CC BY
14
29. Lin F., Zeng A., Yang N. et al. Quantification of human bocavirus in lower respiratory tract infections in China // BioMed Central, Infectious Agents and Cancer. 2007; 2:3 (публикация доступна только в электронном варианте: http://www.infectagentscancer.com/content/2/1/3).
30. Longtin J., Bastien M., Gilca R. et al. Human bocavirus infections in hospitalized children and adults // Emerging Infect. Dis. 2008. V. 14. № 2. P 17 - 221.
31. Lu X., Chittaganpitch M., Olsen S.J. et al. Real-time PCR assays for detection of bocavirus in human specimens // J. Clin. Microbiol. 2006. V. 44. № 9. P 3231 - 3235.
32. Ma X., Endo R., Ishiguro N. et al. Detection of human bocavirus in Japanese children with lower respiratory tract infections // J. Clin. Microbiol.
2006. V. 44. № 3. P. 1132 - 1134.
33. Mackay I. Human bocavirus: multisystem detection raises questions about infection // J. of Infect. Dis. 2007. V. 196. P. 968 - 970.
34. Maggi F., Andreoli E., Pifferi M. et al. Human bocavirus in Italian patients with respiratory diseases // J. of Clin. Virol. 2007. V. 38. P 321 - 325.
35. Manning A., Russell V., Eastick K. et al. Epidemiological profile and clinical associations of human bocavirus and other human parvoviruses // J. of Infect. Dis. 2006. V. 194. P. 1283 - 1290.
36. Manning A., Willey S., Bell J.E. et al. Comparison of tissue distribution persistence and molecular epidemiology of parvovirus B19 and novel human parvoviruses PARV4 and human bocavirus // J. Infect. Dis. 2007. V. 195. P 1345 - 1352.
37. Mochizuku M., Hashimoto M., Hajima T. et al. Virologic and serologic identification of minute virus of canines (canine parvovirus type 1) from dogs in Japan // J. Clin. Microbiol. 2002. V. 40. P. 3993 - 3998.
38. Monteny M., Niesters H.G., Moll H.A. et al. Human bocavirus in febrile children, the Netherlands // Emerg. Infect. Dis. 2007. V. 13. P. 180 - 182.
39. Neske F., Blessing K., Tollmann F. et al. Real-time PCR for diagnosis of human bocavirus infections and phylogenetic analysis // J. of Clin. Microbiol. 2007. V. 45. № 7. P. 2116 - 2122.
40. Qu X.W., Duan Z.J., Qi Z.Y. et al. Human bocavirus infection, People's Republic of China // Emerg. Infect. Dis. 2007. V. 13. № 1. P 165 - 168.
41. Redshaw N., Wood C., Rich F. et al. Human bocavirus in infants, New Zealand // Emerging Infect. Dis. 2007. V. 13. № 11. P. 1797 - 1799.
42. Regamey N., Frey U., Deffernez C. et al. Isolation human bocavirus from Swiss infants with respiratory infections // Pediatr. Infect. Dis. J. 2007. V. 26. P. 177 - 179.
43. Schenk T., Strahm B., Kontny U. et al. Disseminated bocavirus infection after stem cell transplant // Emerg. Infect. Dis. 2007. V. 13. № 9. P 1425 - 1427.
44. Semple M.G., Cowell A., Dove W. et al. Dual infection of infants by human metapneumovirus and human respiratory syncytial virus is strongly associated with severe bronchiolitis // J. Infect. Dis. 2005. V. 191. P 382 - 386.
45. Shildgen O., Muller A., Simon A. Human bocavirus and gastroenteritis // Emerging Infect. Dis. 2007. V. 13. № 4. P. 638.
46. Sloots T., McErlean P., Speicher D. et al. Evidence of human coronavirus HKU1 and human bocavirus in Australian children // J. of Clin. Virol. 2006. V. 35. P. 99 - 102.
47. Smuts H., Hardie D. Human bocavirus in hospitalized children, South Africa // Emerg. Infect. Dis. 2006. V. 13. P. 636, 637.
48. Storz J., Leary J.J., Carlson J.H. et al. Parvoviruses associated with diarrhea in calves // J. Am. Vet. Med. Assoc. 1978. V. 173. P. 624 - 627.
49. Templeton K.E., Scheltinga S.A., van den Eeden W.C. et al. Improved diagnosis of the etiology of community-acquired pneumonia with real-time polymerase chain reaction // Clin. Infect. Dis. 2005. V. 41. P. 345 - 351.
50. Vicente D., Cilla G., Montes M. et al. Human bocavirus, a respiratory and enteric virus // Emerging Infect. Dis. 2007. V. 13. № 4. P. 636, 637.
51. Vicente D., Cilla G., Montes M. et al. In response... // Emerging Infect. Dis.
2007. V. 13. № 4. P. 638, 639.
52. Volz S., Schildgen O., Klinkenbrg D. et al. Prospective study of human bocavirus infection in a pediatric university hospital in Germany 2005/2006 // J. of Clin. Virol. 2007. V. 40. P. 229 - 235.
53. Weissbrich B., Neske F., Schubert J. et al. Frequent detection of bocavi-
rus DNA in German children with respiratory tract infections // BioMed Central, Infectious diseases 2007; 6:109 (публикация доступна только в электронном варианте: http://www.biomedcentral.com/1471-
2334/6/109).
54. Williams J.V., Harris PA., Tollefson S.J. et al. Human metapneumovirus and lower respiratiry tract disease in overwise healthy infants and children // N. Engl. J. Med. 2004. V. 350. P. 443 - 450.
55. Young N.S., Brown K.E. Parvovirus B19 // N. Engl. J. Med. 2004. V. 350. P. 586 - 597.
Результаты изучения культур шигелл и сальмонелл, циркулирующих на территории Тульской области
Э.С. Куракин1, А Я. Сыпченко2
1 Тульская областная клиническая больница
2 Центр гигиены и эпидемиологии Тульской области
Введение
В структуре внутрибольничных инфекций (ВБИ) спорадические случаи заболеваний острыми кишечными инфекциями занимают отнюдь не последнее место и в многолетней динамике прослеживается определенная последовательность активизации тех или иных возбудителей дизентерии, сальмонеллезов, эшерихиозов [2, 3]. При этом анализ зарегистрированных вспышек внутрибольничных инфекций показывает, что значительная их часть относится именно к острым кишечным инфекциям, в частности обусловленным шигеллами и сальмонеллами [4, 6, 7].
Важное значение в борьбе с ВБИ и их профилактике имеет лабораторная диагностика, которая, безусловно, должна осуществляться на высоком методическом уровне, с учетом современных представлений о молекулярно-генетической природе возбудителей инфекции [1, 5]. В последнее время
неуклонно растет число публикаций, посвященных целесообразности и необходимости определения плазмид в качестве дополнительных маркеров при эпидемиологическом анализе, а также для идентификации и дифференциации госпитальных штаммов микроорганизмов [1, 5, 6, 9].
Целью работы было исследование молекулярно-генетических свойств госпитальных и внегоспи-тальных штаммов кишечных инфекций.
Материалы и методы
Изучение плазмидного спектра госпитальных и внегоспитальных штаммов Sh. flexneri 2а и S. typhimurium проводили в централизованной микробиологической лаборатории Центра гигиены и эпидемиологии Тульской области. Для получения плазмидной ДНК использовали метод Ц. Кадо и С.Т. Лиу [9].
Материалом для исследования служили 3294 культуры шигелл Флекснера, выде-
— 40
epid 3 (40).indd 40 Ф 6/24/08 3:57:30 PM
ленные на территории Тульской области в 2001 - 2006 годах от больных и бактерионосителей. Исследовано также 2058 культур сальмонелл, изолированных от больных и из внешней среды в процессе наблюдения в те же годы. Все эти культуры имели типичные для сальмонелл морфологию и серологические свойства.
Результаты исследований
Установлено, что в серопейзаже шигелл Флекс-нера, выделенных от больных и бактерионосителей в 2001 - 2006 годах, присутствовали серовары Лехпеп 1а, 1Ь, 2а, 3а, 6. Доминирующим в указанный период был серовар flexneri 2а, доля которого в общей структуре шигеллезов Флекснера оставалась примерно на одном уровне - 41,2 - 77,5%. С учетом этого дальнейшие исследования были направлены на изучение именно данного серологического варианта. При изучении и сопоставлении выделенных штаммов шигелл использовали внутриклональные маркеры (плазмидный спектр) [5, 9].
Результаты типирования показали, что циркулирующие штаммы Sh. flexneri 2а достаточно гетерогенны. Частота встречаемости плазмид с различным набором пар оснований представлена в таблице 1, из которой видно, что для возбудителей внебольничных шигеллезов высоким является значение данного показателя в отношении плазмид размером 180; 6; 3,2; 2,7 тысячи пар оснований (т.п.о.), в то время как у возбудителей ВБИ встречаются плазмиды размером 180; 72; 82,4; 6; 3,8 т.п.о.
Выявлено восемь условных клональных типов возбудителей, объединенных по схожести плазмид-ных профилей в общую группу, и два самостоятельных плазмидных варианта, циркулирующих в Тульской области и не входящих в эту группу.
Шигеллы первого типа имели в своем составе четыре плазмиды размером 180; 6,0; 3,2;
2.7 т.п.о. Второй клональный тип рассматривали как производный от первого, у которого появилась дополнительная пятая плазмида размером 72 т.п.о. Третий клональный тип также был производным от первого, который утратил плазмиду размером 6,0 т.п.о. Четвертый клональный тип (6,0; 3,2; 2,7 т.п.о.) отличался от первого отсутствием плазмиды 180 т.п.о., а пятый (6,0; 3,2; 2,7;
2,3 т.п.о.), кроме того, еще и наличием дополнительной малой плазмиды 2,3 т.п.о. Шестой (180; 6,0; 3,2; 2,7; 2,3 т.п.о.) и седьмой (180; 82,4; 6,0; 3,2;
2.7 т.п.о.) клональные типы характеризовались пятью плазмидами в микробной клетке и отличались от первого типа наличием дополнительной плазмиды размером 2,3 т.п.о. и 82,4 т.п.о. соответственно. Восьмой клональный тип (180; 82,4; 2,7; 2,0 т.п.о.), утратив две характерные для клона плазмиды 6,0 т.п.о. и 3,2 т.п.о., приобрел две новые плазмиды: 82,4 т.п.о. и 2,0 т.п.о. - и, вероятно, являлся крайним плазмидоваром в группе, имея
наиболее выраженные отличия в наборе плазмид от первого клонального типа.
Таким образом, вся совокупная заболеваемость шигеллезами определялась в основном тремя клональными типами flexneri 2а: первый тип поддерживал как вспышечную, так и спорадическую заболеваемость, второй - вызывал только крупные вспышки, третий - обусловливал исключительно спорадические случаи. На долю этих трех клональных типов приходилось 88,1% всей совокупной заболеваемости шигеллезом Флекснера 2а в Тульской области. Значительно реже выделялись минорные изоляты шигелл четвертого (3,2%), шестого (2,4%), седьмого (2,4%) и очень редко - пятого и восьмого типов, удельный вес каждого из которых не превышал 0,8%.
Молекулярное типирование штаммов шигелл, выделенных в период вспышек от пациентов трех психиатрических клиник Тульской области, показало их идентичность по набору и размерам плазмид. Все штаммы относились ко второму типу и несли две крупных плазмиды размером 180 и 72 т.п.о. и три мелких плазмиды - 6,0; 3,2; 2,7 т.п.о.
Подобный плазмидный «портрет» является достаточно индивидуальной штаммовой характеристикой и позволяет говорить, что эпидемические очаги, не связанные между собой инкубацией и изолированные друг от друга, могут демонстрировать сходный эпидемический процесс.
Характерно, что ни в одном штамме, вызвавшем спорадические вспышки, как и в тех, что привели к вспышкам меньшей интенсивности и продолжительности, плазмида размером 72 т.п.о. не была обнаружена, и это позволило использовать ее в качестве молекулярного маркера для дифференциации штаммов, вызывающих внутрибольничные и внебольничные вспышки различной интенсивности и продолжительности.
Сопоставление же полученных результатов с клиническими данными позволяет определить особенности госпитальных штаммов шигелл, несущих плазмиду 72 т.п.о., - отсутствие летальности, легкое течение заболевания и возможность повторного инфицирования.
Характерной особенностью штаммов первого и второго типа была способность вызывать пищевые вспышки, но смена ведущего пути передачи с пищевого на контактно-бытовой в ходе развития эпидемического процесса наблюдалась только у шигелл второго типа. Следует подчеркнуть широкое вторичное распространение шигелл этого типа в стационарах, связанное с передачей инфекционного агента от одного пациента другому, поскольку данный механизм способствует длительному поддержанию эпидемического процесса в коллективе и выносу возбудителя из эпидемического очага.
Изучение культур сальмонелл показало, что 18,5% из них составил серовар S. typhimurium, 67,3% - S. enteritidis, 14,1% - другие сальмонеллы. Несмотря на преобладание по серопейзажу
41
epid 3 (40).indd 41 Ф 6/24/08 3:57:30 PM
Таблица 1.
Частота выявления плазмид (%) у шигелл (Sh. Аехпеп 2а),
вызывающих вне- и внутрибольничную заболеваемость в Тульской области
Размер плазмиды (тысяч пар оснований) Возбудители внебольничных шигеллезов Возбудители внутрибольничных шигеллезов
180 80,9 100,0
92 7,1 -
72 - 84,5
82,4 11,9 100,0
6,0 66,7 100,0
3,8 4,7 100,0
3,2 90,5 -
3,0 2,4 -
2,7 97,6 -
2,3 9,5 -
2,0 2,4 -
S. enteritidis, только S. typhimurium были «склонны» к образованию госпитальных штаммов. Для большинства изученных штаммов (95,2%) был характерен типичный плазмидный профиль, представленный тремя плазмидами - размером 128,7; 17,4 и
2,4 т.п.о. Наличие этих клональных маркеров было характерно для изученных штаммов сальмонелл, выделенных от больных, сотрудников стационаров и с объектов внешней среды палатных секций. Наряду с этим у 4,8% штаммов, изолированных от больных, отмечался нетипичный плазмидный профиль, что свидетельствует о фактах заноса саль-монеллезной инфекции в стационар. Коэффициент неоднородности, составивший менее 0,05, подтверждает доминирующую циркуляцию именно госпитального штамма S. typhimurium.
Результаты проведенных исследований позволяют предположить, что ведущий госпитальный и доминирующий внебольничный серовары возбудителя шигеллеза совпадают ^. flexneri 2а). В отношении возбудителей сальмонеллеза подобной закономерности не выявлено, что, по-видимому, говорит о том, что для сальмонеллезов риск заноса в стационар не является определяющим фактором развития ВБИ. Очевидно, циркуляции выявленного клонального типа сальмонелл способствуют другие факторы, в первую очередь вирулентность и резистентность к воздействию антибиотических средств и дезинфектантов.
Выводы
1. Госпитальные штаммы возбудителей острых кишечных инфекций представляют собой особую биологическую разновидность, характеризующуюся рядом свойств, позволяющих диф-
ференцировать их от обычных штаммов соответствующих сероваров. Госпитальные штаммы обладают способностью обусловливать внутрибольничные очаги инфекции, характеризующиеся определенными особенностями течения эпидемического процесса, отличающими их от классической инфекции.
2. Специфика госпитальных штаммов Sh. Лехпеп 2а и S. typhimurium во многом определяет характер и тяжесть течения инфекционного процесса, ведущие пути и факторы передачи инфекции в стационаре, длительность и особенности проведения комплекса противоэпидемических мероприятий по ликвидации очагов нозокомиальных острых кишечных инфекций.
3. Полученный нами плазмидный «портрет» возбудителей кишечных внутрибольничных инфекций свидетельствует о том, что очаги, не связанные между собой инкубацией и изолированные друг от друга, могут демонстрировать сходный эпидемический процесс.
Проведенные в последнее десятилетие исследования показали, что использование методов, обладающих высокой разрешающей силой, способно значительно расширить представления о ВБИ [5, 8]. Результаты нашего исследования подтверждают существенную значимость методов типирования при анализе сложного эпидемического процесса. Использование при этом молекулярных методов должно стать существенным подспорьем в работе госпитальных эпидемиологов при реализации программ борьбы с ВБИ, а также врачей при лечении госпитализированных больных. ш
42
epid 3 (40).indd 42 Ф 6/24/08 3:57:30 PM
Литература
1. Джузенов А.А. Микробиологические и молекулярно-биологические методы типирования Pseudomonas aeruginosa и их использование для эпидемиологического анализа: Автореф. дис. ... канд. мед. наук. - М., 1990.
2. Карцев А.Д. О причине активизации эпидемического процесса кишечных инфекций в 70-е годы // Журн. микробиол. 1991. № 12. С. 22 - 25.
3. Коваль Т.А., Лезина В.В., Савич С.Ф. Внутрибольничные острые кишечные инфекции: анализ причин и эффективности противоэпидемических мероприятий / В кн.: Острые кишечные инфекции. Вып. 7. - Л.: Медицина, 1983. С. 45 - 47.
4. Покровский В.И., Семина И.А. Внутрибольничные инфекции: проблемы и пути решения // Эпидемиол. и инфекц. бол. 2000. № 5. С. 12 - 14.
5. Рашидов A.M. Эпидемиологический анализ заболеваемости сальмонеллезами тифимуриум и энтеритидис с использованием микробиологических и молекулярно-биологических методов типирования: Ав-тореф. дис. ... канд. мед. наук. - М., 1992.
6. Семина Н.А. Научные и организационные принципы профилактики внутрибольничных инфекций // Эпидемиол. и инфекц. бол. 2001. № 5. С. 5, 6.
7. Durand-Gasselin B., Rothau-Tonder M. Infections nosocomiales // Rew. Geriatr. 1998. V. 23, № 6. P. 543 - 548.
8. Emmerzon A.M., Enstone J.E., Kelsey M.C. The second national prevalence survey of infection in hospitals: methodology // J. Hosp. Infect. 1995. № 30. P. 7 - 29.
9. Kado С., Liu S.T. Rapid procedure for detection and isolation of large and small plasmids // J. Bacteriol. 1981. V. 145, № 3. P. 1365 - 1373.
Анализ результативности информационнопросветительной работы в период развития эпидемии ВИЧ-инфекции
М.И. Самойлов
ГУЗ «Оренбургский областной центр по профилактике и борьбе со СПИДом и инфекционными заболеваниями»
Начало циркуляции ВИЧ среди населения Оренбургской области пришлось на 1997 - 1998 годы. По мере того как ВИЧ распространяется по территориям Оренбуржья, становятся очевидными различия в показателях общей заболеваемости населения ВИЧ-инфекцией: Восточная и Центральная зоны - 50,9%; Восточная и Западная - 94,0% и Центральная и Западная - 87,9%.
Наиболее динамично эпидемический процесс ВИЧ развивается на территориях Восточной и Центральной зон области. По критерию Стьюден-
та для парных данных (1:) установлены различия интенсивности эпидемического процесса в Центральной и Восточной зонах области (1 = 2,813 при р = 0,0253); Центральной и Западной (1 = 3,324 при р = 0,0125); Восточной и Западной (1 = 3,497 при р = 0,01).
При единой системе учета ВИЧ-инфицированных различие сравниваемых показателей многолетнего среднего уровня первичной заболеваемости ВИЧ-инфекцией населения, проживающего в разных зонах области, достоверно (Восточная и Центральная зоны: 1 = 1,87362; Восточная - Западная
Рисунок 1.
Картограмма распределения показателей общей заболеваемости ВИЧ-инфекцией населения Оренбургской области на начало 2007г. (на 100 тыс. человек)
Ф
43
epid 3 (40).indd 43 Ф 6/24/08 3:57:31 PM
