Научная статья на тему 'ГЕМИЦЕЛЛЮЛОЗНЫЙ СУБСТРАТ - ИНДУКТОР БИОСИНТЕЗА L-ЛИЗИН-α-ОКСИДАЗЫ ТРИХОДЕРМОЙ'

ГЕМИЦЕЛЛЮЛОЗНЫЙ СУБСТРАТ - ИНДУКТОР БИОСИНТЕЗА L-ЛИЗИН-α-ОКСИДАЗЫ ТРИХОДЕРМОЙ Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
305
86
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ФЕРМЕНТ / ТРИХОДЕРМА / АМИНООКСИДАЗЫ / БИОСИНТЕЗ / ENZYME / TRICHODERMA / AMINOOXIDASE / BIOSYNTHESIS

Аннотация научной статьи по биотехнологиям в медицине, автор научной работы — Смирнова И. П., Шнейдер Ю. А., Шевченко А. А.

Биосинтез фермента L-лизин-α-оксидаза грибом триходермой исследован при различных способах выращивания и на средах с различными источниками углерода. Фермент активно синтезировался только на среде с пшеничными отрубями. Штаммы триходермы при росте на среде с гемицеллюлозным субстратом проявляли разный спектр активностей оксидаз L-аминокислот. С возрастом культуры триходермы спектр аминооксидазных активностей расширялся, но для каждого штамма он оставался индивидуальным.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Смирнова И. П., Шнейдер Ю. А., Шевченко А. А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Gemycellulose substratum inductor of biosynthesis of L-lysin-α-oxidase (lo) by Trichoderma sp.1

Studies on the biosynthesis of L-lysine-α-oxidase enzyme by Trichoderma sp. were carried out using various growing methods and media with various carbon sources. The enzyme was actively synthesized only on the wheat brans medium. The growth of Trichoderma strains on the gemycellulose substrate medium showed a different range of L-amino acid oxidase activety.With the Trichoderma culture getting older, the range of amino-oxidase activety widened, but for each strain it remained unique.

Текст научной работы на тему «ГЕМИЦЕЛЛЮЛОЗНЫЙ СУБСТРАТ - ИНДУКТОР БИОСИНТЕЗА L-ЛИЗИН-α-ОКСИДАЗЫ ТРИХОДЕРМОЙ»

ГЕМИЦЕЛЛЮЛОЗНЫЙ СУБСТРАТ - ИНДУКТОР БИОСИНТЕЗА Ь-ЛИЗИН-а-ОКСИДАЗЫ ТРИХОДЕРМОЙ

И.П. Смирнова1, Ю.А. Шнейдер2, А.А. Шевченко1

1Кафедра биохимии 2Кафедра ботаники, физиологии, патологии растений и агробиотехнологии Российский университет дружбы народов ул. Миклухо-Маклая, 8/2, Москва, Россия, 117198

Биосинтез фермента L-лизин-а-оксидаза грибом триходермой исследован при различных способах выращивания и на средах с различными источниками углерода. Фермент активно синтезировался только на среде с пшеничными отрубями. Штаммы триходермы при росте на среде с геми-целлюлозным субстратом проявляли разный спектр активностей оксидаз L-аминокислот. С возрастом культуры триходермы спектр аминооксидазных активностей расширялся, но для каждого штамма он оставался индивидуальным.

Ключевые слова: фермент, триходерма, аминооксидазы, биосинтез.

L-лизин-а-оксидаза — метаболит сапрофитного гриба Trichoderma — осуществляет реакцию окислительного дезаминирования незаменимой аминокислоты L-лизина.

Реакция деструкции аминокислоты L-лизина протекает следующим образом: ічн2 ын2

(СН2)4 + 02 + Н20 Ьлизин-а-оксидаза (^ + ^ + ^

СН— 1\1Н2

соон

1_-лизин

С00Н л о

Д-пиперидин-2-

карбоксилат

а-кето-Е-аминокапроновая

кислота

Фермент был получен в Японии из культуральной жидкости гриба Trichoder-ma viride, позднее был получен в России [1—4; 6; 7].

Остаются нерешенными вопросы, связанные с биосинтезом фермента триходермой при разных способах культивирования, использованием различных источников углерода и влиянием метаболита на деструкцию аминокислот, которые являются продуктами распада белков растительного и животного происхождения в почве.

В качестве источника углерода в среде, как было показано ранее японскими исследователями, использовались пшеничные отруби; культивирование продуцента осуществлялось поверхностным способом [1].

Субстрат — пшеничные отруби — содержит следующие биополимеры: белковые вещества (16,9%), пектиновые вещества (3,2%), гемицеллюлозу (23,0%),

целлюлозу (9,6%), крахмал (13,7%). Поскольку биополимеры гемицеллюлоза и целлюлоза представляют собой естественный субстрат для роста триходермы в природных условиях, возникла необходимость выяснить роль пшеничных отрубей как субстрата в образовании фермента грибом триходермой.

В представленной работе исследовались различные варианты сред и возможность замены пшеничных отрубей гемицеллюлозного субстрата на другие источники углерода в связи с образованием фермена, а также субстратная специфичность штаммов рода триходерма при использовании этого субстрата.

Весьма интересным нам представлялось исследование деструкции аминокислот в зависимости от возраста культуры и кислотности среды.

Условия эксперимента. В опытах использовали штаммы рода Trichoderma, поскольку активные продуценты L-лизин-а-оксидазы были найдены японскими исследователями среди представителей этого рода [1; 2]:

1) Tr. viride Rifai,

2) Tr. harzianum Rifai,

3) Tr. viride Pers ex S.F. Gray,

4) Tr. longibrachiatum Rifai,

5) Tr. aureoviride Rifai.

Посевным материалом служил вегетативный мицелий грибов, выращенный в течение 8—10 суток при температуре 28 °C на среде Чапека. Исследование проводили глубинным способом с использованием лабораторного встряхивателя № 357 («Poland») и поверхностным способом выращивания.

Фоном для изучения L-лизин-а-оксидазной активности гриба служила ранее предложенная среда [1], в состав которой вносились добавки различных источников углерода:

— вариант № 1 содержал крахмал;

— вариант № 2 содержал соевую муку, глюкозу;

— вариант № 3 содержал пшеничные отруби.

Опыты по изучению субстратной специфичности штаммов рода Trichoderma проводились при разных значениях рН реакционной смеси с использованием ацетатного буфера рН 5,0 и глицин-НО буфера рН 8,0.

Активность L-лизин-а-оксидазы в культуральной жидкости Trichoderma рассчитывали по приросту Н2О2, количество которой определяли спектрофотометрическим ортодиазидиновым микрометодом [3]. Сущность метода заключается во взаимодействии всей образующейся в реакции Н2О2 с О-дианизидингидро-хлоридом. Инкубационная смесь содержала 20 мкг пероксидазы, 250 мкг О-диа-низидингидрохлорида и 0,1—0,5 мг белка в 1 мл конечного объема. После 20 мин. инкубирования в термостате при 37 °C пробы охлаждали до 0—4 °C. Оптическую плотность окрашенных растворов опытной и контрольной (без субстрата) проб измеряли на спектрофотометре СФ-16 при 540 нм против второй контрольной пробы (без пероксидазы).

Для построения калибровочной кривой молярность свежеприготовленного раствора Н2О2 определяли перманганатометрией. Субстратами служили L- и DL-формы аминокислот («Reanal», Венгрия). Применяли 0,05 М фосфатный буфер. В качестве катализатора пероксидазной реакции использовали пероксидазу фирмы

«Reanal», а в качестве донора протонов — О-дианизидингидрохлорид («Merck», ФРГ). За единицу активности принимали количество фермента, катализирующего образование 1 мкмоль Н2О2 за 1 мин при 37 °С.

Удельную активность фермента выражали числом единиц активности на 1 мг белка или 1 мл культуральной жидкости. Белок определяли по методу Лоури [8]. В качестве стандарта использовали 0,05%-й раствор кристаллического бычьего альбумина («Reanal», Венгрия).

Результаты и обсуждение. На первых стадиях работы изучали биоситез фермента при различных способах выращивания триходермы: глубинном, стационарном и поверхностном (табл. 1).

Таблица 1

Образование Ь-лизин-а-оксидазы штаммом № 2 Trichoderma ер. при разных способах выращивания на среде с пшеничными отрубями (5-е сутки)

Способ выращивания рН Белок, і/мл Активность, и/мл

Глубинный 6,2 260 1,2

Стационарный 6,7 232 3,3

Поверхностный 6,0 420 4,8

Как видно из табл. 1, наилучший способ выращивания для биосинтеза L-ли-зин-а-оксидазы грибом триходермой — поверхностный: активность фермента оказывалась в 2—3 раза выше, чем при других способах выращивания.

При исследовании образования L-лизин-a-оксидазы Trichoderma harzianum Rifai в динамике на средах с использованием в качестве источника углерода крахмала, соевой муки, глюкозы, пшеничных отрубей при глубинном культивировании нами было выяснено, что на среде с пшеничными отрубями возможно наибольшее образование фермента (табл. 2). На других средах биосинтез фермента оказался весьма незначительным.

Таблица 2

Динамика образования Ь-лизин-а-оксидазы Тг. harzianum Rifai при глубинном культивировании на средах разного состава

Варианты сред* Сутки роста рН культуральной жидкости Белок, г/мл Активность, и/мл

№ 1 2 6,2 следы 0,3

3 6,3 следы 0,4

4 6,5 следы 0,5

5 6,5 следы 0,5

№ 2 2 5,4 40 0,4

3 5,7 60 0,5

4 6,5 56 0,6

5 6,4 56 0,6

№ 3 2 6,0 108 0,6

3 6,1 196 0,7

4 6,4 190 0,7

5 6,2 260 1,2

* Состав используемых сред указан в условиях эксперимента выше.

Растительные материалы, в том числе и пшеничные отруби, резистентны к действию различных гидролизующих агентов. Это обусловлено их нерастворимостью, высокой степенью кристалличности природной целлюлозы, наличием защитной матрицы, образованной лигнином и гемицеллюлозой, в которую погружены целлюлозные волокна.

Поры лигнифицированных тканей растений малы для прохождения ферментов. Однако использование питательной среды с подобными субстратами в качестве источников углерода вполне допустимо.

Предварительная стерилизация среды с пшеничными отрубями, которая происходит при повышенном давлении и высокой температуре, приводит субстрат в более доступную для использования грибами форму.

По-видимому, пшеничные отруби, в составе которых много целлюлозы, являются более подходящим источником углерода для биосинтеза фермента трихо-дермой. И это вполне понятно, так как в естественных условиях обитания в почве представители данного рода утилизируют целлюлозосодержащие растительные остатки, как бы адсорбируясь на них. Не исключено, что адгезия мицелия гриба на пшеничных отрубях способна изменять интенсивность и направленность фи-зиолого-биохимических процессов, осуществляемых триходермой [5]. В результате такой иммобилизации возможно значительное изменение проницаемости клеточных стенок.

Гемицеллюлозный субстрат — пшеничные отруби, как показали наши исследования, является индуктором биосинтеза L-лизин-а-оксидазы триходермой.

В дальнейших экспериментах нами была изучена субстратная специфичность штаммов — продуцентов фермента по отношению к природным аминокислотам, которые могут быть субстратом для роста гриба рода триходерма.

Проявляемая активность в отношении деструкции L-лизина для каждого штамма была принята за 100%.

Полученные результаты представлены в табл. 3.

Таблица 3

Изучение субстратной специфичности по отношению к природным аминокислотам штаммов рода Trichoderma на среде с пшеничными отрубями

№ Вид субстрата № штаммов

п/п 1 2 3 4 5

1 DL-лизин 100% 100% 100% 100% 100%

2 DL-лейцин 0 0 5,4% 0 0

3 L-валин 0 0 2,5% 0 0

4 DL-фенилаланин 10,5% 8% 0,9% 0 0

5 L-гистидин 0 0 1,4% 0 1,4%

6 L-треонин 0 0 1,4% 0 0

7 L-аргинин 0 0 5,6% 0 11,6%

8 DL-серин 0 0 0 0 0

9 L-триптофан 0 0 1,2% 0 0

10 L-аланин 0 0 1,7% 0 0

11 L-пролин 0 0 2,8% 0 0

12 L-цистеин 0 0 0 0 0

13 L-аспарагин 0 0 0 0 0

14 DL-аспарагиновая кислота 0 0 0 0 0

15 DL-метионин 7,2% 1,2% 3,8% 0 4%

16 DL-изолейцин 0 0 1,0% 0 0

17 DL-тирозин 0 0 2,7% 0 0

18 DL-глицин 0 0 3,8% 0 0

19 L-глутамин 0 0 1,1% 0 1,6%

20 DL-глутаминовая кислота 0 0 0 0 0

* № штаммов указаны в условиях эксперимента выше.

Как видно из табл. 3, высокой специфичностью обладали штаммы Тг. viride Pers ex S.F. Grey, Tr. harzianum Rifai, Tr. longibrachiatum Rifai ВКМБ-2025. Штамм № 3

вызывал деструкцию почти всех природных аминокислот, за исключением DL-се-рина, L-цистеина, L-аспарагина, DL-аспарагиновой, DL-глутаминовой кислот. Однако проявляемая активность была в пределах от 5,6% до 0,9% в сравнении со 100% деструкцией L-лизина оксидазой триходермы. Из представленных результатов видно, что каждый вид гриба при утилизации пшеничных отрубей проявляет разный спектр аминооксидазных активностей.

В последующих экспериментах нами исследовалась зависимость проявления аминооксидазных активностей триходермой от срока использования субстрата — пшеничных отрубей (табл. 4).

Таблица 4

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Изучение субстратной специфичности штамма Тг. Иатапыт Р1Та1 в зависимости от возраста культуры, выращенной на среде с пшеничными отрубями

Возраст культуры 3-и сутки роста 8-е сутки роста 18-е сутки роста

Активность по лизину ^мл 3,9 5,4 6,7

Субстрат*

1. DL-лизин 100% 100% 100%

2. DL-фенил-аланин 1,2% 10,0% 18,0%

3. L-аргинин 0 0 7,0%

4. DL-метионин 0 1,0% 6,0%

*Штамм № 2 не проявлял оксидазную активность в отношении аминокислот валина, треонина, серина, триптофана, аланина, пролина, цистеина, аспарагина, аспартата, изолейцина, тирозина, глицина, глутамата, лейцина.

Как видно из табл. 4, наблюдается расширение спектра проявления аминооксидазных активностей штаммом № 2 в зависимости от срока культивирования гриба на среде с пшеничными отрубями. Причем проявляемая активность в отношении деструкции аминокислоты L-лизина всегда была наибольшей.

Известно, что скорость любой ферментативной реакции зависит от рН реакционной среды. Поэтому вполне оправданным было исследование субстратной специфичности оксидаз L-аминокислот штаммов триходермы при разных значениях рН реакционной среды.

С этой целью были отобраны два штамма, активные в отношении деструкции L-лизина: штамм № 2 — ^. harzianum Rifai, штамм № 5 — ^. aureoviride Rifai. Исследование проводились с использованием в реакционной среде ацетатного буфера рН 5,0 и глицин-НО буфера рН 8,0.

Результаты эксперимента представлены в табл. 5.

Таблица 5

Изменения субстратной специфичности штаммов рода Trichoderma при разных значениях рН реакционной смеси (8-е сутки роста)

Штамм № 2 № 5

Активность по лизину, ^мл 5,7 3,0 6,4 3,0

рН буфера 5,0 8,0 5,0 8,0

Субстрат*

1. DL-лизин 100% 100% 100% 100%

2. DL-фенил-аланин 8,6% 2,0% 5,6,% 6,8%

3. L-гистидин 0 0 7,4% 5,2%

4. L-аргинин 0 13,1% 2,0% 22,0%

5. DL-метионин 0,7% 0 2,4% 3,7%

6. L-глутамин 0 0 1,5% 0,8%

*Штаммы № 2, № 13 не проявляли оксидазной активности в отношении аминокислот валина, треонина, серина, триптофана, аланина, пролина, цистеина, аспарагина, аспартата, изолейцина, тирозина, глицина, глутамата, лейцина.

Как видно из табл. 5, наибольшая оксидазная активность была в отношении деструкции L-лизина. Для штамма № 2 при рН 5,0 L-лизин-а-оксидазная активность составила 5,7 U/мл, а при рН 8,0, соответственно, 3,0 U/мл.

Для штамма № 5 при рН 5,0 L-лизин-а-оксидазная активность составила 6,4 U/мл, а при рН 8,0, соответственно, 3,0 U/мл.

Для штамма Tr. harzianum Rifai подщелачивание реакционной среды до рН 8,0 приводило к появлению L-аргинин-а-оксидазной активности и снижению активности в отношении деструкции L-метионина.

L-фенилаланин-а-оксидазная активность снижалась в четыре раза при использовании глицин-НО буфера рН 8,0.

Для штамма Tr. aureoviride Rifai (штамм № 5) спектр проявляемых оксидаз-ных активностей в отношении L-аминокислот не менялся с изменением рН среды, однако также, как и у предыдущего штамма, оксидазная активность в отношении деструкции L-лизина была наибольшей.

Количественный показатель деструкции аминокислоты L-аргинина значительно возрастал при определении оксидазной активности при рН реакционной среды 8,0 как для штамма № 2, так и для штамма № 5. Причем для последнего увеличение L-аргинин-а-оксидазной активности возрастало в десять раз.

Как видно из представленных результатов, каждый штамм различных представителей триходермы — продуцентов L-лизин-а-оксидазы проявляет свой специфический спектр деструкции аминокислот, который может служить биохимической характеристикой штамма.

Очевидно, что изучение спектра деструкции аминокислот разных штаммов грибов необходимо проводить при разном значении рН реакционной среды, подбирая оптимальные условия для ее проявления.

Можно предположить, что при использовании гемицеллюлозного субстрата штаммы грибов рода триходерма в природных условиях могут утилизировать аминокислоты в широком диапазоне рН, что позволяет этому роду конкурировать в почве с другими микроорганизмами.

ЛИТЕРАТУРА

[1] Kusakabe C., Kodama K., Kununaka A., Yoshino H., Soda K. Extracellular producion of L-ly-sine-a-oxidase in wheat bran culture of a strain of Trichoderma viride // Agric. Biol. Chem. — 1979. — 43. — 12. — P. 2531—2533.

[2] Kusakabe C., Kodama K., Kununaka A., Yoshino H., Soda K., Misono H. A new antitumor en-zime L-lysine-a-oxidase from Trichoderma viride // J. Bio. chim. — 1980. — Vol. 255. — № 3. — P. 976—981.

[3] Lowry O.H., Roserbrogh N.Y., Farr A.L., Randall R.Y. Protein measurement with the Folin phenol reagent // J. Biol. Chem. — 1954. — Vol. 193. — P. 265—275.

[4] Алимова Ф.К. Промышленное применение грибов рода Trichoderma. — Казань: КГУ, 2006.

[5] Смирнова И.П. Продуценты оксидаз L-аминокислот и возможные области их применения // Биотехнология. — 1991.— № 3. — С. 3—7.

[6] Смирнова И.П., Потапова О.Л. Индукция синтеза оксидаз L-аминокислот биостимуляторов бактериального и грибного происхождения // Биотехнология. — 1991. — № 2. — С. 25—26.

[7] Смирнова И.П., Сяткин С.П., Березов Т. Т. Спектрофотометрический метод определения Ь-лизин-а-оксидазы // Вопр. мед. химии. — 1984. — №1. — С. 133—136.

[8] Смирнова И.П., Гуськова Т.А., Пушкина Т.В., Подборонов В.М. Антибактериальная и антимикробная активность Ь-лизин-а-оксидазы Trichoderma harzianum Rifai // Сибирь— Восток. — 2003. — Вып. 1 (61). — С. 10—12.

GEMYCELLULOSE SUBSTRATUM INDUCTOR OF BIOSYNTHESIS OF L-LYSIN-a-OXIDASE (LO) BY TRICHODERMA SP.

I.P. Smirnova1, J.A. Shneider2,

A.A Shevchenko1

department of biochemistry ^Department of botany, plant physiology, plant pathology and agrobiotechnology Russian People’s Friendship University

Miklukho-Maklaya str., 8/2, Moscow, Russia, 117198

Studies on the biosynthesis of L-lysine-a-oxidase enzyme by Trichoderma sp. were carried out using various growing methods and media with various carbon sources. The enzyme was actively synthesized only on the wheat brans medium. The growth of Trichoderma strains on the gemycellulose substrate medium showed a different range of L-amino acid oxidase activety.With the Trichoderma culture getting older, the range of amino-oxidase activety widened, but for each strain it remained unique.

Key words: enzyme, trichoderma, aminooxidase, biosynthesis.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.