CC BY
128. Kuibanov F., Tanaka Y., Chub E. et al. Molecular epidemiology and interferon susceptibility of the natural recombinant hepatitis С virus strain RFl_2k/lb. J. Infect. Dis. 2008, 15, 198 (10): 1448-1456.
9. Kalinina O., Norder H., Vetrov T. et al. Shift in predominating subtype of HCV from lb to 3a in St. Petersburg mediated by increase in injecting drug use. J. Med. Virol. 2001,65: 517-524.
10. Lidman C., Norden L., Kaberg M. et al. Hepatitis С infection among injection drug users in Stockholm Sweden: prevalence and gender. Scand. J. Infect. Dis. 2009,41:679-684.
11. Morice Y., Cantaloube J.F., Beaucourt S. et al. Molecular epidemiology of hepatitis С virus subtype 3a in injecting drug users. J. Med. ViroL 2006,78(10): 1296-1303. ;
12.Miihlberger N., Schwarzer R., Lettmeier B. et al. HCV-relatedI burden of disease in Europe: a systematic assessment of incidence, prevalence, morbidity,'and mortality. BMC Public Health. 2009, 9:34.
13. Nelson P.K., Mathers B.M., Cowie B. et al. Global epidemiology of hepatitis В and hepatitis С in people who inject drugs: results of systematic reviews. Lancet. 2011, 378: 571-583.
14. Ohno Т., Mizokami M. Genotypihg with type-specific primers that can type HCV types 1-6. Methods in molecular medicine, \bl. 19: Hepatitis С protocols. 1998, p: 159-164.
15. Pybus O.G., Cochrane A., Holmes E.C., Simmonds P. The hepatitis С virus epidemic among injecting drug users. Infect. Genet. Evol. 2005, 5 (2): 131-139.
16. Rhodes Т., Piatt L., Maximova S. et al. Prevalence of HIV, hepatitis С and syphilis among injecting drug users in Russia: a multi-city study. Addiction. 2006, 101: 252-266.
17. Sarna A., Panda S. HCV in people who inject drugs: a neglected epidemic. Lancet Infect. Dis. 2015,15:4-5.
18. Simmonds P. Genetic diversity and evolution ofhepatitis С virus — 15 years on. J. Gen. Virol. 2004, 85 (11): 3173-3188. „ '
19. Thorpe L. E., Ouellet L. J., Hershow R. et al. Risk ofhepatitis С virus infection among young adult injection drug users who share injection equipment. Am. J. Epidemiol. 2002, 155: 645-653.
20. Wbrld Health Organization. A strategy to halt and reverse the HIV epidemic among people who inject drugs in Asia and the Pacific: 2010 — 2015, WHO Library Cataloguing, 2015.
Поступила 14.12.15
Контактная информация: Исаева Ольга Владиславовна, к.б.н.,
142782, Москва, поселение Московский, поселок Института полиомиелита,
27 км Киевского шоссе, р.т. (495)841-90-12
© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2016
Д.В.Воробьев, В.С.Соломка, К.И.Плахова, Д.Г.Дерябин, А.А.Кубанов
NG-MAST ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ NEISSERIA GONORRHOEAE, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФВДЕРАЦИИ В 2012 -2015 ГОДАХ
Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии, Москва
Цель. Характеристика современных штаммов N.gonorrhoeae с использованием NG-MAST генотипирования (Neisseria gonorrhoeae multi antigen sequence typing), выявление доминирующих вариантов и анализ их территориального распределения. Материалы и методы. В работе использованы 440 штаммов N.gonorrhoeae, выделенных в 2012 — 2015 годах на территории 19 субъектов Российской Федерации. Генотипирование проводили на основе секвенирования вариабельных участков генов рогВ и tbpB. Идентификацию аллелей и сиквенс-типов осуществляли согласно www.ng-mast.net. Результаты. Идентифицировано 172 NG-MAST генотипа, 100 из которых были описаны впервые. Преобладающими сиквенс-типами являлись 807, 1152, 1544, 5714 и 5941, типичные для нескольких субъектов Российской Федерации и некоторых стран ближнего зарубежья, а также впервые описанные сиквенс-типы 8583 и 9476, получившие исключительное распространение в регионах своего возникновения. Эпидемически значимые в странах
t
дальнего зарубежья сиквенс-типы 225,1407 и 2992 в настоящем исследовании были представлены единичными изолятами. Заключение. Показано своеобразие и значительное генетическое разнообразие штаммов N.gonorrhoeae, циркулирующих на территории Российской Федерации, с характерной привязанностью некоторых NG-MAST генотипов к одному или нескольким регионам.
Журн. микробиол., 2016, № 4, С. 42—51
Ключевые слова: Neisseria gonorrhoeae, молекулярная эпидемиология, NG-MAST гено-типирование
D. V. Vorobiev, V.S.Solomka, K.I.Plakhova, D.G.Deryabin, A.A.Kubanov
NG-MAST GENOTYPING OF NEISSERIA GONORRHOEAE STRAINS ISOLATED IN RUSSIAN FEDERATION IN 2012 - 2015
State Scientific Centre of Dermatovenerology and Cosmetology, Moscow, Russia
Aim. Characteristics of contemporary strains of N. gonorrhoeae using NG-MAST genotyping (Neisseria gonorrhoeae multi-antigen sequence typing), isolation of dominating variants and analysis of their territorial distribution. Materials and methods. 440 strains of N. gonorrhoeae isolated in 2012 — 2015 in 19 subjects of the Russian Federation were used in the study. Genotyping was carried out based on sequencing of variable regions of porB and tbpB genes. Identification of alleles and sequence-types was carried out according to http://www.ng-mast.net. Results. 172 NG-MAST genotypes were identified, 100 ofwhich—were described for the first time. 807,1152, 1544,5714 and 5941 were predominating sequence-types, typical for several subjects of the Russian Federation and some neighboring countries, as well as sequence-types 8583 and 9476 described for the first time, that were exclusively distributed in the regions of their emergence. Sequence-types 225,1407 and 2992, that are epidemically significant in distant countries, were represented * by single isolates in this study. Conclusion. A peculiar and significant genetic diversity of N. gonorrhoeae strains, circulating in the Russian Federation, with characteristic bond of several NG-MAST genotypes to one or several regions, was shown. ,
Zh. Mikrobiol. (Moscow), 2016, No. 4, P. 42-51
Key words: Neisseria gonorrhoeae, molecular epidemiology, NG-MAST genotyping ВВЕДЕНИЕ
Несмотря на устойчивую тенденцию к снижению заболеваемости гонореей в Российской Федерации (за последние 10 лет она сократилась на 49%, составив 23,5 случая на 100 тысяч населения) [ 1 ], данная инфекция сохраняет важную социальную значимость. Подобная ситуация делает актуальным создание и эффективное функционирование национальной системы эпидемиологического'надзора за распространением инфекций, передаваемых половым путем, базирующейся на глобальных методических подходах [6].
Одним из современных и широко используемых инструментов эпидемиологического контроля за распространением гонококковой инфекции является NG-MAST генотипирование (Neisseria gonorrhoeae multi antigen sequence typing) [5]. В его основу положено сравнение нуклеотидных последовательностей фрагментов двух вариабельных генов: рогВ, кодирующего белок по-ринового канала, и tbpB, кодирующего бета-субъединицу трансферрин-связывающего белка [9]. По результатам секвенирования каждой из данных аллелей определяется их соответствие известной или впервые описываемой последовательности, на основании чего делается заключение о принадлеж-
ности изолята к определенному или ранее неизвестному молекулярному типу N.gonorrhoeae, регистрируемому в международной базе данных www.ng-mast. net.
Использование данного подхода в США, Канаде и странах ЕС [3,5, 10] позволило охарактеризовать распространение определенных сиквенс-типов гонококка по «эпидемическим сетям», определить основные генетические кластеры N.gonoirhoeae, а также оценить изменчивость возбудителя гонококковой инфекции в динамике эпидемического процесса. Одним из важных результатов подобных исследований явилось выявление сиквенс-типа 1407, проявляющего признаки мультирезистентности к антимикробным препаратам и в настоящее время получившего широкое распространение по всему миру [4,5,7]..
На территории постсоветского пространства NG-MAST генотипирование ранее проводилось преимущественно на территории Российской Федерации [2, 11], а также в единичных исследованиях в Республике Беларусь [Lebedzeu F. et al., 2015] и Республике Казахстан [8]. При этом в наших предыдущих работах [2], [Kubanova A. et al., 2014] показано значительное генетическое разнообразие штаммов N.gonorrhoeae, циркулирующих на территории Российской Федерации, доминирующими из которых были сиквенс-типы 285, 228, 807,1152,5042,5714,5825 и др., отсутствующие или представленные единичными изолятами в странах Центральной и Западной Европы.
Полученные результаты подтвердили высокую дискриминирующую способность NG-MAST генотипирования, а также целесообразность его использования в системе пространственно-временного эпидемиологического мониторинга гонококковой инфекции. Однако опубликованные данные [Kubanova A. et al., 2014] ограничивались 2012 г. и не позволяли получить представление
0 характере распределения определенных сиквенс-типов в отдельных субъектах Российской Федерации, возможностях их трансграничного переноса, а также современном состоянии изменчивости N.gonorrhoeae, в том числе ведущей к возникновению новых NG-MAST генотипов.
В этой связи целью настоящего исследования явилось NG-MAST генотипирование штаммов N.gonorrhoeae, выделенных на территории Российской Федерации в 2012 — 2015 гг., с акцентом на выявление новых сиквенс-типов и анализом пространственного распределения ранее выявленных и впервые охарактеризованных молекулярных вариантов возбудителя гонококковой инфекции. , ,
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В исследование включены 440 изолятов N.gonorrhoeae (2012 г.— 156 штаммов; 2013 г. — 160 штаммов; 2015 г. — 124 штамма), полученных из специализированных учреждений дерматовенерологического профиля 19 субъектов Российской Федерации. Первоначальный посев поступивших культур проводили на шоколадный агар с добавлением 1% ростовой добавки ISOVitalex и
1 % селективной добавки VCAT (Becton Dickinson, США), после чего колонии микроскопировали и исследовали с использованием оксидазного теста, Окончательная верификация оксидазо-положительных грамотрицательных диплококков была проведена по совокупности биохимической активности с использованием карт идентификации NH на анализаторе VITEK 2 Compact (BioMerieux, Франция).
Выделение ДН К из чистых культур N.gonorrhoeae проводилось с исполь-
зованием набора «ДНК-Экспресс» (Литех, Россия). Амплификация вариабельных участков генов рогВ и tbpB была проведена с использованием прай-меров (ДНК-синтез, Россия), последовательность которых й условия амплификации указаны на сайте www.ng-mast.net. Наличие продуктов амплификации подтверждали электрофорезом в 1% агарозном геле в присутствии бромистого этидия и визуализировали на трансиллюминаторе (Bio-Rad, США) при 310 нм.
Полученные ДНК-фрагменты использовали в качестве матриц для повторного цикла амплификации, для чего их обрабатывали экзонуклеазой I (20 ед./мкл) и щелочной фосфатазой (1 ед./мкл) (Fermentas, Латвия), после чего проводили ПЦР с меченными терминирующими нуклеотидами Big Dye Terminator v 3.1 Sequencing RR-100 (Applied Biosystems, США). Полученные ампликоны разделяли методом капиллярного электрофореза в генетическом анализаторе ABI 3730XL Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США) и первично анализировали с использованием программного обеспечения 3730 Data Collection v. 3.0 и Sequencing Analysis 5.3.1.
Полученные нуклеотидные последовательности фрагментов генов рогВ и tbpB сравнивали с известными последовательностями аллелей соответствующих генов и по комбинации номеров аллелей определяли сиквенс-тип штамма N.gonorrhoeae. При несовпадении результатов секвенирования с известными последовательностями их направляли в международную базу www. ng-mast.net. для присвоения новых индивидуальных номеров аллелям и сиквенс-типам.
Статистическую обработку полученных результатов осуществляли в программе Statistica 10 (StatSoft, США), группируя региональные популяции N. gonorrhoeae с использованием модуля кластерный анализ.
РЕЗУЛЬТАТЫ <
В результате секвенирования фрагментов генов 440 штаммов N.gonorrhoeae, циркулирующих на территории Российской Федерации в 2012 — 2015 годах, было идентифицировано 133 варианта аллели рогВ и 54 варианта аллели tbpB, что подтверждает представления о высокой изменчивости первого из них [9], имеющего наиболее важное дискриминирующее значение при проведении масштабных молекулярно-эпидемиологических исследований [5]. Анализ нуклеотидных последовательностей названных генов позволил оценить 54 аллели рогВ и 12 аллелей tbpB как ранее неизвестные, что явилось основанием для их депонирования в международной базе NG-MAST под новыми оригинальными номерами. Наиболее часто встречающимися в анализируемой выборке являлись аллели рогВ 738 (п=35) и tbpB 27 (п=107).
Анализ комбинаций аллелей свидетельствовал о присутствии в составе анализируемой выборки 172 различных сиквенс-типов N.gonorrhoeae. При этом 72 NG-MAST генотипа (номера от 205 до 7435) были известны до проведения настоящего исследования^ а 100 были описаны впервые, в связи с чем, в международной базе www.ng-mast.net им были присвоены оригинальные номера в диапазоне от 8099 до 13061 (за исключением сиквенс-типов 8579, 9834 и 11335, ранее выявленных в Нижнем Новгороде, Омске и Калуге соответственно). Доля впервые идентифицированных вариантов была достаточно высокой на протяжении всего периода исследования, составляя от 30% (п=20) от всех NG-MAST генотипов в выборке 2012 года до 55% (п=45) и60,3% (п=35) в 2013 и 2015 годах соответственно.
Таким образом, результаты проведенного исследования подтвердили представления о значительном генетическом разнообразии штаммов N.gonorrhoeae, циркулирующих на территории Российской Федерации [2], [Kubanova A, et al., 2014]. Возможно, одной из причин такого разнообразия являлась недостаточная изученность российской популяции гонококков, в связи с чем, каждая новая попытка анализа приводила к описанию «новых» NG-MAST генотипов, на самом деле являющихся длительно циркулирующими вариантами, ранее не попадавшими в поле зрения исследователей. Другой возможной причиной являлась объективно происходящая интенсивная дивергенция N.gonorrhoeae, действительно ведущая к появлению новых молекулярных вариантов возбудителя гонококковой инфекции.
С целью проверки этих предположений нами был проведен анализ численности штаммов N.gonorrhoeae, относящихся к «старым» и «новым» сиквенс-типам, а также частоты обнаружения одних и тех же NG-MAST вариантов на отдельных этапах проведенного исследования.
Полученный результат свидетельствовал о существовании принципиальных различий в подобных распределениях. Среди известных сиквенс-типов около половины штаммов (49,6%) были представлены значительными по численности (6 и более) кластерами, в то время как на долю одиночных штаммов (каждый NG-MAST генотип представлен только одним изолятом) приходилось только 12,6% культур. Напротив, среди впервые описанных сиквенс-типов преобладали одиночные штаммы (29,4%), а доля изолятов, входящих в значительные по численности кластеры, снижалась до 20,6%.
Среди 72 известных NG-MAST генотипов 7 обнаруживались на всех этапах проведенного исследования, а 14 выявлялись в течение двух лет. С другой стороны, впервые описанные сиквенс-типы наиболее типично (93 из 100) обнаруживались однократно, а на протяжении двух лет выявлялись только 7 из них, и полностью отсутствовали варианты, регистрируемые в течении всего проведенного исследования. Кроме того, 22 наиболее многочисленных «старых» сиквенс-типа (160 штаммов) присутствовали в двух и более субъектах Российской Федерации, в то время как среди впервые описанных вариантов типичным было присутствие только в одном регионе, а межрегиональное распространение получили только 4 сиквенс-типа (14 штаммов). .
Тем самым, в отличие от первой попытки анализа генетического разнообразия N.gonorrhoeae, приведшей к выявлению 85,3% новых сиквенс-типов [Сидоренко С.В. и др., 2008] как следствия неизученности российской популяции гонококков, результаты настоящего исследования свидетельствуют в пользу объективного характера появления «новых» NG-MAST генотипов, непосредственно после своего возникновения имеющих относительно низкую численность, а также ограниченное распространение во времени и пространстве.
Среди наиболее многочисленных по числу штаммов NG-MAST генотипов лидирующее положение занимал известный сиквенс-тип 807, численность которого составила 10% от анализируемой выборки (пт=44). В нашем предыдущем исследовании [7] доля штаммов с данным сиквенс-типом составляла 7,9%, что указывает на его стабильно высокое присутствие в российской популяции N.gonorrhoeae, в настоящем исследовании обнаруживаемое на протяжении всего периода наблюдений в 5 из 19 обследованных субъектов Российской Федерации. Второй по численности сиквенс-тип 5714 (п=21) также регистрировался в течение всего периода наблюдений и был выявлен в
Кол-во Ж5-Ш8Т
Домшшрукяцне сюсвснс-типы
№рмав:к Москва С-Петербург Вологда Казань Н-Новгород
Калуга Омег Новосибирск Псков Саратов Брянск Тамбов Чебоксары Томск Пета Архангельск
О 5 10 15 20 25 30 35 Значение евкледового расстояния
Результаты кластерного анализа, характеризующие взаимосвязь между популяциями ГЧ^опоггЬоеае в обследованных регионах Российской Федерации, а также данные о количестве выявляемых 1ЧС-МА8Т генотипов и доминирующих сиквене-типах. ' - Нет доминирующего сиквенс-типа; * впервые выявленные сиквенс-типы. >
отапси (число шташюв)
7
Т
4 .
3
4
4
5
10
11
19
8
8
10 5714
б 807
5 1152,8583*
18 807
26 807,®», 5714,9570*
8 2610,5714,8106*
53 807,1544,9476*; 12531*
6 из 19 обследованных регионов. Третьим по численности был «новый» сиквенс-тип 9476, при этом его распространение ограничивалось только одним регионом, в котором он был впервые описан в 2013 году (п=4) и к 2015 году там же получил достаточно широкое распространение (п=14). Другими наиболее многочисленными КС-МАБТ генотипами являлись 1152 (п=12; 2012-2013 гг.; 3 региона), 5941 (п=12; 2012 —2015 гг.; 5 регионов), 1544 (п=12; ¡2013 - 2015 гг.; 1 регион), а также впервые описанный 8583 (п=10; 2012 г., 1 регион). Большинство названных эпидемически значимых сик-венс-типов были характерны именно для Российской Федерации, а некоторые из них (807, 1544, 5714) ранее обнаруживались в Беларуси и Казахстане, , ' • ■ что свидетельствует об их представительстве на значительной части всего постсоветского пространства. С другой стороны, наиболее часто регистрируемые в странах'Западной и Центральной Европы сиквенс-типы 225, 2992 [5], а также имеющий высокое эпидемиологическое значение сиквенс-тип 1407 [6] в обследованных регионах Российской Федерации были представлены единичными изолятами и к настоящему моменту в Российской Федерации не получили широкого распространения.
Проведенный в завершение данного исследования кластерный анализ (рис.), учитывающий представительство отдельных сиквенс-типов в региональных популяциях М^опогг1юеае, позволил определить степень подобия между ними и на этой основе сформировать представления о современных тенденциях эпидемиологии гонореи.
; Для 12 из 19 обследованных территорий типичным оказывалось существенное генетическое разнообразие выявляемых гонококков без значимого превалирования каких-либо сиквенс-типов (от 3 до 19 по отдельным регионам), представленных как известными, так и впервые выявляемыми NG-MAST вариантами. При этом подобная ситуация может объясняться внутрироссий-скими миграционными потоками, «размывающими» региональные популяции возбудителя гонококковой инфекции и обеспечивающими их распространение по всей территории Российской Федерации. Помимо Москвы и Санкт-Петербурга в данную группу входили ряд центральных (Калужская, Рязанская, Владимирская), северо-западных (Мурманская, Вологодская, Псковская), приволжских (Нижегородская, Республика Татарстан) и сибирских (Новосибирская, Омская) областей.
С другой стороны, в 7 регионах были выявлены превалирующие NG-MAST генотипы, позволяющие сгруппировать популяции N.gonorrhoeae по степени их подобия (рис.). Так, для Брянской области и Республики Чувашия типичным являлось доминирование сиквенс-типа 807, для Саратовской области — 5417, а для Томской области одновременное значительное представительство сиквенс-типов 807,5714 и 5941, каждый из которых относился к «старым» NG-MAST вариантам. С другой стороны, для 3 областей и республик оказывалась типичной ситуация одновременного доминирования известных и широко распространенных сиквенс-типов, а также одного иди двух «новых» NG-MAST вариантов. В частности, в Пензенской области наряду с существенным представительством сиквенс-типов 2610 и 5714 до 15% анализируемой выборки занимали впервые описанные здесь сиквенс-тиы 8106 и 9570. В Тамбовской области «новый» сиквенс-тип 8583 по частоте распространения даже занял лидирующее положение (41,7% от общей численности анализируемой выборки), в то время как на долю «старого» сиквенс-типа 1152 приходилось только 29,2%. Наконец, в Архангельской областитакже зафиксировано совместное присутствие «старых» (807, 1544) и «новых» (9476, 12531) сиквенс-типов, среди которых описанный нами в 2013 году NG-MAST генотип 9476 в динамке исследования занял в регионе доминирующее положение. Подобная ситуация может быть интерпретирована как результат одновременного действия двух тенденций, первая из которых определяется межрегиональным распространением эпидемически значимых «старых» NG-MAST генотипов, а вторая — возникновением «новых» сиквенс-типов, уже достигших значительной численности в исследуемых регионах, но еще не вышедших за их пределы.
ОБСУЖДЕНИЕ
Методы молекулярной эпидемиологии получают все большее распространение в системе эпидемиологического надзора за распространением гонококковой инфекции на территории Российской Федерации, осуществляемого с 2007— 2008 гг. [5, 6, 11]. Настоящее исследование является развитием этого направления: за период 2012 — 2015 гг. в 19 субъектах Российской Федерации собрана представительная выборка из 440 штаммов N.gonorrhoeae, охарактеризованных по NG-MAST генотипам.
Полученные результаты подтвердили ранее сформированные представления о высоком генетическом разнообразии популяции гонококков, циркулирующих на территории Российской Федерации [2], в настоящем исследовании отнесенных к 172 различными сиквенс-типам. Среди них наиболее выраженное эпидемиологическое значение, определяемое высокой частотой встречаемости, представительством в нескольких регионах, а также устойчивым присутствием на этапах проведенного исследования, имели NG-MAST генотипы 807,1152,1544, 5714 и 5941, ряд из которых также типичен для ближнего зарубежья [8], но спорадически встречается в странах Западной и Центральной Европы [5]. С другой стороны, получившие европейское или всемирное распространение эпидемические сиквенс-типы 225,2992 и 1407 [5, 6], в настоящем исследовании были представлены единичными изолятами, что свидетельствует об отсутствии интенсивного трансграничного переноса N.gonorrhoeae из стран дальнего зарубежья. Одновременно результаты проведенного исследования указывают на существование интенсивной миграции
между обследованными субъектами Российской Федерации, приводящей к формированию в большинстве из них генетически разнообразных популяций N.gonorrhoeae без доминирующих сиквенс-типов или с преобладанием указанных выше эпидемически значимых NG-MAST генотипов.
Другим важным результатом проведенного исследования является выявление значительного количества ранее неизвестных сиквенс-типов N.gonorrhoeae, анализ количественного состава, сроков и ареалов обнаружения которых позволяет констатировать объективный характер происходящей внутривидовой дивергенции в популяции N.gonorrhoeae. При этом ряд из впервые описанных сиквенс-типов (8583, 9476 и др.) в динамике настоящего исследования получили достаточно широкое распространение в регионах своего возникновения, что указывает на их высокий эпидемический потенциал и в дальнейшем позволяет ожидать распространения соответствующих NG-MAST генотипов на другие территории Российской Федерации.
Отметим, что значительное количество ранее неизвестных сиквенс-типов в российской популяции гонококков отмечалось в целом ряде предыдущих работ [2, 11] и сохранялось на достаточно высоком уровне в динамике всего настоящего исследования. При этом преимущественная изменчивость по гену рогВ, кодируемый которым белок поринового канала принимает участие в транспорте антибиотиков [9], позволяет рассматривать подобное разнообразие в качестве одного из вероятных механизмов адаптации популяции N. gonorrhoeae в условиях сохранения эффективных средств антибиотикотерапии гонококковой инфекции.
Указанные обстоятельства, а также растущий риск возникновения неизлечимых форм гонореи, определяемой формированием дополнительных механизмов резистентности N.gonorrhoeae к используемым антимикробным препаратам, явились основанием для включения ВОЗ данного заболевания в проект Глобальной стратегии сектора здравоохранения на 2016 — 2021 гг. с приданием ей статуса стратегического приоритета (http://www.who.int/). В этой связи, представленная в настоящем исследовании национальная система пространственно-временного молекулярно-эпидемиологического мониторинга, основанная на NG-MAST генотипировании N.gonorrhoeae, должна стать одним из элементов этой стратегии, позволяющим своевременно выявлять и предупреждать распространение мультирезистентных вариантов возбудителя гонококковой инфекции.
Исследование выполнено в рамках Государственного задания ФГБУ «ГНЦЦК» Минздрава России на 2015 год и плановый период 2016 и 2017 гг. по Государственному контракту 114/ БУ-2015-051 от 16.01.2015 г. '
ЛИТЕРАТУРА ¡.
1. Кубанова A.A., Кубанов A.A., Мелехина Л.Е., Богданова Е.В. Дерматовенерология в Российской Федерации. Итоги 2014 г. Успехи, достижения, основные пути развития. Вестник дерматологии и венерологии. 2015,4:13-26.
2. Соломка B.C., Чупров-Неточин Р.Н., Фриго Н.В., Кубанов A.A. Опыт молекулярного типирования и филогенетического анализа штаммов N. gonorrhoeae в Российской Федерации. Вестник дерматологии и венерологии. 2012, 2: 13-20.
3. Buono S., Wu А., Hess D.C. et al. Using the Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence-typing method to assess strain diversity and antibiotic resistance in San Francisco, California. Microb. Drug Resist. 2012, 8 (5): 510-517. 1
4. Chen C.C., Yen M.Y., Wang W.W. et al. Tracing subsequent dissemination of a cluster of gono-
4.ЖМЭИ 4 Ns 25-2016
49
coccal infections caused by an ST1407-related clone harbouring mosaic penA alleles in Taiwan. J. Antimicrob. Chemother. 2013, 68 (7): 1567-1571.
5. European centre for disease prevention and control. Molecular typing of Neisseria gonorrhoeae — results from a pilot study 2010-2011. Stockholm, ECDC, 2012.
6. Global incidence and prevalence of selected curable sexually transmitted infections. Geneva, WHO, 2012.
7. Jeverica S., Golparian D., Maticic M. et al. Phenotypic and molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae isolates from Slovenia, 2006—12: rise and fall of the multidrug-resistant NG-MASTgenogroup 1407 clone? J. Antimicrob. Chemother. 2014,69: 1517-1525.
8. KushnirA.V., MuminovTA., BayevA.I. etal. Molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae isolates in Almaty, Kazakhstan, by VNTRanalysis, Opa-typingandNG-MAST. Infection Genetics Evolution. 2012.12:570-576.
9. Martin I.M., Ison С A, Aanensen D.M. et al. Rapid sequencing-based identification ofgonococcal transmission clusters in a large metropolitan area. J. Infect. Dis. 2004,189 (8): 1497-1505.
10. Thakur S.D., Levett P.N., Horsman G.B. et al. Molecular epidemiology of Neisseria gonorrhoeae isolates from Saskatchewan, Canada: utility of NG-MAST in predicting antimicrobial susceptibility regionally. Sex. Transm. Infect. 2014,90 (4): 297-302.
11. Unemo M., \brobieva V., Firsova N. et al. Neisseria gonorrhoeae population in Arkhangelsk, Russia: phenotypic and genotypic heterogeneity. Clin. Microbiol. Infect. 2007, 13 (9): 873-878.
Поступила 04.03.16
Контактная информация: Дерябин Дмитрий Геннадьевич, д.м.н., проф.,
107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6, р.т. (499)785-20-40
© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2016
Н.К.Ахматова1, В.Г.Хоменков', Е.В.Волкова2, ЭААкматова1-3, И.А.Семочкин', Т.С.Перепанова2, В.В.Зверев13
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ЛИЗАТЫ ESCHERICHIA COLI СТИМУЛИРУЮТ ПРОДУКЦИЮ ДЕФЕНСИНОВ НЕЙТРОФИЛАМИ ПЕРИФЕРИЧЕСКОЙ КРОВИ
'НИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова, 2НИИ урологии и интервенционной радиологии, Москва; ^Первый московский государственный медицинский университет им. И.М.Сеченова
Цель. Изучение влияния препарата микробного происхождения на основе лизата бактерий Escherichia coli (Уро-Ваксом) на продукцию дефенсинов (HNP1 -3, лактоферрин — LF) и IgM/IgA у больных с рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей (РИНМП). Материалы и методы. В исследование включены 40 женщин с РИНМП в возрасте от 18 до 68 лет, которые получали монотерапию препаратом «Уро-Ваксом» (бактериальный лизат 18 штаммов Е. coli), и 26 здоровых женщин. Уровень дефенсинов и иммуноглобулинов в крови определяли с помощью твердофазной ИФА тест-системы (HNP1-3, LF, Elisa Kit, Hycult biotech, Netherlands; Serazym Human IgA, IgM, Germany). Результаты. У больных РЙНМП отмечался сниженный уровень дефенсинов HNP1-3 и LF, свидетельствующий о хроническом течении воспалительного процесса в организме. Применение лизата E.coli приводило к нормализации данных показателей в сыворотке крови женщин. Уровень IgM и IgA в крови больных оставался в пределах нормальных значений, и применение бактериального лизата не влияло на эти показатели. Заключение. Препарат «Уро-Ваксом» на основе лизата бактерий E.coli обладает иммунокорригирующим действием при лечении больных РИНМП.
Журн. микробиол., 2016, № 4, С. 50—55
Ключевые слова: рецидивирующая инфекция нижних мочевых путей, лизат Escherichia coli, HNP1-3, лактоферрин, иммуноглобулины < ■ ■ \ <( .
