Научная статья на тему 'Генетическая изменчивость лиственницы Сукачева (Larix sukaczewii Djil. ) в географических культурах под Воронежем'

Генетическая изменчивость лиственницы Сукачева (Larix sukaczewii Djil. ) в географических культурах под Воронежем Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
380
53
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Лесотехнический журнал
ВАК
AGRIS
RSCI
Область наук
Ключевые слова
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ / ЛИСТВЕННИЦА СУКАЧЕВА / НАБЛЮДАЕМОЕ ЧИСЛО АЛЛЕЛЕЙ / ЭФФЕКТИВНОЕ ЧИСЛО АЛЛЕЛЕЙ / MOLECULAR AND GENETIC METHODS / SUKACHEV''S LARCH / OBSERVED NUMBER OF ALLELES / EFFECTIVE NUMBER OF ALLELES

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Кулаков Евгений Евгеньевич, Сиволапов Владимир Алексеевич, Воробьева Елена Анатольевна, Сиволапов Алексей Иванович

Сведения о генетической структуре популяций лесных древесных растений являются основой для оценки генетического потенциала вида. Особенно актуальны эти исследования для видов, имеющих хозяйст-венно ценное значение и занимающих обширные ареалы, как лиственница. Точные сведения о генетической структуре популяций, уровне их генетической изменчивости, характере ее распределения в пределах ареала позволят назначить мероприятия, направленные на сохранение генетических ресурсов вида для использования его в экономике страны и воспроизводстве. В ходе анализа электрофоретических спектров продуктов амплифи-кации шести ядерных микросателлитных локусов (bcLK056, bcLK066, bcLK224, bcLK232, bcLK235, bcLK260) выявлены 42 аллельных варианта. Пять проанализированных локусов оказались полиморфными, локус bcLK066 мономорфным. Дана оценка генетического полиморфизма популяционной структуры лесных культур лиственницы Сукачева из семян Свердловской области (55-600 с. ш.) микросателлитным анализом по 6 парам праймеров. Число амплифицированных фрагментов ДНК в общей выборке растений варьировало в зависимости от праймера. Для праймеров bcLK235 и bcLK056 характерно 14 амплифицированных фрагментов, bcLK224 показал 5 аллелей, bcLK232 6 аллелей, bcLK260 и bcLK066 2 и 1 аллель соответственно. Получены показатели генетической изменчивости. Для лиственницы Сукачева наблюдаемое число аллелей на локус (NА) составляет 5,250. Эффективное число аллелей на локус (NЕ) 3,257. Рассчитан индекс Шеннона (I), который составил 0,913. Показан средний уровень генетического разнообразия биотипов в лесных культурах лиственницы Сукачева

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Кулаков Евгений Евгеньевич, Сиволапов Владимир Алексеевич, Воробьева Елена Анатольевна, Сиволапов Алексей Иванович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

genetic variability of sukachev''s larch (larix sukaczewii djil.) in geographical cultures under Voronezh

Information on the genetic structure of populations of forest tree plants is the basis for assessing the genetic po-tential of the species. These studies are particularly relevant for economically valuable species and species occupying extensive areas, like larch. Accurate information about the genetic structure of populations, the level of their genetic variability, the nature of its distribution within the range allows us to designate measures aimed at preserving the genet-ic resources of the species for the use in the country's economy and reproduction. During the analysis of electrophoretic spectra of the products of amplification of six nuclear microsatellite loci 42 allelic variants have been identified. An estimation of the genetic polymorphism of the population structure of forest plantations of Sukachev’s larch from the seeds of the Sverdlovsk region by microsatellite analysis for 6 pairs of pri-mers is given.

Текст научной работы на тему «Генетическая изменчивость лиственницы Сукачева (Larix sukaczewii Djil. ) в географических культурах под Воронежем»

DOI: 10.12737/article_5ab0dfbc03a703.71494463 УДК 630.165;582.475.2(470.44)

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ЛИСТВЕННИЦЫ СУКАЧЕВА (Larix Sukaczewii Djil.) В ГЕОГРАФИЧЕСКИХ КУЛЬТУРАХ ПОД ВОРОНЕЖЕМ

инженер, аспирант Е. Е. Кулаков1'4 кандидат сельскохозяйственных наук, директор филиала В. А. Сиволапов2 и. о. зав. отделом мониторинга состояния лесных генетических ресурсов Е. А. Воробьева3 кандидат сельскохозяйственных наук, доцент А. И. Сиволапов4 1, 2, 3 - ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Воронежской области», г. Воронеж, Российская Федерация 4 - ФГБОУ ВО «Воронежский государственный лесотехнический университет имени Г.Ф. Морозова»,

г. Воронеж, Российская Федерация

Сведения о генетической структуре популяций лесных древесных растений являются основой для оценки генетического потенциала вида. Особенно актуальны эти исследования для видов, имеющих хозяйственно ценное значение и занимающих обширные ареалы, как лиственница. Точные сведения о генетической структуре популяций, уровне их генетической изменчивости, характере ее распределения в пределах ареала позволят назначить мероприятия, направленные на сохранение генетических ресурсов вида для использования его в экономике страны и воспроизводстве. В ходе анализа электрофоретических спектров продуктов амплификации шести ядерных микросателлитных локусов (bcLK056, bcLK066, bcLK224, bcLK232, bcLK235, bcLK260) выявлены 42 аллельных варианта. Пять проанализированных локусов оказались полиморфными, локус bcLK066 -мономорфным. Дана оценка генетического полиморфизма популяционной структуры лесных культур лиственницы Сукачева из семян Свердловской области (55-600 с. ш.) микросателлитным анализом по 6 парам прайме-ров. Число амплифицированных фрагментов ДНК в общей выборке растений варьировалось в зависимости от праймера. Для праймеров bcLK235 и bcLK056 характерно 14 амплифицированных фрагментов, bcLK224 показал 5 аллелей, bcLK232 - 6 аллелей, bcLK260 и bcLK066 - 2 и 1 аллель соответственно. Получены показатели генетической изменчивости. Для лиственницы Сукачева наблюдаемое число аллелей на локус (NA) составляет 5,250. Эффективное число аллелей на локус (NE) 3,257. Рассчитан индекс Шеннона (I), который составил 0,913. Показан средний уровень генетического разнообразия биотипов в лесных культурах лиственницы Сукачева.

Ключевые слова: молекулярно-генетические методы, лиственница Сукачева, наблюдаемое число аллелей, эффективное число аллелей

GENETIC VARIABILITY OF SUKACHEV'S LARCH (LARIX SUKACZEWII DJIL.) IN GEOGRAPHICAL

CULTURES UNDER VORONEZH

Engineer, Post-graduate student E. E. Kulakov 1,4 PhD (Agriculture), head of the branch V. A. Sivolapov 2 Executive head of the Department of monitoring the state of forest genetic resources Е. А. Vorobyeva 3 PhD (Agriculture), Associate Professor A. I. Sivolapov 4 1, 2, 3 - FBU "Roslezaschita" - "CFP of Voronezh region", Voronezh, Russian Federation 4 - FSBEI HE «Voronezh State University of Forestry and Technologies named after G.F. Morozov»,

Voronezh, Russian Federation

Abstract

Information on the genetic structure of populations of forest tree plants is the basis for assessing the genetic potential of the species. These studies are particularly relevant for economically valuable species and species occupying extensive areas, like larch. Accurate information about the genetic structure of populations, the level of their genetic

variability, the nature of its distribution within the range allows us to designate measures aimed at preserving the genetic resources of the species for the use in the country's economy and reproduction. During the analysis of electrophoretic spectra of the products of amplification of six nuclear microsatellite loci (bcLK056, bcLK066, bcLK224, bcLK232, bcLK235, bcLK260) 42 allelic variants have been identified. The five analyzed loci are polymorphic, the locus bcLK066 is monomorphic. An estimation of the genetic polymorphism of the population structure of forest plantations of Sukachev's larch from the seeds of the Sverdlovsk region (55-600 N.) by microsatellite analysis for 6 pairs of primers is given. The number of amplified DNA fragments in the total sample of plants has varied depending on the primer. BcLK235 u bcLK056 primers are characterized by 14 amplified fragments, bcLK224 has showed 5 alleles, bcLK232 6 alleles, bcLK260 and bcLK066 2 and 1 alleles respectively. The indicators of genetic variability have been got. For Sukachev's larch, the observed number of alleles per locus (NA) is 5,250. Effective number of alleles per locus (Ne) is 3,257. The Shannon index (I) has been calculated, which has been 0.913. The average level of genetic diversity of biotypes in forest plantations of Sukachev's larch has been calculated.

Keywords: molecular and genetic methods, Sukachev's larch, observed number of alleles, effective number of alleles

Введение

Генетическое разнообразие видов и популяций можно изучать по изменчивости их морфологических признаков, хотя это малоэффективно у древесных, так как по фенотипу далеко не всегда можно судить о генотипе. Использование гибридологического анализа и испытание отобранных деревьев по потомству затруднено в связи с биологическими особенностями древесных растений. Более эффективным для изучения генетического разнообразия оказалось применение молекулярных маркеров ДНК.

Ранее изучение генетического разнообразия и структуры рода Larix решалось с помощью изоферментных маркеров [2, 6, 7, 11, 16, 18 и др.]. Для количественной оценки генетического разнообразия популяций данных изоферментных маркеров мало: в силу специфики данного класса маркеров возможно изучить только 1-2 % от общей части генома, а полученные показатели генетической изменчивости занижены.

В последние десятилетия исследование генетической структуры популяций рода Larix проводят с помощью методов, основанных на полиме-разной цепной реакции. Наиболее перспективным методом является ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) (Zietkiewicz et al., 1994) анализ. Микроса-теллитные локусы - это короткие фрагменты ДНК (2-10 нуклеотидов) с повторяющимися последовательностями, которые называют мотивами. Высокий уровень полиморфизма микросателлитов, от-

носительно равномерное их распределение в геноме, широкая представленность сделала их чрезвычайно популярными и широко используемыми в исследовании популяций. Поэтому для изучения генетического разнообразия лиственницы Сукачева нами применялся ISSR-анализ.

Объекты и методика

Объектом молекулярно-генетических исследований послужили биотипы лиственницы Сукачева в географических культурах, семена из Свердловской области 55-600 с. ш. в Учебно-опытном лесхозе ВГЛТУ им. Г.Ф. Морозова.

Участок коллекционно-географических культур лиственницы заложен весной 1955 года Р.И. Дерюжкиным под руководством М.М. Вереси-на. Ранее участок находился под дубовым древостоем, который в 1944 году был вырублен. В 19511953 годах проводилась корчевка пней. Посадка культур осуществлена 2-летними сеянцами в период 20-25 апреля 1955 года под меч Колесова. Рельеф участка ровный. Почвы серые лесные суглинистые.

Всего было высажено 99 вариантов лиственницы на секциях с размещением 1,5 х 0,5 м, среди которых 53 экотипа лиственницы сибирской, 26 -лиственницы Сукачева, 2 экотипа лиственницы европейской и 1 экотип лиственницы гибридной (сибирская х японская), семена из Московской области и др. Образцы лиственницы на участке объединены по районам и высажены на секциях разного

размера. По границам участка и в центре его высажена рябина обыкновенная, между секциями - клен татарский [1].

Молекулярно-генетический анализ проводился в несколько этапов: выделение ДНК из растений, амплификация маркерных участков и статистическая обработка полученных результатов.

Выделение ДНК из образцов хвои лиственницы Сукачева было выполнено CTAB-методом [10].

Основой ISSR-метода, или анализа полиморфных участков ДНК между микросателлитами, является ПЦР (полимеразная цепная реакция) с одним или несколькими праймерами длиной в 1524 нуклеотида (^1еМаг et а1.). Такие праймеры амплифицируют фрагменты ДНК, которые находятся между двумя достаточно близко расположенными микросателлитными повторами [14, 15]. Постановка ПЦР для амплификации маркерных участков проводилась праймерами ЬеЬК056, ЬсЬКОбб, Ье1К224 и Ье1К232, Ье1К235 и ЬсЬК260. Характеристика микросателитных локусов представлена в табл. 1.

Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводили в тонкостенных полипропиленовых пробирках объемом 0,2 мл. В ходе исследований был использован следующий состав реакционной

смеси (в нескольких вариантах и повторностях) на 1 образец:

1) 10 х ПЦР буфер (100мМ Трис HCl, рН 9,2, 250мМ KCl) - 2,5 мкл;

2) 25 мМ MgCl2 - 2,5 мкл;

3) mQ - 16 мкл;

4) смесь 5 мМ нуклеотидтрифосфатов -0,25 мкл, 0,5 мкл, 1 мкл;

5) праймер (прямой) 10 (мкм), 50 (мкм) и 100 (мкм) - 0,5 мкл, 0,75 мкл, 1 мкл;

6) Праймер (обратный) 10 (мкм), 50 (мкм) и 100 (мкм) - 0,5 мкл;

7) Taq ДНК-полимераза (1 ед./мкл) - 0,2 мкл,

1 мкл;

8) образец ДНК (40 нг/мкл) - 1 мкл.

После окончания ПЦР проводили электрофорети-ческое разделение в вертикальных блоках 6 % ПААГ в трис-ЭДТА-боратной буферной системе. После электрофореза гели окрашивали в растворе бромистого этидия. В качестве стандартного маркера длины использовали ДНК плазмиды pBR322 E. coli, обработанную эндонуклеазой рестрикции HpaII. Обработку полученных данных производили в программе GenAlEx 6.2 (Peakall, Smouse, 2006) [4, 9, 17].

Таблица 1

Характеристика микросателлитных локусов, отобранных для анализа генетической изменчивости

лиственницы в географических культурах

Локус Мотив Последовательность T °C отжига Размеры ампликона, п. н. Источник

bcLK056 (AG)20 F: ATGGGCTAAGGTATGTTTTACG R: TGCCAACATCTATACCAAGTCT Touchdown 63-53°C 142-196 Хедрик Ф., [12]

bcLK066 (TG)12 F: GCAACCGACAATGATTACATAG R: CTAAAACTGAACTTTGCTCAAT 143-157

bcLK224 (AG)17 F: GAGAGGCCACTACTATTATTAC R: ATGCGTTCCTTCATTCCTCT 128-148

bcLK232 (AG)19 F: TGTTGCTGGGTTGTTGTTAGA R: GGGTAATAGTTCCAGTCTTTG 133-149

BcLK260 (TG)m(AG)9 F: CTCCATAAGGGGCATCACAT R: TGGGCTCAAGTTTGGACATTA 172-220

bcLK235 (TC)9(AC)2AG(AC)14 F:TTCACTTGTGATCCTAGAGTTAGA R: AACCCCTAACCATATAATATCCA 58 °C

Результаты и обсуждение

По данным молекулярно-генетического анализа интродуцентов лиственницы Сукачева, семена из Свердловской области 55-60° с. ш., было установлено, что локусы и показывают 14 аллельных вариантов, Ь^Ю24 показал 5 аллелей, Ь^Ю32 - 6 аллелей, и - 2 и 1 аллеля соответственно. Частоты встречаемости всех 42 аллелей, отражающие генетические структуры, представлены на рис. 1. Среди всех аллелей 42 % аллельных варианта оказались уникальными, которые встречаются только в каком-либо одном локусе. Анализ рисунка показывает, что локусы Ь^Ю35 и практически по всем локусам имеют сходную генетическую структуру.

Определение уровня изменчивости и дифференциации в географических культурах лиственницы проводилось на основе ряда показателей [3, 5, 12]. Для этого рассчитаны следующие параметры оценки генетической изменчивости (табл. 3): на-

Ргеяиепсу О о о о о о о Э 2 4 6 8 О 2 э о о о о о о э о о о о о о ...... 1 11 , .1 ..11.. 1.... 1.1.1.... 111. 1 , 1 1 ......1 1 ., .... 1. 1. ■ Ье1Ко56 ■ ЬеЫК224 ■ Ье1К232 ■ Ье1К235

00 ч и о О 00 1X1 О гч 00 ю ю 00 00 00 00 гч ГЧ] О 0 0

Л о ку с 1 ГЧ] ГЧ] .0 гч С и! Л о к ус 1 гч] гч Гч] ГЧ ■ Ье1К2бо ■ ЬС1КО66

Рис. 1. Частоты аллелей по локусам лиственницы Сукачева в географических культурах

Таблица 2

Показатели генетической изменчивости лиственниц, рассчитанные по результатам микросателлитного анализа

Популяция Локусы N I Но Не иНе

Лиственница Сукачева Локус1 30 6,000 3,856 0,972 0,044 0,394 0,401 0,449

Локус 2 18 4,500 2,658 0,854 0,031 0,375 0,386 0,725

Среднее - 5,25 3,257 0,913 0,037 0,384 0,393 0,587

Примечание: N - количество образцов в исследуемой выборке, NA - число аллелей на локус, N - эффективное число аллелей на локус, HO - наблюдаемая гетерозиготность, НЕ - ожидаемая гетерозиготность, F - индекс фиксации, I - индекс Шеннона.

блюдаемое число аллелей (N4); эффективное число аллелей (^; индекс Шеннона (I).

Результаты анализа основных параметров генетического разнообразия показали, что исследуемые нами географические культуры рода Ьапх существенного различия по их уровню не имеют. Так, наблюдаемое число аллелей на локус ^а) для интродуцентов лиственницы Сукачева составила 5,25, а эффективное число аллелей на локус (^ -3,257. Несущественные различия в частотах встречаемости аллелей обусловлены географическим районированием экотипов лиственницы. Самая распространенная мера генетической изменчивости для диплоидных особей - это гетерозиготность. Частота гетерозигот является наиболее важным показателем, т. к. каждая гетерозиготная особь несет разные аллели и тем самым показывает наличие изменчивости.

Микросателлитный анализ показал, что полученные величины наблюдаемой (Но) и ожидаемой гетерозиготности (Не) составляют 0,037 и 0,384 соответственно. Обнаруженное снижение доли гетерозигот, в свою очередь, возможно, говорит о пониженной выживаемости растений в изученных популяциях и в целом об уменьшении генетического разнообразия в каждой из популяций лиственницы [8].

Оценка внутри- и межпопуляционного разнообразия была проведена на основе информационного индекса Шеннона [13]. Среднее значение индекса разнообразия Шеннона у биотипов лиственницы Сукачева в географических культурах, рассчитанное по праймерам ЬсЬК056, ЬсЬКОбб, ЬсЬК224 и ЬсЬК232, составило 0,913 нит/особь. Полученные данные говорят о низком генетическом разнообразии данного экотипа.

Анализ значений Б-статистик Райта показал, что 57,8 % наблюдаемой изменчивости приходится на межпопуляционную В целом каждое отдельное дерево в изученных выборках в среднем обнаруживает 90%-й дефицит гетерозигот относительно популяции, и около 95 % составляет дефицит гетерозиготных генотипов относительно вида Ь. sukaczewii.

Выводы

1. Анализ шести ISSR-праймеров выявил 42 аллельных варианта, которые полиморфны

(Р = 1,000), кроме локуса ЪеЬК066. При дальнейших исследованиях данные фрагменты могут быть использованы при составлении молекулярно-гене-тической формулы по предложенной С.В. Борон-никовой методике молекулярно-генетической идентификации и паспортизации растений [5, 10].

2. Сопоставленные значения наблюдаемой и ожидаемой гетерозиготности показали дефицит гетерозиготных генотипов по всем изученным мик-росателлитным локусам.

3. Установленные значения основных показателей генетического полиморфизма свидетельствуют о низком и среднем уровнях генетического разнообразия выборок.

4. В целом выявленные значения основных показателей генетического полиморфизма свидетельствуют о невысоком уровне генетического разнообразия лиственницы Сукачева в географических культурах на территории Учебно-опытного лесхоза ВГЛТУ. Это можно объяснить тем, что для исследования из 26 экотипов лиственницы Сукачева, представленных в географических культурах, изучены только три; все из Свердловской области (Но-волялинское лесничество, Исовский и Висимский лесхозы). Кроме того, у лиственницы пыльца не имеет воздушных мешков, что в большей степени приводит к самоопылению и снижению генетического полиморфизма.

Таблица 3

Значения показателей Б-статистик Райта

Локус

Локус 1 0,887 0,951 0,561

Локус 2 0,916 0,966 0,594

Среднее 0,902±0,015 0,958±0,008 0,578±0,16

Библиографический список

1. Дерюжкин, Р. И. Биологические основы семеноводства и культуры лиственницы в Центральной лесостепи [Текст] : дис. д-ра с.-х. наук: 06.560 / Р. И. Дерюжкин. - Воронеж, 1970. - С. 1-30.

2. Ларионова, А. Я. Генетическая изменчивость лиственницы сибирской в Нижнем Приангарье [Текст] / А. Я. Ларионова, Н. В. Яхнева (Орешкова), Н. А. Кузьмина //Лесоведение. - 2003. - № 4. - С. 17-22.

3. Генетика популяций [Текст] / Е. К. Меркурьева [и др.]. - М., 2004. - С. 8-20.

4. Молекулярная генетика [Текст] : учеб.-метод. пособие / под ред. С. В. Боронниковой. - Пермь, 2007. -С. 9-13.

5. Изучение полиморфизма ISSR-маркеров в природных и искусственных популяциях лиственницы [Текст] / Ю. С. Нечаева, С. В. Боронникова, Р. Р. Юсупов, Б. Хайнце // Фундаментальные исследования. - 2013. -№ 6-6. - С. 1426-1431.

6. Орешкова, Н. В. Аллозимный полиморфизм лиственницы сибирской (Larix sibirica Le-deb.) [Текст] / Н. В. Орешкова, А. Я. Ларионова // Лесные экосистемы Северо-Восточной Азии и их динамика: материалы междунар. конференции. - Владивосток, 2006. - С. 220-223.

7. Орешкова, Н. В. Генетическое разнообразие лиственницы сибирской в Ужурской лесостепи (Красноярский край) [Текст] / Н. В. Орешкова, А. Я. Ларионова // Вестник СВНЦ ДВО РАН. - 2007. - № 3. -С. 50-55.

8. Орешкова, Н. В. Генетические особенности и морфологическая изменчивость лиственницы сибирской в Алтае-Саянской горной области [Текст] / Н. В. Орешкова, А. П. Барченков // Вестник КрасГАУ. - 2010. -№ 10. - С. 59-64.

9. Падутов, В. Е. Методы молекулярно-генетического анализа [Текст] / В. Е. Падутов, О. Ю. Баранов, Е. В. Воропаев. - М. : Юнипол, 2007. - 176 с.

10. Программа и Методика по пункту 59. План мероприятий («дорожной карты») «Развитие биотехнологий и генной инженерии», утв. распоряжением Правительства РФ Природопользование от 18 июля 2013 г. № 1247-р. Программа и Методика утверждена ФБУ «Рослесозащита» 12.02.2014 [Текст]. - Пушкино, 2014. - 205 с.

11. Семериков, В. Л. Изучение генетической изменчивости лиственницы сибирской (Larix sibirica Ldb.) по изоферментным локусам [Текст] / В. Л. Семериков, А. В. Матвеев // Генетика. - 1995. - Т. 31. - № 8. -С. 1107-1113.

12. Хедрик, Ф. Генетика популяций / Ф. Хедрик // Техносфера. - 2003 - 592 с.

13. Detection of genetic variation between and within populations of Gliricidia sepium and G. maculata using RAPD markers [Text] / K. J. Chalmers [et al.] // Heredity. - 1992. - V. 69. - P. 465-472.

14. IRAP and REMAP: two new retrotransposon-based DNA fingerprinting techniques [Text] / R. Kalendar, T. Grob, M. Regina, F. Suoniemi, A. Schulman // Theor. Appl. Genet. - 1999. - Vol. 98. - P. 704-711.

15. Kalendar, R. IRAP and REMAP for retrotransposon-based genotyping and fingerprinting [Text] / R. Kalendar, A. H. Schulman // Nature Protocols. - 2006. - № 1(5). - P. 2478-2484.

16. Somaclonal variation of haploid in vitro tissue culture obtained from Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mega gametophytes for whole genome de novo sequencing [Text] / K. V. Krutovsky [et al.] // In Vitro Cell. Dev. Biol. Plant. - 2014. - Vol. 50(5). - P. 655-664.

17. Sambrook, J. Gel electrophoresis of DNA [Text] / J. Sambrook, E. F. Fritsh, T. Manias (eds.). // Molecular Cloning: a Laboratory Manual. - New York : Could Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, USA, 1989. - Chapter 6.

18. Semerikov, V. L. Intra- and interspecific allozyme variability in Eurasian Larix Mill. species [Text] / V. L. Semerikov, L. F. Semerikov, M. Lascoux // Heredity. - 1999. - Vol. 82. - P. 193-204.

References

1. Deryujkin R. I. Biologicheskie osnovi semenovodstva i kulturi listvennici v Centralnoi lesostepi [Tekst]. Dis. D-ra s.-h. nauk: 06.560.Voronej, 1970. P. 1-30.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

2. Larionova A. Ya., Yahneva (Oreshkova) N.V., Kuzmina N.A. Geneticheskaya izmenchivost listvennici sibirskoi v Nijnem Priangarie // Lesovedenie. 2003. № 4. S. 17-22.

3. Merkureva E. K. [et al.]. Genetikapopulyacii. M., 2004. S. 8-20.

4. Molekulyarnayagenetika: ucheb.-metod. posobie / ed. S. V. Boronnikova. Perm, 2007. S. 9-13.

5. Nechaeva Yu. S., Boronnikova S. V., Yusupov R. R., Haince B. Izuchenie polimorfizma ISSR-markerov vprirodnih i iskusstvennihpopulyaciyah listvennici // Fundamentalnie issledovaniya. 2013. № 6-6. S. 1426-1431.

6. Oreshkova N. V., Larionova A. Ya. Allozimnii polimorfizm listvennici sibirskoi (Larix sibirica Le_deb.) [Tekst] // Lesnie ekosistemi Severo-Vostochnoi Azii i ih dinamika: proceedings of international conf. Vladivostok, 2006. S. 220-223.

7. Oreshkova N. V., Larionova A. Ya. Geneticheskoe raznoobrazie listvennici sibirskoi v Ujurskoi lesostepi (Krasnoyarskii krai) // VestnikSVNCDVORAN. 2007. № 3. S. 50-55.

8. Oreshkova N. V., Barchenkov A. P. Geneticheskie osobennosti i morfologicheskaya izmenchivost listvennici sibirskoi v Altae-Sayanskoi gornoi oblasti // VestnikKrasGAU. 2010. № 10. S. 59-64.

9. Padutov V. E., Baranov O. Yu., Voropaev E. V. Metodi molekulyarno-geneticheskogo analiza [Tekst]. M.: Yunipol, 2007. 176 s.

10. Programma i Metodika po punktu 59. Plan meropriyatii «dorojnoi karti», «Razvitie biotehnologii i gennoi injenerii», utverjdennogo rasporyajeniem Pravitelstva RF Prirodopolzovanie ot 18 iyulya 2013 g. № 1247-r. Programma i Metodika utverjdena FBU «Roslesozaschita» 12.02.2014. [Tekst]. Pushkino, 2014. 205 s.

11. Semerikov V. L., Matveev A. V. Izuchenie geneticheskoi izmenchivosti listvennici sibirskoi (Larix sibirica Ldb.) po izofermentnim lokusam // Genetika. 1995. T. 31. № 8. S. 1107-1113.

12. Hedrik F. Genetika populyacii // Tehnosfera. 2003. 592 s.

13. Chalmers K. J. [et al.] Detection of genetic variation between and within populations of Gliricidia sepium and G. maculata using RAPD markers // Heredity. 1992. V. 69. P. 465-472.

14. Kalendar R., Grob T., Regina M., Suoniemi F., Schulman A. IRAP and REMAP: two new retrotransposon-basedDNA fingerprinting techniques // Theor. Appl. Genet. 1999. Vol. 98. P. 704-711.

15. Kalendar R. Schulman A. H. IRAP and REMAP for retrotransposon-based genotyping and fingerprinting // Nature Protocols. 2006. № 1(5). P. 2478-2484.

16. Krutovsky K. V. [et al.]. Somaclonal variation of haploid in vitro tissue culture obtained from Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mega gametophytes for whole genome de novo sequencing // In Vitro Cell. Dev. Biol. Plant. 2014. Vol. 50(5). P. 655-664.

17. Sambrook J., Fritsh E. F., Manias T. (eds.). Gel electrophoresis of DNA // Molecular Cloning: a Laboratory Manual. New York : Could Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, USA, 1989. Chapter 6.

18. Semerikov V. L., Semerikov L. F., Lascoux M. Intra- and interspecific allozyme variability in Eurasian Larix Mill. species // Heredity. 1999. Vol. 82. P. 193-204.

Сведения об авторах:

Кулаков Евгений Евгеньевич - аспирант кафедры лесных культур, селекции и лесомелиорации ФГБОУ ВО «Воронежский государственный лесотехнический университет имени Г.Ф. Морозова», г. Воронеж, Российская Федерация; инженер филиала ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Воронежской области», г. Воронеж, Российская Федерация; e-mail: evgenyykulakov@yandex.ru

Сиволапов Владимир Алексеевич - директор филиала ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Воронежской области», кандидат сельскохозяйственных наук, г. Воронеж, Российская Федерация; e-mail: sivolapovva@rcfh.ru

Воробьева Елена Анатольевна - и. о. начальника отдела мониторинга состояния лесных генетических ресурсов филиала ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Воронежской области», г. Воронеж, Российская Федерация; e-mail: vorobyevaea@rcfh.ru

Сиволапов Алексей Иванович - профессор кафедры лесных культур, селекции и лесомелиорации ФГБОУ ВО «Воронежский государственный лесотехнический университет имени Г.Ф. Морозова», кандидат сельскохозяйственных наук, доцент, г. Воронеж, Российская Федерация; e-mail: Aleksey-Sivolapov@yandex.ru

Information about authors

Kulakov Evgeny Evgenievich - graduate student of Forest crops, Selection and Afforestation department, Federal State Budget Education Institution of Higher Education «Voronezh State University of Forestry and Technologies named after G. F. Morozov», Voronezh, Russian Federation; Engineer of branch of Federal budget institution "Roslesozashchita" - "Center for forest protection of Voronezh oblast", Voronezh, Russian Federation e-mail: evgenyykulakov@yandex.ru

Sivolapov Vladimir Alekseevich - the Director of branch of Federal budget institution "Roslesozashchita" -"Center for forest protection of Voronezh oblast", PhD (Agricultural), Voronezh, Russian Federation; e-mail: sivolapovva@rcfh.ru

Vorobyova Elena Anatolievna - the acting head of the Department for monitoring the state of forest genetic resources branch of Federal budget institution "roslesozashchita" - "Center for forest protection of Voronezh oblast", PhD (Agricultural), Voronezh, Russian Federation; e-mail: vorobyevaea@rcfh.ru

Sivolapov Aleksey Ivanovich - Professor of Forest crops, Selection and Afforestation department, Federal State Budget Education Institution of Higher Education «Voronezh State University of Forestry and Technologies named after G. F. Morozov», PhD (Agricultural), Associate Professor, Voronezh, Russian Federation; e-mail: Aleksey-Sivolapov@yandex.ru

DOI: 10.12737/аП1с1е_5аЪ0ай>с652664.55071475 УДК 631.526

СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ТРЕХ ТИПОВ ЛЕСНЫХ КУЛЬТУР СОСНЫ КЕДРОВОЙ

СИБИРСКОЙ В ТОМСКОЙ ОБЛАСТИ

Аспирант Пуджа Г.И.1 Доктор биологических наук, профессор Данченко А.М.1,

Кандидат биологических наук Кабанова С.А.2, Кандидат географических наук, доцент Данченко М.А.1

1- ФГАОУ ВО «Национальный исследовательский Томский государственный университет», г. Томск,

Российская Федерация

2 - ТОО «Казахский научно-исследовательский институт лесного хозяйства и агролесомелиорации»,

г. Щучинск, Республика Казахстан

В подзоне южной тайги на территории Томской области были заложены пробные площади в лесных культурах под пологом леса, реконструкции малоценных насаждений и последующих культур. Изучены биометрические показатели и произведен сравнительный анализ трех типов культур. Выявлено, что на рост искусственных насаждений сосны кедровой в значительной мере влияет конкуренция со стороны взрослых деревьев основного полога в подпологовых культурах и в искусственных насаждениях, созданных в процессе реконструкции. Сохранность подпологовых культур изменялась от 55,6 до 64,4 % в 43-летнем возрасте и составила 59,8 % в 32-летнем возрасте. Подпологовые культуры на пробной площади с большей густотой значительно отставали по росту от участков с более низкой густотой при прочих идентичных условиях произрастания и возраста. Сохранность лесных культур, созданных реконструкцией, на участках без основного полога составила 72,6 %, на участке со взрослым древостоем - 46,8 %. Диаметр деревьев на реконструкции без основного полога различался в 2,1 раза, высота - в 1,8 раз в пользу культур на участке, где малоценное насаждение было вырублено. В последующих культурах на тех пробных площадях, где сохранились чистые культуры сосны кедровой,

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.