Научная статья на тему 'ПРИМЕНЕНИЕ ЭКЗОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ НАСЛЕДСТВЕННЫХ МОТОРНО-СЕНСОРНЫХ НЕЙРОПАТИЙ'

ПРИМЕНЕНИЕ ЭКЗОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ НАСЛЕДСТВЕННЫХ МОТОРНО-СЕНСОРНЫХ НЕЙРОПАТИЙ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
285
60
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Нервно-мышечные болезни
Scopus
ВАК
Область наук
Ключевые слова
НАСЛЕДСТВЕННАЯ МОТОРНО-СЕНСОРНАЯ НЕЙРОПАТИЯ / БОЛЕЗНЬ ШАРКО-МАРИ-ТУТА / ПОЛНОЭКЗОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ / НАСЛЕДСТВЕННАЯ ПЕРИФЕРИЧЕСКАЯ НЕЙРОПАТИЯ

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Щагина О.А., Рыжкова О.П., Чухрова А.Л., Миловидова Т.Б., Гундорова П.

Введение. Наследственные моторно-сенсорные нейропатии - обширная генетически-гетерогенная группа наследственных болезней, при которых клинический фенотип обусловлен тем или иным поражением периферических нервов.Цель исследования - оценить размах генетической гетерогенности наследственных моторно-сенсорных нейропатий у российских больных и диагностическую эффективность использования полноэкзомных методов исследования для поиска генетической причины наследственных моторно-сенсорных нейропатий.Материалы и методы. Материалом для исследования послужили образцы ДНК 51 больного и членов их семей, обратившихся за экзомным секвенированием в лабораторию ДНК-диагностики ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. академика Н. П. Бочкова» в 2017-2019 гг. Методы: полноэкзомное секвенирование, секвенирование по Сенгеру, метод анализа полиморфизма длин амплификационных фрагментов.Результаты. Используя экзомное секвенирование в сочетании с анализом сегрегации патогенных вариантов, удалось установить причину болезни в семьях у 41 % пациентов. Еще у 16 % выявлены кандидатные генетические варианты, являющиеся возможной причиной заболевания, однако для подтверждения этого необходимы дополнительные исследования, которые по решению семей не были проведены. Наиболее часто (в 6 неродственных семьях) выявлены мутации гена MFN2, в 2 семьях - гена MPZ, в 2 - AARS, по 1 случаю - GJB1, HINT1, INF2, LRSAM1, LITAF, MME, NEFL, WWOX. Среди причинных вариантов были выявлены мутации генов, отвечающих за спастическую параплегию (B4GALNT1), врожденную мышечную дистрофию Бетлема (COL6A1), миастению (SYT2), что свидетельствует о трудностях дифференциальной диагностики наследственных нервно-мышечных заболеваний. В 2 семьях до проведения полноэкзомного секвенирования (WES) была детектирована дупликация на хромосоме 17.Выводы. Экзомные методы исследования очень важны для поиска молекулярной причины наследственной моторно-сенсорной нейропатии. Для уточнения патогенности вариантов, выявленных при экзомном секвенировании, в большинстве случаев необходимо использовать дополнительные методы. Однако, несмотря на их высокую информативность, следует помнить, что наиболее частой причиной болезни является крупная дупликация региона 17p11.2.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Щагина О.А., Рыжкова О.П., Чухрова А.Л., Миловидова Т.Б., Гундорова П.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

DIAGNOSTIC UTILITY OF EXOME SEQUENCING FOR INHERITED PERIPHERAL NEUROPATHIES

Introduction. Hereditary motor and sensory neuropathies, a highly genetic heterogeneous group of disorders, have a phenotype caused by peripheral nerve damage.Purpose of the study - to assess the extent of genetic heterogeneity of hereditary motor and sensory neuropathies in Russian patients and to evaluate the diagnostic effectiveness of using full-exome research methods to find the genetic cause of hereditary motor and sensory neuropathies.Materials and methods. The material for the study was DNA samples from 51 patients and their family members referred for whole exome sequencing to the DNA-diagnostics laboratory of Research Centre for Medical Genetics in 2017-2019. Methods: whole exome sequencing, Sanger sequencing, restriction fragment length polymorphism.Results. Whole exome sequencing in combination with segregation analysis of the pathogenic variants in families allowed to determine the cause of the disease in 41 % of cases. In another 16 % of cases, candidate genetic variants as a possible cause of the disease were revealed, but additional studies are needed to confirm it. The most frequently mutated gene was MFN2 caused neuropathy in 6 unrelated families. MPZ gene mutations were detected in two families, AARS gene mutations were revealed in another two families, and mutations in GJB1, HINT1, INF2, LRSAM1, LITAF, MME, NEFL, WWOX were detected once. Among the causal variants, mutations in B4GALNT1 caused spastic paraplegia, in COL6A1 led to Bethlem’s congenital muscular dystrophy, and in SYT2 caused congenital myasthenic syndrome indicating difficulties in differential diagnosis of inherited neuromuscular disorders. A PMP22 duplication was detected in 2 families prior to whole exome sequencing.Conclusion. Whole exome sequencing is very important for finding the molecular cause of hereditary motor and sensory neuropathies. In most cases, additional methods should be used to clarify the pathogenicity of variants detected by whole exome sequencing. However, it is necessary to remember that the most common cause of the disease is a large duplication of the region 17p11.2.

Текст научной работы на тему «ПРИМЕНЕНИЕ ЭКЗОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ НАСЛЕДСТВЕННЫХ МОТОРНО-СЕНСОРНЫХ НЕЙРОПАТИЙ»

Применение экзомного секвенирования для диагностики наследственных моторно-сенсорных нейропатий

О.А. Щагина, О.П. Рыжкова, А.Л. Чухрова, Т.Б. Миловидова, П. Гундорова, О.Л. Миронович,

А.А. Орлова, М.Д. Орлова, А.В. Поляков

ФГБНУ«Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова»; Россия, 115522 Москва, ул. Москворечье, 1

Контакты: Ольга Анатольевна Щагина schagina@dnalab.ru

Введение. Наследственные моторно-сенсорные нейропатии — обширная генетически-гетерогенная группа наследственных болезней, при которых клинический фенотип обусловлен тем или иным поражением периферических нервов. Цель исследования — оценить размах генетической гетерогенности наследственных моторно-сенсорных нейропатий у российских больных и диагностическую эффективность использования полноэкзомных методов исследования для поиска генетической причины наследственных моторно-сенсорных нейропатий.

Материалы и методы. Материалом для исследования послужили образцы ДНК 51 больного и членов их семей, обратившихся за экзомным секвенированием в лабораторию ДНК-диагностики ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова» в 2017—2019гг. Методы: полноэкзомное секвенирование, секвенирование по Сенгеру, метод анализа полиморфизма длин амплификационных фрагментов.

Результаты. Используя экзомное секвенирование в сочетании с анализом сегрегации патогенных вариантов, удалось установить причину болезни в семьях у 41 % пациентов. Еще у 16 % выявлены кандидатные генетические варианты, являющиеся возможной причиной заболевания, однако для подтверждения этого необходимы дополнительные исследования, которые по решению семей не были проведены. Наиболее часто (в 6 неродственных семьях) выявлены мутации гена MFN2, в 2 семьях — гена MPZ, в 2 — AARS, по 1 случаю — GJB1, HINT1, INF2, LRSAM1, LITAF, MME, NEFL, WWOX. Среди причинных вариантов были выявлены мутации генов, отвечающих за спастическую параплегию (B4GALNT1), врожденную мышечную дистрофию Бетлема (COL6A1), миастению (SYT2), что свидетельствует о трудностях дифференциальной диагностики наследственных нервно-мышечных заболеваний. В 2 семьях до проведения полноэкзомного секвенирования (WES) была детектирована дупликация на хромосоме 17. Выводы. Экзомные методы исследования очень важны для поиска молекулярной причины наследственной моторно-сенсорной нейропатии. Для уточнения патогенности вариантов, выявленных при экзомном секвенировании, в большинстве случаев необходимо использовать дополнительные методы. Однако, несмотря на их высокую информативность, следует помнить, что наиболее частой причиной болезни является крупная дупликация региона 17p11.2.

Ключевые слова: наследственная моторно-сенсорная нейропатия, болезнь Шарко—Мари—Тута, полноэкзомное секвенирование, наследственная периферическая нейропатия

Для цитирования: Щагина О.А., Рыжкова О.П., Чухрова А.Л. и др. Применение экзомного секвенирования для диагностики наследственных моторно-сенсорных нейропатий. Нервно-мышечные болезни 2020;10(4):12—26.

DOI: 10.17650/2222-8721-2020-10-4-12-26

Ссс)

Diagnostic utility of exome sequencing for inherited peripheral neuropathies

O.A. Shchagina, O.P. Ryzhkova, A.L. Chukhrova, T.B. Milovidova, P. Gundorova, O.L. Mironovich,

A.A. Orlova, M.D. Orlova, A. V. Poliakov

Research Centre for Medical Genetics; 1 Moskvorech'e St., Moscow 115522, Russia

Introduction. Hereditary motor and sensory neuropathies, a highly genetic heterogeneous group of disorders, have a phenotype caused by peripheral nerve damage.

Purpose of the study — to assess the extent of genetic heterogeneity of hereditary motor and sensory neuropathies in Russian patients and to evaluate the diagnostic effectiveness of using full-exome research methods to find the genetic cause of hereditary motor and sensory neuropathies.

Materials and methods. The material for the study was DNA samples from 51 patients and their family members referred for whole exome sequencing to the DNA-diagnostics laboratory of Research Centre for Medical Genetics in 2017—2019. Methods: whole exome sequencing, Sanger sequencing, restriction fragment length polymorphism.

Results. Whole exome sequencing in combination with segregation analysis of the pathogenic variants in families allowed to determine the cause of the disease in 41 % of cases. In another 16 % of cases, candidate genetic variants as a possible cause of the disease were revealed, but additional studies are needed to confirm it. The most frequently mutated gene was MFN2 caused neuropathy in 6 unrelated families. MPZ gene mutations were detected in two families, AARS gene mutations were revealed in another two families, and mutations in GJB1,

HINT1, INF2, LRSAM1, LITAF, MME, NEFL, WWOXwere detected once. Among the causal variants, mutations in B4GALNT1 caused spastic paraplegia, in COL6A1 led to Bethlem's congenital muscular dystrophy, and in SYT2 caused congenital myasthenic syndrome indicating difficulties in differential diagnosis of inherited neuromuscular disorders. A PMP22 duplication was detected in 2 families prior to whole exome sequencing.

Conclusion. Whole exome sequencing is very important for finding the molecular cause of hereditary motor and sensory neuropathies. In most cases, additional methods should be used to clarify the pathogenicity of variants detected by whole exome sequencing. However, it is necessary to remember that the most common cause of the disease is a large duplication of the region 17p11.2.

Key words: hereditary motor and sensory neuropathy, HMSN, Charcot—Marie—Tooth disease, CMT, whole exome sequencing, WES, inherited peripheral neuropathy

For citation: Shchagina O.A., Ryzhkova O.P., Chukhrova A.L. et al. Diagnostic utility of exome sequencing for inherited peripheral neuropathies. Nervno-myshechnye bolezni = Neuromuscular Diseases 2020;10(4):12—26. (In Russ).

Введение

Наследственные моторно-сенсорные нейропатии (НМСН), или болезнь Шарко—Мари—Тута (Charcot— Marie—Tooth disease, CMT), — группа наследственных заболеваний периферической нервной системы с выраженной гетерогенностью клинических проявлений, типов наследования и причинных генов. Распространенность в европейских странах колеблется от 1:5 тыс. до 1:10 тыс. населения [1].

«Классический» фенотип НМСН, как правило, проявляется слабостью дистальных отделов конечностей, потерей чувствительности, деформаций стопы по типу полой или стопы Фридрейха. У большинства больных признаки заболевания проявляются на 1-м или 2-м десятилетии жизни и нарастают с возрастом. Однако описано много форм, при которых манифестация болезни происходит на 1-м году жизни и, наоборот, в 5-6-й декадах. По электрофизиологическим критериям долгое время было принято выделять миелино-патию (НМСН I) со скоростью проведения импульса (СПИ) по срединному нерву <38 м/с и аксонопатию (НМСН II) - СПИ >38 м/с. По мере накопления клинических и электрофизиологических данных была выделена промежуточная форма НМСН с СПИ от 25 и 45 м/с. В последние годы в группу аксональных НМСН были включены не только моторно-сенсорные нейропатии, но и фенотипы с преобладанием моторного поражения - наследственные моторные нейро-патии или дистальные спинальные атрофии и фенотипы с преобладанием вегетативных нарушений -наследственные сенсорные нейропатии. Сегодня в зарубежной литературе для обозначения всего многообразия форм наследственных периферических поли-нейропатий применяют термины CMT and related disorders (болезнь Шарко—Мари—Тута и подобные ей заболевания) и inherited peripheral neuropathies, или IPN (наследственные периферические нейропатии) [2]. В данной работе мы будем использовать для обозначения исследуемого заболевания привычный термин «наследственная моторно-сенсорная нейропатия».

На сегодняшний день описано описано уже более 80 генов, ответственных за НМСН. Кроме того, для целого ряда генов характерно наличие сразу нескольких

неврологических фенотипов, одним из которых является периферическая полинейропатия (см. рисунок).

При таком разнообразии генетических причин и большом числе пересекающихся фенотипов после исключения наиболее частой причины болезни — дупликации на хромосоме 17, включающей ген PMP22, на долю которой приходится 60 % случаев НМСН I, очевидным методом диагностики является экзомное секвенирование. В табл. 1 суммированы результаты пол-ноэкзомного секвенирования (WES) выборок больных с НМСН из разных стран.

Таблица 1. Результаты экзомного секвенирования выборок больных с периферическими нейропатиями

Table 1. Exome sequencing results for different inherited peripheral neuropathy's cohorts

Страна Число обследованных семей Выявлено мутаций (всего (% от числа обследованных семей))

Region Number of families in the study The identified mutations (in total (% of the investigated families number))

Австралия [3] Australia [3] 110 41(37)

Канада [4] Canada [4] 50 12 (24)

Австрия, Германия, Бельгия [5] Austria, Germany, Belgium [5] 27 8 (29)

США [6] USA [6] 37 17 (45)

Как видно из табл. 1, эффективность полноэкзом-ного секвенирования колеблется от 24 до 45 %. Связано это в большей степени с полнотой предварительного молекулярно-генетического обследования пробандов. Так, в работе М. Schabhuttl и соавт. были отобраны больные из 3 стран, которым на более ранних этапах проведен поиск мутаций в 10 наиболее частых генах, а в работе С. Gonzaga-Jauregui и соавт. у большинства

о >

о

Клинико-генетическое разнообразие наследственных моторно-сенсорных нейропатий. Фигуры разных цветов — фенотипы; курсивом обозначены все гены, варианты которых приводят к наследственным периферическим нейропатиям по данным OMIMна середину 2019 г. ШМТ — болезнь Шарко—Мари—Тута; болезни мотонейрона — наследственные болезни, связанные с поражением мотонейрона: наследственные моторные нейро-патии, боковой амиотрофический склероз, дистальные спинальные атрофии; СЦА — спиноцеребеллярные атаксии; синдромы — синдромы, сопровождающиеся периферической нейропатией; НМСН + «что-то» — синдромальные формы наследственных моторно-сенсорных нейропатий Clinical and genetic diversity of inherited motor-sensory neuropathies. Different colors of figures indicate different phenotypes. Italics indicate all genes, variants of which lead to inherited peripheral neuropathies according to OMIM data for mid-2019. CMT — Charcot—Marie— Tooth disease; motor disease — hereditary diseases associated with motoneurone damage: neuronopathy, distal hereditary motor, amyotrophic lateral sclerosis, spinal muscular atrophy, distal; SCA — spinocerebellar ataxia; syndromic & HMSN + something — syndromes accompanied by peripheral neuropathy and syndromic forms of Charcot—Marie—Tooth disease

больных до проведения экзомного секвенирования была исключена лишь дупликация гена PMP22 [5, 6].

В данной работе представлены результаты экзомного секвенирования и последующего обследования 51 неродственного пробанда с клиническим диагнозом НМСН, обратившихся за экзомным секвенированием в лабораторию ДНК-диагностики ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова» в 2017-2019 гг.

материалы и методы

Проведено исследование 51 неродственного про-банда: 22 женщин и 29 мужчин в возрасте от 3 до 57 лет.

Среди обследованных 39 человек были единственными больными в семье, 10 — семейных с доминантным типом наследования болезни и в 2 случаях не было информации о родословной. У 8 больных по данным элек-тронейромиографии была выявлена миелинопатия, у 28 — аксонопатия, у 10 — промежуточный характер поражения периферических нервов и о 5 больных данные электронейромиографии исследования не были предоставлены. На 1-м этапе всем пробандам вне зависимости от полноты обследований, проведенных до направления на экзомное секвенирование, был выполнен поиск самой частой мутации — 1.4-MB дупликации на хромосоме 17, включающей ген PMP22

с использованием мультиплексной полимеразнои цепной реакции системы маркеров DUP4 и DUP5, локализованных в области дупликации с применением праймеров: DUP4F - GGCAAAAATGGGCATTCTT-GTCTC, DUP4R - GAAATAACCATAACATAATAAAG-GCC, DUP5F - TGAACACATTTGGCTTTGAAACAAC, DUP5R - TTATCCAAAGAGTTGTCACTAGAAC. Для визуализации результатов использовался вертикальный электрофорез в полиакриламидном геле.

Экзомный анализ ДНК пациентов проведен на сек-венаторе нового поколения Illumina NextSeq 500 методом парно-концевого чтения (2 х 75 пар оснований). Для пробоподготовки у 35 пробандов была использована методика селективного захвата участков ДНК, относящихся к кодирующим областям около 20 тыс. генов (набор Illumina TruSeqR ExomeKit и IDT xGenR Exome Research Panel), у 14 пробандов - методика селективного захвата участков ДНК, относящихся к кодирующим областям 6640 генов, описанных на данный момент как клинически значимые (набор SeqCap EZ HyperCap Workflow). Обработка данных секвенирова-ния проведена с использованием стандартного автоматизированного алгоритма, предлагаемого Illumina, для анализа данных использовано фирменное программное обеспечение BaseSpace Sequence Hub (Illumina, США).

Для оценки популяционных частот выявленных вариантов использованы данные выборки проектов «1000 геномов», ESP6500 и The Genome Aggregation Database v2.1.1. Для оценки клинической релевантности выявленных вариантов использованы база данных OMIM, база данных по патогенным вариантам HGMD® Professional версия 2019.4 и данные литературы.

Для оценки патогенности выявленных при эк-зомном секвенировании вариантов был проведен анализ сегрегации в 22 семьях методом прямого автоматического секвенирования по Сенгеру целевых участков конкретных генов.

Оценка патогенности и причинности генетических вариантов проводилась в соответствии с международными рекомендациями по интерпретации данных, полученных методами массового параллельного сек-венирования [7].

Результаты

Клинические, электрофизиологические данные, результаты экзомного секвенирования и последующего сегрегационного анализа по всем исследованным пробандам представлены в табл. 2.

У 2 неродственных пробандов, направленных на экзомное секвенирование, при предварительном анализе была выявлена дупликация гена PMP22, диагноз подтвержден, и массовое параллельное секвенирование им не проводилось. Оба пробанда имели типичную клиническую и электронейромиографическую картину демиелинизирующей формы НМСН.

Как видно из табл. 2, в 22 случаях из 51 были выявлены патогенные и вероятно патогенные варианты, > которые, наиболее вероятно, являются причиной за- ° болевания в семье. В 20 случаях такие варианты были о выявлены при исследовании экзома, а в 2 случаях — при предварительном поиске частой мутации.

Для уточнения патогенности некоторых вариантов был проведен семейный анализ и доказана неслучайная сегрегация выявленного варианта в семье с полинейро-патией, de novo статус варианта или трансположение выявленных мутаций.

Наиболее частой причиной НМСН, выявляемой при экзомном секвенировании 6 неродственых семей, оказались мутации гена MFN2, ответственного за НМСН IIA2. Этот результат не вызывает удивления, так как данная форма является наиболее частой среди аксонопатий, на ее долю приходится 25 % случаев этой формы болезни [8, 9].

В 2 семьях с миелинопатией были выявлены мутации гена MPZ, ответственного за НМСН IB. По ранее полученным в лаборатории ДНК-диагностики данным этот ген тоже является нередкой причиной миелино-патий, на его долю приходится до 9 % случаев этой формы НМСН [10].

Неожиданно в 2 случаях были выявлены различные мутации гена AARS, ответственного за НМСН IIN типа. Данная форма наследственной полинейропатии была впервые описана в 2010 г. [11]. И до сих пор нет данных о высокой распространенности, описаны лишь единичные случаи.

Было выявлено по 1 случаю мутаций в других частых генах периферических нейропатий — GJB1 (НМСН IX), HINT1 (нейромиотония и аксональная нейропатия) [12, 13]. Небольшая доля таких форм, выявленных при экзомном исследовании, объясняется тем, что НМСН, связанные с этими генами, имеют свои характерные особенности — Х-сцепленная родословная для GJB1 и миотонические феномены для HINT1, а гены имеют небольшой размер и доступно более дешевое их исследование методом секвенирования по Сен-геру.

Из редких генетических вариантов НМСН были выявлены мутации в генах INF2 (НМСН доминантная, промежуточная Е), LRSAM1 (НМСН IIP), LITAF (НМСН IQ, MME (НМСН IIT).

Кроме того, используя алгоритм Illumina для анализа данных, удалось выявить протяженную делецию на хромосоме 8, включающую ген NEFL (НМСН IIE), а при анализе покрытия целевых генов — делецию эк-зона 2 в гене WWOX (эти мутации были валидированы референсными методами). Необходимо отметить, что метод экзомного секвенирования не приспособлен для обнаружения таких мутаций — данные находки являются случайностью.

Среди причинных вариантов были выявлены мутации генов, отвечающих за спастическую параплегию,

Таблица 2. Клинические, электрофизиологические данные, результаты молекулярно-генетического анализа Table 2. Clinical and electrophysiological data, results of molecular analysis

HMCH HMSN

HMCH HMSN

энмг Число больных Возраст начала

ENMG Number of patients

Результаты молекулярно-генетического анализа

Results of molecular genetic analysis

Ген Вариант (ы)

, Сегрегация

Zygosity I Segregation

Патогенность (критерии ACM G)

Выявлена дупликация на хромосоме 17

Миели-нопатия Myelinopathy

Миели-нопатия Myelinopathy

Детский Childhood

30

РМР22

РМР22

DUP

DUP

het

het

PAT

PAT

Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 1А Charcot—Marie —Tooth disease, type 1A

Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 1А Charcot—Marie —Tooth disease, type 1A

? %

E

CD

О « VI

и «л

HMCH HMSN

HMCH HMSN

HMCH HMSN

Промежуточный Intermediate

Akcoho-патия Axono-pathy

Миели-нопатия Myelinopathy

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Диагноз подтвержден молекулярно-генетическими методами

The diagnosis was confirmed by molecular genetic methods

S3 NM"^022489.4 c.271C>G (p.Arg91Gly)

20-30 NM^0CU005374.3 c.2047-lG>A

het

het

53

LITAF

c.348G>C

NM 001136472.1 (p.Trpll6Cys)

het

Болезнь Шарко—Мари-PAT Тута, доминантный

Да (PS4 РМ1 промежуточный Е

Yes РМ2 РР2 Charcot-Marie-Tooth

РРЗ) disease, dominant

Intermediate E

Да

Yes

Выявлена у бессимптомного сына (27 лет) и больной мамы Detected in an asymptomatic

son (27 years old)

and a sick mother

PAT (PVS1 PS4 PM2 PP3)

Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2Р Charcot—Marie —Tooth disease, axonal, type 2P

LPAT Болезнь Шарко—Мари-

(PM1 PM2 Тута, тип 1С

РМ5 РРЗ Charcot-Marie-Tooth

BS2) disease, type 1С

(V ?! Л

s: s: s:

о

&

10

И

12

НМСН HMSN

НМСН HMSN

НМСН

HMSN

НМСН HMSN

НМСН HMSN

НМСН

HMSN

НМСН

HMSN

Ген

Результаты молекулярно-генетического анализа

Results of molecular genetic analysis

Аксоно-патия Axono-pathy

Аксоно-патия

Ахопо-pathy

Аксоно-патия Ахопо-pathy

Аксоно-патия

Ахопо-pathy

Миели-нопатия Myelinopathy

Вариант (ы)

Детский Childhood

Детский Childhood

MFN2 NM 001127660

MFN2 NM 001127660

с.638Т>С (p.Ile213Thr) het

c.281G>A(p.Arg94Gln) het

Да

Yes

Да

Yes

Stood NM ШШ27660 c.280C>T(p.Arg94Trp)

MFN2 NM 001127660

C.7750T (p.Arg259Cys)

het

het

Детский Childhood

MFN2 NM 001127660

с. 1146 1148delGGC (p.Ala383del)

het

Детский Childhood

Младенческий

infancy

MFN2 NM 001127660

c.263T>A (p.Ile88Asn)

het

MPZ

NM 000530.8

c.499G>A (p.Glyl67Arg) het

Патогенность (критерии

ACMG)

LPAT (PM1 PM2 PM5 PP2 PP3 PP5)

PAT (PS4 PM1 PM2PM5 PP2 PP3 PP4 PP5)

PAT (PM1 PM2 PM5 PP2 PP3 PP4 PP5)

PAT (PM1 PM2 PM5 PP2 PP3 PP5)

Родственники не доступны. Выявлен у новорожденного

сына Relatives are not available.

Detected in a newborn son

LPAT (PM1 PM2 PM4 PP3)

Диагноз

LPAT (PM1 PM2 PP2 PP3 PP4)

PAT (PSI PS4

PMI PM2 PM5 PP2 PP3 PP5)

Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2А2А Charcot -Marie-Tooth disease, axonal, type 2A2A

Болезнь Шарко-Мари-Тута, тип 2А2А

Charcot- Marie -Tooth disease, axonal, type 2A2A

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Болезнь Шарко-Мари-Тута, тип 2А2А

Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2A2A

Болезнь Шарко- Мари -Тута, тип 2А2А Charcot Marie-Tooth disease, axonal, type 2A2A

Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2А2А Charcot Marie-Tooth disease, axonal, type 2A2A

Болезнь Шарко-Мари-Тута, тип 2А2А

Charcot- Marie -Tooth disease, axonal, type 2A2A

Болезнь Шарко- Мари-Тута, тип IB

Charcot Marie-Tooth disease, type IB

TOM 10 I/0L.10

42020

ОС

Продолжение табл. 2

Continuation of table 2

N Клинический диагноз В энмг Число больных Возраст начала Результаты молекулярно-генетического анализа

Ген Вариант (ы) Зиготность Сегрегация Патогенность (критерии ACMG) итатиямя Диагноз

13 имен HMSN Миели-нопатия Myelinopathy 5 Детский СЫкШооа MPZ NM 000530.8 c.223G>A (p.Asp75Asn) het Да Yes PAT (PS4 PM1 PM2 PM5 PP2 PP3 PP4) Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 1В Charcot—Marie-Tooth disease, type IB

14 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 4 Детский СШсШоос! GJB1 NM 001097642.2 c.86T>C (p.Phe29Ser) hem Да Yes PAT (PS4; PM1; PM2; PM5; PP2; PP3) Болезнь Шарко—Мари-Тута, Х-сцепленная, доминантная 1 Charcot—Marie—Tooth neuropathy, X-linked dominant, 1

15 НМСН HMSN - 1 60 AARS NM 001605.2 c.332A>G (p.Lysl 1 lArg) het He выявлена у здоровых родственников Not detected in healthy relatives LPAT (PS4 PM2 PP3 PP4 BP1) Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2N Charcot—Marie-Tooth disease, axonal, type 2N

16 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 4 Детский СШсШоос! AARS NM 001605.2 c.2738G>A (p.Gly913Asp) het Да Yes LPAT (PS4 PM2 PP3 PP4 BP1) Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2N Charcot—Marie —Tooth disease, axonal, type 2N

17 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 1 Детский СШШкхх! HINT1 NM 005340.7 c.ll0G>C (p.Arg37Pro) homo Родители-гетерозиготы Parents are heterozygotes PAT (PS3 PM1 PM3 PP2 PP3) Нейромиотония и ак-сональная нейропатия рецессивная Neuromyotonia and axonal neuropathy, autosomal recessive

18 НМСН/дСМА HMSN/dSMA Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский СШсШоск! MME NM_007288.3 C.1914+1G>A; с.1946Т>С (p.Ile649Thr) compound Транс-поло-жение In trans position PAT(PVS1 PM2 PP3); LPAT (PM1 PM2 PM3 PP2 PP3) Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2Т Charcot—Marie—Tooth disease, axonal, type 2T

19 НМСН HMSN Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский сыкшооа NEFL chr8:24,771,268— 24,814,014 DEL (подтверждена XMA) chr8:24,771,268-24,814,014 DEL (confirmed by СМА) het - LPAT (PVS1 PM2) Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2Е Charcot—Marie —Tooth disease, type 2E

N Клинический диагноз ЭНМГ Число больных Возраст начала гзультаты молекулярно-генетического анализа

Ген Сегрегация Патогенность (критерии Диагноз

■ н ACMG)

20 НМСН HMSN Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood SYT2 NMJ77402.5 С.9170Т (p.Ser306Leu) het de novo LPAT (PS2 РМ2 РРЗ) Миастенический синдром врожденный, 7, пресинаптический Myasthenic syndrome, congenital, 7, presynaptic

21 НМСН? Повышение КФК (1260 Ед/л) HMSN? high СК (1260 U/1) Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood COL6A1 NM 001848.3 c.903+lG>T het de novo PAT (PVS1 PS2 PM2 РРЗ PP5 Миопатия Бетлема, 1 Bethlem myopathy 1

22 НМСН? пмд? Спастическая параплегия? HMSN? LGMD? Spastic paraplegia? Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood B4GALNT1 NM 001478.5 c.l514G>C (p.Arg505Pro) homo Родители гетерозиготы Parents are heterozygotes LPAT (PS4 PM2 РРЗ PP4) Спастическая параплегия 26, аутосомно-рецессивная Spastic paraplegia 26, autosomal recessive

Выявлены кандидатные варианты

Candidates variants were identified

23

НМСН HMSN

24

25

НМСН HMSN

НМСН HMSN

Промежуточный Intermediate

Аксоно-патия Axono-pathy

Промежуточный Intermediate

Детский Childhood

WWOX NM 016373.4

Детский Childhood

Детский Childhood

AAAS NM 015665.6

GDAP1 NM 018972.4

c.[310C>T (p.Argl04Trp);.411G>T]; [(EX2del)] DEL EX2 подтверждена ХМА цис/трансположение с комплексным аллелем

неизвестно с.[310С>Т (p.Argl04Trp);.

411G>T]; [(EX2del)] DEL ЕХ2 confirmed by CMA cis/trans position with complex allele unknown

c.787T>C (p.Ser263Pro)

с.ЗЮОТ Hc.411G>T выявлены

у отца с.ЗЮОТ and С.4110Т were found in the father

Спиноцеребеллярная атаксия аутосомно-рецес-VUS; PAT сивная 12?

Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 12?

het

C.7150T (p.Leu239Phe); c.695-29T>C

compaund

Синдром ахалазия—адци-_ YUS (PP2 РРЗ сонизм—алакримия?

РР5) Achalasia—addisonianism —

alacrimia syndrome?

Трансполо- PAT(PM1PM2 Болезнь Шарко-Мари-

жение РР2РРЗРР5); Тута, тип 4А?

In trans VUS (РМ2 Charcot-Marie-Tooth

position РМЗ BP4) disease, type 4A?

Продолжение табл. 2 Continuation of table 2

N Клинический диагноз ЭНМГ Число больных Возраст начала Результаты молекулярно-генетического анализа

Gene Вариант (ы) Сегрегация Патогенность Диагноз

В of patients station Zyg osit У

26 НМСН с атрофией дисков зрительных нервов HMSN with optic atrophy - 1 Детский Childhood FDXR NM 001258012.4 с. 17G>A (р.ТгрбТег); C.9790T (p.Arg327Cys) compaund Трансположение In trans position PAT (PVS1 PM2 PP3); VUS (PM2 PP3 BP1) Аудиторная нейропатия и атрофия зрительного нерва? Auditory neuropathy and optic atrophy?

27 НМСН? Мышечная дистрофия? HMSN? Muscular dystrophy? - 1 Детский Childhood COL12A1 NM 004370.6 c.2962A>G (p.Thr988Ala) het - VUS (PM2 BP1 BP4) Миопатия Бетлема 2? Bethlem myopathy 2?

28 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 4 20-30 HARS NM_002109.6 c.ll41G>A (p.Gly381Arg) het - VUS (PM2 PP3 BP1) Болезнь Шарко—Мари-Тута, тип 2W? Charcot—Marie—Tooth disease, axonal, type 2W?

29 НМСН? дСМА? ПКМД? HMSN? dSMA? LGMD? Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 40-50 LDB3 NMJ107078.3 c.ll87G>A (p.Arg396Gln) het - VUS (PM2 PP3 BP1) Миофибриллярная миопатия, 4? Myopathy, myofibrillar, 4?

30 НМСН? СМА? HMSN? SMA? Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood DCAF8 NM 015726.4 c.407T>C (p.Leul36Pro) het Выявлен у необследованной мамы Detected in an untreated mother VUS (PM2 PP3 BS2) Нейропатия гигантских аксонов 2, аутосомно- доминантная? Giant axonal neuropathy 2, autosomal dominant?

Вероятной причины болезни не выявлено

The probable cause of the disease was not revealed

31 НМСН HMSN Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood KARS NM 001130089.1 C.3750G het Нет данных No data 1 вариант в АР гене One variant in AR gene He установлен Not defined

32 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 1 Детский Childhood EN03 NM_053013.4 C.880T (p.Arg30Ter) het Нет данных No data 1 вариант в АР гене One variant in AR gene He установлен Not defined

33

НМСН HMSN

Миели-нопатия Myelinopathy

50

MME NM 007288.3

34

НМСН HMSN

Аксоно-патия Axono-pathy

30

GAN NM 001377486.1

35

HMCH HMSN

Аксоно-патия Axono-pathy

Детский Childhood

SH3TC2 NM 024577.4

MED25 NM 030973.3

36

37

38

НМСН с атрофией Аксоно-зрительных патия нервов Ахопо-HMSN with the optic pathy atrophy

НМСН? Миотония? HMSN?

Myotonia?

НМСН HMSN

НМСН? 39 СМА?

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

HMSN? SMA?

Аксоно-патия Axono-pathy

Аксоно-патия Axono-pathy

Аксоно-патия Axono-pathy

Взрослый OPAl

Adult NM 130835.2

30

IGHMBP2 NM 002180.3

Детский IGHMBP2 Childhood NM 002180.3

Детский Нет данных Childhood No data

Результаты молекулярно-генетического анализа

Results of molecular genetic analysis

C.1040A>G (p.Tyr347Cys)

c.642G>A (p.Metllle)

c.505T>C (p.Tyrl69His)

C.10040T (p.Ala335Val)

het

het

het

het

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Патогенность (критерии ACM G)

1 вариант в АР-гене One variant in AR gene

1 вариант в АР-гене One variant inAR gene

1 вариант в АР-гене One variant inAR gene

1 вариант в АР-гене One variant inAR gene

Диагноз

EM

He установлен Not defined

He установлен Not defined

He установлен Not defined

He установлен Not defined

C.1146A>G (Ile382Met)

het

Нет данных No data

1 вариант в АР-гене One variant in AR gene

He установлен Not defined

c.2317G>A, (p.Gly773Arg)

c.l65G>C (p.Gln55His)

het

het

Нет данных No data

Нет данных No data

1 вариант в АР-гене One variant in AR gene

1 вариант в АР-гене One variant in AR gene

He установлен Not defined

He установлен Not defined

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

He установлен Not defined

N Клинический диагноз энмг Число больных Возраст начала Ген ■ 1

ENMG Number of patients /ige of manife-

ин station Gene

40 нмсн? пкмд? HMSN? LGMD? Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 20 Нет данных No data

41 НМСН HMSN Миели-нопатия Myelinopathy 1 40-50 Нет данных No data

42 НМСН HMSN Миели-нопатия Myelinopathy 1 Детский Childhood Нет данных No data

43 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 2 Детский Childhood Нет данных No data

44 НМСН HMSN Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood Нет данных No data

45 НМСН HMSN Промежуточный Intermediate 1 Детский Childhood Нет данных No data

46 НМСН? Спастическая параплегия HMSN? Spastic paraplegia Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 Детский Childhood Нет данных No data

47 НМСН HMSN Аксоно-патия Ахопо-pathy 1 50-60 Нет данных No data

Продолжение табл. 2 Continuation of table 2

Результаты молекулярно-генетического анализа

Results of molecular genetic analysis

Вариант (ы) Zyg osil I У Сегрегация Патогенность (критерии ACMG) HWHWHHH Диагноз

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Нет данных No data Не установлен Not defined

Результаты молекулярно-генетического анализа

Results of molecular genetic analysis

48

49

50

51

НМСН HMSN

НМСН HMSN

НМСН HMSN

НМСН

с атрофией зрительных

нервов HMSN and optic atrophy

Аксоно-патия Axono-pathy

Аксоно-патия Axono-pathy

Миели-нопатия Myelinopathy

40-50

10

Детский Childhood

10

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет Нет

данных данных No data No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет Нет

данных данных No data No data

Патогенность (критерии ACM G)

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Нет данных No data

Диагноз

ЕЯ

Не установлен Not defined

Не установлен Not defined

Не установлен Not defined

Не установлен Not defined

Примечание. ЭНМГ— электронейромиография; ACMG — Американский колледж молекулярной генетики; НМСН — наследственная моторно-сенсорная нейропатия; PAT -патогенный; het — гетерозиготное состояние; homo — гомозиготное состояние; compound — компаунд-гетерозиготное состояние вариантоа(ов); LPAT — вероятно-пато-генный; СМА — спинальная мышечная атрофия; дСМА — дистальная спинальная мышечная атрофия; КФК— креатинфосфокиназа; VUS — вариант неопределенного клинического значения — патогенность вариантов, согласно критериям ACMG; ПКМД — поясно-конечностная мышечная дистрофия.

Note. ENMG — electroneuromyography; ACMG — American College of Medical Genetics; HMSN — hereditary motor and sensory neuropathy; PAT — pathogenic; het — heterozygote; homo — homozygote; compound — compound heterozygotes; LPAT — likely pathogenic; SMA — spina! muscular atrophy; dSMA — spina! muscular atrophy, distal; CK — creatine kinase; VUS — variant of uncertain clinical significance - pathogenicity of variants according to ACMG criteria; LGMD — muscular dystrophy, limb-girdle.

rtO

I

i m

U GO

S

и s

M LO

ТОМ 10 VOL. 10

42020

I] врожденную мышечную дистрофию Бетлема, миастению, > что свидетельствует о трудностях дифференциальной ° диагностики наследственных нервно-мышечных зао болеваний.

В 8 случаях были выявлены кандидатные варианты, которые, вполне вероятно, могут являться причиной заболевания, но необходимы дополнительные подтверждающие факторы: анализ сегрегации, функциональный анализ — данные исследования не были проведены по решению семей больных в силу различных причин.

В 21 семье не было выявлено вероятной причины болезни. В 6 семьях определялись гетерозиготные патогенные и вероятно патогенные варианты в генах с аутосомно-рецессивным типом наследования. Однако выявление такого варианта не является молекуляр-но-генетическим подтверждением болезни. Кроме того, при анализе экзомных данных носительство вариантов в рецессивных генах нервно-мышечных болезней в гетерозиготном состоянии было выявлено и в 5 семьях, где молекулярный диагноз был установлен в дополнение к патогенным/вероятно патогенным вариантам в доминантных генах.

Обсуждение

Таким образом, мы оценивали диагностическую ценность полноэкзомных методов исследования в когорте пациентов с клиническим диагнозом НМСН. Всем больным был проведен также поиск дупликации на хромосоме 17. Некоторым больным до направления на экзомное секвенирование был выполнен поиск мутаций в других частых генах, ответственных за НМСН. Необходимо подчеркнуть, что описываемая в данной работе группа больных не была специально сформированной выборкой, а представляла когорту пациентов, направленных на экзомное секвенирование с диагнозом НМСН, поэтому нередкими находками были мутации в частых генах, ответственных за развитие периферических нейропатий.

Обращает на себя внимание тот факт, что, несмотря на то что экзомное секвенирование — дорогостоящее и долгое исследование, а при НМСН описана частая мутация, ответственная за 60 % случаев миелино-патий, которая может быть детектирована простыми, быстрыми и дешевыми методами, на диагностику методом массового параллельного секвенирования часто направляются больные без предварительного исследования дупликаций. Детекция делеций и дупликаций протяженностью более 15 пар нуклеотидов является ограничением метода экзомного секвениро-вания. Несмотря на то что некоторые вариации числа копий генов, в том числе и дупликации 17р11.2, могут быть выявлены у больного с использованием специальных целевых методов анализа экзомных данных, данный поиск не проводится рутинно при каждом исследовании экзома. При отсутствии предваритель-

ного целевого поиска дупликаций данные пациенты с высокой долей вероятности остались бы без моле-кулярно-генетически подтвержденного диагноза после проведения экзомного секвенирования.

Используя экзомные методы исследования в сочетании с сегрегационным анализом, молекулярную причину заболевания удалось установить в 41 % случаев НМСН, в качестве причины которых была исключена дупликация на хромосоме 17, что согласуется с данными исследователей из других стран.

Еще в 16 % случаев выявлены кандидатные генетические варианты, выступающие возможной причиной заболевания, однако для подтверждения этого необходимы дополнительные исследования, которые по решению семей не были проведены.

В 6 % случаев были выявлены причинные мутации в генах, ответственных за нервно-мышечные заболевания, патогенез которых отличается от периферических полинейропатий, — врожденная мышечная дистрофия, миастения, наследственная спастическая параплегия. Данный феномен может быть связан как с трудностями дифференциальной диагностики на клиническом этапе обследования больных, так и с многообразием пересекающихся фенотипов при мутациях в различных генах нервно-мышечных болезней.

Причина болезни при экзомном секвенировании выявлялась практически в одинаковом проценте случаев при различных электронейромиографических типах полинейропатий: в 43 % случаев — миелинопатий с исключенной дупликацией гена РМР22, в 44 % случаев — промежуточных НМСН и в 41 % случаев — ак-сонопатий.

В семейных случаях болезни чаще, чем в спорадических, выявляется молекулярная причина болезни. Из 10 семейных случаев НМСН в 8 выявлен патогенный/вероятно патогенный вариант, еще в 1 случае выявлен кандидатный вариант и лишь в 1 случае ничего не выявлено.

Среди 33 случаев манифестации заболевания в детском возрасте (до 10 лет) причина полинейропатии при экзомном исследовании установлена в 16 (48 %) случаях, еще в 6 (18 %) — найден кандидатный вариант, в то время как при манифестации во взрослом и подростковом возрасте (15 случаев) причина болезни найдена у 3 (20 %) пробандов и кандидатный вариант — у 2 (13 %) пробандов. Полученные результаты согласуются с данными других исследователей и могут быть обусловлены многообразием генетических и негенетических причин полинейропатий у взрослых пациентов.

Заключение

Экзомные методы исследования очень важны для поиска молекулярной причины генетически-гетерогенных моногенных болезней, к которым относится НМСН. Данные методы позволяют не только получить

информацию о генотипе в настоящем времени, но и проводить повторные анализы по мере накопления информации о новых причинных генах.

Для уточнения патогенности вариантов, выявленных при экзомном секвенировании, в большинстве случаев необходимо использовать дополнительные методы: секвенирование по Сенгеру для определения сегрегации, количественные методы анализа для подтверждения случайно выявленных крупных перестроек, функциональный анализ для доказательства влияния варианта на работу протеина.

При подозрении на НМСН, особенно при низких скоростях проведения импульса, необходимо помнить, что наиболее частой причиной болезни является крупная дупликация региона 17р11.2, обнаружение которой при секвенировании экзома практически невозможно, так как данный метод имеет свои ограничения по ти-

пам мутаций. Для детекции дупликации существуют простые, дешевые и надежные методы.

На сегодняшний день для диагностики НМСН все чаще предлагают использовать панели генов, основанные на методе массового параллельного секвенирова-ния. Однако представляется маловероятным, что какая-либо специфическая панель когда-нибудь охватит все гены периферических нейропатий, да и максимальные панели по своей стоимости и трудоемкости анализа сопоставимы с аналогичными параметрами клинического экзома. С другой стороны, если учитывать полученные нами результаты, у достаточно большого числа семей болезнь связана с хорошо известными, хотя и достаточно большими генами, такими как ми-тофузин. Исследование всей последовательности этих генов секвенированием по Сенгеру — достаточно трудоемкая задача.

о >

о

ЛИТЕРАТУРА / REFERENCES

1. Barreto L.C.L.S., Oliveira F.S., Nunes P.S. et al. Epidemiologic study of Charcot—Marie—Tooth disease:

a systematic review. Neuroepidemiology 2016;46(3):157-65. DOI: 10.1159/000443706. PMID: 26849231.

2. Baets J., Timmerman V. Inherited peripheral neuropathies: a myriad of genes and complex phenotypes. Brain 2011;134(6):1587-90. DOI: 10.1093/brain/awr114.

3. Drew A.P., Zhu D., Kidambi A. et al. Improved inherited peripheral neuropathy genetic diagnosis by whole-exome sequencing. Mol Genet Genomic Med 2015;3(2):143-54. DOI: 10.1002/ mgg3.126. PMID: 25802885.

4. Hartley T., Wagner J.D., Warman-Chardon J. et al. Whole-exome sequencing is a valuable diagnostic tool for inherited peripheral neuropathies: Outcomes from a cohort of 50 families. Clin Genet 2018;93(2):301-9.

DOI: 10.1111/cge.13101. PMID: 28708278.

5. Schabhuttl M., Wieland T., Senderek J.

et al. Whole-exome sequencing in patients with inherited neuropathies: outcome and challenges. J Neurol 2014;(261):970-82. DOI: 10.1007/s00415-014-7289-8. PMID: 24627108.

6. Gonzaga-Jauregui C., Harel T., Gambin T. et al. Exome sequence analysis suggests that genetic burden contributes to phenotypic variability and complex neuropathy. Cell Rep 2015;12(7):1169-83. DOI: 10.1016/j.celrep.2015.07.023. PMID: 26257172.

7. Richards S., Aziz N., Bale S. et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation

of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med 2015;(17):405-23. DOI: 10.1038/gim.2015.30. PMID: 25741868.

8. Щагина О.А., Дадали Е.Л., Федотов В.П., Поляков А.В. Спектр мутаций в гене MFN2 у больных наследственной моторно-сенсорной ней-ропатией II А типа. Медицинская генетика 2006;5(9):21-6. [Shchagina O.A., Dadali E.L., Fedotov V.P., Polyakov A.V. The spectrum of mutations in the MFN2 gene in patients with hereditary motor-sensory neuropathy type II A. Medicinskaya genetika = Medical genetics 2006;5(9):21-6. (In Russ.)].

9. Дадали Е.Л., Щагина О.А., Федотов В.П. Клинико-генетические особенности моторно-сенсорной ней-ропатии IIA типа. Анналы клинической и экспериментальной неврологии 2007;1(4):10-5. [Dadali E.L., Shchagina O.A., Fedotov V.P. Clinical and genetic features of type IIA motor-sensory neuropathy. Annaly klinicheskoj i ekspe-rimental'noj nevrologii = Annals

of Clinical and Experimental Neurology 2007;1(4):10-5. (In Russ.)].

10. Миловидова Т.Б., Дадали Е.Л.,

Федотов В.П. и др. Клинико-генетиче-кие корреляции при наследственной моторно-сенсорной нейропатии, вызванной мутациями в гене MPZ (P0).

Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова 2011;11Щ2):48-55. [Milovidova T.B., Dadali E.L., Fedotov V.P. et al. Clinical-genetic correlations in the hereditary motor-sensor neuropathy caused by mutations in the MPZ (P0) gene. Zhurnal nevrologii i psikhiatrii imeni S.S. Korsakova = S.S. Korsakov journal of neurology and psychiatry 2011;111(12):48—55. (In Russ.)].

11. Latour P., Thauvin-Robinet C., Baudelet-Méry C. et al. A major determinant for binding and aminoacylation of tRNAAla in cytoplasmic alanyl-trna synthetase

is mutated in dominant axonal charcot-marie-tooth disease. Am J Hum Genet 2010;86(1):77-82. DOI: 10.1016/j. ajhg.2009.12.005. PMID: 20045102.

12. Shchagina O.A., Milovidova T.B., Murtazina A.F. et al. HINT1 gene pathogenic variants: the most common cause of recessive hereditary motor and sensory neuropathies in Russian patients. Mol Biol Rep 2020;(47):1331-7.

DOI: 10.1007/s11033-019-05238-z.

13. Дадали Е.Л., Никитин С.С., Курбатов С.А. и др. Клинико-генети-ческие характеристики аутосомно-ре-цессивной аксональной нейропатии с нейромиотонией у больных из России. Нервно-мышечные болезни 2017;7(3): 47-55. [Dadali E.L., Nikitin S.S., Kurbatov S.A. et al. Clinical and genetic characteristics of autosomal recessive axonal neuropathy with neuromyotonia in Russian patients. Nervno-myshechnye bolezni = Neuromuscular diseases 2017;7(3):47-55. (In Russ.)].

DOI: 10.17650/2222-8721-2017-7-3-47-55.

т~. Вклад авторов

о О.А. Щагина: разработка дизайна исследования, формирование когорты больных, проведение валидации методом секвенирования по 0 Сенгеру, написание текста рукописи;

^ О.П. Рыжкова, А.Л. Чухрова, Т.Б. Миловидова, П. Гундорова, О.Л. Миронович: проведение всех этапов полноэкзомного секвенирования, о анализ и интерпретация полученных данных;

М.Д. Орлова: анализ дупликаций, секвенирование по Сенгеру, проведение всех этапов полноэкзомного секвенирования, анализ и интерпретация полученных данных;

А.В. Поляков: подбор последовательностей праймеров и проб, использованных в данной работе. Authors' contributions:

O.A. Shchagina: design of the study, formation of a patient's cohort, validation by Senger sequencing, manuscript preparation; O.P. Ryzhkova, A.L. Chukhrova, T.B. Milovidova, P. Gundorova, O.L. Mironovich: exome sequencing and data analysis; M.D. Orlova: PMP22 duplication analysis, Senger sequencing, exome sequencing and data analysis; A.V. Poliakov: primers and probes design.

ORCID авторов / ORCID authors'

О.А. Щагина / O.A. Shchagina: https://orcid.org/0000-0003-4905-1303 О.П. Рыжкова / O.P. Ryzhkova: https://orcid.org/0000-0003-1285-9093 А.Л. Чухрова / A.L. Chukhrova: https://orcid.org/0000-0002-5474-4713 Т.Б. Миловидова / T.B. Milovidova: https://orcid.org/0000-0002-0050-6947 П. Гундорова / P. Gundorova: https://orcid.org/0000-0001-8703-7997 О.Л. Миронович / O.L. Mironovich: https://orcid.org/0000-0003-0351-1271 А.А. Орлова / A.A. Orlova: https://orcid.org/0000-0002-8831-1844 М.Д. Орлова / M.D. Orlova: https://orcid.org/0000-0002-3743-094X А.В. Поляков / A.V. Poliakov: https://orcid.org/0000-0002-0105-1833

Благодарности. Авторы выражают благодарность научному сотруднику ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова» А.Ф. Муртазиной за исправления в процессе подготовки рукописи.

Gratitude. Authors express their gratitude to the researcher of Research Centre for Medical Genetics A.F. Murtazina for corrections during the preparation of the manuscript.

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.

Финансирование. Работа выполнена в рамках государственного задания Минобрнауки России для ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова».

Funding. The research was carried out within the state assignment of Ministry of Science and Higher Education of the Russia for Research Centre for Medical Genetics.

Информированное согласие. От всех исследованных пациентов, членов их семей или их законных представителей было получено информированное согласие на проведение исследования и публикацию результатов работы на условиях анонимности.

Informed consent. Written informed consent was obtained for genetic examination and publication with anonymity from all patients or their legal representatives.

Соблюдение прав пациентов и правил биоэтики. Протокол исследования одобрен локальным этическим комитетом ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова» (протокол № 2016-6/7 от 2016 г.).

Compliance with patient rights and principles of bioethics. The study protocol was approved by the local ethic committee of the Research Centre for Medical Genetics (protocol 2016-6/7 dates 2016).

Статья поступила: 17.04.2020. Принята к публикации: 24.11.2020. Article submitted: 17.04.2020. Accepted for publication: 24.11.2020.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.