CC BY
29Компьютерная биология, медицина и биотехнология 165
Реконструкция генной сети глиомы с помощью он-лайн инструментов биоинформатики
Ю. Л. Орлов1-2, С. С. Ковалев2,3, Ю. П.Белоусова3, С. А. Цховребова1 1 Первый МГМУ им. И. М. Сеченова Минздрава России 2Новосибирский государственный университет 3Институт цитологии и генетики СО РАН Email: orlov@d-health.institute DOI: 10.24411/9999-017A-2020-10291
С помощью он-лайн инструментов биоинформатики и баз данных медицинской генетики выполнен анализ генов предрасположенности к развитию опухолей мозга, реконструирована генная сеть. На основе анализа базы данных OMIM (omim.org) выявлено 195 генов, которые опосредуют развитие глиомы. Из них инструмент PANTHER-DB определил идентификаторы 163 генов. Оценки значимых категорий генных онтологий показали связь категорий генов глиомы с регуляцией клеточных процессов, метаболизмом, пролиферацией, дифференциацией, нейро- и глиогенезом и с процессами клеточной смерти, апоптозом. С помощью ресурсов STRING-DB и GeneMANIA реконструирована генная сеть глиомы, выявлены гены с наибольшим числом связей сети - PTEN, TP53, CDKN2A, EGFR, GLI1. Рассмотрена трехмерная структура белка GLI1. C помощью базы данных GeneCards были определены лекарства, влияющие на GLI1.
Работа выполнена при финансовой поддержке бюджетного проекта ИЦиГ СО РАН (0324-2019-0040-С-01).
Геоинформационные системы в медицине
Ю. Л. Орлов1,2, Г. С. Лебедев1
1 Первый МГМУ им. И. М. Сеченова Минздрава России 2Новосибирский государственный университет Email: orlov@d-health.institute DOI: 10.24411/9999-017A-2020-10292
Рассмотрены аспекты использования геоинформационной системы в сфере здравоохранения с точки зрения системной биологии. Благодаря появлению современных информационных технологий произошел прорыв в медико-географическом картографировании и моделировании в мире [1, 2]. В практике стали применяться геоинформационные системы, которые позволяют визуализировать географические объекты, процессы и явления, выполнять анализ, планирование и моделирование медицинских задач, в том числе в удаленных регионах Сибири и Крайнего Севера. Разработана геоинформационная система, предназначенная для консолидации и графического отображения информации о ресурсах здравоохранения, медицинских организациях, участвующих в реализации территориальных программ оказания медицинской помощи.
Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (19-15-00219). Список литературы
1. Сомов Э. В., Тимонин С. А. Применение геоинформационных методов в решении задач оптимизации медицинского обслуживания населения г. Москвы // М.: Врач и информационные технологии. 2012. № 2. С. 30-41.
2. Pednekar P, Peterson A. Mapping pharmacy deserts and determining accessibility to community pharmacy services for elderly enrolled in a State Pharmaceutical Assistance Program // PLoS One. 2018. V. 13(6). e0198173.
Численное моделирование эмболизации т-образного микроканала
Д. В. Паршин1,2, А. А. Ягодницына1,3
Новосибирский государственный университет
2Институт гидродинамики имени М. А. Лаврентьева СО РАН
3Институт теплофизики им. С. С. Кутателадзе СО РАН
Email: parshin@hydro.nsc.ru
DOI: 10.24411/9999-017A-2020-10293
Эмболизация кровеносных сосудов широко применяется при лечении аневризм или артерио-ве-нозных мальформаций. Хирург выполняет операцию эмболизации исходя из собственного опыта и от-
