CC BY
31
БЮЛЛЕТЕНЬ ВОЛГОГРАДСКОГО НАУЧНОГО ЦЕНТРА РАМН
заболеваний, вызванных вирусом простого герпеса (инфекции слизистых оболочек, неонатальные инфекции, висцеральные инфекции
иммунокомпромиссных пациентов и др.). Известно, что мутации двух ферментов вируса герпеса (тимидинкиназы и ДНК-полимеразы) обусловливают его резистентность к ацикловиру.
Выявление молекулярных механизмов ацикловир-резистентности вируса Herpes simplex типа 1 человека и обобщение полученных данных (путем создания базы данных мутаций тимидинкиназы и ДНК-полимеразы) позволят проводить быстрое молекулярно-генетическое определение ацикловир-резистентности данного штамма вируса.
ЦЕЛЬ РАБОТЫ. Определить с помощью информационных технологий новые молекулярные механизмы возникновения ацикловир-резистент-ности герпес-вирусов типа 1 человека.
МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЯ.
Проанализированы взятые на сервере NCBI (National Center for Biotechnology Information, www.ncbi.nlm.nih.gov) аминокислотные
последовательности тимидинкиназ ацикловир-чувствительного штамма 17 [3] и ацикловир-резистентного клона 3 (CL3, [2]) вируса Herpes simplex типа 1 человека. Также проанализированы нуклеотидные последовательности гена,
кодирующего тимидинкиназу клона 3 данного вируса [2], и нуклеотидная последовательность секвенированного генома штамма 17 вируса Herpes simplex типа 1 человека [3]. Выравнивание последовательностей проведено с помощью программ ClustalW Protein и ClustalW DNA [1]. Работа поддержана грантом БРФФИ № Б06М-060 от 01.04.2006 г.
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ. Основным отличием изучаемых тимидинкиназ является количество входящих в них аминокислотных остатков (376 - у штамма 17, 407 -у CL3). При выравнивании данных последовательностей установлено, что участки 1-354 являются консервативными, в них наблюдаются лишь 4 аминокислотные замены (в 23-м положении - аспарагин-серин, в 36-м - лизин-глутаминовая кислота, в 89-м - аргинин-глутамин и в 265-м положении - аланин-треонин). Выравнивание С-терминальных участков, напротив, характеризуется малым сходством с большим количеством гэпов, что ставит под сомнение его корректность. Именно существенные отличия С-тер-миналей сопоставляемых последовательностей обусловливают сложность их выравнивания. Понятно, что такие различия первичной структуры изучаемых тимидинкиназ не могли не повлиять на их вторичную структуру и функции. С определенной степенью осторожности мы полагаем, что именно они и являются одним из молекулярных механизмов изменения чувствительности к ацикловиру изучаемого вируса.
Для выявления причин существенных вариаций аминокислотных последовательностей тимидинкиназ
Ф
3-2007 |
клона 3 и штамма 17 вируса простого герпеса типа 1 человека проведено выравнивание нуклеотидной последовательности гена, кодирующего
тимидинкиназу CL3, и нуклеотидной последовательности локусов 23 и 22 генома штамма 17 вируса Herpes simplex типа 1 человека. При этом обнаружена делеция цитозина в кодоне ЦЦА (10631065) последовательности изучаемого гена, кодирующего тимидинкиназу CL3 изучаемого вируса, что привело к сдвигу рамки считывания и появлению уникальной последовательности аминокислот в кодируемом белке.
Транскрипция гена, кодирующего
тимидинкиназу штамма 17 вируса простого герпеса типа 1 человека, останавливается по стоп-кодону ТГА (1129-1131). За счет сдвига рамки считывания в последовательности аналогичного гена CL3 происходит исчезновение стоп-кодона, и транскрипция продолжается в локусе 23, в межлокусном пространстве, и прекращается лишь в локусе 22 на расположенном в нем стоп-кодоне ТАА.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Делеция цитозина в кодоне ЦЦА (1063-1065) последовательности гена, кодирующего тимидинкиназу CL3 вируса простого герпеса типа 1 человека, приводит к сдвигу рамки считывания и появлению в С-терминальной области белка уникальной последовательности аминокислот. Показанные изменения первичной структуры тимидинкиназ, безусловно, могут являться одним из молекулярных механизмов ацикловир-
резистентности изучаемых вирусов.
ЛИТЕРАТУРА
1. Clustal W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions - specific gap penalties and weight matrix choice / J. D. Tompson, D. G. Higgins, T. J. Gibson // Nucl. Acids Res. -1994. - Vol. 22. - P. 4673-4680.
2. National Center for Biotechnology Information [Electronic resource] / National Library of Medicine, B. 38A, Be-thesda, MD 20894. - Mode of access: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=protein&v al=9857320. - Date of access: 28.05.2007.
3. The complete DNA sequence of the long unique region in the genome of herpes simplex virus type 1/ McGeo^ D.J., et al. // J. Gen. Virol. - 1988. - Vol. 69 (PT 7). - P. 15311574.
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПЛАНТОГРАФИЯ И СОМАТОТИПИРОВАНИЕ ПАЦИЕНТОВ В ПРОГНОЗЕ РЕЗУЛЬТАТОВ КОРРЕКЦИИ ПОПЕРЕЧНОГО ПЛОСКОСТОПИЯ
А. А. Воробьев, В. В. Сивик, А. И. Краюшкин
Волгоградский государственный медицинский университет
Плоскостопие, характеризующееся уплощением продольного и поперечного сводов стопы в сочетании с поворотом вокруг продольной оси и
Ф
43
БЮЛЛЕТЕНЬ ВОЛГОГРАДСКОГО НАУЧНОГО ЦЕНТРА РАМН
I 3-2007
отведением, является наиболее распространенным и сложным для прогноза ортопедическим заболеванием нижних конечностей [Ануфриева Л. В., 2002; Knupp M. et al., 2005; Grimes J., Coughlin M., 2006; Logel K. J. et al., 2007].
В настоящее время при оценке плоскостопия выдвигается все больше требований к объективности не только к установлению самого факта пласкостопия, но и к количественной оценке прогноза эффективности возможных вариантов его коррекции [Kristen K. H., 2006; Vasarhelyi A. et al., 2006; Gallentine J. W. et al., 2007; Takao M. et al., 2007].
В последние годы нами совместно с проф. К.В. Гавриковым всесторонне внедряется и детально обосновывается применимость оригинальной программы компьютерной плантографии в различных областях анатомии, физиологии и клинической медицины [Краюшкин А. И. с соавт., 2004, 2005; Воробьев А. И., с соавт., 2006; Бабайцева Н. С., 2007].
ЦЕЛЬ РАБОТЫ. Обосновать необходимость включения данных компьютерной плантографии и соматотипирования пациентов с поперечным плоскостопием в количественный прогноз результатов лечения.
МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЯ. В основную группу были включены 36 лиц в возрасте 19-28 лет (мужчин - 22, женщин - 14) с поперечным плоскостопием, поступивших на плановое лечение в травматологическое отделение ОКБ № 1 г. Волгограда. Группу сравнения составили практически здоровые мужчины (25) и женщины (15) в возрасте 18-26 лет, обучающиеся в вузах г. Волгограда.
Всем обследованным было проведено соматотипирование, по результатам которого в основной группе было выделено 12 (33 %) пациентов брахиморфного соматотипа, 20 (56 %) -мезоморфного и 4 (11 %) - долихоморфного типов. В группе сравнения оказалось 9 (22 %) человек брахиморфного типа, 20 (50 %) - мезоморфного типа и 11 (28 %) - долихоморфного типа.
Показатели компьютерной морфометрии были разделены на четыре группы: интегральные (общая длина, ширина, высота, площадь контактной поверхности и угол подъема стопы), а также раздельно характеризующие передний, средний и задний отделы стопы.
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ. Сопоставление значений показателей, выявленных до начала лечения, с его результатами выявило две закономерности.
1. Наиболее значимыми критериями, которые необходимо включать в прогностический анализ при выборе метода у лиц с поперечным плоскостопием, являются показатели площади переднего и заднего отделов стопы, углы отклонения большого пальца и свода стопы, а также ширина среднего отдела стопы.
2. Наименее устойчивые и трудно
прогнозируемые результаты характерны для лиц с
ф
долихоморфным типом телосложения.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ. На основании полученных характеристик стопы предложена упрощенная математическая модель, подставляя в которую индивидуальные значения соматотипа и показателей морфофункционального состояния стопы, можно количественно оценить риск получения малоэффективных результатов оперативного лечения поперечного плоскостопия у взрослых.
АЛГОРИТМ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ТРАВМ ОПОРНО-ДВИГАТЕЛЬНОГО АППАРАТА НА ОСНОВЕ СОВРЕМЕННЫХ КОМЬЮТЕРНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ
И. В. Гречухин
Астраханская государственная медицинская академия
В связи с тем, что травмы опорно-двигательного аппарата составляют одну их острых проблем современного общества, внедрение эффективных форм организации их профилактики и травматологической помощи в условиях рыночных отношений приобрели особую актуальность.
В то же время система управления лечебными учреждениями на современном этапе рассматривается как менеджмент, включающий в себя ряд принципов, методов, функций и уровней, что предусматривает использование экономико-математических методов. Стратегический уровень управления базируется на прогнозировании и планировании с применением приемов эксперимента и моделирования.
Важнейшим ресурсом управления является информация, используемая для системного и ситуационного анализа и принятия верных решений. Все это обусловливает применение адекватных методов обработки большого массива данных, выбор которых представляет весьма непростую задачу.
На кафедрах оперативной хирургии и топографической анатомии, травматологии и ортопедии, травматологии, ортопедии и ВПХ Астраханской государственной медицинской академии проводятся комплексные исследования региональных особенностей травм опорно-двигательного аппарата среди городского населения на базе новых компьютерных технологий с применением прикладного пакета "STATISTICA" for WINDOWS v. 6.0.
Для изучения динамики первичных обращений за травматологической помощью использован специальный алгоритм, основанный на современной теории анализа временных рядов,
предусматривающий:
• построение графика временной изменчивости интенсивного показателя;
• получение автокорреляционной функции, указывающей на зависимость значений показателя;
• спектральный анализ с построением
Ф
44
