Научная статья на тему 'Новый подход к представлению объектов растительного и животного мира в базах данных'

Новый подход к представлению объектов растительного и животного мира в базах данных Текст научной статьи по специальности «Прочие технологии»

CC BY
105
70
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по прочим технологиям, автор научной работы — Трубина Л. К., Беленко О. А., Дюхина Е. И.

To present a great amount of facts on biological variety, virtual herbariums, electronic atlases, libraries and databases are used. The new approach to representation of the plantand animal kingdom objects is based on supplying electronic documents with stereoscopic models (stereopairs), collection species and biological objects natural filming. It provides 3D-vizualization of biological objects and thus makes them vivid and real, that can't be achieved by any other way. This approach realization is considered by the authors.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

NEW APPROACH TO REPRESENTATION OF PLANT AND ANIMAL KINGDOM OBJECTS IN DATA BASE

To present a great amount of facts on biological variety, virtual herbariums, electronic atlases, libraries and databases are used. The new approach to representation of the plantand animal kingdom objects is based on supplying electronic documents with stereoscopic models (stereopairs), collection species and biological objects natural filming. It provides 3D-vizualization of biological objects and thus makes them vivid and real, that can't be achieved by any other way. This approach realization is considered by the authors.

Текст научной работы на тему «Новый подход к представлению объектов растительного и животного мира в базах данных»

УДК 528.7:574

Л.К. Трубина, О.А. Беленко, Е.И. Дюхина СГГ А, Новосибирск

НОВЫЙ ПОДХОД К ПРЕДСТАВЛЕНИЮ ОБЪЕКТОВ РАСТИТЕЛЬНОГО И ЖИВОТНОГО МИРА В БАЗАХ ДАННЫХ

L.K. Trubina, O.A. Belenko, Ye.I. Dyukhina SSGA, Novosibirsk

NEW APPROACH TO REPRESENTATION OF PLANT AND ANIMAL KINGDOM OBJECTS IN DATA BASE

To present a great amount of facts on biological variety, virtual herbariums, electronic atlases, libraries and databases are used. The new approach to representation of the plant- and animal kingdom objects is based on supplying electronic documents with stereoscopic models (stereopairs), collection species and biological objects natural filming. It provides 3D-vizualization of biological objects and thus makes them vivid and real, that can’t be achieved by any other way. This approach realization is considered by the authors.

В целях изучения и систематизации объектов животного и растительного мира биологи в своей научной деятельности собирают огромный фактический материал, характеризующий различные аспекты биоразнообразия. В настоящее время эта оригинальная информация хранится в виде гербариев, коллекций насекомых и других архивов. Расширить круг пользователей созданными коллекционными фондами в научных и образовательных целях, обеспечить сохранность уникальных образцов для будущих поколений - задачи важные и решаемые в настоящее время.

Современные компьютерные технологии способствуют развитию новых форм представления и хранения биологических данных в виде виртуальных гербариев, электронных атласов, баз данных, электронных библиотек, в том числе с применением Интернет-технологии.

Новый подход к представлению объектов растительного и животного мира заключается в дополнении электронных документов стереоскопическими моделями, формируемыми по стереопарам снимков коллекционных экземпляров и натурных съемок биообъектов. Это обеспечивает 3D-визуализацию биообъектов, следовательно, наглядность и реалистичность недостижимую другими способами.

Реализация такого подхода основана на применении цифровых съемочных систем и цифровых методов обработки изображений. Современные цифровые фотоаппараты обеспечивают оперативное получение цифровых изображений в широком диапазоне масштабов. Благодаря их конструктивным особенностям, а также за счет оснащения сменными объективами с переменным фокусным расстоянием, реализована возможность съемки как в макро-, так и в телережиме, не прибегая к использованию дополнительных приспособлений. Широкий набор функций по выбору

режимов съемки обеспечивает высокое фотографическое качество изображений, для хранения которых употребляются флэш-карты памяти большой вместимости и с высокой скоростью записи, что обеспечивает получение большого числа кадров за короткое время и облегчает организацию съемки в полевых условиях.

3D-визуализация биообъектов может быть осуществлена разными способами с помощью специальных аппаратных средств, в частности стереоочков разной конструкции. С экономической точки зрения наименее затратным и доступным для широкого круга пользователей является анаглифический способ, при котором рассматриваются два совмещенных изображения (стереопара), окрашенные в дополнительные цвета (красный и синий) при помощи очков-светофильтров, имеющих такую же окраску. С точки зрения достижения качественного стереоэффекта этот метод имеет некоторые ограничения, связанные с погрешностями в цветопередаче. Более качественное стереоскопическое восприятие обеспечивает электронный способ на основе применения очков на жидких кристаллах. Ниже на рис. 1 приведена стереопара фотоснимков, рассматривать которую можно без специальных приспособлений или используя стереонасадку.

Рис. 1. Стереопара изображений для получения искусственного

стереоэффекта

Таким образом, практическая реализация возможностей создания цифровых стереомоделей и их 3D-визуализации на экране может найти приложение в изучении разнообразных биологических объектов, что обеспечит их представление, очень близкое к реальному, существующему в природе. Следует отметить, что при формировании стереомоделей нет ограничений, связанных с пространственными размерами биообъекта. Например, можно стереоскопически наблюдать ландшафт, съемки которого выполнены с самолета, изучать в деталях устройство лапок насекомых или цветка по изображениям, полученным в режиме «макро», а также внутреннее строение листа или клетки по снимкам, получаемых с помощью микроскопа.

Предлагается новый подход к представлению гербарных образцов в электронном виде, которые остаются основой для проведения исследований по изучению биоразнообразия на видовом уровне. В частности, при оценке состояния природных экосистем, изменение видов устанавливается при

сравнении сборов растений с типовыми образцами, следовательно, важно обеспечить их доступность исследователям. Для достижения цели предлагается формировать коллекции образцов растений в виде структуры, включающей набор цифровых изображений разного масштаба, например, растение целиком - гербарный лист - фотографируется в максимально крупном масштабе, далее каждый орган растения (стебель, лист, корень и т. д.) фотографируется отдельно с более близкого расстояния. Кроме того, к ним можно добавить изображения семени, пыльцы, полученные с помощью микросъемки. Такой подход позволит в максимальной степени отразить особенности каждого гербарного образца за счет отображения отдельных органов растений с большим увеличением, чем в целом гербарный лист. Уникальная информация, содержащаяся на гербарном листе, будет передана со всеми возможными деталями, при этом специальная компоновка снимков для дальнейшего рассматривания обеспечит подобие работы непосредственно с оригиналом гербарного листа, когда исследователь рассматривает его через лупу.

Изложенные подходы по 3D-визуализации биообъектов предлагается применять для подготовки тематических СD-дисков и по разным разделам биологии и экологии для иллюстраций соответствующих курсов. Во время проведения учебных занятий при индивидуальной работе стереомодели можно демонстрировать на экране монитора, кроме того, они могут проецироваться на выносной экран с помощью мультимедийного проектора для одновременного рассматривания группой лиц из зала через анаглифические очки.

Компьютерная поддержка учебных курсов биологии в виде СD-дисков с включением стереоскопических моделей по разным разделам биологии и экологии способна дополнительно обеспечить наглядную демонстрацию биологического разнообразия живой природы на качественно новом уровне, а также доступность информации о биологическом разнообразии, накопленной в специализированных музеях и различных научных учреждениях.

Предложенный подход к формированию тематических дисков с включением стереомоделей уже применен при подготовке первого из планируемой серии диска «Приспособления насекомых и растений к различным жизненным средам».

Второе направление приложений ЗD-визуализации - это формирование специализированных баз данных.

Таким образом, на компьютере можно визуализировать объемные изображения разнообразных биологических объектов, что обеспечит их представление очень близкое к реальному, существующему в природе.

Представление объектов в виде 3D-моделей может быть использовано для создания специализированных баз данных и образовательных мультимедиа продуктов, представленных на CD-дисках.

БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК

1. Биоразнообразие и динамика экосистем: информационные технологии и

моделирование / отв. ред. Шумный В.К. и др. - Новосибирскск: Изд-во СО РАН, 2006. -648 с. - (Интеграционные проекты СО РАН; вып. 7).

2. Трубина, Л.К. Стереомодели в изучении биологических объектов [Текст]: монография / Л.К. Трубина. - Новосибирск: СГГА, 2006. - 136 с.

3. Трубина, Л.К. Стереоскопические модели природных объектов разного масштаба в качестве иллюстративного материала для изучения биологии / Л.К. Трубина // материала междунар. конф. «Теорет. и приклад. исследования в ботанике». - Белгород: Белгород. гос. ун-т, 2005. - С. 280-282.

© Л.К. Трубина, О.А. Беленко, Е.И. Дюхина, 2008

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.