Научная статья на тему 'Генетическая структура популяций крапчатого суслика (spermophilussuslicus Güld. ) в среднем Поволжье по данным анализа яДНК'

Генетическая структура популяций крапчатого суслика (spermophilussuslicus Güld. ) в среднем Поволжье по данным анализа яДНК Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
194
23
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
КРАПЧАТЫЙ СУСЛИК / ЯДЕРНАЯ ДНК / ГЕН P53 / УЛЬЯНОВСКАЯ ОБЛАСТЬ / SPOTTED GROUND SQUIRREL / NUCLEAR DNA / GENE P53 / ULYANOVSK REGION

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Закс Светлана Сергеевна, Кузьмин Антон Алексеевич, Титов Сергей Витальевич

Актуальность и цели. Изучение популяционного полиморфизма у видов животных, имеющих широкое распространение, было и остается одной из актуальных задач популяционной экологии. Особенно такие исследования необходимы при изучении ареалов видов, резко сокращающих свою численность или находящихся в долговременном депрессивном состоянии. Целью исследования было изучение уровня генетического полиморфизма особей в современных популяциях крапчатого суслика ( Sреrmорhilus susliсus Güld.), обнаруженных на территории Ульяновской области, с использованием молекулярно-генетического маркера яДНК 6 интрона гена р53. Материалы и методы. Была исследована генетическая структура 24 популяций крапчатого суслика, обнаруженных на территории Ульяновской области. Обобщенная выборка составила 203 особи. Были использованы специфические для сусликов праймеры, применяемые для амплификации фрагментов интрона 6 гена p53. Генетическую структуру популяций описывали по четырем показателям: по доле аллелей гена в поселении, уровню гетерозиготности, соотношению Харди Вайндберга, индексам фиксации (F-статистика) при использовании программы Аrlеquin vеr. 3.1 и пакета программ Stаtistiса fоr Windоws. Результаты. При анализе фрагментов 6 интрона гена р53 были обнаружены две различные по массе аллели. Исследования аллельного разнообразия 24 популяций крапчатого суслика в Ульяновской области выявили частотное преобладание аллели S1 интрона 6 гена р53. В обобщенной выборке ( n = 202) частота этой аллели составила 0,693, при этом проведенный c2-тест ожидаемых и наблюдаемых частот генотипов (S1/S1, S1/S2, S2/S2) не выявил расхождений от теоретической модели их распределения (1,723, df = 2, p = 0,423). В целом полученные результаты подтверждают выявленную ранее метапопуляционную структуру. Выводы. Анализ частот генотипов по использованному ядерному генетическому маркеру как в случае сравнения отдельных популяций, так и в случае с обобщенной выборкой свидетельствует о том, что в этих популяциях автономные генетические процессы проходят в соответствии с законом Харди Вайнберга, и, следовательно, в них отсутствуют какие-либо признаки действия отбора. Наблюдаемая разобщенность популяций крапчатых сусликов связана с географическими барьерами. Она проявляется в метапопуляционной структуре восточной части ареала этого вида и подтверждается генетическими данными по аллельному распределению интрона 6 гена р53.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Закс Светлана Сергеевна, Кузьмин Антон Алексеевич, Титов Сергей Витальевич

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

GENETIC STRUCTURE OF SPOTTED GROUND SQUIRREL POPULATIONS (SPERMOPHILUS SUSLICUS GÜLD.) IN MIDDLE VOLGA REGION ACCORDING TO NDNA ANALYSIS DATA

Background. The study of population polymorphism in wide spread animal species has always been one of topical tasks of population ecology. Such researches are especially important when studying habitats of species that rapidly decrease in numbers or have long-term depressive statements. The goal of the research work is to study genetic polymorphism levels of individuals in living populations of Spotted Ground Squirrel ( Spermophilus suslicus Güld.), found in the territory of Ulyanovsk region, using nuclear DNA locus intron 6 gene p53. Materials and methods. The genetic structure of 24 local spotted souslik populations in the territory of Ulyanovsk region was studied. The total sample size 203 individuals. Specific primers for ground squirrels applicable for intron 6 gene p53 amplification were used. The genetic structure of populations was described by 4 parameters: percentage of gene’s alleles in a population, heterozygosity level, Hardy Weinberg equilibrium, fixation indices (F-statistics) using Arlequin ver. 3.1 and Statistica for Windows software. Results. During the analysis of intron 6 gene p53 fragments two alleles with different masses were detected. The study of allelic diversity of 24 populations of spotted souslik in Ulyanovsk region has revealed frequency predominance of the S1 allele. In the total sample ( n = 202) the frequency of S1-allele was 0,693. Herewith the c2-test of expected and observed genotypes’ frequencies (S1/S1, S1/S2, S2/S2) hasn’t revealed any deviations from a theoretical model of their distribution (1,723, df = 2, p = 0,423). The obtained results confirm the metapopulation structure revealed earlier. Conclusions. The analysis of genotypes’ frequencies according to the used nDNA locus between populations as well as the whole data shows that autonomous genetic processes correspond to the Hardy Weinberg’s law. Consequently, there is no selection in these populations. The observed dissociation of populations is reasoned by geographical barriers. It displays itself in the metapopulation structure of the eastern part of specie’s habitat and is confirmed by genetic data according to intron 6 gene p53 allelic distribution.

Текст научной работы на тему «Генетическая структура популяций крапчатого суслика (spermophilussuslicus Güld. ) в среднем Поволжье по данным анализа яДНК»

БИОЛОГИЯ

УДК 591.557:599.322.2

DOI: 10.21685/2307-9150-2016-4-1

С. С. Закс, А. А. Кузьмин, С. В. Титов

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ПОПУЛЯЦИЙ КРАПЧАТОГО СУСЛИКА (SPERMOPHILUS SUSLICUS GÜLD.) В СРЕДНЕМ ПОВОЛЖЬЕ ПО ДАННЫМ АНАЛИЗА яДНК1

Аннотация.

Актуальность и цели. Изучение популяционного полиморфизма у видов животных, имеющих широкое распространение, было и остается одной из актуальных задач популяционной экологии. Особенно такие исследования необходимы при изучении ареалов видов, резко сокращающих свою численность или находящихся в долговременном депрессивном состоянии. Целью исследования было изучение уровня генетического полиморфизма особей в современных популяциях крапчатого суслика (Spermophilus suslicus Güld.), обнаруженных на территории Ульяновской области, с использованием молекулярно-генетического маркера яДНК - 6 интрона гена р53.

Материалы и методы. Была исследована генетическая структура 24 популяций крапчатого суслика, обнаруженных на территории Ульяновской области. Обобщенная выборка составила 203 особи. Были использованы специфические для сусликов праймеры, применяемые для амплификации фрагментов интрона 6 гена p53. Генетическую структуру популяций описывали по четырем показателям: по доле аллелей гена в поселении, уровню гетерозиготности, соотношению Харди - Вайндберга, индексам фиксации (F-статистика) при использовании программы Arlequin ver. 3.1 и пакета программ Statistica for Windows.

Результаты. При анализе фрагментов 6 интрона гена р53 были обнаружены две различные по массе аллели. Исследования аллельного разнообразия 24 популяций крапчатого суслика в Ульяновской области выявили частотное преобладание аллели S1 интрона 6 гена р53. В обобщенной выборке (n = 202) частота этой аллели составила 0,693, при этом проведенный %2-тест ожидаемых и наблюдаемых частот генотипов (S1/S1, S1/S2, S2/S2) не выявил расхождений от теоретической модели их распределения (1,723, df= 2, p = 0,423). В целом полученные результаты подтверждают выявленную ранее метапопу-ляционную структуру.

Выводы. Анализ частот генотипов по использованному ядерному генетическому маркеру как в случае сравнения отдельных популяций, так и в случае с обобщенной выборкой свидетельствует о том, что в этих популяциях автономные генетические процессы проходят в соответствии с законом Харди -Вайнберга, и, следовательно, в них отсутствуют какие-либо признаки действия отбора. Наблюдаемая разобщенность популяций крапчатых сусликов связана с географическими барьерами. Она проявляется в метапопуляционной струк-

1 Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках науч-

ного проекта № 16-34-60059 мол_а_дк и проекта №14-04-00301 а (исследования в 2014-2015 гг.).

туре восточной части ареала этого вида и подтверждается генетическими данными по аллельному распределению интрона 6 гена р53.

Ключевые слова: крапчатый суслик, ядерная ДНК, ген p53, Ульяновская область.

S. S. Zaks, A. A. Kuzmin, S. V. Titov

GENETIC STRUCTURE OF SPOTTED GROUND SQUIRREL POPULATIONS (SPERMOPHILUS SUSLICUS GULD.) IN MIDDLE VOLGA REGION ACCORDING TO nDNA ANALYSIS DATA

Abstract.

Background. The study of population polymorphism in wide spread animal species has always been one of topical tasks of population ecology. Such researches are especially important when studying habitats of species that rapidly decrease in numbers or have long-term depressive statements. The goal of the research work is to study genetic polymorphism levels of individuals in living populations of Spotted Ground Squirrel (Spermophilus suslicus Guld.), found in the territory of Ulyanovsk region, using nuclear DNA locus - intron 6 gene p53.

Materials and methods. The genetic structure of 24 local spotted souslik populations in the territory of Ulyanovsk region was studied. The total sample size -203 individuals. Specific primers for ground squirrels applicable for intron 6 gene p53 amplification were used. The genetic structure of populations was described by 4 parameters: percentage of gene's alleles in a population, heterozygosity level, Hardy - Weinberg equilibrium, fixation indices (F-statistics) using Arlequin ver. 3.1 and Statistica for Windows software.

Results. During the analysis of intron 6 gene p53 fragments two alleles with different masses were detected. The study of allelic diversity of 24 populations of spotted souslik in Ulyanovsk region has revealed frequency predominance of the S1 al-lele. In the total sample (n = 202) the frequency of Sl-allele was 0,693. Herewith the %2-test of expected and observed genotypes' frequencies (Sl/Sl, S1/S2, S2/S2) hasn't revealed any deviations from a theoretical model of their distribution (1,723, df = 2, p = 0,423). The obtained results confirm the metapopulation structure revealed earlier.

Conclusions. The analysis of genotypes' frequencies according to the used nDNA locus between populations as well as the whole data shows that autonomous genetic processes correspond to the Hardy - Weinberg's law. Consequently, there is no selection in these populations. The observed dissociation of populations is reasoned by geographical barriers. It displays itself in the metapopulation structure of the eastern part of specie's habitat and is confirmed by genetic data according to intron 6 gene p53 allelic distribution.

Key words: spotted ground squirrel, nuclear DNA, gene p53, Ulyanovsk region.

Изучение популяционного полиморфизма у видов животных, имеющих широкое распространение, было и остается одной из актуальных задач попу-ляционной экологии [1]. Изучение динамики ареала во времени и пространстве с привлечением данных о генетической структуре популяций, кроме выявления причин таких хорологичеких изменений, позволяет составить прогноз развития ситуации на будущее. Особенно это важно при исследовании ареалов видов, резко сокращающих свою численность или находящихся

в долговременном депрессивном состоянии и требующих проведения охранных мероприятий [2]. Именно к таким видам млекопитающих относится крапчатый суслик (БрегторНИш .ъшИеш ОиЫ.), включенный в Красные книги большинства субъектов Поволжского региона [3-7], а также в Красную книгу Международного союза охраны природы (МСОП) (http://www.iucnredlist.org/ details/20492/0).

Целью исследования было изучение уровня генетического полиморфизма особей в современных популяциях крапчатого суслика, обнаруженных на территории Ульяновской области, с использованием молекулярно-генети-ческого маркера яДНК - 6 интрона гена р53.

Материалы и методы

Материал для работы был собран в ходе проведения экспедиционных работ в период 2014-2016 гг. в Ульяновской области. Была исследована генетическая структура 24 популяций крапчатого суслика, обнаруженных на территории Ульяновской области. Обобщенная выборка составила 202 особи (табл. 1). В молекулярно-генетическом анализе были использованы выборки всех географически разобщенных популяций, а в статистическую обработку полученных данных были вовлечены только те из них, у которых величина выборки превышала три особи (п = 15).

Таблица 1

Исследованные на аллельное разнообразие интрона 6 гена р53 популяции крапчатого суслика в Ульяновской области

Выявленные

Популяция N Адрес поселения генотипы

S1/S1 S1/S2 S2/S2

1 2 3 4 5 6

1. Беловодье 3 Окр-ти с. Беловодье, Карсунский р-н, 54°15' с.ш., 46°39' в.д. 2 1 0

2. Белозерье 2 Окр-ти с. Белозерье, Карсунский р-н, 54°16' с.ш., 47°16' в.д. 2 0 0

3. Бестужевка 2 Окр-ти с. Бестужевка, Кузоватовский р-н, 53°44' с.ш., 47°38' в.д. 2 0 0

4. Волчанка 3 Окр-ти с. Волчанка, Радищевский р-н, 53°00' с.ш., 47°10' в.д. 1 2 0

5. Вязовка 4 Окр-ти с. Вязовка, Радищевский р-н, 52°54' с.ш., 48°22' в.д. 4 0 0

6. Загоскино 2 Окр-ти с. Загоскино, Майнский р-н, 53°53' с.ш., 47°38' в.д. 0 2 0

7. Зыково 4 Окр-ти с. Зыково, Новоспасский р-н, 53°04' с.ш., 47°46' в.д. 2 1 1

8. Красноборск 5 Окр-ти пос. Красноборск, 53°45' с.ш., 48°02' в.д. 2 2 1

9. Николаевка 38 Окр-ти пос. Николаевка, Николаевский р-н, 53°07' с.ш., 47° 19' в.д. 24 14 0

Окончание табл. 1

1 2 3 4 5 6

10. Новое Погорелово 5 Окр-ти с. Новое Погорелово, Вешкаймский р-н, 54°09' с.ш., 46°50' в.д. 2 1 2

11. Русские Горенки 8 Окр-ти с. Русские Горенки, Карсунский р-н, 54°15' с.ш., 46°44' в.д. 5 1 2

12. Сарым 2 Ур. Сарым, Теренгульский р-н, 53°36' с.ш., 48°19' в.д. 0 1 1

13. Смышляевка 79 Окр. с. Смышляевка, Кузоватовский р-н, 53°45' с.ш., 47°44' в.д. 20 44 15

14. Соловчиха 2 Окр-ти с. Соловчиха, Радищевский р-н, 52°58' с.ш., 47°48' в.д. 2 0 0

15. Старая Ярыкла 2 Окр-ти с. Старая Ярыкла, Теренгульский р-н, 53°41' с.ш., 47°58' в.д. 2 0 0

16. Студенец 2 Окр-ти ст. Студенец, Кузоватовский р-н, 53°25' с.ш., 47°58' в.д. 2 0 0

17. Сухаревка 3 Окр-ти с. Сухаревка, Майнский р-н, 53°58' с.ш., 47°47' в.д. 3 0 0

18. Сухая Терешка 1 Окр-ти с. Сухая Терешка, Николаевский р-н, 52°59' с.ш., 47°29' в.д. 1 0 0

19. Тимерсяны 10 Окр-ти с. Нижние Тимерсяны, Цильнинский р-н, 54°33' с.ш., 47°48' в.д. 7 3 0

20. Трубетчина 7 Окр-ти с. Трубетчина, Кузоватовский р-н, 53°38' с.ш., 47°52' в.д. 5 2 0

21. Урено-Карлинское 6 Окр-ти с. Урено-Карлинское, Карсунский р-н, 54°15' с.ш., 47°15' в.д. 3 2 1

22. Чувашская Кулатка 1 Окр-ти с. Чувашская Кулатка, Старо-кулатский р-н, 52°43' с.ш., 47°43' в.д. 1 0 0

23. Шевченко 5 Окр-ти пос. Шевченко, Радищевский р-н, 52°53' с.ш., 48°11' в.д. 3 2 0

24. Элита 6 Окр-ти пос. Элита, Сурский р-н, 54°28' с.ш., 46°51' в.д. 6 0 0

Всего: 202 101 78 23

Молекулярно-генетические исследования проведены на базе лаборатории молекулярной экологии и систематики животных кафедры зоологии и экологии Пензенского государственного университета.

ДНК выделяли из образцов печени или когтевых фаланг пальцев, зафиксированных в этаноле (96 %). Предварительно гомогенизировав, небольшие кусочки ткани (около 50 мг) инкубировали в течение 6-12 ч в смеси, включающей 0,5 мл буфера STE, 50 мкл 10 %-го додецилсульфата натрия (SDS) и 17 мкл протеиназы К, при 50 °C с последующей фенольной экстракцией [8].

Полимеразную цепную реакцию (PCR) проводили в 25 мкл реакционной смеси, содержащей 50 мМ Трис-HCl (pH 8,9), 20 мМ сульфата аммония, 20 мкМ ЭДТА, 170 мкг/мл бычьего сывороточного альбумина (BSA), смесь

дезоксинуклеозидтрифосфатов (200 мкМ каждого из них), 2 мМ хлористого магния, 0,6 мкМ каждого из праймеров, 0,1-0,2 мкг ДНК и 2 ед. акт. Taq-полимеразы. Реакцию проводили при условиях - 94 °С - 1 мин, 60 °С -1 мин (отжиг), 72 °С - 1-3 мин (30 циклов). В работе были использованы специфические для сусликов праймеры, применяемые для амплификации фрагментов интрона 6 гена p53: Sp53 6D - 5'-gactggaagggattgtcattg-3' и Sp53 6R -5'-cactggcctaacatatgtgag-3' [9]. Впоследствии полученные таким образом PCR-продукты были подвергнуты электрофоретическому разделению в 6 %-м по-лиакриламидном геле (ПААГ) с целью выявления аллельного состава генотипа для каждого образца.

Генетическую структуру популяций описывали по четырем статическим и динамическим показателям: 1) доле аллелей гена в поселении. Принимали как показатель генетического разнообразия; 2) уровню гетерозиготно-сти. Вычисляли в ходе проведения простейших статистических процедур и при использовании программы Arlequin ver. 3.1; 3) соответствию наблюдаемого соотношения генотипов с теоретически ожидаемым (соотношение Харди - Вайндберга). Выявляли с помощью проведения простейших статистических процедур (%2-тест) и при использовании программы Arlequin ver. 3.1; 4) индексам фиксации (F-статистика). При использовании программы Arlequin ver. 3.1 вычисляли значения иерархических коэффициентов F, с помощью которых выявляли метапопуляционную структуру восточной части ареала крапчатого суслика.

Достоверность различий параметрических показателей оценивалась по критерию Стьюдента при пороговом значении p < 0,05, а непараметрических - с помощью %2-теста. При обработке многомерных показателей был использован пакет программ Statistica for Windows.

Результаты и обсуждение

При анализе полученных в ходе проведения амплификации и гель-электрофореза фрагментов 6 интрона гена р53 образцов, использованных в исследовании, было обнаружено, как показывают фореграммы, две различные по массе аллели (рис. 1). Различия в массах обнаруженных аллель-ных фрагментов 6 интрона гена р53 по данным секвенирования связаны с различной длиной так называемого ID-повтора (поли-Т-хвоста) характерного для грызунов.

Рис. 1. Выявленные у крапчатого суслика аллели (81,82) 6 интрона гена р53: А - гомозиготные и гетерозиготный варианты генотипов; Б - выявленные различия в длине ГО-повтора в аллелях

Исследования аллельного разнообразия 24 популяций крапчатого суслика в Ульяновской области выявили частотное преобладание аллели S1 интрона 6 гена р53 (табл. 1). В обобщенной выборке (n = 202) частота этой аллели составила 0,693, тогда как для второй аллели (S2) этот показатель оказался значительно ниже по своему значению - 0,307. При этом проведенный %2-тест ожидаемых и наблюдаемых частот генотипов (S1/S1, S1/S2, S2/S2) не выявил расхождений от теоретической модели их распределения (1,723, df = 2, p = 0,423).

Анализ генетической структуры локальных популяций S. suslicus показал, что в 17 из 24 популяций не обнаружен генотип S2/S2, в 10 не было обнаружено гетерозигот (S1/S2), а только в 6 присутствуют особи всех возможных вариантов генотипов. При этом, как и в случае с обобщенной выборкой, проведенный %2-тест ожидаемых и наблюдаемых частот генотипов не выявил различий (0,118^4,016, df = 2, p = 0,134^0,943) в 15 подлежащих этому анализу популяциях (табл. 2).

Таблица 2

Частоты аллелей 6 интрона гена р53 в популяциях (n > 3) крапчатого суслика из Ульяновской области и достоверность результатов %2-теста ожидаемых и наблюдаемых частот генотипов в них: номера популяций соответствуют порядковым в таблице локалитетов (см. табл. 1)

Популяция N Частота аллелей Результаты %2-теста ожидаемых и наблюдаемых частот генотипов

S1 S2

1. Беловодье 3 0,833 0,167 0,118, df = 2, p = 0,943

4. Волчанка 3 0,667 0,333 0,759, df = 2, p = 0,684

5. Вязовка 4 1,000 0,000 -

7. Зыково 4 0,625 0,375 0,882, df = 2, p = 0,643

8. Красноборск 5 0,600 0,400 0,139, df = 2, p = 0,933

9. Николаевка 38 0,816 0,184 1,945, df = 2, p = 0,378

10. Новое Погорелово 5 0,500 0,500 1,800, df = 2, p = 0,407

11. Русские Горенки 8 0,688 0,312 4,016, df = 2, p = 0,134

13. Смышляевка 79 0,538 0,462 1,135, df = 2, p = 0,567

17. Сухаревка 3 1,000 0,000 -

19. Тимерсяны 10 0,850 0,150 0,307, df = 2, p = 0,858

20. Трубетчина 7 0,857 0,143 0,189, df = 2, p = 0,910

21. Урено-Карлинское 6 0,667 0,333 0,384, df = 2, p = 0,825

23. Шевченко 5 0,800 0,200 0,313, df = 2, p = 0,855

24. Элита 6 1,000 0,000 -

Таким образом, анализ частот генотипов интрона 6 гена р53, как в случаях сравнения отдельных популяций, так и в случае с обобщенной выборкой, свидетельствует о том, что в этих популяциях автономные генетические процессы проходят в соответствии с законом Харди - Вайнберга, и, следовательно, в них отсутствуют какие-либо признаки действия отбора.

Выявленная по данным анализа митохондриальной ДНК метапопуля-ционная структура ареалов видов наземных беличьих, обитающих на территории Ульяновской области, подтверждается для крапчатого суслика результатами анализа генетической структуры его ареала по ядерному маркеру -интрону 6 гена р53 [10, 11].

Проведенный анализ соответствия соотношения наблюдаемых частот генотипов интрона 6 гена р53 (81/81, 81/82, 82/82) к теоретически ожидаемым значениям в пяти метапопуляционных группировках (рис. 2) выявил достоверные отличия только по Северо-Западной (Присурской) метапопуляции (%2 = 10,445, df = 2, р = 0,005). Это, возможно, указывает на действие отбора или проявления деструктивных процессов в популяции, связанных в первую очередь с падением численности особей в локальных популяциях. В остальных метапопуляциях (Южной (Сызранской), Восточной (Приволжской), Центральной и Северной) автономные генетические процессы проходят в соответствии с законом Харди - Вайнберга, и, следовательно, в них отсутствуют какие-либо признаки действия отбора (%2 = 0,201^1,655, df = 2, р = 0,437^0,905).

Выделение указанных метапопуляций по результатам анализа характера распределения поселений 5". .ъшНеш относительно выраженности физико-географических преград к расселению и анализа мтДНК подтверждается сопоставлением частотных показателей генотипов в них. Были выявлены достоверные различия между метапопуляциями почти при всех парах сравнения (%2 = 594,850^50,183, df = 2, р < 0,0001). Только при сравнении частот генотипов Северной и Северо-Западной (Присурской) метапопуляций достоверные различия не были выявлены (%2 = 4,183, df = 2, р = 0,123). Это, возможно, указывает на недостаточную надежность барьерной роли р. Барыш в процессе формирования фрагментированного ареала крапчатого суслика на территории Ульяновской области.

В проведенных ранее исследованиях нами было показано, что модель метапопуляционной структуры восточной части ареала крапчатого суслика, представленная пятью метапопуляциями, имеет право на существование. Проведенный анализ по индексам фиксации (Р-статистика) митохондриаль-ных маркеров (Б-1оор, cyt В) позволил тогда построить иерархические ряды Р-коэффициентов Р18-Р8С-Р1Т-РСТ (Б-1оор - 0,186-0,190-0,334-0,011, су В-0,164-0,189-0,313-0,014 соответственно), что свидетельствовало о реальном обособленном существовании выделенных метапопуляционных группировок [11].

По результатам анализа метапопуляционной структуры ареала крапчатого суслика в Ульяновской области с использованием данных по ядерному маркеру - 6 интрону гена р53 - были получены следующие результаты. Индекс фиксации генотипов во всех проанализированных популяциях 5. sus-Ист оказался достаточно высоким (Р8Т - 0,406), что свидетельствует о надежной изоляции локальных популяций и отсутствии масштабного обмена генетическим материалом между ними за счет мигрантов. Полученный иерархический ряд Р-коэффициентов Р18-Р8С-Рп--РСТ (0,047-0,065-0,137-0,031 соответственно) хотя и представлен по сравнению с митохондриальными маркерами более низкими по значению индексами, также свидетельствует о реальном обособленном существовании выделенных метапопуляционных группировок. Таким образом, выявленная метапопуляционная структура восточной части ареала крапчатого суслика подтверждается как данными по ми-тохондриальной, так и ядерной ДНК.

Рис. 2. Распределение генотипов интрона 6 гена 53 в локальных популяциях крапчатого суслика в Ульяновской области (А): цифрами указаны номера популяций (см. табл. 1); большими пунсонами выделены популяционные выборки с n > 10 особей, средними - выборки с n = 5-10 особей, малыми - выборки с n < 5; темно-серым цветом показаны гомозиготы по аллели S1, светло-серым - гетерозиготы S1/S2,

белым - гомозиготы по аллели S2; пунктирной линией показаны границы метапопуляций: I - Южной (Сызранской) (n = 58), II - Восточной (Приволжской) (n = 20), III - Центральной (n = 82), IV - Северной (n = 18), V - Северо-Западной (Присурской) (n = 20); результаты анализа генетической структуры выделенных метапопуляций по индексам фиксации (многоуровневая F-статистика) (Б): FIS - индекс фиксации гаплотипов (гамет) между особями в локальных популяциях; FSC - индекс фиксации генотипов между локальными популяциями внутри метапопуляций; FIT - индекс фиксации гаплотипов (гамет) между локальными популяциями из разных метапопуляций; FCT - индекс фиксации популяций между метапопуляциями

Выводы

Таким образом, анализ генетической структуры популяций по ядерному гену р53 свидетельствует, что во всех проанализированных популяциях внутренние автономные генетические процессы идут в соответствии с теоретически ожидаемыми. Несмотря на это, есть негативные факты, указывающие на нестабильность и дефективность генетической структуры популяций крапчатого суслика. Это, например, сильная генетическая однородность населения в пределах популяций и достоверно значимые различия географических популяций, свидетельствующие об их сильной изоляции.

Анализ частот генотипов по использованному ядерному генетическому маркеру как в случае сравнения отдельных популяции, так и в случае с обобщенной выборкой свидетельствует о том, что в этих популяциях автономные генетические процессы проходят в соответствии с законом Харди - Вайнбер-га, и, следовательно, в них отсутствуют какие-либо признаки действия отбора. Наблюдаемая разобщенность популяций крапчатых сусликов связана с географическими барьерами. Она проявляется в метапопуляционной структуре восточной части ареала этого вида и подтверждается генетическими данными по аллельному распределению интрона 6 гена р53.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Список литературы

1. Алтухов, Ю. П. Генетические процессы в популяциях / Ю. П. Алтухов. - М. : Академкнига, 2003. - 431 с.

2. Титов, С. В. Современное распространение и изменение численности крапчатого суслика в восточной части ареала / С. В. Титов // Зоологический журнал. -2001. - Т. 80, № 2. - С. 230-235.

3. Красная книга Ульяновской области / под науч. ред. Е. А. Артемьевой, А. В. Масленникова, М. В. Корепова. - М. : Буки Веди, 2015. - 550 с.

4. Красная книга Пензенской области. Том 2. Животные. - Пенза : Пензенская правда, 2005. - 300 с.

5. Красная книга Саратовской области. Грибы. Лишайники. Растения. Животные / Комитет охраны окружающей среды и природопользования Саратовской области. - Саратов : Изд-во Торгово-промышленной палаты Саратовской области, 2006. - 528 с.

6. Красная книга Республики Татарстан (животные, растения, грибы). - 2-е изд. -Казань, 2006. - 832 с.

7. Красная книга Чувашской Республики. Том 1. Часть 2. Животные. - Чебоксары : РГУП «ИПК Чувашия», 2011 (2010). - 372 с.

8. Sambrook, J. Molecular cloning: А laboratory Manual / J. Sambrook, E. F. Fritsch, T. Maniatis. - 2nd ed. - New York : Cold Spring Harbor Laboratory Press : Cold Spring Harbor, 1989. - Р. 58-64.

9. Изучение гибридизации четырех видов сусликов (Spermophilus: Rodentia, Sciu-ridae) молекулярно-генетическими методами / О. А. Ермаков, В. Л. Сурин, С. В. Титов, А. Ф. Тагиев, А. В. Лукьяненко, Н. А. Формозов // Генетика. - 2002. -Т. 38, № 7. - С. 950-964.

10. Наумов, Р. В. Особенности экологии и современное распространение степного сурка (Marmota bobak Muller, 1776) в Самарской области: предварительные данные / Р. В. Наумов, А. А. Кузьмин, С. В. Титов // Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Естественные науки. - 2013. - № 4 (4). - С. 60-68.

11. Динамика ареалов и современное состояние поселений наземных беличьих в правобережных районах Поволжья / С. В. Титов, А. А. Кузьмин, Р. В. Наумов, О. А. Ермаков, С. С. Закс, О. В. Чернышова. - Пенза : ПГУ, 2015. - 124 с.

References

1. Altukhov Yu. P. Geneticheskie protsessy v populyatsiyakh [Genetic processes in populations]. Moscow: Akademkniga, 2003, 431 p.

2. Titov S. V. Zoologicheskiy zhurnal [Zoological journal]. 2001, vol. 80, no. 2, pp. 230-235.

3. Krasnaya kniga Ul'yanovskoy oblasti [The red book of Ulyanovsk region]. Ed. by E. A. Artem'eva, A. V. Maslennikov, M. V. Korepov. Moscow: Buki Vedi, 2015, 550 p.

4. Krasnaya kniga Penzenskoy oblasti. Tom 2. Zhivotnye [The red book of Penza region. Vol. 2. Animals]. Penza: Penzenskaya pravda, 2005, 300 p.

5. Krasnaya kniga Saratovskoy oblasti. Griby. Lishayniki. Rasteniya. Zhivotnye [The red book of Saratov region. Fungi. Lichens. Plants. Animals]. Saratov: Izd-vo Torgovo-promyshlennoy palaty Saratovskoy oblasti, 2006, 528 p.

6. Krasnaya kniga Respubliki Tatarstan (zhivotnye, rasteniya, griby) [The red book of the Republic of Tatarstan (animals, plants, fungi)]. 2nd ed. Kazan, 2006, 832 p.

7. Krasnaya kniga Chuvashskoy Respubliki. Tom 1. Chast' 2. Zhivotnye [The red book of the Republic of Chuvashia. Vol. 1. Part 2. Animals]. Cheboksary: RGUP «IPK Chuva-shiya», 2011 (2010), 372 p.

8. Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T. Molecular cloning: A laboratory Manual. 2nd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press: Cold Spring Harbor, 1989, pp. 58-64.

9. Ermakov O. A., Surin V. L., Titov S. V., Tagiev A. F., Luk'yanenko A. V., Formozov N. A. Genetika [Genetics]. 2002, vol. 38, no. 7, pp. 950-964.

10. Naumov R. V., Kuz'min A. A., Titov S. V. Izvestiya vysshikh uchebnykh zavedeniy. Povolzhskiy region. Estestvennye nauki [University proceedings. Volga region. Natural sciences]. 2013, no. 4 (4), pp. 60-68.

11. Titov S. V., Kuz'min A. A., Naumov R. V., Ermakov O. A., Zaks S. S., Chernyshova O. V. Dinamika arealov i sovremennoe sostoyanie poseleniy nazemnykh belich'ikh vpravobe-rezhnykh rayonakh Povolzh'ya [Areal dynamics and contemporary conditions of ground squirrel habitats in right-bank areas of Volga region]. Penza: PGU, 2015, 124 p.

Закс Светлана Сергеевна кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, научно-исследовательский отдел, Пензенский государственный университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40)

E-mail: s.s.zaks@yandex.ru

Zaks Svetlana Sergeevna Candidate of biological sciences, senior researcher, research department, Penza State University (40 Krasnaya street, Penza, Russia)

Кузьмин Антон Алексеевич кандидат биологических наук, доцент, кафедра биотехнологий и техносферной безопасности, Пензенский государственный технологический университет (Россия, г. Пенза, проезд Байдукова/ул. Гагарина, 1а/11)

E-mail: kuzmin-puh@yandex.com

Kuzmin Anton Alekseevich Candidate of biological sciences, associate professor, sub-department of biotechnology and technosphere safety, Penza State Technological University (1a/11 Baidukova lane/Gagarina street, Penza, Russia)

Титов Сергей Витальевич

доктор биологических наук, профессор, заведующий кафедрой зоологии и экологии, декан факультета физико-математических и естественных наук, Пензенский государственный университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40)

E-mail: svtitov@yandex.ru

Titov Sergey Vital'evich

Doctor of biological sciences, professor,

head of sub-department of zoology

and ecology, dean of the faculty of physics,

mathematics and natural sciences, Penza

State University (40 Krasnaya street, Penza,

Russia)

УДК 591.557:599.322.2 Закс, С. С.

Генетическая структура популяций крапчатого суслика (Брггто-philus suslicus СйМ.) в Среднем Поволжье по данным анализа яДНК /

С. С. Закс, А. А. Кузьмин, С. В. Титов // Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Естественные науки. - 2016. - № 4 (16). - С. 3-13. Б01: 10.21685/2307-9150-2016-4-1

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.