CC BY
37
(НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова); Владивосток, ул. Сельская 1, 690087; раб. тел. 8(423)244-26-04; моб. тел. 8(999)040-71-08 е-mail: [email protected] (автор корреспондент);
Берлизова Мария Владимировна - младший научный сотрудник лаборатории флавивирусных инфекций ФГБНУ «Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова» (НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова); Владивосток, ул. Сельская 1, 690087; раб. тел. 8(423)244-26-04; моб. тел. 8(964) 447-83-68 е-mail: [email protected];
Курловская Александрия Владимировна - студентка ФГАОУ ВПО «Дальневосточный Федеральный университет»; Владивосток, ул. Суханова, 8, 690091; моб. тел. 8(914)070-24-28; е-mail: [email protected];
Бондаренко Евгений Иванович - кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории ПЦР АО «Вектор-Бест», Новосибирск. е-mail:[email protected];
Леонова Галина Николаевна - главный научный сотрудник лаборатории флавивирусных инфекций, доктор медицинских наук, профессор. ФГБНУ «Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова» (НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова); Владивосток, ул. Сельская 1, 690087; раб. тел. 8(423) 244-07-12; е-mail:[email protected].
© Коллектив авторов, 2018 г. doi: 10.5281/zenodo.1194878
Удк 577.2:577.21+616.981.21/.958.7
Ф.Н. Шубин, Н.А. Кузнецова, А.В. Раков
особенности завозной заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным отдельными плазмидными типами salmonella enteritidis
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова, г. Владивосток
Целью исследования является сравнительное изучение плазмидных характеристик популяций Salmonella Enteritidis в Приморском и Хабаровском краях для установления причин и механизмов повышения заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным отдельными плазмидными типами микроба. Изучена плазмидная характеристика Salmonella Enteritidis, выделенных в 2006-2013 гг. от 7057 больных, в том числе от 6120 больных в Приморском крае и от 937 - в Хабаровском крае. Определение спектра плазмид выполнено по методу Kado C.I. и Liu S.T., (1981). Сформулировано представление о синхронной заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным отдельными плазмидными типами Salmonella Enteritidis, в различных субъектах федерации России. Необходимость выделения такого типа заболеваемости определяется, особенностями ее профилактики. Эпидемиологический надзор за сальмонеллезом, проводимый на отдельных административных территориях, не сможет контролировать весь процесс формирования синхронной заболеваемости, необходимы дополнительные методы контроля.
Ключевые слова: сальмонеллез, Salmonella Enteritidis, плазмидный тип, заболеваемость населения, Приморский край, Хабаровский край.
Для цитирования: Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Раков А.В. Особенности завозной заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным отдельными плазмидными типами Salmonella Enteritidis // Здоровье. Медицинская экология. Наука. 2018; 1(73): 20-24. doi: 10.5281/zenodo.1194878
Для корреспонденции: Шубин Ф.Н., д.м.н., e-mail: [email protected].
Поступила 15.12.17
F N. Shubin, N.A. Kuznetsova, A.V. Rakov
specific particularities of morbidity in the far east region of russia caused by salmonella enteritidis introduced strains with specific plasmid types
Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Vladivostok, Russia
The aim of the study was to compare the plasmid characteristics of Salmonella Enteritidis isolated from human in the Primorsky and Khabarovsk Regions to determine the causes and mechanisms of morbidity associated with Salmonella infections caused by specific plasmid types. The plasmid analysis of Salmonella Enteritidis isolates from 7057 patients, including 6120 patients in the Primorsky Region and 937 in the Khabarovsk Region was performed in 2006-2013. The plasmid spectrum was analysed by the method of Kado C.I. and Liu S.T., (1981). The concept of synchronous morbidity among people living in different administrative territories caused by specific plasmid types of Salmonella Enteritidis was formulated. The need to identify this type of morbidity is predicated on its targeted control and prevention measures.
Epidemiology •
Nonintegrated epidemiological surveillance of salmonellosis covering certain administrative territories is unable to control the whole process of synchronous morbidity, additional infection control strategies are needed.
Keywords: salmonellosis, Salmonella Enteritidis, plasmid type, morbidity, Primorsky and Khabarovsk Regions
For citation: Shubin F.N., Kuznetsova N.A., Rakov A.V Specific particularities of morbidity in the far east region of Russia caused by Salmonella enteritidis introduced strains with specific plasmid types. Health. Medical ecology. Science. 2018; 1(73): 20-24. doi: 10.5281/zenodo.1194878
For correspondence: Shubin F.N., MD, e-mail: [email protected]. Conflict of interests. The authors are declaring absence of conflict of interests. Financing. The study had no sponsor support.
Received 15.12.17 Accepted 13.01.18
Введение
В настоящее время Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis (Salmonella Enteritidis) имеет ведущее значение в этиологии сальмонелле-за во многих странах мира [1]. Общепризнанным источником инфекции при данном сальмонеллезе служит птица предприятий промышленного птицеводства. Соответственно, общим для формирования заболеваемости населения является ее связь с употреблением в пищу яиц, мяса бройлеров и других продуктов, включающие в качестве отдельных компонентов продукты птицеводства [2]. В России производство птицеводческой продукции в различных субъектах федерации варьирует от полной обеспеченности ею населения до отсутствия его, что обеспечило высокие уровни перевозок продуктов птицеводства между субъектами федерации. Возможность миграции сальмонелл с транспортируемыми продуктами и их важная роль в развитии заболеваемости сальмонеллезом показана во многих странах мира. При этом миграции сальмонелл ведут к формированию завозной заболеваемости населения. Однако значимость завозных продуктов в формировании заболеваемости населения чаще всего выявляется лишь при формировании вспышек сальмонеллеза, когда для анализа причин их возникновения применяются молекулярно-генетические методы, позволяющие устанавливать эпидемиологические связи между источниками инфекции, факторами передачи и заболевшими людьми [3, 4, 5]. Применение молекулярно-генетических методов, основанных на анализе хромосомной ДНК, для изучения различных аспектов спорадической заболеваемости затруднительно в связи с их трудоемкостью.
Разработка и внедрение в Приморском крае централизованного микробиологического молекулярно-гене-тического мониторинга за сальмонеллами, основанного на данных плазмидного типирования микроба, и распространение его на некоторые регионы Сибири и Дальнего Востока позволило дифференцировать в популяциях Salmonella Enteritidis плазмидные типы микроба, выяснить степень их гетерогенности в различных регионах и выполнить сравнительное их иссле-
дование. Эти данные легли в основу дифференциации местных и завозных плазмидных типов возбудителя сальмонеллеза на примере двух соседних экономически тесно связанных субъектов РФ - Приморского и Хабаровского краёв [6].
Цель исследования. Целью исследования являлось сравнительное изучение плазмидных характеристик популяций Salmonella Enteritidis в Приморском и Хабаровском краях для установления причин и механизмов повышения заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным отдельными плаз-мидными типами микроба.
Материалы и методы исследования
В процессе централизованного микробиологического мониторинга за сальмонеллами изучена плазмидная характеристика штаммов Salmonella Enteritidis, выделенных в 2006-2013 гг. от 7057 больных, в том числе от 6120 больных в Приморском крае и от 937 - в Хабаровском крае. Определение спектра плазмид проводили у свежевыделенных штаммов микроба по методу Kado и Liu [7]. Электрофоретиче-ское разделение плазмидных ДНК, их визуализацию и определение молекулярной массы проводили, как описано ранее [8]. Результаты обработаны статистически с использованием критериев Стьюдента.
Полученные результаты
Изучение плазмидной характеристики штаммов Salmonella Enteritidis, выделенных от больных в Приморском крае выявило высоко гетерогенную популяцию микроба. представленную десятью плаз-мидными типами. При этом анализ многолетней динамики этиологической значимости в Приморском крае Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda выявил необычный ее подъем в 2008 г. (табл. 1). Как видно из табл. 1, этиологическая значимость Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda на протяжении 8 лет наблюдения, за исключением 2008 г., не поднималась выше 3,8% (2006 г.) и средний показатель значимости составил 2,6±0,2%. В 2008 г. этиологическая значимость плазмидного типа 38:30:2,3 MDa возросла и составила 8,3%, что в 3,2 раза превысило ее средний показатель (различия статистически достоверны, Р>0,01).
HEALTH. MEDICAL ECOLOGY. SCiENCE 1 (73) - 2018 21
Напротив, анализ многолетней заболеваемости сальмонеллезом населения Хабаровского крае показал, что микроб плазмидного типа 38:30:2,3 MDa ежегодно участвовал в её формировании. Однако именно в 2008 г. этиологическая значимость данного плазмидного типа была максимальной и составила 25,6±3,5% от всех штаммов микроба,
В Приморском крае заболеваемость населения, вызванная данным типом Salmonella Enteritidis, считается завозной, поскольку подобные штаммы микроба никогда не изолировались из проб продукции местных предприятий птицеводства. Её происхождение связывается с продукцией предприятий птицеводства Хабаровского края [9], где заболеваемость, обусловленная Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda, является местной.
Напротив, в Приморском крае большая часть случаев сальмонеллеза (46 из 60 зарегистрированных, 76,6%), вызванного Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda, была зарегистрирована в июле и августе, хотя единичные случаи заболеваний регистрировались в период с марта по ноябрь.
выделенных от 156 больных. При этом средняя многолетняя этиологическая значимость составила 8,4±0,9%., что в 3 раза ниже значимости 2008 г. (различия статистически достоверны, Р>0,05). Такие резкие колебания этиологической значимости отдельных плазмидных типов Salmonella Enteritidis не могут быть случайными.
Представленные данные явились основанием для сравнительного помесячного анализа этиологической значимости Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda в Приморском и Хабаровском краях в 2008 г. Результаты представлены в табл. 2. Как видно из табл. 2, в Хабаровском крае заболеваемость населения, вызванная микробом 38:30:2,3 Mda, появилась в мае и в течение последующих трех месяцев выявлена высокая этиологическая значимость данного типа микроба, хотя случаи инфекции регистрировались до конца года.
Подекадное распределение заболеваемости в июле-августе 2008 г: в соответствии с датой заболеваний представлено в табл. 3. Как видно из табл. 3, заболеваемость населения, начавшаяся в первой декаде июля, достигла максимума в период второй, третьей декады июля и первой декады августа и прекратилась во второй декаде августа.
Таблица 1
Этиологическая значимость Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda в заболеваемости сальмонеллезом в Приморском и Хабаровском краях
Край Количество больных Годы
2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013
Приморский Всего 525 630 727 652 802 754 966 1064
в том числе 38:30:2,3 20 18 60 9 9 10 17 14
% ± m 3,8±0,8 2,8±0,7 8,3±1,0 1,4±0,5 1,1±0,4 1,3±0,4 1,8±0,4 1,3±0.3
Хабаровский Всего 102 101 156 85 123 114 114 142
в том числе 38:30:2,3 9 5 40 7 4 4 3 7
% ± m 8,8±2,8 5,0±2,2 25,6±3,5 8,2±3,0 3,3±1,6 3,4±1,7 2,6±1,5 4,9±2.1
Таблица 2
Этиологическая значимость Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda в заболеваемости сальмонеллезом в Приморском и Хабаровском краях в 2008 г.
Кол-во больных Месяцы года
I II III IV V VI VII VIII IX X XI XII
Приморский край (n=727)
Всего 23 20 52 62 82 52 137 80 79 70 50 49
включая 38:30:2,3 Mda 0 0 1 2 2 3 31 15 3 2 1 0
% ± m - - 1,9±1,9 3,2±2,2 2,5±1,7 5,8±3,1 22,6±3,6 18,8±4,4 3,4±2,0 2,9±2,0 2,0±2,0 -
Хабаровский край (n=156)
Всего 8 12 9 13 15 19 32 24 9 3 7 5
включая 38:30:2,3 Mda 0 0 0 0 3 6 18 7 2 2 0 2
% ± m - - - - 20,0±10 31,5±11 56,2±8,9 29,2±9,5 - - - -
Epidemiology
Таблица 3
Заболеваемость сальмонеллезом, вызванным Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda, в Приморском крае в июле и августе 2008 г.
Декады июля Число случаев болезни Декады августа Число случаев болезни
Первая 4 Первая 10
Вторая 11 Вторая 5
Третья 16 Третья 0
Всего 31 Всего 15
Представленная динамика характерна для завозной заболеваемости сальмонеллезом. Имеются основания считать, что заболеваемость населения Приморского края, обусловленная Salmonella Enteritidis плазмидного типа 38:30:2,3 Mda, была связана с завозом в край из Хабаровского края крупной партии мясной продукции, контаминированной данным плазмидным типом микроба. В 2007 г. циркуляция этого типа микроба выявлена на птицефабрике Хабаровского края [9]. Эти данные позволяют полагать, что заболеваемость населения в обоих краях имеет единый источник инфекции, а широта распространения заболеваемости в Приморском крае определялась географией распределения конта-минированной сальмонеллами продукции, в результате чего, заболеваемость была зарегистрирована в 9 городах и трех районах края.
Обсуждение
Представленные результаты показали, что завозная заболеваемость населения в Приморском крае и местная заболеваемость сальмонеллезом в Хабаровском крае, вызванные однотипным возбудителем в пределах единого промежутка времени, являются, по сути, синхронной заболеваемостью, имеющей единый источник инфекции. Синхронная заболеваемость определена нами как заболеваемость, вызванная одним плазмидным типом определенного серотипа Salmonella enterica, например, Salmonella Enteritidis, среди населения различных субъектов федерации, характеризующаяся единым источником инфекции и проявляющаяся в определенный промежуток времени. Необходимость выделения такого типа заболеваемости определяется, прежде всего, особенностями ее профилактики.
В заключении следует отметить, что представленный нами механизм формирования синхронной заболеваемости населения в разных субъектах РФ является пока первой попыткой представления новой проблемы. Не вызывает сомнения, что глобализация производства и торговли будут только расширяться, а вместе с тем будет увеличиваться риск формирования синхронной заболеваемости населения. В этом случае эпидемиологический надзор за сальмонеллезом, проводимый на
отдельных административных территориях, не сможет контролировать одновременно весь процесс формирования синхронной заболеваемости, а, следовательно, необходимы дополнительные методы контроля. Нами для этого предложена система централизованного микробиологического молекулярно-генетического мониторинга за сальмонеллами. Дополнительные возможности этой системы и позволили нам сформулировать представление о синхронной заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным отдельными плазмидными типами Salmonella Enteritidis.
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Финансирование. Исследование проводилось без привлечения спонсорских средств.
ЛИТЕРАТУРА
1. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Структура популяции Salmonella Enteritidis в Приморском крае по данным плазмидного анализа // Журн. ми-кробиол. 2006; 3; 28-32.
2. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Зоо-нозный сальмонеллез на Дальнем Востоке: основные аспекты проблемы // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015. № 29. С. 72-79.
3. Шубин Ф.Н., Соловьева А.С., Радкевич М.А. Динамика заболеваемости населения Приморского края на фоне начального этапа вакцинации кур против сальмонеллеза на бройлерной птицефабрике // Здоровье. Медицинская экология. Наука. 2017; 5: 5-10. doi: 10.5281/zenodo.1115434.
4. Braden C.R. Salmonella enterica serotype Enteritidis and eggs: a national epidemic in the United States. Clinical Infectious Diseases. 2006; 43 (15): 512-517.
5. Jernberg C., Hjertqvist M., Sundborger C. Outbreak of Salmonella Enteritidis phage type 13a infection in Sweden linked to imported dried-vegetable spice mixes. Euro Surveill. 2015; 20(30): 119-204.
6. Kado C.I., Liu S.T. Rapid procedure for detection and isolation of large and small plasmid. J Bacteriol. 1981;145: 1365-1373.
7. Lukinmaa S., Schildt R., Rinttila T. Salmonella Enteritidis phage types 1 and 4; pheno- and genotypic epidemiology of recent outbreaks in Finland. J. Clin. Microbiol. 1999; 37; 2176-2182.
8. Malorny B., Junker E., Helmuth R. Multi-locus variable-number tandem repeat analysis for outbreak studies of Salmonella enterica serotype Enteritidis. BMC Microbiol. 2008; 8: 84-90.
9. Rudbeck Jepsen M, Fisher I, Galle M, Bang H, Ethelberg S. Creating an online atlas of Salmonella serotypes in Europe. Euro Surveill. 2008; 13(3): pii8016.
HEALTH. MEDICAL ECOLOGY. SCIENCE 1 (73) - 2018 23
Сведения об авторах
Шубин Феликс Николаевич, д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и микробиологии ФГБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова», г. Владивосток; тел. 8(423)2442604, e-mail: [email protected];
Кузнецова Наталья Анатольевна, к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории хантавирусных инфекций ФГБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова», г. Владивосток; тел. 8(423)2441888, e-mail: [email protected];
Раков Алексей Владимирович, к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и микробиологии ФГБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова», г. Владивосток; тел. 8(423)2442604, e-mail: [email protected].
