Научная статья на тему 'ГАЛОФИЛЬНЫЙ ШТАММ - ДЕСТРУКТОР БЕНЗОЙНОЙ КИСЛОТЫ HALOMONAS SP. D2'

ГАЛОФИЛЬНЫЙ ШТАММ - ДЕСТРУКТОР БЕНЗОЙНОЙ КИСЛОТЫ HALOMONAS SP. D2 Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
42
9
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ГАЛОФИЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ / HALOMONAS / РАЗЛОЖЕНИЕ БЕНЗОЙНОЙ КИСЛОТЫ / СЕКВЕНИРОВАНИЕ / ГЕН BENA

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Усанина Д.И., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г.

Бензойная кислота используется в промышленности, а также является промежуточным продуктом микробиологического разложения многих ароматических соединений - загрязнителей окружающей среды. Штамм Halomonas sp. D2, выделенный из глинистых отложений соляной шахты Верхнекамского месторождения (г. Соликамск, Пермский край), способен использовать бензойную кислоту (БК) в качестве единственного источника углерода и энергии. Halomonas sp. D2 растет на богатой среде Раймонда в присутствии 10-300 г/л NaCl и на минеральной среде с БК (1 г/л) при 3070 г/л соли. В геноме штамма выявлен ген benA, кодирующий а-субъединицу бензоат 1,2-диоксигеназы - ключевого фермента разложения БК. Анализ нуклеотидной последовательности гена benA штамма D2 показал наиболее высокий уровень сходства (94.86%) с последовательностью benA-гена типового штамма Halomonas taeanensis BH539T, с которым штамм D2 наиболее филогенетически близок и по гену 16S рРНК (сходство 99.43%). Выявленные свойства штамма Halomonas sp. D2 делают его перспективным для использования в биотехнологиях восстановления засоленных почв и водоемов, загрязненных ароматическими углеводородами.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Усанина Д.И., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

BENZOIC ACID-DEGRADING HALOPHILIC STRAIN HALOMONAS SP. D2

Benzoic acid is widely used in various fields of industry, and it is a intermediate in the bacterial catabolism of many aromatic compounds, environmental pollutants. Halomonas sp. D2 strain, isolated from clay deposits of the salt mine of the Verkhnekamsky salt deposit (Solikamsk, Perm krai) is capable of using benzoic acid (BA) as a sole source of carbon and energy. Halomonas sp. D2 grows in the rich Raymond's medium in the presence of 10-300 g/L NaCl and in the mineral medium with BA (1 g/L) in the presence of 30-70 g/L NaCl. The gene (benA) encoding the benzoate 1,2-dioxygenase alpha subunit was detected in the strain D2. Analysis of benA gene of the strain D2 showed the highest similarity (94.86%) with benA gene of Halomonas taeanensis BH539T with which the strain D2 is the most phylogenetically close in the 16S rRNA gene (99.43% similarity). The revealed properties of Halomonas sp. D2 strain makes it promising for use in biotechnologies for the restoration of saline soils and water contaminated with aromatic hydrocarbons.

Текст научной работы на тему «ГАЛОФИЛЬНЫЙ ШТАММ - ДЕСТРУКТОР БЕНЗОЙНОЙ КИСЛОТЫ HALOMONAS SP. D2»

ВЕСТНИК ПЕРМСКОГО УНИВЕРСИТЕТА

2021 БИОЛОГИЯ Вып. 3

МИКРОБИОЛОГИЯ

УДК 579.26:57.083.18

DOI: 10.17072/1994-9952-2021-3-171-177.

Д. И. Усанина1, А. А. Пьянкова2, Е. Г. Плотникова1,2

1 Пермский государственный национальный исследовательский университет, Пермь, Россия

2 Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН - филиал ФГБУН ПФИЦ УрО РАН, Пермь, Россия

ГАЛОФИЛЬНЫЙ ШТАММ - ДЕСТРУКТОР БЕНЗОЙНОЙ КИСЛОТЫ Halomonas sp. D2

Бензойная кислота используется в промышленности, а также является промежуточным продуктом микробиологического разложения многих ароматических соединений - загрязнителей окружающей среды. Штамм Halomonas sp. D2, выделенный из глинистых отложений соляной шахты Верхнекамского месторождения (г. Соликамск, Пермский край), способен использовать бензойную кислоту (БК) в качестве единственного источника углерода и энергии. Halomonas sp. D2 растет на богатой среде Раймонда в присутствии 10-300 г/л NaCl и на минеральной среде с БК (1 г/л) при 3070 г/л соли. В геноме штамма выявлен ген benA, кодирующий а-субъединицу бензоат 1,2-диоксигеназы - ключевого фермента разложения БК. Анализ нуклеотидной последовательности гена benA штамма D2 показал наиболее высокий уровень сходства (94.86%) с последовательностью benA-гена типового штамма Halomonas taeanensis BH539T, с которым штамм D2 наиболее филогенетически близок и по гену 16S рРНК (сходство 99.43%). Выявленные свойства штамма Halomonas sp. D2 делают его перспективным для использования в биотехнологиях восстановления засоленных почв и водоемов, загрязненных ароматическими углеводородами.

Ключевые слова: галофильные бактерии; Halomonas; разложение бензойной кислоты; секвенирование; ген benA.

D. I. Usanina1, A. A. Pyankova2, E. G. Plotnikova1,2

1 Perm State University, Perm, Russian Federation

2 Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms of the Ural Branch RAS, Perm, Russian Federation

Benzoic acid-degrading halophilic strain Halomonas sp. D2

Benzoic acid is widely used in various fields of industry, and it is a intermediate in the bacterial catabo-lism of many aromatic compounds, environmental pollutants. Halomonas sp. D2 strain, isolated from clay deposits of the salt mine of the Verkhnekamsky salt deposit (Solikamsk, Perm krai) is capable of using benzoic acid (BA) as a sole source of carbon and energy. Halomonas sp. D2 grows in the rich Raymond's medium in the presence of 10-300 g/L NaCl and in the mineral medium with BA (1 g/L) in the presence of 30-70 g/L NaCl. The gene (benA) encoding the benzoate 1,2-dioxygenase alpha subunit was detected in the strain D2. Analysis of benA gene of the strain D2 showed the highest similarity (94.86%) with benA gene of Halomonas taeanensis BH539T with which the strain D2 is the most phylogenetically close in the 16S rRNA gene (99.43% similarity). The revealed properties of Halomonas sp. D2 strain makes it promising for use in biotechnologies for the restoration of saline soils and water contaminated with aromatic hydrocarbons.

Key words: halophilic bacteria; Halomonas; degradation of benzoic acid; DNA sequencing; benA gene.

Бензойная кислота относится к классу моноароматических соединений, которые в своем составе имеют одно ароматическое кольцо. Бензойная кислота и ее производные, благодаря своим фунгицидным и антибактериальным свойствам, широко применяются в пищевой, косметической индустрии в качестве консервантов (пищевые добавки Е210-Е219), а также в медицине в качестве лекарственных средств. Кроме того, бензойная кислота используется в химической промышленно-

сти как сырьё для получения широкого спектра соединений, таких как фенол, пластификаторы, бен-зоилхлорид и другие. Известно, что некоторые аэробные микроорганизмы способны разлагать сложные полиароматические соединения, в том числе такие стойкие органические загрязнители, как бифенил, полихлорированные бифенилы, с образованием бензойной кислоты в качестве промежуточного продукта [Pieper, 2005]. В литературе описаны бактерии разных таксономических групп,

© Усанина Д. И., Пьянкова А. А., Плотникова Е. Г., 2021

171

способные осуществлять разложение бензойной кислоты и использовать ее в качестве единственного источника углерода и энергии [Field, Sierra-Alvarez, 2008; Егорова, Пьянкова, 2019]. В то же время крайне ограничена информация о галофиль-ных бактериях-деструкторах, строении и функционировании их метаболических, генетических систем, контролирующих разложение бензойной кислоты в условиях засоления [Fathepure, 2014].

Ранее из соляной шахты района промышленных разработок Верхнекамского месторождения калийно-магниевых солей (ВМКС) были выделены галофильные бактерии, которые на основании морфологических, физиологических и генетических исследований были идентифицированы как представители семейства Halomonadaceae (класс Gammaproteobacteria) [Пьянкова и др., 2020]. На настоящем этапе изучения проводится дальнейшая характеристика выделенных галофилов, в том числе для перспективы использования в биотехнологических целях. Цель настоящей работы - изучение способности галофильного штамма Halomonas sp. D2 разлагать бензойную кислоту в условиях повышенной солености среды, а также выявление и филогенетическая характеристика ключевого гена катаболизма бензойной кислоты (benA).

Материалы и методы исследования

Объектом исследования являлся штамм Halomonas sp. D2, выделенный из глинистых донных отложений рассолоотводящей выработки одного из рудников ВМКС [Пьянкова и др., 2020]. Также в работе был использован типовой штамм Halomonas taeanensis BH539T из рабочей коллекции лаборатории микробиологии техногенных экосистем «ИЭГМ УрО РАН».

Среды и условия культивирования. При

культивировании бактерий использовали минеральную среду Раймонда (МСР) [Raymond, 1961], а также богатую среду Раймонда (БСР) с трипто-ном (5 г/л) и дрожжевым экстрактом (2.5 г/л), с разным содержанием NaCl (от 10 до 300 г/л). Для агаризованных сред добавляли 15 г/л агара. Культивирование проводили при 28 °С.

Устойчивость бактерий к различным концентрациям хлорида натрия оценивали по появлению и размеру колоний при росте на агаризо-ванной БСР без соли и с содержанием NaCl от 10 до 300 г/л. Оценку роста колоний проводили через 2 недели после культивирования.

Рост бактерий на ароматических соединениях оценивали при культивировании в жидкой минеральной среде Раймонда (30 г/л NaCl). Бензойную кислоту, нафталин, бифенил, орто-фталат,

как единственный источник углерода и энергии, добавляли в среду в количестве 1 г/л, салициловую кислоту - 0.5 г/л. Культивирование проводили на термошейкере при 28°С при 140 об./мин. Рост штаммов оценивали при определении оптической плотности культуры (ОП600) на спектрофотометре UV-Visible BioSpec-mini («Shimadzu», Япония) при длине волны 600 нм в кювете с длиной оптического пути 1 см.

Ростовые характеристики штамма D2 определяли при выращивании в жидкой МСР с бензойной кислотой (1 г/л) и содержанием 30 г/л NaCl, оптимальным для роста культуры. Культивирование проводили на термошейкере при 28°С при 140 об./мин. в течение 2 недель. Рост штаммов оценивали при определении оптической плотности культуры (ОП600). Параметры роста культуры рассчитывали согласно Г. Шлегеля [1987]. Эксперименты были выполнены в трехкратной повторности. Полученные данные обрабатывали с использованием стандартных пакетов компьютерных программ Microsoft Excel.

Выделение бактериальной ДНК. Единичную колонию чистой культуры бактерий при помощи платиновой петли помещали в пробирку «эппен-дорф», содержащую 100 мкл 0.05 NaOH. Смесь инкубировали при 95°C в течение 15 мин., затем охлаждали 15 мин. при температуре -20°C, далее центрифугировали при 12 000 об./мин. 30 сек. Процедуру повторяли 4 раза. Для проведения ам-плифкации отбирали 1 мкл супернатанта.

Амплификация и определение нуклеотидных последовательностей гена benA. Для амплификации гена benA, кодирующего а-субъединицу бензоат 1,2-диоксигеназы, использовали праймеры benA-F (5'-GCCCACGAGAGCCAGATTCCC-3') и benA-R (5'-GGTGGCGGCGTAGTTCCAGTG-3') при условиях, приведенных в публикации [Baggi et al., 2008]. Амплификацию осуществляли на приборе C1000 TouchTM Thermal Cycler («Bio-Rad Laboratories», США). В качестве положительного контроля был использован штамм Rhodococcus wratislaviensis КТ112-7, деструктор бензойной кислоты [Егорова и др., 2013]. Анализ продуктов амплификации и документирование полученных результатов осуществляли, как описано ранее [Пьянкова и др., 2020].

Определение нуклеотидных последовательностей гена benA проводили на автоматическом се-квенаторе Genetic Analyzer 3500xl («Applied Biosystems», США), с применением реактивов Big Dye Terminator Ready Reaction Kit v 3.1 («Applied Biosystems», США), согласно рекомендациям производителя, на кафедре ботаники и генетики растений Пермского государственного национального исследовательского университета. Поиск гомоло-

гичных последовательностей гена benA осуществляли с использованием базы данных GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov). Множественное выравнивание транслированных аминокислотных последовательностей гена benA и построение филогенетического дерева проводили с использованием программы MEGA 7.0. При построении филогенетического дерева применяли кластерный метод «neighbor-joining». Оценку статистической достоверности ветвления («bootstrap»-анализ) устанавливали на основе 1000 альтернативных деревьев. Нуклеотидная последовательность гена benA депонирована в базу данных GenBank под номером MW862487.

Результаты и их обсуждение

Ранее из образца глинистых отложений соляной шахты ВКМС был выделен грамотрицательный штамм D2. В результате секвенирования и сравнения последовательностей гена 16S рРНК с типовыми штаммами из базы данных EzBioCloud было установлено, что данный штамм относится к се-

мейству Halomonadaceae (класс Gammaproteo-bacteria) и имеет наибольшее сходство (99.43% по гену 16 S рРНК) с типовым штаммом Halomonas taeanensis BH539T [Пьянкова и др., 2020].

Проведенные исследования по изучению дегра-дационных свойств штамма D2 показали, что он способен использовать в качестве единственного источника углерода и энергии бензойную кислоту, но не другие моно- и полиароматические соединения (в частности, салициловую, орто-фталевую кислоты, нафталин, бифенил).

Установлено, что штамм Halomonas sp. D2 является галофильным организмом и способен к эффективному росту в БСР при содержании хлорида натрия от 10 до 300 г/л. В сравнении, штамм Halomonas taeanensis BH539T выдерживал не более 250 г/л NaCl при культивировании в аналогичных условиях. Оба штамма не росли при отсутствии соли в среде. В МСР с использованием в качестве субстрата бензойной кислоты (1 г/л) штаммы Halomonas sp. D2 и H. taeanensis BH539T росли в присутствии 10-70 г/л соли (табл. 1).

Таблица 1

Рост бактерий рода На1ошопан в присутствии различных концентраций хлорида натрия

Штамм Агаризованная БСР, NaCl (г/л) Жидкая МСР, бензойная кислота (1 г/л), NaCl (г/л)

Без NaCl 10 100 150 200 250 300 Без NaCl 30 50 70

H. taeanensis DSM 16463T - + + + + + - - +++ ++ +

Halomonas sp. D2 - + + + + + + - +++ +++ ++

Примечание. «-» - рост не обнаружен; «+» - на агаризованной среде, колонии размеров больше 2 мм; «+» - в жидкой среде, ОЩ00 от 0.1 до 0.3 ед.; «++» - ОЩ00 от 0.4 до 0.7 ед.; «+++» - ОЩ00 выше 0.7 ед.

Штамм D2 демонстрировал наибольший прирост биомассы при выращивании на бензоате в присутствии 30 г/л №0. На рисунке 1 представлена кривая роста штамма D2. На начальных этапах культивирования наблюдался замедленный рост культуры (ОПбоо не превышала 0.2 ед.), толь-

ко через 150 ч. был отмечен активный прирост биомассы. Максимальная ОП600, равная 1.05 ед., наблюдалась при 259 ч. (11-е сут.) культивирования. Скорость экспоненциального роста (ц) составляла 0.0211±0.003 ч-1.

Рис. 1. Рост штамма Halomonas sp. D2 в МСР (30 г/л NaCl) на бензойной кислоте (1 г/л) в качестве

единственного источника углерода и энергии

На ДНК-матрице штамма D2 был амплифици- зоат 1,2-диоксигеназы - ключевого фермента, рован ген benA, кодирующий а-субъединицу бен- участвующего на начальном этапе окислении бен-

зоата [Parales, Resnick, 2006]. Также фрагмент аналогичного размера (около 521 п.н.) был обнаружен в ДНК штамма H. taeanensis BH539T, что указывает на присутствие гена benA в ДНК типового штамма (рис. 2).

Полученный ампликон гена benA Halomonas sp. D2 был секвенирован. Проведен сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гена benA штамма Halomonas sp. D2 с гомологичными последовательностями из базы данных GenBank (табл. 1). Установлено, что наиболее близким к изучаемому гену является ген а-субъединицы бензоат/толуат-1,2-диоксигеназы типового штамма H. taeanensis BH539T (FNCI01000003). Сходство гена benA штамма Halomonas sp. D2 c гомологичным геном H. taeanensis BH539T составляло 94.86%. С другими подобными генами представителей рода Halomonas уровень сходства не превышал 89.38%, а с генами штаммов других родов семейства Рис. 2. Электрофореграмма результатов Halomonadaceae - 78.13% (ближайшая последова-

амплификации гена benA: тельность гена benA Chromohalobacter sp. HS2,

M - маркер 100+ bp DNA Ladder (Евроген, EU155151) (табл. 2).

Россия), 1 - Halomonas sp. D2, 2 - H. taeanensis BH539T, K+ - Rhodococcus wratislaviensis КТ112-7, K- - отрицательный контроль

Таблица 2

Сравнительный анализ гена benA штамма Halomonas sp. D2 с ближайшими гомологичными последовательностями из базы данных GenBank

Гомологичные гены Номер в GenBank* Номер в GenBank** Сходство, % Место выделения Ссылка

Бензоат/толуат 1,2-ДО, H. taeanensis ВН539Т FNCI01000003 SDF94072 94.86 Солнечная солеварня, Корея н.д.

Бензоат 1,2-ДО, H. aestuarii НЬ3 CP018139 APE30514 89.38 Солеварня, Корея н.д.

Белок с кластером Риске [2Бе-28], Halomonas Бр. ВМ-2019 CP071922 QTF93273 87.90 Озерная вода, Танзания н.д.

Бензоат 1,2-ДО, H. beme-nensis ОТи-111 CP021435 ATJ82503 87.50 Солеварня, Тайвань Chen et al., 2017

Бензоат 1,2-ДО, H. organivorans СЕСТ 5995Т FN997646 CBR26855 86.74 Засоленная почва, Испания García et al., 2004

Белок с кластером Риске [2Бе-28], Halomonas Бр. РвЕ1 CP053032 QJQ97940 86.70 Гиперсоленая экосистема, Нидерланды н.д.

Бензоат 1,2-ДО, Chromo-halobacter Бр. Н82 EU155151 ABV82781 78.13 Солёные ферментированные моллюски Kim et al., 2008

Примечание: «н.д.» - нет данных; * ности.

нуклеотидные последовательности; ** - аминокислотные последователь-

на основании полученных данных построено филогенетическое дерево, показывающее положение транслированных аминокислотных последовательностей benA штамма Halomonas Бр. D2 и гомологичных последовательностей представителей семейства Halomonadaceaе (рис. 3).

Гены benA, кодирующие большую субъединицу ключевого фермента деструкции БК - бензоат 1,2-диоксигеназы, выявлены в геномах бактерий различных таксономических групп [Егорова, Пьянкова, 2019]. На настоящем этапе исследований пока-

зано, что ген benA штамма Halomonas sp. D2 является наиболее филогенетически близким benA-генам галофильных бактерий-деструкторов бензо-ата, рода Halomonas (сем. Halomonadaceae) и, кроме того, имеет высокий процент сходства (94.86%) с benA-геном типового штамма вида H. taeanensis, который является наиболее близкородственным по гену 168 рРНК штамму Б 2 [Пьянкова и др., 2020]. Таким образом, мы предполагаем, что benA -ген может быть использован в качестве филогенетического маркера для определения бакте-

рий рода Halomonas среди деструкторов БК раз- личных таксонов прокариот.

95

75

57

- БешиУТ 1т2-ДО, IMmiwmts sp. D2 (MWNÄ24N7)

"Бетоат/толуат 1.2-ДО, Я. taeanensis ВН539Т (SI 3F94072 )

>4

-Иенчгат 1,2-ЛО. //. nestiuirii I llv; (API-3(1514)

—Бенэадт 1,2-ДО, ff. beimenensis NTU-111 (АТШ503) -Белок с кластером Риск е. На/ошонач sp, ВМ-20 19 ( QTF93 2 7 3 )

-1>еллк с кластером Риске,Halvmопаз sp. Ptilil ( QJQ9794Ö)

-Бетзоат J.2-ДО. Я orgœmomus СЕСТ 5995T(CBR26855) -Пензоат 1.2'-ДО, Cfiromokalobacter sp. HS2 (ABVX27ÄI )

0.01

Рис. 3. Филогенетическое дерево, построенное с использованием метода neighbor-joining, показывающее положение транслированных аминокислотных последовательностей гена benA Halomonas sp. D2 и ближайших последовательностей из базы данных GenBank

Заключение

В результате проведенных исследований было установлено, что штамм Halomonas sp. D2 является активным деструктором бензойной кислоты, способным осуществлять ее разложение (1 г/л) в присутствии высоких концентраций хлорида натрия (30-70 г/л). Полученные данные указывают на возможность использования штамма при разработке технологий, направленных на очистку объектов окружающей среды от токсичных ароматических поллютантов.

Работа выполнена в рамках государственного задания, номер госрегистрации темы: АААА-А19-119112290008-4.

Список литературы

Егорова Д. О. и др. Деструкция ароматических углеводородов штаммом Rhodococcus wrati-slaviensis KT112-7, выделенным из отходов соледобывающего предприятия // Прикладная биохимия и микробиология. 2013. Т. 49, № 3. С. 267-278.

Егорова Д.О., Пьянкова А.А. Скрининг гена альфа-субъединицы бензоат диоксигеназы в бактериальных ассоциациях, полученных в результате селекции на (хлор)ароматических соединениях // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2019. Вып. 4. С. 464-470. Пьянкова А.А. и др. Характеристика бактерий, выделенных из рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край) // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2020. Вып. 4. С. 312-320. Шлегель Г. Общая микробиология: пер. с нем. М.: Мир, 1987. 567 с.

Baggi G. et al. Co-metabolizm of di- and trichlorben-zoates in a 2-chlorobenzoate-degrading bacterial culture: Effect of the position and number of halo-substituents // International Biodeterioration and Biodegradation. 2008. Vol. 62, № 1. P. 57-64.

Chen Y. et al. Revealing the saline adaptation strategies of the halophilic bacterium Halomonas beimenensis through high-throughput omics and transposon mutagenesis approaches // Science Reports. 2017. Vol. 7. P. 183-195.

Fathepure B.Z. Recent studies in microbial degradation of petroleum hydrocarbons in hypersaline environments // Frontiers in Microbiology. 2014. Vol. 5. P. 173.

Field J.A., Sierra-Alvarez R. Microbial transformation of chlorinated benzoates // Reviews in Environmental Science and BioTechnology. 2008. Vol. 7. P. 191-210.

Garcia M.T. et al. Halomonas organivorans sp. nov., a moderate halophile able to degrade aromatic compounds // International Journal of Systematic and Evolutionary of Microbiology. 2004. Vol. 54, № 5. P. 1723-1728.

Kim D. et al. Molecular cloning and functional characterization of the genes encoding benzoate and p-hydroxybenzoate degradation by the halophilic Chromohalobacter sp. strain HS-2 // FEMS Microbiology Letters. 2008. Vol. 280, № 2. P. 235-241.

Parales R.E., Resnick S.M. Aromatic ring hydroxylat-ing dioxygenases // Pseudomonas / Eds. J.L. Ramos, R.C. Levesque. Boston: Springer, 2006. P. 287-340.

Pieper D.H. Aerobic degradation of polychlorinated biphenyls. // Applied Microbiology Biotechnology. 2005. Vol. 67, № 2. P. 170-191.

Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons // Developments in Industrial Microbiology. 1961. Vol. 2, № 1. P. 23-32.

References

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Baggi G., Bernasconi S., Zangrossi M., Cavalca L., Vincenza A. Co-metabolizm of di- and trichlor-benzoates in a 2-chlorobenzoate-degrading bacterial culture: Effect of the position and number of halo-substituents. International Biodeterioration and Biodegradation. V. 62, N 1 (2008): pp. 5764.

Chen Y., Lu C., Shyu Y., Lin S. Revealing the saline adaptation strategies of the halophilic bacterium Halomonas beimenensis through high-throughput omics and transposon mutagenesis approaches. Science Reports. V. 7 (2017): pp. 183-195.

Egorova D.O., Korsakova E.S., Demakov V.A., Plot-nikova E.G. [Destruction of aromatic hydrocarbons by the Rhodococcus wratislaviensis KT112-7 strain isolated from waste products of a salt-mining factory]. Prikladnaja biochimija i mikro-biologija. V. 49. N 3 (2013): pp. 267-278. (In Russ.).

Egorova D.O., Pyankova A.A. [Alpha-subunit benzo-ate dioxygenase gene screening in bacterial associations obtained by selection on (chlorine) aromatic compounds]. Vestnik Permskogo universi-teta. Biologija. Iss. 4 (2019): pp. 464-470. (In Russ.).

Fathepure B.Z. Recent studies in microbial degradation of petroleum hydrocarbons in hypersaline environments. Frontiers in Microbiology. V. 5 (2014): p. 173.

Field J.A., Sierra-Alvarez R. Microbial transformation of chlorinated benzoates. Reviews in Environmental Science and BioTechnology. V. 7 (2008): pp. 191-210.

Garcia M.T., Mellado E., Ostos J.C., Ventosa A.

Halomonas organivorans sp. nov., a moderate halophile able to degrade aromatic compounds.

International Journal of Systematic and Evolutionary of Microbiology. V. 54, N 5 (2004): pp. 1723-1728.

Kim D., Kim S.W., Choi K.Y., Lee J.S., Kim E. Molecular cloning and functional characterization of the genes encoding benzoate and p-hydroxybenzoate degradation by the halophilic Chromohalobacter sp. strain HS-2. FEMS Microbiology Letters. V. 280, N 2 (2008): pp. 235-241. Parales R.E., Resnick S.M. Aromatic ring hydroxylat-ing dioxygenases. In Pseudomonas. Eds. Ramos J.L., Levesque R.C. Boston, Springer, 2006, pp. 287-340.

Pieper D.H. Aerobic degradation of polychlorinated biphenyls. Applied Microbiology Biotechnology. V. 67, N 2 (2005): pp. 170-191. Pyankova A.A., Usanina D.I., Aleev V.S., Blinov S.M., Plotnikova E.G. [Characteristics of bacteria isolated from the miner of the Verkhnekamsky salt deposit (Perm krai)]. Vestnik Permskogo uni-versiteta. Biologija. Iss. 4 (2020): pp. 312-320. (In Russ.).

Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons. Developments in Industrial Microbiology. V. 2, N 1 (1961): pp. 23=32. Schlegel H. Obscaja mikrobiologija [General Microbiology]. Moscow, Mir Publ., 1987. 567 p. (In Russ.).

Поступила в редакцию 08.07.2021

Об авторах

Усанина Дарья Игоревна, студент ФГАОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» ОКСГО: 0000-0003-0436-0890 614068, Пермь, ул. Букирева, 15; usanina_d@mail.ru; 89824588408

Пьянкова Анна Александровна, инженер лаборатории микробиологии техногенных экосистем «Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН ОКСГО: 0000-0003-2210-7873х 614081, г. Пермь, ул. Голева, 13; annpjankva@mail.ru; (342)2808431

About the authors

Usanina Darya Igorevna, student Perm State University. ORCID: 0000-0003-0436-0890 15, Bukirev str., Perm, Russia, 614990; usanina_d@mail.ru; 8-9824588408

Pyankova Anna Aleksandrovna, engineer of laboratory of microbiology of technogenic ecosystems Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms UB RAS.

ORCID: 0000-0003-2210-7873x 13, Golev str., Perm, Russia, 614081; annpjankva@mail.ru; (342)2808431

Плотникова Елена Генриховна, доктор биологических наук, заведующая лабораторией микробиологии техногенных экосистем «Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН

профессор кафедры ботаники и генетики растений

ФГАОУВО «Пермский государственный

национальный исследовательский университет»

ОКСГО: 0000-0002-0107-0719

614081, Пермь, ул. Голева, 13; peg_el@mail.ru;

(342)2808431

Plotnikova Elena Genrikhovna, doctor of biology, head of the laboratory of microbiology of technogenic ecosystems

Institute of Ecology and Genetics of Microorganism UB RAS.

professor of the Department of botany and plant genetics

Perm State University. ORCID: 0000-0002-0107-0719 13, Golev str., Perm, Russia, 614081; peg_el@mail.ru; (342)2808431

Информация для цитирования:

Усанина Д.И., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Галофильный штамм-деструктор бензойной кислоты Halomonas sp. D2 // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2021. Вып. 3. С. 171-177. DOI: 10.17072/1994-9952-2021-3-171-177.

Usanina D.I., Pyankova A.A., Plotnikova E.G. [Benzoic acid-degrading halophilic strain Halomonas sp. D2]. Vestnik Permskogo universiteta. Biologija. Iss. 3 (2021): pp. 171-177. (In Russ.). DOI: 10.17072/19949952-2021-3-171-177.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.