Изменение профиля экспрессии ключевых генов онкогенеза при различных стадиях колоректального рака Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

XXI РОССИЙСКИЙ ОНКОЛОГИЧЕСКИЙ КОНГРЕСС

ПОСТЕРЫ

ИНФЕКЦИИ

имеет большой потенциал в диагностике, прогнозе и последующем наблюдении за пациентами из-за низкой инвазивности и возможности быстро и без вреда для пациента проводить исследование.

Материалы и методы. Ранее нами был разработан биологический микрочип для анализа соматических мутаций в гене BRAF (V600E [c. 1799T>A], V600M, V600K, V600R, V600D, V600E [c. 1799_1800delTGinsAA]) в опухолевой ткани. В ходе данной работы он был адаптирован для анализа мутаций и в цоДНК. Для преимущественной амплификации мутант-ной ДНК на фоне избытка ДНК дикого типа использовали LNA-блокирующую ПЦР. Длина ПЦР-продукта составляла 74 п. о., что позволило успешно анализировать деградированную ДНК. Полученные ампликоны служили матрицей на втором этапе ПЦР, в результате которого получали одноцепочечный флуоресцентно-меченный ПЦР-продукт, который затем гибридизовали с аллель-специфичными олиногуклеотидами, иммобилизованными на биочипе. Метод был протестирован на 30 контрольных образцах ДНК, выделенных из опухолевой ткани, и 19 образцах цоДНК. Генотип контрольных образцов был предварительно определен секвенированием по Сенгеру. ЦоДНК была выделена из 2—5 мл плазмы, полученной от пациентов до хирургического вмешательства.

Результаты. Генотипы всех контрольных образцов были определены корректно. Также мы протестировали 19 образцов цоДНК у пациентов с метастатической меланомой с известным статусом BRAF: 12 опухолей были мутированы и 7 были WT. Мутации были обнаружены в 10/12 образцах цоДНК у пациентов, имеющих мутацию BRAF в опухоли, и ни в одном из 7 образцов цоДНК у BRAF WT пациентов. Метод позволяет детектировать мутацию, если ее доля в образце >0,2%. Заключение. Предложенный метод идентификации соматических мутаций в гене BRAF в цоДНК на основе технологии биочипов является эффективным и простым в применении. Работа выполнена при поддержке гранта президента Российской Федерации (# МК-2519.2017.4).

Изменение профиля экспрессии ключевых генов онкогенеза при различных стадиях колоректального рака

У. Станоевич',2, В. К. Боженко', М. В. Захаренко', И. Д. Тро-ценко2, Т. В. Крашихина2, В. А. Солодкий' Место работы: 'ФГБУ «Российский научный центр рент-генорадиологии» МЗ РФ, Москва, Россия; 2Кафедра онкологии и рентгенорадиологии медицинского факультета Российского университета дружбы народов, Москва, Россия e-mail: 8'5879'@gmail.com

Цель. Поиск молекулярно-генетических факторов прогноза клинического течения колоректального рака (КРР). Материалы и методы. Методом ПЦР в реальном времени проанализирован уровень экспрессии 64 генов, ответственных за пролиферацию, апоптоз, ангиогенез, адгезию, ремо-делирование межклеточного матрикса, маркеров и факторов врожденного и приобретенного иммунитета, рецепторов эстрогенов и прогестерона, ароматазы, в 261 образце ткани толстой кишки (132 образцах ткани опухоли и 129 образцах слизистой оболочки толстой кишки без морфологических признаков опухолевого роста (МНТ), полученных от тех же пациентов). Группы сравнения сформированы в зависимости от поставленной задачи: глубина инвазии первичной опухоли (Т1, Т2, Т3, Т4), наличие регионарных (N0, N+) и отдаленных

метастазов (М0, М+), прогрессирование заболевания. Средние сроки наблюдения — 31,4 ± 15,2 мес. Результаты. При определении уровня экспрессии изучаемых генов в зависимости от глубины инвазии не выявлено каких-либо достоверных изменений в группах Т1, Т2 и Т3 как в ткани опухоли, так и в МНТ, тогда как при уровне инвазии Т4 выявлено большое количество генов, достоверно (р<0,05) отличающих данную группу от остальных, как в ткани опухоли (CD56, ММР2, GNLY, 12, ВАХ, LIF, 17, CD45, ^4, SCUBE2, IL2Ra, 115, CD68, VEGFA165, 112а, LGALS1, 16, РАРРА, LIFR, CD69, СОХ-2), так и в МНТ ^СШЕ2, CD56, ВАХ, 115, РТЕ^ GNLY, LGALS1, LIF, 112а, РАРРА). При анализе экспрессии генов в сравниваемых образцах в зависимости от наличия пораженных лимфатических узлов обнаружена ассоциированность регионарных метастазов с повышением (р<0,05) экспрессии ССND1 и Р16 в ткани опухоли и повышением (р<0,05) К1 67 и снижением 16 в МНТ. Наличие отдаленных метастазов ассоциировалось с достоверным (р<0,05) изменением уровней экспрессии 12 из изученных 64 генов в ткани первичной опухоли (ВАХ, TGF-p, ^4, Р161, GNLY, GATA3, IGF1, 17, LIFR, CD45, 16, LIF) и Р14 и TGF-p в МНТ. Прогрессиро-

вание заболевания также характеризуется (р<0,05) изменением экспрессии большого количества генов в ткани опухоли (Р16, 17, 12, ВАХ, CD56, ММР11, 112а, ^4, CD45, GNLY, LIFR, 115, ММР2, ^а, CD69), а также МНТ (С^2, ССШ1, MYBL2, TERT, GREM1, CYP19A).

Заключение. Установлен профиль экспрессии генов, ассоциированный с глубиной инвазии, наличием регионарных и отдаленных метастазов и прогрессированием как в ткани самой первичной опухоли, так и в слизистой оболочке толстой кишки без морфологических признаков опухолевого роста больного КРР.

Стратегия лечения нозокомиальных инфекций, вызванных Enterococcus spp. (Enterococcus faecium и Enterococcus faecalis) у онкологических больных

В. В. Агинова'

Место работы: 'ГБПОУ ДЗМ «Медицинский колледж №'», г. Москва

e-mail: in. [email protected]

Цель. Анализ резистентности энтерококков, вызывающих инфекционные осложнения у онкологических больных, к антибиотикам для определения стратегии их дальнейшего использования в клинике.

Материалы и методы. Проанализировано 1 419 штаммов энтерококков, выделенных от онкологических больных, имевших различные инфекционные осложнения в период 2014—2016 гг. Идентификация микроорганизмов и оценка их чувствительности к антибактериальным препаратам производилась с помощью современных автоматизированных систем: Vitek-2, WalkAway, MS MALDI TOF. Результаты. Общее количество E. faecalis и E. faecium снизилось с 489 штаммов в 2014 г. до 417 штаммов в 2016 г. (p<0,001). Число ампициллин-резистентных штаммов было минимальным для E. faecalis и составило 8%, что позволяет рассматривать аминопенициллины, в том числе ампицил-лин/сульбактам и амоксициллин/клавуланат, как препараты выбора для лечения инфекций, вызванных этим возбудителем. Напротив, почти все штаммы E. faecium были резистентны к ампициллину, за исключением 2016 г., когда их количество снизилось до 51,9%, оставаясь в целом

Злокачественные опухоли

www.malignanttumours.org

Том / Vol. 7 № 3 S 1 /2017

Malignant Tumours

www.malignanttumours.org