Научная статья на тему 'Полиморфизм генов DC-SIGN -336A/G, MCP1 -2518A/G и INFy +874A/T у больных легочным туберкулезом в Иркутской области'

Полиморфизм генов DC-SIGN -336A/G, MCP1 -2518A/G и INFy +874A/T у больных легочным туберкулезом в Иркутской области Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
181
41
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ / M. TUBERCULOSIS / DC-SIGN / MCP1 / INFY / MIRU-VNTR / POLYMORPHISM OF GENES

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Синьков В. В., Огарков О. Б., Зоркальцева Е. Ю., Скворцова Р. Г., Савилов Е. Д.

Исследован полиморфизм генов DC-SIGN -336A/G, MCP1 -2518A/G и INFy +874A/T у 208 больных легочным туберкулезом и 177 здоровых жителей Иркутской области. Для 101 пациента выборки была исследована ДНК M. tuberculosis на полиморфизм MIRU-VNTR повторов и определена принадлежность к пекинскому и не пекинским семействам возбудителя туберкулеза. Проведенный статистический анализ не обнаружил достоверных различий между когортой больных и здоровых людей по всем трем исследуемым генам. При сравнении распределения генотипов по трем исследуемым генам человека между выборками пациентов пораженных пекинским и не пекинскими генотипами M. tuberculosis обнаружены статистически значимые различия в полиморфизме гена DC-SIGN -336A/G у мужчин. Делается предположение о роли пекинского генотипа M. tuberculosis в распространенности аллелей -336A и -336G DC-SIGN гена в человеческой популяции.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Синьков В. В., Огарков О. Б., Зоркальцева Е. Ю., Скворцова Р. Г., Савилов Е. Д.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Polymorphism of DC-SIGN -336A/G, MCP1 -2518A/G and INFY+874A/T genes in patients with pulmonary tuberculosis in Irkutsk region

We studied polymorphism of genes DC-SIGN-336A/G, MCP1 -2518A/G and INFy +874A/T in 208 patients with pulmonary tuberculosis and 177 healthy residents of the Irkutsk region. DNA of 101 isolates of M. tuberculosis from patients was analyzed by method MIRU-VNTR and identifi ed as Beijing or non-Beijing families. A statistical analysis found no signifi cant diff erence between the cohort of patients and healthy control in all three investigated genes. When comparing the distribution of genotypes for the three studied genes between samples of patients aff ected by Beijing and non-Beijing genotypes of M. tuberculosis were found statistically signifi cant diff erences in polymorphism DC-SIGN-336A/G for men. Th e role of Beijing genotype M. tuberculosis in distribution of alleles -336A and -336G of DC-SIGN gene in the human population is assumed.

Текст научной работы на тему «Полиморфизм генов DC-SIGN -336A/G, MCP1 -2518A/G и INFy +874A/T у больных легочным туберкулезом в Иркутской области»

Таким образом у больных АГ пожилого и старческого возраста высокое пульсовое АД по результатам суточного мониторирования АД является независимым от систолического АД фактором риска гипертрофии и дилатации левого желудочка сердца.

Среднесуточное пульсовое АД ассоциировано с увеличенной жесткостью аорты и атеросклерозом сосудов нижних конечностей. Повышенный уровень офисного пульсового АД является самостоятельным предиктором атеросклеротического поражения общей сонной артерии.

Высокое офисное пульсовое АД, в отличие от систолического АД, увеличивает риск снижения почечного клиренса креатинина. Не найдено взаимосвязей пульсового АД со степенью альбуминурии и креатининемии.

Генерализованное сужение артериол у больных АГ старше 75 лет сопряжено с повышением офисного среднего гемодинамического АД. Пульсовое АД не имеет самостоятельного прогностического значения в развитии гипертонической ангиопатии глазного дна.

ЛИТЕРАТУРА

1. Ощепкова М.В., Зелвеян П.А., Буниатян М.С. и др. Пульсовое артериальное давление (по данным суточного мониторирования) и структурные изменения миокарда левого желудочка у больных гипертонической болезнью // Тер. арх. —

2002. — №12. — С.21-24.

2. Benetos A., Safar M., Rudnichi A., et al. Pulse pressure. A predictor of long-term cardiovascular mortality in a French male population // Hypertension. — 1997. — Vol. 30. — P. 1410-1415.

3. Blacher J., Staessen J.A., Girerd X. Pulse pressure not mean pressure determines cardiovascular risk in older hypertensive patients // Arch. Intern. Med. — 2000. — Vol. 160. — P. 10851089.

4. Franklin S.S., Gustin W.G., WongN.D., et al. Hemodynamic patterns of age-related changes in blood pressure: the Framingham Heart Study // Circulation. — 1997. — Vol. 96. — P. 308-315.

5. Franklin S.S., Khan S.A., Wong N.D., et al. Is pulse pressure useful in predicting risk of coronary heart-disease? The Framingham Heart Study // Circulation. — 1999. — Vol. 100. — P. 354-360.

6. Hubbard L.D., Brothers R.J., King W.N., et al. Methods for evaluation of retinal microvascular abnormalities associated with hypertension/sclerosis in the Atherosclerosis Risk In Communities study // Ophthalmology. — 1999. — Vol. 106. — P. 2269-2280.

7. Inoue R., Ohkubo T., Kikuya M., et al. Predicting stroke using 24 ambulatory blood pressure monitoring-derived blood pressure

indices: The Ohasama Study // Hypertension. — 2006. — Vol. 48. — P. 877-882.

8. Leung H., Wang J.J., Rochtchina E., et al. Relationships between age, blood pressure, and retinal vessel diameters in an older population // Investigative Ophthalmology & Visual Science. —

2003. — Vol. 44. — P. 2900-2904.

9. Madhavan S., Ooi W.L., Cohen H., Alderman M.H. Relation of pulse pressure and blood pressure reduction to the incidence of myocardial infarction // Hypertension. — 1994. — Vol. 23. — P. 395-401.

10. Mazza A., TikhonoffV., Casiglia E., Pessina A.C. Predictors of congestive heart failure mortality in elderly people from the general population // Int. Heart. J. — 2005. — Vol. 46, №3. — P 419-431.

11. Perry Jr. H.M., Miller P.J., FornoffJ.R., et al. Early predictors of 15-year end-stage renal disease in hypertensive patients // Hypertension. — 1995. — Vol. 25. — P. 587-594.

12. Sharrett A.R., Hubbard L.D., Cooper L.S., et al. Retinal arteriolar diameters and elevated blood pressure The Atherosclerosis Risk In Communities Study // Am. J. Epidemiol. — 1999. — Vol. 150, N. 3. — P. 263-270.

13. 2007 Guidelines for the management of arterial hypertension. The task force for the management of arterial hypertension of the ESH and ESC // J. Hypertens. — 2007. — Vol. 25, № 6. — P. 1105-1187.

Адрес для переписки: 664079, г. Иркутск, м/р Юбилейный, 100, ИГИУВ. Дзизинский Александр Александрович — д.м.н., проф., чл.-корр РАМН;

Протасов Константин Викторович — доцент; Синкевич Денис Алексеевич — ассистент, к.м.н.

© СИНЬКОВ В.В., ОГАРКОВ О.Б., ЗОРКАЛЬЦЕВА Е.Ю., СКВОРЦОВА Р.Г., САВИЛОВ Е.Д., ВОРОБЬЕВА Д.В., КОРЧИНА С.И., ЖДАНОВА С.Н., КОСЕНКОВА Д.В., МЕДВЕДЕВА Т.В. — 2009

ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ DC-SIGN —336A/G( MCP1 —25^^ И INFY +874A/T У БОЛЬНЫХ ЛЕГОЧНЫМ ТУБЕРКУЛЕЗОМ В ИРКУТСКОЙ ОБЛАСТИ

В.В. Синьков, О.Б. Огарков, 2Е.Ю. Зоркальцева, 2Р.Г. Скворцова, 3Е.Д. Савилов,

2Д.В. Воробьева, 2С.И. Корчина, 3С.Н. Жданова, 4Д.В. Косенкова, ‘Т.В. Медведева ('Иркутский областной клинический консультативно-диагностический центр, гл. врач — к.м.н. И.В. Ушаков, отдел патоморфологии, зав. — к.м.н. С.С. Голубев, отдел лабораторной диагностики, зав. — к.б.н. О.Б. Огарков; 2Иркутский институт усовершенствования врачей, ректор — д.м.н. проф. В.В. Шпрах, кафедра туберкулеза — зав. — д.м.н. Е.Ю. Зоркальцева; кафедра лабораторной диагностики, зав. — д.б.н., проф. Р.Г. Скворцова;

3НИИ эпидемиологии и микробиологии НЦПЗС СО РАМН, директор — к.м.н. Л.В.Миронова, лаборатория эпидемиологии антропонозных инфекций, зав. — д.м.н., проф. Е.Д. Савилов, 4Иркутский государственный медицинский университет, ректор — д.м.н., проф. И.В. Малов, кафедра патологии, зав. — д.м.н., проф. И.Ж. Семинский)

Резюме. Исследован полиморфизм генов DC-SIGN —336A/G, MCP1 —2518A/G и INFy +874A/T у 208 больных легочным туберкулезом и 177 здоровых жителей Иркутской области. Для 101 пациента выборки была исследована ДНК M. tuberculosis на полиморфизм MIRU-VNTR повторов и определена принадлежность к «пекинскому» и «не пекинским» семействам возбудителя туберкулеза. Проведенный статистический анализ не обнаружил достоверных различий между когортой больных и здоровых людей по всем трем исследуемым генам. При сравнении распределения генотипов по трем исследуемым генам человека между выборками пациентов пораженных «пекинским» и «не пекинскими» генотипами M. tuberculosis обнаружены статистически значимые различия в полиморфизме гена DC-SIGN —336A/G у мужчин. Делается предположение о роли «пекинского» генотипа M. tuberculosis в распространенности аллелей —336A и —336G DC-SIGN гена в человеческой популяции.

Ключевые слова: полиморфизм генов, DC-SIGN, MCP1, INFy, MIRU-VNTR, M. tuberculosis.

POLYMORPHISM OF DC-SIGN —336A/G, MCP1 —2518A/G AND INFY +874A/T GENES IN PATIENTS WITH PULMONARY TUBERCULOSIS IN IRKUTSK REGION

IV.V. Sinkov, IO.B. Ogarkov, 2E.Yu. Zorkaltseva, 2R.G. Skvortsova, 3E.D. Savilov,

2O.A. Vorob'eva, 2S.I. Korchina, 3S.N., Zhdanova, 4D.V. Kosenkova, IT.V. Medvedeva

(Irkutsk Regional Diagnostic Center;

2Irkutsk State Institute for Medical Advanced Studies;

3Institute of Epidemiology and Microbiology, Siberian Division of Russian Academy of Medical Sciences;

4State Medical University)

Summary. We studied polymorphism of genes DC-SIGN-336A/G, MCP1 —2518A/G and INFy +874A/T in 208 patients with pulmonary tuberculosis and 177 healthy residents of the Irkutsk region. DNA of 101 isolates of M. tuberculosis from patients was analyzed by method MIRU-VNTR and identified as «Beijing» or «non-Beijing» families. A statistical analysis found no significant difference between the cohort of patients and healthy control in all three investigated genes. When comparing the distribution of genotypes for the three studied genes between samples of patients affected by «Beijing» and «non-Beijing» genotypes of M. tuberculosis were found statistically significant differences in polymorphism DC-SIGN-336A/G for men. The role of «Beijing» genotype M. tuberculosis in distribution of alleles —336A and —336G of DC-SIGN gene in the human population is assumed.

Key words: Polymorphism of genes, DC-SIGN, MCP1, INFy, MIRU-VNTR, M. tuberculosis.

Mycobacterium tuberculosis является широко распространенным возбудителем. В 2007 году зарегистрировано 1,75 миллионов случаев смерти от туберкулеза и 9,27 миллиона новых случаев заболевания [1]. «Пекинский» генотип этого возбудителя является доминирующим во многих регионах мира и в значительной мере отвечает за текущую пандемию данного заболевания [11]. Более того, считается, что для регионов с высоким распространением «пекинского» генотипа БЦЖ вакцинация может быть малоэффективна [4]. Иркутская область не является исключением, по нашим данным около 50% штамов возбудителя туберкулеза в этом регионе принадлежит к «пекинскому» семейству [2].

Первой линией обороны от патогенов являются неспецифические реакции организма, отвечающие за раннее распознавание и утилизацию микроорганизмов. В первую очередь к эффекторам этого звена иммунной системы относятся фагоциты — макрофаги и дендритные клетки. Фагоцитирующие клетки экспрессируют ряд клеточных рецепторов, известных как паттерн-распознающие (pattern recognition receptors) [13]. На одном из таких рецепторов — CD209 (ген DC-SIGN) в последнее время сосредоточено внимание многих исследователей в связи с его важной ролью при туберкулезе [15] и ряде других инфекций [13]. Несмотря на то, что для жителей Южной Африки была обнаружена протективная роль аллелей —871G и —336A, гена DC-SIGN при туберкулезной инфекции [6], аналло-гичное, исследование полиморфизма гена DC-SIGN у жителей Колумбии (Южная Америка) не выявило достоверных различий между когортой больных туберкулезом и здоровыми людьми [9].

Проведенное нами ранее исследование [3] так же не выявило значимых различий в полиморфизме этого гена у больных легочным туберкулезом и контрольной группы, однако, было обнаружено достоверное снижение

встречаемости —336G аллеля гена DC-SIGN у пациентов пораженных «пекинским» генотипом M tuberculosis. Причина такого явления может лежать в различной реакции иммунной системы на доминирующий во всем мире «пекинский» генотип M tuberculosis по сравнению со всеми остальными семействами туберкулезных штаммов [5]. Дополнительно нами были выбраны два гена, полиморфизм которых у больных туберкулезом в ряде популяций людей достоверно отличался от контрольной группы — гены MCP1 —2518A/G и INFY +874A/T. Для двух популяций — жителей Мексики и Кореи было показано достоверное различие в распределении генотипов между больными легочным туберкулезом и здоровыми людьми в промоторе гена монцитарного хемоатрактив-ного белка 1 (MCP1 —2518A/G). [8]. Для больных легочным туберкулезом из Хорватии было показано, что у пациентов-носителей аллеля +874A гена гамма интерферона (INFY) достоверно чаще встречается микробиологически подтвержденный туберкулез [7].

Задачей настоящего исследования было сравнение генетического полиморфизма группы больных легочным туберкулезом по сравнению с контрольной группой по полиморфизму генов DC-SIGN —336A/G, MCP1 —2518A/G и INFy +874A/T с учетом распределения штаммов M tuberculosis по генетическим семействам, определенных методом MIRU-VNTR типирования.

Материалы и методы

Сбор биологических образцов. Использование проводили в 2-х выборках, составленных из жителей Иркутской области, преимущественно славянской национальности. Первая выборка — клинические образцы (кровь или щечный соскоб), полученные от 208 больных легочным туберкулезом, проходивших лечение

в 2004-2008 гг. в областном противотуберкулезном диспансере. Для 101 пациента данной выборки были исследованы штаммы M. tuberculosis на полиморфизм MIRU-VNTR повторов [12]. Вторая выборка — 177 образцов (кровь, щечный или урогенитальный соскоб), полученных от здоровых людей, проходивших плановый медицинский осмотр или исследование на инфекции, передающиеся половым путем, в Иркутском диагностическом центре (ИДЦ). В качестве критерия отбора контрольной группы использовали следующие параметры: отсутствие в анамнезе туберкулеза, сахарного диабета и

Taблuua 1

Структуры и концентрации использованных праймеров и зондов

Название Структура Конечная концентрация в ПЦР мкМ

DCSIGN —33б For 5'-ACT GTG TTA CAC CCC CTC CAC TAG-3' 0,3

DCSIGN —33б Rev 5'-AGG AAA GCC AGG AGG TCA CA-3' 0,3

DCSIGN Probe G 5'- R6G-CTGC(C-LNA)(C-LNA)(A-LNA)CCCTTGC —BHQ1- 3' 0,1

DCSIGN Probe A 5'- FAM-CTGC(C-LNA)(T-LNA)(A-LNA)CCCTTGC-BHQ1- 3' 0,1

MCP1 —2518 For 5'-GGG AGG GCA TCT TTT CTT GAC-3' 0,3

MCP1 —2518 Rev 5'- GGT GAA GGG TAT GAA TCA GAA AAG A-3 0,3

MCP1 Probe A 5'- R6G-GACAG(C-LNA)T(A-LNA)T(LNA-C)A(C-LNA)TTTC-BHQ1- 3' 0,1

MCP1 Probe G 5'- FAM-GACAG(C-LNA)T(G-LNA)T(LNA-C)A(C-LNA)TTTC-BHQ1- 3' 0,1

INFy +874 For 5'-TCA GAC ATT CAC AAT TGA TTT TAT TCT TAC —3' 0,3

INFy +874 Rev 5'-CCT TCC TGT AGG GAT TTA TTA TAC GAG C-3' 0,3

INFy Probe A 5'- FAM-CAAAATCAA(LNA-A)TC(LNA-A)CAC(A-LNA)CAC —BHQ1- 3' 0,1

INFy Probe T 5'- R6G-CAAAATCAA(LNA-A)TC(LNA-T)CAC(A-LNA)CAC-BHQ1- 3' 0,1

Таблица 2

-336 A/G полиморфизм промотора гена DC-SIGN

Группа Аллель Генотип

A G AA AG GG

Здоровые 291/354 (0.82) 63/354 (0.18) 119/177 (0.67) 53/177 (0.30) 5/177 (0.03)

Больные туберкулезом 342/416 (0.82) 74/416 (0.18) 141/208 (0.68) 60/208 (0.29) 7/208 (0.03)

Больные туберкулезом пораженные «пекинским» генотипом 74/88 (0.84) 14/88 (0.16) 31/44 (0.71) 12/44 (0.27) 1/44 (0.02)

Больные туберкулезом пораженные «не пекинским» генотипом 88/114 (0.77) 26/114 (0.23) 33/57 (0.58) 22/57 (0.39) 2/57 (0.03)

других гормональных нарушений. Данные о пациентах и клинических образцах получали с помощью информационных систем МИС и ЛИС ИДЦ (http://www.dc.baikal. ru/company/teh/mis/).

ДНК от больных туберкулезом и здоровых индивидуумов выделяли из урогенитальных или щечных со-скобов и концентрата полиморфноядерных лейкоцитов (ПЯЛ) крови с помощью набора «ДНК-сорб» производства ЦНИИ Эпидемиологии по протоколу производителя. Концентрат ПЯЛ получали как описано ранее [3].

Сбор клинических изолятов. Выделение ДНК микобактерий и MIRU-VNTR типирование проводили, как описано ранее [2]. Принадлежность исследованных MIRU-VNTR паттернов к известным семействам туберкулезных штаммов определяли по алгоритмам предложенным S. Ferdinand с соавт. [10] и нами [2].

Полиморфизм генов DC-SIGN в позици —336A/G (rs4804803), MCP1 —2518A/G (rs1024611) и INFy+874A/T (rs2430561) определяли методом ПЦР в реальном времени с использованием праймеров и LNA-зондов раз-работаных и синтезированных НПФ «Синтол» (Россия) на амплификаторе iQ-Cycler (БиоРад, США). Структуры праймеров и зондов приведены в таблице 1.

ПЦР проводили в 15 мкл реакционой смеси следующего состава: 1х ПЦР буфер (Интерлабсервис); 3 мМ MgSO4 (Интерлабсервис); Смесь олигонуклеотидов и зондов (Синтол) в эквимолярных концентрациях (см. табл. 1); 4NTP (Интерлабсервис) в конечной концентрации 200 мкМ каждого нуклеотида; Модифицированная TaqF полимераза (Интерлабсервис) по 1 ед. на реакцию; ДНК образец в концентрации около 50 нг на реакцию. ПЦР инициировали 15-ти минутным прогревом реакционной смеси при 95о С (для активации TaqF полимеразы) с последующей амплификацией в течение 45 циклов, состоящей из этапов: Плавление при 95о — 30 сек.; Отжиг при 56о-67о (в зависимости от расчетной температуры каждого набора) — 30 сек.; Элонгация при 72о — 20 сек.

Статистическую обработку данных проводили с помощью статистического пакета R [14].

Частоты аллелей и генотипов, соответствие распределения частот генотипов равновесию Харди-Ванберга определяли в модуле «genetics» пакета R. Половозрастные различия между группами сравнивали с использованием непараметрического критерия Манна-Уитни. Отношение шансов (ОШ) и его доверительный интервал (ДИ) выявления того или иного генотипа и их комбинаций в исследуемых группах вычисляли методом критерия точности Фишера.

Проверку значимости различий частот аллелей и генотипов среди

исследуемых групп проводили с использованием метода хи-квадрата Пирсона. Для изучения связи между признаками использовали логистическую регрессию.

Результаты и обсуждение

Исследовано 208 больных легочным туберкулезом, из которых 79 женщин и 129 мужчин, средний возраст 40,3±12,4. В контрольную группу входило 177 здоровых человек (50 женщин и 127 мужчин), средний возраст 38,9± 13,3. Между всеми группами не наблюдалось значимых различий по возрасту в соответствии с критерием Манна-Уитни. Распределение генотипов во всех выборках соответствовало ожидаемому при равновесии Харди-Вайнберга.

В таблицах 2, 3 и 4 приведены абсолютные и относительные частоты генотипов и аллелей для генов DC-SIGN —336A/G, MCP1 —2518A/G и INFy +874A/T. Как видно из таблиц 2-4 вариабельность однонуклеотидного полиморфизма (SNP) между выборкой больных легочным туберкулезом и группой здоровых индивидуумов не достоверна. Нет различий в распределении генотипов между группами больных легочным туберкулезом, вызванным «пекинским» и «не пекинскими» генотипами. Следует отметить, что, в той же популяции больных легочным туберкулезом проживающих в Иркутской области, ранее нами [3] обнаруживалась статистически значимая разница распределения аллелей и генотипов при изучении полиморфизма DC-SIGN —336A/G у больных пораженных «пекинскими» и «не пекинскими» штаммами. Из табл. 2 видно, что, несмотря на на имеющийся тренд в преимущественном поражении «пекинским» семейством M. tuberculosis носителей AA и AG генотипов гена DC-SIGN в анализируемой выборке это явление не достигает статистически занчимых величин. Дальнейший углубленный анализ данных показал, что ранее описаное [3] явление различий в распределении аллеля —336G в гене DC-SIGN у пациентов пораженных «пекинским» и «не пекинскими» генотипами все таки достигает значимых величин в исследуемой выборке, но только у мужчин. Так, среди 77 штаммов выделенных от мужчин больных легочным туберкулезом и изученых в настоящем исследовании, 32 штммма принадлежали «пекинскому» генотипу и 45 «не пекинскому». Распределение генотипов у больных, пораженных «пекинским» генотипом было следующим: AA-26; AG-5; GG-1. Распределение генотипов по аллелям у больных, пораженных «не пекинским» генотипом было: AA-24; AG-20; GG-1. Соотношение A/G аллелей для пораженных «пекинским» генотипом составило 57/7, а анало-

Таблица 3

-2518A/G полиморфизм промотора гена MCP1

Группа Аллель Генотип

A G AA AG GG

Здоровые 253/354 (0.72) 101/354 (0.28) 90/177 (0.51) 73/177 (0.41) 14/177 (0.08)

Больные туберкулезом 291/416 (0.70) 125/416 (0.30) 104/208 (0.50) 83/208 (0.40) 21/208 (0.10)

Больные туберкулезом пораженные «пекинским» генотипом 64/88 (0.73) 24/88 (0.27) 24/44 (0.55) 16/44 (0.36) 4/44 (0.09)

Больные туберкулезом пораженные «не пекинским» генотипом 80/114 (0.70) 34/114 (0.30) 26/57 (0.46) 28/57 (0.49) 3/57 (0.05)

Таблица 4

+874A/T полиморфизм промотора гена INFy

Группа Аллель Генотип

A T AA AT TT

Здоровые 212/354 (0.6) 142/354 (0.4) 68/177 (0.38) 76/177 (0.43) 33/177 (0.19)

Больные туберкулезом 249/416 (0.6) 167/416 (0.4) 75/208 (0.36) 99/208 (0.48) 34/208 (0.16)

Больные туберкулезом пораженные «пекинским» генотипом 51/88 (0.58) 37/88 (0.42) 14/44 (0.32) 23/44 (0.52) 7/44 (0.16)

Больные туберкулезом пораженные «не пекинским» генотипом 64/114 (0.56) 50/114 (0.44) 18/57 (0.32) 28/57 (0.49) 11/57 (0.19)

гичное соотношение для пораженных «не пекинским» генотипом 68/22 (хи-квадрат=7,0 р=0,03) (ОШ=2,62 (ДИ 1,0-7,8), р=0,04). Методом логистической регрессии была выявлена связь между наличием «пекинского» штамма и частотой встречаемости Л/О аллелей (Б статистика = 3,8, р=0,03) Для двух других 8ЫР МСР1 —2518Л/О и ЮТу +874Л/Т нами не было обнаружено никаких значимых отличий по всем вышеописаным выборкам. В соответствии с гипотезой выдвинутой Ваггаго с соавторами [6] аллель —336Л является протективным при туберкулезе легких. Среди мужчин, носителей «пекинского» генотипа в данном исследовании наблюдалось увеличение частоты аллеля А за счет числа АА гомозигот. Это позволяет предположить, что «пекинский» генотип, возможно, является фактором, способствующим элиминации из популяции минорного О аллеля

и накопления мажорного A аллеля. Известно, что G аллель неравномерно распространен среди различных рас: азиатская группа 5,8%, европейская группа 20.9%, африканская группа от 37,8 до 42.8% [6]. Возможно это связано с особенностями распространения «пекинского» генотипа среди человеческой популяции. Проведенное исследование позволило нам сделать ряд выводов.

Таким образом, исследованный однонуклеотидный полиморфизм в трех генах человека DC-SIGN —336A/G, MCP1 —2518A/G и INFy +874A/T не выявил достоверных различий между выборками больных легочным туберкулезом и здоровым контролем. Распределение аллелей в —336A/G DC-SIGN гена среди пораженных «пекинским» генотипом мужчин достоверно отличается от аналогичного распределения среди пораженных штаммами «не пекинских» семейств. При этом данная закономерность не распространяется на два других исследованных SNP —2518A/G и INFy +874A/T, что вероятно свидетельствует о наибольшем влиянии —336A/G DC-SIGN полиморфизма на функционирование иммунной системы при туберкулезе по сравнению с другими исследованными SNP. Распространенность —336G аллеля гена DC-SIGN в популяции жителей Иркутской области несколько ниже, чем у европейцев, но выше чем у азиатов. Нельзя исключать, что наименьшее распространение —336G аллеля в азиатской популяции, связанно имменно с максимальным распространением «пекинского» генотипа M. tuberculosis именно в Азии.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

ЛИТЕРАТУРА

1. Доклад ВОЗ 2009г. — Глобальная борьба с туберкулезом. http://www.who.int/tb/publications/global_report/2009/key_ points/ru/index.html

2. Огарков О.Б., Медведева Т.В., Zozio с соавт. Молекулярное типирования штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000-2005 г. // Молекулярная медицина. — 2007. — №2. — С. 33-38.

3. Огарков О.Б., Медведева Т.В., Некипелов О.М. с соавт. Изучение полиморфизма гена DC-SIGN у больных, пораженных штаммами of Mycobacterium tuberculosis различных генотипов в Иркутской области // Пробл. туб. — 2007. — №11. — С. 37-42.

4. Abebe F., Bjune G. The emergence of Beijing family genotypes of Mycobacterium tuberculosis and low-level protection by bacille Calmette-Guerin (BCG) vaccines: is there a link? // Clinical and Experimental Immunology. — 2006. — Vol. 145. — P. 389-397.

5. Barnes W. S., Samten P. F., Pang B., et al. Activation of the eis gene in a W-Beijing strain of Mycobacterium tuberculosis correlates with increased SigA levels and enhanced intracellular growth // Microbiology. — 2009. — Vol. 155(Pt 4). — P1272-1281.

6. Barreiro, L.B., Neyrolles O., Babb C.L., et al Promoter variation in the DC-SIGN- encoding gene CD209 is associated with tuberculosis. // PLoS Med. — 2006. — Vol. 3. — N.2. e20. — P. 1-6.

7. Etokebe G.E., Bulat-Kardum L., Johansen M.S., et al Interferon-g Gene (T874A and G2109A) Polymorphisms Are Associated With Microscopy-positive Tuberculosis. // Scand J Immunol. — 2004. — Vol.59(5). — P.496-503.

8. Flores-Villanueva P.O., Ruiz-Morales J.A., Song C.H., et al. A functional promoter polymorphism in monocyte chemoattractant

protein-1 is associated with increased susceptibility to pulmonary tuberculosis.// J. Exp. Med. — 2005. — V. 202. — P. 1649-1658.

9. Gomez L.M., Anaya J.M., Sierra-Filardi E. Analysis of DC-SIGN (CD209) functional variants in patients with tuberculosis. // Hum Immunol. — 2006. — Vol.67. —N.10. — P808-811.

10. Ferdinand S, Valetudie G, Sola C, Rastogi N. Data mining of Mycobacterium tuberculosis complex genotyping results using mycobacterial interspersed repetitive units validates the clonal structure of spoligotyping-defined families. // Res Microbiol. — 2004 — Vol.155. — N.8. — P647-654.

11. Mathema B., Kurepina N.E., Bifani P.J., Kreiswirth B.N. Molecular Epidemiology of Tuberculosis: Current Insights // Clinical Microbiology Reviews. — 2006. — Vol.19. — N.4. — P 658-685.

12. Mazars E., Lesjean S., Banuls. A.L., et al High-resolution minisatellite-based typing as a portable approach to global analysis of Mycobacterium tuberculosis molecular epidemiology // PNAS. — 2001.- Vol.98. — N.4. — P1901-1906.

13. Neyrolles O., Gicquel B., Quintana-Murci L. Towards a crucial role for DC-SIGN in tuberculosis and beyond // TRENDS in Microbiology. — 2006. — Vol.14. — N.9. — P.383-387.

14. R Development Core Team (2009). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. iSBN 3-900051-07-0, http://www.R-project.org.

15. Tailleux L., Schwartz O., Herrmann J., et al. DC- SIGN is the major Mycobacterium tuberculosis receptor on human dendritic cells. // J. Exp. Med. — 2003. — Vol.197. — P. 121-127.

Адрес для переписки: 664047, г. Иркутск, Байкальская 109. Иркутский диагностический центр.

Огарков Олег Борисович, к.б.н., зав. отделом лабораторной диагностики.

Тел. раб.: (3952) 211-236.

E-mail: [email protected]

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.