Научная статья на тему 'Применение maldi-tоf масс-спектрометрии в системе мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов'

Применение maldi-tоf масс-спектрометрии в системе мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
92
17
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Басов Е.А., Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Ганин В.С., Хунхеева Ж.Ю.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Применение maldi-tоf масс-спектрометрии в системе мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов»

2014, Т. 4, № 1

Материалы научно-практической конференции «От эпидемиологии к диагностике актуальных инфекций...»

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ИЗОЛЯТА ВИРУСА КРАСНУХИ В РАМКАХ НАДЗОРА ЗА КОРЬЮ И КРАСНУХОЙ НА ЭТАПЕ ИХ ЭЛИМИНАЦИИ

А.Ю. Антипова1, Е.В. Тимофеева2, И.Н. Лаврентьева1

1ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

2Управление Роспотребнадзора по городу Санкт-Петербургу, Санкт-Петербург

На этапе элиминации кори и краснухи обязательным элементом эпиднадзора за этими инфекциями является лабораторное подтверждение каждого случая (Постановление Главного государственного санитарного врача Российской Федерации от 17 апреля 2013 г. № 17). В рамках реализации программы «Профилактика кори и краснухи в период верификации их элиминации в Российской Федерации (2013— 2015 гг.)» предусмотрено проведение генетического мониторинга циркуляции диких штаммов вирусов кори и краснухи для дифференцирования эндемичных и завозных случаев на территории РФ.

Цель исследования — лабораторное обследование лиц с первичным диагнозом «краснуха» для выделения и генотипирования изолятов вируса краснухи.

В сыворотках крови и смывах из ротоглотки больных, поступивших в Городскую инфекционную больницу № 30 в 2011 г. с клиническим диагнозом «краснуха» в одном из 30 случаев диагноз был подтвержден лабораторно методами ИФА (IgM-АТ в сыворотке крови) и ПЦР. Из ротоглоточного смыва больного был получен изолят Sankt Petersburg RUS 1366, который по результатам генотипирования отнесен к 1Е генотипу и близкородственен штаммам, циркулирующим в Китае.

Проведенное эпидемиологическое расследование показало, что заболевший, студент одного из ВУЗов Петербурга, проживающий в общежитии, уехал в КНР 22.01.11 г., вернулся в СПб 04.03.11 г. и 14.03.11 г. заболел краснухой. Очаг инфекции был ограничен одним заболевшим. Был доказан факт импортирования штамма вируса краснухи Sankt Petersburg RUS 1366 из Китая.

Отсутствие циркуляции эндемичных штаммов вируса является необходимым условием верификации элиминации. Собственные результаты и литературные данные (Шульга С.В., 2010; Бузицкая Ж.В., 2012; Тюников Г.И., 2007) подтверждают факт вытеснения эндемичного для России генотипа 2С штаммами вируса краснухи первой генетической группы.

ОСОБЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИОННОГО СОСТАВА CXCR3- И CCR6-ПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ ЛИМФОЦИТОВ ПЕРИФЕРИЧЕСКОЙ КРОВИ БОЛЬНЫХ C HCV-ИНФЕКЦИЕЙ

Н.А. Арсентьева1, Д.С. Елезов1, И.В. Кудрявцев2, А.В. Семенов1

1 ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

2 ФГУННИИээкспериментальной медицины, Санкт-Петербург

Введение. Характерной чертой вирусного гепатита С является высокая частота хронизации процесса (80%), в большой степени обусловленная нарушением иммунного ответа. Провоспалительные хемокины — ключевые молекулы, ответственные за направленное движение иммунокомпетентных клеток в очаг воспаления. Поэтому хемокиновые рецепторы, экс-

прессирующиеся на поверхности лейкоцитов, можно рассматривать как маркеры активации клеток, готовых к миграции. При развитии ИСУ-инфекции для попадания лимфоцитов в печень хемокиновые рецепторы СХСК3 и ССК6 имеют наибольшую значимость. Целью исследования стало количественное определение СХСК3- и ССК6-положительных лимфоцитов у больных с хроническим вирусным гепатитом С (ХВГС).

Материалы и методы. Материалом исследования служила периферическая кровь больных ХВГС (п = 42) и условно здоровых доноров (п = 32). Методом проточной цитофлюориметрии определяли экспрессию хемокиновых рецепторов СХСК3 и ССК6 на Т-хелперах (Тх), цитотоксических Т-лимфоцитах (ЦТЛ), натуральных киллерных (НК), Т-натураль-ных киллерных клетках (ТНК) и В-лимфоцитах. Статистический анализ осуществляли с применением GraphPad Рмш 6. Для сравнения групп использовали непараметрический критерий Манна— Уитни.

Результаты. Количество основных популяций лимфоцитов Тх, ЦТЛ, НК, ТНК и В-клеток больных ХВГС не отличалось от контрольной группы. Тем не менее, содержание СХСК3+ Тх было повышено в 1,3 раза (р < 0,0001), а ССК6+ Тх было снижено в 1,5 раза (р = 0,002) в крови больных с ИСУ-инфекцией по сравнению с условно здоровыми донорами. Количество ЦТЛ, экспрессирующих СХСК3 и ССК6 в группе больных, снижалось в 1,3 (р < 0,0001) и 1,75 (р = 0,004) раза соответственно, по сравнению с контрольной группой. Уровень СХСК3+ и ССК6+ НК и ТНК был ниже у больных ХВГС: в 2,3 и 14,5 среди НК (р = 0,005; р = 0,002) и 1,3 и 1,5 среди ТНК (р = 0,009; 0,019). Количество СХСК3+ В-клеток у пациентов с ИСУ-инфекцией было повышено более чем в 3 раза по сравнению с группой условно здоровых доноров (р < 0,0001).

Заключение. У больных с ИСУ-инфекцией в периферической крови увеличивается содержание СХСК3+ Тх и В-лимфоцитов, уменьшается количество СХСК3+ и ССК6+ клеток, обладающих цито-токсической активностью, что может отражать активацию гуморального и подавление эффекторного звеньев иммунитета.

ПРИМЕНЕНИЕ MALDI-TОF МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ В СИСТЕМЕ МОНИТОРИНГА ВИБРИОФЛОРЫ ПОВЕРХНОСТНЫХ ВОДОЕМОВ

Е.А. Басов, Л.В. Миронова, М.В. Афанасьев, В.С. Ганин, Ж.Ю. Хунхеева, Л.Я. Урбанович, С.В. Балахонов

ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора

Мониторинг вибриофлоры поверхностных водоемов является важным звеном в системе эпиднадзо-ра за холерой. При его осуществлении одно из требований — скорость и достоверность идентификации патогена. В настоящее время таким требованиям отвечает MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ (MALDI-TOF МС), позволяющий идентифицировать микроорганизмы на основании их белкового профиля.

Цель работы — оценка эффективности использования прямого белкового профилирования с использованием MALDI-TOF МС в мониторинге ви-бриофлоры поверхностных водоемов.

Материалы научно-практической конференции «От эпидемиологии к диагностике актуальных инфекций...»

Инфекция и иммунитет

При проведении мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов г. Иркутска в летний период 2012—13 гг. исследовано 1872 пробы (вода, ил, гидро-бионты, водоросли). Бактериологическому и масс-спектрометрическому анализу подвергались колонии, морфологически сходные с V. cholerae. Масс-спектрометрический анализ осуществлялся после предварительной постановки ориентировочной реакции агглютинации с холерными сыворотками О1 и О139 серогрупп: не агглютинирующиеся культуры исследовались прямым нанесением на чип, агглютинирующиеся одной из сывороток предварительно проходили спиртовую обработку с последующей экстракцией белка ацетонитрилом и муравьиной кислотой.

В результате из 583 исследованных колоний масс-спектрометрически к V. cholerae отнесено 220 из 76 проб, отобранных в стационарных точках поверхностных водоемов г. Иркутска. Бактериологически как V. cholerae идентифицировано 65 культур, отнесенных по результатам масс-спектрометри-ческого анализа к указанному виду. Из них две культуры по комплексу признаков отнесены к V. cholerae eltor, остальные 63 — к V. cholerae не О1/О139. Выявленные различия масс-спектрометрической идентификации и бактериологического анализа (наличие положительных по MALDI-TOF МС культур, не подтвержденных бактериологически) требуют дальнейшего исследования с применением молекулярно-генетических методов, позволяющих определить таксономическую принадлежность микроорганизма.

Таким образом, методика MALDI-TOF МС идентификации показала высокую эффективность при проведении мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов и может быть рекомендована для включения в схему лабораторной диагностики холеры.

ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ДИАГНОСТИКА CIN III И CARCINOMA IN SITU ШЕЙКИ МАТКИ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ПАПИЛЛОМАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ, С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ИММУНОЛОГИЧЕСКИХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ И.Л. Батурина, И.Ю. Орнер, М.А. Зотова, Л.Ф. Телешева, А.В. Жаров, К.В. Никушкина, Е.А. Мезенцева

НИИ иммунологии ГБОУ ВПО Южно-Уральский государственный медицинский университет МЗ РФ, г. Челябинск

В настоящее время основным методом диагностики, подтверждающим рак шейки матки (РШМ), является гистологическое исследование. Однако до 20% эксцизионных биопсий оказываются неинформативными, в связи с чем возникла потребность усовершенствовать дифференциальную диагностику между цервикальной интраэпителиальной нео-плазией (CIN) и преинвазивным раком шейки матки (Cr in situ).

Цель исследования: установить иммунологические критерии перехода CIN III в Cr in situ для использования их в дифференциальной диагностике данной патологии.

Материалы и методы. Проведено иммунологическое обследование 53 женщин с гистологически верифицированным диагнозом CIN III (I подгруппа, n = 30) и Cr in situ (II подгруппа, n = 23), у ко-

торых предварительно методом ПЦР была выявлена папилломавирусная инфекция. Для оценки иммунологических показателей у женщин исследовались периферическая кровь и цервикальная слизь. Статистические методы: «Statistica for Windows 6.0», пошаговый дискриминантный анализ.

Результаты исследования. Выявлены достоверные отличия ряда иммунологических показателей у больных CIN III и Cr in situ. Для уточняющей диагностики между I и II подгруппами установленными переменными явились: абсолютное содержание CD10+, CD20+, CD25+ лимфоцитов крови, функциональный резерв нейтрофилов цервикальной слизи (ФРНС, у.е.), уровень IL-10 крови (IL-10K, пг/мл), IFNy (IFNyC, пг/мл) и TNFa (TNFaC, пг/мл) цер-викальной слизи. На основании полученных данных была составлена функция: F (x1) = —15,671 х (CD10+) + 13,993 х (CD20+) - 15,035 х (CD25+) + 0,488 х ФРНС + 0,633 х IL-10K + 0,1 х IFNyC — 0,081 х TNFaC — 4,786. Применение формулы подразумевает формальную подстановку количественных значений показателей.

Выводы. Методом пошагового дискриминантного анализа составлена функция, позволяющая провести дифференциальную диагностику между CIN III и Carcinoma in situ, ассоциированных с папилломави-русной инфекцией.

СКРИНИГ ШТАММОВ HELICOBACTER PYLORI НА НАЛИЧИЕ cagA+

Э.Е. Бекенова12, Г.Н. Кулмамбетова2, А.К. Туякова2, А.Т. Сукашев3, А.А. Логвиненм3, К.Х. Алмагамбетов2

1 Евразийский национальный университет им. Л.Н. Гумилева, Астана, Казахстан

2 РГП Республиканская коллекция микроорганизмов, Астана, Казахстан

3Национальный научный медицинский центр Астаны, Казахстан

Инфицирование бактерией Helicobacter pylori вызывает развитие в слизистой желудка воспалительного процесса, который в большинстве случаев протекает в форме хронического гастрита. К настоящему времени у двух штаммов H. pylori (J99 и 26695) определены полные последовательности генома. Геном H. pylori содержит 1600 генов. Ряд генов, продукты которых — белки CagA, VacA, IceA, BabA, считаются факторами патогенности. Гены H. pylori, ассоциированные с цитотоксином А или островка патогенности сag, кодируют белок длинной 1186 аминокислотных остатка и состоит из 30—40 генов. Этот белок признан одним из основных факторов патогенности H. pylori и считается ответственным за нарушение целостности эпителия слизистой желудка. Он обычно отсутствует у штаммов, которые выделены от людей, являющихся бессимптомными носителями H. pylori.

Целью работы являлось культивирование и скрининг штаммов на наличие CagA+ H. pylori.

В работе были исследованы 16 культур H. pylori, изолированных из биоптатов слизистой оболочки желудка от пациентов с патологиями желудочно-кишечного тракта Национального научного медицинского центра г. Астаны. С биопсийного материала проводили посев на селективные среды. Посевы инкубировали при температуре 37°С, влажности 98%, в микроаэрофильных условиях, в течение 7 сут.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.