Филогенетический анализ вирусов москитных лихорадок, выделенных на территории Афганистана Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

Электронный научно-образовательный вестник "Здоровье и образование в XXI веке" № 9, 2008 г. (Т. 10)

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВИРУСОВ МОСКИТНЫХ ЛИХОРАДОК, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ АФГАНИСТАНА

Клименко И.С., Бутенко АМ., Грибенникова Т.В.

ГУ НИИ вирусологии имени Д.И. Ивановского, г. Москва

Вирусы москитных лихорадок (МЛ) относятся к роду Phlebovirus семейства Bunyaviridae и вызывают неспецифические заболевания по типу лихорадок. Впервые вирусы МЛ были выделены в 1943-1944 гг. Sabin A.B. из крови больных в период эпидемии среди американских солдат в Италии (сицилийская и неаполитанская лихорадки). Геном вирусов МЛ представлен тремя кольцевыми РНК (L, M и S), молекулярная масса которых составляет 2,6-2,8, 1,8-2,2 и 0,7-0,8 кДа, соответственно.

В мае-августе 1986-1987 гг. в Афганистане от больных советских военнослужащих были выделены новые штаммы вирусов МЛ. Эти штаммы, согласно серологическим данным, представлены вариантами неаполитанского (1008) и сицилийского (1028) серокомплекса. Молекулярно-генетический анализ каждого выделенного вирусного штамма МЛ позволит более точно определить их принадлежность к тому или иному серокомплексу. Целью нашего исследования было проведение филогенетического анализа штаммов вирусов МЛ, выделенных на территории Афганистана, на основе нуклеотидных последовательностей фрагментов S-сегмента генома. На основе усредненной последовательности S-сегмента вирусов МЛ, представленных в базе данных NCBI GenBank, мы разработали последовательности специфических нуклеотидов. В результате использования ПЦР и последующего секвенирования была определена первичная структура фрагментов S-сегмента генома штаммов Аф-1008 и Аф-1028 вирусов МЛ, размером 379 пар оснований. Далее был выполнен филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей фрагментов генома исследованных штаммов вирусов МЛ в сравнении с имеющимися в базе данных NCBI Gen Bank. Проведенные исследования показали, что штамм Аф-1008, обнаруженный в Афганистане, является представителем серокомплекса вируса неаполитанской москитной лихорадки, а штамм Аф-1028 - сицилийского серокомплекса. Кроме того, при сравнении нуклеотидной последовательности секвени-рованного участка S-сегмента генома штамм Аф-1008 имел сходство со штаммом индийского происхождения Р-7101795, процент гомологии составил 93%. Штамм Аф-1028 в пределах своего серокомплекса также оказался наиболее близким штамму индийского происхождения I 701735, процент гомологии составил 97%.

ЛИТЕРАТУРА

1. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2007. Т. 9. № 4.

2. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2006. Т. 8. № 4.

3. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2005. Т. 7. № 4.

4. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2004. Т. 6. № 4.

5. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2003. Т. 5. № 4.

6. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2002. Т. 4. № 4.

7. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2001. Т. 3. № 4.

8. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2000. Т. 2. № 4.

9. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2007. Т. 9. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

10. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2006. Т. 8. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

11. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2005. Т. 7. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

12. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2004. Т. 6. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

13. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2003. Т. 5. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

14. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2002. Т. 4. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

15. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2001. Т. 3. № 1. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

16. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2000. Т. 2. № 1. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

Материалы IX международного конгресса «Здоровье и образование в XXI веке» РУДН, Москва

Стр. [408]