CC BY
29
V Евразийский гематологический форум
КЛИНИЧЕСКАЯ ОНКОГЕМАТОЛОГИЯ
Результаты. В процессе терапии дазатинибом подавляющее большинство больных (90,8 %) испытывали по крайней мере один симптом на протяжении всего периода наблюдения; 82 % больных имели один и более симптомов выраженностью 5 баллов и более (умеренно или значительно выраженные), 17 % — более 20 симптомов выраженностью 5 баллов и более. Установлены корреляции большой силы между выраженностью 16 симптомов опросника СБР-1_еи< СМЬ и показателями качества жизни: чем больше выраженность симптома, тем ниже интегральный показатель качества жизни (ЮоЫ) (г = -0,50 ... -0,748). Выявлены следующие симптомы, выраженность которых коррелировала как с физическим, так и с психосоциальным благополучием: слабость, чувство постоянной усталости, быстрая утомляемость при небольшой физической нагрузке, сниженная работоспособность, головокружение, одышка в покое или при небольшой физической нагрузке, снижение концентрации внимания, психологические симптомы и онемение (г = -0,5 ... -0,765). Установлены симптомы, выраженность которых коррелировала только с психосоциальным благополучием (нарушение сна; г = -0,505 ... -0,511) и только с физическим функционированием (сердцебиения; г = -0,517). На основании множественной линейной регрессионной модели было продемонстрировано, что в большей степени негативное влияние на ЮоЫ оказывают следующие симптомы: грусть, одышка в покое или при небольшой физической нагрузке, головокружение и снижение работоспособности (р < 0,01; И = 0,777).
Заключение. Выявлены симптомы, которые оказывают негативное влияние как на физическое, так и психосоциальное благополучие, а также симптомы, которые воздействуют только на физическое или только психосоциальное благополучие больных. Определены симптомы, оказывающие наиболее значимое отрицательное действие на качество жизни: грусть, одышка в покое или при небольшой физической нагрузке, головокружение и снижение работоспособности. Полученные результаты свидетельствуют о важности оценки и мониторинга симптомов у больных ХФ ХМЛ в процессе длительной терапии ИТК с целью улучшить качество медицинской помощи этой сложной категории больных.
Конфликты интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.
Источники финансирования. Данные, использованные в анализе, получены в рамках исследования при поддержке гранта компании ВМБ.
the worse Integral QoL Index (r = -0.50 to -0.748). The severity of fatigue, sense of constant tiredness, easily getting tired after physical activity, decreased work energy, dizziness, shortness of breath with little exertion, concentration loss, psychological symptoms and numbness correlated both with physical and psychosocial functioning r = -0.5 to -0.765). The severity of insomnia correlated only with psychosocial well-being (r = -0.505 to -0.511), palpitation — with physical functioning (r = -0.517). The multiple linear regression model showed that sadness, shortness of breath with little exertion, dizziness and decreased work energy had the most significant negative impact on Integral QoL Index, along with age and the rate of cytogenetic response (p < 0.01, R = 0.777).
Conclusion. The majority of CML CP pts receiving treatment by dasatinib experience symptoms. There have been identified symptoms which have negative impact both on physical and psychosocial well-being and symptoms which are associated only with physical or psychosocial well-being. Such symptoms as sadness, shortness of breath with little exertion, dizziness and decreased work energy have the major negative impact of patient's QoL. These findings emphasize the need for symptom assessment and management in CML CP pts receiving long-time TKI treatment to improve quality of care of this patient population.
Conflicts of interest. The authors declare no conflicts of interest.
Funding. The data used in analysis were obtained from the study supported by the grant of BMS.
ОЦЕНКА ТАРГЕТНЫХ ПАНЕЛЕЙ СЕКВЕНИРОВАНИЯ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ У ВЗРОСЛЫХ ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ DE NOVO
Р. Кодгуле1, Г. Равал1, Ч. Какирде1, П.Г. Субраманиан1, Ш. Кадечкар1, С. Джоши1, Ш. Чоудхари1, Д. Шетти2, Н. Рабаде1, П. Тембхаре1, С. Гуйрал1, Н. Паткар1
1 Гематологическая лаборатория, Мемориальный госпиталь Тата, Мумбаи, Индия
2 Отделение цитогенетики рака, Мемориальный госпиталь Тата, Мумбаи, Индия
Цель. Стандартизация комплексной панели нового поколения для секвенирования генов (NGS), участвующих в патогенезе мие-лоидных опухолей, создание и подтверждение таргетного секвенирования биоинформативной линии разрабатываемых препаратов, способных обнаруживать варианты сигналов и комплексных вставок, делеций и тандемных дубликатов.
Материалы и методы. В группу исследования было включено 54 пациента с острым миелоидным лейкозом (ОМЛ) (критерии ВОЗ,
TARGETED NEXT GENERATION SEQUENCING IN ADULT DE NOVO ACUTE MYELOID LEUKEMIA
R Kodgule1, G Raval1, C Kakirde1, PG Subramanian1, S Kadechkar1, S Joshi1, S Chowdhari1, D Shetty2, N Rabade1, P Tembhare1, S Gujral1, N Patkar1
1 Hematopathology Laboratory, Tata Memorial Centre, Mumbai, India
2 Department of Cancer Cytogenetics, Tata Memorial Centre, Mumbai, India
Aim. Standardization of comprehensive NGS panel for sequencing genes implicated in pathogenesis of myeloid neoplasms, establish and validate targeted sequencing bioinformatics pipeline capable of detecting variant calls & detection of complex insertions, deletions and tandem duplications.
Materials & Methods. 54 patients of AML (WHO 2008 criteria) were accrued. FISH and conventional karyotyping was done to risk stratify the patients. Library was prepared using standard Illumina Trusight Myeloid Panel protocol. Sequencing was done on an Illumina MiSeq instrument using the V3 chemistry kit. Demultiplexing was done
http://bloodjournal.ru/ V Евразийский гематологический форум 549
2008). С целью стратификации риска пациентам проводили FISH-реакцию и стандартное кариотипирование. Анализ осуществляли на приборе Illumina MiSeq с использованием набора химических веществ V3. Демультиплексирование осуществлялось с помощью MiSeq Reporter. Полученные таким образом данные Fastq были привязаны к hg19 с использованием BWA и предварительно обработаны с помощью программ Samtools и Picard. Определение вариантов панели выполнялось с помощью программ Varscan 2, PINDEL и ITD-Seek, спецификация была получена посредством Annovar при использовании различных баз данных.
Результаты. У 25 пациентов был выявлен низкий цитогенети-ческий риск, у 24 — промежуточный риск, у 5 — высокий. Средняя глубина охвата ампликонов составляла 3564x. В среднем на образец было обнаружено 2,6 патогенной мутации. Наиболее распространенными мутациями у пациентов с низким цитогене-тическим риском были KIT (14 %), FLT3-ITD, NRAS, NOTCH1 (11 %); у пациентов с промежуточным цитогенетическим риском — FLT3-ITD (16 %), NPM1 (13 %), DNMT3A (9 %), CBL (9 %), NRAS, NOTCH1 и IDH1 (по 7 % каждый). Частыми сопутствующими мутациями были FLT3-ITD с DNMT3A, NPM1, NOTCH1 и CBL, DNMT3A с NPM1 и NOTCH1 с CBL.
Заключение. Наше исследование является первым в своем роде в Индии и подчеркивает огромную сложность мутационного профиля ОМЛ. Используя целевой подход NGS, мы могли бы быстро исследовать большое количество молекулярных путей, вовлеченных в патогенез ОМЛ. Одним из преимуществ использования Illumina, является то, что образцы могут быть мультиплексированы без ущерба для глубины охвата, а также количества оцениваемых генов. Есть возможность получить ценную прогностическую информацию для определенных подтипов заболеваний, например для ОМЛ с RUNX1-RUNX1T1. Тестирование генных панелей методом NGS может использоваться для изучения различных генных мутаций ОМЛ в клинической практике. Эти первоначальные результаты указывают на важность быстрого молекулярного анализа профиля образцов в эпоху персонализированной медицины.
Конфликты интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.
Источники финансирования. Исследование финансировалось трастом Wellcome и компанией DBT (Индия).
by the MiSeq Reporter. Fastq files thus obtained were aligned to hg19 using BWA and preprocessed in Samtools and Picard tools. Variant calling was done with the help of Varscan 2, PINDEL and ITD-Seek and were annotated using Annovar with the help of various databases.
Results. 25 patients were of favorable risk, 24 were of intermediate risk and 05 were poor risk. The average amplicon mean coverage depth was 3564x. An average of 2.6 pathogenic mutations was detected per sample. Most common mutations amongst favorable cytogenetic risk were KIT (14 %), FLT3-ITD, NRAS, NOTCH1 (11 %). In Intermediate cytogenetic risk group FLT3-ITD (16 %), NPM1 (13 %), DNMT3A (9 %), CBL (9 %), NRAS, NOTCH1 and IDH1 (7 % each). Commonly co-occurred mutations were FLT3ITD with DNMT3A, NPM1, NOTCH1 and CBL, DN-MT3A with NPM1 and NOTCH1 with CBL.
Conclusion. Our study first of its kind in India, highlights the immense complexity of the mutational landscape of AML. Using targeted NGS approach we could rapidly interrogate a large focused subset of molecular pathways implicated in the pathogenesis of AML. One of the advantages of an Illumina based approach is that samples can be multiplexed without compromising on the depth of coverage as well as the number of genes assessed. We could obtain valuable prognostic and predictive information amongst established subsets for e.g. AML with RUNX1-RUNX1T1. Gene panel testing by NGS approach was applicable for detection of various known gene mutations of AML in the clinical laboratory set up. These initial results indicate importance of rapid comprehensive molecular profiling of patient samples in the era of personalised medicine.
Conflicts of interest. The authors declare no conflicts of interest.
Funding. The study is funded by Wellcome trust and DBT India.
ПРОГНОСТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ МУТАЦИЙ И ИХ СВЯЗЬ С ВОЗМОЖНОСТЬЮ ДОСТИЖЕНИЯ РЕМИССИИ ПОСЛЕ ПЕРВОГО ИНДУКЦИОННОГО КУРСА У БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОИДНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ В ГОМЕЛЬСКОМ РЕГИОНЕ БЕЛАРУСИ
Ж.М. Козич, В.Н. Мартинков, А.Е. Силин, И.Б. Тропашко
ГУ «Республиканский научно-практический центр радиационной медицины и экологии человека», Гомель, Республика Беларусь
Введение. Достижение полной ремиссии — основная задача при лечении острых миелоидных лейкозов (ОМЛ). Выход в ремиссию после первого индукционного курса химиотерапии связан с множеством факторов, одним из которых является наличие моле-кулярно-генетических аномалий.
Цель. Оценить взаимосвязь между наличием мутаций генов FLT3, NPM1, СЕВРА, ТР53 и частотой ремиссии после первого курса химиотерапии у пациентов с ОМЛ.
Материалы и методы. Материалом для исследования служили образцы венозной крови и костного мозга 97 пациентов с впервые выявленным ОМЛ, проходивших лечение в 2009-2016 гг. в гематологическом отделении для взрослых ГУ «РНПЦ РМ и ЭЧ»
PROGNOSTIC VALUE OF MUTATIONS AND THEIR CORRELATION WITH POTENTIAL REMISSION AFTER THE FIRST COURSE OF INDUCTION THERAPY IN PATIENTS WITH ACUTE MYELOID LEUKEMIA IN THE GOMEL REGION OF BELARUS
ZhM Kozich, VN Martinkov, AE Silin, IB Tropashko
Republican Scientific Center of Radiation Medicine and Human Ecology, Gomel, Republic of Belarus
Background. Achievement of complete remission is the main task in the treatment of acute myeloid leukemia (AML). The remission after the first induction course of chemotherapy is associated with a number of factors, one of which is the presence of molecular genetic anomalies.
Aim. To evaluate the relationship between the presence of FLT3, NPM1, СЕВРА and TP53 mutations and the frequency of remission after the first course of chemotherapy in patients with AML.
Materials & Methods. The samples of whole venous blood and bone marrow of 97 patients with newly diagnosed AML, who were treated in 2009-2016 in the hematological department of the Republican Scientific Center for Radiation Medicine and Human Ecology
