Научная статья на тему 'Особенности распределения и частота встречаемости генотипов вирусов папилломы человека в г. Астане у женщин с нормальной цитологией'

Особенности распределения и частота встречаемости генотипов вирусов папилломы человека в г. Астане у женщин с нормальной цитологией Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
116
24
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ВИРУСЫ ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА / ГЕНОТИПИРОВАНИЕ / МЕТОД АМПЛИФИКАЦИИ И ОПРЕДЕЛЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ФРАГМЕНТА ГЕНОМА ВПЧ / ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МАТЕРИАЛ ВИРУСА ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА 19 РАЗЛИЧНЫХ ГЕНОТИПОВ

Аннотация научной статьи по наукам о здоровье, автор научной работы — Абжалелов А.Б., Шевцов А.Б., Садыкова Г.Д., Байгабулова А.О., Сейдалина А.Б.

Вирусы папилломы человека (ВПЧ) являются основным этиологическим фактором развития рака шейки матки (РШМ), который в структуре злокачественных опухолей у женщин Казахстана и в мире занимает второе место, уступая раку молочной железы. В настоящее время насчитывается более 100 различных генотипов вирусов папилломы человека, высокоонкогенными рисками признаны 15 генотипов (ВПЧ генотипов 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 68, 73,82), три генотипа характеризуются как с вероятно высокоонкогенным риском (26, 53, и 66), а 12 классифицированы как типы низкоонкогенного риска (6, 11, 40, 42, 43, 44, 54, 61, 70, 72, 81, и CP6108).

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по наукам о здоровье , автор научной работы — Абжалелов А.Б., Шевцов А.Б., Садыкова Г.Д., Байгабулова А.О., Сейдалина А.Б.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Особенности распределения и частота встречаемости генотипов вирусов папилломы человека в г. Астане у женщин с нормальной цитологией»

НАЦИОНАЛЬНЫЕ ПРИОРИТЕТЫ РОССИИ. 2011. № 2 (5). СПЕЦИАЛЬНЫЙ ВЫПУСК

мены этих фильтров, обеспечения ежедневного контроля герметичности.

Вопросы использования средств контроля эффективности стерилизации паровым методом изделий медицинского назначения регламентированы соответствующими нормативными документами и состоят из нескольких важных составных частей. К ним относятся оперативные методы: физический - по показаниям регистрирующих приборов; химический - с применением современных термо-временных химических индикаторов для внутреннего контроля и в качестве свидетелей процесса. Использование нестандартных индикаторов может вводить в заблуждение персонал относительно выхода стерильных изделий.

Методы периодического контроля паровых стерилизаторов включают:

- периодический термометрический контроль для проверки правильности показаний контрольного мано-вакууметра, полноты удаления воздуха из материалов;

- бактериологические индикаторы (биотесты), использующиеся в комбинации со средствами физического и химического контроля, с частотой не менее двух раз в год, но при высокой оперативной активности учреждения частота такого контроля может быть выше;

- исследование материалов на стерильность из структурных подразделений ЛПУ с частотой, определенной нормативными документами;

- использование ТЕСТ - ИХ для определения полноты удаления воздуха из пористого материала в труднодоступной дл я стерилизации зоне и ТЕСТ -ИБ для подтверждения достоверного выхода стерильного материала на каждом аппарате для паровой стерилизации.

Перспективно внедрение новых технологий в виде использования стерилизаторов инфракрасного излучения для стерилизации инструментов в стоматологии, приобретение и использование газовых стерилизаторов для стерилизации эндоскопов и изделий из термолабильных материалов, микроинструментов с микроэлектронной заточкой, низкотемпературного плазменного стерилизатора на пероксиде водорода или другой основе.

Многолетняя совместная работа Госсанэпиднадзора с органами и учреждениями здравоохранения разных уровней позволила добиться снижения неудовлетворительных результатов (по результатам биологических тестов) в 4-5 раз ниже среднефедеральных показателей.

ОСОБЕННОСТИ РАСПРЕДЕЛЕНИЯ И ЧАСТОТА ВСТРЕЧАЕМОСТИ ГЕНОТИПОВ ВИРУСОВ ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА В г. АСТАНЕ У ЖЕНЩИН С НОРМАЛЬНОЙ ЦИТОЛОГИЕЙ

А.Б. Абжалелов, А.Б. Шевцов, Г.Д. Садыкова, А.О. Байгабулова,

А.Б. Сейдалина, Д.А. Мухамедьяров, Е.М. Раманкулов

РГП «Национальный центр биотехнологии РК», Астана, РК

ГККП «Центр дерматологии и профилактики болезней, передающихся

половым путем, г. Астаны», Астана, РК

Вирусы папилломы человека (ВПЧ) являются основным этиологическим фактором развития рака шейки матки (РШМ), который в структуре злокачественных опухолей у женщин Казахстана и в мире занимает второе место, уступая раку молочной железы. В настоящее время насчитывается более 100 различных генотипов вирусов папилломы человека, высокоонкоген-ными рисками признаны 15 генотипов (ВПЧ генотипов 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 68, 73, 82), три генотипа характеризуются как с вероятно вы-сокоонкогенным риском (26, 53, и 66), а 12 классифицированы как типы низкоонкогенного риска (6, 11, 40, 42, 43, 44, 54, 61, 70, 72, 81, и СР6108).

Последние исследования выявили отличия в распределении генотипов ВПЧ в определенных географических областях. Поэтому целью нашего исследования являлось изучение распределения генотипов ВПЧ среди женщин с неизмененной цитологией в г. Астане.

В исследование были включены 338 образцов ДНК, выделенных из соскобов цервикального канала. Генотипирование проводили методом амплификации и определения нуклеотидной последовательно-

сти фрагмента генома ВПЧ. Амплификация фрагмента вирусов папилломы человека была выполнена с использованием универсальных праймеров: MY09HPV-5'-CGTCCMARRGGAWACTGATC-3' и MY11HPV-5' -GCMCAGGGWCATAAYAATGG-3'. Учет результатов продуктов ПЦР проводили электрофоретическим методом детекции в 2 %-ном агарозном геле с визуализацией этидтиумом бромидом. Для очистки реакционной смеси от праймеров димеров был использован протокол с осаждением полиэтиленгликолем (PEG 6000). Очищенные ПЦР продукты были использованы для определения нуклеотидной последовательности. Реакцию секвенирования проводили с применением BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applide Biosystems), согласно инструкции производителя, с последующим разделением фрагментов на автоматическом генетическом анализаторе 3730xl DNA Analyzer (Applide Biosystems). Нуклеотидные последовательности, полученные с применением прямого и обратного праймеров, были проанализированы и объединены в общую последовательность при помощи программного обеспечения SeqScape 2.6.0 (Applied Biosystems). Выверенные

ВОПРОСЫ ПРЕПОДАВАНИЯ МИКРОБИОЛОГИИ, ВИРУСОЛОГИИ, ИММУНОЛОГИИ

Таблица 1

Результаты скринингового исследования 338 образцов на вирус папилломы человека

Наименование генотипов Кол-во % Наименование генотипов Кол-во %

ВПЧ 16 типа 9 2,7 ВПЧ 84 типа 2 0,6

ВПЧ 58 типа 5 1,5 ВПЧ 6 типа 1 0,3

ВПЧ 53 типа 4 1,2 ВПЧ 18 типа 1 0,3

ВПЧ 31 типа 2 0,6 ВПЧ 35 типа 1 0,3

ВПЧ 33 типа 2 0,6 ВПЧ 45 типа 1 0,3

ВПЧ 54 типа 2 0,6 ВПЧ 52 типа 1 0,3

ВПЧ 61 типа 2 0,6 ВПЧ 66 типа 1 0,3

ВПЧ 62 типа 2 0,6 ВПЧ 83 типа 1 0,3

ВПЧ 68 типа 2 0,6 ВПЧ 118 типа 1 0,3

ВПЧ 81 типа 2 0,6

нуклеотидные последовательности были идентифицированы в международной базе данных GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) с применением функции BLAST. Генотип определяли по максимальному проценту идентичности анализированной последовательности к референным образцам в GenBank. Процент идентичности варьировался от 98 до 100 %, тогда как по L1 гену генотипы различаются между собой более чем на 10 %.

В результате проведенных исследований в 42 (12,4 %) образцах выявлен генетический материал вируса папилломы человека 19 различных генотипов (табл. 1).

В исследуемой выборке у женщин с неизмененной цитологией из вирусов высокоонкогенного риска были выявлены следующие генотипы: ВПЧ-16 - в 2,7 % (n-338), ВПЧ-58 - 1,5 %, ВПЧ-31 и 33 типов - в 0,6 %, а генотипы 18, 35, 45, 66 и 52 - в 0,3 % случаев. Также были выявлены вирусы низкого онкогенного риска: ВПЧ-53 - 1,5 %; ВПЧ-61 - 0,6 %; ВПЧ-6 - 0,3 % случаев. Из не онкогенных вирусов были выявлены ВПЧ-54, 62, 81 и 84 типов в 0,6 %, а ВПЧ-83 и 118 генотипов -в 0,3 % случаев.

Самыми распространенными генотипами ВПЧ во всем мире являются 16, 18, 31, 58, 52 и 53 генотипы, на

долю которых приходится 50 % всех ВПЧ инфекций. Распределение генотипов отличается в различных географических областях. Так, в Японии, на Тайване и в Восточной Африке доминирует ВПЧ-52 генотипа, а ВПЧ-16 генотипа находится на втором месте. В Центральной Америке и Восточной Европе ВПЧ-31 типа находится на втором месте, уступая ВПЧ-16 генотипа. Исследования, проведенные Л^ Ye с соавторами (2010), свидетельствуют о превалировании на территории Китая ВПЧ-52 генотипа (3,1 %), далее на убывание ВПЧ-16 (2,5 %), ВПЧ-58 (2,1 %), ВПЧ-68 (1,0 %) и ВПЧ-81 (0,9 %) генотипов.

В нашем исследовании среди вирусов высокоон-когенного риска доминировал ВПЧ-16 генотипа 2,7 % (п-338), далее на убывание ВПЧ-58 - 1,5 %, ВПЧ-31 и 33 типов в 0,6 %, а генотипы 18, 35, 45, 66 и 52 выявлены в 0,3 % случаев. Низкий процент ВПЧ-18 генотипа в нашем исследовании можно объяснить наименьшей частотой встречаемости данного генотипа в Азиатском регионе.

Таким образом, распределение генотипов ВПЧ является важным эпидемиологическим показателем и может быть использовано при планировании государственных программ скрининга и вакцинации.

ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНОМА ШТАММОВ ВИРУСА ГРИППА А (НШ1) КАЛИФ0РНИЯ/04/2009, ИЗОЛИРОВАННЫХ В РАЗЛИЧНЫХ СТРАНАХ

В.Л. Стасенко, И.В. Червенчук, И.О. Кожевников, А.О. Вайс, А.П. Ускова Омская государственная медицинская академия, Омский государственный технический университет

В апреле 2009 года Всемирная организация здравоохранения проинформировала мир о случаях инфицирования людей новым вирусом гриппа А (НШ1).

Появление нового вируса гриппа сопровождалось беспрецедентно высокой скоростью его распространения - 120 стран и территорий почти за 8 недель. ВОЗ

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.