Научная статья на тему 'Дисперсионный анализ эффектов алкилоксибензолов в системах «Фермент - субстрат» и «Антиген - антитело»'

Дисперсионный анализ эффектов алкилоксибензолов в системах «Фермент - субстрат» и «Антиген - антитело» Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
91
39
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
АЛКИЛОКСИБЕНЗОЛЫ / МОДИФИКАЦИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ БЕЛКОВ / ИЗМЕНЕНИЕ СВОЙСТВ СУБСТРАТОВ И АНТИГЕНОВ / ALKYL PHENYL ALCOHOLS / MODIFICATION OF PROTEIN FUNCTIONAL ACTIVITY / ALTERATION OF THE SUBSTRATUM AND ANTIGEN CHARACTERISTICS

Аннотация научной статьи по биотехнологиям в медицине, автор научной работы — Дерябин Д. Г., Михайленко Н. А., Кобзева Т. Г.

С использованием метода дисперсионного анализа количественно оценена значимость воздействия алкилоксибензолов (АОБ) на компоненты реакций «фермент субстрат» и «антиген антитело». Установлено, что в подобных двухкомпонентных системах С1-АОБ проявлял свое действие как через модификацию функциональной активности белковых молекул, так и посредством изменения свойств субстратов и, особенно, антигенов. С другой стороны, наиболее значимым механизмом действия С6-АОБ оказывалось его прямое модифицирующее действие на активность ферментов и антигенсвязывающую способность антител.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Дерябин Д. Г., Михайленко Н. А., Кобзева Т. Г.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

THE VARIANCE ANALYSIS OF THE ALKYL PHENYL ALCOHOL EFFECTS IN THE SYSTEMS ‘FERMENT-SUSTRATUM’AND ‘ANTIGEN- ANTIBODY’

The significance of the alkyl phenyl alcohol (APA) impact on the reaction components ‘Ferment-Substratum’ and ‘Antigen-Antibody’ was quantitatively assessed through the variance analysis method. It was found that in these two-component systems the C1-APA acted both through modification of functional activities of the protein molecules and alterations of the substratum characteristics and, in particular, antigens. On the other hand, most significant action mechanism of the C6-APA was found to be its direct modifying impact on the ferment activity and antigen-binding capabilities of the antibodies.

Текст научной работы на тему «Дисперсионный анализ эффектов алкилоксибензолов в системах «Фермент - субстрат» и «Антиген - антитело»»

Дерябин Д.Г., Михайленко Н.А., Кобзева Т.Г.

ГОУ ВПО «Оренбургский государственный университет»

ДИСПЕРСИОННЫЙ АНАЛИЗ ЭФФЕКТОВ АЛКИЛОКСИБЕНЗОЛОВ В СИСТЕМАХ «ФЕРМЕНТ - СУБСТРАТ» И «АНТИГЕН - АНТИТЕЛО»

С использованием метода дисперсионного анализа количественно оценена значимость воздействия алкилоксибензолов (АОБ) на компоненты реакций «фермент - субстрат» и «антиген -антитело». Установлено, что в подобных двухкомпонентных системах С1-АОБ проявлял свое действие как через модификацию функциональной активности белковых молекул, так и посредством изменения свойств субстратов и, особенно, антигенов. С другой стороны, наиболее значимым механизмом действия С6-АОБ оказывалось его прямое модифицирующее действие на активность ферментов и антигенсвязывающую способность антител.

Ключевые слова: алкилоксибензолы, модификация функциональной активности белков, изменение свойств субстратов и антигенов.

Алкилоксибензолы (АОБ) составляют широкую группу молекул микробного и растительного происхождения [1]. Универсальные механизмы их биологической активности заключаются в установлении гидрофобных, электростатических и водородных взаимодействий с широким кругом биополимеров, результатом чего является модификация структурной организации и функциональной активности последних [2, 3]. При этом формирование подобных эффектов оказывается возможным и в гетероло-гичных системах, в частности - в отношении ферментных и рецепторных белков животного происхождения [4, 5]. Другой интересной особенностью АОБ является их способность модифицировать свойства полимерных субстратов [6].

Сказанное определяет интерес к исследованию эффектов алкилоксибензолов в двухком-понентных биологических системах с выявлением относительной силы воздействия на каждый из компонентов реакции. В частности, целью настоящей работы явился дисперсионный анализ эффектов АОБ в ферментной системе «лизоцим - Micrococcus luteus», а также их влияния на специфическое взаимодействие антител к Toxoplasma gondii с соответствующими антигенами.

При проведении исследований в качестве химических аналогов микробных АОБ использовали метилрезорцин (С1-АОБ, мол. вес = 124) и гексилрезорцин (С6-АОБ, мол. вес = 194) со степенью очистки 99,9% (Sigma, США). Исходные концентрации данных веществ, взаимодействующих с компонентами анализируемых реакций, составляли 0, 2х10-7, 2х10-5 и 2х10-3М в ферментной системе и 0, 2х10-7, 2х10-6, 2х10-5, 2х10-4 и 2х10-3М в системе с участием антител и антигенов. Для формирования охарактеризо-

ванных выше физико-химических взаимодействий ферменты, антитела, бактериальные клетки и антигены предварительно инкубировали в контакте с АОБ при 37 оС в течение 60 мин., после чего запускали сами реакции путем смешивания действующих компонентов.

Ферментную литическую систему формировали путем смешивания коммерческого препарата лизоцима яичного белка (EC 3.2.1.17) с культурой Micrococcus luteus АТСС 15307. Для этого клетки M. luteus культивировали на жидкой питательной среде в течение 24 часов при температуре 37 оС, после чего биомассу отделяли центрифугированием и ресуспендировали в фосфатном буфере рН 6,2 до оптической плотности 0,5 ед. (ширина кюветы 1 см, длина волны 540 нм), что соответствовало абсолютному содержанию бактериальных клеток на уровне 2,85х107 КОЕ/мл. После совместной часовой инкубации с различными концентрациями алкилоксибензолов к полученной суспензии объемом 2,8 мл, добавляли 0,2 мл раствора лизоцима с концентрацией 2х10-5М, также предварительно обработанного АОБ, и определяли значения оптической плотности образца в течение 10 мин с интервалом 10 сек. Эффективность литичес-кой реакции характеризовали величиной ее максимальной скорости (Vmax), для чего строили касательную к кривой падения оптической плотности с последующим расчетом по формуле:

V =

C - C

t - t

кон нач

где С и С - содержание клеток М. Ывш в 1 мл

нач кон 1

суспензии при Ь и Ь - времени начала и окон-

нач кон

чания участка максимальной скорости лизиса. При этом на основании заранее определенной пропорциональности между значениями опти-

ческой плотности и содержанием бактериальных клеток в пробе скорость лизиса выражали величиной абсолютного количества клеток, разрушающихся при воздействии лизоцима в 1 мл реакционной смеси в единицу времени: КОЕ/млхсек.

Эксперименты по исследованию эффектов АОБ в системе «антиген - антитело» проводились с использованием наборов «ВектоТоксо-IgG» (Вектор-Бест, Новосибирск, Россия) для иммуноферментного количественного определения иммуноглобулинов класса G к Toxoplasma gondii. В качестве источника антител использовали имеющийся в них контрольный образец с концентрацией иммуноглобулинов 50 МЕ/мл, антигенами служили соответствующие компоненты, сорбированные на дне полистироловых планшетов. Перед проведением эксперимента АОБ в обозначенных выше концентрациях смешивали с антителами в соотношении 1:1, а также после аналогичного разведения дистиллированной водой вносили в лунки полистироловых планшетов и инкубировали при 37 оС в течение 60 мин. для созревания соответствующих комплексов. В дальнейшем планшет промывали и вносили в него образцы антител, модифицированных АОБ, после чего оценивали взаимодействие в системе «антиген - антитело» с использованием технологии иммуноферментного анализа. Показатели связывания характеризовали относительной величиной оптической плотности (ОП), регистрируя последнюю при 450 нм.

Таблица 1. Скорости ферментативной реакции (Vmax, КОЕ/млхс), формирующиеся в литической системе «лизоцим - Micrococcus luteus» после воздействия АОБ

Концентрация АОБ при модификации лизоцима (строки) или клеток (столбцы), М 0 2 X 10-7 2 X 10-5 2 X 10-3

Ci-АОБ

0 5903 6342 6614 6974

2 X 10"7 6141 6250 6387 7019

2 X 10-5 6547 6413 6598 7129

2 X 10"3 7001 6778 6949 7205

Сб-АОБ

0 5628 4408 3658 2345

2 X 10"7 4660 3846 2720 2144

2 X 10"5 3752 3749 2064 750

2 X 10"3 3564 2940 1688 469

Все эксперименты выполнены минимум в трех повторностях. Статистическая обработка полученных результатов проведена с использованием пакета программ «Microsoft Excel», в том числе модуля «Анализ данных» в варианте двухфакторного дисперсионного анализа без повторений.

В ходе проведенных исследований было установлено, что действие различных АОБ в использованных двухкомпонентных системах неоднозначно.

Так в ферментной системе «лизоцим -M. luteus» метилрезорцин во всем диапазоне использованных концентраций и вариантах постановки экспериментов вызывал увеличение скорости литической реакции. При этом обработка лизоцима увеличивающимися от 0 до 2х10"7, 2х10"5 и 2х10"3М концентрациями С. -АОБ результировалась в росте значений V

1 г J 1 1 max

в ряду 5903 > 6343 > 6614 > 6974 КОЕ/млхсек. В свою очередь прединкубация клеток M.luteus в том же диапазоне концентраций С1-АОБ прогрессивно увеличивала скорость лизиса от 5903 до 7001 КОЕ/млхсек. Одновременная же обработка названных компонентов ферментной системы еще более увеличивала V , наибольшие

max

значения которой были достигнуты в случае предварительной инкубации как лизоцима, так и клеток M. luteus с С1-АОБ в наибольшей из использованных концентраций (таблица 1).

В свою очередь гексилрезорцин вызывал в ферментной литической системе противоположные дозозависимые ингибирующие эффекты, заключающиеся в снижении регистрируемых значений V с 5628 до 2354 КОЕ/млхсек в

max

варианте эксперимента с предварительной обработкой лизоцима и до 3564 КОЕ/млхсек при инкубации С6-АОБ в контакте с клетками M. luteus. Наиболее же выраженные эффекты С6-АОБ и в этом случае были установлены при его одновременном воздействии на оба компонента системы: минимальные значения V = 469 КОЕ/млхсек достигнуты в случае

max

предварительной инкубации как лизоцима, так и клеток M. luteus с данным алкилоксибензолом в концентрации 2х10-3М (таблица 1).

Таким образом, полученные результаты свидетельствовали о возможности воздействия АОБ как на ферментную, так и на субстратную составляющую литической системы «лизоцим -M.luteus», что определило задачу выявления

Дерябин Д.Г., др.

Дисперсионный анализ эффектов алкилоксибензолов...

влияния каждого из обозначенных факторов на результат эксперимента. Для ее решения нами был использован метод дисперсионного анализа, предложенный Р. Фишером для исследования влияния одной или нескольких качественных переменных на одну зависимую количественную переменную. При этом в качестве причин (факторов, или независимых переменных) нами рассматривались комплексы «лизоцим -АОБ» и «М.Ывш - АОБ», формирующиеся при различных использованных концентрациях алкилоксибензолов, а в качестве следствия (зависимой переменной) достигаемые при их смешивании значения V .

тах

Проведенный в исследуемом двухфактор-ном равномерном комплексе расчет дисперсионного отношения позволил опровергнуть нулевую гипотезу на высоком уровне значимости (Р<0,01 для С1-АОБ и Р<0,001 для С6-АОБ), что свидетельствовало о достоверном влиянии на зависимую переменную каждого из регулирующих факторов. Последующий же анализ, направленный на определение силы воздействия регулирующих факторов, позволил оценить значимость взаимодействия АОБ с каждым из компонентов литической системы.

Так характеризуемое коэффициентом детерминации (У) преимущественное влияние С1-АОБ на литическую систему реализовыва-лось через модифицирующее воздействие на активность лизоцима: Ь2лиз = 0,53. Одновременно 34% эффекта С1-АОБ в подобной ферментной системе определялось изменением (повышением) степени лизо-цимчувствительности клеток М.Ывт с сохранением 13% за неучтенными в модели факторами. С другой стороны, для С6-АОБ варьирование, вызванное влиянием неучитываемых факторов, не превышало 3%, в то время как рассчитанные значения коэффициентов детерминации составили Ь2лиз = 0,70 и Ь2М1 = 0,27 (рисунок).

В серии аналогичных экспериментов с использованием системы «антитело - антиген» характер действия алкилоксибензолов несколько отличался от описанного выше. Так обработка каждого из

1,2 -

0,8 -

0,6 -

0,4 -

компонентов реакции, как С1-АОБ, так и С6-АОБ, в диапазоне концентраций от 0 до 2х10-3М результировалась в снижении выраженных в единицах оптической плотности величин взаимодействия, при этом количественные характеристики подобных эффектов вновь зависели от природы АОБ.

При модификации антител в использованном диапазоне концентраций С1-АОБ зарегистрировано снижение показателей их связывания с соответствующими антигенами лишь на 7% от контрольных значений. В свою очередь предварительная инкубация антигенов с данным ауто-регулятором несколько больше изменяла значения отражающей количество образовавшихся комплексов «антиген - антитело» оптической плотности, изменяющейся с увеличением действующих концентраций С1-АОБ в ряду 0,745 > 0,776 > 0,754 > 0,710 > 0,666 > 0,672. В результате же параллельной обработки каждого их названных компонентов реакции вышеописанные эффекты частично суммировалась, при этом наименьшие показатели связывания достигались в случае предварительной инкубации антител с С^АОБ в концентрациях 2х10"4 и 2х10"3М, а антигенов в концентрации 2х10-3М (таблица 2).

На этом фоне С6-АОБ оказывал на способность антител к специфическому взаимодей-

0,8

0,4

По оси абсцисс - используемые АОБ; по оси ординат - коэффициент детерминации (h2), описывающий силу их влияния на отдельные компоненты систем.

Обозначения: 1 - лизоцим, 2 - клетки M. luteus, 3 - антитела к T. gondii, 4 - антигены T. gondii, 5 - прочие (неучтенные) факторы.

Рисунок. Оценка модифицирующего влияния АОБ на компоненты систем «фермент - субстрат» (а) и «антиген антитело» (б).

1,2

0,6

0,2

0

Таблица 2. Показатели связывания (ОП, ед.), формирующиеся в системе «антитело - антиген» после воздействия АОБ

Концентрация АОБ при модификации антител (строки) или антигенов (столбцы) 0 2 X 10"7 2 X 10"6 2 X 10"5 2 X 10"4 2 X 10"3

СгАОБ

0 0,745 0,720 0,758 0,716 0,744 0,692

2 X 10"7 0,776 0,757 0,784 0,725 0,741 0,712

2 X 10"6 0,754 0,704 0,733 0,717 0,721 0,722

2 X 10-5 0,710 0,668 0,701 0,690 0,679 0,680

2 X 10-4 0,666 0,689 0,709 0,682 0,701 0,677

2 X 10"3 0,672 0,730 0,698 0,686 0,657 0,660

С6-АОБ

0 0,515 0,537 0,504 0,493 0,497 0,099

2 X 10"7 0,512 0,537 0,514 0,506 0,485 0,102

2 X 10"6 0,507 0,528 0,496 0,497 0,457 0,099

2 X 10"5 0,482 0,499 0,485 0,468 0,457 0,098

2 X 10"4 0,496 0,504 0,493 0,473 0,460 0,094

2 X 10"3 0,480 0,531 0,493 0,495 0,455 0,098

ствию с соответствующими антигенами значительно более выраженные эффекты. При этом результатом являлось существенное снижение параметров связывания с увеличением концентрации данного алкилоксибензола, изменяющихся в ряду 0,515 > 0,537 > 0,504 > 0,493 > 0,497 > 0,099 и в максимуме эффекта отклоняющихся от контрольных значений на 81%. С другой стороны, при инкубации антигенов с С6-АОБ показатели связывания менялись незначительно, что сопровождалось их достаточно слабым влиянием на параметры системы при одновременной обработке антител и антигенов (таблица 2).

Окончательное ранжирование значимости эффектов АОБ в системе «антиген - антитело» вновь было осуществлено с использованием метода дисперсионного анализа. При этом, подобно описанному выше примеру в качестве независимых переменных нами рассматривались комплексы «антитело - АОБ» и «антиген -АОБ», формирующиеся при различных концентрациях алкилоксибензолов, а в качестве зависимых - достигаемые при различных вариантах их сочетания значения оптической плотности системы.

Проведенный при этом расчет дисперсионного отношения позволил констатировать статистическую достоверность влияния каждой из независимых переменных на уровне Р<0,05 для

С1-АОБ и Р<0,001 для С6-АОБ. При этом для С1-АОБ преимущественное влияние на изученную двухкомпонентную систему реализовыва-лось через модифицирующее воздействие на антигены: Ь2Дг = 0,61, в то время как лишь 16% эффекта определялось влиянием на антигенсвя-зывающую способность антител. Одновременно неучтенными оставалось 23% дисперсии, что существенно превышало аналогичное значение <1%, вычисленное для системы, модифицированной С6-АОБ. В свою очередь еще одно значимое отличие в эффектах гексилрезорцина по сравнению с метилрезорцином заключалось в том, что влияние первого из названных АОБ было максимальным в отношении антигенсвя-зывающей способности антител (коэффициент детерминации Ь2Дт = 0,99), в то время как в отношении антигенов оно характеризовалось минимальной величиной Ь2Дг = 0,0047 (рисунок).

Таким образом, использование метода дисперсионного анализа позволило количественно оценить значимость воздействия алкилоксибен-золов на компоненты реакций «фермент - субстрат» и «антиген - антитело». При этом особенностями действия С^АОБ и С6-АОБ в ферментной системе являлась противоположная направленность инициируемых ими эффектов (стимуляция и ингибиция лизиса соответственно), в то время как во второй системе назван-

Дерябин Д.Г., др.

Дисперсионный анализ эффектов алкилоксибензолов..

ные алкилоксибензолы действовали сонаправ-ленно, обуславливая только снижение показателей специфического связывания антител с соответствующими антигенами.

На этом фоне эффекты С^АОБ в обоих системах не могли быть сведены исключительно к его воздействию на регулирующие факторы (процент необъясненной дисперсии от 13 до 23%), в то время как эффекты С6-АОБ интерпретировались более однозначно. Одновременно С^АОБ оказывался значим не только как фактор, вызывающий модификацию свойств белковых молекул, но в значительной степени проявляя свое действие через изменение свойств

субстратов и, особенно, антигенов. С другой стороны, наиболее значимым механизмом действия С6-АОБ оказывалось его прямое модифицирующее действие на ферментативную активность лизоцима и антигенсвязывающую способность антител.

Полученные результаты существенно расширяют представления о значимости эффектов алкилоксибензолов в двухкомпонентных биологических системах, одновременно открывая возможности для управления протекающими в них ферментативными и неферментативными реакциями. Разработке подобных подходов будут посвящены наши дальнейшие исследования.

Список использованной литературы:

1. Kozubek A., Tyman J.H.P. Resorcinolic lipids, the natural non-isoprenoid phenolic amphiphiles and their biological activity // Chem.Rev. 1999. V. 99. №1. P. 1-31.

2. Николаев Ю.А., Лойко Н.Г., Степаненко И.Ю., Шаненко Е.Ф., Мартиросова Е.И., Плакунов В.К., Козлова А.Н., Борзен-ков И.А., Коротина О.А., Родин Д.С., Крупянский Ю.Ф., Эль-Регистан Г.И. Изменения физико-химических свойств белков, модифицированных алкилоксибензолами // Прикл. биохимия и микробиология. 2008. Т. 44. №2. С. 159-167.

3. Давыдова О.К., Дерябин Д.Г., Никиян А.Н., Эль-Регистан Г.И. О механизмах взаимодействия ДНК с химическими аналогами микробных аутоиндукторов анабиоза // Микробиология. 2005. Т.74. №5. С.616-625.

4. Колпаков А.И., Ильинская О.Н., Беспалов М.М., Куприянова-Ашина Ф.Г., Гальченко В.Ф., Курганов Б.И., Эль-Регистан Г.И. Стабилизация ферментов аутоиндукторами анабиоза как один из механизмов устойчивости покоящихся форм микроорганизмов // Микробиология. 2000. Т.69. №2. С. 224-230.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

5. Kozubek A., Wroblewski Z. Cereal grain long chain amphiphilicresorcinolic lipids inhibit significantly binding of fibrinogen by plateletswhereas short chain resorcinolic lipids and fatty acids do not // Stud.Biophys. 1990. №139 P. 177-181.

6. Мартиросова Е.И., Карпекина Т.А., Эль-Регистан Г.И. Модификация ферментов естественными химическими шаперона-ми микроорганизмов // Микробиология. 2004. Т.73. №5. С. 708-715.

Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований

(проект 08-04-99078-р_офи)

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.