Научная статья на тему 'Разложение монои полиароматических соединений новым грамположительным бактериальным штаммом'

Разложение монои полиароматических соединений новым грамположительным бактериальным штаммом Текст научной статьи по специальности «Экологические биотехнологии»

CC BY
191
74
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по экологическим биотехнологиям, автор научной работы — Егорова Д. О., Шумкова Е. С., Плотникова Е. Г.

Из почв, подверженных интенсивному техногенному воздействию, выделен грамположительный бактериальный штамм-деструктор. Штамм идентифицирован как Rhodococcus sp. В7а. Установлено, что штамм утилизирует ряд замещенных и незамещенных монои полиароматических углеводородов, использует в качестве ростового субстрата 2и 4-хлорбензойные кислоты, осуществляет разложение 4-хлорбензойной кислоты через стадии образования пара-гидроксибензойной и протокатеховой кислот, проявляет высокую активность к ортои паразамещенным моно-, дии трихлорированным бифенилам.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по экологическим биотехнологиям , автор научной работы — Егорова Д. О., Шумкова Е. С., Плотникова Е. Г.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Degradation of monoand polyaromatic hydrocarbons by a new gram-positive bacterial stain

A gram-positive bacterial stain was isolated from soil of industrial impact. Strain was identified as Rhodococcus sp. B7a. The strain was utilizing substituted and non-substituted monoand polyaromatic hydrocarbons. The strain was able to growth on 2and 4-chlorobenzoic acids. The para-hydroxybenzoate and protokatechuate were metabolites of 4-chlorobenzoate by strain Rhodococcus sp. B7a. The strain demonstrates a high degrade activity to orthoand para-substituted mono-, diand threechlorinated biphenyls

Текст научной работы на тему «Разложение монои полиароматических соединений новым грамположительным бактериальным штаммом»

ВЕСТНИК ПЕРМСКОГО УНИВЕРСИТЕТА

2009 Биология Вып. 10 (36)

УДК 579.87:579.222.2:579.222.4:579.25

РАЗЛОЖЕНИЕ МОНО- И ПОЛИАРОМАТИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ НОВЫМ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫМ БАКТЕРИАЛЬНЫМ ШТАММОМ

Д. О. Егорова3, Е. С. Шумкова3, Е. Г. Плотниковаа,ь

a Институт экологии и генетики микроорганизмов, 614081, Пермь, ул. Голева, 13 b Пермский государственный университет, 614990, Пермь, ул. Букирева, 15

Из почв, подверженных интенсивному техногенному воздействию, выделен грамположительный бактериальный штамм-деструктор. Штамм идентифицирован как Rhodococcus sp. В7а. Установлено, что штамм утилизирует ряд замещенных и незамещенных моно- и полиароматических углеводородов, использует в качестве ростового субстрата 2- и 4-хлорбензойные кислоты, осуществляет разложение 4-хлорбензойной кислоты через стадии образования пара-гидроксибензойной и протокатеховой кислот, проявляет высокую активность к орто- и пара- замещенным моно-, ди- и трихлорированным бифенилам.

Одной из наиболее актуальных проблем в настоящее время является загрязнение окружающей среды токсичными, устойчивыми соединениями, образующимися в результате промышленной деятельности человека и представляющими опасность для биосферы. К числу таких соединений относится ряд моно- и полиароматических соединений, а так же их замещенные производные.

Принятие в 2001 г. Стокгольмской Конвенции

о запрете использования 12 групп соединений га-логенароматического ряда (Стойкие органические загрязнители (СОЗ)) и необходимости их утилизации послужило основанием для расширенного изучения возможных способов деструкции данных веществ (http://www.unep.org).

Анализ научных публикаций показывает, что одним из наиболее перспективных методов разложения СОЗ является бактериальная деструкция (Занавескин, Аверьянов, 1998; Васильева, Стрижа-кова, 2007; Хоменков и др., 2008; Unterman, 1996; Pieper, 2005).

Цель работы - выделение бактериального штамма, проявляющего высокую деградативную активность к соединениям группы СОЗ, и изучение его особенностей.

Материалы и методы исследования

Выделение штамма-деструктора проводили методом накопительного культивирования, как описано Е.Г. Плотниковой и др. (2006). В качестве источника углерода использовали бифенил в концентрации 1 г/л.

Определение таксономического положения изолированного штамма. Морфологические, физиологические, биохимические признаки

микроорганизмов изучали по общепринятым методикам (Методы..., 1983; Методы..., 1991). Хемотаксономические признаки изучали так, как описано ранее (Chemical methods in bacterial systematic, 1985; Evtushenko et al, 2000). Амплификацию генов 16S рРНК проводили с использованием бактериальных праймеров 27F и 1492R (Tiirola et al., 2002). Секвенирование продуктов амплификации осуществляли с помощью набора реактивов DYEnamic ET Dye Terminator Cycle sequencing Kit на автоматическом секвенаторе MegaBASE 1000 (JSC GE Healthcare, США) согласно рекомендациям производителя. Полученные нуклеотидные последовательности анализировали с использованием программ CLUSTAL W (Thompson et al., 1994), TREECON (van de Peer, DeWachter, 1994), BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov). Поиск гомологичных последовательностей производили по базам данных GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) и EzTaxon (http://www.eztaxon.org).

Определение субстратной специфичности.

Субстратную специфичность штамма изучали как описано Е.Г. Плотниковой и др. (2006). В качестве единственного источника углерода и энергии использовали бензол, бифенил, нафталин, толуол и ряд карбоновых кислот: гентизиновую,

салициловую, пара-гидроксибензойную (ПГБК), протокатеховую (ПКК), 2-хлор- и 4-хлорбензойную (2ХБК, 4ХБК), орто-фталевую, 2,4-дихлорфеноксиуксусную (2,4-Д).

Ростовые характеристики штамма изучались в жидкой минеральной среде К1 (Zaitsev et al., 1991). Штамм выращивали в колбах Эрленмей-ера объемом 750 мл в 200 мл минеральной среды

© Д.О. Егорова, Е. С. Шумкова, Е. Г. Плотникова, 2009

84

при температуре 28оС и аэрации на шейкере со скоростью 220 об/мин. В качестве субстратов использовали 2ХБК и 4ХБК в концентрации 1 г/л. Количество колониеобразующих единиц (КОЕ) определяли методом серийных разведений с последующим высевом и подсчетом колоний на чашках Петри с агаризованной средой Luria-Bertrani (LB) (Ausbel et al., 1995). Расчет удельной скорости роста (д) культуры и время удвоения (td) производили по стандартным формулам.

Динамику дегалогенирования хлорбен-зойных кислот контролировали измерением оптической плотности ОП460 хлорида серебра, образующегося после реакции ионов хлора с азотнокислым серебром, в культуральной жидкости, освобожденной от клеток (Tsoi et al., 1991).

Продукты деградации хлорбифенилов

(ХБ) определяли спектрофотометрически (спектрофотометр Shimadzu BioSpec-mini) и методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ) (хроматограф Shimadzu LC-10ADvp, детектор Shimadzu RF-10Axl, колонка Alltech Lichro-sorb RP-18 10U 250 x 4.6 мм). Эксперименты с «отмытыми клетками» проводили аналогично экспериментам Д.О. Рыбкиной и др. (2003).

Образование продуктов мета-расщепления ароматического кольца хлорбифенилов -2-гидроксо-6-оксо-(хлорфенил)гекса-2,4-диеновые кислоты (ГОФДК) определяли спектрофотометрически при Xmax от 390 нм до 440 нм.

Содержание ХБК в среде культивирования регистрировали методом ВЭЖХ. 20 дл очищенной от клеток культуральной жидкости вносили в установку ВЭЖХ. Подвижной фазой являлась смесь - ацетонитрил : 0.1% Н3РО4, в соотношении 70:30, скорость протока - 0.70 мл/мин. Продукты деградации ХБ определяли в УФ при длине волны 205 нм. Идентификацию образовавшихся продуктов проводили при сравнении времени удержания вещества со стандартами (2ХБК, 4ХБК, 2,4-ХБК).

Разложение 2ХБК и 4ХБК определяли методом ВЭЖХ. Для экспериментов с «отмытыми клетками» бактериальную культуру выращивали как описано Д.О. Рыбкиной и др., (2003). ХБК вносили в концентрации 1 г/л. Пробы отбирали через 24 и 48 ч инкубации. В случае ростовых экспериментов пробы отбирали одновременно с определением КОЕ бактериальной культуры. 20 дл очищенной от клеток культуральной жидкости вносили в установку ВЭЖХ и анализировали при условиях, описанных выше. Идентификацию образовавшихся метаболитов проводили при сравнении времени удержания вещества с временем удержания стандартов (2ХБК, 4ХБК, ПГБК, ПКК).

Скрининг функциональных генов (bphAl, fcbA, fcbB) с использованием ПЦР осуществляли по описанной ранее методике (Шумкова и др., 2007; Witzig et al., 2006).

Статистическая обработка результатов. Все

эксперименты проводили в трехкратной повторности. Полученные данные обрабатывали с использованием стандартных пакетов

компьютерных программ Microsoft Excel.

Результаты и обсуждение

Выделение и идентификация штамма-

деструктора

Методом накопительных культур из образцов почв, отобранных на территориях с высокой техногенной нагрузкой (Плотникова и др., 2006) выделены бактериальные культуры, обладающие де-градативной активностью по отношению к различным ароматическим соединениям.

Наибольший интерес в рамках проводимых исследований представляют штаммы, способные использовать в качестве ростового субстрата бифенил. Из числа таких штаммов был отобран изолят, обозначенный В7а.

При росте на полноценной среде LB штамм формирует круглые, выпуклые колонии с гладкой поверхостью, ровным краем, блестящие, маслянистые, розово-кремового цвета. Строгий аэроб. Клетки неподвижные. Споры не образует. Катала-зоположительный. Характерен трехстадийный морфогенетический цикл развития. Пептидогликан клеточной стенки содержит мезо-

диаминопимелиновую кислоту, арабинозу и галактозу, что соответствует IV хемотипу клеточной стенки. Растет в широком диапазоне температур -от 8 до 42°С и при рН среды 6-9.

У штамма В7а определена нуклеотидная последовательность гена 16S рРНК длиной 467 п.н. и проведено сравнение с гомологичными последовательностями, имеющимися в международных базах данных GenBank/EMBL/DDBJ и на сервере EzTaxon (http ://www. eztaxon. org). Выявлена филогенетическая близость исследуемого штамма с типовым штаммом Rhodococcus erythropolis DSM 43066T (GenBank X79289). Уровень сходства составил 99.1%.

На настоящем этапе исследования штамм идентифицирован как Rhodococcus sp.

Субстратная специфичность

Изучение способности штамма Rhodococcus sp. В7а использовать в качестве ростового субстрата различные ароматические соединения показало, что данный штамм растет как на моно-, так и на полиароматических соединениях (табл. 1).

Полученные результаты позволяют предположить, что штамм Rhodococcus sp. В7а содержит ферментные системы, обеспечивающие полный путь деструкции нафталина и бифенила, а также хлорированных производных бифенила и бензойной кислоты.

Таблица 1

Рост штамма Rhodococcus sp. В7а на ароматических субстратах

Субстрат Рост Субстрат Рост

Бензол - о-фталат +++

Толуол - 2,4-Д +

Бифенил ++++ 2ХБК +++

Нафталин +++ 4ХБК +++

Г ентизат +++ ПГБК ++++

Салицилат +++ ПКК ++++

Примечание. «-» - нет роста, «+» - «++++» -интенсивность роста.

Хлорбензойные кислоты - ростовой

субстрат для Rhodococcus sp. В7а

Эксперименты по деструкции 2- и 4-хлорбензойных кислот исследуемым штаммом показали, что за 48 ч. штамм разлагает 89% 2ХБК и 90.7% 4ХБК. Деструкция хлорбензоатов сопровождалась выделением в среду эквимолярных количеств ионов хлора. Были выявлены основные продукты разложения 4ХБК - пара-гидроксибензойная и протокатеховая кислоты.

Изучена способность штамма Rhodococcus sp. В7а к росту в минеральной среде, содержащей в качестве единственного источника углерода и энергии 2ХБК или 4ХБК (рис. 1, 2).

Рост штамма на 2ХБК и 4ХБК сопровождался значительным увеличением числа клеток (на три порядка за двое суток) и коррелировал со снижением концентрации субстрата и накоплением свободных ионов хлора в среде. Изучение ростовых характеристик показало, что удельная скорость роста и время удвоения культуры на данных субстратах отличаются незначительно (д2ХБК = 0.042 ч\ Ц4ХБК = °.°61 ч\ ЪсХБК = П.52 Ч, 1а4ХБК = 11.3 ч).

Полученные данные показывают, что штамм Rhodococcus sp. В7а проявляет одинаковую активность как в отношении орто-, так и в отношении пара-хлорированной бензойной кислоты.

Подобный уровень деградативной активности отмечен для штамма R. ruber Р25, выделенного из образца почвы того же района исследования и обладающего широкой субстратной специфичностью (Рыбкина, 2003).

Деструкция хлорированных бифенилов

штаммом Rhodococcus sp. В7а

Эксперименты показали способность штамма Rhodococcus sp. В7а трансформировать орто- и па-ра-замещенные моно-, ди- и трихлорированные бифенилы (табл. 2).

% КОЕ/мл

Время, сутки

Рис. 1. Рост штамма Rhodococcus sp. В7а на 2-хлорбензойной кислоте:

1 - содержание 2ХБК в среде; 2 - содержание Cl-в среде; 3 - количество клеток штамма В7а

% КОЕ/мл

Время, сутки

Рис. 2. Рост штамма Rhodococcus sp. В7а на 4-хлорбензойной кислоте:

1 - содержание 4ХБК в среде; 2 - содержание ПГБК в среде; 3 - содержание ПКК в среде; 4 -содержание Cl- в среде; 5 - количество клеток штамма В7а

При разложении монохлорированных бифенилов штамм окисляет незамещенное кольцо с последующим расщеплением молекулы до ХБК и утилизацией последней. Большинство известных штаммов-деструкторов трансформируют хлорби-фенилы только до стадии образования хлорбензоа-та, утилизируя лишь отщепляющуюся при этом пентадиеновую кислоту (Bedard, Haberl, 1990; Billingsley et al., 1997; Pieper, 2005).

При разложении дихлорированных бифенилов штамм Rhodococcus sp. В7а окисляет как орто-,

так и пара-замещенные кольца. Однако большую активность он проявляет к орто-хлорированному кольцу молекулы бифенила, чем отличается от известных штаммов (Seeger et а1., 1999; Suenaga et а1., 2002).

Анализ метаболитов, образующихся при деструкции трихлорированных бифенилов, показал, что штамм В7а окисляет моно-замещенное кольцо

молекулы бифенила, при этом конечным продуктом разложения является дихлорированная бензойная кислота. Данный путь характерен для ряда описанных бактерий-деструкторов (Unterman, 1996; Pieper, 2005), однако выделенный нами штамм отличается высокой активностью по отношению к трихлорированным бифенилам.

Таблица 2

Деструкция хлорированных бифенилов штаммом Rhodococcus sp. В7а

Продукты деструкции

Субстрат Время, час ГОФДК Бензойная кислота

^max, нм ОП, ед положение заместителя мг/л %

0 4.27±0.02 7.4

2-ХБ 3 24 н.д. н.д. 2-Cl 57.29±0.01 52.25±0.02 98.6 89.9

0 н.д. н.д. 10.62±0.01 13.5

4-ХБ 3 413 0.538 4-Cl 76.88±0.08 98.2

24 0.298 49.66±0.07 63.5

0 390 0.196 1.05±0.01 6.76

2,2’-ХБ 3 0.324 2-Cl 15.42±0.02 95.2

24 н.д. н.д. 16.99±0.03 100

2,4’-ХБ 0 3 24 396 1.368 2.383 2.096 4-Cl 4-Cl 3.57±0.02 7.77±0.02 5.31±0.01 22.9 49.6 33.9

2-Cl 2.20±0.02 14.1

0 н.д. н.д.

4,4’-ХБ 3 24 н.д. н.д. 4-Cl 7.78±0.02 8.98±0.03 49.8 57.5

0 н.д. 0.08±0.01 0.8

2,4,2’-ХБ 3 393 0.351 2,4-Cl 1.56±0.01 16.3

24 0.387 7.72±0.02 80.88

0 н.д. н.д.

2,4,4’-ХБ 3 24 н.д. н.д. 2,4-Cl 1.25±0.01 5.21±0.01 13.1 54.5

Примечание: «н.д.» - не детектировалось в среде

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Скрининг функциональных генов штамма Rhodococcus sp. В7а

На матрице ДНК исследуемого штамма была проведена амплификация нуклеотидных последовательностей, соответствующих участкам fcbA и fcbB генов, контролирующих первый этап разложения 4ХБК, и нуклеотидных последовательностей, гомологичных участку гена bphAl, контролирующего первый этап разложения бифени-ла/ПХБ. Однако специфичной амплификации зафиксировано не было. По-видимому, гены штамма Rhodococcus sp. В7а, ответственные за начальные этапы разложения бифенила/ПХБ и 4ХБК, отличаются от известных (Pieper, 2005; Schmitz et al., 1992; Witzig et al., 2006; Zaitzev et al., 1991; http://www.ncbi.nlm.nih. gov).

Заключение

Бактериальная деструкция хлорированных ароматических соединений группы СОЗ, в частности ПХБ и ХБК, является одним из наиболее оптимальных способов разложения данных соединений и восстановления загрязненных ими территорий.

Выделенный из почвы, загрязненной отходами химических производств, штамм Rhodococcus sp. В7а обладает широким спектром деградативной активности. Установлено, что исследуемый штамм использует в качестве ростового субстрата как мо-но-, так и полиароматические соединения. При этом он осуществляет минерализацию моно- и ди-хлорированных орто- и пара-замещенных бифенилов, утилизируя образующиеся при их разложении моно-замещенные орто- и пара-хлорбензойные кислоты. Подобные свойства опи-

саны лишь для нескольких штаммов-деструкторов (Arensdorf, Foht, 1994; Kim, Picardal, 2001; Adebu-soye et al., 2007, 2008).

Таким образом, представленный в данной работе штамм Rhodococcus sp. В7а обладает существенным потенциалом для использования в биотехнологиях по очистке почв, загрязненных галогена-роматическимим соединениями, и в частности полихлорированными бифенилами.

Работа поддержана грантом РФФИ-Урал № 07-04-96078_а, Программой Президиума РАН "Молекулярная и клеточная биология", проект «Исследование метаболизма токсичных органических соединений у аэробных бактерий, анализ генетических и ферментных систем биотрансформации», ФЦП “Научные и научно-педагогические кадры инновационной России”, тема "Разработка биока-талитических технологий синтеза органических кислот и энантиомерно-чистых соединений для полимерной химии, медицины и экологической биотехнологии на основе микроорганизмов-продуцентов, селекционированных из природных и антропогенноизмененных почв” (ГК №

02.740.11.0078.)

Библиографический список

Васильева Г.К. Биоремедиация почв и седиментов, загрязненных полихлорированными бифенилами / Г.К. Васильева, Е.П. Стрижакова // Микробиология. 2007. Т. 76, № 6. С. 725-741. Занавескин Л.Н. Полихлорбифенилы: проблемы загрязнения окружающей среды и технологические методы обезвреживания / Л.Н. Занавескин, В.А. Аверьянов // Успехи химии. 1998. Т. 67, № 8.С. 788-800.

Методы общей бактериологии / под ред. Ф. Гер-хардт и др. М.: Мир, 1983. Т. 1, 2, 3.

Методы почвенной микробиологии и биохимии: учеб. пособие / под ред. Д.Г. Звягинцева. М.: Изд-во МГУ, 1991. 304 с.

Плотникова Е.Г. Характеристика микроорганизмов, выделенных из техногенных почв Прикамья / Е.Г. Плотникова, Д.О. Рыбкина, Л.Н. Ананьина и др. // Экология. 2006. № 4. С. 261268.

Рыбкина Д.О. Исследование аэробных бактерий, разлагающих полихлорированные бифенилы и хлорбензойные кислоты: дис. на соиск. учен. степ. к. б. н. / Д.О. Рыбкина. Пермь, 2003. 181 с. Рыбкина Д.О. Новый аэробный грамположитель-ный микроорганизм с уникальными свойствами деструкции орто- и пара-хлорированных бифенилов / Д.О. Рыбкина, Е.Г. Плотникова, Л.В. Дорофеева и др. // Микробиология. 2003. Т. 72, №. 6. С. 759-765.

Хоменков В.Г. Организация метаболических путей и молекулярно-генетические механизмы биодеградации ксенобиотиков у микроорганизмов /

B.Г. Хоменков, А.Б. Шевелев, В.Г. Жуков и др. // Прикладная биохимия и микробиология. 2008. Т. 44, № 2. С. 133-152.

Шумкова Е.С. Изучение генов, контролирующих реакцию дегалогенирования, бактерий-деструкторов 4-хлорбензоата / Е.С. Шумкова, И.В. Лобова, Л.Н. Ананьина, Е.Г. Плотникова // Вестник Перм. ун-та. 2007. Вып. 5. Биология.

C. 117-122.

Adebusoye A.S. Cometabolic degradation of polychlorinated biphenyls (PCBs) by axenic cultures of Ralstonia sp. strain SA-5 and Pseudomonas sp. strain SA-6 obtained from Nigerian contaminated soils / A.S. Adebusoye, M.O. Ilory, F.W. Picardal, O.O. Amund // World J. Microbiol. Biotechnol. 2008. Vol. 24. P. 61-68.

Adebusoye A.S. Growth on dichlorobipnenyls with chlorine substitution on each ring by bacteria isolated from contaminated African soils / A.S. Adebusoye, F.W. Picardal, M.O. Ilory et al. // Appl. Microbial. Biotechnol. 2007. Vol. 74. P. 484-492.

Arensdorf J.J. Formation of chlorocatechol meta cleavage products by a pseudomonad during metabolism of monochlorobiphenyls / J.J. Arensdorf, D.D. Focht // Appl. Environ. Microbiol. 1994. Vol. 60. P. 2884-2889.

Ausbel F. M. Short protocols in molecular biology / F. M. Ausbel, R. Brent, R.E. Kingston et al. 1995. 450 p.

Bedard D.L. Influence of chlorine substitution pattern on the degradation of polychlorinated biphenyls by eight bacterial strains / D.L. Bedard, M.L. Habel // Microbial Ecology. 1990. Vol. 20. P. 87-102.

Billingsley K.A. Studies on the transformation of selected polychlorinated biphenyl congeners by Pseudomonas strain LB400 / K.A. Billingsley, S.M. Backus, O.P. Ward // Can. J. Microbiol. 1997. Vol. 43. P. 782-788.

Chemical Methods in Bacterial Systematic. M. Good-fellow & D.E.). London: Academic Press. 1985. 412 p.

Evtushenko L. I. Leifsonia poae gen. nov., sp. nov., isolated from nematode galls on Poa annua and reclassification of “Corynebacterium aquaticum” Leifson 1962 as Leifsonia aquatica (ex Leifson 1962) gen. nov., nom. rev., comb. nov. and Clavi-bacter xyli Davis et al. 1984 with two subspecies as Leifsonia xyli (Davis et al. 1984) gen. nov., comb. nov. / L. I. Evtushenko, L. V. Dorofeeva, S. A. Subbotin et al. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000. Vol. 50. P. 371-380.

Kim S. Microbial growth on dichlorobiphenyls chlorinated on both rings as a sole carbon and energy suorse / S. Kim, F.W. Picardal // Appl. Environ. Microbiol. 2001. Vol. 64. P. 1953-1955.

Pieper D.H. Aerobic degradation of polychlorinated biphenyls // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005. Vol. 67. P. 170-191.

Schmitz A. Cloning and sequence analysis of genes for dehalogenation of 4-chlorobenzoate from Arth-

robacter sp. strain SU / A. Schmitz, K.-N. Garte-mann, J. Fielder et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1992. Vol. 58. P. 4068-4071

Seeger M. Regiospecificity of dioxygenation of di- to pentachlorobiphenyls and their degradation to chlorobenzoates by the bph-encoded catabolic pathway of Burkcholderia sp. Strain LB400 / M. Seeger, M. Zielinski, K.N. Timmis, B. Hofer // Appl. Environ. Microbiol. 1999. Vol. 65. P. 36143621.

Suenaga H. Alteration of regiospecificity in biphenyl dioxygenase by active-site engineering / H. Suenaga, T. Watanabe, M. Sato et al. // J. Bacteriol. 2002. Vol. 184. P. 3682-3688.

Thompson J.D. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment son / D.G. Higgins, T.J. Gibson // Nucleic. Acids. Res. 1994. Vol. 22. P. 4673-4680.

Tiirola M.A. Isolation and characterization of Novos-phingobium sp. Strain MT1, a dominant polychlo-rophenol-dagrading strain in a groundwater bioremediation system / M.A. Tiirola, M.K. Mannisto, J.A. Puhakka et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2002. Vol. 68. P. 173-180.

Tsoi T. V. Cloning and expression of the Arthrobacter globiformis KZT1 fcbA gene encoding dehaloge-nase (4-chlorobenzoate-4-hydrolase) in Escheri-

chia coli / T.V. Tsoi, G.M. Zaitsev, E.G. Plotnikova et al. / FEMS Microbiol.Lett. 1991. Vol. 65. P. 165-169.

Unterman R. A history of PCB biodegradation // Bioremediation. Principles and Applications / Eds. Crawford R.L., Crawford D.L. Cambridge Univarsity Press: Nyw York. 1996. P. 209-253.

Van de Peer Y. TREECON for Windows a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment / Y. van de Peer, R. DeWachter // Comput. Appl. Biosci. 1994. Vol. 10. P. 569-570.

Witzig R. Assessment of toluene/biphenyl dioxygenase gene diversity in benzene-polluted soils: links between benzene biodegradation and genes similar to those encoding isopropyibenzene dioxygenases / R. Witzig, H. Junca, H.-J. Hecht, D.H. Pieper // Appl. Environ. Microbiol. 2006. Vol. 72, № 5. P. 3504-3514.

Zaitsev G.M. Genetic control of degradation of chlorinated benzoic acids in Arthrobacter globiformis, Corynebacterium sepedonicum and Pseudomonas cepacia strains / G.M. Zaitsev, T.V. Tsoi, V.G. Grischenkov et al. // FEMS Microbiol. Lett. 1991. Vol. 81. P. 171-176.

Поступила в редакцию 09.06.2009.

Degradation of mono- and polyaromatic hydrocarbons by a new gram-positive bacterial stain

D.O. Egorova, E.S. Shumkova, E.G. Plotnikova

A gram-positive bacterial stain was isolated from soil of industrial impact. Strain was identified as Rhodococcus sp. B7a. The strain was utilizing substituted and non-substituted mono- and polyaromatic hydrocarbons. The strain was able to growth on 2- and 4-chlorobenzoic acids. The para-hydroxybenzoate and protokatechuate were metabolites of 4-chlorobenzoate by strain Rhodococcus sp. B7a. The strain demonstrates a high degrade activity to ortho- and para-substituted mono-, di- and three- chlorinated biphenyls.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.