CC BY
2
| ГЕМАТОЛОГИЯ И ТРАНСФУЗИОЛОГИЯ | RUSSIAN JOURNAL OF HEMATOLOGY AND TRANSFUSIOLOGY (GEMATOLOGIYA I TRANSFUSIOLOGIYA) | 2023; ТОМ 68; №2 |
Хабибуллин Н.Р., Хрульнова С.А., Федорова А.В., Фролова И.Н., Клясова Г.А.
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ПЛАЗМИДНЫХ РЕПЛИКОНОВ В ИЗОЛЯТАХ KLEBSIELLA PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ГЕМОКУЛЬТУРЫ
БОЛЬНЫХ ОПУХОЛЯМИ СИСТЕМЫ КРОВИ
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Москва
Введение. Гипервирулентные множественно устойчивые к антибиотикам штаммы Klebsiella pneumoniae представляют существенную угрозу, особенно для иммунокомпрометированных больных. Распространение K. pneumoniae, одновременно несущих детерминанты резистентности и вирулентности, может быть обусловлено как кло-нальным распространением, так и горизонтальным переносом генов резистентности и вирулентности на плазмидах.
Цель. Изучить распределение плазмидных репликонов в изоля-тах K. pneumoniae, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови.
Материалы и методы. Материалом исследования были изоляты K. pneumoniae, выделенные из гемокультуры больных, находившихся на стационарном лечении в 7 учреждениях 5 городов России (2003— 2021 гг.). Чувствительность изолятов K. pneumoniae к карбапенемам оценивали согласно критериям CLSI (2021). Наличие генов карбапе-немаз (групп blaKPC, blaOXA-48, blaVIM, blaIMp, blaNDM) определяли методом ПЦР в режиме реального времени с использованием коммерческих наборов. Наличие генов гипервирулентности peg-344, iroB, iucA, rmpA и rmpA2, а также наиболее распространенных среди K. pneumoniae плазмидных репликонов HI1, HI2, M, N, FIA, FIB, X3, X4, L, B/O, R,
HI1B, A/C, FIIK, FIBMar, FII и FIBk определяли методом ПЦР с последующим анализом продуктов амплификации гель-электрофорезом.
Результаты. Для исследования разнообразия плазмидных репликонов было отобрано 306 изолятов. В их число вошли 132 кар-бапенемазопродуцирующих K. pneumoniae (CP-K. pneumoniae), 95 K. pneumoniae с продукцией ß-лактамаз расширенного спектра действия и без продукции карбапенемаз (ESBL-K. pneumoniae), 79 K. pneumoniae без продукции ESBL и карбапенемаз. Ген-позитивных гипервирулентных K. pneumoniae (hypervirulence genes-positive K. pneumoniae, hg-K. pneumoniae) среди CP-K. pneumoniae было 70 (53%), среди ESBL-K. pneumoniae — 45 (47,4%), среди K. pneumoniae без продукции ESBL и карбапенемаз — 34 (43%). Исследуемые репликоны не были обнаружены у 32 (10,5%) изолятов. Наиболее часто в одном изоля-те детектировалось два (29,7%) или три (22,5%) репликона, при этом 11 (3,6%) изолятов несли 5 или 6 репликонов. Репликоны HI2 и B/O не были обнаружены ни в одном изоляте. Наиболее представленными репликонами оказались FIIK (45,8%), FIBk (36,3%) и R (35,6%). Репликоны HI1B, L, FIBMar и FII были обнаружены у 26,8—15,7% изолятов, реже встречались остальные репликоны ■— у 6,2—0,3% изолятов. CP-K. pneumoniae по сравнению с K. pneumoniae без продукции ESBL и карбапенемаз чаще несли репликоны R, L, X3, HI1B, FIBMar, FII и M (p<0,0077). Как показано на рис., HI1B чаще встречался среди hg-K. pneumoniae (p<0,0023). FIBMar чаще выявлялся среди hg-CP-K. pneumoniae и hg-ESBL-K. pneumoniae (p<0,0002), практически не встречался у K. pneumoniae без продукции ESBL и карбапенемаз.
Заключение. Ген-детектированные гипервирулентные K. pneumoniae с продукцией карбапенемаз и/или ESBL чаще содержали репликон FIBMar, горизонтальный перенос которого может быть одной из причин распространения гипервирулентных K. pneumoniae с множественной резистентностью к антибиотикам.
Хрульнова С.А.1, Фёдорова Ф.В.1, Фролова И.Н.1, Ветохина А.В.2, Молчанова И.В.3, Куцевалова О.Ю.4, Ликольд Е.Б.1, Клясова Г.А.1
КЛОНАЛЬНЫИ СОСТАВ КАРБАПЕНЕМАЗОПРОДУЦИРУЮЩИХ KLEBSIELLA PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ГЕМОКУЛЬТУРЫ
БОЛЬНЫХ С ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ
]ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Москва, 2ГБУЗ «Иркутская ордена "Знак Почета" областная клиническая больница», г. Иркутск, 3ГБУЗ «Челябинская областная клиническая больница», г. Челябинск, 4ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Ростов-на-Дону
Введение. В последние годы возросло число сообщений об увеличении доли K. pneumoniae, устойчивых к карбапенемам.
Цель. Изучить клональный состав Klebsiella pneumoniae с продукцией карбапенемаз (CP-K. pneumoniae), выделенных из гемокультуры.
Материалы и методы. Материалом исследования были K. pneu-moniae, выделенные из гемокультуры от больных, находившихся на стационарном лечении в 7 учреждениях 5 городов России (2003—2022 гг.).
Чувствительность K. pneumoniae к карбапенемам оценивали согласно критериям CLSI (2021). Детекция генов карбапенемаз (групп blaKPC, baOXA-48, blaIMP, blaVIM и blaNDM) была проведена с помощью ПЦР в режиме реального времени с использованием коммерческих наборов. Для характеристики клональной структуры популяции использовали метод мультилокусного секвенирования-типирования (МЛСТ) (http s ://bigsdb .web .p asteur.fr/kleb siella/kleb siella.html).
Результаты. Всего было исследовано 159 изолятов CP-K. pneumoniae. Среди CP-K. pneumoniae преобладали гены карбапенемаз OXA-48 (71,1%; n=113), затем следовали сочетание OXA-48+NDM (13,2%; n=21), KPC (10,7%; n=17) и NDM (3,1%; n=5). По одному изоляту (по 0,6%) представляли сочетания генов карбапенемаз
OXA-48+ KPC, NDM+KPC, OXA-48+KPC+NDM Всего гены карбапенемаз NDM в моноварианте или в сочетаниях были выявлены у 28 (17,6%) СР-K. pneumoniae. При генотипировании всех CP-K. pneumoniae было обнаружено 20 сиквенс-типов (ST), среди которых преобладал ST395 (32,7%, 52 из 159). Более 10 изолятов относились к ST23 (11,9%, n=19), ST11 (9,4%, n=15), ST147 (8,2%, n=13), ST377 (7,5%, n=12) и ST101 (6,9%, n=11). К 6
ПРИЛОЖЕНИЕ 1
сиквенс-типам принадлежало от 2 до 9 изолятов (ST874 (n=9), ST307 (n=7), ST3229 (n=5), ST512 (n=4), ST39 (n=2) и ST258 (n=1)). По одному изоляту было отнесено к 8 сиквенс-типам (ST13, ST14, ST15, ST29, ST86, ST218, ST336, ST590). На рис. 1 представлено распределение групп карбапене-маз среди разных ST. Карбапенемазы группы OXA-48 содержали все изоляты K. pneumoniae ST23 и ST377, от 80 до 90,4% — ST395, ST11 и ST307. В то время как K. pneumoniae в составе ST874 несли сочетание групп генов карбапенемаз OXA-48+NDM, а K. pneumoniae ST101 (90,9%) и ST512 (75%) — карбапенемазы группы KPC. Наибольшее разнообразие генов карбапенемаз было отмечено у K. pneumoniae в составе ST147, среди которых сочетание групп генов карбапенемаз OXA-48+NDM имели 46,2% изолятов, группы OXA-48 — 30,8%, группы NDM — 23,1%. Впервые CP-K. pneumoniae в рамках многоцентрового исследования были выделены в 2007 г. и принадлежали к ST258. В последующем возросло число определяемых ST. Наибольшее разнообразие ST среди CP-K. pneumoniae было выявлено в 2018—2022 гг., и они вошли в состав 15 ST (рис. 2). Доминирующий ST395 впервые был определен в 2013—2017 гг., далее занял ведущую позицию (38,3%) и сохранил её (33,7%) в 2018-2022 гг. Доля ST23, ранее занимавшего 2-ю позицию, снизилась с 29,8% (2013-2017) до 5% (2018-2022). Следует отметить появление в 2018-2022 гг. ранее не определяемых ST, таких как ST101 (n=11), ST874 (n=9), ST307 (n=7) и ST512 (n=4).
Заключение. Среди CP-K. pneumoniae отмечено генетическое разнообразие, которое представлено 20 ST. В клональной структуре определено преобладание ST395 (32,7%), который можно рассматривать клоном высокого риска для стационаров России. Для каждого ST определены «свои» доминирующие группы карбапенемаз. В период исследования происходило изменение клонального состава CP-K. pneumoniae, которое характеризовалось увеличением разнообразия детектируемых сиквенс-типов.
Чеботкевич В.Н., Кулешова А.В. Бурылев В.В., Грицаев С.В., Бессмельцев С.С.
КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ И КАЧЕСТВЕННЫЙ СОСТАВ МИКРОБИОМА КИШЕЧНИКА КАК ПРЕДИКТОР РАЗВИТИЯ ИНФЕКЦИЙ У ОНКОГЕМАТОЛОГИЧЕСКИХ БОЛЬНЫХ ПРИ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК
ФБГУ «Российский научно-исследовательский институт гематологии и трансфузиологии Федерального медико-биологического агентства», г. Санкт-Петербург
Введение. Исследования последних лет показали, что эндогенное заражение из кишечника является основным путем проникновения микробов в кровоток и развития инфекций кровотока у онкогемато-логических больных. Этому способствует иммуносупрессия и частое развитие мукозитов у пациентов. Показано так же, что важную роль играет нарушение состава микробиоты кишечника и снижение ее разнообразия под влиянием терапии антибиотиками.
Цель. Определить качественные и количественные характеристики кишечного микробиома, способствующие развитию инфекций у пациентов с множественной миеломой, при высокодозной химиотерапии и аутологичной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (АТГСК).
Материалы и методы. В исследование было включено 30 пациентов с множественной миеломой в возрасте 48—67 лет (медиана 60 лет), в период с 2020 по 2022 год, перенесших процедуру аутологичной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (АТГСК). Протокол исследования включал сбор и низкотемпературное замораживание образцов кала, полученных от больных до проведения АТГСК и в разные сроки от 7 до 35 дней после ее проведения. Всего было получено 98 образцов биоматериала. В каждом из биологических образцов выполнялась ПЦР-амплификация V5 региона гена 16S рРНК с помощью модифицированных универсальных бактериальных праймеров. Очищенные ПЦР-продукты секвенировали с помощью платформы MiSeq Illumina. Филогенетическая классификация до видового уровня выполнялась на основании базы данных Illumina.
Результаты. Разнообразный кишечный микробиом имеет защитный эффект против ряда инфекций, включая способность предотвращать колонизацию кишечника высокоустойчивыми патогенами. Установлено, что снижение индекса разнообразия является независимым предикто-
ром развития инфекционных осложнений при аллогенной ТГСК. Наши исследования показали, что достоверное (р=0,0215) снижение индекса разнообразия наблюдается и при АТГСК. Известно, что доминирование протеобактерий в кишечной микробиоте является независимым предиктором развития грамотрицательных инфекций кровотока. Недавно было показано, что в защитном эффекте микробиоты и ее способности подавлять патогены важную роль играют бактерии рода Б1аи1ш. В нашем исследовании бактерии рода В1аи1ш в разные сроки до и после трансплантации выявлены у 29 из 30 пациентов. Всего идентифицировано 30 штаммов Ыа^1а, из них: В. соссо$ел 18 (60%), В. шех1егае 8 (27%), В. hansenii 1 (3%), В. hyдrogenotrophica 2 (7%), В. дЖ'тки, 1 (3%). Далее была проанализирована частота выявления энтерококков — частых возбудителей бактериемии — в микробиоте пациентов. Установлено, что энтерококк был выявлен в 11 случаях из микробиоты, где бактерии рода В1аи11а обнаружены не были, и только в четырех при выявлении бактерии этого рода в микробиоте. Это указывает на пробиотические свойства бактерий рода В1аи1ш. Кроме того, имеются работы, показавшие, что снижение плотности бактерий рода В1аи11а в микробиоте является предиктором развития РТПХ при алло-ТГСК.
Заключение. Снижение разнообразия кишечного микробиома является предиктором возможного развития инфекционных осложнений у гематологических больных при высокодозной терапии и АТГСК. Бактерии рода В1аиЕа обладают пробиотическими свойствами и способствуют подавлению колонизации кишечника патогенными микробами, в частности энтерококками. Понижение плотности В1аика или их отсутствие в микробиоте кишечника является предиктором развития РТПХ при аллогенной ТКМ. Это указывает на необходимость мониторинга микробиоты как предиктора развития РТПХ при аллогенной ТКМ.
Юдинцева О.С., Попова М.О., Рогачева Ю.А., Спиридонова А.А., Казанцев И.В., Слесарчук О.А., Быкова Т.А., Зубаровская Л.С.
КОЛОНИЗАЦИЯ РЕЗИСТЕНТНЫМИ БАКТЕРИЯМИ: ВЛИЯНИЕ НА ИНФЕКЦИИ И ВЫБОР ЭМПИРИЧЕСКОЙ АНТИБАКТЕРИАЛЬНОЙ ТЕРАПИИ У ДЕТЕЙ ПРИ ВЫПОЛНЕНИИ ТГСК
ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской
Федерации, НИИ ДОГиТ им. Р.М. Горбачевой, г. Санкт-Петербург
Введение. Исследования во взрослой популяции подтвердили, обусловленной резистентным гр(-) бактериями, является колониза-что наиболее важным фактором риска развития тяжелой инфекции, ция или предшествующая инфекция устойчивым патогеном. Однако
