Научная статья на тему 'НАША МЕДИЦИНА - ЛИШЬ ЧАСТЬ МИРОВОЙ, МЫ ПРОСТО ОБЯЗАНЫ БЫТЬ В КУРСЕ ВСЕХ ТЕНДЕНЦИЙ, ОТКРЫТИЙ, РАЗРАБОТОК, НОВЫХ ПОДХОДОВ К ДИАГНОСТИКЕ И ЛЕЧЕНИЮ БОЛЬНЫХ'

НАША МЕДИЦИНА - ЛИШЬ ЧАСТЬ МИРОВОЙ, МЫ ПРОСТО ОБЯЗАНЫ БЫТЬ В КУРСЕ ВСЕХ ТЕНДЕНЦИЙ, ОТКРЫТИЙ, РАЗРАБОТОК, НОВЫХ ПОДХОДОВ К ДИАГНОСТИКЕ И ЛЕЧЕНИЮ БОЛЬНЫХ Текст научной статьи по специальности «Ветеринарные науки»

CC BY
14
9
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Доктор.Ру
ВАК
RSCI
Область наук
Ключевые слова
МИКРОБИОТА ЖЕЛУДКА / СЛИЗИСТАЯ ОБОЛОЧКА ЖЕЛУДКА

Аннотация научной статьи по ветеринарным наукам, автор научной работы — Корниенко Е. А., Паролова Наталья Ивановна

Цель исследования: сравнить состав микробиоты желудка неинфицированных и инфицированных Helicobacter pylori детей по данным секвенирования 16S рибосомной рибонуклеиновой кислоты (рРНК) и сопоставить эти результаты с морфологическими изменениями слизистой оболочки желудка. Дизайн: сравнительное исследование. Материалы и методы. У 16 детей в возрасте от 10 до 17 лет с гастродуоденальной патологией в ходе планового эндоскопического исследования провели определение бактериального метагенома желудка. Четырнадцать биоптатов слизистой оболочки антрального отдела и два биоптата слизистой оболочки тела желудка после предварительного выделения ДНК были исследованы методом секвенирования с парой олигонуклеотидных праймеров, специфичных для консервативных участков гена 16S рРНК на секвенаторе Life Technologies Ion Torrent с использованием чипа 318v2. Биоинформатическая обработка проведена с помощью пакета QIIME. Результаты сопоставлены с данными гистологического исследования биоптатов из того же отдела желудка. В 8 биоптатах методом секвенирования обнаружена ДНК H. pylori, у остальных 8 детей эта бактерия не выявлена, на основании чего дети разделены на две равные группы: 8 H. pylori(-) - 1-я группа, 8 H. pylori(+) - 2-я группа. Результаты. Среди H. pylori(+) детей у 2 эта бактерия присутствовала в малом, а у 6 - в значительном количестве. Доминирующими типами бактерий в желудке у всех детей были Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, в меньшей степени были представлены Actinobacteria, Cyanobacteria, Fusobacteria. У H. pylori(+) пациентов доля этой бактерии составила 64,1% всего микробиома, а среди Proteobacteria достигала 75-99%, количество других бактерий при этом сокращалось, а видовое разнообразие уменьшалось. У детей с малым количеством H. pylori нехеликобактерная микробиота по составу была практически аналогична таковой H. pylori(-) пациентов, другие микроорганизмы были более многочисленны и разнообразны, в том числе внутри Proteobacteria. При наличии H. pylori признаки воспаления в слизистой оболочке были более выражены, чем при ее отсутствии (воспалительный индекс - 9,3 ± 1,2 против 5,3 ± 0,89, дистрофический индекс слизистой оболочки антрального отдела - 1,0 ± 0,2 против 0,3 ± 0,04, в обоих случаях p < 0,05). У 2 детей с малым количеством H. pylori воспалительный индекс составил 5,0 ± 1,4, дистрофический индекс - 0,5 ± 0,1, что практически не отличается от показателей 1-й группы, но значимо ниже, чем у детей с доминированием H. pylori (p < 0,05). Заключение. Микробиом желудка у детей многообразен. Инфицирование H. pylori подавляет другую микробиоту, сопровождается признаками воспаления слизистой оболочки, выраженность которого коррелирует с количеством H. pylori.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по ветеринарным наукам , автор научной работы — Корниенко Е. А., Паролова Наталья Ивановна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

OUR MEDICINE IS ONLY ONE PART OF GLOBAL MEDICINE, SO WE ARE OBLIGED TO KEEP UP TO DATE ON ALL TRENDS, DISCOVERIES, INNOVATIONS, AND NEW APPROACHES TO DIAGNOSING DISORDERS AND TREATING PATIENTS"

Study Objective: To compare the composition of gastric microbiota in children infected with Helicobacter pylori and those who are not, based on data from the sequencing of 16S ribosomal ribonucleic acid (RNA), and to correlate the findings with morphological changes in gastric mucosa. Study Design: This was a comparative study. Materials and Methods: The bacterial gastric metagenome was studied in 16 children, aged 10 to 17, who presented with gastroduodenal disorders during routine endoscopy. After DNA extraction, fourteen antral and two gastric body mucosal biopsy specimens were sequenced, using two oligonucleotide primers specific to conserved regions of the 16S-rRNA gene. This analysis was performed on an Ion Torrent PGM (Life Technologies) sequencer using a 318v2 chip. A bioinformatic assessment was done using the QIIME pipeline. The sequencing results were correlated with the histology of biopsy specimens obtained from the same parts of the stomach. H. pylori DNA was detected in eight biopsy specimens by rRNA sequencing. In the other eight patients this bacterium was not found. Based on these results, the patients were divided into two equal groups: H. pylori-negative (n = 8, Group 1) and H. pylori-positive (n = 8, Group 2). Study Results: Two of the H. pylori-positive patients had low levels and the other six had significant levels of this microorganism. The dominant gastric bacteria in all patients were Proteobacteria, Bacteroidetes, and Firmicutes, while Actinobacteria, Cyanobacteria, and Fusobacteria were less abundant. In the H. pylori-positive patients, H. pylori accounted for 64.1% of the gastric microbiome and 75-99% of the Proteobacteria species. This was associated with smaller quantities of other bacteria and lower species diversity. In patients with low levels of H. pylori, composition of the non-H. pylori microbiota was almost identical to that found in H. pylori-negative patients; other microbes, including Proteobacteria species, were more abundant and diverse. In the presence of H. pylori mucosal inflammation was more marked than in the absence of this microorganism (inflammatory index 9.3 ± 1.2 vs. 5.3 ± 0.89 and index of antral mucosal dystrophy 1.0 ± 0.2 vs. 0.3 ± 0.04; p < 0.05 for both comparisons). In the two patients with low levels of H. pylori, the inflammatory index was 5.0 ± 1.4 and the index of antral mucosal dystrophy was 0.5 ± 0.1, which was almost identical to the values in Group 1, but significantly lower than in patients with H. pylori dominance (p < 0.05). Conclusion: Children have a diverse gastric microbiome. H. pylori infection suppresses other microorganisms and is associated with mucosal inflammation, which correlates in intensity with H. pylori levels.

Текст научной работы на тему «НАША МЕДИЦИНА - ЛИШЬ ЧАСТЬ МИРОВОЙ, МЫ ПРОСТО ОБЯЗАНЫ БЫТЬ В КУРСЕ ВСЕХ ТЕНДЕНЦИЙ, ОТКРЫТИЙ, РАЗРАБОТОК, НОВЫХ ПОДХОДОВ К ДИАГНОСТИКЕ И ЛЕЧЕНИЮ БОЛЬНЫХ»

ИНТЕРВЬЮ В НОМЕР |

«Наша медицина — лишь часть мировой, мы просто обязаны быть в курсе всех тенденций, открытий, разработок, новых подходов к диагностике и лечению больных»

Корниенко Елена Александровна — доктор медицинских наук, профессор, главный внештатный детский специалист по гастроэнтерологии и эндоскопии Комитета по здравоохранению Правительства Санкт-Петербурга, заведующая кафедрой гастроэнтерологии факультета послевузовского и дополнительного профессионального образования ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет» Минздрава России.

Президент Ассоциации детских гастроэнтерологов Санкт-Петербурга «Диреал», ответственный секретарь ежегодных Всероссийских конференций «Гастро» в Санкт-Петербурге, член Европейского общества детских гастроэнтерологов, гепатологов и нутрициоло-гов (European Society for Paediatric Gastroenterology Hepatology and Nutrition, ESPGHAN).

Автор более 300 научных работ, обладатель 5 патентов на изобретения, касающиеся новых методов диагностики хеликобактериоза.

— Глубокоуважаемая Елена Александровна, какие заболевания желудочно-кишечного тракта наиболее часто встречаются у детей? Изменилась ли их структура за последние годы? Если да, то чем это обусловлено?

— Заболевания органов пищеварения — одни из наиболее распространенных, ими страдает каждый чет-вертый-пятый ребенок. Для каждой возрастной группы характерна своя структура, например, у детей раннего возраста преобладают заболевания кишечника, а у школьников — желудка. В последние десятилетия структура гастроэнтерологических заболеваний изменилась во всем мире. Растет число пациентов с аллергическими и аутоиммунными заболеваниями. Большую тревогу вызывает рост распространенности воспалительных заболеваний кишечника: болезни Крона и неспецифического язвенного колита. Это обусловлено изменением условий жизни и питания современного человека. Он меньше подвержен воздействию микробов благодаря использованию в сельском хозяйстве и пищевой промышленности стабилизаторов, антибиотиков и консервантов, заморозки, химической и газовой обработки продуктов при их длительном хранении и др. Употребление большего количества белка, растительных масел, уменьшение потребления пищевых волокон также оказывают свое влияние.

Питание в раннем возрасте имеет особое значение, так как именно в этот

период происходит становление кишечной микробиоты, формирующей и стимулирующей иммунную систему. Короткий период грудного вскармливания, рождение путем кесарева сечения повышают риск болезней иммунной системы, включая аллергические заболевания.

— Одним из направлений Вашей научной деятельности является изучение гастродуоденальной патологии, ассоциированной с инфекцией Helicobacter pylori. В одном из интервью Вы отмечали, что в России инфицированы примерно 30-35% детей дошкольного и до 70-75% школьного возраста. Изменились ли эти показатели?

— Мы занимаемся изучением проблемы H. pylori в течение 25 лет. На рубеже веков распространенность данной инфекции была очень высока, но с годами, вероятно, вследствие активного выявления и лечения, она снизилась. Точную цифру я не могу назвать, так как широкие эпидемиологические исследования в России не проводились, но отдельные небольшие исследования в Санкт-Петербурге показали примерно 20%-ное снижение — до 50-55% среди школьников. Уменьшилась и распространенность хронического гастрита (примерно в 1,5 раза за последние 10 лет) и язвенной болезни (в 2,5 раза) у детей.

— Существуют ли новые исследования относительно влияния H. pylori на болезни желудка и ее роли в воз-

никновении предраковых заболеваний и рака желудка у детей?

— Исследования роли H. pylori в развитии патологии не только желудка, но и других органов и систем, продолжаются. Установлено, что эта инфекция может быть причиной железодефицит-ной анемии, тромбоцитопении, мигрени, предполагается ее участие в развитии болезни Паркинсона, а также заболеваний, обусловленных хроническим воспалением, метаболическим синдромом, атеросклерозом. H. pylori называют канцерогеном первого порядка, это главная причина рака желудка.

В последние годы благодаря современным молекулярно-генетическим технологиям активно изучается микро-биота желудка в целом. Оказалось, что и она на поздних стадиях хронического гастрита, инициированного H. pylori, может оказывать дополнительное канцерогенное действие. В детском возрасте мы видим лишь начало процесса, поэтому у детей доминирует неатро-фический гастрит, но при углубленном морфологическом исследовании выяснилось, что примерно 20% подростков уже имеют атрофические и даже метапластические изменения слизистой оболочки желудка. Поэтому диагностику и лечение хеликобактериоза оптимально проводить до развития тяжелой атрофии, особенно в школьном возрасте, когда изменения еще обратимы.

— Какие на сегодняшний день существуют методы диагностики

Гастроэнтерология № 12 (141) / 2017 | DotOKO^. fy | 5

| INTERVIEW

хеликобактериоза у детей? Чем они отличаются от методик, применяемых у взрослых пациентов? И есть ли отличие в диагностических методах, применяемых в России и за рубежом?

— Все методы диагностики хеликобактериоза можно разделить на инвазивные, требующие эндоскопии и биопсии, и неинвазивные, не требующие их. Конечно, у детей предпочтительны неинвазивные методы. Поэтому мы в течение многих лет разрабатываем методы дыхательной диагностики. Я — один из авторов дыхательного метода, основанного на кинетической оценке концентрации аммиака в воздухе ротовой полости, — Хелик-теста. Идея возникла еще в 1990-е годы, тогда создавались дыхательные методы С13 за рубежом, а мы были очень ограничены в средствах. Может быть, это и было одним из стимулов сделать свой дешевый, но не менее информативный тест. И мы его создали!

Хелик-тест основан на свойстве хе-ликобактера разлагать мочевину своим ферментом уреазой, в результате чего образуются углекислота и аммиак. Аммиак легче воздуха, поэтому выделяется из желудка в ротовую полость. Когда пациент принимает раствор мочевины (в отличие от дорогих С13-тестов мы используем обычную немеченую дешевую мочевину), уровень аммиака в воздухе ротовой полости нарастает в случае, если человек инфицирован.

А способы регистрации аммиака с тех пор изменились. Когда-то использовали индикаторные трубки, результат оценивали визуально и отчасти субъективно. Сегодня разработаны считывающие регистрирующие приборы, позволяющие дать ответ быстро и объективно. При этом стоимость теста по-прежнему невысока, он доступен и может применяться как для скрининга, так и для оценки результатов терапии.

Хелик-тест применяют и у взрослых, но у детей он оптимален. В других странах подход к диагностике принципиально не отличается от нашего, но там шире используется дыхательный С13-тест, он похож на Хелик-тест методически, но требует приема меченной С13 мочевины и, конечно, стоит значительно дороже.

— Еще одно направление Вашей научной деятельности — изучение целиакии. Эпидемиологические данные указывают на значительную ее распространенность. Каковы современные методы диагностики и принципы лечения?

— Когда для диагностики целиакии стали применять иммунологические и морфологические методы исследования, оказалось, что это отнюдь не редкое заболевание. Часто оно имеет стертую форму течения, не дает яркой клинической картины и может носить различные «маски», что существенно затрудняет диагностику.

Распространенность целиакии в Европе — в среднем 1 : 100, в разных регионах мира она варьирует от 1 : 50 до 1 : 500. В России большие эпидемиологические исследования не проводили, но, вероятно, мы также находимся в пределах этого коридора. Диагностику целиакии проводят амбулаторно, в Санкт-Петербурге она хорошо налажена: пациент сдает кровь для определения антител к диамидированному пептиду глиадина и тканевой трансглютамина-зе, возможны определение генетических маркеров DQ2 и DQ8, эндоскопическое и гистологическое исследования биоп-татов двенадцатиперстной кишки. При значительном повышении концентрации антител и генетическом подтверждении целиакии эндоскопию можно не делать. При отсутствии специфического генотипа диагноз маловероятен.

Лечение целиакии сводится к пожизненному соблюдению строгой безглю-теновой диеты. Соблюдая диету, ребенок нормально развивается, и ему не требуется дополнительное лечение.

— Какие научные исследования проводятся на кафедре гастроэнтерологии, возглавляемой Вами? Какие разработки уже внедрены в практику?

— Учитывая изменения структуры заболеваний органов пищеварения и катастрофический рост распространенности болезни Крона и язвенного колита, основное направление наших научных исследований — совершенствование диагностики и лечения этих заболеваний.

Мы продолжаем исследовать микро-биоту желудка на современном моле-кулярно-генетическом уровне; изучаем роль пробиотиков в терапии хелико-бактериоза.

Особую группу составляют дети раннего возраста с воспалительными заболеваниями кишечника. Они болеют особенно тяжело, пытаемся найти причины данного явления, поэтому изучаем иммунологический статус и генетические особенности таких пациентов.

Некоторые результаты наших исследований уже внедрены в практику, в частности, разработанные нами совместно с коллегами алгоритмы диагностики и фенотипические обос-

нования выбора терапии при воспалительных заболеваниях кишечника. Мы знакомим с нашими данными коллег из других регионов, когда они приезжают к нам на курсы повышения квалификации, а также на конференциях.

— Есть ли возможность обмена опытом с иностранными специалистами? Какие совместные проекты Вы можете назвать?

— Наша медицина — лишь часть мировой, мы просто обязаны быть в курсе всех тенденций, открытий, разработок, новых подходов к диагностике и лечению больных. Поэтому приходится постоянно читать иностранные журналы, а участие в международных конференциях дает возможность встречаться с ведущими специалистами мира, слушать их выступления и, конечно, делиться результатами своих исследований. В прошлом году мы проводили международную конференцию в рамках года «Россия — Греция» совместно с профессорами Афинского университета. Они посетили клинику Санкт-Петербургского государственного педиатрического медицинского университета, были обсуждены важные вопросы педиатрии, наметили ряд совместных исследований.

— Расскажите, пожалуйста, о европейском обществе ESPGHAN, членом которого Вы являетесь. Какие цели и задачи стоят перед организацией? Что важно для практической деятельности врачей?

— ESPGHAN выполняет важную работу: это и мультицентровые научные исследования, и разработка международных рекомендаций по диагностике и лечению различных заболеваний, по питанию детей, а также выпуск международного журнала по детской гастроэнтерологии. ESPGHAN действует в бедных странах Африки и Азии, оказывая медицинскую помощь детям; обучает молодых специалистов, регулярно проводит школы для них. В 2002 году я была организатором такой школы в Санкт-Петербурге, а в 2010 году сама принимала участие как лектор.

— Что бы Вы пожелали коллегам, читателям нашего журнала?

Постоянно повышать свой профессиональный уровень, совершенствоваться, активно заниматься научным поиском и практической медициной.

Специально для

Елисова О. В.

6 | Doctor. | Gastroenterology No. 12 (141) / 2017

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.