CC BY
39
Пробл. особо опасных инф. 2018; 1:36-43. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-1-36-43
УДК: 616.932(470)
Э.А.москвитина1, Е.Г.Тюленева1, В.Д.Кругликов1, с.В.Титова1, А.с.Водопьянов1, м.л.куриленко1, н.Д.Пакскина2, с.м.иванова3, Г.БАнисимова1, с.о.Водопьянов1, и.П.олейников1
ХОЛЕРА: ОЦЕНКА ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЙ ОБСТАНОВКИ В МИРЕ И РОССИИ
В 2008-2017 гг. ПРОГНОЗ НА 2018 г.
1ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт», Ростов-на-Дону, Российская Федерация; 2Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека,
Москва, Российская Федерация; 3ФКУЗ «Противочумный центр», Москва, Российская Федерация
В мире в 2017 г. продолжается тенденция снижения заболеваемости холерой (относительно 2008 г.) при среднем ежегодном темпе -1,113 %. Установлена тенденция роста интенсивных помесячных показателей заболеваемости холерой в мире в 2017 г. по сравнению с 2015 и 2016 гг. Выявлено 25 стран с 70 эндемичными территориями, 11734 импортированных случая холеры на различные континенты с преобладанием межгосударственных заносов в Азии. В России имели место заносы холеры в 2008, 2010, 2012 и 2014 гг. из Индии. Из поверхностных водоемов выделены V. cholerae 01 биовара Эль Тор ctxA-tcpA-, ctxA-tcpA+ и V. cholerae 0139 ctxA- и tcpA- , а также единичные V. cholerae 01 биовара Эль Тор ctxA+tcpA+. При INDEL-типировании 242 штаммов V. cholerae O1 из объектов окружающей среды (2014-2017 гг.) получены данные о принадлежности к одному кластеру V. cholerae O1 ctxA-tcpA+ и, наряду с генетическим разнообразием V. cholerae O1 ctxA-tcpA- в ряде регионов, ежегодно были изолированы штаммы одного или близкородственных генотипов. Впервые для прогноза разработана оценка риска активизации эпидемического процесса при холере в России с учетом различных факторов (условий), их градации и экспертной оценки в баллах. Прогноз по холере на глобальном уровне и в России на 2018 г. неблагоприятный.
Ключевые слова: холера, эпидемиологическая обстановка, заносы, эндемичные территории, V. cholerae O1, V. cholerae 0139, прогноз.
Корреспондирующий автор: Москвитина Эльза Афанасьевна, e-mail: [email protected].
E.AMoskvitina1, E.G.Tyuleneva1, V.D.Kruglikov1, S.V.Titova1, A.S.Vodop'yanov1, M.L.Kurilenko1, N.D.Pakskina2, S.M.Ivanova3, G.B.Anisimova1, S.O.Vodop'yanov1, I.P.Oleynikov1
Cholera: Assessment of Epidemiological Situation on Cholera around the World and in Russia in 2008-2017. Forecast for 2018
1 Rostov-on-Don Research Anti-Plague Institute, Rostov-on- Don, Russian Federation; 2Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare, Moscow , Russian Federation; 3Plague Control Center, Moscow, Russian Federation
The trend of morbidity reduction at an average annual rate of 1.113 % in 2017 (in comparison to 2008) continues. The tendency of intensive monthly cholera incidence growth around the world in 2017 in relation to 2015 and 2016 is established. 25 countries with 70 endemic areas and 11734 imported cases of cholera onto different continents with predominance of interstate carrying of infection in Asia were identified. In Russia in 2008, 2010, 2012 and 2014 cholera importations from India have been registered. V. cholerae O1 biovar El Tor ctxA-tcpA-, ctxA-tcpA+, V. cholerae O139 ctxA- and tcpA- and singular V. cholerae O1 biovar El tor ctxA+tcpA+ strains were isolated from surface water bodies. INDEL typing of 242 V. cholerae O1 strains, isolated from environmental objects (2014-2017), provided the data which confirmed their belonging to common cluster of V. cholerae O1 ctxA-tcpA+. Along with genetic diversity of V. cholerae O1 ctxA-tcpA-, several strains of the same or closely related genotypes in some regions were isolated every year. For the first time ever the algorithm for risk of epidemic process activation assessment in case of cholera in Russia, taking into account the various factors (conditions), their gradation and expert scores, has been developed for the prediction. The forecast for cholera at the global level and in Russia for 2018 is unfavorable.
Key words: cholera, epidemiological situation, importation, endemic areas, V. cholerae O1, V. cholerae O139, forecast.
Conflict of interest: The authors declare no conflict of interest.
Corresponding author: Elza A. Moskvitina, e-mail: [email protected].
Citation: Moskvitina E.A., Tyuleneva E.G., Kruglikov V.D., Titova S.V., Vodop'yanov A.S., Kurilenko M.L., Pakskina N.D., Ivanova S.M., Anisimova G.B., Vodop'yanov S.O., Oleynikov I.P. Cholera: Assessment of Epidemiological Situation on Cholera around the World and in Russia in 2008-2017. Forecast for 2018. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2018; 1:36-43. (In Russian). DOI: 10.21055/0370-1069-2018-1-36-43
Холера продолжает оставаться значимой проблемой для здравоохранения многих стран мира, что, в свою очередь, определяет организацию и проведение, а также выработку приоритетных направлений профилактической деятельности, предусмотренных на международном, региональном и национальном уровнях [3, 38, 45]. При этом мониторинг динамики заболеваемости холерой, а также контаминации хо-
лерными вибрионами 01 и 0139 серогрупп поверхностных водоемов и других объектов окружающей среды, составляет основу эффективных, целенаправленных, превентивных и контрольных противохолерных мероприятий.
Использованы сведения проблемно-ориентированных баз данных «Холера Эль-Тор. Эпидемиологический анализ заболеваемости в мире», «Холера
Эль-Тор. Эпидемиологический анализ заболеваемости в СНГ, России»; «Холерные вибрионы. Россия». Формирование их проводили с использованием сведений из Weekly Epidemiological Record of World Health Organization [11-19], ProMED-mail post [http:// www.promedmail.org] (2017 г.), с сайта http://www. mspp.gouv.ht/site/index.php, Documentation-MSSP, научных публикаций из поисковой системы PubMed.
Проведен анализ данных о выделении холерных вибрионов 01 и 0139 серогрупп из поверхностных водоемов и других объектов окружающей среды (2008-2017 гг.) с учетом информации, поступающей в Референс-центр по мониторингу за холерой из противочумных учреждений, Управлений Роспотребнадзора и ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии» в субъектах Российской Федерации, паспортных данных на штаммы после их окончательной идентификации. Проведено INDEL-типирование 242 штаммов V. cholerae O1, в том числе V. cholerae O1 ctxA-tcpA- (232), V. cholerae O1 ctxA-tcpA+ (10), выделенных в 16-ти регионах России из поверхностных водоемов (2014-2017 гг.), с использованием девяти локусов по методике [2]. Вариабельность оценивали с помощью индекса разнообразия симпсона (diversity index, DI) [47].
Кластерный анализ и построение дендрограммы проводили с использованием авторского программного обеспечения по методу UPGMA и программы MEGA 5 [48].
статистическую обработку данных проводили по Е.Д.Савилову [9]. Текстовый и графический материал оформлен на персональном компьютере под управлением операционной системы MS Microsoft XP Professional и офисного пакета MS Office 2007.
В мире при мониторинге холеры на глобальном уровне установлено, что за период с 2008 по 2017 год зарегистрировано 2441973 больных холерой в 107 странах. Следует отметить, что в 2017 г., по данным ProMed [21], учтено 1215265 больных с подозрением на холеру, в том числе 1007013 в Азии, 205598 в Африке и 2654 в Америке. Основное количество больных с подозрением на холеру выявлено в Азии, в частности в Йемене. По мнению эксперта ВОЗ D.Legros, количество случаев с подозрением на холеру в йемене нельзя точно проверить, и многие из них могут быть острой водянистой диареей, которая имеет аналогичные симптомы и лечение, но вызывается не холерным вибрионом [34]. Выявлена тенденция снижения заболеваемости в 2017 г. (относительно 2008 г.) при среднем ежегодном темпе -1,113 % (рис. 1). Прогноз на 2018 г. по линейной и полиномиальной линиям тренда показал сохраняющуюся тенденцию снижения заболеваемости с коэффициентами достоверности аппроксимации R2=1 и R2=0,11798 соответственно.
В структуре мировой заболеваемости наибольший удельный вес больных холерой приходится на Африканский континент - 54,7 % (1335665 больных), на Американском континенте он составил 34,81 % (850021), в Азии - 9,97 % (243567), Европе -0,01 % (226), Австралии с Океанией - 0,51 % (12494).
Показатели летальности в мире: 2008 г. - 3,06 %,
2015 г.- 0,76 %, 2017 г. - 3,06 %.
Установлено продолжение эпидемий и вспышек с переходом их с декабря на январь в 2016, 2017 и 2018 гг. в странах Карибского бассейна (Гаити), на Африканском континенте (Нигерия, Танзания, Демократическая Республика Конго (ДРК), Замбия, Малави), в Азии (Йемен).
при сравнительном анализе помесячной заболеваемости за 2015-2017 гг. установлено, что если в 2015 г. сезонные подъемы холеры имели место в январе (0,221 %000), мае (0,227) и октябре (0,204), а в
2016 г. в августе (0,553 %000), октябре (0,254) и ноябре (0,194), то в 2017 г. выявлены подъемы в апреле (0,685 %000), мае (0,615), июне (0,439), июле (0,522) и октябре (0,468) при среднемесячных показателях - 0,149, 0,188 и 0,333 %000 соответственно [20]. Приведенные данные свидетельствуют о тенденции роста интенсивных помесячных показателей заболеваемости холерой в мире, существовании различных эпидемиологических рисков, влияющих на активизацию эпидемического процесса, в том числе в различные сезоны года.
С 2008 по 2017 год выявлено 25 стран с 70 эндемичными территориями (на уровне штатов, провинций и других административных территорий), где холеру регистрировали без заносов извне три года и более: в Азии (Индия, Бангладеш, Непал, Пакистан, Малайзия и Вьетнам, 9 пораженных административных территорий); в Африке (Зимбабве, Кения, Замбия, Сомали, Уганда, Мозамбик, Нигерия, Камерун, Южный Судан, Танзания, Гана, Либерия, Ангола, дрК, Нигер, Малави, 45 пораженных территорий); в странах Карибского Бассейна (Гаити, доминиканская республика и Куба, 16 пораженных территорий). При этом формирование новых эндемичных территорий в 2017 г. имело место в странах Африканского континента (Кения, Танзания, Малави, ДРК, Южный Судан), что указывает на продолжающееся, характерное для пандемии, распространение холеры с вовлечением новых территорий и опреде-
12,000 т-
о
А
г—
8 ю,ооо --
сз
2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 Годы
Рис. 1. Динамика заболеваемости холерой в мире. 20082017 гг.:
1 - линейная линия тренда с аппроксимацией ^2=1) и сглаживанием;
2 - полиномиальная линия тренда с аппроксимацией ^2=0,1798) и сглаживанием
ляет неблагоприятный прогноз по холере.
Эпидемиологическая обстановка усугублялась межконтинентальными и межгосударственными заносами холеры вследствие миграции населения -одного из основных эпидемиологических рисков, который при активизации эпидемического процесса определяет генез (завозное происхождение) и оказывает существенное влияние на интенсивность заболеваемости при ЧС различного происхождения. За последнее десятилетие в мире зарегистрировано 11734 импортированных случаев холеры, в том числе в Азии - 11228 (70,8 %), на Американском континенте - 249 (14,4 %), в Европе - 188 (10,8 %), Африке - 66 (3,8 %) и Австралии с Океанией - 3 (0,2 %). В 2008-2017 гг. имели место межконтинентальные заносы: из Азии в Европу (Великобритания, Дания, Финляндия, Франция, Германия, Швеция, Швейцария, Бельгия, Россия, Чехия); из стран Карибского Бассейна в Европу (Великобритания, Испания, Италия, Германия, Нидерланды), в страны Северной Америки (США и Канада), Центральной (Мексика) и Южной (Венесуэла); межгосударственные заносы: в странах Карибского бассейна - из Гаити, Доминиканской Республики и Кубы в Пуэрто-Рико, Сент-Мартин, Мартинику, на Багамские острова; в Азии - из Филиппин в Южную Корею, из Ирака в Сирию, Оман, Кувейт и Бахрейн, из Бангладеш в Оман и Индию, из Йемена в Саудовскую Аравию; в Африке - из Нигерии в Камерун и Танзанию, из танзании в Бурунди, из Эфиопии и Южного Судана в Судан, из Южного Судана, ДРК и Бурунди в Уганду, из Центрально-Африканской Республики в ДРК; из Мозамбика в Малави, из ДРК в Бурунди [4, 23, 32].
Эпидемии и вспышки на всех континентах в последнее десятилетие вызваны V. с^1егае 01 биовара Эль Тор, сероваров Огава и Инаба, продуцирующими холерный токсин классического типа и содержащими в основном аллели гена В-субъединицы холерного токсина е£х:В1, с^В7 и др. M.M.Das et а1. (2016) отметили, что при фенотипическом и генетическом тестировании штаммов V. ^о1егае 01, выделенных в Сильвасе (Индия) [39] в 2012-2014 гг., наряду с про-тотипными штаммами Эль Тор, выявлен один прото-типный штамм V. ^о1егае 01 классического биовара. При молекулярном типировании методом MLVA штаммов V. ^о1егае 01, обусловивших вспышки холеры в Иране (2012-2013 гг.), среди 30 изученных штаммов один штамм принадлежал к классическому биовару [46]. Вспышки и спорадические случаи холеры Бенгал периодически имели место в Индии и Китае [17, 40, 41].
В Азии сохранится тенденция роста заболеваемости в 2017 г. при среднем ежегодном темпе 6,595 % . Прогноз на 2018 г. по линейной, логарифмической и экспоненциальной линиям тренда - рост заболеваемости с коэффициентами достоверности аппроксимации R2=1, R2=0,1944 и R2=0,2565 соответственно. Число пораженных холерой стран, в том числе с заносами, составило 29. Наибольшее число больных холерой имело место в Афганистане - 45481
и 58064 (2014 и 2015 гг.), Ираке - 4693 и 4965 (2012 и 2015 гг.), Индии - 1171, 6008 и 4031J2012-2014 гг.), на Филиппинах - 4547 (2014 г.) и в Йемене - 31789, 10184 и 20466 (2011, 2016 и 2017 гг.). Необходимо отметить, что в Йемене в 2016 и 2017 гг. ЧС, способствующей активизации и интенсивным проявлениям эпидемического процесса, являлся внутренний военный конфликт и, как следствие, миграция населения внутри страны и за ее пределы с распространением инфекции, разрушенная инфраструктура, нерегулярный доступ к доброкачественной воде, нехватка медицинского персонала и медикаментов [21, 27, 31, 37]. ВОЗ классифицирует ситуацию в Йемене как тяжелейшую ЧС в мире наряду с Сирией, Южным Суданом, Нигерией и Ираком [26].
Фактором, способствующим активизации эпидемического процесса в Индии (штат одиша) в
2017 г. являлось употребление населением контами-нированной холерными вибрионами воды, использованной для приготовления национального напитка «Pana» [25]. Имел место занос холеры из Западной Бенгалии [35]. Летальность - от 0,05 % (2015 г.) до 10,42 % (2017 г.).
Сравнительный анализ полногеномных сиквен-сов штаммов V. cholerae О1, выделенных от больных холерой в Калькутте и других регионах Индии в период 2007-2014 гг., показал их принадлежность к третьей волне седьмой пандемии. Установлена гетерогенность острова пандемичности VSP-II и гена субъединицы B холерного токсина (ctxB), а также наличие нескольких филогенетических линий и под-линий, сменивших друг друга с 2007 по 2014 год. По мнению D.Imamura et al. (2017 г.) [42], учитывая, что V. cholerae о1 во всех пандемиях распространяются из Бенгальского залива, высока вероятность распространения новых геновариантов с VSP-II и аллелью гена ctxB за пределы этого региона.
На Африканском континенте, наиболее затронутом во время текущей пандемии, выявлена тенденция снижения заболеваемости в 2017 г. (относительно 2008 г.) при среднем ежегодном темпе -0,052 %. Холера зарегистрирована в 45 странах. Прогноз на
2018 г. по линейной, степенной и экспоненциальной линиям тренда - снижение заболеваемости с коэффициентами достоверности аппроксимации R2=1, R2=0,3138 и R2=0,2231 соответственно. При этом необходимо отметить, что показатель заболеваемости в 2017 г. (26,441 %00й) находится практически на уровне 2008 г. (26,580 %000). Наиболее высокие показатели заболеваемости холерой отмечены в Зимбабве -60055 больных (2008 г.), Анголе - 10511 (2008 г.), Эфиопии - 31509 (2009 г.), Мозамбике - 19679 (2009 г.), Камеруне - 22433 (2011 г.), Сомали - 77636 (2011 г.), ДРК - 33661 (2012 г.), Южном Судане -6421 (2014 г.), Нигерии - 35996 (2014 г.), Кении -13291 (2015 г.) и Танзании - 13694 (2016 г.).
В 2017 г. зарегистрированы высокие показатели заболеваемости холерой в Северном (Судан -18773 больных, Южный Судан - 14452), Западном (Нигерия - 7726), Центральном (ДРК - 39090) и
Восточном (Сомали - 78784, Эфиопия - 26966) регионах Африки. Активизация эпидемического процесса и его последующие проявления обусловлены ЧС социального характера (военно-политические конфликты, войны), которые повлекли за собой миграцию населения с внутригосударственными заносами в Южном Судане [22, 30], ДРК, [22], Сомали [24], Нигерии [33]. Ситуация осложнялась ЧС, способствующими также активизации эпидемического процесса за счет природных условий, таких как засуха в Эфиопии, Сомали и ДРК [22, 29, 36], длительные проливные дожди (нигерия, Судан и Южный Судан [28, 32, 33]). Летальность варьировала - в 2008 г. составила 3,2 %, в 2015 г. 1,3 %, а в 2017 г. 2,4 %.
Учитывая, что возбудители холеры V. cholerae 01 и V. cholerae 0139 являются системообразующими факторами в возникновении эпидемического процесса, актуальными в этом плане являются исследования по изучению молекулярно-генетических свойств штаммов, циркулирующих на Африканском континенте [41, 43, 44]. Н.Б.Челдышевой с со-авт. (2017 г.) при анализе и изучении молекулярно-генетических свойств штаммов V. cholerae El Tor, циркулирующих на Африканском континенте, показано, что наряду с заносами в Зимбабве (2003 г.), ЮАР (2009 г.) и Камерун (2010 г.) генетически измененных вариантов V. cholerae El Tor с большим числом SNPs, с новой аллелью гена ctxB (ctxB7) из Азии со второй и третьей волной пандемии, на территории Замбии, Кении и Танзании, расположенных в районе Великих Африканских озер, где сформировались вторичные эндемичные очаги, штаммы являлись геновариантами, но вошли в самостоятельный кластер. Безусловный интерес представляют данные Fr.-X.Weill et al. (2017 г.) [50] по анализу геномов 651 штамма V. cholerae El Tor, выделенного в период седьмой пандемии, их пространственно-временному распространению в Африке с учетом неоднократных межконтинентальных (из Азии) и внутригосударственных заносов [10].
В Америке. Холера выявлена в 14 странах Карибского бассейна, Центральной, Южной и Северной Америки.
В страны Карибского бассейна. В Гаити и Доминиканской Республике в 2017 г. продолжалось снижение уровня заболеваемости холерой (относительно 2010 и 2011 гг.), на Кубе и в других странах холера не выявлена.
В Республике Гаити. По данным Министерства здравоохранения и народонаселения Республики Гаити (Ministère de la Santé Publique et de la Population (MSPP), с 18.10.2010 г. (начало эпидемии) по 30.12.2017 г. в стране зарегистрировано 816000 больных холерой, 9748 смерти; летальность от 0,91 % (2016 г.) до 2,43 % (2010 г.), в 2017 г. - 0,98 %. Выявлена тенденция снижения заболеваемости холерой в 2017 г. (относительно 2010 г.) при среднем ежегодном темпе -30,763 %.
Центральная Америка. В Мексике зарегистрированы больные холерой в 2008 г. (1 больной), в
2010-2012 гг. (1, 1, 2). В 2013 г. имела место вспышка с 187 больными холерой, в 2014 г. выявлено 14 больных, в 2015 г. - 1.
Южная Америка. Зарегистрировано 64 больных холерой, в том числе в Бразилии - 1 (2011 г.), Венесуэле - 49 и 4 (2011 и 2013 гг.), Парагвае - 5 (2009 г.), Чили - 1, 2 и 1 (2011, 2013 и 2014 гг.).
Северная Америка. С 2008 по 2017 год импортировано в США 118 и в Канаду 20 заносов холеры без распространения возбудителя инфекции.
В Европе. Заносы холеры имели место в Великобританию (2008-2016 гг.), Францию (2008-2009, 2011 г., 2014-2015 г.), Испанию (2008, 2013, 2015 гг.), Финляндию (2008 г.), Данию (2008, 2016 гг.), Нидерланды (2008, 2013, 2016 гг.), Германию (2010, 2011, 2013-2016 гг.), Швецию (2011, 2015 гг.), Украину (2011, 2016 гг.), Италию (2013 г.), Норвегию (2015 г.), Швейцарию (2015 г.) и Чехию (2017 г.). В 2016-2017 гг. в Мелитополе и Запорожье (Украина), выявлено по два больных холерой с выделением не-токсигенных (авирулентных) штаммов V. с^1егае 01 серовара Огава [49]. Распространения инфекции, кроме Украины (2011 г.), в странах Европы не отмечалось.
В Австралии и Океании. За анализируемый период зарегистрированы крупные вспышки холеры в Папуа-Новая Гвинея - 1957 случаев холеры (2009 г.), 8997 (2010 г.) и 1535 (2011 г.). Имели место заносы в Австралию (2010-2014 и 2016 гг.) без распространения возбудителя инфекции.
В странах СНГ. В ноябре 2017 г. отмечено два случая завоза холеры в Казахстан из Индии. В середине августа 2017 г. на сайте Министерства здравоохранения Украины было опубликовано сообщение о холере. Подтверждено четыре случая заболевания в Запорожье.
В России. Эпидемические проявления по холере (2008-2017 гг.) характеризовались заносами инфекции российскими гражданами, возвратившимися из Индии в Башкортостан (2008 г.) и Москву (2010, 2012, 2014 гг.), без последующего распространения возбудителя инфекции.
В этот период установлена в 29 субъектах контаминация V. сЫ1егае О1 и V. сЫ1егае О139 серогрупп поверхностных водоемов, используемых в качестве источников водоснабжения и водопользования. Из объектов окружающей среды изолирован 741 штамм V. сЫ1егае 01 биовара Эль Тор, в том числе V. сЫ1-егае с^А+^рА+- 10 (Республика Крым - 8 штаммов (2010 г.), Ростовская область - 2 (2011 и 2014 гг.), V. сЫ1егае с£хА^ерА+ - 33, V. сЫ1егае с£хА-^рА- -692 и V. с^1егае 0139 сГхА'ГерА- - 6.
определена продолжительность выделения V. сЫ1егае 01 и V. сЫ1егае 0139 из поверхностных водоемов за анализируемый период с использованием индекса продолжительности выделения холерных вибрионов из поверхностных водоемов (ИПХВ), равному отношению продолжительности мониторинга холеры объектов окружающей среды (в годах) с выявленной контаминацией холерными вибрио-
нами к продолжительности мониторинга (в годах). Для оценки продолжительности выделения холерных вибрионов проведено ранжирование рассчитанных значений ИПХВ, с учетом которых выделены группы административных районов с низкими (0,1-0,2), повышенными (0,3-0,5) и высокими (0,6-1,0) значениями показателей, соответствующим периодическим (или ежегодным) выделениям холерных вибрионов в течение 1-2, 3-5 и 6-10 лет. Установлена ежегодная, в течение 7-10 лет, контаминация холерными вибрионами поверхностных водоемов в шести (20,7 %) субъектах (Республики Калмыкия и Крым, Ростовская и Иркутская области, Забайкальский и Приморский края) со значениями показателей ИПХВ - 0,7-1,0. Это свидетельствует о наличии эколого-гигиенических условий, которые можно рассматривать как потенциальные эпидемиологические риски или предпосылки в активизации эпидемического процесса при острых кишечных инфекциях, в том числе холеры, с реализацией водного пути распространения возбудителей. Периодическое выделение холерных вибрионов в течение 3-5 лет выявлено в семи (24,1 %) субъектах (Республике Коми, Москве, Республике Татарстан, Челябинской области, Алтайском крае, Свердловской области и Республике Алтай) со значениями показателей - 0,3-0,5. В 16 (55,2 %) субъектах холерные вибрионы изолировали 1-2 года, значение показателей - 0,1-0,2 (Архангельская, Вологодская, Калининградская, Псковская, Кировская, Рязанская, Липецкая, Астраханская, Кемеровская, Новосибирская, Тюменская области, Санкт-Петербург, Краснодарский, ставропольский и Хабаровский края, Республика Саха (Якутия)).
На основе проведенного INDEL-типирования 242 штамма V. с^1егае 01 распределились между 34 генотипами, которые по результатам кластерного анализа сгруппировались в восемь кластеров, обозначенных буквами от «А» до «Н». Необходимо отметить, что кластер G представлен исключительно штаммами V. сЫ1егае 01 с£хА^ерА+. Это подтверждает ранее полученные данные, что штаммы V. ^о1е-гае 01 с1хА^срА+ составляют отдельный кластер, четко дискриминирующийся от штаммов V. с^1егае 01 с£сА-^рА- [1]. При изучении выделенных на разных территориях штаммов V. сЫ1егае 01 с^сА^срА-получены данные, свидетельствующие об их вариабельности. Так, для штаммов, изолированных из водных объектов в Ростовской области, Республике Калмыкия и Приморском крае, характерно высокое генетическое разнообразие при принадлежности к различным кластерам: А4, В3, Е1, F4,5, G3; А1-5,В4,5-8, С1, D1, F1-5,G2, Н1 и А4,А6, В2, С4 соответственно (рис. 2). Вместе с тем, в некоторых регионах циркулируют штаммы, принадлежащие преимущественно к одному кластеру. Например, все штаммы, изолированные в забайкальском крае, относились к кластеру А (два близкородственных генотипа А5 и А6), в Республике Крым - к кластеру Е. Отмечены факты выделения в течение 2-3 лет V. ^о1егае 01 с1хА-1срА- одних и тех же генотипов в Забайкальском
Регион Вариаб. Год Генотипы
Забайкальский край 0.04 2014 А6
2015 А5
2016 А5
2017 А5
Иркутская область 0.62 2014 А6
2015 А5
2017 А4 А5 Е2
Калининградская область 0 2014 А6
Краснодарский край 0 2015 Е2
Приморский край 0.69 2014 А6 С4
2016 А4
2017 А4 В2
Псковская область 0 2014 А6
Республики Бурятия 0.5 2016 А5
2017 В1
Республика Калмыкия 0.87 2014 В5 В7 В8 С2 СЗ 01 Е5 Т2 РЗ П Р5 Н1
2015 А4 А5 В8 г2
2016 А2 А4 В4 С1 С2 Р1 РЛ
2017 А1 АЗ А4 А5 В4 В8 С1 П 0,7
Республика Коми 0 2016 С1
Республика Крым 0.37 2014 ЕЗ
2016 Е4
Ростовская область 0.75 2014 Р4
2015 ВЗ СЗ
2016 А4 Я4 а
2017 Е1
Рязанская область 0 2014 А7
Свердловская область 0.48 2016 А4 В6
2017 А4
Татарстан 0 2016 А5
Хабаровский край 0 2016 С1
Челябинская область 0.5 2015 Е2
2016 ГЛ
Рис. 2. Распределение генотипов штаммов V. екоктае 01 по регионам России (2014-2017 гг.)
крае и Иркутской области - А5, Приморском крае, Свердловской области и в Республике Калмыкия -А4. Это может указывать на повышенный потенциал персистенции, в частности, штаммов V. ^о1егае 01 ^А^срА- INDEL-генотипа А, а также на возможность длительной циркуляции холерных вибрионов при наличии благоприятных экологических условий, как рисков, для сохранения вибрионов. В то же время штаммы V. ^о1егае 01 ^А^срА-, выделенные в Иркутске в 2017 г. из р. Ушаковка, имели идентичный INDEL-генотип - Е2, который не встречался ранее на территории Иркутской области и сопредельных регионов, что может свидетельствовать в пользу заносного происхождения штаммов.
Прогноз в России на 2018 г. с учетом эпидемиологической обстановки по холере в мире - неблагоприятный в плане возможных заносов холеры. оценка риска активизации эпидемического процесса при холере (РАЭПХ) в России осуществлена на основе анализа различных факторов (условий) в период эпидемических осложнений холеры (1970-2014 гг.) [5, 6, 7, 8], градации их и экспертной оценки в баллах (таблица).
Конечная оценка риска активизации эпидемического процесса определяется по результирующей сумме всех расчетных данных по формуле:
РАЭПХ = АА1-А3 + В + С + ^1-3 + Е„-2 + F + G + Н
максимально возможная величина риска активизации эпидемического процесса при холере составила 1 балл с градацией: высокий - 0,51-1,0 баллов; повышенный - 0,5-0,3 и низкий - менее 0,3.
Так, при заносах инфекции российскими гражданами, возвратившимися из Индии в Башкортостан (2008 г.) и Москву (2010, 2012, 2014 гг.), без после-
факторы (условия), определяющие риск активизации эпидемического процесса при холере в россии
Факторы (условия) Наименование факторов (условий) Градация факторов (условий), их балльная оценка Максимальный балл
А Заносы холеры (установленные или неустановленные). С распространением - 0,3 Без распространения - 0 Нет - 0 0,3
А1 Недостаточный санитарно-карантинный контроль в пунктах пропуска через государственную границу РФ пассажиров и членов экипажей, прибывающих воздушными, морскими, автомобильными и железнодорожными транспортными средствами. Есть - 0,1, в том числе, с распространением - 0,1, без распространения - 0 Нет - 0 в том числе - 0,1
А2 Отсутствие санитарно-контрольных пунктов пропуска на границе с сопредельными государствами. Есть - 0,1, в том числе, с распространением - 0,1, без распространения - 0 Нет - 0 в том числе - 0,1
А3 Заносы холеры различными транспортными средствами (водным, автомобильным и др.) внутри страны. Есть - 0,1, в том числе, с распространением - 0,1, без распространения - 0 Нет - 0 в том числе - 0,1
В Международная миграции (туризм с коммерческой целью, паломничество и др. виды, в том числе в страны, неблагополучные по холере). Есть - 0,1 Нет - 0 0,1
С Контаминация поверхностных водоемов V. ско1вгав 01 с1хА+1срА+ Есть - 0,15 Нет - 0 0,15
D Реализация водного пути распространения с выделением V. ско1вгав 01 с1хА+1срА+ при: Есть - 0,15 Нет - 0 0,15
употреблении воды централизованной системы хозяйственно-питьевого водоснабжения; Есть - 0,05 Нет - 0 в том числе - 0,05
употреблении воды нецентрализованной системы хозяйственно-питьевого водоснабжения; Есть - 0,05 Нет - 0 в том числе - 0,05
рекреационном водопользовании водоемами. Есть - 0,05 Нет - 0 в том числе - 0,05
Е Реализация других путей распространения возбудителя инфекции: Есть - 0,1 Нет - 0 0,1
Е, алиментарного Есть - 0,05 Нет - 0 в том числе - 0,05
Е2 контактного (контактно-бытового) Есть - 0,05 Нет - 0 в том числе - 0,05
F Отсутствие или неполный комплекс канализационных очистных сооружений, откуда сбрасываются сточные воды в водоемы, которые используются в качестве источников для хозяйственно-питьевых, хозяйственно-бытовых и рекреационных целей. Есть - 0,1 Нет - 0 0,1
G Сброс ливневых сточных вод в водоемы, которые используются для рекреационных целей. Есть - 0,05 Нет - 0 0,05
Н Традиции и обычаи населения (ритуальные обряды при захоронении трупов, поминальная еда). Есть - 0,05 Нет - 0 0,05
дующего распространения возбудителя инфекции риск активизации эпидемического процесса с учетом недостаточного санитарно-карантинного контроля в пунктах пропуска через государственную границу РФ и международной миграции населения низкий, составил 0,25 баллов. Контаминация поверхностных водоемов V. сЫкгае 01 сЪхА+1срА+ в Ростовской области (2011 и 2014 гг.) при неустановленном заносе холеры, наличии сбросов сточных и (или) ливневых сточных вод в водоем, который использовался для рекреационных целей, определили повышенную величину риска активизации эпидемического процесса - 45 баллов.
Необходимо отметить, что приведенные риски, способствующие активизации эпидемического процесса, являются базой для краткосрочного и долгосрочного прогнозирования и разработки целенаправленных программ надзора и профилактики холеры.
Таким образом, прогноз по холере в мире на 2018 г. - неблагоприятный. Об этом свидетельствует мониторинг холеры на глобальном уровне, показавший превалирование интенсивных показателей в динамике заболеваемости и территориальное распро-
странение инфекции, обусловленной геноварианта-ми холерных вибрионов Эль Тор в странах Африки, Азии и Карибского бассейна, где сформировались эндемичные очаги, которые могут стать причиной возникновения эпидемиологических осложнений на этих территориях и обусловить возможность распространения инфекции как внутри страны, так и вывоз ее на другие континенты, что подтверждено событиями последнего десятилетия и седьмой пандемии. Заносы холеры остаются основными эпидемиологическими рисками в распространении холеры на глобальном, региональных и национальных уровнях. Возможность заноса инфекции в Россию является реальной и диктует необходимость обеспечения выполнения в полном объеме мероприятий, предусмотренных действующими СП 3.1.1.2521-09 «Профилактика холеры. Общие требования к эпидемиологическому надзору за холерой в Российской Федерации» и распорядительными документами Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по обеспечению санитарно-эпидемиологического благополучия населения в стране.
конфликт интересов. Авторы подтверждают отсутствие конфликта финансовых/нефинансовых интересов, связанных с написанием статьи.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н., Крутиков В.Д., Архангельская И.В., Зубкова Д.А., Ежова М.И. INDEL- и VNTR-типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных в 2013 году из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Здор. населен. и среда обит. 2015; 5(266): 41-4.
2. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н. INDEL-типирование штаммов Vibrio cholerae. Эпидемиол. и инф. бол. 2017; 4(22):195-200.
3. Международные медико-санитарные правила (2005 г). Всемирная организация здравоохранения. Женева; 2006. 79 с.
4. Москвитина Э.А., Тюленева Е.Г., Самородова А.В., Крутиков В.Д., Титова С.В. Эпидемиологическая обстановка по холере в мире и России в 2007-2016 гг., прогноз на 2017 г Пробл. особо опасных инф. 2017; 1:13-20. DOI: 10.21055/03701069-2017-1-13-20.
5. Онищенко Г.Г., Беляев Е.Н., Москвитина Э.А., Резайкин
B.И., Ломов Ю.М., Мединский Г.М. Холера в Дагестане: прошлое и настоящее. Ростов-на-Дону: Изд-во «Полиграф»; 1995. 120 с.
6. Онищенко Г.Г., Москвитина Э.А., Крутиков В.Д., Титова С.В., Адаменко О.Л., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О. Эпидемиологический надзор за холерой в России в период седьмой пандемии. Вест. Рос. акад. мед. наук. 2015; 70(2):249-56.
7. Покровский В.И., Онищенко Г.Г. Актуальные проблемы холеры. М.: ТОУ ВУНМЦ МЗ РФ; 2000. 384с.
8. Покровский В.И., редактор. Холера в СССР в период седьмой пандемии. М.: Медицина; 2000. 472 с.
9. Савилов Е.Д., Мамонтова Л.М., Астафьев В.А., Жданова
C.Н. Применение статистических методов в эпидемиологическом анализе. М.: МЕДпресс-информ; 2004. 112 с.
10. Челдышова Н.Б., Смирнова Н.И., Заднова С.П., Краснов Я.М., Крицкий А.А. Буаро М.И. Молекулярно-генетические свойства штаммов Vibrio Ло1егае биовара Эль Тор, циркулирующих на Африканском континенте. Мол. генет., микробиол. и вир/усол. 2017; 1:12-9.
11. Cholera: global surveillance summary, 2008. Wkly Epidem. Rec. 2009; 84(31):309-2.
12. Cholera, 2009. Wkly Epidem. Rec. 2010; 85(31):293-308.
13. Cholera, 2010. Wkly Epidem. Rec. 2011; 86(31):325-40.
14. Cholera, 2011. Wkly Epidem. Rec. 2012; 87(31):289-304.
15. Cholera, 2012. Wkly Epidem. Rec. 2013; 88(31):321-6.
16. Cholera, 2013. Wkly Epidem. Rec. 2014; 89(31):345-56.
17. Cholera, 2014. Wkly Epidem. Rec. 2015; 90(40):517-29.
18. Cholera, 2015. Wkly Epidem. Rec. 2016; 91(38):433-440.
19. Cholera, 2016. Wkly Epidem. Rec. 2017; 92(36):521-536.
20. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (01-137): ASIA (YEMEN) [Internet]. 29 Dec 2016 - 25 Dec 2017. Archive Number: 20170105.4742075-20171227.5523714. Available from: http://www. promedmail.org.
21. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (1): Asia (YEMEN) WHO [Internet]. 1 Jan 2017. Archive Number: 20170105.4742075. Available from: http://www.promedmail.org.
22. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (9): Africa [Internet]. 13 Mar 2017. Archive Number: 20170313.4898254. Available from: http://www.promedmail.org.
23. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (11): Africa, Asia [Internet]. 2 Apr 2017. Archive Number: 20170402.4942849. Available from: http://www.promedmail.org.
24. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (20): Africa, Americas [Internet]. 5 May 2017.ArchiveNumber: 20170505.5015480 Available from: http://www.promedmail.org.
25. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (24): Africa, Asia [Internet]. 10 May 2017. Archive Number: 20170510.5026111. Available from: http://www.promedmail.org.
26. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (29): Asia (YEMEN) [Internet]. 17 May 2017. Archive Number: 20170517.5043339. Available from: http://www.promedmail.org.
27. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (44): Asia (YEMEN) [Internet]. 3 Jun 2017. Archive NumW: 20170603.5081754. Available from: http://www.promedmail.org.
28. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (76): Africa [Internet]. 27 Jul 2017. Archive Number: 20170727.5209397 Available from: http://www.promedmail.org.
29. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (78): Africa [Internet]. 30 Jul 2017. Archive Number: 20170730.5215414. Available from: http://www.promedmail.org.
30. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (82): Africa [Internet]. 9 Aug 2017. Archive Number: 20170809.5238710. Available from: http://www.promedmail.org.
31. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (92): Saudi Arabia
(Jizan) expatriates, request for information [Internet]. 1 Sep 2017. Archive Number: 20170901.5289839. Available from: http://www. promedmail.org.
32. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (95): Africa, Asia [Internet]. 6 Sep 2017. Archive Number: 20170906.5296768. Available from: http://www.promedmail.org.
33. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (98): Africa, Asia [Internet]. 14 Sep 2017. Archive Number: 20170914.5300906. Available from: http://www.promedmail.org.
34. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (100): ASIA (YEMEN) [Internet]. 18 Sep. 2017. Archive Number: 20170919.5326212. Available from: http://www.promedmail.org. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (107): Africa [Internet]. 1 Oct 2017. Archive Number: 20171001.5349664. Available from: http://www.promedmail.org.
35. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (118): Africa, Asia [Internet]. 15 Oct 2017. Archive Number: 20171015.5376068. Available from: http://www.promedmail.org.
36. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (125): Africa [Internet]. 31 Oct 2017. Archive Number: 20171031.5416115. Available from: http://www.promedmail.org.
37. Cholera,Diarrhea &DysenteryUpdate(137):Asia(YEMEN) [Internet]. 27 Dec 2017. Archive Number: 20171227.5523714. Available from: http://www.promedmail.org.
38. Cholera Prevention, Control and Elimination. A Policy Brief by the initiative against Diarrheal and Enteric Diseases in Asia. (Cited 12 May 2016). http://www.idea-asia.info/index.php/component/searc h/?searchword=policy+brief&ordering=&searchphrase=all.
39. Das M.M., Bhotra T., Zala D., Singh D.V. Phenotypic and genetic characteristics of Vibrio cholerae O1 carrying Haitian ctxB and attributes of classical and El Tor biotypes isolated from Silvassa, India. J. Med. Microbiol. 2016; 65(8):720-8.
40. Fazil M.H., Bhanumathi R., Pandey H.P., Singh D.V. Characterization of Vibrio cholerae O139 belonging to multiple ri-botypes and isolated from diarrhoeal patients in Kerala, southern India. Infect. Genet. Evol. 2011 Mar;11(2):454-9. DOI: 10.1016/j. meegid.2010.12.008.
41. Garrine M., Mandomando I., Vubil D., Nhampossa T., Acacio S., Li S., Paulson J.N., Almeida M., Thomson N.R., Alonso P., Stine O.C. Minimal genetic change in Vibrio cholerae in Mozambique over time: Multilocus variable number tandem repeat analysis and whole genome sequencing. PloS Negl. Trop Dis. 2017; 11(6):e0005671. DOI: 10.1371/journal.pntd.0005671.
42. Imamura D., Morita M., Sekizuka T., Mizuno T Takemura T., Yamashiro T., Chowdhury G., Pazhani G.P., Mukhopadhyay A.K., Ramamurthy T., Miyoshi S.I., Kuroda M., Shinoda S. Comparative genome analysis of VSP-II and SNPs reveals heterogenic variation in contemporary strains of Vibrio cholerae O1 isolatedfrom cholera patients in Kolkata, India. PLoSNegl. Trop. Dis. 2017; 11(2):e0005386. DOI: 10.1371/journal.pntd.0005386.
43. Kachwamba Y., Mohammed A.A., Lukupulo H., Urio L., Majigo M., Mosha F., Matonya M., Kishimba R., Mghamba J., Lusekelo J., Nyanga S., Almeida M., Li S., Domman D., Massele S.Y., Stine O.C. Genetic characterization of Vibrio cholerae O1 isolates from outbreaks between 2011 and 2015 in Tanzania. BMC Infect. Dis. 2017; 17(1):157. DOI: 10.1186/s12879-017-2252-9.
44. Ngwa M.C., Masalla T., Esemu S., Fumoloh F.F., Kracalik I., Cella E., Alam M.T., Akoachere J., Liang S., Salemi M., Morris J.G., Ali A., Ndip L.M. Genetic studies of Vibrio cholerae in South West Cameroon - A phylogenetic analysis of isolates from the 2010-2011 epidemic. PLOS Currents Outbreaks. 2016 Aug 12. Edition 1. DOI: 10.1371/currents.outbreaks.13b4e5e36a5c0831a1663fbdb5713fe9.
45. Pena E.S., Bwire G., Dzotsi E., Bonnet M.C., Hessel L. New momentum in prevention, control and elimination of cholera in Africa: priority actions identified by affected countries. Weekly Epidemiol. Rec. 2016; 91(24):305-14.
46. Ranjbar R., Sadeghy J., Shokri Moghadam M., Bakhshi B. Multi-locus variable number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae isolates from 2012 to 2013 cholera outbreaks in Iran. Microb. Pathog. 2016; 97:84-8.
47. Simpson E.H. Measurement of diversity. Nature (London). 1949; 163(148):668
48. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28:2731-9. DOI: 10.1093/ molbev/msr121.
49. URL: http://www.dsesu.gov.ua/ua/dses-ua/novyny/item/ 2175-vypadok-zakhvoriuvannia-na-kholeru-u-melitopoli? (Дата обращения 27.07.2016 г.).
50. Weill Fr.-X., Domman D., Njamkepo E., Tarr C., Rauzier J., Fawal N., Keddy K.H., Salje H., Moore S., Mukhopadhyay A.K., Bercion R., Luquero, F.J., Ngandjio A., Dosso M., Monakhova E., Garin B., Bouchier C., Pazzani C., Mutreja A., Grunow R Sidikou F., Bonte L., Breurec S., Damian M., Njanpop-Lafourcade B.-M., Sapriel G., Page A.-L., Hamze M., Henkens M., Chowdhury G., Menge M., Koeck J.-L., Fournier J.-M., Dougan G., Patrick A.D., Grimont, Parkhill J., Holt K.E., Piarroux R., Ramamurthy Th., Quilici M.-L., Thomson N.R. Genomic history of the seventh pan-
demic of cholera in Africa. Sciense. 2017; 358:785-9. DOI: 10.1126/ science.aad5901.
References
1. Vodop'yanov A.S., Vodop'yanov S.O., Oleynikov I.P., Mishan'kin B.N., Kruglikov V.D., Arkhangelskaya I.V., Zubkova D.A., Ezhova M.I. [INDEL- and VNTR-typing of Vibrio cholerae strains, isolated in 2013 from environmental objects in the territory of the Russian Federation]. Zdor. Naselen. Sreda Obit. 20l5; 5(266):41-4.
2. Vodop'yanov A.S., Vodop'yanov S.O., Oleynikov I.P., Mishan'kin B.N. [INDEL-typing of Vibrio cholerae strains]. Epidemiol. Infek. Bol. 2017; 4(22): 195-200.
3. [International Health Regulations (2005)]. World Health Organization. Geneva; 2006. 79 p.
4. Moskvitina E.A., Tyuleneva E.G., Samorodova A.V., Kruglikov V.D., Titova S.V., Ivanova S.M., Kovaleva T.V., Anisimova G.B. Epidemiological Situation on Cholera across the Globe and in the Russian Federation in 20072016. Forecast for 2017]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2017, 1:13-20. DOI: 10.21055/0370-1069-2017-1-13-20.
5. Onishchenko G.G., Belyaev E.N., Moskvitina E.A., Rezaikin V.I., Lomov Yu.M., Medinsky G.M. [Cholera in Dagestan: Past and Present]. Rostov-on-Don: "Poligrafist"; 1995. 120 p.
6. Onishchenko G.G., Moskvitina E.A., Kruglikov V.D., Titova S.V., Adamenko O.L., Vodop'yanov A.S., Vodop'yanov S.O. [Epidemiological surveillance over cholera in Russia during the seventh pandemic]. Bulletin of the Russian Academy of Medical Sciences. 2015; 70(2):249-56.
7. Pokrovsky V.I., Onishchenko G.G. [Relevant Problems of Cholera]. M.; 2000. 384 p.
8. Pokrovsky V.I., editor. [Cholera in USSR during the Seventh Pandemic]. M.: "Meditsina". 2000. 472 p.
9. Savilov E.D., Mamontova L.M., Astaf'ev V.A., Zhdanova S.N. [Application of Statistical Methods in Epidemiological Analysis]. M.: "MEDpress-infrom"; 2004. 112p.
10. Cheldyshova N.B., Smirnova N.I., Zadnova S.P., Krasnov Ya. M., Kritsky A.A., Boiro M.I. [Molecular-genetic properties of Vibrio cholerae strains biovar El Tor, circulating on the African continent]. Mol. Genet. Mikrobiol. Virusol. 2017; 1:12-9.
11. Cholera: global surveillance summary, 2008. Wkly Epidem. Rec. 2009; 84(31):309-2.
12. Cholera, 2009. Wkly Epidem. Rec. 2010; 85(31):293-308.
13. Cholera, 2010. Wkly Epidem. Rec. 2011; 86(31):325-40.
14. Cholera, 2011. Wkly Epidem. Rec. 2012; 87(31):289-304.
15. Cholera, 2012. Wkly Epidem. Rec. 2013; 88(31):321-6.
16. Cholera, 2013. Wkly Epidem. Rec. 2014; 89(31):345-56.
17. Cholera, 2014. Wkly Epidem. Rec. 2015; 90(40):517-29.
18. Cholera, 2015. Wkly Epidem. Rec. 2016; 91(38):433-440.
19. Cholera, 2016. Wkly Epidem. Rec. 2017; 92(36J:521-536.
20. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (01-137): ASIA (YEMEN) [Internet]. 29 Dec 2016 - 25 Dec 2017. Archive Number: 20170105.474207520171227.5523714. Available from: http://www.promedmail.org.
21. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (1): Asia (YEMEN) WHO [Internet]. 1 Jan 2017. Archive Number: 20170105.4742075. Available from: http://www.promedmail.org.
22. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (9): Africa [Internet]. 13 Mar 2017. Archive Number: 20170313.4898254. Available from: http://www. promedmail.org.
23. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (11): Africa, Asia [Internet]. 2 Apr 2017. Archive Number: 20170402.4942849. Available from: http:// www.promedmail.org.
24. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (20): Africa, Americas [Internet]. 5 May 2017. Archive Number: 20170505.5015480 Available from: http://www.promedmail.org.
25. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (24): Africa, Asia [Internet]. 10 May 2017. Archive Number: 20170510.5026111. Available from: http:// www.promedmail.org.
26. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (29): Asia (YEMEN) [Internet]. 17 May 2017. Archive Number: 20170517.5043339. Available from: http://www.promedmail.org.
27. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (44): Asia (YEMEN) [Internet]. 3 Jun 2017. Archive Number: 20170603.5081754. Available from: http://www.promedmail.org.
28. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (76): Africa [Internet]. 27 Jul 2017. Archive Number: 20170727.5209397 Available from: http://www. promedmail.org.
29. Ch olera, Diarrhea & Dysentery Update (78): Africa [Internet]. 30 Jul 2017. Archive Number: 20170730.5215414. Available from: http://www. promedmail.org.
30. Ch olera, Diarrhea & Dysentery Update (82): Africa [Internet]. 9 Aug 2017. Archive Number: 20170809.5238710. Available from: http:// www.promedmail.org.
31. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (92): Saudi Arabia (Jizan) expatriates, request for information [Internet]. 1 Sep 2017. Archive Number: 20170901.5289839. Available from:http://www.promedmail.org.
32. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (95): Africa, Asia [Internet]. 6 Sep 2017. Archive Number: 20170906.5296768. Available from: http:// www.promedmail.org.
33. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (98): Africa, Asia [Internet]. 14 Sep 2017. Archive Number: 20170914.5300906. Available from: http:// www.promedmail.org.
34. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (100): ASIA (YEMEN) [Internet]. 18 Sep. 2017. Archive Number: 20170919.5326212. Available from: http://www.promedmail.org.Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (107): Africa [Internet]. 1 Oct 2017. Archive Number: 20171001.5349664. Available from: http://www.promedmail.org.
35. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (118): Africa, Asia [Internet]. 15 Oct 2017. Archive Number: 20171015.5376068. Available from: http://www.promedmail.org.
36. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (125): Africa [Internet]. 31 Oct 2017. Archive Number: 20171031.5416115. Available from: http://www. promedmail.org.
37. Cholera, Diarrhea & Dysentery Update (137): Asia (YEMEN) [Internet]. 27 Dec 2017. Archive Number: 20171227.5523714. Available from: http://www.promedmail.org.
38. Cholera Prevention, Control and Elimination. A Policy Brief by the initiative against Diarrheal and Enteric Diseases in Asia. (Cited 12 May 2016). http://www.idea-asia.info/index.php/component/search/?searchword= policy+brief&ordering=&searchphrase=all.
39. Das M.M., Bhotra T., Zala D., Singh D.V. Phenotypic and genetic characteristics of Vibrio cholerae O1 carrying Haitian ctxB and attributes of classical and El Tor biotypes isolated from Silvassa, India. J. Med. Microbiol. 2016; 65(8):720-8.
40. Fazil M.H., Bhanumathi R., Pandey H.P., Singh D.V. Characterization of Vibrio cholerae O139 belonging to multiple ribotypes and isolated from diarrhoeal patients in Kerala, southern India. Infect. Genet. Evol. 2011 Mar;11(2):454-9. DOI: 10.1016/j.meegid.2010.12.008.
41. Garrine M., Mandomando I., Vubil D., Nhampossa T., Acacio S., Li S., Paulson J.N., Almeida M., Thomson N.R., Alonso P., Stine O.C. Minimal genetic change in Vibrio cholerae in Mozambique over time: Multilocus variable number tandem repeat analysis and whole genome sequencing. PloS Negl. Trop Dis. 2017; 11(6):e0005671. DOI: 10.1371/journal.pntd.0005671.
42. Imamura D., Morita M., Sekizuka T., Mizuno T., Takemura T., Yamashiro T., Chowdhury G., Pazhani G.P., Mukhopadhyay A.K., Ramamurthy T., Miyoshi S.I., Kuroda M., Shinoda S. Comparative genome analysis of VSP-II and SNPs reveals heterogenic variation in contemporary strains of Vibrio cholerae O1 isolated from cholera patients in Kolkata, India. PLoS Negl. Trop. Dis. 2017; 11(2):e0005386. DOI: 10.1371/journal. pntd.0005386.
43. Kachwamba Y., Mohammed A.A., Lukupulo H., Urio L., Majigo M., Mosha F., Matonya M., Kishimba R., Mghamba J., Lusekelo J., Nyanga S., Almeida M., Li S., Domman D., Massele S.Y., Stine O.C. Genetic characterization of Vibrio cholerae O1 isolates from outbreaks between 2011 and 2015 in Tanzania. BMC Infect. Dis. 2017; 17(1):157. DOI: 10.1186/s12879-017-2252-9.
44. Ngwa M.C., Masalla T., Esemu S., Fumoloh F.F., Kracalik I., Cella E., Alam M.T., Akoachere J., Liang S., Salemi M., Morris J.G., Ali A., Ndip L.M. Genetic studies of Vibrio cholerae in South West Cameroon - A phy-logenetic analysis of isolates from the 2010-2011 epidemic. PLOS Currents Outbreaks. 2016 Aug 12. Edition 1. DOI: 10.1371/currents.outbreaks.13b4e5 e36a5c0831a1663fbdb5713fe9.
45. Pena E.S., Bwire G., Dzotsi E., Bonnet M.C., Hessel L. New momentum in prevention, control and elimination of cholera in Africa: priority actions identified by affected countries. Weekly Epidemiol. Rec. 2016; 91(24):305-14.
46. Ranjbar R., Sadeghy J., Shokri Moghadam M., Bakhshi B. Multi-locus variable number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae isolates from 2012 to 2013 cholera outbreaks in Iran. Microb. Pathog. 2016; 97:84-8.
47. Simpson E.H. Measurement of diversity. Nature (London). 1949; 163(148):668
48. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28:2731-9. DOI: 10.1093/molbev/msr121.
49. URL: http://www.dsesu.gov.ua/ua/dses-ua/novyny/item/2175-vy-padok-zakhvoriu vannia-na-kholeru-u- melitopoli? (Cited 27 Jul 2016).
50. Weill Fr.-X., Domman D., Njamkepo E., Tarr C., Rauzier J., Fawal N., Keddy K.H., Salje H., Moore S., Mukhopadhyay A.K., Bercion R., Luquero, F.J., Ngandjio A., Dosso M., Monakhova E., Garin B., Bouchier C., Pazzani C., Mutreja A., Grunow R., Sidikou F., Bonte L., Breurec S., Damian M., Njanpop-Lafourcade B.-M., Sapriel G., Page A.-L., Hamze M., Henkens M., Chowdhury G., Menge M., Koeck J.-L., Fournier J.-M., Dougan G., Patrick A.D., Grimont, Parkhill J., Holt K.E., Piarroux R., Ramamurthy Th., Quilici M.-L., Thomson N.R. Genomic history of the seventh pandemic of cholera in Africa. Sciense. 2017; 358:785-9. DOI: 10.1126/science.aad5901.
Authors:
Moskvitina E.A., Tyuleneva E.G., Kruglikov V.D., Titova S.V., Vodop'yanov A.S., Kurilenko M.L., Anisimova G.B., Vodop'yanov S.O., Oleynikov I.P. Rostov-on-Don Research Anti-Plague Institute. 117/40, M.Gor'kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation. E-mail: [email protected].
Pakskina N.D. Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare. 18, Bld. 5 and 7, Vadkovsky Pereulok, Moscow, 127994, Russian Federation.
Ivanova S.M. Plague Control Center. 4, Musorgskogo St., Moscow, 127490, Russian Federation. E-mail: [email protected].
Об авторах:
Москвитина Э.А., Тюленева Е.Г., Кругликов В.Д., Титова С.В., Водопьянов А.С., Куриленко М.Л., Анисимова Г.Б., Водопьянов С.О., Олейников И.П. Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт. Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40. E-mail: [email protected].
Пакскина Н.Д. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Российская Федерация, 127994, Москва, Вадковский переулок, дом 18, строение 5 и 7.
Иванова С.М. Противочумный центр. Российская Федерация, 127490, Москва, ул. Мусоргского, 4. E-mail: [email protected].
Поступила 23.01.18. Прината к публ. 27.02.18.
