CC BY
86
СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННАЯ БИОЛОГИЯ, 2012, № 4
Рецензии
Падкина М.В., Залуцкая Ж.М., Лапина Т.В., Самбук Е.В., Ермилова Е.В. Протеомика микроорганизмов и растений. Принципы, технологии и практическое использование /Под ред. Е.В. Ермиловой. СПб, изд-во ТЕССА, 2012, 148 с.
Рецензируемая монография посвящена одному из бурно развивающихся направлений современной биологии, предметом изучения которого служат белки и их взаимодействия внутри клеток. В русскоязычной литературе отсутствует монография, учебник или какое-либо пособие по протеомному анализу. Это издание, на наш взгляд, удачно заполняет образовавшийся пробел и представляет интерес для всех специалистов в области протеомики, хотя в нем возможности, основные принципы и технологии протеомного анализа изложены на примере микроорганизмов и растений.
Монография состоит из семи глав. В первой («Протеомика в по-стгеномную эру») подробно охарактеризованы ключевые направления исследований, позволяющих получать качественно новые результаты, изучать функции и взаимодействия белков, их роль в биологических процессах. Авторы предлагают стратегию выбора технологий протеомики для успешного анализа сложных биологических систем.
Во второй главе («Подготовка образцов для протеомного анализа») описаны основные способы предварительного разделения и обработки белков. Третья глава («Технологии разделения белков в протеомном анализе») посвящена детальному сопоставлению приемов фракционирования при помощи двумерного электрофореза, а также проявления белков. Отдельно рассмотрена DIGE (difference gel electrophoresis) модификация двумерного электрофореза, позволяющая анализировать несколько образцов на одной гелевой пластинке для обеспечения воспроизводимости результатов. Здесь же приведены основные виды жидкостной хроматографии, используемой как на стадии обогащения образца определенной фракцией белков, так и собственно в протеомном анализе в сочетании с масс-спектрометрией. В четвертой главе («Масс-спектрометрия в протеомных исследованиях») показано применение этой методики для изучения как белков, так и нуклеиновых кислот, сравниваются достоинства и недостатки используемых приемов. Обсуждаются программы, используемые для компьютерного анализа масс-спектров. Специальное внимание уделено технологиям мечения белков, позволяющим оценивать количественные изменения протеома.
В следующей главе («Изучение посттрасляционных модификаций белков») описаны основные типы посттрансляционных модификаций. Обсуждаются способы обогащения препаратов фосфопротеинами. Рассматриваются методы выявления модифицированных белков при помощи двумерного электрофореза и специальных красителей Pro Q Diamond. Описаны приемы выделения гликопротеинов и методики их идентификации. Отдельное внимание уделено подходам к идентификации белков, участвующих в окислительно-восстановительном метаболизме.
В шестой главе («Анализ межмолекулярных взаимодействий») подробно охарактеризованы наиболее популярные подходы в исследованиях взаимодействий белков друг с другом, с нуклеиновыми кислотами и ма-
лыми молекулами. Рассмотрены принципы работы двух- и трехгибридной систем на основе дрожжей-сахаромицетов. Отдельное внимание уделено таким важным для протеомного анализа технологиям, как модифицированный нативный электрофорез BNE (blue-native electrophoresis) и ТАР (tandem-affinity purification). Особый интерес представляет обсуждение стратегии создания и использования белковых микрочипов.
В заключительной главе («Модельные объекты и практическое применение протеомики») приведены примеры использования описанных подходов в исследованиях микроорганизмов и растений.
В целом к несомненным достоинствам книги относится то, что она хорошо иллюстрирована.
В.А. Драгавцев, Ю.В. Чесноков
Вниманию читателей! Вышла в свет книга: Развитие идей континентальной биогеохимии и геохимической экологии: Материалы У1-ХИ Биогеохимических чтений, посвященных памяти В.В. Ковальского (2006-2010 гг.) /Отв. ред. В.В. Ермаков. М.: ГЕО-ХИ РАН, 2010, 365 с.
Биогеохимические чтения памяти выдающегося ученого-натуралиста Виктора Владиславовича Ковальского проходят ежегодно с 2000 года в ГЕОХИ РАН под руководством ведущего ученого страны в области биогеохимии и геохимической экологии, основного идеолога отечественной школы системного исследования природно-техногенных комплексов, заслуженного деятеля науки РФ, профессора В.В. Ермакова — председателя Оргкомитета научного форума.
В представляемый сборник включено 38 докладов. Они отражают комплексные проблемы биогеохимии континентальных таксонов биосферы — от водных экосистем до локальных природных и техногенных аномалий. В книге выделено девять разделов: биогеохимические эндемии и методы их изучения; проблемы континентальной биогеохимии; интегральная миграция вещества в биосфере; биоритмы в биогеохимических исследованиях; проблемы биогеохимической индикации; современные проблемы геохимической экологии и др.
Рассмотрены актуальные вопросы биогеохимии растений — центрального звена биогеоценозов и главной составляющей биогеохимической пищевой цепи. Обсуждены вопросы биогеохимической индикации микроэлементозов и интегрированной биогеохимической оценки экологического состояния таксонов биосферы с использованием элементного состава организмов. Систематизированы данные по биогеохимии селена, фтора и ртути, радиобиогеохимии, а также по проблемам геохимической экологии и истории ее становления.
Впервые обобщены многочисленные данные по биогеохимической роли человека и показана перспективность диагностики гипермикроэлементозов в условиях полиметаллических биогеохимических провинций и при токсикозах, обусловленных соединениями металлов, по уровню содержания металлотионеинов в биологических жидкостях. В ряде докладов рассмотрены новые подходы к оценке биогенной миграции микроэлементов в водных экосистемах и показана биоиндикационная роль рыб. В докладах отражены современные технологии районирования и картирования техногенных и природно-техногенных биогеохимических провинций.
Идеи и методические подходы, изложенные в докладах известных отечественных и зарубежных ученых, представляют научную и практическую ценность, способствуют дальнейшему развитию биогеохимии и геохимической экологии — важнейших направлений современного естествознания.
Для специалистов в области биогеохимии, экологии, ботаники, медицины и сельского хозяйства.
Оргкомитет биогеохимических чтений памяти В.В. Ковальского: ermakov@geokhi.ru
РАЗВИТИЕ ИДЕЙ КОНТИНЕНТАЛЬНОЙ БИОГЕОХИМИИ И ГЕОХИМИЧЕСКОЙ ЭКОЛОГИИ
(2006-2010 гг.)
МАТЕРИАЛЫ VI-ХИ БИОГЕОХИМИЧЕСКИХ ЧТЕНИЙ
плмятм
В мы юра Владиславовича Коиальскою
(1899-1984)
