CC BY
40
ВЕСТНИК ПЕРМСКОГО УНИВЕРСИТЕТА
2018 БИОЛОГИЯ Вып. 1
УДК 575.22:577.29
DOI: 10.17072/1994-9952-2018-1-50-56.
Ю. У. Донтa, А. В. Тимароваb, Л. В. Комароваa, С. В. Боронниковаa
a Пермский государственный национальный исследовательский университет, Пермь, Россия
b Филиал НПО «Микроген» «Пермское НПО «Биомед»» в г. Перми, Россия
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ТРЕХ ПОРОД ЛОШАДИ ДОМАШНЕЙ
Изучен генетический полиморфизм тракененской, рысистой и тяжеловозной пород лошади домашней (Equus caballus L., Equidae), как наиболее часто разводимых в Пермском крае. Для определения генетического разнообразия пород E. caballus был использован ISSR-метод анализа полиморфизма ДНК. Выявлено 111 ISSR-PСR маркеров. Определены и проанализированы группы генетических характеристик на уровне пород. Для характеристики генофондов пород E. caballus установлены число молекулярных маркеров, доля полиморфных локусов, ожидаемая гетерозигот-ность, число редких аллелей. Генетическая специфика генофондов изученных пород выявлена с помощью коэффициента генетической оригинальности (КГО^) и с учетом числа редких аллелей. Определены особи, в генотипе которых отмечены типичные и специфичные для генофонда аллели. Даны рекомендации по сохранению генофондов трех пород E. caballus при разведении их в Пермском крае.
Ключевые слова: ISSR-PCR маркеры, КГО^; тракененская, рысистая и тяжеловозная породы; Equus caballus L.
J. U. Dohnta, A. V. Timarovab, L. V. Komarovaa, S. V. Boronnikovaa
a Perm State University, Perm, Russian Federation
b Branch FSUC SIC «Microgen» of «Perm SIC «Biomed»» in Perm, Russian Federation
GENETIC POLYMORPHISM OF THREE BREEDS OF THE DOMESTIC HORSE
The genetic polymorphism of the trakehner, trotting and heavy-weight breeds of the horse home (Equus caballus L., Equidae), as the most commonly bred in the Perm region, has been studied. To determine the genetic diversity of the breeds of E. caballus, an ISSR-method for DNA polymorphism analysis was used. In E. caballus home amplified with 111 ISSR-PСR markers. The groups of genetic characteristics at the rock level have been determined and analyzed. To characterize gene pools of E. caballus, the number of molecular markers, the proportion of polymorphic loci, the expected heterozygosity, and the number of rare alleles are established. Genetic specificity of gene pools of the studied breeds is revealed using the coefficient of genetic originality (CGQog), but taking into account number of rare alleles. In 3 breeds of E. caballus, individuals are identified, in the genotype of which typical and region-specific alleles are noted. The recommendations are given on the preservation of gene pools of three breeds of E. caballus, when breeding them in the Perm region.
Key words: ISSR-PCR markers, CGOlog; trakehner, trotting and heavy-weight breeds; Equus caballus L.
Введение
Использование в животноводстве методов моле-кулярно-генетического анализа является тенденцией современной науки [Эрнст, Зиновьева, 2008], а в коневодстве уже внедряются технологии полного геномного анализа [Храброва, 2015]. Одной из разновидностей исследования генетического полиморфизма является амплификация межмикросателлитных фрагментов ДНК, находящихся между двумя инвертированными повторами генома [Zietkiewicz,
Rafalski, Labuda, 1994]. ISSR-PCR маркирование, по сравнению с другими методами, характеризуется высочайшей вариабельностью, наилучшей воспроизводимостью и результативно используется для оценки внутривидовой и межвидовой генетической вариабельности, проведения генетического мониторинга в породах с целью сохранения аллелофонда немногочисленных пород [Мухина, Дубинина, 2011; Гаври-личева и др., 2017; Денискова, Соловьева, Зиновьева, 2017]. Формирование программ селекции с учетом не только лишь родословной, фенотипических
© Донт Ю. У., Тимарова А. В., Комарова Л. В., Боронникова С. В., 2018
50
характеристик, но и полилокусных генотипов, а еще значений генетического сходства имеет возможность способствовать ускорению и увеличению эффективности селекционной работы. Для учета генетического разнообразия пород проводят подготовительный подбор наиболее информативных ISSR-PCR маркеров [Глазко и др., 2013; Glazko et. al, 2016; Erkenov et al, 2017].
В Пермском крае разнообразие лошади домашней представлено 19 породами. В конных хозяйствах Пермского края чаще других используют лошадей тракененской породы, реже - орловских и русских рысаков, и ещё реже - лошадей тяжеловозных пород, а также местные улучшенные породы [Лядова, Пол-ковникова, 2013].
Целью данной работы является молекулярно-генетический анализ и характеристика генофондов тракененской, рысистой и тяжеловозной пород лошади домашней, как наиболее часто представленных в Пермском крае.
Материал и методы исследования
Материал
Проведено молекулярно-генетическое изучение трех пород лошади домашней (Equus caballus L., Equidae): тракененская (n=41), тяжеловозная (n=20) и рысистая породы (n=21). Забор 82 проб крови у лошадей был проведен ветеринарным врачом с соблюдением всех санитарно-гигиенических норм на базе крестьянско-фермерского хозяйства Д.Н. Шашерина, расположенного в пос. Красный восход Пермского р-на Пермского края. Кровь помещалась в пробирки с антикоагулянтом ЭДТА (Этилендиаминтетрауксусная кислота), которые транспортировались в контейнере с хладоэлемен-тами [Методические рекомендации..., 2003]. Среди изученных преобладали лошади в возрасте от 6 до 15 лет (63.4% от общего числа). Лошади молодого возраста (от 2 до 5 лет) составили 9.8% от 82 лошадей; а старше 15 лет - 24.4%. Половой состав изученных лошадей следующий: 40.2% - жеребцы, 59.8% - кобылы. Избранные для исследования генотипов лошадей ISSR-PCR маркеры не сцеплены с полом.
Методы исследования
Для выделения ДНК из крови лошадей применен комплект реагентов Проба ГС («ДНК-технология», Россия). Тотальную ДНК для проведения ПЦР разводили до концентрации 10 нг/мкл в TE-буфере. Концентрацию и качество ДНК определяли с применением прибора Nanodrop ND-2000 («^егто scientific», USA). Для характеристики генофондов пород лошадей был избран ISSR (Inter Simple Sequence Repeats)-метод определения полиморфизма ДНК [Zietkiewicz et al., 1994] с исполь-
зованием полимеразной цепной реакции (ПЦР). Праймеры синтезированы в ЗАО «Синтол» (г. Москва). Эффективность праймеров определяли по результативности выявления полиморфизма ДНК [Календарь, Боронникова, 2007], рассчитанной в соответствии со шкалой 1-5: от невысокой (1) до высочайшей (5).
ПЦР проводили в термоциклере Gene Amp PCR System 9700 («Applied Biosystems», USA) по стандартной для ISSR-метода программе: предшествующая денатурация 94°C, 2 мин.; первые 5 циклов 94°С, 20 сек.; t° отжига, 10 сек.; 72°С, 10 сек.; в следующих 35 циклах: 94°С, 5 сек.; t отж., 5 сек.; 72°С, 5 сек. Завершающий цикл элонгации длился 2 мин. при 72°С. Температура отжига в зависимости от G/С-состава праймеров увеличивалась от 56 до 64°С. Для проверки достоверности полученных ДНК-спектров опыт повторяли не менее трех раз. В качестве негативного (К-) контроля в реакционную смесь для проверки чистоты реактивов добавляли вместо ДНК 5 мкл деионизированной воды.
Продукты амплификации делили методом электрофореза в 1.7%-ном агарозном геле в 1х TBE буфере. Гели окрашивали бромистым этидием и снимали в проходящем ультрафиолетовом свете в системе Gel-Doc XR («Bio-Rad», США). Определение длин фрагментов велось с поддержкой программы Quantity One в системе гель-документации Gel Doc XR («Bio-Rad», США) с использованием маркера молекулярной массы (100 bp +1.5 + 3 КЬ DNA Ladder) («ООО-СибЭнзим-М», Москва).
Компьютерный анализ полученных данных проведен с использованием программы POPGENE 1.31 [Yeh, Young, Mao, 1999] и с поддержкой спец макроса GenAlEx6 [Peakall, Smouse, 2006] для MS-Excel с определением: доли полиморфных локусов (P95) [Williams et al., 1990], абсолютного числа аллелей (na), эффективного числа аллелей (ne) [Ki-mura, Crow, 1964], ожидаемой гетерозиготности (HE) [Nei, 1987]. Описание специфики генофонда каждой породы проведены с применением коэффициента генетической оригинальности или же КГО [Потокина, Александрова, 2008], с учетом каждой особи [Боронникова, 2009]. Статистическая обработка данных проведена в программе STATISTICA 6.0.
Результаты и их обсуждение
С целью выявления эффективности протестировано 14 ISSR-праймеров, которые содержали последовательности ди- и тринуклеотидных микросателлит-ных мотивов с добавлением одного или двух якорных нуклеотидов на З'-конце (табл. 1).
Каждый праймер был индивидуально проанализирован в ПЦР с тотальной ДНК исследуемых пород. Из 14 ISSR-праймеров были отобраны 5 наиболее эффективных для дальнейшего анализа.
Для Е. саЬаИш эффективными являются в зависимости от числа нуклеотидов в коровом повторе три динуклеотидных праймера: ^Л)6СС; (AG)8CA; ^^Ш; два тринуклеотидных: (СТС)бС; (GAG)6C.
Таблица 1
Эффективность ISSR-праймеров для E. сaballus
Обозначение праймера Нуклеотидная последовательность праймера (5'^3') Эффективность праймера
М1 (ЛС>СО 3
М2 (АС)8СС 2
(АС)8Т 1
(ТО)8ЛД -
(ТО)8вС 2
ISSR-5 (AG)SCA 5
ISSR-6 5
ISSR-7 (CTC)6C 5
ISSR-8 (GAG)6C 5
(ЛС0)70 2
СЯ-212 (СТ>ТО 1
СЯ-215 (СЛ>ОТ 4
СЯ-216 (ОЛ)6вО 1
CR-218 (GA)6CC 5
Примечание. Жирным шрифтом выделены праймеры с наибольшей эффективностью.
У трех изученных пород Е. саЬаПш посредством ПЦР с пятью эффективными ISSR-праймерами выявлено 111 ISSR-PCR маркеров, из которых 106 являются полиморфными (Р95 = 0.955). Число амплифи-
цированных ISSR-PCR маркеров Е. саЬаПш варьировало в зависимости от праймера от 14 (праймер ^Я-8) до 26 (праймер ISSR-5) а их размеры - от 140 (ISSR-6) до 1550 (ISSR-7) пн (табл. 2). Доля полиморфных локусов наибольшая у рысистой породы (Р95 = 0.938), наименьшая - у тракененской породы (Р95 = 0.821). Ожидаемая гетерозиготность (НЕ) на общую выборку Е. саЬаПш составила 0.227 (табл. 3). Данный показатель наибольший в выборке лошадей рысистой породы (НЕ =0.228), а наименьший - у лошадей тракененской породы (НЕ =0.178).
Абсолютное число аллелей на локус (па) на общую выборку составило 1.988 (табл. 3). Этот показатель наивысший у выборки лошадей тракенен-ской породы (па=1.757), в выборке лошадей тяжеловозных пород он наименьший (па =1.685).
Эффективное число аллелей на локус (пе) на общую выборку составило 1.365. Наибольшее значение эффективного числа аллелей выявлено у рысистых пород (пе =1.382), а наименьшее - у тракененской породы (пе =1.269).
Для характеристики генофондов важны редкие ISSR-PCR маркеры, встречающиеся с частотой менее 5%.
Наибольшее число редких маркеров отмечено у лошадей тракененской породы (Я = 5). Всего лишь один редкий маркер отмечен у рысаков.
Таблица 2
Характеристика ISSR-PCR маркеров трех пород E. сabaUus
ВБЯ-праймеры Нуклеотидная последовательность (5'^ 3') Длина фрагментов ДНК, пн Число полиморфных КВЯ-РСЯ маркеров (их частота) Число ЮБЯ-РСЯ маркеров
учитываемых полиморфных
Тг Tg Я
(ЛО)8СЛ 230-1000 14 (0.737) 12 (0.800) 15 (0.938) 26 24 (0.923)
(ЛО)8СО 140-1340 12 (0.667) 15 (0.938) 10 (0.909) 24 23 (0.958)
(СТС)6С 280-1550 13 (0.929) 11 (1.000) 24 (0.960) 25 24 (0.960)
(ОЛО)6С 240-1000 11 (0.917) 10 (0.833) 10 (0.909) 14 14 (1.000)
СЯ-218 (ОЛ>СС 300-1100 19 (0.905) 19 (0.864) 16 (0.941) 22 21 (0.955)
Всего КВЯ-РСЯ маркеров 69 (0.821) 67 (0.882) 75 (0.938) 111 106 (0.955)
Примечание. Тг - тракененская порода, Tg - тяжеловозная порода, Я - рысистая порода.
Генетическое разнообразие трех пород E. caballus
Таблица 3
Породы / показатели Тг Tg Я На общую выборку
Не 0.178 (0.015) 0.211 (0.018) 0.228 (0.018) 0.227 (0.012)
Па 1.757 (0.165) 1.685 (0.153) 1.712 (0.162) 1.988 (0.160)
Пе 1.269 (0.125) 1.347 (0.124) 1.382 (0.132) 1.365 (0.131)
R 5 4 1 10
Примечания: НЕ - ожидаемая гетерозиготность; па - абсолютное число аллелей на локус; пе аллелей на локус; у всех вышеуказанных параметров в скобках даны стандартные отклонения: лелей; Тг - тракененская порода, Tg - тяжеловозная порода, Я - рысистая порода.
- эффективное число R- число редких ал-
Анализ КГО проведен как у каждой породы отдельно, так и у каждой из 82 лошадей. Чем выше этот показатель, тем больше специфических аллелей содержится в генотипе лошади. Значения КГО были прологарифмированы по основанию 2 и обозначены как КГО^. Установлено, что КГО^ имеет
нормальное распределение, так как критерий Ша-пиро-Уилка высок и равен у рысаков 0.927, у тяжеловозов - 0.891; у тракенов - 0.958.
На основании функции плотности распределения произведено разделение значений КГО^ на квантили [Нестерук, 2016]. Наименьшие значения
этого показателя соответствовали типичным аллелям лошадей породы, а наибольшие - специфическим. У трех лошадей тракененской породы отмечены минимальные значения КГО^ (1.519 и ниже), то есть эти лошади являются носителями типичных для породы аллелей. У четырех лошадей этой породы определены максимальные значения, которые равны или выше 1.799, что свидетельствует о наличии в генотипе лошадей специфических для генофонда породы аллелей. Близкие по значению показатели получены и для изученных лошадей рысистых пород: у четырех лошадей выявлены минимальные значения КГО^ (1.572 и ниже), а у трех лошадей - максимальные (1.783 и выше). У изученных тяжеловозов всего две лошади пригодны для разведения как представители типичного генофонда породы, так как у них отмечены минимальные значения КГО^ (1.279 и ниже), только три лошади имеют в своем генотипе специфические аллели, так как значение КГО^ у них максимальное (1.600 и незначительно выше). Причем и минимальные, и максимальные значения КГО^ лошадей тяжеловозных пород ниже, чем у траке-ненской и рысистых пород.
Таким образом, выявлены лошади, которые являются носителями типичных и специфических аллелей в составе генофонда каждой из изученных пород. К тому же, лошадей с минимальными значениями КГО^ у изученных пород выявлено меньше, чем с максимальными значениями этого показателя.
Полиморфизм ISSR-PCR маркеров ранее был использован для выявления генетической структуры и внутрипородной дифференциации карачаевской и алтайской пород лошадей [Эркенов, 2015], выполненных в Центре нанобиотехнологий РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева (г. Москва). Данные молекулярно-генетического анализа могут быть использованы для выявления «генофондного стандарта» исследованных пород лошадей, а также для разработки программ контроля динамики генофондов различных пород лошадей в меняющихся условиях искусственного и естественного отбора [Глазко и др., 2013].
На основании данных о генетическом полиморфизме трех пород E. caballus, разводимых в Пермском крае, даны следующие рекомендации:
1. C целью сохранения генофонда пород E. caballus в практику племенной работы необходимо внедрять маркерную систему оценки родословных, включающую определение степени гете-розиготности, контроль передачи генетической информации из поколения в поколение, определение фактического генотипического сходства про-банда с выдающимися предками.
2. Полученные данные о генетическом разнообразии трех пород могут в дальнейшем быть ис-
пользованы для разработки индивидуального генетического паспорта каждой лошади.
3. Редкие ISSR-PCR маркеры можно использовать при молекулярно-генетической идентификации пород.
4. Представленные в работе данные о KT0log могут быть применены как в селекционно-племенной работе (при отборе-подборе пар для скрещивания, обмене животными между хозяйствами), так и при сохранении генофонда породы, в частности, для сохранения всего спектра редких (оригинальных) и типичных (базовых) аллелей.
Выводы
1. Для молекулярно-генетического анализа лошадей тракененской породы, тяжеловозных и рысистых пород определены 5 эффективных ISSR-праймеров, из которых три динуклеотидных -(AG)8CA; (AG)8CG; (GA^CC и два тринуклеотид-ных - (CTC)6C и (GAG)6C праймера.
2. У изученных пород E. caballus выявлено 111 ISSR-PCR маркеров, из которых 106 были полиморфными (P95 = 0.955).
3. Наибольшие показатели генетического разнообразия отмечены у лошадей рысистых пород (P95 = 0.938; HE = 0.228; ne = 1.382).
3. У изученных лошадей выявлено 10 редких ISSR-PCR маркеров, наибольшее их число отмечено у лошадей тракененской породы (R=5).
4. У всех изученных особей E. caballus установлены КГО1. Лошади с минимальными значениями КГО имеют в генотипе типичные для породы аллели и могут быть рекомендованы для разведения с целью сохранения базового для породы генофонда. Лошади же с максимальными КГО являются носителями специфических аллелей и могут быть использованы в скрещиваниях в селекционной работе с целью закрепления специфических особенностей пород.
5. Установлены лошади, которые являются носителями типичных и специфических аллелей в составе генофонда каждой из изученных пород. Отмечено, что лошади с базовыми аллелями встречаются реже, чем со специфическими аллелями; поэтому их разведение необходимо для поддержания типичного генофонда изученных пород E. caballus, в том числе и в Пермском крае.
Выражаем искреннюю благодарность сотрудникам крестьянско-фермерского хозяйства Д.Н. Шашерина за возможность проведения молеку-лярно-генетических исследований и забор крови лошадей.
Библиографический список
Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ генофондов редких и исчезающих видов растений Пермского края: автореф. дис. ... д-ра биол. наук. Уфа, 2009. 44 с.
Гавриличева И.С. и др. Идентификация и паспортизация генотипов лошадей по микросателлитам ДНК // Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии: сб. тез. докл. 17-ой Всерос. молодеж. науч. конф. М., 2017. С. 24-27.
Глазко В.И. и др. ISSR-PCR маркеры и мобильные генетические элементы в геномах сельскохозяйственных видов млекопитающих // Сельскохозяйственная биология. 2013. № 2. С. 71-76.
Денискова Т.Е., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А. Изучение динамики изменений аллелофонда и генетического разнообразия в трех популяциях романовских овец с помощью микросателлитов // Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии: сб. тез. докл. 17-ой Всерос. молодеж. науч. конф. М., 2017. С. 2223.
Дубина Е.В., Мухина Ж.М. Молекулярные маркеры и их использование в селекционно-генетических исследованиях // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. 2011. № 66. С. 1-11.
Календарь Р.Н., Боронникова С.В. Анализ моле-кулярно-генетического полиморфизма природных популяций редких видов растений Урала с помощью ретротранспозонов // Материалы четвертого Моск. междунар. конгресса «Биотехнология состояние и перспективы развития». М., 2007. Ч. 2. С. 121.
Лядова Н.С., Полковникова В.И. Эффективность использования лошадей разной типологии в до-суговом коневодстве Пермского края // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2013. № 4(42). С. 128-132.
Нестерук Л.В., Макарова Н.Н., Свищева Г.Р., Столповский Ю.А. Оценка генетического разнообразия романовской породы овец с помощью коэффициента генетической оригинальности на основе данных ISSR-фингерпринтинга // Генетика. 2015. Т. 51, № 7. С. 847-852.
Нестерук Л.В. Генетический полиморфизм романовской породы овец: автореф. дис. ... канд. биол. наук. М., 2016. 22 с.
Потокина Е.К., Александрова Т.Г. Методы классификации внутривидового разнообразия по результатам молекулярного маркирования // Фундаментальные и прикладные проблемы ботаники в начале XXI века: материалы Всерос. конф. Петрозаводск, 2008. Ч. 3. С. 62-65.
Храброва Л.А. Использование ДНК-технологий в коневодстве // Эффективное животноводство. 2015. № 6 (115). С. 13-17.
Эркенов Т.А. Генетическая структура и внутрипо-родная дифференциация карачаевской лошади: автореф. дис. ... канд. с/х. наук. М., 2015. 23 с.
Эрнст Л.К., Зиновьева Н.А. Биологические проблемы животноводства в XXI веке. М.: РАСХН, 2008. 501 с.
Erkenov T.A. et al. Generation of Molecular Genetic Markers in Studies of Genetic Structures of Horses // International Journal of Environmental Problems. 2017. Vol. 3, № 1. P. 36-46.
Glazko V.I. et al. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers // Biogeosystem Technique, 2016. Vol. 9, № 3. P. 195-204.
Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics (US). 1964. Vol. 49. P. 725-738.
Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press, 1987. 512 р.
Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Not., 2006. Vol. 6. P. 288-295.
Yeh F.C., Young R.C., Mao J. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits // Department of Renewable Resources, Univ. of Alberta, Edmonton. Alta, 1999. 283 p.
Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by seguence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. 1994. Vol. 20. P. 176-183.
Williams J.G.K. et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acids Res. 1990. Vol. 18. P. 6531-6535.
References
Boronnikova S.V. Molekuljarno-geneticeskij analiz genofondov redkich i iscezajuscich vidov rastenij Permskogo kraja. Avtoref. diss. d-ra boil. nauk [Molecular genetic analysis of genofond of rare and endangered plant species in Perm Krai: Abstract of. dis. doc. Biol. sciences]. Ufa, 2009. 44 p. (In Russ.).
Gavrilicheva I.S., Blokhina N.V., Khrabrova L.A., Tsareva M.A. [Identification and certification of horses genotypes by microsatellites of DNA]. Bio-technologija v rastenievodstve, zivotnovodstve i veterinoriji [Biotechnology in crop production, animal husbandry and veterinary science: a collection of abstracts]. Moscow, 2017, pp. 24-27. (In Russ.).
Glazko V.I., Gladyr Е.А., Feofilov А.В. and et al. [ISSR-PCR Markers and mobile genetic elements in genomes of mammal agricultural species].
Sel'skochozjajstvennaja biologija, N 2 (2013): pp. 71-76. (In Russ.).
Deniskova T.E., Soloveva A.D., Zinoveva N.A. [The study of changes dynamics in allelofond and genetic diversity in three Romanov sheep population by microsatellites]. Biotechnologija v rastenievod-stve, zivotnovodstve i veterinoriji [Biotechnology in crop production, animal husbandry and veterinary science: a collection of abstracts]. Moscow, 2017, pp. 22-23. (In Russ.).
Dubina E.V., Muhina Yz. M. [Molecular markers and their use in breeding and genetic studies]. Politemeticeskij setevoj elektronnyj naucnyj zur-nal Kubanskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta. N 66 (2011): pp. 1-11. (In Russ.).
Kalendar R.N., Boronnikova S.V. [Molecular genetic polymorphism analysis of natural populations of rare plant species in the Urals by retrotrans-posons]. Materialy cetvertogo Moskovskogo mezdunarodnogo kongressa [Materials of the Fourth Moscow. Intern. of the Congress "Expo-biochem-technologies"]. Moscow, 2007, P. 2, p. 121. (In Russ.).
Lyadova N.S., Polkovnikova V.I. [Efficiency of different typology horses utilization in leisure horse breeding in Perm Krai]. Izvestija Orenburgskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta N 4(42) (2013): pp. 128-132. (In Russ.).
Nesteruk L.V. Geneticeskij polimorfizm romanovskoj porody ovec. Avtoref. diss. cand. boil. nauk [Genetic polymorphism of Romanov sheep: Abstract PhD dis.]. Moscow, 2016. 22 p. (In Russ).
Nesteruk L.V., Makarova N.N., Svishcheva G.R., Stolpovsky Yu.A. [Estimation of genetic diversity of Romanov sheep by the coefficient of genetic originality based on ISSR-fingerprinting data]. Genetika. V. 51, N 7 (2015): pp. 847-852. (In Russ.).
Potokina E.K., Aleksandrova T.G. [Methods of the intraspecific diversity classification as a result of molecular marking]. Fundamental'nye i priklad-nye problemy botaniki v nacale XXI veka [Fundamental and Applied Botany at the Beginning of the 21st Century]. Petrozavodsk, 2008, pp. 62-65. (In Russ.).
Khrabrova L.A. [Using of DNA technologies in horse breeding]. Effektivnoe zivotnovodstvo. N 6 (115) (2015): pp. 13-17. (In Russ.).
Erkenov T.A. Geneticeskaja struktura i vnutri-porolnaja differenciacija karacaevskoj losadi. Avtoref. diss. cand. selchoz. nauk [Genetic structure and in-breed differentiation of the Karachai horse. Abstract of Cand. Diss.]. Moscow, 2015. 23 p (In Russ.).
Ernst L.K., Zinoveva N.A. Biologiceskie problemy zivotnovodstva v XXI veke [Biological problems of livestock in the 21 century]. Moscow, 2008. 501 p. (In Russ.).
Erkenov T.A., Glazko V.I., Knyaseva E.F., Glazko T.T. Generation of Molecular Genetic Markers in Studies of Genetic Structures of Horses. International Journal of Environmental Problems, V. 3 (1) (2017): pp. 36-46.
Glazko V.I., Erkenov T.A., Glazko T.T., Dzatoev K.M. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers. Biogeosystem Technique, V. 9(3) (2016): pp. 195-204.
Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population. Genetics (US). V. 49 (1964): pp. 725-738.
Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. New York, Columbia University Press, 1987. 512 р.
Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Not. V. 6 (2006): pp. 288295.
Yeh F.C., Young R.C., Mao J. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits. Edmonton, Department of Renewable Resources, Univ. of Alberta, 1999. 283 p.
Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by seguence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genom-ics. V. 20 (1994): pp. 176-183.
Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J. et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acids Res. V. 18 (1990): pp. 6531-6535.
Поступила в редакцию 24.01.2018
Об авторах
Донт Юлиана Удовна, магистрант биологического факультета ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» ORCID: 0000-0002-1296-3635 614099, Пермь, ул. Букирева, 15; yulianadont@mail.ru; (342)2396233
About the authors
Dohnt Juliana Udovna, graduate student of the
biological faculty
Perm State University.
ORCID: 0000-0002-1296-3635
15, Bukirev str., Perm, Russia, 614990;
yulianadont@mail.ru; (342)2396233
Тимарова Анна Владимировна, микробиолог в отделе контроля качества
Филиал АО «НПО «Микроген» в г. Пермь «Пермское НПО «Биомед» ORCID: 0000-0003-2636-3988 614089, Пермь, ул. Братская, 117; lynx531@ya.ru
Комарова Лидия Васильевна, ассистент кафедры ботаники и генетики растений ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» ORCID: 0000-0002-7021-0017 614990, Пермь, ул. Букирева, 15; arealfreedom@mail.ru; (342)2396279
Боронникова Светлана Витальевна, доктор биологических наук, профессор, заведующий кафедрой ботаники и генетики растений ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» ORCID: 0000-0002-5498-8160 614990, Пермь, ул. Букирева, 15; svboronnikova@yandex.ru; (342)2396279
Timarova Anna Vladimirovna, microbiologist in the quality control
The branch of FSUC "SIC "Microgen" of MOH of Russia "Perm SIC "Biomed" in Perm. ORCID: 0000-0003-2636-3988 117, Bratskaja str., Perm, Russia, 614089; lynx531@ya.ru
Komarova Lidia Vasilevna, , assistant of the Department of Botany and Genetics of Plants Perm State University. ORCID: 0000-0002-7021-0017 15, Bukirev str., Perm, Russia, 614990; arealfreedom@mail.ru; (342)2396279
Boronnikova Svetlana Vitalevna, doctor of biology,
professor, head of the Department of Botany and
Genetics of Plants
Perm State University.
ORCID: 0000-0002-5498-8160
15, Bukirev str., Perm, Russia, 614990;
svboronnikova@yandex.ru; (3422)2396279
Информация для цитирования:
Генетический полиморфизм трех пород лошади домашней / Ю.У Донт, А.В. Тимарова, Л.В. Комарова, С.В. Боронникова // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2018. Вып. 1. С. 50-56. DOI: 10.17072/1994-9952-2018-1-50-56.
Dohnt J.U., Timarova A.V., Komarova L.V., Boronnikova S.V. [Genetic polymorphism of three breeds of the domestic horse]. Vestnik Permskogo universiteta. Biologija. Iss. 1 (2018): pp. 50-56. (In Russ.). DOI: 10.17072/1994-9952-2018-1-50-56.
