Научная статья на тему 'ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГРИБОВ РОДА PENICILLIUM И TALAROMYCES, АССОЦИИРОВАННЫХ С БУРЫМИ ВОДОРОСЛЯМИ РОДА SARGASSUM'

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГРИБОВ РОДА PENICILLIUM И TALAROMYCES, АССОЦИИРОВАННЫХ С БУРЫМИ ВОДОРОСЛЯМИ РОДА SARGASSUM Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
109
15
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
PENICILLIUM / TALAROMYCES / ФИЛОГЕНИЯ / СИСТЕМАТИКА / ГРИБЫ ИЗ БУРЫХ ВОДОРОСЛЕЙ SARGASSUM / PHYLOGENY / SYSTEMATIC / FUNGI FROM BROWN ALGAE SARGASSUM

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Киричук Н. Н., Пивкин М. В., Худякова Ю. В.

В настоящей статье приведены результаты исследования разнообразия видов Penicillium sensu lato , выделенных из бурых водорослей рода Sargassum ( S. miyabei и S. pallidum ) Японского моря. Было изучено 17 штаммов грибов с использованием принципов полифазной таксономии, объединяющих как традиционные методы исследований культурально-морфологических признаков, так и современные молекулярно-генетические методы. В результате филогенетического анализа на основе генов ITS и BenA были выявлены представители рода Penicillium из пяти секций: Fasciculata , Paradoxa , Ramosa , Canescentia , Aspergilloides . Один штамм - из рода Talaromyces (секция Talaromyces ). На основе анализа генов бетатубулина были идентифицированы виды P. spinulosum , P. subspinulosum , P. roseomaculatum , P. thomii , P. murcianum , P. antarcticum . Установление видовой принадлежности некоторых штаммов требует проведение дополнительных исследований.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Киричук Н. Н., Пивкин М. В., Худякова Ю. В.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГРИБОВ РОДА PENICILLIUM И TALAROMYCES, АССОЦИИРОВАННЫХ С БУРЫМИ ВОДОРОСЛЯМИ РОДА SARGASSUM»

почв. Рос. Академия сельскохозяйственных наук. М.: Почв. ин-т им. В.В. Докучаева, 1993. 191 с.

3. Рухович Д.И. Многолетняя динамика засоления орошаемых почв центральной части Голодной степи и методы ее выявления. Автореф. дис. ... к.б.н. М., 2009. 25 с.

4. Савин И.Ю., Отаров А. и др. Выявление многолетних изменений площади засоленных почв Шаульдерского орошаемого массива по космическим снимкам Landsat // Бюл. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева, 2014.

5. Ambast S.K. Monitoring and evaluation of irrigation system Performance in saline irrigated command using satellite remote sensing and Бюллетень Почвенного института им. В.В. Докучаева. 2014. Вып. 74. gis // Interne Mededeling,

УДК 582.28

ГРНТИ 34.27.15

Report No. 471. DLO Winand Staring Centre, Wageningen, the Netherlands, 1997. -106 p.

6. Fernandez-Buces N., Siebea C., Cramb S., Palacio J.L. Map-ping soil salinity using a combined spectral response index for bare soil and vegetation: A case study in the former lake Texaco, Mexico // J. of Arid Environments. 2006. V. 65 (4). P. 644-667.

7. Shrestha D.P., Farshad A. Mapping salinity hazard: an integrated application of remote sensing and modeling-based techniques // Remote sensing of soil salinization. Impact on land management, 2009. P. 257-272.

8. Хлебникова Г.М. Сравнительная характеристика биологической активности почв и подпочвенных осадочных пород: Автореф. дисс. ... канд. биол. наук. М., 1980. 24 с.

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГРИБОВ РОДА PENICILLIUM И TALAROMYCES,

_АССОЦИИРОВАННЫХ С БУРЫМИ ВОДОРОСЛЯМИ РОДА SARGASSUM_

DOI: 10.31618/ESU.2413-9335.2020.3.78.1011 Киричук Н.Н.1, Пивкин М.В.2, Худякова Ю.В.3

1 Канд. биол. наук,

Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН им. Г.Б. Елякова,

г. Владивосток

2 Доктор биол. наук,

Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН им. Г.Б. Елякова,

г. Владивосток

3 Канд. биол. наук,

Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН им. Г.Б. Елякова,

г. Владивосток

АННОТАЦИЯ

В настоящей статье приведены результаты исследования разнообразия видов Penicillium sensu lato, выделенных из бурых водорослей рода Sargassum (S. miyabei и S. pallidum) Японского моря. Было изучено 17 штаммов грибов с использованием принципов полифазной таксономии, объединяющих как традиционные методы исследований культурально-морфологических признаков, так и современные молекулярно-генетические методы. В результате филогенетического анализа на основе генов ITS и BenA были выявлены представители рода Penicillium из пяти секций: Fasciculata, Paradoxa, Ramosa, Canescentia, Aspergilloides. Один штамм - из рода Talaromyces (секция Talaromyces). На основе анализа генов бета-тубулина были идентифицированы виды P. spinulosum, P. subspinulosum, P. roseomaculatum, P. thomii, P. murcianum, P. antarcticum. Установление видовой принадлежности некоторых штаммов требует проведение дополнительных исследований.

ABSTRACT

The results of the investigation of Penicillium sensu lato phylogenetic diversity of brown algae Sargassum spp. (the Sea of Japan) are presented in this article. Seventeen fungal strains were studied using traditional methods of phenotypic investigations and modern molecular-genetic approaches. As a result of phylogenetic analysis of ITS and BenA gene sequences, Penicillium species from five sections were revealed (sections Fasciculata, Paradoxa, Ramosa, Canescentia, Aspergilloides). One strain was identified as species of Talaromyces which more related to section Talaromyces. Five species (P. spinulosum, P. subspinulosum, P. roseomaculatum, P. thomii, P. murcianum, P. antarcticum) were identified based on BenA gene analysis. For species identification of some strains additional analysis of genetic and phenotypic features is necessary.

Ключевые слова: Penicillium, Talaromyces, филогения, систематика, грибы из бурых водорослей Sargassum.

Key words: Penicillium, Talaromyces, phylogeny, systematic, fungi from brown algae Sargassum.

Грибы рода PeniciШum имеют широкое распространение, как в наземных, так и в морских местах обитания и в настоящее время включают более 350 видов. В составе группы вторичных морских грибов виды рода PeniciШum принимают

активное участие во взаимоотношениях гидробионтов, как животного, так и растительного происхождения. Известно, что представители этого рода вызывают заболевания морских животных, а также паразитируют на водорослях [1,2,3]. Кроме

этого, виды рода Pénicillium входят в состав грибных комплексов аквапочв, участвующих в процессе деструкции органического вещества [4,5,6].

По сравнению с аквапочвами, макрофиты (водоросли, морские травы) представляют собой более сложный субстрат. Известно, что морские растения почти половину синтезированного органического вещества выделяют в виде растворенной органики, поэтому они наиболее предпочтительны для развития микромицетов, которые являются неотъемлемым компонентом перифитона в автотрофных сообществах макробентоса [7,8]. Более того, существуют сведения о том, что вторичные морские грибы способны выполнять защитные функции и предотвращать заражение водорослей патогенными микроорганизмами, в том числе грибами, за счет продукции ими вторичных метаболитов [9]. Среди водорослей основным субстратом для мицелиальных грибов являются бурые водоросли, что, вероятно, связано с их большей устойчивостью к разложению бактериями и дрожжами, по сравнению с представителями зелёных и красных водорослей [10]. Среди микромицетов, населяющих бурые водоросли, представители рода Pénicillium преобладают по численности и видовому составу [11]. Однако сведения об их видовом разнообразии ограничены [12,13].

Цель настоящего исследования - изучить филогенетическое разнообразие вторичных морских грибов рода Pénicillium, ассоциированных с бурыми водорослями рода Sargassum (S. miyabei и S. pallidum).

Материалы и методы

Образцы водорослей были отобраны в период с июля по сентябрь в бухте Новик (о-в Русский), заливах Посьет (бухта Троицы) и Восток Японского моря. Сбор образцов проводился в стерильные полиэтиленовые пакеты. Образцы хранились при -20°С. Перед посевом водоросли пятикратно отмывались в стерильной морской воде. Выделение грибов проводилось по стандартной методике путем посева кусочков таллома водоросли на агаризованное сусло, приготовленное на морской воде [14], а также на фильтровальную бумагу. Для посева образцов было

использовано 30 чашек с агаризованной средой и 10 чашек с фильтровальной бумагой, которые инкубировались при комнатной температуре в течение 1-4 недель. Появившиеся колонии грибов переносились на скошенное агаризованное сусло на морской воде, где и содержались в чистой культуре. Выделенные штаммы грибов хранятся в Коллекции морских микроорганизмов

(официальный акроним КММ) Тихоокеанского института биоорганической химии им. Г.Б. Елякова ДВО РАН

(http://www.wfcc.info/ccinfo/index.php/search/basic/)

Фенотипические признаки грибов рода Pénicillium изучались на стандартных агаризованных средах (среда Чапека с дрожжевым автолизатом (CYA), экстракт солода (MEA), дрожжевой экстракт с сахарозой (YES) [15].

Выделение геномной ДНК из мицелия проводили с использованием HiPurATM Plant DNA Isolation kit (метод CTAB) (HiMedia Laboratories Pvt. Ltd., Индия) согласно инструкции.

Амплификацию проводили с использованием стандартных праймеров: ITS1 и ITS4 [16], Bt2a и Bt2b [17]. Секвенирование продуктов ПЦР проводили с теми же праймерами в двух направлениях.

Филогенетический анализ полученных последовательностей, множественные

выравнивания по алгоритму ClustalW, построение филогенетического древа проводили в программе MEGA5 [18]. Реконструкцию филогенетического древа проводили c использованием алгоритма Maximum Likelihood (ML) по модели Tamura-Nei [19]. Оценку достоверности реконструированных деревьев проводили методом бутстреп-анализа на основе 1000 реплик [20]. Полученные последовательности были сопоставлены с данными электронной базы NCBI при помощи алгоритма Blastn с целью поиска имеющихся гомологов.

Результаты и обсуждение

В филогенетический анализ были включены последовательности 17 штаммов грибов, выделенных нами из водорослей, а также референсные последовательности ITS (internal transcribed spacer) и BenA (бета-тубулина) 37 типовых штаммов (ex-type culture) из базы данных GenBank (Таблица 1).

Таблица 1.

Референсные штаммы из базы данных СспБапк, использованные в филогенетическом анализе.

Таксон Номер штамма Номер ITS Номер BenA

P. adametzii K.M. Zalessky CBS 209.28T JN714929 JN625957

P. adametzioides S. Abe ex G. Sm. CBS 313.59T JN686433 JN799642

P. antarcticum A.D. Hocking et C.F. McRae CBS 100492T KJ834503 KJ834432

P. atramentosum Thom CBS 291.48T AF033483 AY674402;

P. atrovenetum G. Sm. CBS 241.56T AF033492 JX140944

P. attenuatum Kirichuk et Pivkin KMM4671T KU358555 KU358558

P. canescens Sopp CBS 300.48T AF033493 JX140946

P. cavernicola Frisvad et Samson CBS 100540T KJ834505 KJ834439

P. chrysogenum Thom CBS 306.48T AF033465 AY495981

P. commune Thom CBS 311.48T AY213672 AY674366

P. coralligerum Nicot et Pionnat CBS 123.65T JN617667 KJ834444

P. corylophilum Dierckx CBS 312.48T AF033450 JX141042

P. crocicola W. Yamam. CBS 745.70T KM189581 KJ834445

P. cyclopium Westling CBS 144.45T JN097811 AY674310

P. dunedinense Visagie, Seifert et Samson CBS 138218T KJ775678 KJ775171

P. echinulatum Raper et Thom ex Fassat. CBS 317.48T AF033473 AY674341

P. glabrum (Wehmer) Westling CBS 125543T GU981567 GU981619

P. janczewskii K.M. Zalessky CBS 221.28T AY157487 KJ834460

P. jensenii K.M. Zalessky NRRL 909T AY443470 JX140954

P. kewense G. Sm. CBS 344.61T AF033466 JX996849

P. magnielliptisporum Visagie, Seifert et Samson CBS 138225T KJ775686 KJ775179

P. mexicanum Visagie, Seifert et Samson CBS 138227T KJ775685 KJ775178

P. murcianum C.Ramirez et A.T. Martinez CBS 161.81T NR138358 KP016924

P. novae-zeelandiae J.F.H. Beyma CBS 137.41T JN617688 KJ834477

P. ochotense Kirichuk et Pivkin KMM4670T KU358553 KU358556

P. piltunense Kirichuk et Pivkin KMM4668T KU358554 KU358557

P. raistrickii G. Sm. CBS 261.33T AY373927 KJ834485

P. roseomaculatum Biourge CBS 137962T KM189755 KM089004

P. roseomaculatum (T of P. subericola) CBS 125096T KM 189535 KM 088773

P. sajarovii Quintan. CBS 277.83T KC411724 KJ834489

P. solitum Westling CBS 424.89T AY373932 AY674354

P. spinulosum Thom CBS 374.48T AF033410 KJ834493

P. subspinulosum Houbraken CBS 137946T KM189483 KM088719

P. thomii Maire CBS 225.81T KM189560 KM088799

P. vancouverense Houbraken, Frisvad et Samson CBS 126323T JN617675 JN606663

P. yarmokense Baghd. CBS 410.69T KC411757 KJ834502

Talaromyces marneffei (Segretain, Capponi et Sureau) Samson et al. CBS 388.87T JN899344 JX091389

В качестве внешней группы выбран вид Talaromyces marneffei. В результате анализа последовательностей на основе локуса ITS выявлено, что 16 выделенных штаммов Penicillium являются представителями пяти секций рода Penicillium: Fasciculata, Paradoxa, Ramosa, Canescentia, Aspergilloides (рис.1). Один штамм относится к роду Talaromyces. При этом наиболее часто встречаемыми оказались представители секций Aspergilloides и Canescentia.

Филогенетический анализ на основе локуса BenA показал принадлежность некоторых штаммов к уже известным видам: уровень их сходства с гомологичными последовательностями из базы данных GenBank составил 98-100% (рис.2). В секции Aspergilloides идентифицированы виды P. spinulosum (штаммы S.m.54, S.m.72), P.

subspinulosum (штамм S.m.52), P. roseomaculatum (штамм S.m.74), P. thomii ^т78) образовавшие субклады с типовыми штаммами с высоким уровнем поддержки в соответствующих узлах (бутстреп более 80%). Два других штамма ^^.47 и S.m.58) показали уровень гомологии с типовым штаммом P. glabrum 98.52% и 94.43%, соответственно и, как видно на филограмме, сформировали относительно типового штамма обособленную субкладу с высоким уровнем поддержки (бутстреп 99%). Следует отметить, что уровень сходства штаммов S.m.47 и S.m.58 между собой составляет 94,2% и, вероятно, они лишь в данном контексте располагаются в одной субкладе, что подтверждается достаточно низким уровнем поддержки в соответствующем узле (64%). Такие результаты молекулярно-генетического анализа не

позволяют с уверенностью определить таксономическую принадлежность этих двух штаммов, поэтому необходимо провести более детальное изучение их морфологических и физиологических особенностей. Несколько штаммов (S.m.59, S.m.70, S.m.71 и S.m.57) образовали отдельную кладу c видом P. antarcticum

из секции Canescentia с высоким доверительным интервалом (бутстреп 89%). Из них три штамма показали 100% сходство (S.m.59, S.m.70, S.m.71), а штамм S.m.57 - 99.72% сходства с типовым штаммом P. antarcticum CBS 100492 (ex-type culture).

47

S.m.59 S.m.71

KMM 4668T P. piltunense CBS 123.65T P coralligerum CBS 100492T P antarcticum S.m.75

- CBS 241 56T P atrovenetum S.m.57 |-S.m.70

■KMM 4670T P ochotense

98~l-KMM 4671T P. attenuatum

CBS 161.81T P murcianum CBS 300.48T P canescens CBS 221 28T P janczewskii NRRL 909T P. jensenii CBS 138218T P. dunedinense CBS 410 69T P yarmokense l—CBS 137.41TP novae-zeelandiae

CBS 313.59T P. adametzioides i—CBS 261 33T P. raistrickii CBS 277 83T P sajarovii - S.m.53 S.m.67

CBS 291 48NTP. atramentosum - jS.m.68

cL-CBS 138227T P mexicanum

-CBS 138225TP magnielliptisporum |CBS 306 48NT P chrysogenum i-CBS 344 61T P. kewense

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

CBS 144 45T P cyclopium

С M

U

о

S

X о -а

55

38

S.m.60

CBS 311 48T P. commune '< CBS 100540T P. cavernícola CBS 317 48T P echinulatum CBS 424 89T P. solitum -CBS 312 48T P corylophilum CBS 125096 P roseomaculatum (T of P subericola) S.m.72

CBS 137962TP roseomaculatum S.m.54

CBS 745 70T P. croc/co/a CBS 374 48T P spinulosum S.m.74 S.m.52

CBS 137946TP subspinulosum -|CBS 347.59T P thomii

S.pall.47 L CBS 125543T P glabrum S.m.58 CBS 209.28T P. adametzii —CBS 126323TP vancouverense

63

(A <

69

—I"

100 I-С

S.pall.46

BS 388.87T Talaromyces marneffei

Рисунок 1. Филогенетическое древо, построенное на основе ITS последовательностей с использованием алгоритма максимального правдоподобия (Maximum Likelihood), по модели Tamura-Nei.

Рисунок 2. Филогенетическое древо, построенное на основе последовательностей гена BenA с использованием алгоритма максимального правдоподобия (Maximum Likelihood) (модель Tamura-Nei).

Впервые P. antarcticum был обнаружен в Антарктике, в образцах почвы вблизи гнезд буревестников, и описан как новый вид. В

настоящее время, во многом благодаря наличию информации о таксономически значимых нуклеотидных последовательностях типового

штамма в базе данных GenBank, этот вид все чаще выявляется в результате молекулярно-генетических исследований микобиоты не только в наземных, но и в морских местах обитания далеко за пределами Антарктики, что говорит о космополитичности и эврибионтности этого вида [21,22]. В этой же секции идентифицирован еще один вид - P. murcianum (штамм S.m.75), образовавший субкладу с типовым штаммом с высоким доверительным интервалом (бутстреп 91%).

Кроме этого, выявлены представители секций Paradoxa и Fasciculata, показавшие наибольшее сходство с видами P. mexicanum (штамм S.m.68) и P. solitum (штамм S.m.60). Уровень их молекулярно-генетического сходства с

соответствующими типовыми штаммами составил более 98%. Однако для окончательного подтверждения их видовой принадлежности необходимо провести изучение и фенотипических признаков.

В результате филогенетического анализа на основе ITS-локуса один из выделенных штаммов показал принадлежность к роду Talaromyces [23]. Согласно современной классификации, основанной на анализе генов ITS и BenA, род Talaromyces подразделяется на 7 секций и включает 88 видов. Blast-анализ показал максимальное сходство (на уровне 97.2%) штамма S.pall.46 по данному локусу с видом Talaromyces marneffei (секция Talaromyces). Учитывая процент гомологии и тот факт, что гены ITS обладают достаточно низкой разрешающей способностью, можно сделать заключение лишь о высокой степени родства данного штамма с представителями секции Talaromyces.

Таким образом, таксономический анализ выявил, что наиболее часто встречаемыми видами оказались представители секций Aspergilloides и Canescentia. В результате молекулярно-генетического анализа по локусам ITS и BenA достоверно определена видовая принадлежность 10 штаммов грибов из 17 исследованных. Среди них выявлены виды P. spinulosum, P. subspinulosum, P. roseomaculatum, P. thomii, P. murcianum, P. antarcticum. Для установления видовой принадлежности 7 штаммов необходимо проведение дополнительных исследований с применением как молекулярно-генетических методов, так и традиционных методов изучения фенотипических признаков штаммов.

Работа поддержана грантом РФФИ №19-04-00697а.

Список литературы

1. Blaylock RB, Ovestreet RM, Klich MA Mycoses in red snapper (Lutjanus campechanus) caused by two deuteromycete fungi (Penicillium corylophilum and Cladosporium sphaerospermum). Hydrobiologia. 2001; (460):221-228. https://doi.org/10.1023/A:1013124214166

2.Dewey FM, Donnelley KA, Foster D Penicillium waksmanii isolated from a red seaweed,

Eucheuma striatum. Trans. Br. Mycol. Soc. 1983;81:433-434.

3.Sterflinger K, Hain WM, Scholz OJ, et al. Fungal infections of a colonial marine invertebrate: diversity and morphological consequences. FACIES. 2001;45:31-38.

4.Слинкина Н.Н., Пивкин М.В. Биоразнообразие грибов аквапочв южной части Сахалина // Микология и фитопатология. 2007. Т. 41, № 1. С. 48-56. [Slinkina NN, Pivkin MV Fungal biodiversity of submarine soils from south part of Sakhalin island. Mikologija i fitopatologija [Mycology and phytopathology]. 2007;41(1):48-56. (in Russ).]

5.Слинкина Н.Н., Пивкин М.В., Полохин О.В. Мицелиальные грибы аквапочв Сахалинского залива (Охотское море)//Биол. моря. 2010. Т. 36, № 6. С. 410-414. [Slinkina NN, Pivkin MV, Polokhin OV Filamentous Fungi of the Submarine Soils of the Sakhalin Gulf (Sea of Okhotsk). Russian Journal of Marine Biology. 2010;36(6):413-418. (in Russ).] https://doi.org/10.1134/S1063074010060027

6.Киричук Н.Н., Пивкин М.В., Полохин О.В. Грибные комплексы акваземов восточно-сахалинского шельфа//Биол. моря. 2012. Т. 38, № 5, С. 363-369. [Kirichuk NN, Pivkin MV, Polokhin OV Fungal Assemblages of Submarine Soils of the Eastern Sakhalin Shelf. Russian Journal of Marine Biology. 2012;38(5):375-380. (in Russ).] https://doi.org/10.1134/S1063074012050069

7.Hyde KD A study of the vertical zonation of intertidal fungi on Rhizophora spp. at Kampung Danau mangrove. 1988;36:255-262.

8.Жирков И.А. Жизнь на дне. Биогеография и биоэкология бентоса. М.; 2010. [Zhirkov IA Zhizn' na dne. Biogeografiya i bioecologiya bentosa. M.; 2010. (in Russ).]

9.Ding L, Qin S, Li F, et al. Isolation, antimicrobial activity, and metabolites of fungus Cladosporium sp. associated with red alga Porphyra yezoensis. Curr. Microbiol. 2008;56:229-235.

10.Пивкин М.В., Кузнецова Т.А., Сова В.В. Морские грибы и их метаболиты. Владивосток: Дальнаука; 2006. [Pivkin MV, Kuznecova TA, Sova VV Marine fungi and their metabolites. Vladivostok: Dal'nauka; 2006. (in Russ).]

11.Киричук Н.Н., Пивкин М.В. Вторичные морские грибы, ассоциированные с бурыми водорослями рода Sargassum залива Петра Великого//Микология и фитопатология. 2015. Т. 49, № 3. С. 146-150. [Kirichuk NN, Pivkin MV, Secondary marine fungi associated with brown algae Sargassum spp. from Peter the Great Bay (Sea of Japan).Mikologija i fitopatologija [Mycology and phytopathology]. 2015;49:146-150. (in Russ).]

12.Зверева Л.В. Микобиота культивируемой бурой водоросли Laminaria japonicaZ/Биол. моря. 1998. Т. 24, № 1. С. 19-23. [Zvereva LV Mycobiota of cultivated brown algae Laminaria japonica. Russian Journal of Marine Biology.1998;24(1):19-23. (in Russ).]

13.Zuccaro A, Schoch C, Spatafora J, Kohlmeyer J, Draeger S, Mitchell J Detection and identification of fungi intimately associated with the brown seaweed

Fucus serratus. Appl. Environ. Microbiol. 2008;74:931-941.

14.Литвинов М.А., Дудка И.А. Методы исследования микроскопических грибов пресных и соленых (морских) водоемов. Л.: Наука; 1975. [Litvinov MA, Dudka IA Metody issledovaniya mikroskopicheskikh gribov presnykh I solenykh (morskikh) vodoemov. L.: Nauka; 1975. (in Russ).]

15.Visagie CM, Houbraken J, Frisvad JC, et al. Identification and nomenclature of the genus Penicillium. Studies in Mycology. 2014;78:343-371. https://doi.org/10.1016/j.simyco.2014.09.001

16.White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor JW Amplificaion and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR protocols: A Guide to Methods and Applications. London, UK: Academic Press; 1990.

17.Glass NL, Donaldson GC Development of primer sets designed for use with the PCR to amplify conserved genes from filamentous ascomycetes. Appl Environ Microbiol. 1995;61:1323-1330.

18.Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance and Maximum Parsimony

УДК: 579.8.06

ГРНТИ: 34.27: микробиология

Methods. Molecular Biology and Evolution.

2011;28(10):2731-2739.

https://doi.org/10.1093/molbev/msr121

19.Tamura K and Nei M Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution. 1993;10:512-526.

20.Felsenstein J Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution. 1985;39:783-791.

21.McRae CF, Hocking AD, Seppelt RD Penicillium species from terrestrial habitats in the Windmill Island, East Antarctica, including a new species, Penicillium antarcticum. Polar Biol. 1999;21:97-111.

https://doi.org/10.1007/s003000050340

22.Park MS, Lee EJ, Fong JJ, Sohn JH, Lim YW A new record of Penicillium antarcticum from marine environments in Korea. Mycobiology. 2014;42:109-113. https://doi.org/10.1007/s12275-015-4700-9

23.Yilmaz N, Visagie CM, Houbraken J et al. Polyphasic taxonomy of the genus Talaromyces. Studies in Mycology. 2014;78:175-341. http://dx.doi.org/10.1016/j.simyco.2014.08.001

МИКРОФЛОРА ПОЧВЫ БАССЕЙНА ВЫСОХШЕГО АРАЛЬСКОГО МОРЯ В ЭКСРЕМАЛЬНЫХ УСЛОВИЯХ ИЗМЕНЕНИЯ ЭКОСИСТЕМЫ

Мавлоний М.И

академик Академии Республики Узбекистан, доктор биологических наук, заведующей лабораторией Технической микробиологии института микробиологии Академии наук Республики Узбекистан,

г. Ташкент Рузиева Н.Л.

младший научный сотрудник лабораторией Технической микробиологии института микробиологии Академии наук Республики Узбекистан,

г. Ташкент

MICROFLORA OF SOIL IN THE BASIN OF THE HIGH ARAL SEA UNDER EXTREME CONDITIONS OF ECOSYSTEM CHANGE

АННОТАЦИЯ

В статье представлены результаты исследования одного из аспектов микробиологической экологии -микробиоценоз осушенных берегов Арала. Процесс исчезновения Аральского море является примером радикального изменения экосистемы современности. Эти изменения экосистемы стали причиной изменения видового состава растений, животных и микроорганизмов. В работе рассмотрены бактерии, микроскопические грибы и дрожжи, обитающие в экстремальных условиях в высушенной зоне Аральского моря. Впервые дана микробиологическая характеристика почвенного покрова осушенных берегов Арала. Экспериментально установлено количественное содержание в микробном сообществе Приаралья четырех физиологических групп микроорганизмов: бактерии - 50-55%; дрожжи - 2-3%; микроскопические грибы - 30-35%; актиномицеты - 12-15% от общего количества микрофлоры. В результате исследования собран ценный материал по систематике микроорганизмов, обитающих в "жестких" экстремальных условиях природы.

ABSTRACT

The article presents the results of a study of one of the aspects of microbiological ecology - microbiocenosis of the drained shores of the Aral Sea. The disappearance of the Aral Sea is an example of a radical change in the ecosystem of our time. These ecosystem changes caused changes in the species composition of plants, animals and

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.