Научная статья на тему 'МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ ОСТРОГО МЕГАКАРИОБЛАСТНОГО ЛЕЙКОЗА У ДЕТЕЙ'

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ ОСТРОГО МЕГАКАРИОБЛАСТНОГО ЛЕЙКОЗА У ДЕТЕЙ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
70
18
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Гаськова М.В., Солдаткина О.И., Тимофеева Н.М., Зеркаленкова Е.А., Попов А.М.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ ОСТРОГО МЕГАКАРИОБЛАСТНОГО ЛЕЙКОЗА У ДЕТЕЙ»

ВЕСТНИК ГЕМАТОЛОГИИ, том XVII, № 2, 2021

нуемо приводит к снижению количественного содержания функционально активного белка.

Выводы. Для случаев ДВККЛ с вовлечением ЦНС в рецидиве характерны аберрации, позволяющие лимфомным клеткам не только проникать в нервную ткань, но и успеш-

но сохраняться и расти в условиях специфического бедного на ростовые стимулы микроокружения. Работа выполнена за счет средств гранта Президента РФ МД-2706.2019.7, а также в рамках бюджетной темы по Госзаданию № АААА-А17-117112850280-2.

А.Д. Гарифуллин, С.В. Волошин, И.С. Мартынкевич, С.С. Бессмельцев, М.П. Бакай,

Е.В. Клеина, С.Ю. Линников

ОЦЕНКА ПОКАЗАТЕЛЕЙ ВЫЖИВАЕМОСТИ БОЛЬНЫХ С ВПЕРВЫЕ ВЫЯВЛЕННОЙ МНОЖЕСТВЕННОЙ МИЕЛОМОЙ В ГРУППАХ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЙ

СТРАТИФИКАЦИИ MSMART 3.0

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Российский научно-исследовательский институт гематологии и трансфузиологии Федерального медико-биологического агентства», г.Санкт-Петербург

Введение. Стратификация риска при множественной миеломе прошла неоднократные обновления в связи с появлением информации о прогностическом воздействии генетических аномалий и других факторов. Разделение пациентов в группы риска на основе генетических маркеров используется многими центрами для выбора и оптимизации тактики лечения. Однако, роль комплексных и сочетанных генетических нарушений, а также аутологичной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (аутоТГСК) остается до конца неясной.

Цель. Определить влияние генетических аномалий и ау-тоТГСК на показатели выживаемости пациентов с впервые выявленной множественной миеломой (ВВММ), соответственно риск стратификации.

Материалы и методы. Проведено комплексное обследование 87 пациентов с ВВММ. Все пациенты получали борте-зомиб-содержащие программы первичной противомиелом-ной терапии (VD, CVD, VMP, PAD).

Результаты. Наличие аберрантного кариотипа (сочетание 2-х аномалий не из группы высокого риска), Double Hit (2 аномалии высокого риска) и комплексного кариотипа (3 и более аномалии) являлось неблагоприятным прогностическим маркером по сравнению с группой стандартного риска (СР) mSmart 3.0 (нормальный кариотип, t(11;14), гиподи-плоидия, гипердиплоидия и другие единичные аномалии). Медиана общей выживаемости (ОВ) в данных группах составила: 74, 50, 36 и 14 месяцев (p=0,00011). На основании результатов ОВ и БПВ нами проведена модификация (mod) группы высокого риска (ВР) mSMART 3.0 (TP53/del17p, t(4;14), t(4;16), t(14;20), +1q, R-ISS III) с добавлением паци-

ентов, имеющих «комплексный кариотип» и наличие Double Hit.

Медиана ОВ в группе СР mSMART 3.0 (n=53) не была достигнута, в группе ВР mSMART 3.0mod (n=34) - 50 месяцев: 5-летняя ОВ составила 61% и 38%, соответственно (p=0,0073).

Медиана БПВ в группе СР mSMART 3.0 (n=53) составила 43 мес., в группе ВР mSMART 3.0mod (n=34) - 29 месяцев.

Наилучшие результаты БПВ и ОВ были достигнуты в обеих группах пациентов, которым выполнена аутоТГСК. Медиана ОВ в группе стандартного риска mSMART 3.0 с аутоТГСК (n=37) не была достигнута, в группе высокого риска mSMART 3.0 mod с аутоТГСК - 48 месяцев (n=20); в группе стандартного риска mSMART 3.0 без аутоТГСК - 40 месяцев (n=16); в группе высокого риска mSMART 3.0 mod без аутоТГСК - 22 месяца (n=14); 5 - летняя ОВ составила 81%, 60%, 33% и 28% соответственно (p=0,0015). Медиана БПВ не была достигнута, 46, 22 и 19 месяцев соответственно (р=0,017).

Выводы. Аберрантный кариотип, Double Hit или комплексный кариотип являются неблагоприятным прогностическим маркером по сравнению аномалиями стандартного риска или без них. Это может быть полезно для обновления системы стратификации риска в будущем. Медиана общей и беспрогрессивной выживаемости достоверно выше у пациентов в группе стандартного риска, чем в группе высокого риска по данным mSMART 3.0 mod. Аутологичная трансплантация гемопоэтических стволовых клеток может улучшить результаты лечения, особенно у пациентов в группе высокого молекулярно-генетического риска.

М.В. Гаськова, О.И. Солдаткина, Н.М. Тимофеева, Е.А. Зеркаленкова, А.М. Попов, И.И. Калинина, Ю.В. Ольшанская, А.А. Масчан

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ ОСТРОГО МЕГАКАРИОБЛАСТНОГО

ЛЕЙКОЗА У ДЕТЕЙ

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Москва

Введение. Острый мегакариобластный лейкоз встречается преимущественно у детей младшего возраста и представляет собой генетически гетерогенную группу заболеваний. У детей с синдромом Дауна (ДС), острый мегака-риобластный лейкоз является наиболее частым вариантом лейкоза, клинические и биологические особенности этого варианта лейкоза позволяют рассматривать его отдельно. Острый мегакариобластный лейкоз, не ассоциированный с ДС, характеризуется широким спектром как химерных генов, так и повторяющихся мутаций, что определяет различия в

клиническом течении заболевания.

Цель. Охарактеризовать молекулярно-генетический профиль острого мегакариобластного лейкоза у детей и определить прогностическое значение различных генетических перестроек.

Материалы и методы. С 2014 года по сентябрь 2020 диагноз острого мегакариобластного лейкоза был установлен у 101 пациента, в рамках референсной диагностики острых лейкозов получившего диагностику в ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева». 39 пациентов имели синдромом Да-

МАТЕРИАЛЫ КОНФЕРЕНЦИИ

уна (ДС), медиана возраста в этой группе составила 1,95 года (от 2 дней до 6,6 лет), М:Ж=19:20. Пациентов без синдрома Дауна было 62, медиана возраста составила 3,3 года (от 2 месяцев до 9 лет), М:Ж=42:20. Всем пациентам было проведено кариотипирование, исследование методом FISH и/или ПЦР для выявления известных перестроек и химерных генов. Для обнаружения мутаций во 2 экзоне гена GATA1 выполнили секвенирование по Сэнгеру и фрагментный анализ. Для более подробного изучения мутационного профиля было выполнено таргетное высокопроизводительное секвениро-вание (ВПС).

Результаты. Конституциональная трисомия 21 (21с) была выявлена у всех пациентов ДС. В 30% случаев была выявлена изолированная 21с (n=13), клональные хромосомные перестройки были представлены в 22% случаев комплексным кариотипом, в 12% трисомией 8 и дериватом 7 хромосомы в 5%(n=2). У 7 пациентов (18%) были обнаружены другие хромосомные аберрации. В 3 случаях стандартное кариотипирование провести не удалось в связи с отсутствием митозов, однако 21с была установлена по результатам FISH исследования. У пациентов без ДС были выявлены перестройки генов CBFA2T3-GLIS2, NUP98, KMT2A и t(1;22) (p13;q13) обнаруженные в 15%, 8%, 7% и 10% случаев, соответственно. Соматическая трисомия 21 хромосомы была выявлена в 7% случаев (n=4), нормальный кариотип - у 1 больного. Пациенты с комплексным кариотипом составили 33% (n=19). Мутации в гене GATA1 у пациентов с ДС обнаружены в 92% случаев(п=36), у пациентов без ДС - в 23% (n=14). В группе пациентов с ДС наиболее частыми были мутации в JAK1, JAK2, JAK3 и MPL генах (38%). Мутации в основных генах - компонентах когезинового комплекса STAG2,

RAD21, CTCF и SMC1A, выявлены в 33% случаев. В 4 случаях (10%) выявлены мутации в генах эпигенетической регуляции (EZH2, SUZ12). Только один больной с ДС с комплексным кариотипом не имел каких-либо мутаций. В когорте больных без ДС мутационный профиль варьировал в зависимости от цитогенетических маркеров. Примечательно, что больные, имеющие транслокации генов CBFA2T3-GLIS2, NUP98, KMT2A и t(1;22)(p13;q13), почти не имели дополнительных мутаций. Подгруппа пациентов с соматической трисомией 21 несла мутации в гене GATA1 и по молекулярному профилю была схожа ДС: все пациенты имели 1-2 дополнительные мутации в генах JAK-STAT пути и генах когезинового комплекса. У пациентов, не имеющих известных транслокаций и мутаций в гене GATAI (n=23), в 30% случаев обнаружены мутации в генах RAS - сигнального пути (KRAS, nras, PTPN11), среди генов когезинового комплекса мутации были обнаружены только в гене CTCF (25%). Мутации в генах JAK-STAT пути по частоте встречаемости преобладали (33%).

Выводы. Острый мегакариобластный лейкоз у детей является генетически гетерогенной группой. Мутации в гене GATA1 - самые частые, как у пациентов с ДС (92%), так и без ДС (23%). Среди дополнительных мутаций, обнаруженных методом ВПС, наиболее часто встречаются мутации в генах JAK-STAT сигнального пути. Пациенты без ДС с химерными онкогенами не имеют дополнительных мутаций, в то время как у пациентов с мутациями в гене GATA1, мутационный профиль схож с таковым у пациентов с ДС. Общая выживаемость (ОВ) ДС пациентов составляет 60%. Среди пациентов без ДС перестройка генов CBFA2T3-GLIS2 определяет неблагоприятный прогноз ОВ (40%), лучше всего выживаемость у пациентов с мутациями в гене GATA1 (90%).

О. С. Глотов12, А.Н. Чернов1, А. И. Чангалиди34, Ю. А. Барбитов245, Р.С. Калинин1, В.В. Цай1, С.Г. Щербак15, С.П. Уразов1, А. Ю. Анисенкова15, С. В. Мосенко1, Е. Ю. Шрбузов1, Д. Н. Хоботников1, А.С. Глотов2,5

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ РИСКА РАЗВИТИЯ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ

COVID-19 У ЖИТЕЛЕЙ САНКТ-ПЕТЕРБУРГА

1Санкт-Петербургское городское учреждение здравоохранения «Городская больница № 40 Курортного района», г. Санкт-Петербург

2Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт акушерства,

гинекологии и репродуктологии имени Д.О. Отта», г. Санкт-Петербург 3Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики», г. Санкт-Петербург

4Общество с ограниченной ответственностью «Институт биоинформатики», г. Санкт-Петербург 5Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный университет», г. Санкт-Петербург

Введение. Онкологические заболевания представляют серьезную медико-социальную проблему. Их течение, особенно лейкозов, часто сопровождается супрессией иммунной системы пациента и присоединением сопутствующих заболеваний, в том числе вирусных инфекций. В связи с продолжающейся с конца 2019 г. в мире пандемией коронавиру-са COVID-19 крайне актуальным является выявление генетических предикторов у инфицированных пациентов, которые также составляют группу высокого риска развития онкологических заболеваний.

Цель. Генетический анализ вариантов в геноме пациентов с COVID-19 и в геноме РНК вируса SARS-COV-2, поиск их корреляций с клиническими показателями и степенью тяжести заболевания. Исследование проводили в соответствии с Хельсинской декларацией. У всех пациентов проводили: сбор анамнестических данных с уточнением особенностей течения заболевания, объективный осмотр с оценкой параметров гемодинамики, дыхательной системы (ЧДД, ЧСС, АД, SpO2, степень дыхательной недостаточности), оценку по шкале NEWS (National Early Warning Score), рекомендованной к использованию для пациентов с COVlD-19, компьютер-

ную томографию (КТ) органов грудной клетки по 4-значной шкале (КТ-1, КТ-2, КГ-3, КТ-4); лабораторные исследования (клинический анализ крови, биохимический минимум, определение уровней ферритина, С-реактивного белка (СРБ), интерлейкина-6 (ИЛ-6), лактатдегидрогеназы, Д-димера), ЭКГ, при необходимости использовали дополнительные инструментальные методики. Проведен анализ 766 историй болезни пациентов с COVID-19, находившихся на лечении в ГБУЗ «Городская больница №40» Санкт-Петербурга в период с 18.04.2020 по 31.12.2020.

Материалы и методы. Методом экзомного секвенирова-ния был проведен анализ SNP у 766 пациентов с COVID-19 и 50 геномов РНК COVID-19 соответственно. Результаты данных секвенирования обрабатывали с помощью DeepVariant v.0.10.0, GLnexus v.1.2.6 и GATK v.4.1. Анализ генома вируса проводили с помощью сервиса PANGO lineages и Nextclade, программы Integrative Genomics Viewer (IGV). Анализ ассоциации клинической информации и SNP в геноме вируса и человека проводили методом корреляционного анализа по Пирсону.

Результаты. Установлена статистически значимая кор-

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.