Научная статья на тему 'ПОИСК ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ, РЕГУЛИРУЮЩИХ ТРАНСКРИПТОМ СКЕЛЕТНОЙ МЫШЦЫ ЧЕЛОВЕКА ПРИ РЕЗКОМ СНИЖЕНИИ ДВИГАТЕЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ'

ПОИСК ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ, РЕГУЛИРУЮЩИХ ТРАНСКРИПТОМ СКЕЛЕТНОЙ МЫШЦЫ ЧЕЛОВЕКА ПРИ РЕЗКОМ СНИЖЕНИИ ДВИГАТЕЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
29
10
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
СКЕЛЕТНАЯ МЫШЦА / ГИПОКИНЕЗИЯ / "СУХАЯ" ИММЕРСИЯ / ТРАНСКРИПТОМ / ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ ФАКТОР / РНК СЕКВЕНИРОВАНИЕ / ПОЗИЦИОННАЯ ВЕСОВАЯ МАТРИЦА / ОТКРЫТЫЙ ХРОМАТИН
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Попов Д.В., Махновский П.А., Борзых А.А., Леднев Е.М., Вепхвадзе Т.Ф.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «ПОИСК ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ, РЕГУЛИРУЮЩИХ ТРАНСКРИПТОМ СКЕЛЕТНОЙ МЫШЦЫ ЧЕЛОВЕКА ПРИ РЕЗКОМ СНИЖЕНИИ ДВИГАТЕЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ»

МАТЕРИАЛЫ V НАЦИОНАЛЬНОГО КОНГРЕССА ПО РЕГЕНЕРАТИВНОЙ МЕДИЦИНЕ

187

ПОИСК ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ, РЕГУЛИРУЮЩИХ ТРАНСКРИПТОМ СКЕЛЕТНОЙ МЫШЦЫ ЧЕЛОВЕКА ПРИ РЕЗКОМ СНИЖЕНИИ ДВИГАТЕЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ

Д.В. Попов1, 2, П.А. Махновский1, А.А. Борзых1, Е.М. Леднев1, Т.Ф. Вепхвадзе1, 2, Н.С. Курочкина1, Е.С. Томиловская1, О.И. Орлов1

1 Институт медико-биологических проблем РАН, Москва, Россия

2 МГУ им. М.В. Ломоносова, Москва, Россия

e-mail: danil-popov@Yandex.ru

Ключевые слова: скелетная мышца, гипокинезия, «сухая» иммерсия, транскриптом, транскрипционный фактор, РНК секвенирование, позиционная весовая матрица, открытый хроматин.

Резкое снижение двигательной активности (постельный режим, микрогравитация в космосе и т. п.) оказывает негативное влияние на функции скелетных мышц и на организм в целом. Так, уже через неделю гипокинезии происходит снижение мышечной массы (~0,4%/ день) и силы, митохондриальной плотности, активности окислительных ферментов и работоспособности, а также инсулиновой чувствительности мышц и организма. Эти изменения связаны с подавлением трансляции, увеличением деградации мышечных белков и с масштабными изменениями в генной экспрессии. Изменение транс-криптомного профиля скелетных мышц, вызванное гипокинезией, достаточно хорошо охарактеризовано [1, 2], однако регуляторные механизмы, ответственные за эти изменения (в частности, транскрипционные факторы и ассоциированные с ними сигнальные пути), изучены явно недостаточно.

В докладе обсуждается влияние резкого снижения двигательной активности (6 суток нахождения в «сухой» иммерсии) на изменения транскриптомного профиля (RNA-seq) m. soleus — основной постуральной мышцы, состоящей преимущественно из медленных мышечных волокон, и смешанной m. vastus lateralis. В базальном состоянии генная экспрессия значительно различается между этими мышцами (~1500 мРНК). Нахождение в иммерсии вызывает значительно более выраженные изменения транскриптома в m. soleus (562 мРНК увеличили и 996 мРНК снизили экспрессию), чем в m. vastus lateralis (209 мРНК увеличили и 392 мРНК снизили экспрессию).

Среди генов, изменивших экспрессию, были выделены кластеры со сходным экспрессионным профилем — предположительно, корегулируемые гены. Поиск транскрипционных факторов, ассоциированных с изменением экспрессии, проводили для каждого кластера методом позиционных весовых матриц. Для этого искали мотивы связывания транскрипционных факторов в индивидуальном для каждого гена промоторном регионе — открытый хроматин вокруг старта инициации транскрипции, определённый в нашем предыдущем исследовании [3] по данным ATAC-seq, DNase-seq и CAGE-seq.

Предложенный нами подход позволил выявить группы коэкспрессируемых генов и несколько десятков транскрипционных факторов, ассоциированных с разнонаправленными изменениями генной экспрессии в них. Часть из этих транскрипционных факторов выделены как потенциальные мишени для предотвращения негативного влияния гипокинезии на функции скелетных мышц. Значимость этих факторов для развития указанных

негативных эффектов требует дальнейшей проверки в модельных исследованиях с подавлением/увеличением генной экспрессии на клетках и/или животных. При поддержке Минобрнауки России в рамках соглашения № 075-15-2022-298 от 18.04.2022 г.

Литература:

1. Pillon N.J., Gabniel B.M., Dollet L. et al. Nat Commun. 2020. V. 11(1). P. 470.

2. Makhnovskii P.A., Bokov R.O., Kolpakov F.A., et al. Int J Mol Sci.

2021. V. 22(3). P. 1208.

3. Makhnovskii P.A., Gusev O.A., Bokov R.O., et al. Hum Genomics.

2022. V. 16(1). P. 24.

ТРАНСПЛАНТАЦИЯ КАРДИОМИОБЛАСТОВ ПОЖИЛЫМ ПАЦИЕНТАМ С КАРДИОТОКСИЧЕСКИМИ ЭФФЕКТАМИ ХИМИОТЕРАПИИ

О.Е. Поповкина, Л.Ю. Гривцова

МРНЦ им. А.Ф. Цыба - филиал ФГБУ НМИЦ радиологии Минздрава России, Обнинск, Россия

e-mail: popovkinaoe@mail.ru

Ключевые слова: кардиотоксичность, хроническая сердечная недостаточность (ХСН), перфузия миокарда, кардиомио-бласты, трансплантация, сократительная функция миокарда.

Актуальность: кардиотоксичность противоопухолевой терапии у пожилых пациентов чаще всего проявляется в виде ХСН, встречается от 5 до 57% [1, 2]. Существующие методы лечения не приводят к восстановлению количества утраченных кардиомиоцитов и уменьшению фиброза в миокарде, что могло бы увеличить сократимость и уменьшить прогрессирование ХСН [3].

Цель: оценить влияние трансплантации кардиоми-областов на показатели сократимости и перфузии миокарда при проведении химиотерапии (ХТ) у пожилых пациентов.

Материалы и методы: 3 группы пациентов (22 мужчины, 38 женщин с сердечно-сосудистой патологией и онкологическими заболеваниями в возрасте от 65 до 80 лет): 1-я — клеточная терапия после возникновения карди-отоксических эффектов на фоне ХТ, 2-я — превентивное введение кардиомиобластов, 3-я — контроль (медикаментозная терапия). Распределение пациентов по классификации NYHA: ХСН1 — 35%, ХСН11 — 43,75%, ХСН111 — 21,25%. Контроль структурно-функциональных показателей — ЭхоКГ и сцинтиграфия миокарда с Тс99т через 2, 6, 12 месяцев.

Результаты: по данным ЭхоКГ ФВ ЛЖ значимо (р <0,05) увеличилась в группах 1 и 2. В 3-й группе ФВ снижалась. Данные коррелировали с динамикой встречаемости гипокинеза участков миокарда ЛЖ в группах. По данным сцинтиграфии выявлено усиление перфузии миокарда в ответ на трансплантацию кардиомиобластов у больных с клинически выраженной ХСН. При введении кардиомиобластов в 1-й группе перфузия миокарда усиливалась на длительный период, но в меньшей степени, чем в группе 2. Положительная динамика отмечена во все сроки контроля, максимальна — через 6 мес. В 3-й группе — начиная с 2-го месяца, отмечена отрицательная динамика на фоне постоянной кардиотропной терапии. Прогрессирования основного заболевания за 12 месяцев наблюдения не отмечено.

Выводы: применение трансплантации кардиоми-областов пожилым пациентам с онкологическими

Гены & Клетки XVII, №3, 2022

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.