CC BY
0
DOI: 10.24412/2071-5315-2024-13114
Хроническая микробная экзема
Микробиом кожи и кишечника у пациентов
о / и о
с хроническом микробном экземой:
оценка с помощью метагеномного секвенирования
и его динамика в процессе терапии
В.В. Лазарев, М.М. Тлиш, М.Е. Шавилова
Кафедра дерматовенерологии ФГБОУВО "Кубанский государственный медицинский университет " Минздрава России, Краснодар
Микробиота кожи и кишечника включает разнообразное резидентное и транзиторное сообщество, композиция которого специфична и определяется строго индивидуально, наравне с радужкой глаз или рисунком сосочкового слоя дермы, формирующего отпечатки пальцев. Данное исследование представляет собой идентификацию геномов микроорганизмов кишечника и кожи из пораженных и здоровых участков у больных хронической микробной экземой. С целью повышения точности определения таксономического разнообразия обоих микробиомов был использован метод метагеномного секвенирования 16S рибосомной РНК. Полученные данные свидетельствуют о том, что в период обострения наблюдается смещение равновесия микробиологических сообществ в сторону преобладания Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus capitis, Streptococcus pyogenes, Klebsiella spp. и Candida spp. как в кишечных, так и в кожных таксономических группах. Это открывает возможность для коррекции изменений в бактериальных консорциумах посредством восстановления нормальной микрофлоры с целью снижения частоты рецидивов и уменьшения тяжести течения хронической микробной экземы.
Ключевые слова: микробная экзема, микробиом кожи, микробиом кишечника, микробиота, метагеномное секвенирование.
Введение
Микробная экзема (МЭ) — хроническое, рецидивирующее, социально и экономически значимое заболевание из группы ал-лергодерматозов, проявляющееся острой воспалительной реакцией, сильным зудом, полиморфизмом сыпи и рецидивирующим течением без длительных ремиссий с наиболее частой локализацией на кистях, ягодицах и голенях [1, 2]. В структуре дерматозов МЭ составляет 12—27% [2]. Временная нетрудоспособность при данном заболевании может достигать 36% [2, 3].
Контактная информация: Лазарев Вениамин Викторович, gorod256@inbox.ru
В современных условиях МЭ характеризуется распространенными формами воспалительного процесса, резистентностью к традиционным методам лечения и склонностью к рецидивированию и прогредиент-ному течению за счет качественных и количественных сдвигов в популяциях микроорганизмов как в кишечнике, так и на коже. Это особенно часто наблюдается у пациентов после длительной антибактериальной терапии, оказывающей неблагоприятное воздействие на микробиом кишечника, обогащая его условно-патогенными микроорганизмами и истощая полезные комменсалы, из-за чего купирование рецидивов требует большего времени [3—5].
На коже и ее придатках описано более 2300 бактериальных, 400 вирусных, 400 грибных и 70 архейных геномов. Условно-патогенные бактерии, которые представляют микробиом кожи здорового человека, относятся к 4 типам: Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria и Bacteroidetes. Staphylococcus epidermidis является доминирующим комменсалом [6, 7].
Многообразие микроорганизмов, обитающих в просвете кишечника, представлено основными типами (phyla): Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Proteobacteria [7]. Закономерность таксономических групп этих 2 микробиомов дает основание полагать, что наравне с уже известными функциями микробиоты (такими как защитная или пищеварительная) особого внимания заслуживает регуляторная функция, в частности ось кишечник—кожа [8, 9].
Стабильность микробных сообществ обеспечивает колонизационную резистентность биотопов [1]. Исследования показывают, что при повышении проницаемости кишечного барьера бактерии и их метаболиты гематогенно диссеминируют в кожу, нарушая гомеостаз, что подтверждается обсемененностью S. aureus, S. capitis, S. haemolyticus в период обострения [7]. При этом в кишечном микробиоме в данный период отслеживается схожая тенденция с представителями тех же таксонов, что и в кожном. Резкое снижение микробного разнообразия у большинства пациентов с хронической МЭ сопровождается избыточной колонизацией кожи S. aureus, S. saprophyticus, S. pyogenes, S. capitis, Proteus, Klebsiella; при микологическом исследовании выявляются дрожжевые грибы, дер-матофиты, плесневые грибы и ассоциации нескольких грибов [9—11]. В кишечнике в стадии обострения дерматоза отслеживается доминирование этих же видов.
Обострения и хронизация МЭ связаны с увеличением условно-патогенной и патогенной флоры. Появление грибов в ассоциации с представителями облигат-ной флоры при длительном воздействии
на кожу приводит к снижению колонизационной резистентности и приобретению микрофлорой выраженной патогенности. При этом аллергический фактор в условиях микст-инфекции усиливается, что создает возможности для развития аутоаллергиче-ского компонента и хронизации течения заболевания [12]. Острое воспаление кожи в период обострения МЭ проявляется зудом и сухостью, шелушением, образованием экзематозных везикул, быстро сменяющихся серозными "колодцами" или серозными корками [2, 13].
На фоне длительного течения заболевания пациенты испытывают стресс, что является дополнительным триггером для манифестации воспалительных реакций и активации условно-патогенной флоры [14]. Изменения состава микробиоты при этом меняются в сторону уменьшения количества видов лактобацилл и увеличения Escherichia coli и Pseudomonas [15]. Во многих работах описываются глубокие перестройки микробиоценоза кожи, сопровождающиеся сменой ценотипа [10, 11]. Установлены изменения параметров микробиома кишечника за счет пролиферации патогенных или условно-патогенных бактерий у 83% пациентов с хронической МЭ [10].
Генетическая характеристика сложных бактериальных сообществ на уровне видов имеет важное значение в диагностике и лечении дерматозов. Достижения в технологиях секвенирования позволяют проводить более корректное выявление таксономического разнообразия микробиоты кожи и кишечника, а также расширять понимание кожи как экосистемы [9, 12, 13, 16]. По этой причине для оценки микробного сообщества у пациентов с хронической МЭ может быть использован метод секвенирования геномов [12, 13]. Данное исследование основано на использовании бактериальной рибосомной РНК (рРНК), кодирующей структурно и функционально важные компоненты рибосомы. С учетом коэффициента седиментации используется 16S рРНК, обладающая оптимальной дли-
ной последовательности генов и достаточной генетической информацией для дифференцирования суммы геномов кишечной микробиоты и выделения конкретного возбудителя [13]. Метод секвенирования 16S рРНК позволяет сформировать представление о микробиоте в очаге экземати-зации по 3 параметрам, которые считаются важными для понимания ее роли в репа-ративных процессах: микробная нагрузка, микробное разнообразие и присутствие патогенов. После амплификации методом полимеразной цепной реакции секвениру-ются и анализируются гены рРНК.
Вышеизложенное определяет актуальность использования данного метода диагностики для анализа микробиома у больных МЭ.
Цель исследования — изучить состав микробиома кожи и кишечника у пациентов с хронической МЭ с помощью метаге-номного секвенирования 16S рРНК и оценить влияние стандартной терапии на его динамику.
Материал и методы
Под наблюдением находились 2 группы пациентов по 30 человек. Основную группу составили пациенты с хронической МЭ, контрольную группу — здоровые лица.
Критерии включения в исследование: диагноз хронической МЭ (длительность заболевания не менее 6 мес); отсутствие других заболеваний кожи; отсутствие в анамнезе хронических соматических заболеваний или заболеваний неопластического характера; возраст от 18 до 70 лет; отсутствие в течение последнего месяца системной и/или местной антибактериальной терапии; подписанное информированное добровольное согласие.
Критерии исключения: диагноз острой МЭ (длительность заболевания менее 6 мес); наличие в анамнезе других заболеваний кожи; наличие в анамнезе хронической соматической патологии или неопла-зий; возраст младше 18 лет и старше 70 лет;
применение в течение последнего месяца системных и/или местных антибактериальных средств; отказ от подписания информированного добровольного согласия.
Пациенты основной группы получали лечение в соответствии с федеральными клиническими рекомендациями по ведению пациентов с МЭ [17].
Забор биоматериала у пациентов с хронической МЭ проводили до начала терапии, на 14-й, 21-й дни и спустя 6 мес после лечения. Образцы из очагов поражения и видимо здоровых участков кожи для мо-лекулярно-генетического исследования собирали с помощью мазка, взятого одноразовыми стерильными тампонами с ватным наконечником. В контрольной группе забор биоматериала проводили с видимо неизмененных участков кожи. Тампоны предварительно смачивали стерильным буферным раствором и плотно втирали в течение 20 с в пораженную кожу. Затем образцы с ватных палочек хранили в пробирке, заполненной стерильным буферным раствором. Геномную ДНК извлекали из каждого мазка с помощью набора для извлечения геля. Забор мазков кала проводился в стерильный одноразовый коллектор. После сбора образцов ДНК извлекали из фекалий в 2 основных этапа. На 1-м этапе образец очищался с помощью нескольких реагентов и центрифугирования для очистки микроорганизмов от других компонентов фекалий. Последующий этап включал лизис бактериальных клеток при помощи инкубации образцов с ли-зисным буфером с гомогенизацией путем встряхивания с циркониевыми шариками и проведение дальнейшего центрифугирования. Гены 16S рРНК различных регионов (16S V3—V4) были амплифицированы с использованием праймера из вариабельных регионов 3—4, что делает таксономический охват исследования более широким.
Для оценки кожного патологического процесса использовали индекс площади поражения и тяжести атопического дерматита (Eczema Area and Severity Index, EASI).
-Лечебное дело 2Ж|1
Степень заболевания оценивалась в баллах и учитывала клинические признаки: эритему, отек, экскориации, лихенификации. Минимальная сумма баллов (от 0,1 до 1,0) соответствует легкой степени тяжести течения заболевания, максимальная (от 50,1 до 72,0) — очень тяжелой.
Статистическая обработка данных. У каждого пациента основной и контрольной групп оценивалась доля (в %) обсеме-ненности кожи различными микроорганизмами. Например, у пациента Х. среди всех микроорганизмов, высеянных в процессе анализа образца, взятого с пораженных участков кожи, доля S. aureus составила 32,4%. Таким образом, первичные данные для статистического анализа представляли собой распределение объемов высева изучаемых возбудителей, указанное для каждого пациента. За 100% берется объем высева всех бактерий у каждого пациента.
Статистическая обработка данных производилась с использованием статистического пакета SPSS Version 26 (IBM Analytics, США). Статистическое описание количественных показателей (распределение доли конкретного выделенного возбудителя (в %) от всего объема возбудителей по каждому пациенту в основной и контрольной группах) осуществлялось с помощью медианы и верхнего и нижнего квартилей. Для сравнения независимых групп (основной и контрольной) использовался непараметрический критерий Манна—Уитни. Сравнение показателей между разными периодами лечения в изучаемых клинических группах производилось с помощью непараметрического теста Вилкоксона.
Результаты и обсуждение
Под наблюдением в основной группе находилось 18 женщин (60%) и 12 мужчин (40%), в контрольной — 18 (60%) и 12 (40%) соответственно. Возраст больных основной группы составил 56 (42—60) лет, что практически не отличалось от данного показателя в группе контроля — 55
(41—55) лет (p = 0,183). Средняя длительность заболевания у больных МЭ составила 18,5 (11,8-29,3) мес.
Была проведена идентификация микроорганизмов методом метагеномного сек-венирования, отражающая среднюю долю содержания микроорганизмов определенного типа в крови от общего объема возбудителей, выявленных у пациента, принятую за 100%, среди пациентов с исследуемой патологией и лиц контрольной группы. До начала лечения на коже пациентов с МЭ преобладающей таксономической группой были стафилококки: средняя доля по группе составила 67,7 (67,6-67,7)% от общего числа выделенных бактерий.
Среди стафилококков до лечения наибольшую долю в среднем по выборке составлял S. aureus - 32,3 (32,2-32,5)% от общего числа выделенных бактерий в области высыпаний и 20,9 (20,9-20,9)% на видимо здоровых участках кожи (p < 0,001). Комменсальные стафилококки верифицировались реже и составили на пораженных участках кожи 35,0%, на видимо здоровых — 35,2%. Также были выявлены различия в соотношении таксонов в зависимости от исследуемого участка кожи. В очагах высыпаний доля S. haemolyticus и S. epidermidis составила 12,2 (12,1—12,4) и 6,4 (6,4—6,4)% соответственно, а других комменсальных стафилококков — 16,4% (p < 0,001). На видимо здоровых участках доля S. epidermidis была больше, чем в очагах поражения (10,0 (10,0—10,0)%; р < 0,001), при этом S. haemolyticus составлял 10,4 (10,4—10,4)%, другие ком-менсальные стафилококки — 14,8%. Кроме того, секвенировались S. pyogenes (0,2 (0,1—0,2)%) и Klebsiella pneumoniae (0,08 (0,07—0,08)%), что свидетельствует о смещении микробного равновесия в сторону патогенной группы микроорганизмов. В микробном сообществе на кожном покрове также были выявлены Acinebacterium, Micrococcus, Aerococcus, Pseudomonas, Moraxella, Brevibacillus, Corinebacterium, Cyto-bacillus, Dermatococcus и секвенированы
участки генома грибов рода Malassezia. При анализе распределения данных микроорганизмов в очагах поражения и на видимо здоровой коже были обнаружены следующие структурные различия: Acinetobacteri-um (4,0 (4,0-4,0)%), Pseudomonas (3,4 (3,4-3,4)%) и дрожжеподобные грибы рода Candida (17,1 (17,1-17,2)%) преобладали на пораженных участках (p < 0,001 по сравнению с видимо неизмененными участками), а Micrococcus (10,7 (10,7-10,7)%), Aerococcus (2,6 (2,6-2,6)%), Moraxella (1,4 (1,4-1,4)%), Brevibacillus (2,5 (2,5-2,5)%), Corinebacterium (2,4 (2,4-2,4)%), Cytobacillus (0,07 (0,07-0,07)%), Dermatococcus (0,9 (0,9-0,9)%) и Malassezia spp. (0,14 (0,13-0,14)%) (p < 0,001 по сравнению с пораженной кожей) - на видимо неизмененной коже (рис. 1).
На 14-й день лечения доля S. aureus на пораженных участках снизилась по сравнению с ситуацией до лечения в среднем до 27,2 (27,0-27,8)% (р < 0,001), а на видимо неизмененной коже - до 16,8 (15,9-17,7)% (p < 0,001). При этом обсемененность S. epidermidis на пораженных участках увеличилась в 2,9 раза (до 18,2 (18,2-18,6)%) (p < 0,001 по сравнению с показателем до начала лечения), а на видимо неизмененной коже - в 1,4 раза (13,5 (13,5-13,6)%) (p < 0,001). Значимых изменений в численном соотношении других стафилококков выявлено не было (р > 0,05). Среди комменсалов на пораженной коже по сравнению с показателями до начала лечения отмечено значительное увеличение доли Brevibacillus (в 1,2 раза) (p < 0,001), Moraxella (в 1,4 раза) (p < 0,001) и Corinebacterium (в 1,3 раза) (p = 0,002) и снижение доли условно-патогенных грибов Candida spp. (в 1,5 раза) (p < 0,001). На участках непораженной кожи отмечалась схожая, однако статистически менее значимая тенденция. Эти изменения свидетельствуют об ингиби-рующем влиянии проводимой терапии на патогенные микроорганизмы микрофлоры и отражают тенденцию к постепенной нормализации микробиома кожи.
На 21-й день терапии отмечено снижение доли S. aureus в качественном составе мик-робиома кожи на 6,8% (р < 0,001 по сравнению с показателями до лечения). Также на 21-й день терапии отмечалось значимое повышение доли S. epidermidis и снижение доли S. haemolyticus как на измененных (19,3 (19,3-19,4) и 9,7 (9,7-9,8)% соответственно), так и на неизмененных (17,2 (17,2-17,3) и 6,8 (6,8-6,8)% соответственно) участках кожи (p < 0,001 для указанных возбудителей по сравнению с ситуацией до лечения на измененных и неизменных участках кожи). В образцах, взятых с поврежденных участков кожи, S. pyogenes составил на 0,18% больше, чем на видимо неизмененной коже (р < 0,001), а Pseudomonas - на 1,6% (p < 0,001). Таксономическое разнообразие пораженных участков характеризовалось увеличением в образцах кожи доли Micrococcus на 2,6% (p < 0,001), Acinetobacterium - на 1,6% (p < 0,001) и Corinebacterium - на 0,8% (p < 0,001) по сравнению с исходным уровнем. Вне участков поражения по сравнению с ситуацией до лечения отмечалось расширение микробного спектра с увеличением доли Aerococcus (4,4 (4,3-4,4)%) (р < 0,001), что указывает на увеличение разнообразия микробиома.
К 6-му месяцу терапии у пациентов на участках пораженной кожи отмечено снижение доли S. aureus до 8,4 (7,8-10,8)% (р < 0,001), на видимо неизмененной коже - до 5,7 (5,4-5,9)% (р < 0,001) в сравнении со значениями до начала терапии. В очагах поражения среди комменсальных видов рода Staphylococcus были секвени-рованы участки метагенома S. hominis (7,6 (7,5-7,8)%) и S. capitis (4,3 (4,2-4,4)%), на неизмененной коже доля S. hominis составила 6,9 (6,8-7,0)%, S. capitis - 1,8 (1,8-1,9)%. При этом S. haemolyticus определялся как на пораженных (6,7 (6,2-7,0)%), так и на неизмененных (3,6 (2,6-7,2)%) участках кожи. В очагах поражения доля других микробных патогенов (Pseudomonas spp., Klebsiella) была снижена по сравнению со значениями до лечения в 1,2 раза по сумме обоих патогенов (p < 0,001, р = 0,003 соответственно),
-Лечебное дело Ш4|1
Результаты исследований
Пораженные участки
До На 14-й На 21-й Через лечения день день 6 мес
S. aureus S. capitis S. epidermidis S. haemolyticus S. hominis S. warneri S. cohnii S. oralis S. borealis S. gallinarum S. saprofiticus S. pyogenes Acinetobacter Micrococcus Aerococcus Pseudomonas Moraxella Brevibacillus Corinebacterium Dermatococcus Cytobacillus K. pneumoniae Malassezia Candida spp. Другие
Видимо неизмененные участки
До На 14-й На 21-й Через лечения день день 6 мес
Доля в образце, %
0,02
Доля в образце, %
Рис. 1. Показатели таксономического разнообразия кожи.
на здоровых участках — в 2,1 раза по сумме обоих патогенов (p < 0,001), а условно-патогенные грибы (Candida spp. и Malassezia spp.) также стали встречаться в 2,3 раза реже (p < 0,001) (см. рис. 1). Приведенные показатели практически достигли уровней здоровых лиц, за исключением значений на пораженных участках кожи, которые оставались выше, чем в группе контроля.
При исследовании микробиома кишечника с использованием метагеномного секвенирования были выявлены существенные различия в его составе у пациентов основной группы, у которых до начала лечения преобладал S. aureus (22,8 (22,5—22,9)%), реже регистрировались S. epidermidis (10,0 (10,0—10,0)%) и S. capitis (10,7 (10,7-10,7)%). Также были выявле-
S. aureus S. capitis S. epidermidis S. haemolyticus S. warnen S. pyogenes Bifidobacterium spp. Lactobacterium spp. Enterobacterium spp. Klebsiella spp. Citrobacterium spp.
E. coli Candida spp. Corinebacterium spp. Proteus spp. Другие
До лечения
На 14-й день
На 21-й день
Через 6 мес
Доля в образце,!
Рис. 2. Показатели таксономического разнообразия кишечника.
ны S. pyogenes (0,08 (0,08-0,08)%) и дрож-жеподобные грибы Candida spp. (10,5 (10,1-10,8)%). Комменсальная микрофлора была представлена Bifidobacterium spp. (17,9 (17,1-18,4)%) и в меньшей степени Lactobacterium spp. (3,5 (3,5-3,5)%). В контрольной группе S. aureus и S. pyogenes отсутствовали. Среди других штаммов стафилококков преобладали S. epi-dermidis (4,0 (3,0-4,0)%) и S. capitis (2,8 (2,7-2,8)%) (p < 0,001 по сравнению с основной группой до лечения). Комменсаль-ные микроорганизмы в контрольной группе были представлены Bifidobacterium spp. (45,9 (45,2-46,2)%), Lactobacterium spp. (26,7 (26,1-27,5)%), Citrobacterium spp. (1,4 (1,4-1,4)%), Corinebacterium spp. (3,0 (3,0-3,0)%) (p < 0,001 по сравнению с основной группой для всех перечисленных патогенов), в категории условно-патогенной флоры были выделены Enterobacterium spp. (0,8 (0,6-0,8)%) и дрожжеподобные грибы Candida (8,3 (7,5-8,4)%) (p < 0,001 по срав-
нению с основной группой). Полученные данные указывают на резкое уменьшение разнообразия микробиома кишечника у пациентов основной группы по сравнению с контрольной (рис. 2).
На 14-й день лечения частота выделения S. aureus в кишечнике снизилась до 14,1 (14,0-14,1)% (p < 0,001 по сравнению с показателями до лечения). Преобладающими видами с нисходящей динамикой стали S. epidermidis (7,0 (7,0-7,0)%) (p < 0,001), S. haemolyticus (8,3 (8,3-8,3)%) (p < 0,001) и S. capitis (10,4 (10,1-10,5)%) (p = 0,011). Среди комменсальных видов было отмечено наибольшее увеличение количества по сравнению с начальными данными Bifidobacterium (на 8,4%) (p < 0,001) и Lactobacterium (на 6,3%) (p < 0,001). Прослеживалась положительная динамика в сторону значимого уменьшения доли условно-патогенной флоры микробиома, которую составили Candida spp. (9,3 (9,3-9,3)%) (p < 0,001) и S. pyogenes (0,07 (0,07-0,07)%)
35 30
29,7
25
20
15
10
21,0
17,6
До терапии
_I_
После 14 дней терапии
_I_
После 21 дня терапии
0
_1_
После 6 мес терапии
Основная группа ----Контрольная группа
Рис. 3. Показатели EASI.
(p = 0,043). В контрольной группе на долю Candida spp. и Proteus spp. пришлось 8,3 (7,5—8,4) и 2,6 (2,6—2,6)% соответственно, со статистически значимым отличием от основной группы (р < 0,001). Данные показатели указывают на снижение микробной обсемененности, что свидетельствует о необходимости продолжения лечения.
На 21-й день лечения наблюдалось снижение видового состава Staphylococcus spp. в кишечнике в 1,6 раза (p < 0,001), а S. haemolyticus — в 1,2 раза (p < 0,001) от начала терапии. В контрольной группе доля S. haemolyticus составила 1,8 (1,8—1,8)%, доля других стафилококков — 6,8% от общего числа микроорганизмов. У пациентов основной группы среди условно-патогенной флоры отмечено статистически значимое снижение Enterobacterium spp. на 1,4% (p < 0,001) и Candida spp. на 0,13% (p < 0,001), что приблизило их значения к таковым в группе контроля. C учетом увеличения доли в основной группе Bifidobacterium spp. на 0,7% (p < 0,001) и Lactobacterium spp. на 8,1% (p < 0,001) доля представителей ком-менсальной флоры составила 61,9%.
К 6-му месяцу лечения отмечено уменьшение доли S. aureus в 3,6 раза (p < 0,001), других микробных патогенов в 1,6 раза, что сопровождалось увеличением кишечных комменсалов: Bifidobacterium spp. — в 2,1 раза (p < 0,001), Lactobacterium spp. — в
5.8 раза (p < 0,001) и Corinebacterium — в
1.9 раза (p < 0,001). Реже встречались представители условно-патогенной флоры: доля Enterobacterium spp. снизилась по сравнению с показателями до лечения в 4,4 раза (p < 0,001), а дрожжеподобных грибов Candida spp. — в 1,3 раза (p < 0,001).
При исследовании микробиома кожи и кишечника были выявлены существенные различия в его составе у пациентов, страдающих МЭ, по сравнению со здоровыми лицами. Микробиом кожи у пациентов с МЭ отличался не только в области высыпаний, но и на видимо здоровых участках.
При оценке по показателям EASI до начала лечения тяжелое течение МЭ наблюдалось у 23 человек (76,7%), умеренное — у 7 (23,3%), при этом среднее значение индекса составило 29,7 (22,6—39,1) балла
(р < 0,001 по сравнению с контрольной группой) (рис. 3).
На 14-й день терапии среднее значение EASI снизилось на 8,7%, составив 21,0 (19,0-25,4) балл (р < 0,001). При этом умеренное течение заболевания было отмечено у 14 пациентов (46,7%), тяжелое — у 16 (53,3%) (р < 0,001). К 21-му дню EASI снизился еще на 3,4% (17,6 (15,2—21,1) балла) (р < 0,001 по сравнению с исходными значениями): у 20 пациентов (66,7%) отмечалась умеренная степень тяжести, у 10 (10,0%) — тяжелая.
К концу наблюдения (6-й месяц) EASI снизился на 23,0% по сравнению с началом терапии и составил 6,7 (4,8—9,5) балла (р < 0,001 по сравнению с исходными значениями). На момент окончания наблюдения легкая степень тяжести заболевания была зарегистрирована у 21 пациента (70,0%), умеренная — у 6 (20,0%), а у 3 пациентов (10,0%) сохранялось тяжелое течение кожного патологического процесса. У 4 пациентов (13,3%) в очагах поражения отмечались эритема, воспалительная инфильтрация и единичные папулезные элементы; у 26 пациентов (86,7%) патологический процесс дополнительно сопровождался зудом, наличием участков лихенификации и множественными экскориациями.
При сборе анамнеза выявлено, что пациенты отмечали уменьшение зуда и интенсивности эритемы уже на 14-й день от начала терапии, однако значимой клинической динамики в очагах при осмотре не отмеча-
лось. К 21-му дню лечения на участках поврежденной кожи было отмечено уменьшение лихенификации, уплощение папулезных элементов и снижение интенсивности эритемы, зуд отсутствовал. К 6-му месяцу субъективная симптоматика отсутствовала, но на участках кожи сохранялись единичные очаги лихенификации.
Заключение
Исходный состав микробиома кожи и кишечника у пациентов с хронической МЭ характеризовался низким разнообразием комменсальной флоры с преобладанием S. aureus. В процессе терапии отмечено постепенное увеличение доли представителей комменсальной флоры и уменьшение доли условно-патогенной флоры.
Таким образом, стандартная терапия больных МЭ оказывает положительное влияние на динамику кожного патологического процесса и микробиома, но не восстанавливает показатели последнего до уровня здоровых лиц, что может быть причиной рецидивов заболевания. Вышеизложенное свидетельствует о необходимости оптимизации ведения пациентов с хронической МЭ с применением методов коррекции нарушений баланса между таксономическими группами.
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Со списком литературы вы можете ознакомиться на нашем сайте www.atmosphere-ph.ru
Skin and Gut Microbiome in Patients with Chronic Microbial Eczema: Assessment Using Metagenomic Sequencing and Its Dynamics during Therapy V.V. Lazarev, M.M. Tlish, and M.E. Shavilova
The microbiota of skin and gut includes a stable and variable commensal community with specific composition. The microbiome is individual to each person similarly to the iris or papillary pattern of dermis that forms the fingerprint. The study identified microbial genomes of gut and skin from affected and apparently healthy areas in patients with chronic microbial eczema. In order to improve the accuracy of identifying the taxonomic diversity of both microbiomes, 16S ribosomal RNA metagenomic sequencing was used. The results suggested a shift in the equilibrium of microbiological communities towards the predominance of Staphylococcus aureus, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus capitis, Streptococcus pyogenes, Klebsiella spp., and Candida spp. both in intestinal and skin taxonomic groups during the exacerbation period. This observation offers opportunities to correct the changes in bacterial consortia by restoring the normal microflora, in order to reduce the frequency of relapses and alleviate the severity of course of chronic microbial eczema.
Key words: microbial eczema, skin microbiome, intestinal microbiome, microbiota, metagenomic sequencing.
