CC BY
13НЕКОТОРЫЕ дефиниции, ИЛИ ОПРЕДЕЛЕНИЯ В МЕДИЦИНСКОЙ МИКОЛОГИИ
Елинов Н.П.
НИИ медицинской микологии им. П.Н.Кашкина ГОУ ДПО СПб МАПО Минздравсоцразвития, Санкт-Петербург, Россия
© Елинов Н.П., 2008
В данной публикации приведен ряд определений, широко используемых микологами в своей профессиональной деятельности, дана им характеристика, включая принятые ныне пересмотренные и согласованные дефиниции. Статья рассчитана на широкий круг клинических и лабораторных микологов, в также врачей смежных специальностей.
Ключевые слова: грибы, классификация, микозы, микроми-цеты, определения, терминология
SOME DEFINITIONS IN THE MEDICAL MYCOLOGY
Yelinov N.P.
Kashkin Research Institute of Medical Mycology of SEI APE SPb MAPE, Saint Petersburg, Russia
©Yelinov N.P., 2008
There are a number of papers with definitions which are used widely by mycologists in their professional activities and also have been given characters them including accepted now revised and coordinated definitions
Key words: classification, definitions, Fungi, mycoses, micro-mycetes, terminology
Лица, повышающие квалификацию по лабораторной и клинической микологии, с первых занятий встречаются с многими терминами и определениями, знание которых необходимо для изучения вышеназванных дисциплин и закрепления их впредь. Это в равной мере относится и к студентам, обучающимся по данным предметам в системе вузовского образования, и, прежде всего, медицинского.
С «легкой руки» Р.Х. Уиттакера [1] грибы (Fungi)
- макромицеты и микромицеты теперь составляют самостоятельное царство в живой природе, наряду с царствами животных (Animalia), растений (Plantae), бактерий (Bacteria) и вирусов (Vi'ra) [2, 3]. Еще недавно грибы, выделенные из сообщества растений, именовали как Mymta, но название Fungi ныне стало общепринятым. Более ранние названия грибов составляют ранг синонимов, которые перечислены ниже: Carpomycetes, Eumycota, Eumycophyta, Eumycetes, Fungales, Hysterophyta, Inophyta, Mycota, Mycetes, Mycetoideum, Mycocetales, Mycetalia, Mycophyta, Mycophytes, Mycophycophytes [4]. И, тем не менее, Fungi в том же труде [4] и в некоторых других [5] именуют как царство Eukaryota. Однако терминологически и по сути своей эукариоты включают организмы, в клетках которых содержатся настоящие (оформленные) ядра. Поэтому правомерно выделение эукариот в ряд Надцарства (Supraregnum, или по-англ. Suprakingdom) [3], или Домен [4]. Следовательно, различные ранги грибов в иерархии ботанической номенклатуры можно представить в следующем виде:
Главные, вторичные и некоторые другие ранги в номенклатурной иерархии (ботанической) на при-
мере базидиальных грибов:
Domain (Домен, Надцарство)...............Eukaryota
Regnum (Царство).............................Fungi
Phylum, Division (Отдел).............Basidiomycota
Sub -”- Sub -»- (Подотдел).........Basidiomycotina
Classis (Класс).....................Basidiomycetes
Sub -”- (Подкласс)................Basidiomycetidae
Ordo (Порядок)..........................Basidiales
Sub -”- (Подпорядок)....................Basidineae
Familia (Семейство) ...................Basidiaceae
Sub -”- (Подсемейство)................Basidioideae
Tribus (Колено, ветвь)...................Basidieae
Sub -”- (Субветвь) .....................Basidinae
Genus (Род)...........Rhodotorula, Schizophyllum,
Basidiobolus, Trichosporon и др.
Sub -»- (Подрод).........................cм.Genus
Sectio (Секция) ..................................
Sub -”- (Подсекция) ..............................
Series (Серия) ...................................
Sub -”- (Подсерия) ..............................
Species (Вид)...............................разные
Sub -”- (Подвид) ..........................разные
Variant (Вариант) ......................... разные
Sub -”- (Подвариант) ......................разные
Forma (Форма).....................................
Forma specialis (Специальная форма)
Physiologicus Race (Физиологическая раса).....
Individualis (Индивидуальный), например strain -штамм
Не все ранги применимы для каждого вида и часто в этом нет необходимости.
Медицинским микологам, прежде всего, лабораторным постоянно приходится выделять микро-мицеты из различного патологического материала и ряда других объектов с последующим определением грибов-патогенов или условных патогенов до рода и вида. При этом они вплотную соприкасаются с систематикой или биосистематикой грибов - наукой
о биоразнообразии грибов в природе и их классификации. Субдисциплинами систематики являются номенклатура и таксономия. Номенклатура - это придание научных названий единицам систематического значения с официальным (формальным) их признанием. Номенклатура грибов «управляется» Международным Кодексом (Уложением - от франц. Code) ботанической номенклатуры и принимается каждым Международным Ботаническим Конгрессом (МБК). Поскольку правила Кодекса можно изменять в различных изданиях, постольку самые последние по времени должны быть проконсультированы. Конгресс назначает Комитет по Грибам (CF), побуждающий к действиям, которые следует предпринять по предложениям, касающимся грибов. Кодекс нацеливает на обеспечение стабильного метода названия таксономических групп, упреждая и исключая использование названий, которые могут привести к ошибке или двусмысленности или толкать науку на ложный путь.
Когда решение по таксономии принято, Кодекс обеспечивает правила определения названия, которое должно быть принято: каждый таксон (таксономическая группа любого ранга - вид, род и т.д.) в данной позиции о ранге может иметь только одно номенклатурно корректное название. Например, Токийский Кодекс включает 6 принципов, названных в работе [6], 62 статьи (мандатные), не мандатные рекомендации и различные дополнения.
Таксономия - наука о классификации, сущность которой заключается в отнесении грибов к определенным таксонам, поименованным выше в номенклатурной иерархии.
Ранг вида является основным (базовым) (2-я статья в Кодексе), хотя еще не существует универсально приемлемого его определения.
В настоящее время достаточно широко прибегают к геносистематике, то есть проведению каталогизации нуклеотидных последовательностей (НП) в наиболее консервативных структурах клетки гриба (равно как и других организмов) - рРНК (16S p-РНК, 5S р-РНК). На последовательности нуклеиновых оснований в них не влияют ни супрессорные мутации, ни вырожденность генетического кода. В результате каталогизации НП устанавливают величины (размах) сходства видов (штаммов), по которым
создают филогенетические дендрограммы. Филогенетическая реконструкция - это метод систематики, или кладистика, продуктом которой является кла-дограмма. Монофилетическую группу любой величины называют кладом; признание и иерархическое расположение таких таксонов составляет практику кладистики.
Выше «порядка» и, особенно, выше «класса» существует большое различие в их использовании, потому что правила приоритета не применяют выше семейства. Неформальный ранг «специальная форма» (forma specialis = f.sp. - статья 4-я в Кодексе), приемлемая для микологов, желающих разделить морфологически идентичные грибы посредством множества реакций, не регулируется Кодексом и не является системой обозначения для физиологических рас, определенных рядом соглашений между заинтересованными микологами.
Любые рассматриваемые характеристики, представляющие значительные расхождения либо биологические, морфологические, ультраструктурные или молекулярные, могут быть использованы в классификациях. особое ударение делается на репродуктивных структурах, ультраструктуре и молекулярных данных на уровнях выше «семейства».
Для патогенных и условно-патогенных грибов свойство патогенности представляет особую важность и, как установлено во второй половине прошлого века, болезнетворными оказываются бесполые формы соответствующих микромицетов, то есть анаморфы (в ед. числе - анаморф). С половыми формами - телеоморфами ( в ед. числе - телеоморф) необходимы дополнительные исследования для выяснения их роли в возникновении и развитии некоторых заболеваний, хотя представляется очевидным, что телеоморфы непатогенны у всех медицински значимых микромицетов.
Применительно к изложенным выше материалам целесообразно и полезно привести определения, пересмотренные и согласованные (проект VI) Европейской организацией по изучению и лечению рака (EORTC = European Organization for Research and Treatment of Cancer) и группой по изучению микозов в Национальных институтах здравоохранения, США (MSG = Mycoses Study Gropup NIH, USA) [7].
Участники группы исполнителей (32 человека)
- известные в мире ученые: Бен Де Поу (Председатель), Том Уэлш (Председатель), Дж. Питер Доннели (Секретарь), Сибе Эсфиоглу, Джек Бенетт, Джакэ Билл, Дэвид Деннинг, Билл Дисмуке, Джек Эдвардс, Рауль Хербрехт, Уильям Хоуп, Кэрол Кауфман, Крис Кибблер, Барт-Йан Кулберг, Оливер Лорталари, Йохан Маертенс, Кирен Марр, Георг Машмейер, Патриция Муноз, Фрэнк Оддс, Пит Паппае, Том Паттерсон, Джон Пёрфект, Анжела Ристрепо, Маркус Рунке, Сегал Брамс, Джек Собел, Таня К. Соррелл, Дэвид Стивенс, Клаудио Висколи, Джон Уингард, Теоклис Зутис.
1 Доказанные инвазивные грибковые заболевания
2 Болезнь глубоких тканей
3 Плесени1
4 Гистопатологическая, цитопатологическая или прямая микроскопическая проверка2 игольного
5 аспирата или биоптата на наличие гифальных форм с очевидностью ассоциированного
6 повреждения ткани (или микроскопически, или как инфильтрат, или предполагаемое поражение)3
7 ИЛИ
8 Обнаружение плесени культурально из образца, полученного стерильной процедурой
9 из нормально стерильного и клинически или радиологически ненормального места,
10 обусловленного инфекционным заболеванием, исключая бронхолегочный лаваж (БАЛ), полость черепного синуса и мочу
11 Дрожжи
12 Гистопатологическая или цитопатологическая проверка2 игольного аспирата или биоптата
13 из нормально стерильного места, исключая слизистые оболочки, выявляя
14 дрожжевые клетки (Candida species могут быть в виде псевдогиф и настоящих гиф)
15 ИЛИ
16 Обнаружение дрожжей культурально стерильной процедурой
17 (включая свежеустановленный (< 24 часов) дренаж из нормального стерильного и клинически или
1 радиологически ненормального места, обусловленного инфекционным процессом
2 Фунгемия
3 Плесени
4 культура крови позитивна на наличие плесени, например, Fusarium spp. в контексте
5 процесса совместимого инфекционного заболе-вания4
6 Дрожжи
1 Дополнительная идентификация до рода или вида, если выделена культура
2 Ткань или клетки, представленные для гистопатологи-ческой и цитологической проверки, должны быть окрашены по Грокотту-Гоморри метенамином серебра или перйодной кислотой (окраска по Шиффу) на выявление структур гриба. Где возможно, влажные образцы из фокусов, имеющих отношение к инвазивному грибковому заболеванию, должны быть окрашены флуоресцентным маркером (например, калькофлюором или Бланкофо-ром)
3 Индивидуальное грибковое заболевание по все данным, например, доказанный аспергиллез, должен быть подтвержден культурально с определением культуры. При недостатке данных для этого заболевания оно признается как доказанное плесневое инвазивное грибковое заболевание.
4 Другие плесени могут вызвать фунгемию. Однако должна быть исключена контаминация (загрязнение) перед обозначением диагноза доказанного инвазивного грибкового заболевания
7 Культура крови позитивна на наличие дрожжей (например, Candida spp.) или дрожжеподобных грибов (например,
8 Trichosporon spp.)
9 Эндемические грибковые заболевания5
10 Диссеминированное и/или легочное заболе-вание6
11 Должно быть доказано выделением культуры из образца, полученного из
12 пораженного места в организме хозяина, временно связанного с процессом грибкового
13 инфекционного заболевания;
14 ИЛИ,
15 если культура стерильна или не получена, ги-стопатологическая или прямая микроскопическая
16 демонстрация соответствующих морфологических форм расценивается адекватной для
1 диморфных грибов, имеющих точно отличительное появление7.
2 ИЛИ
3 Положительная культура крови
4 В случае гистоплазмоза диагноз диссеминированного заболевания может быть
5 поставлен на основании положительного теста на антиген8 Histoplasma в цереброспинальной жидкости (CSF), моче или сыворотке
6 с помощью EIA или по присутствию характерных внутриклеточных дрожжевых форм в мазке периферической
7 крови или в костном мозге.
8 Или, в случае кокцидиоидомикоза, диагноз диссеминированного заболевания может быть
9 установлен демонстрацией специфических ан-тител9
10 к возбудителю в CSF или их подъем во 2-м разведении, при совпадающих данных в двух последовательных образцах крови, при условии
11 связанного по времени процесса инфекционного заболевания
12 Криптококкоз
13 Вероятно инвазивное грибковое заболева-
5 Гистоплазмоз, бластомикоз, кокцидиоидомикоз и пара-коккцидиоидомикоз, споротриксоз и инфекция, вызванная Penicillium marneffei
6 Должна быть установлена медицинская история, чтобы провести различие между первичной и хронической легочной инфекцией. Атака в пределах 3 месяцев определяет первичную легочную инфекцию.
7 Histoplasma capsulatum var. capsulatum может походить на Candida glabrata или Leishmania в ткани, но может быть отличима от них по характерным гистологическим проявлениям гранулематозного воспаления и по окрашиванию метенамином серебра по Грокотту-Гоморри
8 Определение должно выполняться только в лабораториях, имеющих на то законное разрешение; то есть клинические корреляции делают по результатам и титрам и данным, пригодным по ложно-положительным и ложнонегативным оценкам в сравнении с тестом, полученным в названной лаборатории.
9 При условии других вероятных причин должны быть исключены
ние
14 По крайней мере, определены
15 а) один хозяйский критерий
16 И
1 Ь) один клинический критерий
2 И
3 с) один микробиологический критерий
4 Возможное инвазивное грибковое заболевание9 (см. примечание на с. 14)
5 По крайней мере, определены
6 а) один хозяйский критерий
7 И
8 Ь) один клинический критерий
9 НО
10 с) не микробиологический критерий
11 Хозяйские факторы
12 Хозяйские факторы не синонимичны с факторами риска и являются характеристиками, благодаря
13 которым индивидуумы могут быть признаны как предрасположенные к инвазивным грибковым заболеваниям
14 Они готовы первично быть отнесенными к пациентам, леченным от опухолевого заболевания,
15 и к реципиентам аллогенных гематопоэтиче-ских стволовых клеток и
16 трансплантата паренхиматозного органа. Эти хозяйские факторы приложимы к лицам, получающим
17 кортикостероиды и другие Т-клеточные су-прессанты, так же как и к лицам с первичными
18 иммуннодефицитами
19 1) Современная история нейтропении (<0.5 х 109/Ь {<500 нейтрофилов/мм3} в течение
20 > 10 дней), временно связанная с атакой грибкового заболевания или наступление
1 нейтропении.
2 2) Восприятие трансплантата аллогенных стволовых клеток
3 3) пролонгированное использование кортикостероидов (исключая пациентов с АБЛА) в
4 средней минимальной дозе 0.3 мг/кг/день пред-низалонового эквивалента в течение
5 > 3 недель
6 4) Лечение другими признанными Т-клеточны-ми супрессантами, такими как
7 циклоспорин, ТЫБ-а блокаторы, специфические моноклональные антитела алемтуцумаб,
8 нуклеозидные аналоги в течение последних 90 дней
9 5) Наследственный серьезный иммуннодефи-цит (например, хроническое гранулематозное заболевание,
10 серьезный комбинированный иммунодефицит)
11 Клинические критерии
12 Должны быть в соответствии с микробиологиче-
скими находками, если любая, временно связанная с
13 текущим эпизодом, и другие потенциальные причины были устранены
14 Грибковые заболевания нижнего отдела дыхательного тракта
15 A) наличие одного из следующих «специфических» картин (признаков) на компьютерном томографе (КТ):
16 • Хорошо определенный узел (узлы) с или без признака ореола (гало)
17 • Клиновидный инфильтрат
18 • Признак воздушного полумесяца
19 • Полость
20 B) Наличие нового неспецифического фокального инфильтрата
1 ПЛЮС, по крайней мере, одного из следующих признаков10:
2 Плеврального затруднения
3 Плевральной боли
4 Кровохарканья
5 Трахеобронхит
6 Трахеобронхиальное изъязвление, при бронхоскопии видны
7 узел, псевдомембрана, пляки (тромбоциты) или струпья
8 Синусоназальная инфекция
9 Имидж (образ), доказывающий синусит
10 ПЛЮС
11 по крайней мере, одно из следующих:-
12 Острая локализованная Боль (включая радирующую в глаз)
13 Назальная язва, темные струпья
14 распространение из параназального синуса через костные барьеры, включая
15 орбиту
16 Эндофтальмит
17 как определено при офтальмологическом обследовании
18 ЦНС инфекция
19 по крайней мере, одно из следующего:-
20 Фокальные поражения на изображении
21 Возрастание менингита при магнитнорезонансном исследовании или при КТ
1 Хронический диссеминированный кандидоз
2 Малые, периферические, мишенеподобные абсцессы (новые узловые дефекты, заполняющиеся дефекты, поражения наподобие бычьего глаза) в
3 печени и/или селезенке
4 Микробиологические Критерии
5 Цитология, прямая микроскопия или культура:
6 1. мокрота, БАЛ (бронхоальвеолярный лаваж) и бронхиальные brush-образцы (от англ. brush - щетка), в которых присутствуют
7 грибные элементы либо получение культуры
10 симптомы не необходимы, если имеется микологическая
очевидность
плесени (например, Aspergillus spp.,
8 Fusarium spp., Zygomycetes, Scedosporium spp.) или определение
9 нитчатых форм при цитологической проверке или прямой микроскопией
10 2. синусовый аспират: получение плесеней в культуре или определение нитчатых
11 форм цитологически или прямой микроскопией.
12 3. Язвы на коже, дренирующие поражения мягких тканей или трещины; при этом необходимы и микроскопия,
13 и получение культур
14 Определение антигена, компонентов клеточной стенки или нуклеиновой кислоты
15 4. галактоманнановый антиген EIA (Platelia).
16 a) единичные образцы плазмы или сыворотки позитивны на галактоманнан
17 b) единичные образцы БАЛ, плевральной жидкости или цереброспинальной жидкости позитивны на галактоманнан
18 6. Испытание на глюкан применимо, главным образом, при аспергиллезе и кандидозе, но не
19 при криптококкозе, не зигомикозах (Rhizopus spp., Mucor spp.,
20 Absidia spp.)
21 единичный образец сыворотки позитивен на бета^-глюкан
22 7. Полимеразная Цепная Реакция (ПЦР) для определения нуклеиновой кислоты
1 До тех пор, пока ПЦР-система окончательно не развита, что было признано, позитивные
2 результаты с кровью, тканями или БАЛ на изученные специфические грибы не
3 будут оценены как микробиологическая очевидность инвазивного грибкового заболевания.
В изложенных выше дефинициях имеются такие неточности, как название Candidiasis вместо научно обоснованного Candidosis в подзаголовке «Хронический диссеминированный кандидиазис» в английском тексте, а также нарушение хронологии в нумерации (раздел «Определение антигена, компонентов клеточной стенки или нуклеиновой кислоты» в английском тексте) обозначены строки 18.6 вместо 18.5 и 22.7 вместо 22.6.
В контексте представленных материалов не устарело международное соглашение по дефиниции оппортунистических грибковых инфекций, опубликованное в 2003 г.[8].
Для исключения каких-либо неточностей и в целях сопоставления приведены вышеизложенные дефиниции на английском языке.
1 Proven invasive fungal diseases
2 Deep tissue disease
3 Moulds1
4 Histopathologic, cytopathologic, or direct microscopic examination2 of a needle
5 aspiration or biopsy specimen showing hyphal forms with evidence of associated
6 tissue damage (either microscopically or as an infiltrate or lesion by imaging)3
7 OR
8 Recovery of a mould by culture from a sample obtained by a sterile procedure
9 from a normally sterile and clinically or radiologically abnormal site consistent
10 with an infectious disease process, excluding BAL, cranial sinus cavity, and urine.
11 Yeasts
12 Histopathologic or cytopathologic examination2 of a needle aspiration or biopsy
13 specimen from a normally sterile site excluding mucous membranes showing
14 yeast cells {Candida species may also show pseu-dohyphae or true hyphae)3
15 OR
16 Recovery of a yeast by culture from a sample obtained by a sterile procedure
17 (including a freshly (<24h) placed drain) from a normally sterile and clinically or
1 radiologically abnormal site consistent with an infectious disease process,
2 Fungemia
3 Moulds
4 Blood culture that yields a mould e.g. Fusarium spp. in the context of a
5 compatible infectious disease process4.
6 Yeasts
7 Blood culture that yields yeast (e.g. Candida species) or yeast-like fungi (e.g.
8 Trichosporon spp.)
9 Endemic fungal disease5
1 Append identification at genus or species level from culture, if available.
2 tissue and cells submitted for histopathology or cytopathol-ogy should be stained by Grocott-Gomorri methenamine silver stain or by periodic acid Schiff stains to facilitate inspection of fungal structures. Where possible, wet mounts of specimens from foci related to invasive fungal infectious disease should be stained with a fluorescent marker (e.g., calcofluor or Blancophor)
3 Individual fungal invasive disease entities e.g. proven aspergillosis require culture and identification. Failling this the disease is designated as proven mould invasive fungal disease
4 Other moulds can cause fungemia. However contamination should be excluded before assigning the diagnosis of proven invasive fungal disease
5 Histoplasmosis, blastomycosis, coccidioidomycosis, and paracoccidioidomycosis, sporotrichosis and infection due to Penicillium marneffei
10 Disseminated and/or pulmonary6 disease
11 Must be proven by recovery in culture from a specimen obtained from the
12 affected site, in host with a temporally related illness consistent with a fungal
13 infectious disease process;
14 OR
15 if culture is sterile or not obtained, histopathologic or direct microscopic
16 demonstration of appropriate morphological forms is considered adequate for
1 dimorphic fungi having truly distinctive appear-ance.7
2 OR
3 Positive blood culture
4 In the case of histoplasmosis a diagnosis of disseminated disease may be
5 established by a positive Histoplasma antigen test8 on CSF, urine or serum by
6 EIA, or the presence of characteristic intracellular yeast forms in a peripheral
7 blood smear or in bone marrow.
8 Or in the case of coccidioidomycosis a diagnosis of disseminated disease may be
9 established by demonstration of coccidioidal antibody9 in CSF, or a 2-dilution rise
10 measured in two consecutive blood samples tested concurrently in the setting of
11 a temporally related infectious disease process.
12 Cryptococcosis
13 Probable invasive fungal disease
14 Defined by at least
15 a) one host criterion
16 AND
1 b) one clinical criterion
2 AND
3 c) one microbiological criterion
4 Possible invasive fungal disease9
5 Defined by at least
6 a) one host criterion
7 AND
8 b) one clinical criterion
9 BUT
10 c) no microbiological criterion
11 Host factors
6 the medical history must be established to distinguish between a primary and chronic pulmonary infection. Onset within 3 months defines a primary pulmonary infection.
7 Histoplasma capsulatum variety capsulatum may resemble Candida glabrata or Leishmania in tissue but can be distinguished from them by the characteristic histologic features of granulomatous inflammation and staining by Grocott-Gomorri methenamine silver stain
8 Testing should be performed only in laboratories where the assays have been validated; i.e., clinical correlations made with results and titers, and with data available on false positive and false negative rates with the test as performed in that laboratory.
9 provided other plausible causes have been excluded
12 Host factors are not synonymous with risk factors and are characteristics by
13 which individuals predisposed to invasive fungal diseases can be recognized.
14 They are intended primarily to apply to patients treated for malignant disease
15 and to recipients of allogeneic hematopoietic stem cell and solid organ
16 transplant. These host factors are also applicable to those receiving
17 corticosteroids and other T-cell suppressants as well as those with primary
18 immune deficiencies
19 1) Recent history of neutropenia (< 0.5 x 109/L {<500 neutrophils/mm3} for
20 >10 days) temporally related to the onset of fungal disease or ongoing
1 neutropenia
2 2) Receipt of an allogeneic stem cell transplant
3 3) Prolonged use of corticosteroids (excluding patients with ABPA) at an
4 average minimum dose of 0.3 mg/kg/day prednisone equivalent for > 3
5 weeks
6 4) Treatment with other recognized T-cell immune suppressants such as
7 ciclosporin, TNF-a blockers, specific monoclonal antibodies alemtuzumab,
8 nucleoside analogues during the past 90 days
9 5) Inherited severe immunodeficiency (e.g., chronic granulomatous disease,
10 severe combined immunodeficiency)
11 Clinical criteria
12 Must be consistent with the microbiological findings, if any, temporally related to
13 current episode and other potential causes must have been eliminated
14 Lower respiratory tract fungal disease
15 A) the presence of one of the following “specific” imaging signs on CT:-
16 • Well defined nodule(s) with or without a halo sign
17 • Wedge-shaped infiltrate
18 • Air crescent sign
19 • Cavity
20 B) the presence of a new non-specific focal infiltrate
1 PLUS at least one of the following10:
2 Pleuralrub
3 Pleural pain
4 Hemoptysis
5 Tracheobronchitis
6 Tracheobronchial ulceration, nodule, pseudomembrane, plaque or eschar
7 seen on bronchoscopy
8 Sinonasal infection
10 symptoms not necessary if there is mycoiogical evidence
9 Imaging showing sinusitis
10 PLUS
11 at least one of the following :-
12 Acute localized Pain (including pain radiating to
eye)
13 Nasal ulcer, black eschar
14 extension from the paranasal sinus across bony barriers, including
15 into the orbit
16 Endophthalmitis
17 as determined by ophthalmologic examination
18 CNS infection
19 at least one of the following:-
20 Focal lesions on imaging
21 Meningeal enhancement on MRI or CT
1 Chronic disseminated candidiasis
2 Small, peripheral, target like abscesses (new nodular filling defects, bull’s-eye
3 lesions) in liver and/or spleen
4 Microbiological Criteria
5 Cytology, direct microscopy or culture:
6 1. sputum, BAL and bronchial brush samples demonstrating the presence of
7 fungal elements either by recovery by culture of a mould (e.g. Aspergillus
8 spp., Fusarium spp., Zygomycetes, Scedosporium spp.) or detection by
9 cytology or direct microscopy of hyphal forms
10 2. sinus aspirate: recovery by culture of moulds from or detection of hyphal
11 forms by cytology or direct microscopy.
12 3. Skin ulcers, draining soft tissue lesions or fissure for which both microscopy
13 and culture are required
14 Detection of antigen, cell wall constituents or nucleic acid-
15 4. Galactomannan antigen EIA (Platelia).
16 a) a single plasma or serum sample positive for galactomannan
17 b) a single BAL, pleural fluid or CSF sample positive for galactomannan
18 6. Glucan Assay is primarily applicable for aspergillosis and candidiasis and does
19 not detect Cryptococcus species nor the Zygomycetes, Rhizopus spp., Mucor spp.
20 Absidia spp.
21 a single serum sample positive for beta-D-glucan
22 7. Polymerase Chain Reaction to detect nucleic acid
1 Until a PCR system is developed that has been externally validated, a positive
2 PCR result for blood, tissue, or BAL fluid for the specific fungus studied will not
3 be considered microbiological evidence of invasive fungal disease.
заключение
Накопление фактических данных по микромице-там и вызываемым ими заболеваниям будет стимулом к совершенствованию дефиниций, или определений и формированию новых применительно к оригинальным свершениям в области медицинской микологии.
литература
1. Whittaker R.H. New concepts of kingdoms of organisms // Science. — 1969. — Vol. 163. — P. 150-169.
2. Блинов Н.П. Химия микробных полисахаридов. — М.: «Высшая школа», 1984. — 256 с.
3. Блинов Н.П. Основы биотехнологии. — СПб: «Наука», 1995. — 600 с.
4. Aihsworth & Bisby’s Dictionary of the Fungi by D.L.Hawksworth, P.M.Kirk, B.C. Sutton and D.N.Pegler with assistance of other coauthors. Eight et., repr., 1996. — P. 169.
5. Andreoni S., Faggi E., Farina C., et al. Medical Mycology Atlas Systems, 2004. — P.8.
6. Проект Положения о Российской Комиссии по Номенклатуре Патогенных и Условно-патогенных грибов (РКНПУГ) при научно-методическом микологическом центре Минздравосоцразвития на базе НИИ медицинской микологии им.П.Н.Кашкина ГОУ ДПО СПб МАПО // Ж. Проблемы медицинской микологии. — 2007. — Т.9, №4. — С. 12-18.
7. EORTC/MSG revised definations. Dec. 18, 2005 (draft VI). — 9 p.
8. Эсфйоглу С., Рекс Дж.Х., Де Поу Б. и др. «Определение оппортунистических инвазивных грибковых инфекций у иммунокомпрометированных пациентов с опухолевым заболеванием и трансплантантами гемопоэтических стволовых клеток: Международное соглашение» // Ж. Проблемы медицинской микологии. — 2003. — Т.5, №1. — С. 3-16.
