Научная статья на тему 'Детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах Vibrio spp. , выделенных на территории Волгоградской области'

Детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах Vibrio spp. , выделенных на территории Волгоградской области Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
124
23
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
VIBRIO SPP / ИНТЕГРАТИВНЫЕ КОНЪЮГАТИВНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ / ICE / ГЕНЫ РЕЗИСТЕНТНОСТИ / INTEGRATIVE CONJUGATIVE ELEMENTS (ICES) / RESISTANCE GENES

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Захарова Ирина Борисовна, Кузютина Юлия Александровна, Подшивалова Мария Васильевна, Замарин Антон Александрович, Топорков Андрей Владимирович

В настоящей работе установлено присутствие интегративных конъюгативных элементов (ICEs) семейства SXT/R391 в штаммах Vibrio spp., выделенных из воды открытых водоемов на территории Волгоградской области в период 2003-2014 г. В составе ICEs штаммов V. cholerae non-O1/non-O139 серогрупп идентифицированы гены резистентности к триметоприму (dfr18), стрептомицину (strB), сульфометаксазолу (sulII). У ICEs штаммов Vibrio spp., не относящихся к виду V. cholerae, обнаружен другой вариант гена дигидрофолатредуктазы dfrA1, локализованный вне кластера. Полученные результаты показывают, что штаммы водной вибриофлоры могут быть потенциальными резервуарами генов резистентности.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Захарова Ирина Борисовна, Кузютина Юлия Александровна, Подшивалова Мария Васильевна, Замарин Антон Александрович, Топорков Андрей Владимирович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Detection and analysis of integrative conjugative elements in Vibrio spp. strains, isolated in the Volgograd region

The presence of integrative conjugative elements (ICEs) of SXT/R391 family in different Vibrio species isolated from natural water sources in the Volgograd region in 2003 2014 was established. Trimethoprim (dfr18), streptomycin (strB) and sulfametoxazol (sulII) resistance genes were detected in ICEs pattern of in V. choleraenon-O1/non-O139 strains. In Vibrio spp. ICEs strains not referred to V. cholerae type there was detected another variant of dihydrofolate reductase gene dfrA1 localized outside the main resistance cluster. The obtained results indicate to that aqueous Vibrio spp. strains may be potential reservoir of resistance genes.

Текст научной работы на тему «Детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах Vibrio spp. , выделенных на территории Волгоградской области»

Epidemiology and Infectious Diseases. 2016; 21(6)

_DOI: http://dx.doi.org/10.18821/1560-9529-2016-21-6-347-351

ORIGINAL INVESTIGATIONS

© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2016 УДК 579.843.1:579.25].083.1

Захарова И.Б., Кузютина Ю.А., Подшивалова М.В., Замарин А.А., Топорков А.В., Викторов Д.В.

детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах vibrio spp., выделенных на территории волгоградской области

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, 400131, г. Волгоград, Россия

В настоящей работе установлено присутствие интегративных конъюгативных элементов (ICEs) семейства SXT/ R391 в штаммах Vibrio spp., выделенных из воды открытых водоемов на территории Волгоградской области в период 2003-2014 г. В составе ICEs штаммов V. Ло1егае non-O1/non-O139 серогрупп идентифицированы гены резистентности к триметоприму (dfr18), стрептомицину (strB), сульфометаксазолу (sulII). У ICEs штаммов Vibrio spp., не относящихся к виду V. Ло1егае, обнаружен другой вариант гена дигидрофолатредуктазы - dfrAl, локализованный вне кластера. Полученные результаты показывают, что штаммы водной вибриофлоры могут быть потенциальными резервуарами генов резистентности.

Ключевые слова: Vibrio spp.; интегративные конъюгативные элементы; ICE; гены резистентности.

Для цитирования: Захарова И.Б., Кузютина Ю.А., Подшивалова М.В., Замарин А.А., Топорков А.В., Викторов Д.В. Детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах Vibrio spp., выделенных на территории Волгоградской области. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2016; 21 (6): 347-351. DOI: http://dx.doi.org/10.18821/1560-9529-2016-21-6-347-351

ZakharovaI.B., Kuzyutina Yu.A., PodshivalovaM.V., ZamarinА.А., ToporkovA.V., ViktorovD.V.

DETECTION AND ANALYSIS OF INTEGRATIVE CONJUGATIVE ELEMENTS IN O VIBRIO SPP. STRAINS, ISOLATED IN THE VOLGOGRAD REGION

Volgograd Plague Control Research Institute of the Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare, 7, Golubiskaya str., Volgograd, 400012, Russian Federation

The presence of integrative conjugative elements (ICEs) of SXT/R391 family in different Vibrio species isolated from natural water sources in the Volgograd region in 2003 - 2014 was established. Trimethoprim (dfr18), streptomycin (strB) and sulfametoxazol (sulII) resistance genes were detected in ICEs pattern of in V. choleraenon-O1/non-O139 strains. In Vibrio spp. ICEs strains not referred to V. скolerae type there was detected another variant of dihydrofolate reductase gene - dfrA1 localized outside the main resistance cluster. The obtained results indicate to that aqueous Vibrio spp. strains may be potential reservoir of resistance genes.

Keywords: Vibrio spp.; integrative conjugative elements (ICEs); resistance genes.

For citation: Zakharova I.B., Kuzyutina Yu.A., Podshivalova M.V., Zamarin А.А., Toporkov А.У, Viktorov D.V. Detection and analysis of integrative conjugative elements in Vibrio spp. strains, isolated in the Volgograd region. Epidemiology and Infectious Diseases (Russian journal). 2016; 21(6): 347-351. (In Russ.). DOI: http://dx.doi.org/10.18821/1560-9529-2016-21-6-347-351 For correspondence: Irina B. Zakharova, MD, PhD, Head of the Laboratory of Genomics and Proteomics of the Volgograd Plague Control Research Institute of the Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare, 7, Golubiskaya str., Volgograd, 400012, Russian Federation. E-mail: zib279@gmail.com

Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.

Acknowledgment. The study had no sponsorship.

Received 14.07.2016 Accepted 15.11.2016

Представители рода Vibrio широко распространены в морских средах и пресноводных водоемах. Возможность вибрионов занимать различные ниши обитания - свидетельство их высокого адаптационного потенциала [1]. Важный фактор в этом процессе у вибрионов - горизонтальный перенос генов, представляющий собой механизм передачи ДНК из одной бактериальной клетки в другую без необходимости деления клеток [2-4]. Привне-

Для корреспонденции: Захарова Ирина Борисовна, канд. биол. наук, зав. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, е-таД: zib279@gmail.com

сенная ДНК интегрирует в геном реципиента как путем гомологичной рекомбинации, так и посредством мобильных генетических элементов [5], что обеспечивает ее стабильное наследование.

Ранее считали, что детерминанты резистентности к антибиотикам имеют у вибрионов исключительно внехромосомную локализацию. Однако в 1992 г. во время крупной вспышки холеры в Индии в клиническом изоляте V. с^1егае М010 новой 0139 серогруппы обнаружен хромосомный конъюгатив-ный генетический элемент, названный SXTM010, на котором были локализованы гены резистентности к сульфометаксазолу ^и), триметоприму (Тт), хлорамфениколу (Ст) и стрептомицину ^т) [6].

оригинальные исследования

В настоящее время для идентифицированных до 2006 г. интегративных конъюгативных элементов (ICE) используют устоявшиеся названия, а для вновь описываемых элементов данного типа принята универсальная номенклатура: префикс ICE, аббревиатура вида происхождения элемента, три буквы названия страны выделения и количество генов резистентности [7].

Консервативные последовательности ICEs представлены генами, участвующими в интеграции/ вырезании, конъюгативном переносе и регулятор-ных процессах. Кроме того, все известные ICEs содержат вариабельную ДНК, придающую эле-ментспецифические свойства. Среди функций, кодируемых в вариабельной ДНК ICEs, - устойчивость к антибиотикам и тяжелым металлам, регулирование образования биопленки и подвижности [7]. Кроме того, гены вариабельной ДНК, по-видимому, участвуют в модификации ДНК, рекомбинации и репарации, кодируя разнообразные системы рестрикции-модификации, геликазы и эндонуклеазы. Такие гены могут обеспечивать защиту от инвазий чужеродных ДНК, в том числе фаговой инфекции, и/или содействовать целостности генома ICE в процессе его конъюгативной передачи [8].

ICEs семейства SXT/R391 широко распространены в штаммах рода Vibrio, выделенных как от больных, так и из воды открытых водоемов и обычно ассоциированы с мультирезистентностью к целому ряду антибактериальных препаратов [9]. Ранее нами было показано наличие различных типов SXT в составе геномов штаммов V. cholerae О1 и О139 серогрупп, выделенных в 1990-е годы на территории Волгоградской области [10]. Известно, что многие виды рода Vibrio могут служить источником для холерных вибрионов новых, ранее не встречаемых у них комбинаций генов устойчивости к антимикробным соединениям [4]. В связи с этим было логично оценить распространенность данных генетических элементов среди

автохтонной вибриофлоры региональных открытых водоемов.

Материалы и методы

В работе исследованы 136 штаммов V cholerae non-O1/non-O139 серогрупп (из них три клинических изолята) и 43 штамма Vibrio spp., не относящихся к виду V. cholerae, выделенных на территории Волгоградской области в период 2003-2014 гг. Культуры выращивали на щелочном агаре (pH 7,8) при 37°С в течение 18-20 ч. Выделение ДНК проводили методом протеиназного лизиса [11]. Праймеры, использованные в работе, представлены в таблице. Амплификацию мишеней проводили: в мультилокусном формате на амплификаторе C1000 (Bio-Rad) при параметрах: 95 oC - 3 мин, 35 циклов (94 oC - 1 мин, 60,4 oC - 1 мин, 72oC - 1 мин), финальная элонгация при 72 oC - 10 мин;

в монолокусном формате: 95 oC - 3 мин, 35 циклов (94 oC - 30 с, Т oC - 30 с, 72 oC - 30 с), 72 oC - 5 мин, где T - температура отжига праймеров (sulII F/R и strB F/R - 61,8 oC; dfr18 F/R - 60,4 oC; dfrA1 F/R - 57,8 oC).

Продукты ПЦР анализировали с помощью электрофореза в 1,5% агарозном геле и визуализировали окрашиванием бромистым этидием.

Результаты

Скрининг исследуемых штаммов на наличие в составе их геномов последовательностей ICEs с использованием праймеров SXT-F/SXT-B, специфичных гену интегразы int SXT, показал наличие искомого гена у 60 штаммов V. cholerae non-O1/non-O139 и у 25 штаммов Vibrio spp. Для дальнейшего анализа было отобрано 11 штаммов V. cholerae non-O1/non-O139, резистентных к двум и более антибиотикам, и 5 штаммов Vibrio spp., выделенных из разных точек отбора воды (для штаммов этой группы антибиотикограммы предварительно не исследовали) и показавших в ПЦР-скрининге специфические ампликоны наибольшей интенсивности.

Последовательности праймеров, использованных в работе

Праймер Последовательность 5'—3' Мишень (ссылка)

SXT-F TTATCGTTTCGATGGC Ген интегразы int SXT элемента (accession AF099172)

SXT-B GCTCTTCTTGTCCGTTC

sulII-F GTGCGGATGAAGTCAGCTCC Ген устойчивости к сульфаметоксазолу sulII (accession AY034138)

sulII-R GGGGGCAGATGTGATCGAC

strB-F CGCGATAGCTAGATCGCGTT Ген устойчивости к стрептомицину strB (accession AY034138)

strB-R GACTACCAGGCGACCGAAAT

dfr18-F CTGCCGTTTTCGATAATGTGG Ген дигидрофолатредуктазы dfr18 (accession AY034138)

dfr18-R GGGTAAGACACTCGTCATGGG

dfrA1-F AGTTTACATCTGACAATGAGAACGTAT Ген дигидрофолатредуктазы dfrA1 (accession GQ463140)

dfrA1-R ACCCTTTTGCCAGATTTGGTA

ORIGINAL INVESTIGATIONS

Молекулярное типирование обнаруженных ин-тегративных элементов проводили путем анализа структуры локусов вариабельной ДНК, несущих детерминанты резистентности к антибактериальным препаратам. Наличие генов резистентности в составе обнаруженных ICEs анализировали в форматах моно- и мультилокусной ПЦР с праймерами, специфичными к генам устойчивости к стрептомицину (strB), сульфаметоксазолу (sulII) и двум генам дигидрофолатредуктаз (dfr18 и dfrAl). У всех исследованных штаммов V cholerae non-O1/non-O139 обнаружены фрагменты гена dfr18 ожидаемого размера 389 п.н. (см. рисунок, г). Кроме того, у штаммов 233 и 298-13 выявлены специфические ампликоны (515 п.н.) с праймерами strB (см. рисунок, в), а у штаммов 18/841 и 34-1 - фрагменты гена sulII (626 п.н.) (см. рисунок, а). Среди всех исследованных штаммов Vibrio spp. единственный штамм 287-9 содержал ген резистентности к триметоприму dfrAl (ампликон размером 278 п.н.) (см. рисунок, б).

Обсуждение

Вариабельные последовательности ICEs размером в диапазоне 30-60 т. п.н. находятся в основном

в 5 горячих точках (HS, hot spot), обозначаемых HSj-HS5. Кроме того, некоторые ICEs также содержат вариабельную ДНК, встроенную за пределами горячих точек, в четырех вариабельных регионах (VR - variable region), обозначаемых VR I-VR IV [8].

Гены резистентности к антибиотикам сгруппированы вместе около 5'-конца элемента. Кластер генов резистентности к триметоприму (dfr18), хло-рамфениколу (floR), стрептомицину (strAB) и суль-фометаксазолу (sulII) интегрирован в локус rumB ICE элемента и представляет собой транспозоно-подобную структуру, в которой гены резистентности фланкированы генами транспосаз - вариабельный регион VR III. Приведенный состав кластера генов резистентности характерен для ICEs типа SXTM010 [12]. У элементов типа SXTET в кластере нет гена dfr18, а присутствует другой вариант гена дигидрофолатредуктазы - dfrAl, локализованный в HS3 вне основного кластера генов антибиотикоу-стойчивости, а также имеется ген резистентности к канамицину (kan) в горячей точке HS5 [12, 13].

Анализ вариабельного региона VR III обнаруженных ICEs V. cholerae non-01/non-0139 показал наличие интегрированного в локус rumB частич-

Амплификация фрагментов генов резистентности в составе ICEs. Мультилокусная ПЦР с праймерами sulII F/R (626 п.н.), strB F/R (515 п.н.), dfr18 F/R (389 п.н.) и dfrAl F/R (278 п.н.).

а: 1 - V. cholerae non-O1/O139 34-1; 2 - V. cholerae non-O1/O139 18/841; М - ДНК-маркер (100-1000 п.н.).

б: 1 - Vibrio spp. 270; 2 - Vibrio spp. 287-1; 3 - Vibrio spp. 287-9; 4 - Vibrio spp. 290-5; 5 - V. cholerae О139 В191 (в качестве контроля); М - ДНК-маркер (100-1000 п.н.).

Монолокусная ПЦР с праймерами strB F/R (В) и dfr18 F/R (Г): 1 - V. cholerae non-O1/O139 127; 2 - V. cholerae non-O1/O139 135; 3 - V. cholerae non-O1/ O139 162; 4 - V cholerae non-O1/O139 174; 5 - V. cholerae non-O1/O139 233; 6 - V. cholerae non-O1/O139 270-1; 7 - V cholerae non-O1/O139 298-13; 8 - V. cholerae non-O1/O139 305-3; М - ДНК-маркер (100-1000 п.н.).

оригинальные исследования

но делетированного кластера резистентности. Мы идентифицировали три варианта состава кластера: у 7 штаммов (127, 135, 162, 174, 270-1, 305-9 и 982) он был представлен только геном резистентности к триметоприму dfr18, у двух штаммов (233 и 29813) присутствовали детерминанты устойчивости к стрептомицину (strB) и триметоприму (dfr18), в двух штаммах (18/841 и 34-1) - dfr18 и sulII. Известно, что dfr18 специфичен для штаммов V. cholerae O139, в то время как dfrAl специфичен для V cholerae O1 е1-Тог [13], т. е. описываемые ICEs штаммов V. cholerae non-O1/non-O139 относят к типу SXTM010. Ни в одном из ICEs исследованных штаммов Vibrio spp. кластера генов резистентности в составе VR III обнаружено не было. Известно, что его наличие не является маркерным признаком ICEs семейства SXT/R391. Так, ранее описаны элементы этого семейства - ICEVchMex1 из штамма V. cholerae неопределенной серогруп-пы, ICEVchHK01 V. cholerae 0139, ICEVflTha2 V. fluvalis V49 и ICEVvuTha1 V. vulnificus V268, в которых кластер резистентности отсутствовал [14, 12, 15]. Однако в ICE штамма Vibrio spp. 287-9 мы обнаружили вставку в HS3, содержащую ген резистентности к триметоприму dfrAl, характерный для SXTET штаммов V. cholerae 01.

Интересно отметить, что из 24 штаммов V. cholerae non-01/non-0139, выделенных в период 2003-2007 гг., только два (18/841 и 34-1) имели в составе генома интегративные конъюгативные элементы SXTM01°-™m с частично делетирован-ными кластерами антибиотикорезистентности. В то же время среди штаммов V. cholerae non-01/ non-0139, выделенных через 10 лет, более 50% содержали ICEs также SXT^^-rara, но с иными вариантами состава кластера генов резистентности.

Таким образом, полученные результаты дают основание сделать вывод о присутствии и достаточно быстром распространении среди видов вибриофлоры региональных открытых водоемов интегративных конъюгативных элементов семейства SXT/R391. Выявленная мозаичность структуры ICEs свидетельствует о высокой степени генетической изменчивости данных структурных элементов генома вибрионов, а также их потенциальной роли в формировании новых, адаптивно значимых генотипов микроорганизмов. Известно, что штаммы V. cholerae non-01/ non-0139 могут служить источником для вибрионов эпидемически значимых серогрупп новых, ранее не встречаемых у них комбинаций генов устойчивости к антимикробным соединениям [4]. Ранее считали, что распространение генов резистентности -это их основная роль, однако в настоящее время очевидно, что ICEs могут быть посредником для передачи самого разнообразного набора функций, позволяющих бактериям быстро адаптироваться

к новым условиям окружающей среды и колонизировать новые ниши. Учитывая, что ICEs могут быть вовлечены в механизмы горизонтальной передачи генетического материала, расширяющего эпидемический потенциал вибрионов (гены персистенции, патогенности и др.), дальнейшее изучение структуры и изменчивости данных генетических элементов - одна из актуальных задач молекулярно-генетического мониторинга за холерой и патогенными для человека вибрионами.

Финансирование. Исследование не имело спонсорской поддержки.

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

ЛИТЕРАТУРА

1. Thompson F.L., Iida T., Swings J. Biodiversity of vibrios. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004; 68: 403-31.

2. MacDonald D., Demarre G., Bouvier M., Mazel D., Gopaul D.N. Structural basis for broad DNA-specificity in integron recombination. Nature. 2006; 440: 1157-62.

3. Mazel D. Integrons: agents of bacterial evolution. Nature Rev. Microbiol. 2006; 4: 608-20.

4. Rodríguez-Blanco A., Lemos M., Osorio C. Integrating conjugative elements as vectors of antibiotic, mercury, and quaternary ammonium compound resistance in marine aquaculture environments. Antimicrob. Agents Chemother. 2012; 56 (5): 2619-26.

5. Gillings M., Boucher Y., Labbate M., Holmes A., Krishnan S., Holley M., Stokes H.W. The evolution of class 1 integrons and the rise of antibiotic resistance. J. Bacteriol. 2008; 190 (4): 5095-100.

6. Waldor M., Tschape H., Mekalanos J. A new type of conjugative transposon encodes resistance to sulfamethoxazole, trimethoprim, and streptomycin in Vibrio cholerae O139. J. Bacteriol. 1996; 178 (14); 4157-65.

7. Burrus V., Marrero J., Waldor M. The current ICE age: biology and evolution of SXT-related integrating conjugative elements. Plasmid. 2006; 55 (3): 173-83.

8. Wozniak R.A., Fouts D.E., Spagnoletti M., Colombo M.M., Cec-carelli D., Garriss G. et al. Comparative ICE genomics: insights into the evolution of the SXT/R391 family of ICEs. PLoS Genet. 2009; 5 (12): e1000786. doi: 10.1371/journal.pgen.1000786.

9. Захарова И.Б., Викторов Д.В. Интегративные конъюгативные элементы микроорганизмов (ICEs). Молекул. генетика. 2015; 33 (3): 9-16.

10. Подшивалова М.В., Кузютина Ю.А., Захарова И.Б. Лопастей-ская Я.А., Викторов Д.В. Характеристика антибиотикорези-стентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2014; (3): 34-9.

11. Тетерятникова Н.Н., Захарова И.Б., Подшивалова М.В., Романова А.В., Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Молекулярная детекция интегронов класса 1 у Burkholderia pseudomallei. Проблемы особо опасных инфекций. 2011; [2 (108)]: 46-9.

12. Hochhut B., Lotfi Y., Mazel D., Faruque S. M., Woodgate R. Molecular analysis of antibiotic resistance gene clusters in Vibrio cholerae O139 and O1 SXT constins. Antimicrob. Agents Chemother. 2001; 45: 2991-3000.

13. Ramachandran D., Bhanumathi R., Singh D.V. Multiplex PCR for detection of antibiotic resistance genes and the SXT element: application in the characterization of Vibrio cholerae. J. Med. Microbiol. 2007; 56: 346-51.

14. Burrus V., Quezada-Calvillo R., Marrero J., Waldor M.K. SXT-related integrating conjugative element in new world Vibrio cholerae. Appl. Environ. Microbiol. 2006; 72: 3054-7.

14. Kitiyodom S., Khemtong S., Wongtavatchai J., Chuanchuen R. Characterization of antibiotic resistance in Vibrio spp. isolated from farmed marine shrimps (Penaeus monodon). FEMS Microbiol. Ecol. 2010; 72: 219-27.

REFERENCES

1. Thompson F.L., Iida T., Swings J. Biodiversity of vibrios. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004; 68: 403-31.

2. MacDonald D., Demarre G., Bouvier M., Mazel D., Gopaul D.N. Structural basis for broad DNA-specificity in integron recombination. Nature. 2006; 440: 1157-62.

3. Mazel D. Integrons: agents of bacterial evolution. Nature Rev. Microbiol. 2006; 4: 608-20.

4. Rodríguez-Blanco A., Lemos M., Osorio C. Integrating conjuga-tive elements as vectors of antibiotic, mercury, and quaternary ammonium compound resistance in marine aquaculture environments. Antimicrob. Agents Chemother. 2012; 56 (5): 2619-26.

5. Gillings M., Boucher Y., Labbate M., Holmes A., Krishnan S., Holley M., Stokes H.W. The evolution of class 1 integrons and the rise of antibiotic resistance. J. Bacteriol. 2008; 190 (4): 5095-100.

6. Waldor M., Tschape H., Mekalanos J. A new type of conjugative transposon encodes resistance to sulfamethoxazole, trimethoprim, and streptomycin in Vibrio cholerae O139. J. Bacteriol. 1996; 178 (14); 4157-65.

7. Burrus V., Marrero J., Waldor M. The current ICE age: biology and evolution of SXT-related integrating conjugative elements. Plasmid. 2006; 55 (3): 173-83.

8. Wozniak R.A., Fouts D.E., Spagnoletti M., Colombo M.M., Cec-carelli D., Garriss G. et al. Comparative ICE genomics: insights into the evolution of the SXT/R391 family of ICEs. PLoS Genet. 2009; 5 (12): e1000786. doi: 10.1371/journal.pgen.1000786.

9. Zakharova I.B., Viktorov D.V. Integrative conjugative elements (ICEs) of microorganisms. Molekul. genetika. 2015; 33 (3): 9-16. (in Russian)

10. Podshivalova M.V., Kuzyutina Yu.A., Zakharova I.B., Lopastey-skaya Ya.A., Viktorov D.V. Characteristics of antibiotic resistant strains of Vibrio cholerae carrying SXT type integrative conjugative elements. Epidemiol. i infects. bol. 2014; (3): 34-9. (in Russian)

ORIGINAL INVESTIGATIONS

11. Teteryatnikova N.N., Zakharova I.B., Podshivalova M.V, Romanova A.V., Lopasteyskaya Ya.A., Viktorov D.V Molecular Detection of Class 1 Integrons in Burkholderia pseudomallei. Problemy osobo opasnykh infektsiy. 2011; [2 (108)]: 46-9. (in Russian)

12. Hochhut B., Lotfi Y., Mazel D., Faruque S. M., Woodgate R. Molecular analysis of antibiotic resistance gene clusters in Vibrio cholerae O139 and O1 SXT constins. Antimicrob. Agents Chemother. 2001; 45: 2991-3000.

13. Ramachandran D., Bhanumathi R., Singh D.V. Multiplex PCR for detection of antibiotic resistance genes and the SXT element: application in the characterization of Vibrio cholerae. J. Med. Microbiol. 2007; 56: 346-51.

14. Burrus V., Quezada-Calvillo R., Marrero J., Waldor M.K. SXT-related integrating conjugative element in new world Vibrio cholerae. Appl. Environ. Microbiol. 2006; 72: 3054-7.

14. Kitiyodom S., Khemtong S., Wongtavatchai J., Chuanchuen R. Characterization of antibiotic resistance in Vibrio spp. isolated from farmed marine shrimps (Penaeus monodon). FEMS Microbiol. Ecol. 2010; 72: 219-27.

Поступила 14.07.2016 Принята в печать 15.11.2016

Сведения об авторах:

Кузютина Юлия Александровна, науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора; Подшивалова Мария Васильевна, науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора; Замарин Антон Александрович, науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора; Топорков Андрей Владимирович, доктор мед. наук, директор ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнад-зора; Викторов Дмитрий Викторович, доктор биол. наук, доцент, зам. директора по научно-экспериментальной работе ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.