CC BY
0УДК 577
ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ ВИРУСА ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА ВЫСОКОГО КАНЦЕРОГЕННОГО РИСКА У НАСЕЛЕНИЯ, ПРОЖИВАЮЩЕГО В КАРАГАНДИНСКОЙ ОБЛАСТИ
КАРАКУЗОВА Э.Б.
студентка биолого-географического факультета Карагандинского университета им. Е.А. Букетова, Караганда, Казахстан
САННОВА Е.А.
студентка биолого-географического факультета Карагандинского университета им. Е.А. Букетова, Караганда, Казахстан
КОНОВАЛОВА А.А.
старший лаборант лаборатории ДНК-диагностики «Здравницы Дипнера»,
Караганда, Казахстан
ПОГОСЯН Г.П.
профессор кафедры ботаники Карагандинского университета им. Е.А. Букетова, канд. биол. наук, Караганда, Казахстан
Аннотация. Статья посвящена комплексному анализу обнаружения вируса папилломы человека (ВПЧ) и его генотипов методом ПЦР в режиме реального времени. Проведен анализ распространенности вируса у представителей мужского и женского пола. Изучены также образцы, взятые у представителей различных возрастных групп. Отдельные исследования проводили на предмет выявления генотипов 16 и 18, известные опасными последствиями. Полученные результаты могут служить основой для разработки и усовершенствования мер по борьбе с этой значимой проблемой общественного здравоохранения.
Ключевые слова. Вирус папилломы человека, рак шейки матки, генотипы, ПЦР в режиме реального времени, ДНК.
Введение. В современном мире проблема инфекций, передающихся половым путем, остается актуальной и представляет серьезную угрозу здоровью человека[1 -3]. Одной из таких инфекций является вирус папилломы человека (ВПЧ), высокие канцерогенные штаммы которого ассоциированы с развитием различных форм рака, в том числе рака шейки матки, аногенитальных областей, гортани и других [1]. Важность изучения генотипов ВПЧ высокого канцерогенного риска (ВПЧ ВКР) состоит в выявлении особенностей их распространения, адаптации и влияния на организм человека [4, 5].
Однако, несмотря на значительные достижения в области медицины, многие аспекты биологии и молекулярной эпидемиологии ВПЧ и связанные проблемы и последствия остаются нерешенными. Это создает необходимость в более обширном исследовании генетических характеристик высоко канцерогенных штаммов ВПЧ, чтобы лучше понять механизмы их воздействия на клеточный уровень и разработать эффективные стратегии профилактики и лечения[5-8].
В настоящем исследовании определяли распространенность среди населения Карагандинской области генотипов вируса папилломы человека высокого канцерогенного риска с целью раскрытия их роли в распространенности заболеваний различных типов. В работе рассмотрены перспективы использования полученных данных в клинической практике для улучшения диагностики, профилактики и лечения инфекций, связанных с ВПЧ.
Цель исследования. Проанализировать распространение ВПЧ высокого канцерогенного риска, определить генотипысреди положительных образцов населения Карагандинской области;
Материалы и методы исследования.Исследовали 1850 биологических образцов мужчин и женщин напредмет обнаружения в них ДНК ВПЧ ВКР в разных возрастных категориях до и после 30 лет.Материалом для исследований служили мазки, соскобы из урогенитального тракта, моча.
Для обнаружения ДНК вируса папилломы человека в биологическом материале использовали метод realtimePCR, все исследования проводили на амплификаторе ДТШе4 фирмы «ДНК-технология». Выделяли ДНК из клинического материала комплектом реагентов «ДНК-сорб-АМ». Реакции амплификации ставили с наборами реактивов фирмы «Амплисенс» в режиме, рекомендованном инструкциями.
Результаты исследований. Изучали пробы у лиц, проживающих в Карагандинской области. Всего проанализировали 1850 проб. Всех исследуемых поделили на 4 группы. Первую группу составили женщины в возрасте до 30 лет, вторую - старше 30, третью - лица мужского пола до 30 лет, четвертую - мужчины после 30. Выделяли ДНК из всех образцов, затем ставили реакции амплификации в режиме реального времени.
Исследования проводили в течение 24 месяцев с января 2022 по январь 2024 года.
Первоначальные исследования включали скрининговые анализы на предмет выявления в пробах ДНК ВПЧ ВКР, использовали набор реагентов для выявления ДНК вирусов папилломы человека высокого канцерогенного риска 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 52, 58, 59, 67 типов в клиническом материале методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией «АмплиСенс ВПЧ ВКР скрин-Р^». Тест-система включала праймеры для выявления 11 генотипов с высоким канцерогенным риском без определения конкретного генотипа.
Результаты проведенных анализов представлены в таблице 1.
Распространение ВПЧ ВКР среди населения Карагандинской области.Таблица 1
1 группа 2 группа 3 группа 4 группа Итого
Всего образцов 592 558 241 459 1850
Из них положительных 137 58 35 68 298
Процент 23,1 10,4 14,5 14,9 16,1
положительных
результатов
Из таблицы следует, что ДНК искомого вируса обнаружили в 298 образцах из 1850 протестированных, что составило 16,1%. При этом чаще всего ВПЧ ВКР обнаруживался у лиц, представляющих 1 группу, т.е. женщины в возрасте до 30 лет. Меньше всего ДНК вируса папилломы человека обнаруживался у лиц мужского пола до 30 лет из 3 группы.
По результатам исследований составили диаграмму, представленную на Рисунке 1
Динамика положительных результатов ВПЧ ВКР в Карагандинской области за 2022-2024 гг.
11 группа I 2 группа I 3 группа 14 группа
Рисунок 1. Соотношение положительных результатов в различных группах пациентов.
Рисунок демонстрирует соотношение образцов, показавших положительные результаты. Как видно из диаграммы, наибольшую долю положительных результатов составила группа пациенток в возрасте до 30 лет (обозначены синим цветом).
Дальнейшие исследования проводили, определяя конкретные генотипы, используя набор реагентов, для выявления и дифференциации ДНК вирусов папилломы человека (ВПЧ) высокого канцерогенного риска (ВКР) 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией «АмплиСенс ВПЧ ВКР генотип-БЬ». Результаты этих экспериментов представлены в таблице 2.
Определение генотиповВПЧ ВКР среди населения Карагандинской ^ области. Таблица 2
Генотипы 16 18 31 33 35 39 45 51 52 56 58 59
1 группа 84 19 2 1 1 1 1 2 2 2
2 группа 31 7 2 1 1 1 1 1 1 3
3 группа 12 6
4 группа 28 5 1
Всего 155 37 4 2 2 1 2 3 3 1 1 5
Из таблицы видно, что чаще всего выявлялся генотип 16 (8,4% из всех изученных образцов); далее следуют 18 генотип (2,0% из всех изученных образцов); 59 генотип (0,2%); 51, 52 генотипы (0,16%); 33, 35, 45 генотипы (0,10); 39, 56, 58 генотипы (0,05%). Причем 16 генотип обнаруживался чаще, чем другие генотипы и преимущественно у лиц женского пола моложе 30 лет. Все остальные генотипы также чаще встречались преимущественно у женской половины всех пациентов независимо от возраста.
Результаты этих исследований суммировали на диаграмме, представленной на Рисунке
2.
Динамика генотипов ВПЧ ВКР среди населения Карагандинской области за 2022-2024 гг.
■ генотип 16 ■ генотип 18 ■ генотип 59
■ генотипы 51, 52 ■ генотипы 33, 35, 45 ■ генотипы 39, 56, 58
Рисунок 2. Распределение распространенности генотипов ВПЧ ВКР
Анализ показывает, что среди положительных результатов подавляющее большинство составляет 16 генотип.
Отдельные исследования проводили, изучая распространенность генотипов 16 и 18 с применением набора реагентов для выявления и дифференциации ДНК вирусов папилломы человека (ВПЧ) 16 и 18 генотипов в клиническом материале методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией «АмплиСенс ВПЧ 16/18-РЬ». Все результате продемонстрированы в таблице 3.
В некоторых случаях по рекомендации врачей ставили полимеразную цепную реакцию для выявления генотипа 16 (определяющий высокий риск развития рака шейки матки) и 18 (является причиной развития рака шейки матки, наружных половых органов, влагалища, области анального отверстия, а также плоских кондилом).
Распространенность генотипов ВПЧ 16 и 18 среди населения Карагандинской области. Таблица 3
1 группа 2 группа 3 группа 4 группа
Всего образцов 592 558 241 459
16 генотип 84 31 12 28
Процент образцов, в которых обнаружен генотип 16 14,2% 5,5% 4,97% 6,1%
18 генотип 19 7 6 5
Процент образцов, в которых обнаружен генотип 18 3,2% 1,25% 2,5% 1,08%
Из вышеуказанных данных среди положительных результатов наиболее распространенным является 16 генотип преимущественно у женской половины населения, проживающих в Карагандинской области в возрасте моложе 30 лет (1 группа): 14,2%, в то время, как 18 генотип у той же группы обнаруживали в 3,2% образцов. У 2 группы (женщины старше 30 лет) прослеживается такая же корреляция: 16 генотип (5,5%) встречается чаще, чем
ОФ "Международный научно-исследовательский центр "Endless Light in Science"
18 (1,25%). 3 группа - лица мужского пола до 30 лет: 16 генотип - 4,97% и 18 генотип - 2,5%. 4 группа: мужчины старшего возраста после 30 лет: 16 генотип - 6,1% и 18 генотип - 1,08%.
Полученные результаты отображены на диаграмме, представленной на Рисунке 3
Динамика ВПЧ 16 и 18 генотипов среди населения Карагандинской области за 2022-2024 гг.
2,00%
■ 16 генотип ■ 18 генотип
Рисунок 3. Соотношение выявленных генотипов ВПЧ 16 и 18.
Из диаграммывидно распределение в процентном соотношении выявленных положительных результатов всех групп ВПЧ 16 генотипа и 18 генотипа. 16 генотип вируса папилломы человека обнаруживается чаще, что согласуется с литературными данными [4, 911].
Заключение. На основании полученных результатов сформулировали следующие выводы.
1. Определили распространённость вируса папилломы человека высокого канцерогенного риска у населения, проживающего в Карагандинской области, составившую 16,1%. Наибольшее количество положительных результатов зарегистрировали в группе лиц женского пола в возрасте до 30 лет.
2. В исследованиях с определением генотипов ВПЧ ВКР выявили, что чаще всего обнаруживается генотип 16 у всех групп лиц.
Дальнейшие исследования предполагают расширение количества тестируемых генотипов, а также изучение генотипов среднего канцерогенного риска.
ЛИТЕРАТУРА
1. Bruni L, Albero G, Serrano B, Mena M, Collado JJ, Gómez D, Muñoz J, Bosch FX, de Sanjosé S. ICO/IARC Information Centre on HPV and Cancer (HPV Information Centre). Human Papillomavirus and Related Diseases in the World. Summary Report 10 March 2023.
2. World Health Organization (WHO):Sexually transmitted infections (STIs); 10 July 2023 (URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/sexually-transmitted-infections-(stis))
3. Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CACancerJClin. 2018 Nov;68(6):394-424.
4.Каира, А.Н,Свитич,О.А.,Политова,НГ.Папилломавирусная инфекция - эпидемиология и профилактика// Учебное пособие - М.: ФГБОУ ДПО РМАНПО Минздрава России, 2022. -134 с.
5.BrianW.J. Mahy, MarcH.V. VanRegenmortel.Papillomaviruses: GeneralFeaturesofHumanViruses // EncyclopediaofVirology (ThirdEdition), InstitutPasteur, Paris, France,2008, Pages 8-18
6. Хрянин А. А., Решетников О. В. Папилломавирусная инфекция: современный взгляд на эпидемиологию, профилактику и лечение //Гинекология. - 2013. - Т. 15. - №. 5. - С. 16-20.
7. World Health Organization (WHO): Human papillomavirus (HPV) nucleic acid amplification tests (NAATs) to screen for cervical pre-cancer lesions and prevent cervical cancer; policy brief; 16 March 2022
8. ^айдарова Д.Р., Балтабеков Н.Т., Душимова З.Д., Шатковская О.В. [и др.]. Показатели онкологической службы Республики Казахстан за 2019 г. (статистические и аналитические материалы)// Казахский научно-исследовательский институт онкологии и радиологии, Алматы, 2020. - 226 с.
9. Ивашков Е.Л. Сравнительная характеристика результатов выявления папилломавирусной инфекции, вызванной ВПЧ 16 и ВПЧ 18 // Сб. трудов 5-ой Всеросс. научно-практ. конференции "Генодиагностика ин-фекционных болезней", М., 2004, Т. 1, С. 33-36.
10. Каирбаев, М.Р.,Болатбекова, Р.О. Вирус папилломы человека и рак шейки матки// Вестник КазНМУ №4-2016, С. 105-109
11. Bosch F. X., Castellsague X., S. de Sanjose. Cancer Epidemiology and Registration Unit, IDIBELL, InstitutCatala de Oncologia, Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain // British Journal of Cancer. 2008; 98, 15-21.
