CC BY
62
Медицинская иммунология 2012, Т. 14, № 6, стр. 489-500 © 2012, СПб РО РААКИ
Оригинальные статьи
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ индукции НАРУШЕНИЙ РЕГУЛЯЦИИ АНГИОГЕНЕЗА ПРИ САХАРНОМ ДИАБЕТЕ 2 типА
Коненков В.И., Шевченко А.В., Прокофьев В.Ф., Климонтов В.В., Королев М.А., Фазуллина О.Н.,
Лапсина С.А., Королева Е.А.
ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии СО РАМН, г. Новосибирск
Резюме. В статье приводятся результаты изучения распределения генотипов генов регуляторов ангиогенеза ММР и VEGF и их комбинаций с генотипами других цитокинов с проангиогенной активностью среди больных сахарным диабетом 2 типа и здоровых лиц. Показано, что у больных преобладают комбинации генотипов индукторов ангиогенеза MMP2-MMP9-VEGF, обеспечивающих нестабильный баланс соотношения активационных и депрессивных сигналов, связанные с наличием как аллелей С гена VEGFи гена MMP2, так и с наличием аллеля С гена MMP9. В состав комбинированных генетических признаков, частота которых изменена у больных, наряду с генотипами MMP и VEGF, наиболее часто входят генотипы IL-1B, IL-4, IL-10, IL-6и TNFA. Предполагается, что для изучения патогенеза развития сахарного диабета 2 типа необходимо комплексное исследование роли генов факторов регуляции ангиогенеза и воспаления с акцентом на молекулярно-генетические механизмы контроля базового уровня продукции данных регуляторных факторов.
Ключевые слова: матриксные металлопротеиназы, VEGF, цитокины, генный полиморфизм, сахарный диабет 2 типа.
Konenkov V.I., Shevchenko A.V., Prokofev V.F., Klimontov V.V., Korolev M.A., Fazulina O.N., Lapsina S.A., Koroleva E.A.
GENETIC FACTORS INDUCING DISTURBED REGULATION OF ANGIOGENESIS IN DIABETES MELLITUS TYpE 2
abstract. The article includes results of studying frequency distributions of polymorphic genotypes for some genes regulating angiogenesis, i.e., MMP and VEGF, and their combinations with genotypes of some cytokines showing pro-angiogenic activity in patients with diabetes mellitus type 2 (DM2) and healthy controls. Angiogenesis-inducing MMP2-MMP9-VEGF genotype constellations have been shown to be more common in DM patients, thus presumably causing an imbalance between activation and suppression signals, being connected with C alleles of VEGF and MMP2, as well as with harboring of MMP9 C allele. Certain genotypes of IL-1B, IL-4, IL-10, IL-6, and TNFA, along with MMP and VEGF variants are more common within combined genetic patterns in DM patients. It is suggested that allelic combination studies of angiogenesis- and inflammation-regulating genes are necessary for understanding the DM2 pathogenesis, taking into account genetic control mechanisms influencing basic production levels of these regulatory factors. (Med. Immunol., __________________________________________________ 2012, vol. 14, N 6, pp 489-500)
Адрес для переписки:
Прокофьев Виктор Федорович, к.м.н., в.н.с. лаборатории клинической иммуногенетики,
ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии СО РАМН
630117, г. Новосибирск, ул. Академика Тимакова, 2. Тел.: (383) 227-01-94.
Факс: (383) 227-01-96.
E-mail: vprok@ngs.ru
Keywords: matrix metalloproteinases, VEGF, cytokines, gene polymorphism, diabetes mellitus type 2.
Введение
Сосудистые нарушения при сахарном диабете 2 типа (СД2) являются основной причиной тяжелых нефропатий, диабетических ретинопатий, диа-
489
Коненков В.И. и др.
Медицинская Иммунология
бетических микроангиопатий нижних конечностей. Эти клинические проявления нарушений ангиогенеза являются основной причиной инвалидности и смертности пациентов с СД2. При развитии всех этих клинически разнообразных, но патогенетически сходных состояний, развивается порочный круг нарушений ангиогенеза, приводящий к самоподдержанию и хроническому прогрессированию ишемических процессов с последующей гипоксией и развитием склеротических процессов. Ишемия вызывает гиперпродукцию целого ряда биологических агентов, среди которых значимое место занимают матричные металлопротеиназы (ММР), являющиеся мощными индукторами продукции факторов роста сосудистого эндотелия (VEGF), стромального фактора-1 (SDF-1), фактора роста пигментного эпителия (PEDF) и т. п., баланс которых и определяет состояние сосудистого русла в тканях [5].
В поисках способов коррекции сосудистых нарушений у пациентов с СД2, необходимо не только ясно представлять себе взаимодействие многочисленных факторов регуляции ангиогенеза и васкулогенеза, но и оценить базовый уровень их продукции у каждого пациента. На этом пути предстоят значительные сложности, связанные как с недостатками наших знаний о сложном каскаде взаимодействия многочисленных гуморальных регуляторных факторов, так с чрезвычайной вариабельностью их концентраций в биологических жидкостях. Последнее связано с целым рядом причин: принадлежность этих молекул к короткодистантным клеточным регуляторам, короткий срок жизни этих макромолекул во внеклеточной среде, наличие системы естественных агонистов и антагонистов, слабая устойчивость белковых макромолекул к воздействию эндогенных протеаз, низкая концентрация в биологических жидкостях на пределе порога чувствительности современных методов детекции и т.п.
Учитывая эти объективные трудности, нам представляется перспективным на современном этапе использовать данные о том, что базовый уровень продукции каждого из потенциальных регуляторов ангиогенеза во многом зависит от аллельного варианта регуляторных участков промоторных зон соответствующих генов и является конституционно присущим и относительно стабильным у каждого человека на протяжении его жизни [4].
Регуляция экспрессии MMP2 и MMP9 происходит, прежде всего, на транскрипционном уровне, в промоторном регионе гена, и зависит от влияния эндотелиальных факторов роста и цитокинов [12]. Выявлен функциональный полиморфизм MMP9 С/Т в области промотора в позиции
-1562, причем наличие в генотипе минорного аллеля Т обеспечивает высокую транскрипционную активность гена [15]. В промоторном регионе ММР2 выявлено несколько полиморфных сайтов и показано, что замена MMP 2 C/T в позиции -1306 носит функциональный характер, причем аллельный вариант C ассоциирован с высокой промоторной активностью [14].
Фактор роста эндотелия сосудов — семейство структурно близких между собой белков, которые, совместно с рецепторами (VEGFR), играют существенную роль в развитии и регуляции деятельности кровеносных и лимфатических сосудов. Известно, однонуклеотидные замены в промоторном регионе генов VEGF-А, VEGF-В, VEGF-С оказывают определенное влияние на уровень продукции белков. Аллели -2578C, -1154G и -634C ассоциированы с высоким уровнем экспрессии VEGF-А. VEGF SNP полиморфизм в позициях -2578 и -1154, расположенных в пределах промоторного региона, влияет на синтез VEGF-А стимулированными периферийными мононуклеарами [10]. Генотип VEGF -634СС связан с более высокой сывороточной концентрацией VEGF у здоровых лиц и с повышенной VEGF продукцией мононуклеаров, стимулированных липополисахаридами по сравнению с CG и GG генотипами [8]. В 3’-нетранслируемом регионе гена выявлена полиморфная позиция в положении +936, влияющая на уровень VEGF в плазме крови. Плазменные уровни VEGF у носителей VEGF +936 Tснижены [13].
Исходя из этого, целью данной работы было исследование генетической структуры пациентов с СД2 и здоровых лиц с акцентом на распределение комбинированных генотипов, включающих в себя гены таких известных регуляторов ангиогенеза, как гены ММР и гены VEGF. Наряду с этим анализировалось и наличие в ассоциированных с СД2 генетических комбинациях, вариантов генов цитокинов с проангиогенной активностью.
Материалы и методы
В исследование включена группа из 586 жителей России женского пола, считающих себя и своих родителей русскими, в том числе 374 женщины без нарушений углеводного обмена, в возрасте от 23 до 68 лет, и 212 пациенток с СД2, в возрасте от 28 до 69 лет. Диагноз СД устанавливался по критериям ВОЗ (1999 г.). У больных с верифицированным СД определялась гликемия натощак и после еды, а также уровень гликиро-ванного гемоглобина А1с. При необходимости проводилось исследование С-пептида, антител к глутаматдекарбоксилазе и антиостровковых антител, для исключения латентного аутоиммунного диабета взрослых. В исследование не вклю-
490
2012, Т. 14, № 6
Полиморфизм генов регуляции ангиогенеза при СД2
чались пациенты с эндокринопатиями, болезнями экзокринной части поджелудочной железы и другими факторами риска симптоматических форм СД.
Обследованные давали письменное информированное согласие на участие в исследовании. Протокол исследования одобрен локальным этическим комитетом.
Исследовался однонуклеотидный полиморфизм (SNP - single nucleotide polymorphism) промоторного региона генов TNFA -863 CA, TNFA -308 GA, TNFA -238 GA, IL-1$ -31 СТ, IL-4 -590 СТ, IL-6 -174 GC, IL-10 -1082 G A и IL-10 -592 АС, VEGF -2578 CA, VEGF +936 СТ, ММР 2 -1306С Т, ММР 9 -1562 С Т. Генотипирова-ние осуществляли методом рестриктного анализа продуктов амплификации (RFLP) [4, 7, 9, 11].
При статистическом анализе результатов исследований использовали такие показатели как частота встречаемости генов, генотипов и их комбинаций, специфичность (Sp), отношение шансов (OR) с расчетом 95% доверительного интервала (95%CI). Частоту аллелей генов цитокинов вычисляли методом прямого подсчета. Распределение генотипов по исследованным полиморфным локусам проверяли на соответствие равновесию Харди—Вайнберга [1]. Достоверность различий частот распределения изучаемых признаков в альтернативных группах определяли по критерию х2 с поправкой Йетса на непрерывность и двустороннему варианту точного метода Фишера для четырехпольных таблиц как описано ранее [2].
Результаты
Результаты проведенного исследования показали, что в контрольной выборке и в выборке больных наблюдаемое распределение генотипов всех изученных полиморфных вариантов генов регуляторов ангиогенеза соответствовало каноническому распределению Харди—Вайнберга.
Частоты встречаемости комбинированных генетических признаков, включающих в себя генотипы MMP2, MMP9 и VEGF, в группах пациентов с СД2 и с его отсутствием, различаются существенным образом. Всего среди проанализированных частот генетических комбинаций по всей группе обследованных лиц выявлено 968 генетических комбинаций, достоверно различающихся с уровнем значимости p < 0,05 по двустороннему критерию точного метода Фишера. В целях исключения слабо достоверных данных был задан минимальный уровень значимости различий по данному критерию (p < 0,005), что привело к сокращению числа анализируемых признаков до 142. Показатели отношения шансов для этих признаков укладывались в интервал 95%CI. Из этого
общего числа высоко достоверно различающихся признаков, частота 45 из них была значительно повышена среди пациентов с СД2 (позитивная ассоциация), а частота встречаемости 97 из них оказалась сниженной (негативная ассоциация) относительно соответствующих показателей здоровых лиц.
Анализ состава генотипов, входящих в состав генетических комбинированных признаков, позитивно ассоциированных с развитием СД2 (табл. 1), показал, что в большинстве случаев (97,8%) в их состав входят варианты гена VEGF, содержащие в своем составе аллели С в обеих полиморфных позициях +963 и -2578, обеспечивающие высокий уровень продукции проангиогенного фактора роста сосудистого эндотелия у этих лиц. При этом в 75% случаев эти генотипы представлены гомозиготными вариантами СС.
Показано наличие в составе генетических комбинаций, часто встречающихся при СД2, генотипов MMP9. Среди них также выявлено преобладание гомозиготных генотипов СС, однако эти аллели C, как указывалось выше, ассоциируются с более низким уровнем продукции данного фермента. Генотипы MMP2 встречаются относительно редко, всего в 20 % случаев, однако также представлены, в основном, гомозиготными вариантами СС, обеспечивающими высокий уровень продукции желатиназы А у обладателей этого генотипа. Исходя из этого можно предположить, что среди пациентов с СД2 преобладают сложные генотипы индукторов ангиогенеза MMP2-MMP9-VEGF, обеспечивающих нестабильный баланс соотношения активационных и депрессивных сигналов, связанные с наличием как аллелей С гена VEGF и гена MMP2, так и с наличием аллеля С гена MMP9.
Рассматривая наличие в позитивно ассоциированных с СД2 генетических комбинаций аллей других цитокинов с потенциально проангиогенной активностью, обращает на себя внимание широкое представительство генотипов TNFA во всех исследованные полиморфных позициях -238, -308 и -863. Среди этих генотипов также преобладают гомозиготные варианты GG или СС, связанные с низким уровнем продукции самого фактора некроза опухолей-а. Наличие аллей А в составе этих генотипов значительно ниже и соотносится как 1:7.
Генотипы других цитокинов, с явной провоспалительной и проангиогенной активностью (IL-1B и IL-6), в основном, представлены гомозиготными вариантами ТТ и GG, соответственно, в полиморфных позициях -31 T/C и -174 G/C, связанными с высоким уровнем продукции интерлейкина-1р и интерлейкина-6.
491
4^
40
NJ
ТАБЛИЦА 1. КОМБИНИРОВАННЫЕ ГЕНОТИПЫ VEGF И ММР, АССОЦИИРОВАННЫЕ С ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТЬЮ К РАЗВИТИЮ СД2
Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 ЗД OR OR 95%CI P(tmF2) Sp
VEGF-936:MMP9-1562:TNF-863:TNF-308: IL-6-174: IL-10-592 CC-CC-CC-GA-GG-CC 5,24 0,00 28,07 1,64-479,3 0,0002 100,00
VEGF-936: M MP9-1562:TNF-863:TNF-308:TNF-238: IL-6-174: IL-10-592 CC-CC-CC-GA-GG-GG-CC 5,24 0,00 27,27 1,60-465,6 0,0002 100,00
VEGF2578:MMP9-1562: IL-1 B-31:1L-4-590: IL-10-592 CA-CC-CC-CC-CC 3,47 0,00 21,14 1,20-372,3 0,0023 100,00
VEGF2578: VEGF-936: ММ P9-1562: IL-1 B-31: IL-4-590: IL-10-592 CA-CC-CC-CC-CC-CC 3,47 0,00 18,68 1,06-329,1 0,0037 100,00
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-863:TNF-308: IL-6-174: IL-10-592 CA-CC-CC-GG-GG-CA 3,90 0,00 18,64 1,07-324,9 0,0029 100,00
VEGF-936: MM P9-1562:TNF-308: IL-4-590: IL-6-174 CC-CC-GA-CT-GG 3,40 0,00 18,53 1,05-326,5 0,0039 100,00
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308: IL-4-590: IL-6-174 CC-CT-GA-CC-GC 3,40 0,00 18,53 1,05-326,5 0,0039 100,00
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:1 L-4-590: IL-6-174 CC-CC-CC-GA-CT-GG 3,40 0,00 18,53 1,05-326,5 0,0039 100,00
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-863: IL-10-1082 CC-CC-CA-AA 6,60 0,00 18,04 1,07-305,1 0,0028 100,00
VEGF2578: MM P2-1306:TNF-863:TNF-308:TNF-238: IL-6-174: IL-10-592 CA-CC-CC-GG-GG-GG-CA 3,90 0,00 18,03 1,03-314,5 0,0034 100,00
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-4-590: IL-6-174 CC-CC-GA-GG-CT-GG 3,40 0,00 18,01 1,02-317,2 0,0043 100,00
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:TNF-238: IL-4-590: IL-6-174 CC-CC-CC-GA-GG-CT-GG 3,40 0,00 18,01 1,02-317,2 0,0043 100,00
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306:1 L-4-590:1L-10-1082 CA-CC-CC-CC-AA 7,00 0,00 17,49 1,03-296,1 0,0028 100,00
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306:TNF-238: IL-4-590: IL-10-1082 CA-CC-CC-GG-CC-AA 7,00 0,00 17,49 1,03-296,1 0,0028 100,00
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308: IL-6-174: IL-10-592 CC-CC-GA-GG-CC 5,71 0,41 14,67 1,89-113,7 0,0009 99,59
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-6-174: IL-10-592 CC-CC-GA-GG-GG-CC 5,71 0,42 14,24 1,84-110,5 0,0010 99,58
VEGF2578: MMP2-1306:TNF-863: IL-1 B-31: IL-10-592 AA-CC-CC-TT-CC 5,37 0,47 12,02 1,54-93,97 0,0026 99,53
VEGF2578: VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:IL-10-1082 CA-CC-CC-GG-AA 10,53 1,64 7,06 1,63-30,57 0,0018 98,36
VEGF2578: VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-10-1082 CA-CC-CC-GG-GG-AA 10,53 1,64 7,06 1,63-30,57 0,0018 98,36
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:1 L-4-590 CC-CT-GA-CC 5,34 0,79 7,05 1,54-32,18 0,0041 99,21
VEGF2578: VEGF-936: MMP9-1562: IL-4-590:1 L-10-1082 CA-CC-CC-CC-AA 10,34 1,64 6,92 1,59-30,07 0,0029 98,36
VEGF2578: VEGF-936: MMP9-1562:TNF-238:1 L-4-590:1 L-10-1082 CA-CC-CC-GG-CC-AA 10,34 1,64 6,92 1,59-30,07 0,0029 98,36
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-238: IL-1 B-31: IL-6-174 CA-CC-GG-TT-GG 6,31 0,97 6,90 1,54-30,99 0,0035 99,03
Коненков В. И. и др. Медицинская Иммунология
Таблица 1 (окончание)
Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 ЗД OR OR 95%CI P(tmF2) Sp
VEGF2578: ММР9-1562:1L-10-1082:1L-10-592 CA-CC-AA-CC 9,62 1,57 6,65 1,53-28,95 0,0028 98,43
VEGF2578: VEGF-936:MMP2-1306: IL-10-1082 CA-CC-CC-AA 10,68 1,79 6,58 1,52-28,51 0,0032 98,21
VEGF2578: VEGF-936:MMP9-1562: IL-10-1082 CA-CC-CC-AA 13,88 2,46 6,39 1,90-21,45 0,0004 97,54
VEGF2578:VEGF-936:MMP9-1562:TNF-238:IL-10-1082 CA-CC-CC-GG-AA 13,88 2,46 6,39 1,90-21,45 0,0004 97,54
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-238: IL-10-1082: IL-10-592 CA-CC-GG-AA-CC 9,13 1,57 6,28 1,44-27,45 0,0047 98,43
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-308: IL-10-1082 CA-CC-GG-AA 12,92 2,34 6,18 1,84-20,82 0,0006 97,66
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-10-1082 CA-CC-GG-GG-AA 12,44 2,34 5,92 1,75-19,98 0,0010 97,66
VEGF2578: MMP9-1562:1L-4-590:1 L-10-1082 CA-CC-CC-AA 11,82 2,34 5,59 1,65-18,96 0,0017 97,66
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-238: IL-4-590: IL-10-1082 CA-CC-GG-CC-AA 11,82 2,34 5,59 1,65-18,96 0,0017 97,66
VEGF2578: MMP9-1562: IL-10-1082 CA-CC-AA 18,18 3,91 5,47 2,09-14,29 0,0001 96,09
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-238: IL-10-1082 CA-CC-GG-AA 17,70 3,91 5,29 2,02-13,85 0,0001 96,09
VEGF-936:MMP2-1306: MMP9-1562: IL-10-1082 CC-CC-CC-AA 12,44 2,68 5,16 1,53-17,46 0,0035 97,32
VEGF-936: MM P2-1306:TNF-238:1 L-4-590 CC-TT-GG-CC 9,36 2,01 5,03 1,68-15,08 0,0020 97,99
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-863: IL-10-1082 CA-CC-CC-AA 12,44 3,13 4,40 1,50-12,93 0,0029 96,88
VEGF2578: MMP9-1562:TNF-863:TNF-238: IL-10-1082 CA-CC-CC-GG-AA 11,96 3,13 4,21 1,43-12,40 0,0046 96,88
VEGF-936: MM P9-1562:TNF-308:1 L-10-1082 CC-CC-GG-AA 17,45 4,88 4,12 1,69-10,08 0,0006 95,12
VEGF-936: MM P9-1562:TNF-308:1 L-4-590:1 L-10-1082 CC-CC-GG-CC-AA 14,08 4,07 3,87 1,46-10,27 0,0044 95,93
VEGF-936: ММ P9-1562: IL-4-590: IL-10-1082 CC-CC-CC-AA 15,53 4,88 3,59 1,45-8,85 0,0038 95,12
VEGF-936: MM P9-1562:TNF-308:TNF-238:1 L-10-1082 CC-CC-GG-GG-AA 15,57 4,88 3,59 1,46-8,85 0,0026 95,12
VEGF-936: ММ P9-1562: IL-10-1082 CC-CC-AA 21,70 7,32 3,51 1,65-7,45 0,0006 92,68
VEGF-936: MM P9-1562:TNF-238:1 L-10-1082 CC-CC-GG-AA 19,81 7,32 3,13 1,47-6,68 0,0024 92,68
VEGF-936: ММ P2-1306: IL-10-1082 CC-CC-AA 20,10 7,96 2,91 1,36-6,22 0,0039 92,04
Примечание. Здесь и в таблице 2: СД2 - частота встречаемости комбинаций генотипов у больных СД2 в %; ЗД - частота встречаемости комбинаций генотипов у здоровых женщин в %; OR - отношение шансов; OR 95%С1 - 95%-й доверительный интервал для OR; P(tmF2) - значения Р разности частот встречаемости комбинаций генотипов в группах сравнения по двустороннему варианту точного метода Фишера; Sp - специфичность в %.
2012, Т. 14, № 6 Полиморфизм генов регуляции ангиогенеза при СД2
Коненков В.И. и др.
Медицинская Иммунология
Помимо генов цитокинов с проангиогенной активностью, в составе, позитивно ассоциированных с СД2, генотипов выявлены и гены с противоангиогенной активностью IL-4 и IL-10. Так, генотипы IL-4, выявляющиеся в 37,7% случаев, все содержат аллель С в гомозиготном СС варианте или, реже, в гетерозиготном варианте СТ. Аллель С, как известно, ассоциируется со сниженной способностью продуцировать интерлейкин-4. Сходные данные установлены и для аллельного полиморфизма гена IL-10. В 60% случаев среди позитивно ассоциированных с СД2 генетических комбинаций выявляются гомозиготные генотипы АА в полиморфной позиции этого гена -1082 A/G, ассоциированные с низкой способностью клеток лиц с таким генотипом продуцировать интерлейкин-10. C другой стороны, среди всех позитивно ассоциированных признаков, в 24,4% случаев выявлены генотипы, содержащие аллель С в полиморфной позиции IL-10-592 А/С, связанные с высокой продукцией этого цитокина. Здесь же необходимо отметить, что, как правило, в составе одной генетической комбинации генотипы в этих двух полиморфных позициях не выявляются.
При анализе состава генетических комбинаций, негативно ассоциированных с развитием СД2, т.е. тех комбинаций, частота которых достоверно снижена в группе пациентов, по сравнению со здоровыми лицами, выявляются другие закономерности (табл. 2). Данные по частотам встречаемости генотипов VEGF оказались близки к результатам по группе позитивно ассоциированных комбинаций. Здесь также преобладают генотипы, содержащие аллель С, в основном, в гомозиготном варианте СС в обеих полиморфных позициях +963 С/Т и -2578А/С. В отличие данных таблицы 1, в этой группе генетических признаков практически во всех случаях выявляются аллели гена MMP2 в позиции -1306, содержащие аллели С и гораздо реже (39,2%) выявляются генотипы MMP9 c тем же преобладанием аллелей С.
В большинстве комбинированных генетических признаков, негативно ассоциированных с развитием СД2 также выявлено наличие генотипов TNFA, содержащих, в основном, аллели С и G. В отличие от предыдущей группы признаков, в данной группе крайне редко представлены гомозиготные варианты генов IL-1B и IL-6, ассоциированные с определенным влиянием на уровень продукции соответствующих макромолекул.
В частоте встречаемости генотипов цитокинов с противовоспалительной и противоангиогенной активностью также установлены существенные различия. В отличие от сравниваемой группы, среди этих комбинированных генетических признаков значительно реже выявляются генотипы
IL-4, среди которых наличие гомозиготных комбинаций СС оставляет всего 25%. Еще большие различия установлены для гена IL-10. Гомозиготные комбинации AA в позиции -1082 A/G, широко представленные в группе позитивно ассоциированных генетических признаков, в данной группе полностью отсутствуют и в 100% случаев представлены гетерозиготными комбинациями AG. В противоположность этому, среди генотипов этого гена в позиции -592А/С преобладают гомозиготные генотипы СС, способствующие высокому уровню продукции интерлейкина-10.
Подводя итоги выявленных различий, представленных в таблице 3, можно отметить, что между двумя этими группами лиц, подверженных и устойчивых к развитию СД2, установлены разнонаправленные изменения в характере распределения комбинированных генетических признаков по качественному их составу. Так, отмечается полное отсутствие среди лиц, предрасположенных к развитию заболевания генотипа СТ VEGF +963, который широко представлен среди здоровых лиц и выявляется в составе каждого десятого генетического признака. Более того, 100%-е представительство генотипа AC VEGF -2578 в составе генетических комбинаций, позитивно ассоциированных с развитием СД2, в оппозитной группе сменяется относительно равномерным представительством генотипов СС и АС. То же отмечается и для гена MMP2 в позиции -1306, когда 90%-е представительство генотипа СС в одной группе, сменяется преобладанием представительства генотипа СТ. Равномерное представительство генотипов GG и AG гена TNFA в позиции -308, в позитивно ассоциированной группе признаком, сменяется 100% преобладанием гомозиготного генотипа GG в оппозитной группе признаков. Аналогичное заключение можно сделать и для генотипа СС гена TNFA в позиции -863. Еще большие различия выявляются при анализе характера распределения генотипов цитокинов с проангиогенной и противоангиогенной активностью, входящих в состав VEGF - MMP-ассоциированных генетических комбинированных признаков. Равномерное распределение гомозиготных генотипов СС и ТТгена IL-1B в группе лиц, предрасположенных к развитию заболевания, сменяется на практически полное доминирование гетерозиготного генотипа СТ в оппозитной группе. Выявляется инверсия равномерного соотношения генотипов СС и СТ гена IL-4 в позиции -590 на преобладание гетерозиготного генотипа СТ. Если в группе позитивно ассоциированных с СД2 генетических комбинаций преобладает гомозиготный вариант GG гена IL-6 в позиции -174, то среди негативно ассоци-
494
ТАБЛИЦА 2. КОМБИНИРОВАННЫЕ ГЕНОТИПЫ VEGF И ММР, АССОЦИИРОВАННЫЕ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ К РАЗВИТИЮ СД2
Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 ЗД OR OR 95%Cl P(tmF2) Sp
VEGF2578: VEGF-936:MMP2-1306: IL-1 В-31: IL-10-1082 CC-CC-TC-TC-AG 0,00 6,42 0,03 0,00-0,59 0,0005 100,00
VEGF2578:VEGF-936:MMP2-1306:TNF-238:IL-1 В-31: IL-10-1082 CC-CC-TC-GG-TC-AG 0,00 6,42 0,03 0,00-0,59 0,0005 100,00
VEGF-936:MMP2-1306: IL-6-174: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-GC-AG-CA 0,00 5,31 0,04 0,00-0,71 0,0018 100,00
VEGF2578: VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-CC-TC-GG-TC-AG 0,00 5,50 0,04 0,00-0,69 0,0016 100,00
VEGF2578: VEGF-936:MMP2-1306: IL-1 B-31: IL-10-1082: IL-10-592 CC-CC-TC-TC-AG-CC 0,00 5,50 0,04 0,00-0,69 0,0016 100,00
VEGF-936:MMP2-1306:MMP9-1562: IL-6-174: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-GC-AG-CA 0,00 5,36 0,04 0,00-0,71 0,0017 100,00
VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308: IL-6-174: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-GG-GC-AG-CA 0,00 5,31 0,04 0,00-0,71 0,0018 100,00
VEGF2578: VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-CC-TC-GG-GG-TC-AG 0,00 5,50 0,04 0,00-0,69 0,0016 100,00
VEGF2578:VEGF-936:MMP2-1306:TNF-238:IL-1 B-31: IL-10-1082:IL-10-592 CC-CC-TC-GG-TC-AG-CC 0,00 5,50 0,04 0,00-0,69 0,0016 100,00
VEGF-936:MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-308:IL-6-174:IL-10-1082:IL-10-592 CC-TC-CC-GG-GC-AG-CA 0,00 5,36 0,04 0,00-0,71 0,0017 100,00
VEGF-936:MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:TNF-238:IL-1 B-31 :IL-4-590 CC-CC-CC-GG-GG-TC-CT 0,00 5,00 0,04 0,00-0,75 0,0006 100,00
VEGF2578:VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562: IL-10-1082: IL-10-592 CA-CC-TC-CC-AG-CA 0,00 4,50 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF2578:VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308: IL-4-590: IL-6-174 CA-CT-CC-GG-CC-GC 0,00 4,48 0,05 0,00-0,87 0,0036 100,00
VEGF-936: MMP2-1306: M MP9-1562:TNF-863:1L-6-174:1L-10-1082 CT-CC-CC-CC-GC-AG 0,00 4,46 0,05 0,00-0,85 0,0049 100,00
VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562: IL-1 B-31: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-TT-AG-CA 0,00 4,59 0,05 0,00-0,84 0,0046 100,00
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-863:TNF-308: IL-6-174: IL-10-1082 CT-CC-CC-GG-GC-AG 0,00 4,42 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-238: IL-1 B-31: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-GG-TT-AG-CA 0,00 4,55 0,05 0,00-0,84 0,0047 100,00
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-308: IL-10-1082:1 L-10-592 CA-CC-TC-CC-GG-AG-CA 0,00 4,50 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-238: IL-10-1082:1 L-10-592 CA-CC-TC-CC-GG-AG-CA 0,00 4,50 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF2578: VEGF-936: MM P2-1306:TNF-308: IL-1 B-31:1 L-10-1082: IL-10-592 CC-CC-TC-GG-TC-AG-CC 0,00 4,59 0,05 0,00-0,84 0,0047 100,00
VEGF-936: ММ P2-1306: MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:1 L-1 B-31: IL-4-590 CC-CC-CC-CC-GG-TC-CT 0,00 4,06 0,05 0,00-0,96 0,0032 100,00
VEGF-936: ММ P2-1306: MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:1 L-6-174:1 L-10-1082 CT-CC-CC-CC-GG-GC-AG 0,00 4,46 0,05 0,00-0,85 0,0049 100,00
VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-238: IL-1 B-31:1 L-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-GG-TT-AG-CA 0,00 4,59 0,05 0,00-0,84 0,0046 100,00
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-238: IL-6-174: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-GG-GC-AG-CA 0,00 4,46 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-10-1082: IL-10-592 CA-CC-TC-CC-GG-GG-AG-CA 0,00 4,50 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF2578:VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238:IL-1 B-31: IL-10-1082: IL-10-592 CC-CC-TC-GG-GG-TC-AG-CC 0,00 4,59 0,05 0,00-0,84 0,0047 100,00
VEGF-936:MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:TNF-238:IL-1B-31: IL-4-590 CC-CC-CC-CC-GG-GG-TC-CT 0,00 4,17 0,05 0,00-0,93 0,0029 100,00
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-6-174: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-GG-GG-GC-AG-CA 0,00 4,46 0,05 0,00-0,86 0,0050 100,00
VEGF2578: MMP2-1306: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-TC-TC-AG 0,49 7,08 0,06 0,01-0,52 0,0013 99,51
2012, Т. 14, № 6 Полиморфизм генов регуляции ангиогенеза при СД2
Таблица 2 (продолжение)
Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 ЗД OR OR 95%Cl P(tmF2) Sp
VEGF2578: ММР2-1306:TNF-238: IL-1 В-31: IL-10-1082 CC-TC-GG-TC-AG 0,49 7,08 0,06 0,01-0,52 0,0013 99,51
VEGF-936: ММ Р2-1306: ММР9-1562:1L-10-1082:1L-10-592 CC-TC-CC-AG-CA 0,48 8,04 0,06 0,01-0,44 0,0005 99,52
VEGF-936:MMP2-1306: ММР9-1562:TNF-238: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-GG-AG-CA 0,48 7,14 0,06 0,01-0,51 0,0012 99,52
VEGF2578: VEGF-936: ММ P2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-4-590: IL-6-174 CA-CT-CC-GG-GG-CC-GC 0,00 4,08 0,06 0,00-0,96 0,0033 100,00
VEGF2578: MMP2-1306:TNF-308: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-TC-GG-TC-AG 0,49 6,19 0,07 0,01-0,61 0,0035 99,51
VEGF2578: MMP2-1306: IL-1 B-31: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-TC-AG-CC 0,49 6,19 0,07 0,01-0,61 0,0036 99,51
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-TC-CC-TC-AG 0,48 6,42 0,07 0,01-0,58 0,0028 99,52
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308: IL-4-590:1 L-10-1082 CC-TC-GG-CT-AG 0,49 6,19 0,07 0,01-0,62 0,0037 99,51
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:IL-10-1082:1 L-10-592 CC-TC-GG-AG-CA 0,48 6,19 0,07 0,01-0,61 0,0034 99,52
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:1 L-10-1082:1 L-10-592 CC-CC-TC-GG-AG-CC 0,49 6,25 0,07 0,01-0,61 0,0034 99,51
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238:IL-1 B-31:1 L-10-1082 CC-TC-GG-GG-TC-AG 0,49 6,19 0,07 0,01-0,61 0,0035 99,51
VEGF2578: MMP2-1306:TNF-308: IL-4-590: IL-10-1082: IL-10-592 CA-CC-GG-CC-AG-CC 0,50 6,90 0,07 0,01-0,55 0,0018 99,50
VEGF2578: MMP2-1306:TNF-238: IL-1 B-31: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-GG-TC-AG-CC 0,49 6,19 0,07 0,01-0,61 0,0036 99,51
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-863: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-CC-AG-CA 0,48 6,25 0,07 0,01-0,60 0,0033 99,52
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-308: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-CC-GG-AG-CA 0,48 6,25 0,07 0,01-0,60 0,0033 99,52
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-4-590: IL-10-1082 CC-TC-GG-GG-CT-AG 0,49 6,19 0,07 0,01-0,62 0,0037 99,51
VEGF2578: VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-10-1082: IL-10-592 CC-CC-TC-GG-GG-AG-CC 0,49 6,25 0,07 0,01-0,61 0,0034 99,51
VEGF2578: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-863:TNF-308: IL-1 B-31:1 L-10-592 CA-CC-CC-CC-GG-TC-CC 0,49 6,25 0,07 0,01-0,57 0,0016 99,51
VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-863:1 L-10-592 CC-TC-CC-CC-CA 0,48 6,00 0,08 0,01-0,59 0,0013 99,52
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-863:TNF-308: IL-10-592 CC-TC-CC-GG-CA 0,48 5,45 0,08 0,01-0,66 0,0027 99,52
VEGF2578:MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-308: IL-10-1082: IL-10-592 CA-CC-CC-GG-AG-CC 0,49 6,09 0,08 0,01-0,62 0,0038 99,51
VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-4-590 CC-TC-CC-GG-GG-CT 0,49 6,09 0,08 0,01-0,59 0,0014 99,51
VEGF2578: MM P2-1306:TNF-863:TNF-308: IL-4-590:1 L-10-1082:1 L-10-592 CA-CC-CC-GG-CC-AG-CC 0,50 6,03 0,08 0,01-0,65 0,0045 99,50
VEGF2578: MM P2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-4-590: IL-6-174: IL-10-1082 CA-CC-GG-GG-CC-GC-GG 0,50 6,03 0,08 0,01-0,64 0,0044 99,50
VEGF2578: MM P2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-4-590:1 L-10-1082:1 L-10-592 CA-CC-GG-GG-CC-AG-CC 0,50 6,03 0,08 0,01-0,65 0,0045 99,50
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-1 B-31: IL-4-590:1 L-10-1082 CC-CT-GG-GG-TC-CC-AG 0,49 5,83 0,08 0,01-0,65 0,0045 99,51
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-4-590: IL-6-174: IL-10-592 CC-CC-GG-GG-CT-GG-CC 0,49 5,51 0,08 0,01-0,65 0,0022 99,51
VEGF2578:MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-863:TNF-308:TNF-238:IL-1 B-31:1 L-10-592 CA-CC-CC-CC-GG-GG-TC-CC 0,49 5,47 0,08 0,01-0,66 0,0028 99,51
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308: IL-1 B-31 CT-TC-GG-TC 0,48 5,03 0,09 0,01-0,72 0,0048 99,52
VEGF-936: MMP2-1306: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-TC-TC-AG 0,96 10,00 0,09 0,02-0,40 0,0002 99,04
VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-863:TNF-238: IL-10-592 CC-TC-CC-CC-GG-CA 0,48 5,13 0,09 0,01-0,71 0,0046 99,52
VEGF-936: MMP9-1562:TNF-308: IL-4-590: IL-6-174: IL-10-592 CC-CC-GG-CT-GG-CC 0,49 5,35 0,09 0,01-0,67 0,0044 99,51
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-238: IL-1 B-31: IL-10-1082 CC-TC-GG-TC-AG 0,96 9,09 0,10 0,02-0,45 0,0006 99,04
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-4-590 CC-TC-GG-GG-CT 0,99 8,54 0,11 0,02-0,47 0,0003 99,01
Коненков В. И. и др. Медицинская Иммунология
Таблица 2 (окончание)
Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 ЗД OR OR 95%Cl P(tmF2) Sp
VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308:IL-1 В-31 :IL-10-1082 CC-TC-GG-TC-AG 0,96 8,18 0,11 0,02-0,51 0,0015 99,04
VEGF2578:MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-308:IL-1 В-31 :IL-10-592 CA-CC-CC-GG-TC-CC 0,98 8,17 0,11 0,03-0,49 0,0006 99,02
VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-1 В-31: IL-10-1082 CC-TC-GG-GG-TC-AG 0,96 7,27 0,12 0,03-0,59 0,0038 99,04
VEGF2578: MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-308:TNF-238: IL-1 B-31: IL-10-592 CA-CC-CC-GG-GG-TC-CC 0,98 7,46 0,12 0,03-0,54 0,0010 99,02
VEGF2578:VEGF-936:MMP2-1306:TNF-308:IL-10-1082 CC-CC-TC-GG-AG 0,97 7,14 0,13 0,03-0,61 0,0044 99,03
VEGF2578: VEGF-936:MMP2-1306: IL-10-1082: IL-10-592 CC-CC-TC-AG-CC 0,98 7,14 0,13 0,03-0,61 0,0045 99,02
VEGF-936: M M P2-1306: TN F-238:1L-4-590:1L-10-1082 CC-TC-GG-CT-AG 0,99 7,08 0,13 0,03-0,63 0,0050 99,01
VEGF-936:MMP2-1306:TNF-238: IL-10-1082: IL-10-592 CC-TC-GG-AG-CA 0,97 7,08 0,13 0,03-0,61 0,0045 99,03
VEGF2578: VEGF-936: MM P2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-10-1082 CC-CC-TC-GG-GG-AG 0,97 7,14 0,13 0,03-0,61 0,0044 99,03
VEGF2578: VEGF-936: MM P2-1306:TNF-238:1 L-10-1082: IL-10-592 CC-CC-TC-GG-AG-CC 0,98 7,14 0,13 0,03-0,61 0,0045 99,02
VEGF-936:MMP9-1562:TNF-308:TNF-238:IL-1 B-31 :IL-4-590 CC-CC-GG-GG-TC-CT 0,97 7,08 0,13 0,03-0,56 0,0015 99,03
VEGF-936: M MP2-1306: MMP9-1562:TNF-238: IL-1 B-31:1 L-4-590:1 L-10-1082 CC-CC-CC-GG-TT-CC-AG 0,99 7,34 0,13 0,03-0,60 0,0042 99,01
VEGF-936: MMP2-1306: MMP9-1562:TNF-308:IL-4-590 CC-TC-CC-GG-CT 0,99 6,44 0,14 0,03-0,65 0,0035 99,01
VEGF2578:MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-863:IL-1 B-31: IL-10-592 CA-CC-CC-CC-TC-CC 0,98 6,73 0,14 0,03-0,61 0,0035 99,02
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-863:TNF-308:1 L-10-1082: IL-10-592 CA-CC-CC-GG-AG-CC 1,46 8,62 0,16 0,04-0,58 0,0028 98,54
VEGF2578: MMP2-1306:TNF-308: IL-10-1082: IL-10-592 CA-CC-GG-AG-CC 1,95 10,34 0,17 0,05-0,55 0,0020 98,05
VEGF-936: M MP2-1306: MM P9-1562:TNF-863:TNF-308:1 L-1 B-31: IL-10-592 CC-CC-CC-CC-GG-TC-CC 1,45 7,69 0,18 0,05-0,62 0,0029 98,55
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238:1 L-10-1082: IL-10-592 CA-CC-GG-GG-AG-CC 1,95 9,48 0,19 0,06-0,61 0,0041 98,05
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:IL-1B-31 :IL-4-590:IL-6-174 CA-CC-GG-TC-CC-GC 1,50 7,48 0,19 0,05-0,66 0,0040 98,50
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-1 B-31: IL-6-174 CC-CC-GG-GG-TC-GG 1,44 7,29 0,19 0,05-0,65 0,0050 98,56
VEGF2578:MMP2-1306:MMP9-1562:IL-1 B-31:1 L-10-592 CA-CC-CC-TC-CC 1,95 8,65 0,21 0,07-0,63 0,0034 98,05
VEGF2578: MMP2-1306:TNF-308: IL-1 B-31: IL-10-592 CA-CC-GG-TC-CC 2,44 10,33 0,22 0,08-0,58 0,0011 97,56
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-863:TNF-308:IL-1 B-31:1 L-10-592 CA-CC-CC-GG-TC-CC 1,95 8,45 0,22 0,07-0,65 0,0036 98,05
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238:IL-1 B-31: IL-10-592 CA-CC-GG-GG-TC-CC 2,44 9,71 0,23 0,09-0,63 0,0031 97,56
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562: IL-10-1082 CC-TC-CC-AG 3,83 14,29 0,24 0,10-0,58 0,0013 96,17
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-863:TNF-308: IL-1 B-31:1 L-10-592 CC-CC-CC-GG-TC-CC 2,90 10,66 0,25 0,10-0,63 0,0023 97,10
VEGF-936: MMP2-1306:MMP9-1562:TNF-238: IL-10-1082 CC-TC-CC-GG-AG 3,83 13,39 0,26 0,11-0,63 0,0026 96,17
VEGF-936: MMP2-1306: IL-10-1082 CC-TC-AG 7,18 20,35 0,30 0,15-0,61 0,0009 92,82
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308: IL-10-1082 CC-TC-GG-AG 5,74 16,81 0,30 0,14-0,65 0,0024 94,26
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-238: IL-10-1082 CC-TC-GG-AG 6,70 19,47 0,30 0,15-0,61 0,0008 93,30
VEGF-936: MMP2-1306:TNF-308:TNF-238: IL-10-1082 CC-TC-GG-GG-AG 5,74 15,93 0,32 0,15-0,69 0,0043 94,26
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:IL-4-590: IL-6-174 CA-CC-GG-CC-GC 5,00 13,70 0,33 0,16-0,70 0,0026 95,00
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:TNF-238:1 L-4-590: IL-6-174 CA-CC-GG-GG-CC-GC 4,50 12,26 0,34 0,15-0,74 0,0047 95,50
VEGF2578:MMP2-1306:TNF-308:IL-1 B-31 CA-CC-GG-TC 6,80 16,20 0,38 0,20-0,72 0,0035 93,20
4^
40
2012, Т. 14, № 6 Полиморфизм генов регуляции ангиогенеза при СД2
Коненков В.И. и др.
Медицинская Иммунология
ТАБЛИЦА 3. РАЗЛИЧИЯ В ЧАСТОТЕ ВЫЯВЛЕНИЯ ГЕНОТИПОВ ОТДЕЛЬНЫХ ФАКТОРОВ РЕГУЛЯЦИИ АНГИОГЕНЕЗА
в составе комплексных генетических признаков, позитивно и негативно ассоциированных с развитием сд2
Полиморфизмы Позитивные Негативные P(tmF2)
N n % N n %
VEGF-2578 45 25 55,56 97 47 48,45
CC 25 0 0,00 47 20 42,55 0,0001
CA 25 24 96,00 47 27 57,45 0,0004
AA 25 1 4,00 47 0 0,00
VEGF-936 45 30 66,67 97 70 72,16
CC 30 30 100,00 70 64 91,43
CT 30 0 0,00 70 6 8,57
TT 30 0 0,00 70 0 0,00
MMP2-1306 45 10 22,22 97 92 94,85 0,0001
TT 10 1 10,00 92 0 0,00
TC 10 0 0,00 92 60 65,22 0,0001
CC 10 9 90,00 92 32 34,78 0,0011
MMP9-1562 45 36 80,00 97 39 40,21 0,0001
CC 36 34 94,44 39 38 97,44
CT 36 2 5,56 39 1 2,56
TT 36 0 0,00 39 0 0,00
TNF-863 45 10 22,22 97 18 18,56
CC 10 9 90,00 18 18 100,00
CA 10 1 10,00 18 0 0,00
AA 10 0 0,00 18 0 0,00
TNF-308 45 19 42,22 97 61 62,89 0,0288
GG 19 9 47,37 61 61 100,00 0,0001
GA 19 10 52,63 61 0 0,00 0,0001
AA 19 0 0,00 61 0 0,00
TNF-238 45 18 40,00 97 43 44,33
GG 18 18 100,00 43 43 100,00
GA 18 0 0,00 43 0 0,00
AA 18 0 0,00 43 0 0,00
IL-1B-31 45 4 8,89 97 43 44,33 0,0001
TT 4 2 50,00 43 4 9,30
TC 4 0 0,00 43 39 90,70 0,0004
CC 4 2 50,00 43 0 0,00 0,0056
IL-4-590 45 17 37,78 97 23 23,71
CC 17 13 76,47 23 11 47,83
CT 17 4 23,53 23 12 52,17
TT 17 0 0,00 23 0 0,00
IL-6-174 45 12 26,67 97 18 18,56
GG 12 11 91,67 18 3 16,67 0,0001
GC 12 1 8,33 18 15 83,33 0,0001
CC 12 0 0,00 18 0 0,00
IL-10-1082 45 28 62,22 97 66 68,04
AA 28 28 100,00 66 0 0,00 0,0001
AG 28 0 0,00 66 65 98,48 0,0001
GG 28 0 0,00 66 1 1,52
IL-10-592 45 11 24,44 97 52 53,61 0,0012
CC 11 9 81,82 52 30 57,69
CA 11 2 18,18 52 22 42,31
AA 11 0 0,00 52 0 0,00
Примечание. N - общее количество комбинаций или генотипов; n - количество конкретных генотипов среди комбинаций генотипов; % - частота встречаемости генотипов; P(tmF2) - значения P разности частот встречаемости генотипов в группах сравнения по двустороннему варианту точного метода Фишера.
498
2012, Т. 14, № 6
Полиморфизм генов регуляции ангиогенеза при СД2
ированных генетических признаков преобладает вариант GC.
Еще большие различия между группами позитивно и негативно ассоциированных с СД2 генетических комбинированных признаков установлены для гена IL-10. Преобладание гомозиготного варианта СС для полиморфизма в точке -592 в первой группе, сменяется равным представительством генотипов СС и Ж1, тогда как для полиморфизма этого гена в позиции -1082 установлена полная инверсия с 100% преобладанием гомозиготного варианта АА в первой группе на 100% преобладание гетерозиготного варианта AG в группе негативно ассоциированных с СД2 генетических признаков.
Обсуждение
Общей закономерностью, установленной после анализа этих данных может являться заключение о том, что в целом характер распределения (частоты встречаемости) генотипов анализируемых генов, связанных с ремоделированием сосудистой системы, в группе негативно ассоциированных с развитием СД2 генетических комбинаций, гораздо ближе к их распределению в группе здоровых лиц, по сравнению с группой позитивно ассоциированных с СД2 признаков. В составе генетических комбинаций, ассоциированных с СД2, присутствует большое число гомозиготных вариантов генов цитокинов, влияющих на уровень экспрессии их продуктов и, тем самым, определяющих особенности течения воспалительных процессов и состояние ангиогенеза. Об этом свидетельствую данные, широко опубликованные нами в литературе за последние годы [3, 4, 6, 7]. Это подтверждает наше заключение о том, что наибольшие изменения в геноме ангиогенных факторов характерны для лиц, конституционально предрасположенных к развитию СД2, что делает этих лиц чрезвычайно чувствительными к провоцирующим факторам внешней среды при развитии этого заболевания с выраженной склонностью к быстрому формированию сосудистой патологии.
При анализе данных первых двух таблиц обращает на себя внимание их верхние строки в которых содержится информация о тех комбинированных генетических признаках, которые полностью отсутствуют в сопоставляемых группах здоровых и больных СД2. Для этих данных характерны и максимальные значения показателей отношения шансов и 100% специфичности признаков. Если эти результаты найдут свое подтверждение в расширенных многоцентровых исследованиях, можно судить о наличии генетических признаков с высокой достоверностью стратифицирующих популяцию жителей страны
на лиц у которых конституционально, с рождения, присутствует высокий риск развития СД2 и группу лиц с врожденной устойчивостью к развитию этого тяжелого заболевания. Представители первой группы должны с детства входить в группы высокого риска развития заболевания и являться объектом диспансерного наблюдения для снижения риска развития болезни.
Список литературы
1. Вейр Б. Анализ генетических данных. Дискретные генетические признаки. Пер. с англ. — М.: Мир, 1995. — 400 с.
2. Гланц С. Медико-биологическая статистика. Пер. с англ. — М.: Практика, 1998. — 459 с.
3. Коненков В.И., Голованова О.В., Прокофьев В.Ф., Шевченко А.В., Зонова Е.В., Королев М.А., Леонова Ю.Б., Халайджи Н.А., Лапси-на С.А. Распределение аллельных вариантов промоторных участков генов цитокинов и гена фактора роста сосудистого эндотелия среди здоровых людей и пациентов с ревматоидным артритом в популяции европеоидного населения России // Вестник РАМН . - 2010. - № 9. - С. 9-14.
4. Коненков В.И., Прокофьев В.Ф., Шевченко А.В., Голованова О.В. Полиморфизм генов цитокинов как один из факторов демографической структуры европеоидного населения Сибири // Иммунология. — 2011. — № 2. — С. 60-65.
5. Повещенко А.Ф., Коненков В.И. Механизмы и факторы ангиогенеза // Успехи физиологических наук. - 2010. - Т. 41, № 2. - С. 68-89.
6. Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И. Особенности полиморфизма промоторных регионов генов цитокинов IL1, IL4, IL5, IL6, IL10 и TNFa европеоидного населения Западной Сибири // Иммунология. - 2010. - № 4. - С. 176181.
7. Шевченко А.В., Голованова О.В., Коненков В.И., Толкачева О.М., Максимов В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Анализ полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ-2 и -9 у пациентов с ишемической болезнью сердца // Терапевтический архив. - 2010. - T. 82, № 1. - С. 31-35.
8. Awata T, Inoue K., Kurihara S. A common polymorphism in the 5'-untranslated region of the VEGF gene is associated with diabetic retinopathy in type 2 diabetes // Diabetes. - 2002. - N 51. -P. 1635-1639.
9. Banyasz I., Szabo S., Bokodi G., Vrnnay A., Vasarhelyi B., Szabo A., Tulassay T., Rigo J. Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor in severe preeclampsia // Mol. Hum. Reprod. -2006. - Vol. 12 (4). - P. 233-236.
10. Houck K.A. The vascular endothelial growth factor family: identification of a fourth molecular
499
Коненков В.И. и др.
Медицинская Иммунология
species and characterization of alternative splicing of RNA // Mol. Endocrinol. - 1991. - N 5. - P. 18061814.
11. Kim J.K., Oh D., Kwak S.Y., Han J.H., Chung YS., Kim N.K. Genetic Polymorphism of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF C936T) in the Korean Population // Korean J. Biol. Sci. — 2003. - Vol. 7. - P. 261-264.
12. Kondapaka S.B., Fridman R., Reddy K.B. Epidermal growth factor and amphiregulin up-regulate matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) in human breast cancer cells // Int. J. Cancer. - 1997. -N 70. - P. 722-726.
13. Krippl P., Langsenlehner U., Renner W A common 936C/T gene polymorphism of vascular endothelial growth factor is associated with decreased breast cancer risk // Int. J. Cancer. - 2003. - N 106. -P. 468-471.
14. Lamblin N., Bauters Ch., Hermant X., Lablanche J.M., Helbecque N., Amouyel P. Polymorphisms in the Promoter Regions of MMP-2, MMP-3, MMP-9 and MMP-12 Genes as Determinants of Aneurysmal Coronary Artery Disease // J. Am. Coll. Cardiol. - 2002. - №40(1). -P. 43-48.
15. Zhang B., Ye S., Herrmann S.M., Eriksson P., de Maat M., Evans A., Arveiler D., Luc G., Cambien F., Hamsten A., Watkins H., Henney A.M. Functional polymorphism in the regulatory region of gelatinase B gene in relation to severity of coronary atherosclerosis // Circulation. - 1999. - N 99 (14). -P. 1788-1794.
поступила в редакцию 09.06.2012 отправлена на доработку 18.06.2012 принята к печати 22.06.2012
500
