Научная статья на тему 'Энзимологическая школа кафедры биохимии Санкт-Петербургского государственного университета: традиции и современность'

Энзимологическая школа кафедры биохимии Санкт-Петербургского государственного университета: традиции и современность Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
433
70
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Biological Communications
WOS
Scopus
ВАК
RSCI
Область наук
Ключевые слова
КАФЕДРА БИОХИМИИ САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА / ЭНЗИМОЛОГИЯ / BIOCHEMICAL DEPARTMENT OF ST. PETERSBURG UNIVERSITY / ENZYMOLOGY

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Петрова Татьяна Александровна, Лянгузов Андрей Юрьевич, Стефанов Василий Евгеньевич

Настоящая публикация посвящена памяти профессора С. Н. Лызловой и является кратким обзором главных достижений кафедры биохимии Ленинградского/Санкт-Петербургского государственного университета в области энзимологии. Основное внимание в статье сфокусировано на работах С. Н. Лызловой и ее учеников по исследованию фосфагенкиназ. Кроме того, приводится обзор новых энзимологических направлений, разрабатываемых сотрудниками кафедры биохимии в течение двух последних десятилетий. Это создание современной методологии анализа кинетики сложных ферментативных реакций, а также изучение молекулярных превращений субстратов в каталитических центрах ферментов методами компьютерного моделирования и вычислительной химии. Библиогр. 43 назв. Ил. 1.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Петрова Татьяна Александровна, Лянгузов Андрей Юрьевич, Стефанов Василий Евгеньевич

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Enzymology school of the Biochemistry department of St. Petersburg State university: traditions and current state

The paper is dedicated to Professor S. N. Lyzlova. It contains a review of the main achievements of the Biochemistry department of St. Petersburg State university in the area of enzymology. The authors focus mainly on the investigations of phosphagen kinases carried out by S. N. Lyzlova and representatives of her school. Besides it also deals with the new research trends developed at the department of Biochemistry since early nineties of the last century. These are developments of modern methodology for kinetic analysis of complex enzymatic systems and analysis of the mechanism of chemical conversion of substrates in the catalytic sites of enzymes by means of computer simulation and computational chemistry.

Текст научной работы на тему «Энзимологическая школа кафедры биохимии Санкт-Петербургского государственного университета: традиции и современность»

ФИЗИОЛОГИЯ, БИОФИЗИКА, БИОХИМИЯ

УДК 577.151

Т. А. Петрова, А. Ю. Лянгузов, В. Е. Стефанов

ЭНЗИМОЛОГИЧЕСКАЯ ШКОЛА КАФЕДРЫ БИОХИМИИ

САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКОГО

ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА:

ТРАДИЦИИ И СОВРЕМЕННОСТЬ

Памяти

Сусанны Николаевны Лызловой посвящается

27 января 2011 г. исполняется 90 лет со дня рождения Сусанны Николаевны Лызловой — доктора биологических наук, профессора, декана биолого-почвенного факультета Ленинградского государственного университета (1973-1981), заведующей кафедрой биохимии (1976-1990), а также основателя и первого руководителя лаборатории энзимологии (1972-1990). Талантливая ученица академика АМН СССР Г. Е. Владимирова С.Н.Лызлова не только продолжила исследование энергетического метаболизма фосфорорганических соединений, развивавшееся на кафедре биохимии Ленинградского государственного университета с довоенных времен, но и создала свое собственное, получившее мировую известность, направление по изучению фосфагенкиназных систем энергообеспечения клетки.

Настоящая публикация является кратким обзором главных достижений кафедры биохимии Ленинградского/Санкт-Петербургского государственного университета в об© Т. А. Петрова, А. Ю. Лянгузов, В. Е. Стефанов, 2010

Профессор Сусанна Николаевна Лызлова (1921-1999)

ласти энзимологии. Основное внимание сфокусировано на работах С.Н.Лызловой и ее многочисленных учеников по изучению фосфагенкиназ разного видового происхождения и функционального назначения. Кроме того, в статье приводится обзор новых энзимологических направлений, разрабатываемых сотрудниками кафедры биохимии в течение последних двух десятилетий. Это — создание современной методологии анализа кинетики сложных ферментативных реакций, а также исследование молекулярных превращений лигандов в активных центрах ферментов методами компьютерного моделирования.

В 2009 г. на биолого-почвенном факультете Санкт-Петербургского государственного университета отмечалось 80-летие со дня основания первой в нашей стране университетской кафедры биохимии. Этому событию был посвящен отдельный выпуск журнала «Вестник СПбГУ», содержащий, кроме научных и обзорных статей, воспоминания и исторические сведения о развитии основных научных направлений кафедры [2]. Однако, на наш взгляд, энзимология, как одна из самостоятельных и уникальных биохимических дисциплин, традиционно культивировавшихся на кафедре, не нашла своего должного отражения в этом выпуске журнала. Настоящая публикация частично восполняет образовавшийся пробел.

Основоположниками энзимологической школы кафедры биохимии ЛГУ/СПбГУ были великие советские биохимики — академик АН СССР В. А. Энгельгардт и академик АМН СССР Г. Е. Владимиров.

Основные труды Владимира Александровича Энгельгардта, проработавшего на кафедре с 1930 по 1940 г. и возглавлявшего ее с 1939 по 1940 г., посвящены обмену органических фосфорных соединений, их роли в энергетике и физиологических функциях клетки, связи энергетических процессов и механических свойств мышечных белков. В опытах на ядерных эритроцитах птиц и ретикулоцитах млекопитающих В. А. Энгель-гардт открыл процесс аэробного ресинтеза аденозинтрифосфорной кислоты (АТР), сопряженного с клеточным дыханием (дыхательное фосфорилирование), проблема окислительного фосфорилирования стала позже основной проблемой биоэнергетики. Он также описал «апотомический путь» окисления углеводов, заключающийся в отщеплении одноуглеродного фрагмента при превращении гексоз в пентозы и предложил объяснение физиологического механизма взаимодействия брожения и дыхания (так называемый эффект Пастера).

В 1939 г. В. А. Энгельгардт совместно с М. Н. Любимовой обнаружил ферментативную активность структурного белка мышц — миозина — и доказал, что источником энергии для работы мышц является АТР, причем миозин не только расщепляет АТР, но и меняет свои физические свойства. Эти работы связали воедино физическую структуру, химизм и функцию биополимера [2, 32].

Георгий Ефимович Владимиров, заведовавший кафедрой с 1940 по 1960 г. (с перерывом с 1942 по 1944 г.), стал идеологом нового научного направления — функциональной биохимии, под которым понималось изучение физико-химических механизмов процессов, лежащих в основе биологических функций [14]. С применением революционного для того времени радиоизотопного метода были проведены пионерские исследования по биоэнергетике мозга и изучен метаболизм фосфорных соединений в головном мозге при различных видах функциональной деятельности [2]. Именно на нашей кафедре под руководством Г. Е. Владимирова выполнена работа по расчету свободной энергии гидролиза АТР, результаты которой опубликованы в 1957 г. в журнале «Nature» [3, 41].

Открытая В. А. Энгельгардтом АТР-азная активность миозина, широкие исследования биохимических основ физиологических функций, продолженные Г. Е. Владимиро-

вым, а также более ранние работы профессоров Е. С. Лондона в области обмена веществ и В. С. Садикова в области белковой химии заложили фундаментальные основы развития уникальной энзимологической школы кафедры биохимии ЛГУ/СПбГУ. В течение многих десятков лет разные по содержанию научные направления кафедры объединяет одна общая идея — идея изучения тонких биохимических и молекулярно-биологических механизмов жизни клетки, субклеточных структур и отдельных функциональных единиц, познание которых невозможно без исследования ферментных систем организма. Это: работы в области нейрохимии и обмена веществ, выполненные под руководством профессора М. И. Прохоровой ее учениками и в настоящее время продолжаемые под руководством профессора Н. Д. Ещенко; работы профессора А. И. Колотиловой и ее учеников по исследованию ферментов пентозофосфатного пути обмена углеводов; работы профессора Н. С. Пантелеевой и ее учеников по изучению механизма гидролиза АТР миозиновыми и транспортными АТР-азами методом масс-спектометрии с применением тяжелого изотопа 18О; новое направление, созданное профессором И. П. Ашмариным, (позже — академиком АМН СССР) по исследованию механизмов неспецифического иммунитета, обеспечиваемого действием ферментов и неферментных белков лейкоцитов и развиваемое в настоящее время профессором В. Н. Кокряковым; работы профессора В.Ю. Васильева и его учеников в области пиридоксалевого катализа, затем исследование аденилат- и гуанилатциклазных систем в регуляции иммунных реакций, поиск ранних универсальных ферментных маркеров онкогенеза, разработка тест-систем на основе ферментов для экспресс-оценки загрязнения окружающей среды; изучение группой профессора И. А. Сытинского механизмов развития алкогольного синдрома; работы докт. биол. наук А. Е. Антипенко и его лаборатории по исследованию регуляции функции миокарда в норме и патологии; также комплексное изучение реакций ферментных систем организма на воздействие различных неблагоприятных факторов внешней среды (профессор В. Б. Матюшичев) [1, 2, 4, 7, 18, 20, 40].

С начала 1970-х гг. признанным лидером энзимологической школы нашей кафедры становится С.Н. Лызлова. В 1962 г. Сусанна Николаевна выпускает (совместно с Г. Е. Владимировым) первое в нашей стране учебное пособие «Энзимология» и продолжает читать студентам одноименный курс лекций [13]. Возглавивший кафедру в 1964 г. ученик академика Г. Е. Владимирова профессор И. П. Ашмарин предлагает С. Н. Лыз-ловой сосредоточиться на изучении креатинкиназ в ходе эмбриогенеза, однако полученные в этой работе результаты оказываются настолько интересными, что очень скоро исследования выходят за изначально обозначенные рамки и приобретают характер системного анализа поведения фосфагенкиназных систем в процессе онто- и филогенеза. В 1971 г. С. Н. Лызлова защищает докторскую диссертацию, результаты которой публикует в монографии «Фосфагенкиназы» [6]. В 1972 г. на кафедре создается лаборатория энзимологии, возглавляемая С. Н. Лызловой. Средний возраст аспирантов и сотрудников лаборатории в то время составлял 25 лет. Под руководством С.Н. Лызло-вой защищено 30 кандидатских диссертаций, в отечественных и зарубежных изданиях опубликовано свыше 220 работ, из них — 3 монографии (2 в соавторстве) и 4 учебных пособия.

Исследование фосфагенкиназ было естественным продолжением работ кафедры в области биоэнергетики. Фосфагенкиназы (гуанидинкиназы) — это ферменты, поддерживающие постоянство уровня АТР в клетках за счет обратимой реакции переноса фос-форильного остатка между гуанидинсодержащим основанием (фосфагеном) и М^АБР. Эта система депонирования химической энергии едина для всех представителей животного мира, начиная от простейших и кончая приматами и человеком. Известно

8 различных природных фосфагенов и 8 соответствующих им фосфагенкиназ. Главными из них, получившими наиболее широкое распространение, являются креатин-фосфат-креатинкиназа и аргининфосфат-аргининкиназа. Фосфагенкиназы представляют интерес во многих отношениях. Во-первых — это универсальность системы энергообеспечения разнообразных физиологических функций клетки; во-вторых — в разных тканях фосфагенкиназы представлены различными, специфичными для данной ткани изоферментными профилями; в-третьих — изучение распространения и свойств фосфагенкиназ оказалось одним из эффективных методов определения последовательности эволюционного процесса у разных видов животных и филогенетических взаимоотношений между ними; в-четвертых — креатинкиназа вошла в перечень наиболее популярных ферментов, используемых в целях энзимодиагностики различных заболеваний; в-пятых — креатинкиназа явилась практически идеальной моделью при исследовании иерархических закономерностей регуляции функционирования ферментных систем; в-шестых — изучение каталитических функций очищенных препаратов креатин-киназ позволило не только охарактеризовать индивидуальные особенности ферментов из разных источников, но и выработать общие рекомендации по исследованию других сложных ферментативных реакций.

Такой широкий охват биологических, физико-химических и медицинских проблем и полученные в ходе проведенных исследований новые приоритетные результаты, подвергнутые всестороннему системному анализу, побудили американских издателей предложить С. Н. Лызловой обобщить опыт работы лаборатории в виде монографии, которая вышла в свет в Издательстве «CRC Press» в 1991 г. [11].

Потребности практического здравоохранения продолжают диктовать необходимость сотрудничества нашей кафедры с ведущими медицинскими учреждениями Санкт-Петербурга. Креатинкиназный тест был использован при разработке моделей формирования алкогольной зависимости, скрининге наследственных миопатий [11], исследовании влияния фармакологических препаратов [27, 28], а также для диагностики гипоксических состояний плода и новорожденных детей [21, 28].

Несмотря на то, что изучение креатинкиназы на кафедре ведется на протяжении уже нескольких десятилетий, этот объект оказался настолько удачным и универсальным с точки зрения энзимологии, что его исследования продолжаются до сих пор, но уже на новом методическом уровне [8].

Креатинкиназная реакция — реакция двухсубстратная и, более того, — обратимая и не может быть полноценно описана методами традиционной михаэлисовой кинетики, основанной на целом ряде исходных постулатов, главный из которых — участие в реакции только одного субстрата. Разнообразные более поздние усложнения исходного кинетического уравнения Михаэлиса—Ментен так и не позволили выйти за рамки односубстратной модели и потому сложные ферментативные процессы принято анализировать по частям, когда изменяется концентрация только одного действующего реагента, а концентрации всех остальных участников реакции фиксируются на постоянном уровне.

Такой подход не только приводит к утрате значительной части информации, содержащейся в экспериментальных данных, и не позволяет проверить адекватность принятой к рассмотрению кинетической модели, но и осложняет методику математического планирования эксперимента и результатов его анализа, что еще более ухудшает ситуацию.

Теоретические модели, описывающие ферментативные процессы любой степени сложности, существуют уже достаточно давно, и наиболее известный и удобный так называемый диаграммный метод создания подобных моделей был разработан в на-

шем университете группой физиков-теоретиков под руководством чл.-корр. АН СССР М. В. Волькенштейна в 1960-1970-е годы. Метод базируется на теории графов. Первые попытки практического применения этого метода были предприняты учеником и соавтором М. В. Волькенштейна В. Е. Стефановым, перешедшим работать на нашу кафедру [11; 12, с. 284]. Однако ограниченность экспериментальных методик того времени не позволила получить опытные данные высокой степени точности и в полной мере задействовать необходимый математический аппарат. Лишь с появлением лабораторного аналитического оборудования, управляемого персональным компьютером, и с разработкой в нашей лаборатории специального программного обеспечения впервые на примере креатинкиназной реакции удалось выполнить полноценное описание сложного кинетического процесса с одномоментным расчетом всех реальных физических констант (константы Михаэлиса не имеют строго определенного физического смысла) [15, 19, 25, 26]. В настоящее время с учетом приобретенного опыта нами ведется разработка новой современной методологии анализа кинетики сложных ферментативных реакций, которая включает рекомендации по построению кинетических моделей (одной или нескольких), соответствующих предполагаемому механизму реакции; математическому планированию и лабораторной организации кинетических исследований; статистическому анализу результатов с учетом особенностей принятой к рассмотрению математической модели; а также компьютерному моделированию, необходимому для проверки справедливости сделанных выводов [16, 18, 23, 24].

Важным направлением в работе кафедры биохимии в области энзимологии стало модельное изучение физико-химического механизма каталитической активности ферментов и их регуляторных свойств. На основе формальной модели Дегани/Дегани структурно-функциональной организации олигомерных ферментов, постулировавшей наличие каналов связи между субъединицами олигомерных ферментов, проведены исследования возможных молекулярных механизмов реализации таких каналов. Проанализированы доступные структурные данные по большому числу олигомерных ферментов, представляющих все классы белковых катализаторов. Выдвинута гипотеза о том, что роль таких каналов могут играть непрерывные системы водородных связей, выявленные в их структуре, и предложен механизм функционирования этих систем, объясняющий феномен аллостерической регуляции, а также положительной и отрицательной кооперативности, включая такой крайний случай, как реактивность половины от числа активных центров («флип-флоп механизм») [10, 35]. Идентифицированы возможные каналы переноса энергии в ATP/GTP-зависимых белках [5, 22, 29, 34, 37].

В последнее десятилетие в энзимологических исследованиях, проводимых группой биомоделирования, стали широко использоваться современные методы вычислительной химии, что позволило получить принципиально новые данные о базовых физических механизмах процессов, происходящих в молекуле фермента в ходе каталитического акта [9, 17, 30]. Было показано, что ион магния в составе комплекса с ATP(GTP) способен генерировать сигнал, который может распространяться по пути, образованному определенными группами аминокислотных остатков и молекул воды, входящих в сольватную оболочку [36, 37]. На основе сформулированных в результате теоретического анализа представлений были проведены модельные экспериментальные исследования с заменой активирующего магниевого кофактора энергетической накачкой, создаваемой лазерным облучением, косвенно подтвердившие основные положения постулированного механизма функционирования MgATP(MgGTP)-зависимых ферментов [38].

В последние годы энзимологические исследования, в частности исследования механизма действия ферментов, субстратом которых является комплекс иона магния с ATP,

вышли на квантово-механический уровень. Именно такой анализ позволил объяснить стадии катализируемого ферментом химического превращения и сопряженные с ним процессы, связанные с изменениями спинового состояния комплекса. Было выдвинуто предположение о том, что в клетке Mg выступает в качестве спинового катализатора, активность которого связана с переходом катиона Mg из синглетного (S) в триплетное (T) состояние с образованием свободных ион-радикалов в фемтосекундном интервале времени и описан ранее неизвестный ион-радикальный путь распада ATP [31]. Такая реакция протекает со скоростями на десять порядков выше, чем обычный гидролиз, и может лежать в основе сверхбыстрых процессов самоорганизации биомолекулярных систем. Аргументами в пользу реализуемости этого механизма в живых системах служит тот факт, что в клетке энергетическая разница между S- и T-состояниями может быть небольшой и чувствительной к внешним воздействиям и белковому окружению, в результате чего комплекс может легко переходить из S-состояния в Т-состояние, что и определяет путь распада ATP [9, 39].

В течение нескольких лет в рамках сотрудничества с американскими коллегами — профессорами Г. Мизиорко (зав. отд. биохимии и молекулярной биологии Университета Канзас-Сити, штат Миссури) и Д.-Д. Ким (Медицинский центр штата Висконсин) ведутся сравнительные структурно-функциональные исследования двух ключевых АТР-зависимых ферментов мевалонатного пути биосинтеза холестерина — мевалонаткиназы и мевалонатдифосфатдекарбоксилазы, по структурному подобию относящихся к суперсемейству GHMP-киназ. Результаты работы планируется использовать для поиска и целенаправленного синтеза высокоспецифичных ингибиторов ферментов, которые могли бы выступать в качестве антимикробных факторов (ингибиторы мевалонаткиназы) и антираковых препаратов (ингибиторы мевалонатпирофосфатдекарбоксилазы). Исследования проводятся на рекомбинантных белках методами сайт-специфического мутагенеза, рентгеноструктурного анализа и структурного моделирования с последующим изучением кинетики мутантных и диких форм ферментов. В белковый банк данных внесены три новые структуры: апомевалонаткиназа человека, комплекс мевалонатки-назы крысы с фарнезилпирофосфатом и апомевалонатдифосфатдекарбоксилазой человека, впервые полученной в высокоочищенном виде. Картированы аминокислотные остатки, обеспечивающие ретроингибирование мевалонаткиназы и стадию декарбокси-лирования мевалонатдекарбоксилазной реакции [33, 42, 43].

Разработка сотрудниками кафедры, специализирующимися в области энзимологии, новых высокотехнологичных методологий и полученные за последние годы оригинальные приоритетные данные служат хорошей основой для воспитания молодого поколения профессионалов — биохимиков и молекулярных биологов. Для студентов уже более 50 лет читается лекционный курс «Энзимология», проводятся практикумы по отдельным разделам энзимологии, читается выросший из спецпрактикума по энзимологии курс «Персональный компьютер для биохимика», реализуется магистерская программа «Энзимология».

Активная и разнообразная научно-педагогическая и организаторская деятельность кафедры биохимии ЛГУ/СПбГУ привела к созданию уникальной университетской энзимологической школы, традиции которой поддерживаются и системно развиваются ее учениками во многих научных, учебных и клинических учреждениях не только России, но и за рубежом.

Монографии, главы в монографиях

1. Антипенко А. Е., Калинский М. И., Лызлова С. Н. Метаболизм миокарда при различных функциональных состояниях. Екатеринбург: Изд-во Уральского университета, 1992. 211 с.

2. 80-летие кафедры биохимии биолого-почвенного факультета // Вестн. С.-Петерб. ун-та. Сер. 3. 2009. Вып. 1. 182 с.

3. Владимиров Г. Е. Об энергетической функции аденозинтрифосфорной кислоты в клетке // Фосфорилирование и функция. Л.: Изд-во ИЭМ, 1960. С. 44-49.

4. Ивашкин В. Т., Васильев В. Ю., Северин Е. С. Уровни регуляции функциональной активности органов и тканей. Л., 1987. 272 с.

5. Карасев В. А., Стефанов В. Е., Курганов Б. И. Надмолекулярные биоструктуры: организация, функционирование, происхождение. Итоги науки и техники. М., 1989. Т. 31. 200 с.

6. Лызлова С. Н. Фосфагенкиназы. Л.: Изд-во ЛГУ, 1974. 168 с.

7. Пантелеева Н. С. Миозин: 18О обмен и фосфорилирование. Л.: Изд-во ЛГУ, 1975. 200 с.

8. Стефанов В. Е., Лызлова С.Н. Креатинкиназа // Белки и пептиды. М.: Наука, 1995. Т. 1. С. 123-129.

9. Тулуб А. А., Стефанов В. Е. Спинтроника нуклеотидов. Сверхбыстрые реакции в биологии. СПб.: Наука, 2010.

10. Karasev V.A., Stefanov V. E. Chemical organization of supramolecular biostructures // Organization of Biochemical systems: structural and regulatory aspects. Nova Science Publishers, Inc., 1996. P. 125-157.

11. Lyzlova S. N., Stefanov V. E. Phosphagen kinases. USA. CRC Press, 1991. 222 p.

Учебники и учебные пособия

12. Березин И. В., Клесов А. А. Практический курс химической и ферментативной кинетики. М.: Изд-во МГУ, 1976. 320 с.

13. Владимиров Г. Е., Лызлова С.Н. Энзимология. Л., 1962. 256 с.

14. Владимиров Г. Е., Пантелеева Н. С. Функциональная биохимия, избранные главы. Л.: Изд-во ЛГУ, 1965. 240 с.

15. Лянгузов А. Ю., Петрова Т. А., Шишов А. К. Электромиграционные методы анализа белков-ферментов. СПб.: Изд-во СПбГУ, 1992. 56 с.

16. Стефанов В. Е., Петрова Т. А., Лянгузов А. Ю. Методы компьютерного моделирования и анализ ферментативной кинетики. СПб.: Золотое сечение, 2007. 102 с.

17. Стефанов В. Е., Тулуб А. А. Введение в квантовую биологию. Методы компьютерного моделирования в анализе биомолекулярных систем. СПб.: Изд-во СПбГУ, 2006. 75 с.

18. Ферменты и нуклеиновые кислоты / Под ред. В. Г. Владимирова, С. Н. Лызловой. СПб.: Изд-во СПбГУ, 1997. 152 с.

Авторские свидетельства и патенты

19. Берзинь-Берзит Р. В., Петрова Т. А., Васильев В. Ю., Путере М. П., Неймане М. А. Способ получения креатинкиназы ММ из скелетных мышц. Авт. св-во СССР № 1398397. Дата приоритета—10.06.1986. Дата регистрации — 22.01.1988.

20. Васильев В. Ю., Калацкий Ю. М., Петрова Т. А., Стефанов В. Е. Способ интегральной экспресс-оценки загрязнения окружающей среды. Патент РФ №2359036. Дата приоритета — 26.09.2007. Дата регистрации — 20.06.2009.

21. Арутюнян А. В., Павлова Н. Г., Константинова Н. Г., Павленко А. В., Кащеева Т. К., Лызлова Л. В., Козина Л. С., Русина Е. И., Михайлов А. В., Шелаева Е. В. Биохимические маркеры нарушения развития мозга плода человека // Нейрохимия. 1996. Т. 13, №3. С. 187193.

22. Карасев В. А., Стефанов В. Е. Эволюционный структурно-функциональный подход к надмолекулярным структурам // Успехи биол. химии. 1991. Т. 32. С. 114-145.

23. Лянгузов А. Ю., Петрова Т. А. Методология исследования сложных ферментативных реакций // Вестн. С.-Петерб. ун-та. 1998. Сер. 3. Вып. 4. №24. С. 58-72.

24. Лянгузов А. Ю., Петрова Т. А., Стефанов В. Е. Новый подход к расчету параметров в ферментативной кинетике // Доклады Академии наук (биохимия, биофизика, молекулярная биология). 2009. Т. 424, №5. С. 692-695.

25. Матюшичев В. Б., Лянгузов А. Ю., Петрова Т. А. Оценка качества уравнения стационарной скорости для двухсубстратной ферментативной реакции // Биохимия. 1991. Т. 56. С. 1661-1664.

26. Матюшичев В. Б., Лянгузов А. Ю., Петрова Т. А., Лапко А. В. Проверка адекватности кинетических уравнений для двухсубстратной ферментативной реакции (на примере креатинкиназы) // Вестн. ЛГУ. 1991. Сер. 3. Вып. 2. №10. С. 70-76.

27. Матюшичев В. Б., Соколов И.Н., Петрова Т. А., Лянгузов А. Ю., Гончарова В. И., Петрова Т. Н. Сдвиги креатинкиназной активности и белкового спектра развивающейся мышечной культуры, обработанной креатинфосфатом // Вестник АМН. 1992. №5. С. 61-65.

28. Солодкова И. В., Петрова Т. А., Потиха О. В., Лянгузов А. Ю. Эффективность применения пирацетама при внутриутробной гипоксии плода. Контроль за содержанием изоформ креатинкиназы // Антигипоксанты и актопротекторы: итоги и перспективы. СПб., 1994. С. 136.

29. Отефанов В. Е. Моделирование в структурно-функциональном анализе биомолекуляр-ных систем // Биохимические и молекулярно-биологические основы физиологических функций. Нервная система. Вып. 37. СПб.: Изд-во СПбГУ, 2004. С. 112-140.

30. Стефанов В. Е. Исследования наностуктур биологического происхождения и биологически значимых наносекундных процессов методами компьютерного моделирования // Вестн. С.-Петерб. ун-та. 2009. Сер. 3. Вып. 1. С. 36-48.

31. Тулуб А. A., Стефанов В. Е. Окислительные свойства [Mg(H2O)6] в триплетном и син-глетном состоянии определяют энергетику распада молекулы аденозинтрифосфата // Журн. неорганической химии. 2009. Т. 54. С. 1188-1195.

32. Engelhardt V.A., Ljubimova M. N. Myosin and adenosinetriphosphatase // Nature. 1939. Vol. 144, N 3650. Р. 668-669.

33. Fu Z., Voynova N. E., Herdendorf T. J., Miziorko H. M., Kim J.-J. P. Biochemical and structural basis for feedback inhibition of mevalonate kinase and isoprenoid metabolism // Biochemistry. 2008. Vol. 47. P. 3715-3724.

34. Karasev V. A., Stefanov V. E. Origin of oligomeric enzymes: population-template model // Evolutionary Biochem. and Related Areas of Physicochem. Biol. Moscow, 1995. P. 377-407.

35. Stefanov V. E., Karasev V. A. Flip-flop mechanism in the enzymatic catalysis: model for kinetic description or physical reality? // An. Quim. 1990. Vol. 86. P. 903-909.

36. Stefanov V.E., Tulub A. A. Mechanisms of biological effects of metal mediated by interactions with nucleotide cofactors of proteins // Metals Ions in Biology and Medicine. Paris: John Libbey Eurtext, 2002. Vol. 7. P. 89-93.

37. Stefanov V. E., Tulub A. A. Migration of protons in a chain of tyrosine residues // Int. J. Quant. Chem. 2001. Vol. 84, N4. P. 409-415.

38. Tulub A. A., Stefanov V. E. Activation of Tubulin Assembly into Microtubules upon a Series of Repeated Femtosecond Laser Impulses // J. Chem. Phys. 2004. Vol. 121, N 22. P. 1134-1135.

39. Tulub A. A., Stefanov V. E. New horizons of adenosinetriphosphate energetics arising from interaction with magnesium cofactor // Europ. Biophys. J. 2008. Vol. 37, N 8. P. 1309-1316.

40. Vasiliev V. Yu., Kalatzky Yu. M., Petrova T. A., Stefanov V. E. Method for monitoring water pollution based on induced fluorescence in the biomolecular test-system // Proceedings of V International Conference «Current Problems in Optics of Natural Waters». St. Petersburg, Russia, September 8-11, 2009. P. 144-148.

41. Vladimirov G. E., Vlasova V. G., Kolotilova A. I., Lyzlova S. N., Panteleeva N. S. The free energy hydrolysis of adenosine triphosphoric acid // Nature. 1957. Vol. 179, N4574. P. 1350-1351.

42. Voynova N. E., Fu Z., Battaile K. P., Herdendorf T. J., Kim J.-J. P., Miziorko H. M. Human mevalonate diphosphate decarboxylase: characterization, investigation of the mevalonate diphosphate binding site, and crystal structure // Archives of Biochemistry and Biophysics. 2008. Vol. 480. P. 58-67.

43. Voynova N. E., Rios S. E., Miziorko H. M. Staphylococcus aureus mevalonate kinase: isolation and characterization of an enzyme of the isoprenoid biosynthetic pathway // J. Bacteriology. 2004. Vol. 186. P. 61-67.

Статья поступила в редакцию 28 июня 2010 г.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.