], так и от основных MIRU

профилей, характерных для штаммов циркулирующих на территории Иркутской области. Все это свидетельствует с одной стороны об отсутствии лабораторной контаминации (профиль полученного штамма не имеет аналога в Иркутской области), с другой стороны, полученный результат нельзя объяснить иначе как изначальной иер-систенцией в органах новорожденного двух генетически отличных штаммов туберкулеза. Наиболее вероятно, что данные штаммы различались способностями к росту на питательной среде Ле-винштейн-Иенсена и к иерсистенции в лимфоти-ческих тканях. Один штамм получил преимущество при иерсистенции в организме, а другой при росте на питательной среде.

Аналогичное исследование, проведенное с использованием клинических образцов после хирургического вмешательства но поводу туберкулеза, подтверждает уникальность данного случая - все проверенные образцы (более 20-ти, данные не представлены) были генетически гомогенны в рамках одного больного.

Таким образом, описанный случай свидетельствует о потенциальной возможности иерсистенции генетически различных возбудителей туберкулеза у одного больного. Однако, это скорее всего связано с иммунокомироментированностью больного.

THE CASE OF PERSISTENCE OF TWO DIFFERENT STRA1S IN A NEWBORN

Mycobacterium tuberculosis

T.B. Medvedeva, O.B. Ogarkov, I.V. Ushakov, E.S. Koziakova. O.M. Nekipelov, R.G. Skvortsova,

S.I. Belikov

(Irkutsk Regional Diagnosic Center (IRDC), Regional Antituberculosis Hospital (RATH), Limnological Institute SB RAS (LIN SB RAS))

The report presents the case of indication of two different strains oiM. tuberculosis in a newborn. MIRU testing was fulfilled by PCR for 12 polymorphous loci at genome ofM. tubeculosis. PCR patterns of clinical samples and DNA from lymphatic nodule were significantly different. It was shown the evidence of existence of two various strains in one patient.

Литература . Mazars E., Lesjean S., Banuls A.L. et al. Highresolution minisatellite-based typing as a portable approach to global analysis of Mycobacterium tuberculosis molecular epidemiology // Proc. Natl. Acad. Sei. -2001. - Vol.98. - P. 1901-1906.

2. Supply P., Lesjean S., Savine E. et al. Automated high-throughput genotyping for study of global epidemiology of Mycobacterium tuberculosis based on mycobacterial interspersed repetitive units // J. Clin. Microbiol. - 2001. - Vol. 10. - P.3563-3571.

3. http://www.ibl.fr/mirus/mirus.html.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.