Научная статья на тему 'Мутация в локусе tfb1m и ее распространенность в субпопуляции скота Краснодарского края'

Мутация в локусе tfb1m и ее распространенность в субпопуляции скота Краснодарского края Текст научной статьи по специальности «Животноводство и молочное дело»

CC BY
76
13
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ГАПЛОТИП НН5 / ГЕН TFB1M / ЧАСТОТА ВСТРЕЧАЕМОСТИ / HAPLOTYPE HH5 / TFB1M GENE / FREQUENCY OF OCCURRENCE

Аннотация научной статьи по животноводству и молочному делу, автор научной работы — Ковалюк Наталья Викторовна, Якушева Людмила Ивановна, Шахназарова Юлия Юрьевна, Асякина Алевтина Сергеевна, Самойленко Мария Владимировна

На базе лаборатории биотехнологии ФГБНУ КНЦЗВ проведено генотипирование 80 голов коров и 100 голов быков-производителей по локусу TFB1M. Установлено, что в изученной выборке животных, частота встречаемости дефектного гаплотипа НН5 составила 2,2 %.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по животноводству и молочному делу , автор научной работы — Ковалюк Наталья Викторовна, Якушева Людмила Ивановна, Шахназарова Юлия Юрьевна, Асякина Алевтина Сергеевна, Самойленко Мария Владимировна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

MUTATION IN THE TFB1M LOCUS AND ITS PREVALENCE IN THE SUBPOPULATION OF THE CATTLE OF KRASNODAR TERRITORY

Based on the biotechnology laboratory of the Krasnodar Research Centre for Animal Husbandry and Veterinary Medicine, genotyping of 80 heads of cows and 100 heads of sires by the TFB1M locus was carried out. It was efound that in the studied sample of animals, the frequency of occurrence of the defective HH5 haplotype was 2. %.

Текст научной работы на тему «Мутация в локусе tfb1m и ее распространенность в субпопуляции скота Краснодарского края»

of Cow's Milk Free from Beta-Casein A1and Its Application in the Manufacturing of Specialized Foods for Early Infant Nutrition // Foods 6:- 2017. Pubmed reference: 28704923.

DOI: 10.3390/foods6070050.

DOI: 10.34617/dgww-tw07 УДК 636.22/.28.082.2:575.1

МУТАЦИЯ В ЛОКУСЕ TFB1M И ЕЕ РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ В СУБПОПУЛЯЦИИ СКОТА КРАСНОДАРСКОГО КРАЯ MUTATION IN THE TFB1M LOCUS AND ITS PREVALENCE IN THE SUBPOPULATION OF THE CATTLE OF KRASNODAR TERRITORY

Ковалюк Наталья Викторовна1, д-р биол. наук, Якушева Людмила Ивановна1, канд. биол. наук, Шахназарова Юлия Юрьевна1, Асякина Алевтина Сергеевна 2, бакалавр Самойленко Мария Владимировна 2, бакалавр :ФГБНУ КНЦЗВ, Российская Федерация, г. Краснодар, 2ФГБОУ КубГУ, Российская Федерация, г. Краснодар Kovalyuk Natalia Viktorovna1 ,Dr.Biol.Sc., Yakusheva Kyudmila Ivanovna1 ,Cand. Biol. Sc., Shakhnazarova Yulia Yurievna1 , researcher, Asyakina Alevtina Sergeevna2, bachelor, Samoilenko Maria Vladimirovna2, ,bachelor, 1Krasnodar Research Centre for Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Krasnodar, Russian Federation, 2Kuban State Agrarian University, Krasnodar, Russian Federation

Аннотация: на базе лаборатории биотехнологии ФГБНУ КНЦЗВ проведено генотипирование 80 голов коров и 100 голов быков-производителей по локусу TFB1M. Установлено, что в изученной выборке животных, частота встречаемости дефектного гаплотипа НН5 составила 2,2 %.

Ключевые слова: гаплотип НН5; ген TFB1M; частота встречаемости.

Abstract: based on the biotechnology laboratory of the Krasnodar Research Centre for Animal Husbandry and Veterinary Medicine, genotyping of 80 heads of cows and 100 heads of sires by the TFB1M locus was carried out. It was efound that in the studied sample of animals, the frequency of occurrence of the defective HH5 haplotype was 2. %.

Key words: haplotype HH5; TFB1M gene; frequency of occurrence.

Гаплотип фертильности HH5 голштинского скота был идентифицирован в европейской и североамериканской популяции скота в 2013 году (OMIA 001941-9913 : Abortion due to haplotype HH5 in Bos taurus).

Гомозиготные носители этого гаплотипа погибают на ранних стадиях эмбрионального развития. Считается, что мутация впервые возникла у быка - производителя канадской селекции CAN264804 Thomlea Texal Supreme (1957 года рождения).

Сообщается о негативном влиянии аномалии как на индексы оценки быков - носителей (DPR, CCR, HCR), так и на индексы оценки коров - гетерозиготных носителей мутации [1].

Гаплотип НН5 связан с делецией размером 138 п.о. в гене митохондриального транскрипционного фактора В1 (TFB1M). В открытом доступе опубликованы параметры тест-системы, которую можно использовать для идентификации делеции [2].

Цель исследований - оптимизировать данную тест-систему в условиях лаборатории, провести скрининговые исследования группы голштинских животных и установить насколько распространена эта аномалия в Краснодарском крае.

Тест-система может использоваться в диагностике для выявления полиморфизма гена TFB1M крупного рогатого скота, ассоциированного с гаплотипом НН5, с целью последующего применения полученных результатов в разведении и селекции.

Методика. Исследования проведены на базе лаборатории биотехнологии ФГБНУ КНЦЗВ. Объектом исследования являлись образцы крови от 80 коров (АО «Агрообъединение «Ку-

бань», ОАО «Нива Кубани», ООО «Лидер-Р», ОАО «ПЗ «Воля») и образцы спермы от 100 быков - производителей голштинской породы (образцы спермы предоставлены ООО НПО «Юг-Плем»). Для выделения ДНК из образцов использовали наборы реагентов Diatom™ DNA Prep 100 (ООО «Лаборатория Изоген», г. Москва). Для постановки реакций использовали наборы реагентов Gene Pak PCR Core (ООО Лаборатория «Изоген», г. Москва) и праймеры следующей последовательности:

HH5.1 AGATATGCTAAAGTTTACCTAGAAGAA

HH5.2 CTGAAGCTCCATTCTGAGTCAT

HH5.3 TGCTCTATGAATTTTGTGAATGGT

Результаты исследований и их обсуждение. Для ам-

плификатора МС2 и используемых наборов реагентов (Gene Pak PCR Core) подобраны следующие оптимальные условия реакции: 94 С - 4 минуты - 1 цикл; (94 С - 30 секунд; 57 С - 30 секунд, 72С - 30 секунд) - 30 циклов; 72С - 3 минуты - 1 цикл.

Визуализацию ПЦР - продуктов проводили в 2,0 % агароз-ном геле. Электрофореграмма продуктов реакции представлена на рисунке 1.

Рисунок 1. Электрофореграмма ПЦР-продуктов при выявлении носителей гаплотипа HH5

Дорожки 1, 3-11, 13-17 - ПЦР-продукты от животных, свободных от носительства гаплотипа НН5;

Дорожка 2 - ПЦР-продукт, от гетерозиготного носителя гаплотипа НН5;

Дорожка 12 - отрицательный контроль;

Дорожка 18 - молекулярный маркер весов (шаг 50 пн).

Проведено генотипирование 80 голов коров и 100 голов быков-производителей. Установлено, что в изученной выборке животных в гетерозиготном состоянии частота встречаемости дефектного генотипа составила 2,2 %. Аналогичные исследования, проведенные Романенко О.С. и др. (2018) показали, что из 1202 быков-производителей и 708 коров, разводимых в России, 39 быков и 10 коров являются носителями мутантного аллеля, что соответствует частотам встречаемости 3,24 % и 1,41 %, соответственно [3].

Выводы. Таким образом, частота встречаемости носителей мутации в гене TBF1M в региональной популяции скота находится примерно на том же уровне.

В каждом конкретном хозяйстве следует проводить мониторинг встречаемости гаплотипа НН5 с целью предотвращения возможных экономических потерь.

Список литературы

1. Cole, J.B., Null, D.J., VanRaden, P.M Phenotypic and genetic effects of recessive haplotypes on yield, longevity, and fertility // J Dairy Sci 99:7274-88.- 2016. Pubmed reference: 27394947. DOI: 10.3168/jds.2015-10777.

2. Schütz, E., Wehrhahn, C., Wanjek, M., Bortfeld, R., Wem-heuer, W.E., Beck, J., Brenig, B The Holstein Friesian Lethal Haplo-type 5 (HH5) Results from a Complete Deletion of TFB1M and Cholesterol Deficiency (CDH) from an ERV-(LTR) Insertion into the Coding Region of APOB // PLoS One 11:e0154602 - 2016. Pubmed reference: 27128314. DOI: 10.1371/journal.pone.0154602.

3. Романенкова, О.С., Волкова, В.В., Костюнина, О.В., Зиновьева, Н.А. Диагностика гаплотипа HH5 в стадах голштинско-го и голштинизированного черно-пестрого скота России // Молочное и мясное скотоводство. -2018. - № 6. - С. 13-19.

DOI: 10.34617/bs14-0w06 УДК 636.082.251

ОЦЕНКА ЛИНИЙ ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ПРИ ВНУТРИПОРОДНОМ ПОДБОРЕ ДЛЯ ПОВЫШЕНИЯ

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.