CC BY
27
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-3-50-62
Динамика заболеваемости и этиологической структуры острых респираторных инфекций накануне и в первый год распространения COVID-19 в Иркутской области
Н. А. Кравченко1, В. Б. Казанова3, М. И. Хакимова3, Т. А. Гаврилова22 З, З. А. Зайкова1, А. Д. Ботвинкин*1
1 ФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Иркутск
2 ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии по Иркутской области», г. Иркутск
3 Министерство здравоохранения Иркутской области, г. Иркутск
Резюме
Актуальность. Острые респираторные инфекции верхних дыхательных путей (ОРИ) и внебольничные пневмонии (ВП), нередко этиологически связанные с ними, относятся к числу наиболее распространенных форм инфекционной патологии в Российской Федерации. Ретроспективный анализ результатов мониторинга ОРИ необходим для совершенствования эпидемиологического надзора. В начале пандемии новой кронавирусной инфекции наблюдалась региональная вариабельность показателей заболеваемости COVID-19 и ОРИ. Первые случаи COVID-19 в Иркутской области выявлены на два месяца позже первых случаев в России, и в начале эпидемии заболевание медленно распространялось среди местного населения. Цель. Выявить годовые и сезонные изменения заболеваемости ОРИ и циркуляции респираторных вирусов в Иркутской области перед началом и в первые месяцы эпидемии новой коронавирусной инфекции. Материалы и методы. Проведено ретроспективное описательное исследование по результатам регионального мониторинга ОРИ за 2017-2020 гг. В анализ включены данные учета острых инфекций верхних ^06) и нижних ^20^22) дыхательных путей, гриппа (Л0, Л1), внебольничной пневмонии (Л2-Л6, Л8) и COVID-19 (и07.1, и07.2), а также результаты исследования 5,5 тыс. проб от пациентов с ОРИ. Результаты и обсуждение. В 2020 г. инцидентность COVID-19 составила 3180 на 100 тыс. населения или 7% от всех случаев ОРИ верхних и нижних дыхательных путей (2ОРИ). В 2020 г., по данным Управления Роспотребнадзора по Иркутской области, число случаев ОРИ сократилось на 25,7%, но внебольничной пневмонии (ВП) увеличилось на 83,2% (р < 0,001) по сравнению с 2019 г. Инцидентность ВП достигла 1400 на 100 тыс. Доля детей в структуре заболеваемости ВП сократилась с 39,4% до 12,6% (р < 0,001), а доля взрослых возросла с 60,6% до 87,3% (р < 0,001). Эти изменения наиболее выражены на фоне «второй волны» COVID-19 в конце 2020 г. Доля ВП в 2ОРИ в среднем за 2017-2020 гг. составила 2,62% (ДИ 2,56-2,68). Превышение этого показателя отмечено в конце 2020 г. во время эпидемии COVID-19 - 8,08 (ДИ 8,07-8,09), а также в начале 2019 г. во время эпидемии гриппа - 2,83% (ДИ 2,81-2,85). В 2019-2020 гг. зарегистрировано увеличение частоты положительных проб на коронавирусы человека (hCovs) до 2,1-2,3% в сравнении с 0,7-0,9% в 2017-2018 гг. (р < 0,05). Риновирусы продолжали активно циркулировать во время эпидемии COVID-19. Значимое соответствие между частотой обнаружения вирусов и долей ВП в 2ОРИ установлена только для вирусов гриппа (х2 = 26,2, р < 0,01). Для остальных вирусов связь статически не значима (р > 0,05). Заключение. Старт эпидемии COVID-19 сопровождался значительными изменениями заболеваемости ОРИ, хотя в 2020 г. число зарегистрированных случаев новой коронавирусной инфекции не превышало 10% от 2ОРИ. Увеличение доли ВП в 2ОРИ и изменение возрастной структуры групп риска заслуживают особого внимания. Эпидемиологический анализ результатов мониторинга не подтверждает гипотезу о возможном распространении в Иркутской области SARS-CoV-2 ранее 2020 г.
Ключевые слова: острые респираторные инфекции, внебольничная пневмония, мониторинг, COVID-19, пандемия Конфликт интересов не заявлен.
Для цитирования: Кравченко Н. А., Казанова В. Б., Хакимова М. И. и др. Динамика заболеваемости и этиологической структуры острых респираторных инфекций накануне и в первый год распространения COVID-19 в Иркутской области. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2022;21(3): 50-62. https://doi:10.31631/2073-3046-2022-21-3-50-62
* Для переписки: Ботвинкин Александр Дмитриевич, д. м. н., профессор, заведующий кафедрой эпидемиологии, ФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава России, 664003, г. Иркутск, ул. Красного восстания, 1. +7(914) 941-89-40, факс +7 (3952) 24-38-25, botvinkin_ismu@mail.ru. ©Кравченко Н. А. и др.
Dynamics of Morbidity and Etiological Structure of Acute Respiratory Infections on the Eve and in the First Year of COVID-19 in the Irkutsk Region
NA Kravchenko1, VB Kazanova2, MI Khakimova2, TA Gavrilova3, ZA Zaikova1, AD Botvinkin*1
1 Irkutsk State Medical University, Russia
2 Center for epidemiology and hygiene, Irkutsk, Russia
3 Ministry of Health of the Irkutsk Region, Irkutsk, Russia Abstract
Relevance. At the beginning of the pandemic, there was regional variability in incidence rates not only for COVID-19, but also for other acute respiratory infections of the upper and lower respiratory tract (ARIs). The first cases of COVID-19 in the Irkutsk region were detected two months later than the first cases in Russia, and at the beginning of the epidemic, the disease slowly spread among the local population. A retrospective analysis of ARIs monitoring is necessary to improve epidemiological surveillance. The aim of the work is to identify annual and seasonal changes in the incidence of ARIs and the circulation of respiratory viruses in the Irkutsk region before and during the first months of the epidemic of a new coronavirus infection. Materials and methods. A retrospective descriptive study was conducted based on the results of regional monitoring for 2017-2020. The analysis included records of acute infections of the upper (J06) and lower (J20-J22) respiratory tract, influenza (J10, J11), community-acquired pneumonia (J12-J16, J18) and COVID-19 (U07.1, U07.2), as well as the results of a study of 5.5 thousand samples from patients with ARIs. Respiratory viruses (n = 10) were detected using reagent kits for polymerase chain reaction (PCR) «AmpliSense® Influenza virus A/B-FL», «AmpliSense®ORVI-screen-Fl» (Russia). The distribution of incidence rates and PCR results was analyzed by years, epidemic seasons, calendar weeks, and age groups. Results. In 2020, the incidence of COVID-19 was 3180 per 100,000 population, or 7% of all cases of ARIs of the upper and lower respiratory tract (2ARIs). In 2020, according to epidemiological service, the number of cases of acute respiratory infections decreased by 25.7%, but the number of cases of community-acquired pneumonia (CAP) increased by 83.2% (p < 0.001) compared to 2019. The incidence of CAP reached 1400 per 100,000 population. The proportion of children in the structure of CAP incidence decreased from 39.4% to 12.6% (p < 0.001), and the proportion of adults increased from 60.6% to 87.3% (p < 0.001). These changes were most pronounced during the «second wave» of COVID-19 at the end of 2020. The share of CAP in 2ARIs on average for 2017-2020 was 2.62% (CI 2.56-2.68).This indicator was exceeded at the end of2020 during the COVID-19 epidemic - 8.08 (CI 8.07-8.09), and also at the beginning of 2019 during the influenza epidemic - 2.83% (CI 2.81-2.85). In 2019-2020 an increase in the frequency of positive tests for human coronaviruses (hCovs) up to 2.1-2.3% was registered, compared with 0.7-0.9% in 2017-2018 (p<0.05). Rhinoviruses continued to circulate actively during the COVID-19 epidemic. A significant correspondence between the frequency of detection of viruses and the share of CAP in 2ARIs was established only for influenza viruses (x2 = 26.2, p < 0.01). For other viruses, the relationship is not statistically significant (p > 0.05). Conclusions. The start of the COVID-19 epidemic was accompanied by significant changes in the incidence of ARIs, although in 2020 the number of registered cases did not exceed 10% of 2ARIs. The increase in the proportion of CAP in 2ARIs and the change in age risk groups deserve special attention. The epidemiological analysis does not confirm the hypothesis of a possible spread of SARS-Cov2 in the Irkutsk region before 2020.
Keywords acute respiratory infections, community-acquired pneumonia, monitoring, COVID-19, epidemic onset, retrospective analysis, Irkutsk region No conflict of interest to declare
For citation: Kravchenko NA, Kazanova VB, Khakimova MI, et al. Dynamics of Morbidity and Etiological Structure of Acute Respiratory Infections on the Eve and in the First Year of COVID-19 in the Irkutsk Region. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2022;21(3): 50-62 (In Russ.). https://doi:10.31631/2073-3046-2022-21-3-50-62
Введение инфекции нижних дыхательных путей и внебольнич-
Острые респираторные инфекции верхних ды- ные пневмонии. После 2019 г. к ним добавилась
хательных путей (ОРИ) и внебольничные пнев- новая коронавирусная инфекция, быстро полу-
монии (ВП), нередко этиологически связанные чившая пандемическое распространение. К июню
с ними, относятся к числу наиболее распространен- 2020 г. в РФ зарегистрировано более 500 тыс.
ных форм инфекционной патологии в Российской случаев COVID-19, к концу года число выявленных
Федерации [1]. В этиологической структуре ОРИ случаев превысило 3,1 млн [4,5]. Контагиозность
существенное место занимают острые респира- возбудителей ОРИ и большое количество источ-
торные вирусные инфекции (ОРВИ) [2,3]. В целом ников инфекции в популяции определяют высо-
в группе острых респираторных инфекций (^ОРИ) кую вероятность одновременного инфицирования
статистическому учету подлежат грипп, инфекции несколькими патогенами. Накапливается инфор-
множественной и неустановленной этиологии, мация о существенном влиянии конкурентных
" For correspondence: Botvinkin Aleksandr D., Dr. Sci. (Med.), professor, Head of the Epidemiology Department Irkutsk State Medical University, 1, Krasnoe vosstanie, Irkutsk, 664003, Russia. +7 (914) 941-89-40, fax: +7 (3952) 24-38-25, botvinkin_ismu@mail.ru. ©Kravchenko NA, et al.
и симбиотических отношений возбудителей ОРИ на эпидемический процесс [6,7]. Эта группа инфекционных болезней неизменно привлекает внимание при обсуждении теоретических вопросов коморбидности и интеграционной эпидемиологии [6,8-9]. Микстинфекция SARS-CoV-2 с другими респираторными вирусами - распространенное явление [7,10-13]. Установлено, что восприимчивость населения к новой коронавирусной инфекции может изменяться из-за предшествующей вакцинации против других инфекционных заболеваний или инфицирования другими вирусами [9,14,15], при этом особое внимание уделяется ко-ронавирусам человека [16-19].
Первые случаи COVID-19 на территории РФ выявлены 31 января 2020 г. в азиатской части страны (г. Тюмень, г. Чита) среди граждан Китайской Народной Республики [4,20]. Несмотря на большое количество туристов из Китая, первые случаи COVID-19 лабораторно подтверждены в Иркутской области на два месяца позже - с 27 марта после завоза из Объединенных Арабских Эмиратов и европейской части РФ. В апреле и мае новая коро-навирусная инфекция медленно распространялась среди местного населения, и более 40% всех заболеваний выявлялось среди мигрантов из стран СНГ и европейской части РФ. По итогам первых трех месяцев антитела к SARS-Cov-2 выявлялись у 5,8% жителей Иркутской области - существенно реже, чем в ряде других регионах РФ [20,21]. Через 6 месяцев после эпидемии серопревалентность достигла 12,1%. Максимальная инцидентность во время летнего подъема заболеваемости составила в день 69,3, во время осенне-зимнего подъема - 76,3 на 100 тыс. населения [21,22]. Не исключено, что региональные особенности эпидемиологии COVID-19 могли быть связаны с предшествующим эпидемиологическим фоном. Результаты вирусологического мониторинга ОРИ и ВП на территории региона проанализированы до 2016 г. включительно [23], но за три года перед началом эпидемии COVID-19 анализ этих данных не проводился.
Цель исследования - выявить годовые и сезонные изменения заболеваемости ОРИ и циркуляции респираторных вирусов в Иркутской области перед началом и в первые месяцы эпидемии новой коронавирусной инфекции.
Материалы и методы
Проведено ретроспективное описательное исследование по данным регионального реги-страционно-статистического и этиологического мониторинга. Для оценки динамики заболеваемости ОРИ верхних дыхательных путей множественной и неуточненной этиологии У06), гриппом (Л0, Л1) и внебольничной пневмонией (Л2- Л6, Л8) по годам и возрастным группам использованы данные федерального статистического наблюдения формы 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» (далее - форма 2) за 2017-2020 гг.
Управления Роспотребнадзора по Иркутской области. Аналогичные данные за 2019 и 2020 гг., а также сведения об острых инфекциях нижних дыхательных путей (J20-J22) и COVID-19 (U07.1, U07.2) получены из формы 12 «Сведения о числе заболеваний у пациентов, проживающих в районе обслуживания медицинской организации» Минздрава Иркутской области (далее - форма 12). Учитывая проблемы с дифференциальной диагностикой и кодированием диагнозов ОРИ, для анализа использовали также статистические данные по сумме всех острых респираторных инфекций (^ОРИ) верхних и нижних дыхательных путей, включая грипп и ВП, по годам.
Регистрируемая заболеваемость сопоставлена с результатами этиологического мониторинга ОРИ за 2017-2020 гг., который проводился Центром гигиены и эпидемиологии в Иркутской области в соответствии с СП 3.1.2.3117-13 «Профилактика гриппа и других острых респираторных вирусных инфекций». Выборку данных проводили из формы 2 «Сведения о деятельности лабораторий санитарно-гигиенического, микробиологического, пара-зитологического профиля ФБУЗ Центров гигиены и эпидемиологии», а также из оперативных сводок «Мониторинг за зарегистрированными внеболь-ничными пневмониями» и «Недельная динамика заболеваемости гриппом и ОРВИ». Еженедельно в вирусологической лаборатории исследовали в среднем около 30 мазков из носа и ротоглотки амбулаторных и стационарных пациентов с ОРИ, проходивших обследование и лечение в медицинских организациях. В общей сложности за анализируемый период в ПЦР исследовано 5,5 тыс. проб. Для ПЦР-исследований использовали наборы реагентов (ЦНИИ Эпидемиологии, Москва): «АмплиСенс®Influenza virus А/В-FL» - для выявления РНК вирусов гриппа А (Influenza virus A) и гриппа В (Influenza virus B); «АмплиСенс®ОРВИ-скрин^» -для выявления и идентификации возбудителей ОРВИ человека: РНК респираторно-синцитиально-го вируса (human Respiratory Syncytial virus-hRSv), метапневмовируса (human Metapneumovirus-hMpv), вирусов парагриппа 1, 2, 3 и 4 типов (human Parainfluenza virus-1-4-Piv), коронавирусов видов ОС43, Е229, NL63, HKUI (human Coronavirus-hCov), риновирусов (human Rhinovirus-hRv), ДНК аденовирусов групп В, С и Е (human Adenovirus-hAdv) и бокавируса (human Bocavirus-hBov). В апреле-августе 2020 г. мониторинг в обычном режиме не проводился в связи с организацией массовых исследований на новую коронавирусную инфекцию. С апреля по декабрь 2020 г. с помощью набора «Вектор-ПЦР^-2019-nCoV-RG» (ГНЦ «Вектор», Кольцово) и набора реагентов для выявления РНК коронавирусов SARS-CoV-2 и подобных SARS-CoV вирусов (ООО «ДНК-Технология», Москва) исследовано 105 тыс. проб. Базовое оборудование для ПЦР описано ранее [23].
Для анализа сезонной динамики данные по числу выявленных случаев ОРИ и результаты лабораторных
исследований в календарные недели (к.н.) суммировали за периоды времени продолжительностью в четыре недели (всего 13 периодов в год). Это было сделано с целью нивелирования разброса показателей в первые и последние недели года из-за разного количества дней в к.н. на рубеже лет и особенностей регистрации заболеваемости в предновогодние и новогодние дни. Частоту обнаружения различных вирусов оценивали в процентах к числу исследованных проб за каждые 4 к.н. с последующим расчетом средней арифметической за весь анализируемый период. Аналогичным образом обработаны данные по числу случаев ОРИ, ВП и ^ОРИ. На заключительном этапе данные по заболеваемости и результаты вирусологического мониторинга сопоставлены по эпидемическим сезонам с выделением двух периодов: последние 16 недель текущего года («осенне-зимний подъем») и первые 16 недель следующего года («зимне-весенний подъем»).
Статистическая обработка включала расчет темпов прироста, доверительных интервалов (95% ДИ), коэффициента корреляции Спирмена и критерия хи-квадрат (х 2).
Результаты и обсуждение
Анализ заболеваемости по календарным годам
По данным Роспотребнадзора, три года до начала эпидемии COVID-19 характеризовались
постепенным ростом заболеваемости ОРИ и ВП. В 2019 г. зарегистрирована максимальная инцидентность ОРИ верхних дыхательных путей и ^ОРИ среди совокупного населения (табл. 1). В 2020 г., после начала распространения SARS-CoV-2, число случаев ОРИ сократилось на 25,7%, ^ОРИ - на 22,8% (примерно на 160 тыс. случаев), но число случаев ВП увеличилось на 83,2% (р < 0,001). Динамика заболеваемости в разных возрастных группах значительно различалась. При сравнении 2019 г. и 2020 г. отмечен прирост инцидентности ВП (+165,1%) и ОРИ (+18,9%) среди взрослых и одновременное снижение показателя среди детей (41,3% и 39,4% соответственно). Таким образом, резко изменилась возрастная структура заболеваемости. Так, например, доля детей в структуре заболеваемости ВП сократилась с 39,4% до 12,6% (р < 0,001), а доля взрослых возросла с 60,6% до 87,3% (р < 0,001). В 2019 г. отмечена самая высокая за последние годы заболеваемость гриппом. В 2020 г. COVID-19 в форме 2 отдельной строкой не учитывался, и случаи этой инфекции добавлялись либо к ВП, либо к ОРИ.
По данным регионального Минздрава (форма 12), в 2020 г. зарегистрировано 76 025 случаев COVID-19 (3179,4 на 100 тыс. населения), что составило 7% от ^ОРИ верхних и нижних дыхательных путей. В сравнении с 2019 г. общее число
Таблица 1. Динамика заболеваемости внебольничными пневмониями, ОРИ и гриппом в Иркутской области по годам и возрастным группам (по данным Роспотребнадзора)
Table 1. Dynamics of the incidence of community-acquired pneumonia, acute respiratory infections (АRIs) and influenza in the Irkutsk region by years and age groups (according to Rospotrebnadzor)
Болезни Diseases Возрастные группы Age groups Инцидентность по годам, на 10 тыс. (в скобках 95%ДИ) Incidence by year, per 100 ths (95% CI in brackets)
2017 2018 2019 2020
Внебольничные пневмонии community-acquired pneumonia до 17 лет up to 17 years old 793(770-816) 909(897-921) 1282 (1267-1297) 752 (741-763)
Взрослые adults 403(394-412) 475 (470-480) 628(622-634) 1665(1655-1675)
ОРИ acute respiratory infections до 17 лет up to 17 years old 82 040 (81939-82141) 73 234 (73 175-73 293) 89 741 (89 701-89 781) 54 356 (54 290-54 422)
Взрослые adults 6819 (6783-6855) 5764(5747-5781) 9057 (9036-9078) 10 768 (10 746-10 790)
Грипп influenza до 17 лет up to 17 years old 140 (130-150) 67(63-71) 286 (279-293) 163 (158-168)
взрослые adults 24 (22-26) 10 (9-11) 41 (40-42) 26(25-27)
Всего (1ОРИ) Total (ZARIs) до 17 лет up to 17 years old 82 965 (82 861-83 069) 70786 (70670-70902) 88 515 (88 434-88 596) 53 829 (53 703-53 957)
Взрослые adults 7245(7208-7282) 5982 (5948-6016) 9204(9163-9245) 11 984 (11 938-120 131)
Всего Total 24 785 (24 730-24 840) 21 190 (21139-21 241) 27 996 (27 941-28 051) 22 087 (22035-22 139)
Примечание: выделены ячейки с максимальной Note: the cells with the maximum incidence for the
инцидентностью за анализируемый период. analyzed period are highlighted.
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
случаев ОРИ возросло на 4,1%. По данным Центра гигиены и эпидемиологии в Иркутской области, отмечено значительное увеличение доли взрослых в структуре заболеваемости (рис. 1).
Анализ сезонной динамики заболеваемости
Сезонные колебания заболеваемости ОРИ и ВП проанализированы по оперативным данным Управления Роспотребнадзора по Иркутской области. Нарастание числа случаев, как обычно, наблюдалось с сентября-октября с максимумом во второй половине зимы и снижением, начиная с апреля-мая. На графиках хорошо заметно
сходство сезонной динамики заболеваемости ОРИ и пневмонией на протяжении ряда лет с резкой диспропорцией в конце 2020 г. (рис. 2, 3). Коэффициенты корреляции числа случаев по к.н. 2017-2019 гг. варьировались от 0,73 до 0,84 (р < 0,001), но в 2020 г. корреляционная связь менее выражена (г = 0,60, р < 0,001).
По осенне-зимним эпидемическим сезонам число зарегистрированных случаев ОРИ и ВП также увеличивалось до начала распространения COVID-19 (табл. 2). Прирост ^ОРИ в эпидемический сезон 2019-2020 гг. составил 3,4%, следовательно, снижение этого показателя в 2020 г. произошло
Рисунок 1. Изменение числа и доли (%) случаев 2ОРИ верхних и нижних дыхательных путей среди взрослых (18 лет и старше) и детей (0 - 17 лет) до и после начала регистрации COVID-19 по данным различных статистических форм
Figure 1. Change in the number and proportion (%) of cases of JflRIs of the upper and lower respiratory tract among adults (18 years and over) and children (0 - 17 years) before and after the start of COVID-19 registration according to various statistical forms
1200000
D С
CD rn ra О
ш
ra j>
о
о ^
о
1000000 800000 600000 400000
200000
■ 0-17 лет 0 -17 years 41,7% 58,3% Взрослые Adults
26,2%
73,8% 25,1 74,9%
41,2% 58,8%
2019 2020 форма 12, Министерство здравоохранения form 12, Minitry of Health 2019 2020 форма 2, Роспотребнадзор form 2, Rospotrebnadzor
Рисунок 2. Сезонные колебания числа случаев внебольничной пневмонии в Иркутской области в 2017-2020 гг. (по периодам в 4 недели; стрелкой указано начало выявления COVID-19)
Figure 2. Seasonal fluctuations in the number of cases of community-acquired pneumonia in the Irkutsk region in 20172020 (by periods of 4 weeks; the arrow indicates the start of COVID-19)
9000 -i 8000 7000 6000 5000
a
.Q
E с
a)
(Л
to О
I 4000
CÜ T
3000
о
° 2000
о
1000 -
I
I I I I I I I I I I I I -1\1С0^Ю50Г"-С0СПОт-С2
2017
I I I I I I I I I I I I
■CMCO-tflOCOh-.COOQT-ojtv
2018
I I I I I I I I I I I I
-OJCO-tflOCOh-COOQT-ojtv
2019
i i i i i i i i i i i i -OJCO-tflOCOh-COOQT-ojtv
2020
0
0
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Рисунок 3. Сезонные колебания числа случаев ОРИ верхних дыхательных путей в Иркутской области в 2017-2020 гг. (по периодам в 4 недели; стрелкой указано начало выявления COVID-19) Figure 3. Seasonal fluctuations in the number of cases of ARIs of upper respiratory tract in the Irkutsk region in 2017-2020 (by periods of 4 weeks; the arrow indicates the start of COVID-19)
120000
cd 100000 .Q
E
^ 80000
m to О
(P
to j>
о
о ^
о
60000
40000
20000
i i i i i I ГГП I I -CMCO-cMOCOh-COOOT-OJa
2017
TI I I I I I I I I I I -CMCO-cnOCOh-COOOT-OJa
2018
ГГГГГГГГГГП -OJCO-iMDCDh-COOOi-O^a
2019
I
ГГГГГГГГГГП -<^IC0зtЮC0h-70Cno■^-1NCy■
2020
за счет второй половины года. Более показательным оказался анализ по периодам в 16 недель в начале и конце каждого эпидемического сезона. В результате удалось продемонстрировать экстремально высокий прирост числа случаев ВП при одновременном снижении ОРИ в конце 2020 г. В начале этого года наблюдались противоположные тенденции. Значимый прирост ОРИ и ВП отмечался также в начале 2019 г. (табл. 2).
В среднем до начала эпидемии COVID-19 доля ВП в ^ОРИ по «половинкам» осенне-зимнего эпидемического сезона составляла 2,62% (95% ДИ 2,56 - 2,68). Превышение среднего значения отмечено трижды: в конце 2020 г. во время активного распространения COVID-19; в начале 2019 г. во время сезонной активизации гриппа и в осенне-зимний период 2019 г. (см. табл. 2). В последнем случае затяжной подъем заболеваемости ОРИ начался необычно рано, и этиология не была установлена (рис. 2, 3).
Число случаев ВП среди населения от 18 лет и старше резко возросло в последнем квартале 2020 г., но взрослые стали численно преобладать среди заболевших уже в феврале 2020 г. До этого в первые месяцы зимы 2019 - 2020 г., рост заболеваемости ОРИ происходил за счет детей и подростков (рис. 4). Таким образом, структура заболеваемости ОРИ по возрастным группам резко изменилась после начала эпидемии.
Результаты этиологического мониторинга
Различия в частоте положительных проб при исследовании на респираторные вирусы по годам в большинстве случаев статистически не значимы, но обращает на себя внимание увеличение
активности циркуляции коронавирусов человека (hCovs) за последние два года, в сравнении с 2017 и 2018 гг. (табл. 3). Сезонное распределение результатов этиологического мониторинга проанализировано выборочно. Наиболее значительное увеличение числа положительных находок hCovs наблюдалось в начале 2019 г. В 2020 г. hCovs определялись в пробах с частотой от 2,1 до 6,1% в месяц до лабораторного подтверждения первых случаев COVID-19 в Иркутской области в конце марта. В предшествовавшие два года частота положительных результатов лишь в отдельные месяцы превышала средний уровень (рис. 5). Исследования на hCovs не проводились с апреля 2020 г., так как все ресурсы были направлены на выявление нового коронавируса. Частота положительных результатов на SARS-CoV-2 в 2020 г., по данным лаборатории регионального Центра гигиены и эпидемиологии, составила 17,6%. За последние 16 недель 2020 г., при исследовании 145 проб обнаруживались только SARS-CoV-2 и риновирусы.
Оживление циркуляции вирусов гриппа наблюдалось в начале каждого года, но в первые месяцы 2019 г. процент положительных проб значительно увеличился, что согласуется со статистикой заболеваемости. В аналогичный период 2020 г. вирусы гриппа выявлялись намного реже (рис. 6).
Риновирусы обнаруживались чаще, чем другие респираторные вирусы, с увеличением частоты положительных находок в конце лета и осенью. Меньше всего положительных проб регистрировали в конце зимы - начале весны. Осенью и до конца 2020 г., уже после начала эпидемии COVID-19, риновирусы обнаруживались в пробах с частотой выше среднего уровня (рис. 7).
0
Таблица 2. Заболеваемость ОРИ, внебольничными пневмониями (ВП) и частота обнаружения некоторых респираторных вирусов в биоматериале от больных ОРИ по эпидемическим сезонам (2017-2020 гг.) Table 2. The incidence of acute respiratory infections (ARIs), community-acquired pneumonia (CAP) and the frequency of detection of certain respiratory viruses in biomaterial from patients with acute respiratory infections by epidemic seasons (2017-2020)
Эпидемические сезоны Epidemic seasons Всего случаев ОРЗ и ВП за сезон Total cases per season Календарные недели, годы Calendar weeks, years Число случаев (в скобках темп прироста,%) Calendar weeks, years (growth rate in brackets,%) Доля ВП в столбце «всего» (%, 95% ДИ) Share of CAP in the «total» column (%, 95% CI) Частота положительных проб на вирусы (%, 95% ДИ) Virus positive rate (%, 95% CI)
ОРИ ORIs ВП CAP Всего Total корона-вирусы corona-viruses вирусы гриппа viruses influenza аденовирусы adeno-viruses рино-вирусы rhino-viruses
20172018 464 964 37-53, 2017 225 970 4166 230 136 1,81 (1,791,83) 0,2 (0,1-0,3) 0 1,3 (1,0-1,6) 17,0 (13,620,4)
1-16, 2018 228 934 (+1,3) 5894 (+41,5) 234 828 (+2,0) 2,51 (2,492,53) 0,8 (0,760,84) 3,4 (3,0-3,8) 0,2 (0,160,24) 5,0 (4,65,4)
20182019 502 813 37-52, 2018 216957 (-5,2) 5615 (-4,7) 222 572 (-5,2) 2,52 (2,502,54) 0,51 (0,470,55) 0,17 (0,140,20) 0,86 (0,830,89) 19,0 (15,822,2)
1-16, 2019 272 307 (+25,5) 7934 (+41,3) 280 241 (+25,9) 2,83 (2,812,85) 5,2 (4,8-5,6) 33,7 (30,237,2) 0,57 (0,530,61) 8,5 (8,2-8,8)
20192020 520 118 37-52, 2019 228 369 (-16,1) 8129 (+2,5) 236 498 (-15,6) 3,44 (3,423,46) 0,85 (0,830,87) 0,48 (0,450,51) 1,6 (1,3-1,9) 13,9 (11,516,3)
1-16, 2020 276 205 (+20,9) 7415 (-8,8) 283 620 (+19,1) 2,61 (2,592,63) 3,7 (3,2-4,2) 3,7 (3,2-4,2) 0,3 (0,2-0,4) 6,4 (5,9-6,9)
Эпидемия COVID-19 Epidemic COVID-19 37-52, 2020 251 909 (-8,8) 22 141 (+198,6) 274 050 (-3,4) 8,08 (8,078,09) 0* 0 0 20 (13,526,5)
Примечание: выделены по три первых ранговых места в столбцах; *нет положительных результатов на hCoV; частота обнаружения SARS-CoV-2 - 17,6%
Note: the first three ranking places are highlighted in the columns; *no positive results on hCoV; SARS-CoV-2 detection rate - 17.6%
Периоды с более высокой заболеваемостью ОРИ в 2019-2020 гг. совпадают с увеличением частоты положительных проб на вирусы гриппа и hCovs при визуальной оценке таблицы сопряженности (см. табл. 2). Последние 16 недель 2020 г. не включены в статистическую обработку из-за отсутствия равноценных данных вирусологического мониторинга (исследовано проб в 3-5 раз меньше обычного). Значимое соответствие между частотой обнаружения отдельных вирусов и долей ВП в сумме всех ОРИ установлено только для вирусов гриппа (х2 = 26,2, р < 0,01). Для остальных вирусов связь статически не достоверна (р > 0,05), но более выражена для hCovs (х2 = 8,7), чем для аденовирусов (х2 = 1,5) и риновирусов (х2 = 3,8) при критическом значении х2 = 11,7 при р < 0,05. Степень соответствия при включении в анализ
одновременно вирусов гриппа и hCovs повысилась (X2 = 30,4, р < 0,01).
Одной из основных целей внедрения в практику мониторинга гриппа, ОРИ и пневмоний было прогнозирование и своевременное выявление новых патогенов, представляющих эпидемическую опасность. Рутинный и сигнальный мониторинг проводился в масштабах всей страны сетью опорных баз и НИИ [24,25]. В данном исследовании представлен ретроспективный анализ мониторинга в регионе с интенсивными трансграничными перемещениями. В январе - феврале 2020 г. Иркутскую область посетило более 36 тыс. туристов из Китая, в последний год перед началом пандемии COVID-19 число иностранных туристов увеличилось до 1,6 млн, из них 60% составляли граждане Китая [26].
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Рисунок 4. Динамика случаев ВП среди детей и взрослых в Иркутской области в 2019 - 2020 гг. (по периодам в 4 недели). Стрелкой показано время выявления первых случаев COVID-19
Figure 4. Dynamics CAP cases among children and adults in the Irkutsk region in 2019 - 2020 (for periods of 4 weeks). The arrow shows the time when the first cases of COVID-19 were detected.
0-17 лет 0-17 years
18 лет и старше 18 years and older
ф tn
CO
О
m
ф
со
х >
о
о ^
о
8000 -, 7000 -6000 -5000 -4000 -3000 -2000 -1000 -0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 2019
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 2020
Таблица 3. Результаты выявления респираторных вирусов в Иркутской области в 2017 - 2020 гг. Table 3. Results of respiratory viruses detection in the Irkutsk region in 2017-2020
Вирусы Viruses Частота положительных проб по годам в % (в скобках 95% ДИ) The frequency of positive samples by years in % (in brackets 95% CI)
2017 2018 2019 2020
Вирусы гриппа (Influenza virus A, Influenza virus B) 5,0 (4,2 - 5,8) 1,4(1,0 - 1,8) 4,5 (3,9 - 5,1) 4,0 (3,1 - 4,9)
Вирусы парагриппа (1,2,3,4 типы) (human Parainfluenza virus-1-4-Piv) 0,7 (0,5 - 0,9) 0,6 (0,4 - 0,8) 0,8 (0,6 - 1,0) 0,7 (0,4 - 1,0)
Респираторно-синцитиальный вирус (human Respiratory Syncytial virus-hRSv) 10,8 (9,0 - 12,6) 6,6 (5,3 - 7,9) 5,8 (4,7 - 6,9) 7,6 (5,7 - 9,5)
Аденовирусы групп В,С и Е (human Adenovirus-hAdv) 0,9 (0,4 - 1,3) 0,4 (0,1 - 0,7) 0,5 (0,2 - 0,8) 0,3 (0 - 0,7)
Коронавирусы ОС43, Е229, NL63, HKUI (human Coronavirus-hCov) 0,7 (0,3 - 1,1) 0,9 (0,4 - 1,3) 2,3 (1,6 - 3,0) 2,1 (1,2 - 3,0)
Метапневмовирусы (human Metapneumovirus-hMpv) 0,8 (0,3 - 1,3) 0,1 (0 - 0,3) 0,9 (0,5 - 1,3) 0,3 (0 - 0,7)
Риновирусы (human Rhinovirus-hRv) 14,0 (12,1 - 15,9) 14,9 (13,1 - 16,7) 13,2 (11,7-14,7) 17,1 (14,4 - 19,7)
Бокавирус (human Bocavirus-hBov) 0,3 (0 - 0,6) 1,3 (0,7 - 1,9) 1,3 (0,8-1,8) 1,5 (0,7 - 2,3)
Примечание: выделены максимальные показатели в строках Notes: The maximum indicators in the rows are highlighted
Особое внимание уделено ВП, как наиболее тяжелой клинической форме ОРИ.
Прототипом исследования послужил комплексный анализ заболеваемости ОРИ и результатов этиологического мониторинга для характеристики эпидемий гриппа в РФ в 2017 - 2018 гг. [27]. В работе использовали группировку данных еженедельного мониторинга по периодам в 4 и 16 недель, что позволило улучшить наглядность
графических материалов и возможности статистической обработки.
В 2020 г. в условиях кризисной эпидемической ситуации возникли межведомственные затруднения в передаче информации, в результате чего в статистических формах Минздрава зарегистрировано почти в два раза больше случаев ОРИ верхних и нижних дыхательных путей, чем в отчетах Роспотребнадзора и его структурных
Рисунок 5. Процент положительных проб на коронавирусы человека (hCov) по периодам в 4 недели в 2017-2020 гг.
Figure 5. Percentage of positive samples for human coronaviruses (hCov) by 4-week periods for2017 - 2020.
Примечание: среднее арифметическое - 1,2% (0,3 - 2,1), в скобках и пунктиром указаны 95% ДИ. Note: the mean value is 1.2% (0.3 - 2.1), CI 95% are indicated in brackets and dotted lines.
Рисунок 6. Процент положительных проб на вирусы гриппа по периодам в 4 недели за 2017 - 2020 гг. Figure 6. Percentage of positive samples influenza virus by 4-week period, 2017 - 2020.
60
ю
0
CL 1= X -0
1 -0
w
CD
та cc с w о
(Б
Q_
50
40
30
20
10
k
i i i i i i i i i i i -iNco^mcoh-cocnoi-iNc:
2017
I I I I I I I I I I I I
2018
i i i i i i i i i i -смсо-^юаэь-сооот-ола:
2019
Ф
I I I I I I I I I I I I -С\1С0^ЮС0Ь-С0СПОт-12
2020
Примечание: среднее значение - 4% (2,7- 5,3), в скобках и пунктиром указаны 95% ДИ. Note: the mean value is 4% (2.7 - 5.3), 95% CI are indicated in brackets and dotted lines
подразделений. До начала пандемии COVID-19 показатели разных ведомств в регионе совпадали на 88% [28]. Имеются также различия в перечне нозологий, подлежащих учету. Несмотря на эти расхождения, очевидно, что существенного роста заболеваемости ^ОРИ в результате распространения СOVID-19 в регионе не зарегистрировано. Это означает, что другие ОРИ
верхних дыхательных путей стали регистрироваться реже, чем до эпидемии.
Распределение заболеваемости во времени и по возрастным группам анализировали по оперативным формам Роспотребнадзора, которые разработаны более детально. Сезонная динамика заболеваемости ОРИ в 2020 г. в общих чертах осталась прежней. Первые случаи COVID-19 выявлены
0
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Рисунок 7. Процент положительных проб на риновирусы по периодам в 4 недели за 2017 - 2020 гг. Figure 7. Percentage of positive samples for rhinoviruses by periods of 4 weeks for 2017 - 2020.
% положительных проб Percentage of positive samples 11223344 ОСЛОСЛОСЛОСЛОСЛ
,1 1 111 ,1,1, ll
T-CNCO^mCOh-COCnoT-CNCO 2017 i-cNco^mcoh-cocnoT-cNc: 2018 T-CNCO^mCOh-COCnoT-CNO' 2019 Зт-С^СО^ЮСОЬ-СОСПОт-СЧ!? 2020
Примечание: среднее значение - 14% (5 - 23), в скобках и пунктиром указаны 95% ДИ. Note: the mean value is 14% (5 - 23), 95% CI are indicated in brackets and dotted lines
на фоне сезонного снижения заболеваемости ОРИ что частично объясняет низкие темпы распространения новой коронавирусной инфекции на этом отрезке времени. Обращает на себя внимание необычно низкий уровень заболеваемости ОРЗ верхних дыхательных путей летом 2020 г., связанный, по-видимому, с введением масочного режима и ограничительных мероприятий. Сезонный подъем ОРИ, как обычно, стартовал с осени, но отличался значительным ростом заболеваемости ВП в последние месяцы года (см. рис. 2, 3).
Существующая система сбора данных позволила зафиксировать качественные изменения в распространении ОРИ и ВП в первом «ковид-ном» году. Известно, что прирост заболеваемости тяжелыми острыми респираторными инфекциями (ТОРИ) считается важным сигнальным признаком ухудшения эпидемиологической ситуации [24,25]. За последние 16 недель 2020 г. отмечено увеличение доли ВП в ^ОРИ среди совокупного населения до 8,08%, что совпало со «второй волной» новой коронавирусной инфекции в Иркутской области [22]. Ретроспективно выявлено еще два периода статистически значимого увеличения доли ВП в структуре ОРИ (см. табл. 2). В начале 2019 г. это произошло во время подъема заболеваемости гриппом, а в конце этого же года этиологический агент, ответственный за ТОРИ, точно установить не удалось.
Другой сигнальный признак изменения эпидемиологической ситуации - деформация возрастной структуры заболеваемости ОРИ [25]. В 2020 г. случаи ВП среди взрослых в Иркутской
области стали регистрироваться чаще, чем среди детей, и их число достигло максимума в конце года. Соотношение показателей заболеваемости ОРИ верхних дыхательных путей также изменилось в пользу взрослых, хотя и в меньшей степени (см. табл. 1, рис. 4). При этом ситуация в конце 2019 г. и в начале 2020 г. качественно различалась. В последние месяцы 2019 г. отмечено увеличение доли ВП в структуре ОРИ, преимущественно за счет взрослых, а в I квартале 2020 г. наблюдался подъем ОРИ верхних дыхательных путей, преимущественно среди детей и подростков.
К сожалению, результаты этиологического мониторинга не позволяют сделать однозначных выводов о доминирующем возбудителе ОРИ в осенне-зимний сезон 2019 - 2020 гг. Имеется возможность исключить грипп, активизация которого отмечена годом раньше. Повышенная активность hCovs зарегистрирована в начале 2019 г. и прослеживалась до начала эпидемии COVID-19. Участие hCovs в формировании сезонной заболеваемости ОРИ давно известно. По результатам исследований, выполненных в Китае в 2012 г., различные hCovs (чаще всего - 229Е и НКи1) обнаруживались с частотой до 16% у пациентов ОРИ, при этом у 35% из них отмечена коинфекция с вирусом гриппа и риновирусами [29]. По данным мониторинга ОРВИ, в РФ в эпидемический по гриппу сезон 2017-2018 гг. частота положительных проб на hCovs составила 1,6% [27]. Величина этого показателя в разных регионах и во времени может заметно различаться. Например, в Санкт-Петербурге в эпидемический сезон 2018-2019 гг.
hCovs обнаруживались в среднем в 6% проб [2]. Известно, что hCovs способны индуцировать специфический иммунный ответ в отношении нового коронавируса [16,18,19]. Группоспецифические антитела и Т-клетки, реагирующие с SARS-Cov2, обнаружены в пробах крови и материнского молока, собранных до начала пандемии в разных регионах мира [16,17,19]. Таким образом, активная циркуляция hCovs в Иркутской области в предшествующие два года могла способствовать замедлению распространения в ообласти новой коронавирус-ной инфекции в начале эпидемии.
Прямые подтверждения циркуляции SARS-Cov2 в Иркутской области ранее 27 марта отсутствуют, но доля взрослых в возрастной структуре ВП начала увеличиваться с февраля 2020 г. (см. рис. 4). В это время первые случаи COVID-19 уже были выявлены в других регионах Сибири [20,21]. Не исключено, что спорадические заболевания новой коронавирусной инфекции в Иркутской области могли иметь место до первых положительных тестов на SARS-CoV-2. Такое предположение не противоречит данным о постепенном нарастании количества позитивных тестов на SARS-CoV-2 и антитела к нему, начиная с низких значений [21,22]. С другой стороны, подъем заболеваемости ОРИ и ВП в Иркутской заболеваемости в середине зимы 2019 - 2020 гг., по-видимому, не был связан с COVID-19, судя по степени вовлечения детского населения и доле ВП в структуре ОРИ на пике эпидемического сезона 2019-2020 гг. (см. рис. 4). Таким образом, предположение о возможном распространении в Иркутской области SARS-CoV-2 до 2020 г. не подтверждается при эпидемиологическом анализе заболеваемости.
Риновирусы выявлялись в 2020 г. у пациентов с ОРИ, как и в предшествующие годы. На протяжении нескольких лет прослеживалась сходная сезонная динамика со снижением активности циркуляции риновирусов в феврале-марте, когда заболеваемость ОРИ сохранялась на высоком уровне (см. рис. 7). Предполагалось, что снижение частоты положительных проб на риновирусы в периоды активизации сезонного гриппа обусловлено конкурентными отношениями этих возбудителей [27]. Конкуренция SARS-CoV-2 с риновирусами, по-видимому, не имеет существенного значения, так
как в конце 2020 г. на фоне эпидемического распространения нового коронавируса в Иркутской области риновирусы обнаруживались даже чаще, чем в аналогичный период 2019 г. Коинфекция SARS-CoV-2 и риновирусов продемонстрирована в ряде исследований [10,11,14].
Ограничения в интерпретации полученных результатов возможны из-за изменения обращаемости населения за медицинской помощью и корректировки системы диагностики и регистрации ОРИ в начальный период эпидемии новой коронавирусной инфекции. Это могло отразиться на статистике заболеваемости в 2020 г. Однако наблюдаемые изменения возрастной структуры и соотношения клинических форм ОРИ в 2020 г. согласуются с накопленными научными данными о COVID-19. Кроме того, с середины 2020 г., в связи с организацией массового тестирования на новую коронавирусную инфекцию, на несколько месяцев нарушилась привычная система этиологического мониторинга ОРВИ, что не позволило полноценно использовать данные за последний квартал этого года. Возможно, именно с этим связаны сравнительно низкие показатели выявления большинства вирусов в 2020 г.
Заключение
В 2020 г. число зарегистрированных случаев COVID-19 не превышало 10% от ^ОРИ. Несмотря на это, показатели заболеваемости ОРИ качественно изменились. Возросли инцидентность и доля ВП в структуре заболеваемости ОРИ совокупного населения. ВП и ОРИ верхних дыхательных путей стали чаще регистрироваться среди взрослых. Менее выраженные подъемы заболеваемости ВП зарегистрированы в начале 2019 г. (в связи с гриппом) и в конце этого же года (этиология не установлена).
Вирусологический мониторинг выявил повышение активности hCovs с начала 2019 г. Предполагается, что это могло способствовать медленному распространению SARS-CoV-2 в начале эпидемии. Эпидемиологический анализ результатов мониторинга не подтверждает гипотезу о возможном распространении в Иркутской области SARS-CoV-2 ранее 2020 г. Результаты исследования предлагается использовать для дальнейшего совершенствования мониторинга ОРИ.
Литература
1. Салтыкова Т. С, Жигарловский Б. А, Иваненко А. В. и др. Эпидемиологическая характеристика острых респираторных вирусных инфекций и гриппа на территории Российской Федерации и г. Москвы. Журнал инфектологии. 2019. Т. 11, № 2. С. 124-132.
2. Гужов Д. А, Елпаева Е. А, Егорова М. А. и др. Эпидемиологические и клинические характеристики острых респираторных инфекций в Санкт-Петербурге в эпидемические сезоны 2017-2018 гг. и 2018-2019 гг. Журнал инфектологии. 2020. Т. 12, № 4. С. 65-71.
3. Салтыкова Т. С., Жигарловский Б. А, Брико Н. И. и др. Эпидемиологические параллели внебольничных пневмоний, гриппа и ОРВИ в г. Москве. Туберкулез и болезни легких. 2020. Т. 98, № 3. С. 6-12.
4. Кутырев В. В., Попова А. Ю., Смоленский В. Ю. и др. Эпидемиологические особенности новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Сообщение 2: особенности течения эпидемического процесса COVID-19 во взаимосвязи с проводимыми противоэпидемическими мероприятиями в мире и Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 2. С. 6-12.
5. Даты, цифры, события: Хроника COVID-19 в 2020 году. Доступно на: https://tsargrad.tv/news/daty-cifry-sobytija-hronika-covid-19-v-2020-godu_310936 Ссылка активна на 23.12.2021.
6. Chotpitayasunondh T., Fischer T.K., Heraud J.M., et al. Influenza and COVID-19: What does co-existence mean? Influenza Other Respir Viruses. 2021. Vol. 15. № 3. P. 407-412.
7. Шкарин В. В., Ковалишена О. В. Новая эра в эволюции инфекционной патологии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2018. №. 4. С. 6-16.
8. Шкарин В. В., Ковалишена О. В., Чанышева Р. Ф. и др. Клинико-эпидемиологические особенности новыхполиэтиологичных вирусных инфекций. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2018;17(4):4-12.
9. Яковлев А. А., Раков А. В., Поздеева Е. С. Значение межвидовых и внутривидовых взаимодействий микроорганизмов как суборганизменного уровня в иерархии эпидемического процесса. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2020. № 25. С. 118-130.
10. Молочков А. В., Каратеев Д. Е, Огнева Е. Ю. и др. Коморбидные заболевания и прогнозирование исхода COVID-19: результаты наблюдения 13 585 больных, находившихся на стационарном лечении в больницах Московской области. Альманах клинической медицины. 2020. Т. 48, № 1. С. 1-10.
11. Zhu X., Ge Y, Wu T, et al. Co-infection with respiratory pathogens among C0VID-2019 cases. Virus Res. 2020Aug; 285. e198005.
12. Cheng Y, Ma J., Wang H., et al. Co-infection of influenza A virus and SARS-CoV-2: A retrospective cohort study. J Med Virol. 2021. Vol. 93. № 5. P. 2947-2954.
13. Lai C.C., Wang C.Y., Hsueh P.R. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect. 2020. Vol.53. № 4. P. 505-512.
14. Boschiero M.N., Duarte A, Palamim C.V.C., et al. Frequency of respiratory pathogens other than SARS-CoV-2 detected during COVID-19 testing. Diagn Microbiol Infect Dis. 2021 Vol. 102. № 2. P.:115576.
15. Reche P.A. Potential cross-reactive immunity to SARS-CoV-2 from common human pathogens and vaccines. Front Immunol. 2020. Vol. 6. № 11. e586984.
16. Egwang T.G., Owalla T.J., Okurut E., et al. Differential pre-pandemic breast milk IgA reactivity against SARS-CoV-2 and circulating human coronaviruses in Ugandan and American mothers //Int J Infect Dis. 2021. Vol. 112. P. 165-172.
17. Ravindran R., McReynolds C., Yang J., et al. Immune response dynamics in COVID-19 patients to SARS-CoV-2 and other human coronaviruses. PLoS One. 2021. Vol. 16. № 7. e0254367.
18. Mateus J., Grifoni A., Tarke A, et al. Selective and cross-reactive SARS-CoV-2 T cell epitopes in unexposed humans. Science. 2020. Vol. 370. №. 6512. P. 89-94.
19. Lee C.H., Pinho M.P., Buckley P.R., et al. Potential CD8+ T cell cross-reactivity against SARS-CoV-2 conferred by other coronavirus strains. Front Immunol. 2020. Vol. 11. e579480.
20. Попова А. Ю., Ежлова Е. Б., Мельникова А. А. и др. Опыт исследования серопревалентности к вирусу SARS-CoV-2 населения Иркутской области в период вспышки COVID-19. Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 3. С. 106-113.
21. Балахонов С. В., Чеснокова М. В., Пережогин А. Н. и др. Эпидемиологическаяситуация по COVID-19 в Иркутской области и прогноз ее распространения. Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 4. С. 34-40.
22. Балахонов С. В., Дубровина В. И., Пятидесятникова А. Б. и др. Динамика изменений популяционного иммунитета к вирусу SARS-CоV-2 у жителей Иркутской области в условиях пандемии COVID-19. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2021;20(2): 12-17.
23. Кравченко Н. А., Гаврилова Т. А., Хакимова М. И. и др. Опыт сравнительного анализа заболеваемости пневмониями и острыми респираторными инфекциями верхних дыхательных путей после внедрения системы эпидемиологического мониторинга пневмоний. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2019;18(1):96-104.
24. Онищенко Г. Г., Ежлова Е. Б., Демина Ю. В. Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями как одно из направлений биологической безопасности. Проблемы особо опасных инфекций. 2013. № 4. С. 24-27.
25. Соминина А. А., Смородинцева Е. А., Столяров К. А. и др. Совершенствование системы надзора за гриппом в Российской Федерации: основные результаты сигнального надзора за гриппом и другими острыми респираторными вирусными инфекциями. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2017;16(1):7-15.
26. Проект: Россия-Китай. Доступно на: https://ria.ru/20190320/1551946864.html. Ссылка активна на 01.02.2022 г.
27. Соминина А. А., Даниленко Д. М., Комиссаров А. Б. и др. Результаты молекулярной детекции и характеристика вирусов гриппа и других возбудителей респираторных инфекций в России, сезон 2017-2018 гг. Инфекция и иммунитет. 2018. Т. 8, № 4. С. 473-488.
28. Кравченко Н. А., Гаврилова Т. А., Васильева Е. И. и др. Результаты внедрения системы эпидемиологического мониторинга пневмоний на региональном уровне (по материалам Иркутской области). Тихоокеанский медицинский журнал. 2018. Т. 3. №73. С. 42-46.
29. Lu R., Yu X., Wang W., et al. Characterization of human coronavirus etiology in Chinese adults with acute upper respiratory tract infection by real-time RT-PCR assays. PLoS ONE. 2012. Vol. 7. № 6. e38638.
References
1. Saltykova TS, Zhigarlovsky BA, Ivanenko AV, et al. Epidemiological characteristics of acute respiratory viral infections and influenza in the Russian Federation and Moscow. Journal of Infectology. 2019;11(2):124 - 132 (In Russ.). doi: 10.22625/2072-6732-2019-11-2-124-132
2. Guzhov DA, Elpaeva EA, Egorova MA, et al. Epidemiological and clinical characteristics of acute respiratory infections in St. Petersburg during the epidemic seasons of 2017-2018 and2018-2019. Journal of Infectology. 2020;12 (4):65-71(In Russ.). doi:10.22625/2072-6732-2020-12-4-65-71
3. Saltykova TS, Zhigarlovsky BA, Briko NI, et al. Epidemiological parallels of community-acquired pneumonia, influenza and SARS in Moscow. Tuberculosis and lung diseases. 2020; 98(3):6-12 (In Russ.). doi: 10.21292/2075-1230-2020-98-3-6-12
4. Kutyrev VV., Popova A.Yu., Smolensky Vyu, et al. Epidemiological features of a new coronavirus infection (COVID-19). Message 2: features of the course of the COVID-19 epidemic process in conjunction with ongoing anti-epidemic measures in the world and the Russian Federation. Problems of especially dangerous infections. 2020; 2:6-12 (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2020-2-6-12
5. Dates, numbers, events: Chronicle of COVID-19 in 2020. Available at: https://tsargrad.tv/news/daty-cifry-sobytija-hronika-covid-19-v-2020-godu_310936. Accessed: 23.12.2021 (In Russ.).
6. Chotpitayasunondh T., Fischer T.K., Heraud J.M., et al. Influenza and COVID-19: What does co-existence mean? Influenza Other Respir Viruses. 2021. Vol.15. №3. P. 407-412.
doi:10.1111/irv.12824
7. Shkarin VV, Kovalishena OV. New era in the evolution of infectious pathology. Epidemiology and infectious diseases. Topical issues. 2018; 4:6-16 (In Russ.). doi: 10.18565/ epidem.2018.4.6-16
8. Shkarin VV, Kovalishena OV, Chanysheva RF, et al. Clinical and epidemiological features of new polyetiological viral infections. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2018;17(4):4-12 (In Russ.). doi: 10.31631/2073-3046-2018-17-4-4-12
9. Yakovlev AA, Rakov AV, Pozdeeva ES. The significance of interspecific and intraspecific interactions of microorganisms as a suborganismal level in the hierarchy of the epidemic process. Epidemiology and infectious diseases. 2020;25:118-130 (In Russ.). doi: 10.17816/EID.253
10. Molochkov AV, Karateev DE, Ogneva EYu, et al. Comorbid diseases and predicting the outcome of COVID-19: results of observation of 13585 patients who were hospitalized in hospitals of the Moscow region. Almanac of Clinical Medicine. 2020;48(1):1-10. (In Russ.). doi: 10.18786/2072-0505-2020-48-040
11. Zhu X, Ge Y, Wu T, et al. Co-infection with respiratory pathogens among COVID-2019 cases. Virus Res. 2020Aug;285:198005. doi: 10.1016/j.virusres.2020.198005
12. Cheng Y, Ma J, Wang H, et al. Co-infection of influenza A virus and SARS-CoV-2: A retrospective cohort study. J Med Virol. 2021 May;93(5):2947-2954. doi: 10.1002/jmv.26817
13. Lai C.C., Wang C.Y., Hsueh P.R. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect. 2020Aug;53(4):505-512. doi: 10.1016/j.jmii.2020.05.013.
14. Boschiero MN, Duarte A, Palamim CVC, et al. Frequency of respiratory pathogens other than SARS-CoV-2 detected during COVID-19 testing. Influenza Other Respir Viruses. 2021 May;15(3):407-412. doi: 10.1111/irv. 12824
15. Reche PA Potential cross-reactive immunity to SARS-CoV-2 from common human pathogens and vaccines. Front Immunol. 2020 Oct 16; 11:586984. doi: 10.3389/fim-mu.2020.586984
16. Egwang TG, Owalla TJ, Okurut E, et al. Differential pre-pandemic breast milk IgA reactivity against SARS-CoV-2 and circulating human coronaviruses in Ugandan and American mothers. Int J Infect Dis. 2021 Nov;112:165-172. doi: 10.1016/j.ijid.2021.09.039
17. Ravindran R, McReynolds C, Yang J, et al. Immune response dynamics in COVID-19 patients to SARS-CoV-2 and other human coronaviruses. PLoS One. 2021 Jul 9;16(7):e0254367. doi: 10.1371/journal.pone.0254367
18. Mateus J, Grifoni A, Tarke A, et al. Selective and cross-reactive SARS-CoV-2 T cell epitopes in unexposed humans. Science. 2020 Oct 2;370(6512):89-94. doi: 10.1126/science. abd3871
19. Lee CH, Pinho MP, Buckley PR, et al. Potential CD8+ T cell cross-reactivity against SARS-CoV-2 conferred by other coronavirus strains. Front Immunol. 2020 Nov 5;11:579480. doi: 10.3389/fimmu.2020.579480
20. Popova AYu, Ezhlova EB, Melnikova AA, et al. Experience in Studying Seroprevalence to SARS-CoV-2 Virus in the Population of the Irkutsk Region during COVID-19 Outbreak. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020; (3):106-113 (In Russ.) doi: 10.21055/0370-1069-2020-3-106-113
21. Balakhonov SV, Chesnokova MV, Perezhogin AN, et al. The epidemiological situation of COVID-19 in the Irkutsk region and the forecast of its spread. Problems of especially dangerous infections. 2020; 4:34-40 (In Russ.). doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-34-40
22. Balakhonov SV, Dubrovina VI, Pyatidesyatnikova AB, et al. Dynamics of changes in population immunity to the SARS-CoV-2 virus in residents of the Irkutsk region during the COVID-19 pandemic. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2021;20(2):12-17 (In Russ.). doi:10.31631/2073-3046-2021-20-2-12-17
23. Kravchenko NA, Gavrilova TA, Khakimova MI, et al. Comparative analysis of the incidence of pneumonia and acute respiratory infections of the upper respiratory tract after the introduction of a system of epidemiological monitoring of pneumonia. Epidemiology and vaccination. 2019;18(1):96-104 (In Russ.). doi: 10.31631/2073-3046-2019-181-96-109
24. Onishchenko GG, Ezhlova EB, Demina YuV. Epidemiological surveillance of community-acquired pneumonia as one of the areas of biological safety. Problems of especially dangerous infections. 2013; 4:24-27 (In Russ.).
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
25. Sominina AA, Smorodintseva EA, Stolyarov KA, et al. Improving the influenza surveillance system in the Russian Federation: the main results of signaling surveillance for influenza and other acute respiratory viral infections. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 20I7;I6(I):7-I5 (In Russ.). https://doi.org/l0.3l63l/2073-3046-20l7-l6-l-7-15
26. Project: Russia-China. Available at: https://ria.ru/20l90320/l55l946864.html. Access date 0l.02.2022 (In Russ.).
27. Sominina AA, Danilenko DM, Komissarov A B, et al. Results of molecular detection and characterization of influenza viruses and other pathogens of respiratory infections in Russia, season 20l7-20l8. Infection and immunity. 20l8;8(4):473-488 (In Russ.). doi: l0.l5789/2220-76l9-20l8-4-473-488
28. Kravchenko NA, Gavrilova TA, Vasilieva EI, et al. The results of the introduction of the system of epidemiological monitoring of pneumonia at the regional level (based on the materials of the Irkutsk region). Pacific Medical Journal. 20l8;3(73):42-46 (In Russ). doi: l0.l7238/PmJl609-ll75.20l8.3.42-46
29. Lu R, Yu X, Wang W, et al. Characterization of human coronavirus etiology in chinese adults with acute upper respiratory tract infection by real-time RT-PCR Assays. PLoS ONE,20l2. 7(6):e38638. doi:l0.l37l/journal.pone.0038638
Об авторах
About the Authors
• Наталья Александровна Кравченко - ассистент кафедры эпидемиологии, ФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава России. +7 (983) 401-36-86, tasha_v_gorode@mail.ru. ОРСЮ: http://orcid.org/0000-0001-9839-6629.
• Вера Борисовна Казанова - заведующая отделением вирусологических исследований с ПЦР-лабораторией, ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии по Иркутской области», +7 (3952) 22-82-04, epid@sesoirk.irkutsk. ш. ОРСЮ: http://orcid.org/ 0000-0001-7096-0136.
• Марьяна Ивановна Хакимова - заведующая эпидемиологическим отделом, ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии по Иркутской области», +7 (3952) 22-82 04, epid@sesoirk.irkutsk.ru. ОРСЮ: http://orcid.org/0000-0002-2674-3242.
• Татьяна Анатольевна Гаврилова - зам. начальника эпидемиологического отдела Министерства здравоохранения Иркутской области. +7 (902) 170-27-64, gtairkutsk@yandex.ru. ОРСЮ: http://orcid.org/0000-0001-9212-6134.
• Зоя Александровна Зайкова - доцент кафедры общей гигиены, ФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава России. +7 (3952) 240778, zaikovazoya@mail.ru. ОРСЮ: http://orcid. org/0000-0001-8104-4264.
• Александр Дмитриевич Ботвинкин - д. м. н., профессор, заведующий кафедрой эпидемиологии, ФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава России. +7 (914) 941-89-40, Ью^^^ ismu@mail.ru. ОРСЮ: http://orcid.org/0000-0002-1324-7374.
Поступила: 02.03.2022. Принята к печати: 09.05.2022.
Контент доступен под лицензией СС ВУ 4.0.
• Natalya A. Kravchenko - assistant of the Epidemiology Department, Irkutsk State Medical University, Russia. +7 (983) 401-36-86, tasha_v_gorode@mail.ru. ORCID: http://orcid.org/0000-0001-9839-6629.
• Vera B. Kazanova - Head of Virology Department with PCR-laboratory, Center for epidemiology and hygiene, Irkutsk. +7 (3952) 22-82-04, epid@sesoirk. irkutsk.ru. ORCID: http://orcid.org/ 0000-0001-7096-0136.
• Maryana I. Khakimova - Head of the Epidemiology Department, Center for epidemiology and hygiene, Irkutsk. +7 (3952) 22-82-04, epid@sesoirk.ir-kutsk.ru. ORCID: http://orcid.org/0000-0002-2674-3242.
• Tatiana A. Gavrilova - Head of the Epidemiology Department, Ministry of Health of the Irkutsk Region. +7 902 1702764, gtairkutsk@yandex.ru. ORCID: http://orcid.org/0000-0001-9212-6134.
• Zoya A. Zaikova - assistent profesor of the Department General Hygiene Irkutsk State Medical University. +7 (3952) 24-07-78, zaikovazoya@mail.ru. ORCID: http://orcid.org/0000-0001-8104-4264.
• Alexander D. Botvinkin - Dr. Sci. (Med.), professor, Head of the Epidemiology Department, Irkutsk State Medical University. +7 (914) 941-89-40, bot-vinkin_ismu@mail.ru. ORCID: http://orcid.org/0000-0002-1324-7374.
Received: 02.03.2022. Accepted: 09.05.2022.
Creative Commons Attribution CC BY 4.0.
ИНФОРМАЦИЯ МИНЗДРАВА РОССИИ
Состоялось заседание I Национального экспертного совета по вопросам элиминации вирусных гепатитов в Российской Федерации
Пресс-релиз от 28 июня 2022 г. (выдержки)
Заместитель Министра здравоохранения РФ Андрей Плутницкий в ходе заседания отметил, что появление новых возбудителей вирусных заболеваний, растущий уровень резистентности к противомикробным препаратам, активизация и расширение ареала природно-очаговых инфекций, рост активности антипрививочного движения и снижение коллективного иммунитета являются ключевыми угрозами инфекционной безопасности.
<...> По словам замминистра, для дальнейшего ограничения распространения инфекционных болезней и снижения смертности от их последствий в Российской Федерации необходимо эффективное взаимодействие между всеми заинтересованными органами и организациями на федеральном, региональном и местном уровнях, в том числе в части введения ограничительных мероприятий и оперативного управления силами и средствами, а также повышение уровня коллективного иммунитета населения к новой коронавирусной инфекции с акцентом на своевременную вакцинацию и повторную вакцинацию лиц из групп риска. Он также отметил, что важную роль играет и усиление разъяснительной работы с населением о важности вакцинации и соблюдения противоэпидемических мероприятий, а также обеспечение повышенной инфекционной настороженности.
Совершенствование эпиднадзора за вирусными гепатитами
С докладом, посвященным целям, задачам и перспективам элиминации хронических вирусных гепати-
тов в России, выступил Главный внештатный специалист по инфекционным болезням Минздрава России Владимир Чуланов. <...>
ВИЧ, вирусный гепатит и инфекции, передаваемые половым путем, имеют общие способы передачи и детерминанты, из чего следует комплексная основа проекта стратегий. Основными показателями воздействия и цели в области борьбы с вирусными гепатитами на 2022-2030 гг. является снижение смертности от гепатита В и С. Владимир Чуланов подчеркнул, что российский опыт элиминации гепатитов имеет достижения, превышающие показатели в мире. <...>
Одна из главных проблем, которая стоит и перед населением, и перед медицинским сообществом, — это осведомленность о вирусном гепатите, его последствиях и мифе о том, что гепатит С нельзя вылечить. <...>
Завершая свое выступление, Владимир Чуланов выделил ключевые успехи за 2021 г. в направлении элиминации хронических вирусных гепатитов. <...>
На 2022 г. запланировано утверждение стандарта и порядка оказания медицинской помощи при хроническом гепатите С, завершение создания федерального регистра по ХГС.
Источник: https://minzdrav.gov.ru/ news/2022/06/28/18946-sostoyalsya-i-natsюnalnyy-ekspertnyy-sovet-po-voprosam-eliminatsii-virusnyh-gepatitov-v-rossiyskoy-federatsii
